喉鳞癌组织与相邻正常黏膜的基因表达谱差异

目的:研究喉鳞癌组织与相邻正常黏膜的基因表达谱差异。方法:对2例经病理证实的喉鳞状细胞癌标本和邻近的正常黏膜组织标本与基因表达谱芯片进行杂交,利用激光共聚焦荧光检测系统扫描芯片杂交信号,获得样品中基因序列及表达信息。结果:对比2例喉癌和邻近正常组织的基因表达图谱,发现癌组织和正常组织存在差异表达,2例标本重复出现且差异表达的基因共74个,其中喉癌组织表达上调的基因(R 5)27个,表达下调的基因(0相似文献   

基因表达谱芯片发现36条喉鳞癌相关基因

目的：研究探讨喉鳞癌发生、发展中相关基因群的表达和初步功能。方法：按微矩阵排列的4096种全长基因PCR产物制成BioDoor4096型微矩阵表达谱芯片;采用条件优化的一步法抽提喉鳞癌及正常组织总RNA,用Qiagen公司Oligotex mRNA离心柱分离纯化两种组织的mRNA;经逆转录合成荧光分子（Cy3/Cy5)掺入的cDNA一链制备表达谱探针,芯片杂交和严格洗片后,用SanArray3000荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,利用计算机分析肿瘤及正常组织中差异表达的基因。对所获得的基因进行分子生物信息学分析。结果：在4096种基因中,喉鳞状细胞癌与正常组织间存在差异表达的基因。在所检测的4对临床标本中,发现有差异表达的基因36条（0．88％）。生物信息学分析显示,该36条差异表达基因与肿瘤的发病机制可能存在相关性。结论：喉鳞状细胞癌的发生、发展中存在多因素表达调控的改变,对于相关基因群的研究有助于认识肿瘤发病机制。     

肺癌相关基因的表达谱研究

目的：通过研究人肺癌组织和正常组织中差异表达的基因,寻找肺癌相关基因以用于肺癌的诊断和治疗。方法：以包含４０９６个ｃＤＮＡ基因表达谱芯片研究一组肺癌组织样本的基因表达谱。结果：共筛选出差异表达的基因３７０条,包含已知基因１４６条,未知基因２２４条,其中１０７条表达增加,２６３条表达降低。结论：基于ｃＤＮＡ微矩阵技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选与肺癌发生密切相关的基因。     

肿瘤谱阵列芯片技术分析人体不同癌组织hHBrk1基因的差异表达

目的检测不同肿瘤及其癌旁正常组织中hHBrk1基因的差异表达,为进一步研究hHBrk1基因对肿瘤生物学过程的影响提供线索。方法以154对正常及肿瘤组织(19种不同人体组织)和10种肿瘤细胞株的cDNA的肿瘤谱阵列芯片(Cancer profiling arrayⅡ)为研究材料,采用Northern杂交方法分析目的基因表达水平的差异。根据阳性结果收集临床肿瘤组织样本,用RT-PCR检测hHBrk1基因表达,以验证芯片结果的可靠性。结果154对组织及10个肿瘤细胞株均表达hHBrk1基因。其中肺肿瘤组织高表达hHBrk1基因,与正常配对肺组织表达丰度差异有显著性(P<0.01);在肾癌组织中的hHBrk1基因表达丰度低于配对肾组织(P<0.01)。RT-PCR证实8临床肺肿瘤组织中5例高表达hHBrk1基因。结论肿瘤谱阵列芯片技术能够快速检测hHBrk1基因在不同组织中的表达差异,hHBrk1基因可能与肺癌及肾癌的发生、发展有关。     

cDNA微阵列技术对肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱的研究

目的：利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱，并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较，筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因，及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因，为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法：用含4096个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果：肺鳞癌差异表达基因591个，其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因476个，上调的有293个，下调的有183个；肺腺癌差异表达基因524个，其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因460个，上调的有214个，下调有246个；有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论：肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱，筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。     

基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究

目的：探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理变化中的应用价值。方法：应用含有４０９６条人类全长基因的ｃＮＤＡ表达谱芯片,对３例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果：在３例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因３９８条,其中新基因２８９条,老基因１０９条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因３７条,其中在胰腺癌组织中上调基因２０条,下调基因１７条。结     

