北京昌平区北京/W系结核分枝杆菌的流行特征

目的:探讨北京/W系结核分枝杆菌在北京市昌平区的流行特征。方法:连续收集北京市昌平区2004年1月1日至2006年12月31日的结核分枝杆菌分离株336株,采用Spoligotyping和多重PCR法对其进行分型及亚分型;同时采用谱系定义靶标RD105、RD181、RD150、RD142和Real-timePCR方法进行分型和亚分型,并分析北京/W系的2个亚系与其对应患者年龄、出生地、抗结核药物敏感谱和卡介苗(BCG)接种情况之间的关系。结果:2种方法对该地区结核分枝杆菌分型及亚分型结果完全一致,均为:299株为北京/W系和37株为非北京/W系结核分枝杆菌;在北京/W系结核分枝杆菌中,存在RD181的非典型北京菌株47株(15.7%),而相对现代的缺失RD181的W菌/典型北京家族菌株252株(84.3%);在W菌/典型北京家族菌株中,RD150和RD142缺失的菌株分别为168和173株。W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株2个亚系的分布与患者出生地、BCG接种情况、年龄以及抗结核药物敏感谱(链霉素、异烟肼、利福平和乙胺丁醇)均无关(χ2分别为0.530、1.623、2.180、<0.001、0.849、...     

RD105基因缺失法和双重PCR法对125株结核分枝杆菌菌株基因分型检测

目的 为明确比较RD105基因缺失法和双重PCR法对辽宁地区结核分枝杆菌中北京家族菌株的检测能力，同时掌握辽宁地区结核杆菌中北京家族菌株的流行情况而进行该项研究。方法 选取2011—2013年间辽宁省内各地市临床分离菌株，随机抽取经传统方法菌种鉴定为结核分枝杆菌的菌株，共计125株。选用超声破碎法提取菌株DNA，应用RD105基因缺失法和双重PCR法，同时对收集到的125株结核分枝杆菌进行特异性扩增，最后使用琼脂糖凝胶水平电泳对扩增的结果进行判断。结果 两种方法判断标准为：RD105基因缺失法结果中，出现283 bp大小片段的为北京家族菌株，不出现特异性条带的为非北京家族菌株；双重PCR法结果中，只出现393 bp大小片段的为北京家族菌株，而只出现570 bp大小片段为非北京家族菌株。使用上述两种方法鉴定本研究的125株结核分枝杆菌，结果完全相同，其中北京家族菌株有110株（88%），非北京家族菌株有15株（12%）。结论 RD105基因缺失法和双重PCR法对辽宁地区结核分枝杆菌中北京家族菌株的检测能力相当，并且北京家族菌株在辽宁地区流行的结核分枝杆菌中为绝对优势株；两种方法相对于传统的Spoligotyping法更简单、更省时，检测成本也较低，更适合在我国多数实验室推广应用。     

河南省尉氏县结核分枝杆菌的基因型流行特征及耐药性

目的:探讨河南省尉氏县结核分枝杆菌的可变数目串联重复序列(VNTR)基因型流行特征和耐药情况。方法:河南省尉氏县结核病防治机构分离培养的257株结核分枝杆菌,采用比例法药敏试验检测其耐药情况。应用RD105缺失基因检测法鉴定北京家族基因型菌株,7个结核分枝杆菌VNTR基因位点对结核分枝杆菌进行分型,并对其分型结果进行聚类分析。结果:北京家族基因型占90.7%(233/257);VNTR基因型显示明显的多态性。230个基因型聚类分析主要分为4个基因群(Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群和Ⅳ群),其中Ⅲ群包含152基因型(59.1%),为优势基因型;耐多药结核分枝杆菌占8.9%(23/257),任意耐药占24.5%(63/257),北京家族基因型与非北京家族基因型菌株以及主要流行(Ⅲ)群与非主要流行群中耐药株分布比较,差异无统计学意义(χ2=2.412、1.954,P>0.05)。结论:河南省尉氏县北京家族基因型结核分枝杆菌为主导流行型;7位点VNTR基因分型存在4个基因群,主要流行群为Ⅲ群;耐药形势仍不容乐观。     

郴州市结核分枝杆菌MIRU-VNTR分型研究

目的 调查郴州市结核病患者感染的结核分枝杆菌的分子分型特征及流行情况.方法 收集来自郴州市第二人民医院分离培养的结核分枝杆菌188株,采用结核分枝杆菌RD105基因位点对北京基因型进行鉴定,同时对菌株进行药敏试验,并选取MIRU-VNTR中的15位点对结核分枝杆菌进行分型鉴定,通过聚合酶链式反应及琼脂糖凝胶电泳对全部基...     

