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1.
目的 构建基于长链非编码RNA(lncRNA)的风险模型;研究其预测胶质母细胞瘤(GBM)患者预后和指导临床管理的价值。方法 从肿瘤基因组图谱计划(TCGA)和GSE16011中的GBM转录组表达数据,筛选出在GBM中异常表达的lncRNA。通过单因素Cox回归分析鉴定出与GBM患者生存相关的lncRNA。采用LASSO回归进一步筛选目标lncRNA,最终构建基于lncRNA表达量的风险模型。用KaplanMeier生存曲线评估不同风险组患者在预后方面的差异。整合风险模型和临床病理特征构建列线图,并通过校正曲线和决策曲线分析验证其在实际临床管理中的价值。结果 鉴定出26个肿瘤中差异表达的lncRNA,并筛选出8个与预后相关的lncRNA。通过LASSO回归分析最终确定了7个候选lncRNA,并成功构建基于lncRNA的风险模型。在TCGA和GSE16011数据库中,高风险患者的生存时间显著差于低风险组;同时该模型在预测患者预后方面有良好表现。风险模型和临床病理特征构建的列线图能个体化地预测GBM患者预后,以及指导临床治疗决策。结论 基于lncRNA构建的风险模型能够作为预测GBM预后的生物标志物;并为研究GBM发生发展的潜在机制提供新的思路。  相似文献   

2.
目的探讨长链非编码RNA重编程调节因子(lncRNA-ROR)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及其与病人预后的关系。方法选取2015年6月~2019年6月手术切除的GBM组织145例,取同期颅脑损伤内减压术切除非肿瘤脑组织56例为对照,采用qRT-PCR法检测lncRNA-ROR的相对表达量,根据lncRNA-ROR平均表达水平分为高表达和低表达。术后随访24个月,记录无进展生存期和总生存期。结果 GBM组织lncRNA-ROR表达水平明显低于对照组(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示lncRNA-ROR低表达是GBM生存预后不良的独立危险因素(P<0.05)。生存曲线分析显示,lncRNA-ROR高表达组2年累积无进展生存率(40.12%)与2年累积总生存率(48.56%)明显高于低表达组(分别为16.25%、19.85%;P<0.05)。结论 GBM组织lncRNA-ROR呈低表达,与病人不良生存预后密切相关。这提示检测lncRNA-ROR对GBM病人预后具有一定评估价值。  相似文献   

3.
胶质母细胞瘤(GBM)是中枢神经系统中一种高度侵袭性的恶性肿瘤,预后极差。这种致命疾病的发病机制尚不完全清楚,可能涉及数千个基因、信号和分子成分。大量研究表明,长链非编码RNA(lncRNAs)被选择性地包装、分泌和转移到参与肿瘤微环境中细胞间通信的细胞之间,并可以调节GBM的许多特征,如增殖、自噬、凋亡、侵袭和细胞干性。研究还发现lncRNAs被分泌到循环中,一部分自由循环,一部分被选择性地包装成外泌体,这为临床应用,包括诊断、疗效评价和判断预后提供了很大的希望。本文就lncRNAs在GBM中的研究进展进行综述。  相似文献   

4.
目的采用生物信息分析技术探讨胶质母细胞瘤中和长链非编码RNA GAS5相关的m6A基因的筛选及临床特征分析。方法从开放的癌症基因图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)数据平台下载脑胶质瘤样本转录水平数据。根据TCGA胶质母细胞瘤患者GAS5基因的表达量做相关性分析,筛选出GAS5相关m6A基因。通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)构建加权基因共表达网络,寻找协同表达的基因模块,筛选GAS5共表达的基因。GAS5共表达的基因和GAS5相关m6A基因取交集。CGGA数据库分析筛选出的基因与胶质瘤患者的临床特征及预后之间的关系。结果分析的13个m6A基因中,相关性系数> 0.4,P<0.001,7个基因(HNRNPC、FTO、KIAA1429、ALKBH5、YTHDF2、WTAP、YTHDC2)与GAS5相关,其中HNRNPC、KIAA1429、YTHDF2、WTAP呈正相关,FTO、ALKBH5、YTHDC2呈负相关。通过构建WGCNA网络,筛选GAS5共表达的基因,brown模块共1 292个基因与GAS5相关性最高(cor=0.84,P=1e-200)。HNRNP...  相似文献   