利用基因表达谱芯片筛选卵巢癌相关差异表达基因的研究

目的:探讨VEGF、HE4、YKL-40、OPN、BRCA1基因在卵巢癌发生发展中的作用.方法:采用cDNA芯片技术分别检测13例卵巢癌和5例正常卵巢组织中上述基因cDNA表达谱差异.结果:VEGF、HE4、YKL-40、OPN基因在卵巢癌组织中表达上调;BRCA1基因在卵巢癌组织中表达下调.结论:上述基因与卵巢癌发生及发展关系密切.CDNA基因芯片技术对于探讨卵巢癌分子机制,寻找卵巢癌分子标志物具有重要意义.     

食管鳞癌患者癌及癌旁组织差异基因表达

目的:探讨食管鳞癌组织差异基因表达.方法:分别取3例无食管鳞癌家族史患者的癌及癌旁组织(I组)和6例有食管鳞癌家族史患者的癌及癌旁组织(Ⅱ组)等量混合,抽提RNA,将RNA逆转录合成相应cDNA,以Cy5和Cy3标记cDNA作为探针,在含有14 000点人类基因组芯片(BiostarH-140s)上进行杂交.用scan...     

cDNA微阵列技术对肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱的研究

目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 4 0 96个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果 :肺鳞癌差异表达基因 5 91个 ,其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 76个 ,上调的有 2 93个 ,下调的有 183个 ;肺腺癌差异表达基因 5 2 4个 ,其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 6 0个 ,上调的有 2 14个 ,下调有 2 4 6个 ;有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论 :肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱 ,筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。     

瘢痕疙瘩的差异表达基因谱研究

目的 应用基因芯片技术筛选瘢痕疙瘩组织的差异表达基因。探讨异常瘢痕发生的分子机制。方法 应用含有8064个人类靶基因的表达谱芯片,检测瘢痕疙瘩和正常皮肤组织中基因的差异表达变化,筛选出差异表达基因,应用RT-PCR验证芯片结果;建立与瘢痕疙瘩形成相关的基因表达谱并进行生物信息学分析。结果 与正常皮肤组织相比,瘢痕疙瘩组织中发生显著性差异表达变化的基因有277个,其中上调163个、下调114个,涉及到各种信号传递及基因调控的改变。RT-PCR检测结果与芯片结果呈一致性趋势。结论 创面过度愈合形成瘢痕疙瘩是一个复杂的病理生理过程,受多种基因表达调控：差异表达基因谱的建立和研究较全面反映了瘢痕疙瘩发生的分子生物学概貌,有助于认识异常瘢痕形成的机制。     

口腔黏膜成纤维细胞与癌细胞相互作用的基因表达特性研究

目的：探讨口腔癌细胞与成纤维细胞间信号传递的分子机制。方法：将口腔癌细胞与正常黏膜成纤维细胞（NMFs）共培养,采用半定量RT-PCR方法,测定细胞共培养前后6种基因表达改变。结果：共培养之后,除IGFBP1表达较共培养前减少外,Notch3、TFPI-2 TIMP-3、ST3、Tenascin-C基因表达均增加。这些基因分属生长因子／细胞因子类、信号转导／膜受体类、蛋白酶／蛋白酶抑制剂类、细胞基质及相关蛋白类,与ECM降解、血管生成、细胞生长和生存有关。结论：口腔黏膜成纤维细胞与癌细胞相互作用产生促肿瘤发生发展的调控因子和抗肿瘤的调控因子,二者间可能存在着复杂的调控网络。     

舌鳞癌细胞Tca-8113与舌成纤维细胞间信号传导机制的研究

目的：探讨舌鳞癌细胞Tca-8113与正常舌粘膜成纤维细胞（normal mucosa fibroblasts, NMFs）共培养前后多种信号传递分子的基因水平改变。方法：原代培养NMFs，将NMFs与Tca-8113共同培养，观察细胞形态学变化，收集细胞后，分别利用半定量RT-PCR法测定细胞共培养前后生长因子/细胞因子类(IGFBP1)、信号转导/膜受体类(Notch3)、蛋白酶/蛋白酶抑制剂类(ST3，TIMP3，TFPI-2)、细胞基质及相关蛋白类(Tenascin-C) 等6种信号传导分子基因表达的改变。结果：共培养后，NMFs围绕Tca-8113生长，透射电镜下可见细胞内细胞器增多；除Tca-8113的IGFBP1表达减少外，Tca-8113的TFPI-2及NMFs的Notch3、TIMP-3、ST3、Tenascin-C基因表达均增加。结论：舌鳞癌细胞Tca-8113与NMFs相互作用可产生促进肿瘤和抑制肿瘤的调控因子，二者间可能存在着复杂的调控网络。     