海南省136株耐药结核分枝杆菌寡核苷酸基因分型和耐药性分析

目的 通过对2022年收集的海南省136株耐药结核分枝杆菌进行基因分型研究，了解和掌握海南省不同耐药结核分枝杆菌基因型的流行情况及耐药率，为海南省结核病防治策略提供科学依据。方法 收集海南省结核分枝杆菌耐药菌株136株，采用间隔区寡核苷酸分型技术（Spoligotyping）对结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型，并对不同基因型结核分枝杆菌的耐药率进行统计学分析。结果 136株耐药结核分枝杆菌中北京型占54.41%(74/136)，非北京型占27.94%(38/136)，新发现基因型占17.65%(24/136)。北京型中包含SIT1和SIT269两种基因型，占比分别为52.94%(72/136)、1.47%(2/136)。在非北京型中，T型（T1、T2、T3）占21.32%(29/136),U型占6.62%(9/136)。基因分型聚类分析结果：分为北京型和非北京型两个大类以及一些散在的新型基因型。Spoligotyping分型成簇分析结果：136株耐药菌株分为3簇，成簇率为75.74%(103/136)。北京型和非北京型的单耐药、多耐药、耐多药、广泛耐药比率分别为41.89%(31/7...     

耐乙胺丁醇结核分枝杆菌基因型研究

目的研究青海地区耐乙胺丁醇结核分枝杆菌菌株embB基因突变特征,并比较耐乙胺丁醇(Ethambutol,EMB)菌株中耐多药结核分枝杆菌(Multiple drug resistance,MDR)与非结核分枝杆菌菌株的embB基因突变差异。方法采用聚合酶链式反应方法对63株耐乙胺丁醇的结核分枝杆菌的embB高突变区进行扩增,并分析embB基因突变特征。结果 63株耐乙胺丁醇的结核分枝杆菌中,28株在embB基因发生突变,突变率为44.44%(28/63);53株结核分枝杆菌且耐乙胺丁醇菌株中,22株(45.51%,22/53)在embB基因发生突变;10株非结核分枝杆菌耐乙胺丁醇菌株中,6株(60.00%,6/10)在embB基因发生突变。位点embB306和embB406为高突变点,分别占突变菌株的67.86%(19/28)和21.43%(6/28)。耐乙胺丁醇菌株中,结核分枝杆菌与非结核分枝杆菌菌株的embB基因突变差异无统计学意义(χ~2=0.536,P=20.464)。结论青海地区对乙胺丁醇耐药的结核分枝杆菌常见突变位点为embB306和embB406。单测embB基因不能非常有效地快速检测出乙胺丁醇耐药状况,增加emb A及其调控区的检测,能提高耐乙胺丁醇菌株的检出率。     

结核分枝杆菌北京基因型菌株与耐药表型的关系

目的 研究我国结核分枝杆菌北京基因型菌株的分布以及与耐药表型的关系.方法 2008年4～12月从我国6个区域收集痰涂片阳性的结核病患者的临床分离株,每一患者的一份分离株经生化方法鉴定为结核分枝杆菌复合群.收集患者的性别、年龄、病史、菌株耐药谱和菌株来源资料.药物敏感性实验采用比例法.运用间隔区寡核苷酸分型方法或基因dnaA-dnaN之间插入序列136110鉴定北京基因型菌株.结果 在410份结核分枝杆菌分离株中,67.1%(275/410)的分离株属于北京基因型菌株,东北部区域感染北京基因型菌株患者的比例高于中西部区域(χ2=20.50,P=0.000).患者的年龄、性别和治疗史与感染北京基因型菌株无关.在耐多药菌株和耐利福平菌株中,北京基因型菌株的比例显著高于非北京基因型(P=0.002,P=0.005).结论 患者的年龄、性别和治疗史与感染北京基因型菌株无关,东北部区域北京基因型菌株分布比例显著高于中西部区域.北京基因型菌株与利福平耐药和耐多药有关.     

