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相似文献
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目的分析2010年致白城市手足口病流行的肠道病毒71型基因特征。方法对2010年白城市6株EV71分离株VP1编码区基因全长逆转录-聚合酶链反应扩增后进行序列测定,使用Bioedit软件和MEGA 4.0软件进行同源性、基因亲缘关系分析。结果白城市2010年的6株EV71分离株均属于C4a基因亚型,6株白城分离株间的核苷酸同源性为98.6%~100.0%,并形成2个传播链,传播链1的白城4株病毒与吉林省2010年流行株代表株JL-HFM-10-5病毒亲缘关系最近,核苷酸同源性99.7%~100.0%,传播链2的2株白城流行株与2008年的阜阳流行株和2009年的2株吉林省流行株亲缘关系最近,核苷酸同源性99.3%~99.4%。结论 2010年白城市至少有两个EV71传播链致手足口病流行,传播链1的病毒在吉林省内和白城部分县区循环传播导致手足口病的流行;传播链2的病毒已经在国内传播较长时间,提示EV71病毒跨地域迅速而广泛传播特点。  相似文献   

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目的分析吉林省敦化市流行的肠道病毒71型分离株的基因特征。方法对2009-2011年敦化市手足口病来源的3株EV71分离株进行逆转录-聚合酶链反应扩增VP1基因编码区后进行序列测定,并使用Bioedit和Maga4生物信息学软件进行基因特征分析。结果敦化市3株EV71流行株均为C4a基因亚型,3株EV71分离株之间核苷酸同源性为98.6%~98.8%;与吉林省和龙市的流行株核苷酸同源性为98.8%~99.8%,与吉林省其他地区的2株EV71代表株的核苷酸同源性为97.6%~99.3%,与安徽省阜阳市2008年代表株的核苷酸同源性为98.3%~99.3%。敦化市3株EV71分离株之间、与2008年阜阳株以及吉林省2009-2011年3株代表株的氨基酸同源性均达到100%。结论敦化市3株EV71分离株与同为延边州的和龙市的流行株核苷酸同源性最高,与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸也具有较近的同源性。敦化市3株EV71分离株之间以及与中国C4a基因型代表株之间都具有较高的氨基酸同源性。  相似文献   

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2008年珠海肠道病毒71型分子流行病学研究   总被引:6,自引:0,他引:6  
目的 通过扩增VP1节段的核苷酸序列,对2008年珠海暴发流行的EV71进行种系进化分析.方法 选取10例手足口病暴发流行中的EV71阳性病例标本用一对特异引物进行VP1全基因核苷酸序列扩增,由生物技术公司在AB13730型自动测序仪上测序,序列结果用Claxter、DNA Star、Mega软件进行分析.结果 本文的10株病毒与C基因型代表株比较接近,核苷酸同源性在88.2%~99.2%之间,氨基酸同源性在98.7%~99.7%之间;尤其与C4基因型最为相近,与C4基因型相比较核苷酸同源性在97.6%~99.2%之间,氨基酸同源性在99.3%~99.7%之间;而与A、B基因型代表株比较差异较大,核苷酸同源性只在81.8%~84.4%之间,氨基酸同源性在94.6%~98.0%之间;说明本文的10株病毒皆属于EV71病毒C基因型、C4亚型.结论 珠海和新会的病毒株可能与阜阳和浙江分离的EV71病毒有相同的起源,均属于C4亚型,并且C4亚型病毒在中国大陆可能有较广泛的分布和传播,因此加强各地流行的EV71病毒基因特征分析,进而探索EV71病毒的可能进化途径,对于肠道病毒的基础研究和防范EV71在中国的大规模暴发与流行具有重要意义.  相似文献   

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[目的]研究济南地区肠道病毒71型(EV71)的基因特征。[方法]对2010年济南地区手足口病病人的粪便、咽拭子等标本,通过RT—PCR扩增EV71VP1基因片段;选取EV71阳性的18株进行VP1全基因序列测定,用DNAS—TAR、Mega.4.0软件进行同源性分析,并构建系统进化树。[结果]与EV71A型和B型代表株亲缘性较远,核苷酸(氨基酸)同源性分别为81.8%~82.7%(83.7%~85.ooA)和94.3%~94.9%(97.3%~97.6%);与C型代表株亲缘性较近,核苷酸(氨基酸)同源性为87.5%~99.1%(98.3%~100.0%);18株EV71之间在VP1区核苷酸和氨基酸水平上有一定差异,同源性分别为97.1%~100.0%和99.3%~100.0%。构建系统进化树表明,18株EV71与C4亚型处于同一簇,属EV71型C4基因亚型。[结论]20LO年济南地区流行的EV71属肠道病毒71型属C4基因亚型。  相似文献   

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目的了解成都市2010-2013年肠道病毒71型VP1基因变异情况,为疾病防控提供依据。方法选取2010-2013年(上)荧光PCR检测为EV71阳性标本,扩增测序其VP1全长,构建进化树并进行相关生物信息学分析。结果 25份标本基因亚型均为C4亚型,与阜阳株差异不大,核苷酸同源性82.72%~100%,氨基酸同源性为96.29%~100%,氨基酸变异位点11个。结论成都市2010-2013年(上)肠道病毒71型变异不明显,但需关注关键氨基酸突变位点及其可能带来的防控挑战。  相似文献   