应用寡核苷酸芯片鉴别肺鳞癌Ⅰb期特异相关基因

目的建立Ⅰb和Ⅲa期肺鳞癌的基因表达谱并筛选肺鳞癌Ⅰb期特异相关基因。方法收集肺正常、临床Ⅰb和Ⅲa期肺鳞癌组织,分别组成样品池,提取其总RNA并制备cDNA,合成生物素标记的cRNA探针,与人U133A寡核苷酸基因芯片进行杂交,以MSV5．0软件对其结果进行分析处理,在Affymetrix数据库进行信息查询,并以逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）验证芯片检测结果。结果按照多组平行比较的原则进行共筛选,以信号值对数比（signal log ratio,SLR）均大于1为筛选标准,肺鳞癌差异表达基因：Ⅰb期共计1764个,其中上调571个,下调1193个;Ⅲa期共计554个,上调128个,下调426个。相对于Ⅲa期基因表达谱,Ⅰb期特异的差异表达基因共有1329个,其中上调482个,下调847个,对其进行生物学功能分类,其中代谢相关480个,信号转导227个,细胞增殖136个,免疫相关136个,细胞黏附94个,转录调控88个,细胞周期86个,细胞骨架73个,细胞分化45个,细胞凋亡42个,胞外基质31个。FOXM1和TNXB基因的RT—PCR检测结果与基因芯片检测结果一致。结论在全基因组范围内建立了Ⅰb和Ⅲa期肺鳞癌的基因表达谱并筛选了肺鳞癌Ⅰb期特异相关基因,为进一步的癌变机制研究和鉴定肺鳞癌早期诊断分子标记物奠定了基础。     

应用基因芯片技术筛查肺癌变相关基因的研究

目的 使用基因芯片技术研究肺鳞癌及化学致癌物诱导入气管上皮细胞恶性转化的癌变相关基因。方法 应用含4096条人类全长基因的cDNA芯片分别检测6例肺鳞癌和6例正常肺组织的基因表达谱;并用上述芯片研究苯并(a)芘代谢产物BPDE[anti-Benzo(a)pyrene diolepoxide,BPDE]和结晶型硫化镍所诱导的人支气管上皮细胞恶性转化与正常的人支气管上皮细胞系(16HBE)在基因表达谱上的差异;将3类标本共同的差异表达基因确定为肺癌变的相关基因。结果 在肺鳞癌／正常肺组织之间、BPDE诱导的恶性转化细胞／正常16HBE细胞之间及硫化镍诱导的恶性转化细胞/正常16HBE细胞之间发现差异表达基因分别为171条、143条和151条。通过比较,发现89条与肺癌变相关的共同基因,其中表达显著增加的基因39条,它们是：癌基因6条;细胞周期相关基因4条;细胞增殖基因6条;肿瘤转移基因8条;神经内分泌基因3条;耐药基因1条;凋亡抑制基因1条;氧化基因1条;其他基因9条。表达显著下降的基因50条,它们是：抑癌基因7条;DNA修复基因11条;抗氧化基因1条;GST基因家族3条;细胞骨架基因3条;凋亡诱导基因2条;信号传导基因5条;细胞因子及其受体基因5条;细胞代谢基因7条,细胞外基质基因1条;其他基因5条。结论 cDNA基因芯片技术能有效地研究基因的表达谱,筛查出肺癌变相关基因。     