结核分枝杆菌基因分型及其耐药性分析

目的探讨四川地区结核患者结核分枝杆菌基因分型及其与耐药性关系。方法采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对124株结核分枝杆菌的6个可变重复位点进行检测,并应用Gel-Proanalyzer3.0软件和BioNumerics（Version3.0）软件对检测结果进行基因型分析,同时分析其基因型与耐药之间的关系。结果124株结核分枝杆菌共分为37个不同的VNTR类型,成簇基因型占74.19%（92/124）,单一基因型占25.81%（32/124）。耐药菌株在成簇类型和单一类型的分布上存在统计学差异。结论四川地区结核患者的结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,成簇类型是主要流行菌株,应加强流行结核菌株的监控。     

某地区结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药相关基因突变特征分析

目的了解深圳地区结核分枝杆菌临床分离株利福平和异烟肼的耐药相关基因的突变特点。方法 60株结核分枝杆菌临床分离株通过全自动快速分枝杆菌培养鉴定系统(BACTEC-MGIT960)进行鉴定和药敏分析。在这60株菌株中,针对包括利福平耐药决定区(RRDR)在内的rpoB基因和异烟肼耐药相关位点katG315、inhA-15、kasA269、kasA312进行PCR扩增,并将扩增产物T-A克隆后进行测序。结果在60株结核分枝杆菌临床分离株中,检出利福平耐药株45株,敏感株15株;异烟肼耐药株41株,敏感株19株;利福平和异烟肼同时耐药的有14株。在45株利福平耐药株中,rpoB基因RRDR突变发生率为91.1%(41/45),共检测到12种突变形式,主要突变位点在531、526、516、533,以Ser531Leu突变最常见,占rpoB发生基因突变株的51.2%(21/45)。在41株异烟肼耐药株中,katG315位点有29株发生突变,包括28株katG315(AGC-ACC)和1株katG315(AGC-AAC)突变,突变发生率为70.7%(29/41);inhA-15位点有9株发生突变,均为(C-T)突变,突变发生率为21.95%(9/41)。kasA基因未发现常见突变形式。结论深圳地区结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药相关基因突变位点与国内外研究基本一致,但各位点频率有所不同。     

重庆地区耐多药结核分枝杆菌基因分型特征分析

目的 对重庆地区耐多药结核患者结核分枝杆菌进行基因分型,明确该地区基因类型的特征和流行情况.方法 连续收集重庆市公共卫生医疗救治中心和重庆市第十二人民医院结核内科2013年7月至2015年3月753例临床诊断为耐多药结核患者的痰液或其他体液,采用液体培养法分离培养分枝杆菌,采用PCR方法对分枝杆菌分离株进行菌种鉴定,并使用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple locus variable number of tandem repeat analysis,MLVA)方法进行基因分型.采用Bionumerics Version 3.0和phyloviz软件进行各基因位点的多态性和成簇分析.结果 共分离培养出538例耐多药分枝杆菌菌株,经PCR鉴定确认结核分枝杆菌有503例(95.8％),非结核分枝杆菌有35例(4.2％).北京家族型470例(93.4％,470/503),非北京家族型33例(6.6％,33/503).503例分枝杆菌菌株共分为348个基因型,其中267例患者分离株为单一基因型,其余236例菌株可归入81个簇,成簇率为30.8％.北京家族型有76个簇,成簇率为30.8％,成簇比例为35.9％,非北京家族型有5个簇,成簇率为30.3％,成簇比例为33.3％.不同特征的耐多药结核人群对结核分枝杆菌北京基因型菌株易感因素分析:感染北京基因型菌株与性别无显著性关联(x2=2.68,P ＞0.05);与年龄呈显著性关联(x2 =784.00,P＜0.05).结论 重庆地区耐多药结核分枝杆菌的基因型存在明显的多态性,北京基因型占绝对优势;不同特征耐多药结核人群感染北京基因型菌株与性别无关,与年龄相关.