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目的了解2010-2011年湖南省郴州市手足口病EV71病毒的基因特征,为手足口病的预防控制提供科学依据。方法从2010-2011年郴州市各县(市、区)送检的手足口病肛拭子标本中随机挑选60份标本采用RD细胞进行病毒分离,采用Realtime—RT—PCR方法检测肠道病毒核酸,挑选14株致细胞病变阳性且EV71核酸检测阳性的标本(其中2010年的4株均为郴州市手足口流行夏季高峰期分离株,2011年的毒株主要为冬季高峰期分离株),采用RT—PCR法扩增出EV71分离株的VP1区片段,随后进行VP1区核苷酸序列测定和分析,并使用生物信息学方法作基因特性分析。结果郴州市14株EV71毒株在生物进化树上与CAa亚型的代表株属同一分支。14株EV71毒株之间核苷酸序列的同源性在96.1%~100.0%之间,氨基酸序列的同源性在99.3%~100.0%之间;与A、B、C各基因型和亚型代表株EV71VP1编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分析表明,郴州各分离株与安徽阜阳2008年毒株C4a亚型代表株(EU703812)的同源性最高,其中核苷酸同源性在91.8%-93.3%之间,氨基酸同源性均为99.3%。14株分离株与安徽阜阳2008年毒株(C4a亚型代表株)VP1区段的氨基酸编码序列进行比较,发现K98E、S283T和A293S3处位点变异,重症病例与普通病例的EV71病毒VPI氨基酸变异无明显差异。结论2010-2011年郴州市手足口病的优势毒株EV71属于C4a基因亚型。郴州市各县(市、区)的EV71亲缘关系近,毒株基因较稳定,未发现氨基酸突变位点与病例类型有关联。  相似文献   

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肠道病毒71型(EV71)自1969年首次分离出来后,已在世界范围内引起了数次爆发流行.EV71是手足口病的主要病因,常引起多种与神经系统相关的严重疾病.目前缺乏有效的抗病毒治疗和高效疫苗,故早期发现和检测尤为重要.此文就EV71感染的流行情况、临床表现、检测技术及治疗等研究作了介绍.  相似文献   

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肠道病毒71型检测方法研究概况   总被引:7,自引:0,他引:7  
肠道病毒71型(EV71)是引起手足口病(HFMD)的重要病原,已在世界范围内引起了多次大流行,并导致了严重的并发症和后遗症,甚至死亡,引起了人们越来越多的关注.此文就EV71的基本特征和检测方法研究概况作了介绍.  相似文献   

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史薇 《职业与健康》2013,(21):2830-2832
目的了解南京市鼓楼区手足口病流行情况,为制定防控措施提供依据。方法收集南京市鼓楼区2008--2012年手足口病发病资料,用描述流行病学方法对资料进行分析。结果南京市鼓楼区2008--2012年共报告手足口病4096例,年均发病率为125.03/10万,无死亡病例。发病率逐年上升,不同年份间发病率差异有统计学意义。病例分布季节性明显,发病高峰位于5—7月。病例主要为5岁以下儿童,发病率男性高于女性。不同街道发病率差异有统计学意义,以江东街道为高。病原检测显示EV71及Cox A16均有发现。结论南京市鼓楼区2008年以来手足口病发病呈逐年上升趋势,病例的时间、地区、年龄和性别分布存在明显差异,针对性防控措施应予加强。  相似文献   

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目的 了解龙岩市大量判定为其他肠道病毒(EV)感染的手足口病(HFMD)样本的病原组成。方法 对龙岩市2011年经Real-time RT-PCR检测判为未分型EV感染的104份HFMD咽拭子样本经RD细胞分离培养后以RT-PCR法检测EV、EV71、CoxA16,对仍不能分型的样本以187/222引物进行扩增,对扩增产物进行纯化回收、克隆、测序,并用Blast程序在线比对判定型别。同时对培养物进行Real-time RT-PCR检测EV、EV71、CoxA16。任一法检出培养物阳性即判为阳性。结果 104份样本中检出EV阳性88份(84.62%),包括29份EV71,4份EV71+CoxA16,3份CoxB5,2份CoxA10,50份仍未能分型。结论 Real-time RT-PCR检测未能分型的HFMD病例中,相当部分(37.18%)还是由EV71所致,临床不应该随意排除该类病例EV71感染的可能,同时还包含CoxB5和CoxA10病毒。  相似文献   

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天津市河北区2008-2009年手足口病流行病学及危险因素分析   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的通过对天津市河北区手足口病患儿生活习惯的分析,进一步了解手足口病的流行趋势和危险因素。方法采用非条件Logistic回归对相关资料进行分析。结果手足口患者的皮疹主要集中出现在手、足、口腔占60%,手足口伴随其他部位的占29%,单纯的手或口或足占11%。影响手足口病发病的危险因素为流动人口(OR=4.507),吮吸玩具的习惯(OR=3.220)。结论手足口患者的皮疹主要集中出现在手、足、口腔;幼儿是流动人口、有吮吸玩具的习惯为患手足口病的危险因素,家长饭前洗手、患儿饭前洗手,晾晒被褥为保护因素。  相似文献   

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