表浅性与浸润性膀胱癌基因表达谱的比较

目的比较人表浅性与浸润性膀胱癌基因表达谱的差异。方法应用基因芯片技术对表浅性膀胱癌和浸润性膀胱癌的RNA进行检测分析。得到芯片灰度扫描图,通过图像处理软件GenePix Pro 3．0对图像进行分析,得到表达差异基因的相应数据,根据差异基因的类型及膀胱癌的特点分析数据。结果按显著差异基因标准,从13939条基因中筛选出显著差异表达基因：表浅组714条,其中480条下调,234条上调;浸润组470条,其中302条下调,168条上调。在显著差异基因中,下调基因的数量比上调基因多近1倍,免疫相关基因在浸润性膀胱癌中下调最明显。结论浸润性和表浅性膀胱癌的基因表达谱具有许多共同特点,但表浅性膀胱癌的差异表达基因较浸润性膀胱癌更多。免疫相关基因在浸润性膀胱癌中缺失较表浅性膀胱癌严重。     

肺癌p53基因突变与蛋白表达关系的研究

目的 以测序结果为标准,探讨免疫组织化学和聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）两种方法用于检测肺癌ｐ５３基因突变的敏感性及优缺点。方法 用免疫组织化学,ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＰＣＲ产物直接测序检查３０例肺癌标本的Ｐ５３蛋白和基因改变,结果 ３０例肺癌标本经测序共检出２２例突变,突变位于第５外显子８例（３６％）,位于第６外显子２例（９％）,位于第７外显子７例（３２％）,位于第８外显子５例（２     

PDGF在肺鳞状细胞癌中的表达

目的　探讨血小板衍生生长因子 (PDGF)在肺鳞状细胞癌 (肺鳞癌 )中的表达及意义。方法　应用免疫组织化学技术观察了PDGF A链和PDGF B链在 2 8例肺鳞癌中的表达 ,并与其在肺非特异性炎症组织中的表达相比较。结果　PDGF A链和PDGF B链的表达主要定位于肿瘤细胞胞浆、血管内皮细胞及平滑肌细胞 ,炎症组织的肺泡上皮细胞及血管平滑肌细胞少量表达。PDGF A链和PDGF B链在肺鳞癌中有显著表达。结论　PDGF A链和PDGF B链的过表达与肺鳞癌可能有关 ,未发现其过表达与肺鳞癌的病理分级存在相关性     

甲状腺乳头状癌基因谱表达的初步研究

目的:利用基因芯片筛选与甲状腺乳头状癌发生、发展和与恶性度相关的基因。方法:分别选取高、低分化甲状腺乳头状癌组织标本,抽提、纯化mRNA,同法再纯化同患者的正常甲状腺组织的mR-NA;用Cy5荧光染料对甲状腺乳头状癌组织mRNA作探针标记,以Cy3荧光染料对正常黏膜组织的mRNA作探针标记,一同和可检测4096个基因片段的BiostarH-40s型基因芯片进行杂交得到的双色荧光标记芯片,将之分别扫描入计算机,进行结果分析。结果:高、低分化2种芯片上均有大量基因片段出现了的高/低表达的情况,高分化芯片上异常表达片段数量为低表达351条,高表达417条,低分化芯片上异常表达者为低表达410条,高表达415条。在2种芯片中均有相同表达差异趋势的基因片段中,共计有90条基因片段出现低表达,其中随恶性度增高而降低的基因有19条;有78条片段呈现高表达状态,其中随恶性度增高而表达增加的有25条。表达异常的片段功能较分散;有大量的不明功能的片段发现。结论:甲状腺乳头状癌的发生、发展不能用单一的基因变异解释,而是由多基因共同作用的结果,并且变异具有明显的个体性差异;甲状腺乳头状癌的恶性度与多个基因片段异常表达相关。很多新发现的片段的功能不明了,对于确定甲状腺乳头状癌的发生发展内在机制仍有待研究。     

利用组织芯片检测上皮型钙黏素在宫颈癌浸润转移中的作用

目的 检测上皮型钙黏素E-cad在宫颈鳞癌中的表达，探讨其在浸润转移中的作用。方法 利用组织芯片的免疫组化染色对10例正常宫颈上皮、63例无淋巴结转移宫颈鳞癌、63例有淋巴结转移宫颈鳞癌组织中E-cad的蛋白表达进行检测。结果E-cad在正常宫颈组织的表达高于宫颈鳞癌P〈0．05，在无淋巴结转移宫颈鳞癌组织显著高于有淋巴结转移组织（P〈0．05），且E-cad的表达与淋巴结转移相关（P〈0．05）。结论 E-cad与宫颈鳞癌的浸润转移密切相关，可用于判断预后及指导临床治疗。