5.
目的 分别构建由自噬相关基因(ATG)与自噬相关lncRNA(ATL)构成的预后模型,预测胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后情况,为其个性化诊疗与基础研究提供依据。方法 利用TCGA数据库中GBM的测序与临床数据,通过单因素Cox回归分析筛选差异表达且具备预后价值的ATG与ATL,之后通过多因素Cox回归分析分别构建预后模型,根据模型计算患者风险值并验证其有效性。结果 GBM组织相较正常组织共筛选到72个差异表达的ATG(上调53个,下调19个)和170个ATL(上调102个;下调68个),单因素Cox回归分析筛选到16个与患者预后相关的ATG和22个ATL,多因素Cox回归分析分别纳入3个ATG与8个ATL构建预后模型。生存曲线显示在2个模型中高风险组生存率远低于低风险组,受试者工作特性曲线证明2个模型均具有较好的预测能力。结论 所构建的2个预后模型可有效预测患者生存情况,并提供个性化诊疗与基础研究参考。  相似文献   

6.
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)LINC01089对小胶质细胞氧糖剥夺/复氧(OGD/R)损伤后表型和炎症反应的影响及其机制。方法 体外培养小鼠小胶质细胞B-V2细胞,OGD/R损伤后,转染lncRNA LINC01089过表达质粒及其空载质粒、沉默质粒siRNA及阴性对照,以及miR-449c-5p模拟物、抑制剂及其阴性对照寡核苷酸。采用qRT-PCR检测M1型小胶质细胞标记物iNOS mRNA和CD86 mRNA、M2型小胶质细胞标记物Arg1 mRNA和CD206 MRNA、lncRNA LINC01089、miR-449c-5p的表达水平;采用ELISA检测细胞上清液炎性因子的含量;采用免疫印迹法检测细胞STAT6蛋白表达水平。荧光素酶报告基因实验验证lncRNA LINC01089与miR-449c-5p以及miR-449c-5p与STAT6的靶向关系。结果 OGD/R损伤后,B-V2细胞lncRNA LINC01089表达水平显著下调,miR-449c-5p表达水平显著上调。荧光素酶报告基因实验结果显示,lncRNA LINC01089靶向负调控miR-449c-...  相似文献   

7.
8.
目的 探讨多形性胶质母细胞瘤(GBM)预后相关的临床因素.方法 回顾性分析160例随访资料完整的GBM,采用Kaplan-Meier法计算生存率及进行单因素分析,Log-rank法进行生存率显著性检验,Cox比例风险回归模型作多因素分析.结果 本组病人术后1年、2年、5年生存率分别是65.3%、34.1%、9.1%.单因素分析显示年龄、肿瘤切除程度、治疗方式是影响GBM生存率的因素.多因素分析显示年龄、肿瘤部位、肿瘤切除程度及治疗方式是与GBM预后相关的独立因素.结论 年龄、肿瘤部位、肿瘤切除程度和治疗方式是影响GBM预后的主要因素,积极的手术治疗和规范化、个体化的综合治疗可有效提高GBM病人的生存率.  相似文献   

9.
目的 探讨苏氨酸/酪氨酸激酶(TTK)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达变化及其作用。方法 计算机检索TCGA数据库,利用生物信息学技术分析GBM组织TTK的表达水平及其与病人生存预后的关系。免疫组化染色分析我院生物样本库中60例脑胶质瘤组织的TTK表达水平。体外培养U251细胞,慢病毒转染构建TTK低表达细胞系,利用Alarma blue试剂盒测定细胞增殖能力,细胞克隆形成实验检测细胞克隆形成能力,流式细胞技术检测细胞凋亡和细胞周期。将不同TTK表达水平的U251细胞接种裸鼠构建移植瘤模型,分析TTK表达水平与移植瘤模型生存期的关系。结果 生信分析结果显示,GBM组织TTK表达水平明显高于低级别胶质瘤及正常脑组织(P<0.05),TTK低表达GBM病人的总生存期更长(P<0.05)。我院60例胶质瘤中,高级别胶质瘤TTK高表达率(69.0%,29/42)明显高于低级别胶质瘤(16.7%,3/18;P<0.05)。下调TTK表达明显抑制U251细胞增殖、促进细胞凋亡(P<0.05)。TTK低表达裸鼠移植瘤模型的生存期明显延长(P<0.05)。结论 GBM组织...  相似文献   

10.
多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM),按Kernohan分类属于星形细胞瘤Ⅲ~Ⅳ级,WHO2007年中枢神经系统肿瘤分类标准将其归类为星形细胞瘤Ⅳ级,占中枢神经系统恶性肿瘤的25%。该病男性发病率高于女性,具有家族聚集倾向。以往研究认为该病平均发病年龄为60岁,但近些年患者呈现出年轻化的趋势。  相似文献   

11.
目的 探讨胶质母细胞瘤(GBM)氧化应激关键基因的表达变化。方法 从UCSC Xena数据库下载167例GBM基因表达谱数据(TCGA-GBM),从GeneCards数据库下载氧化应激基因集(168个氧化应激相关基因);通过富集分析确定差异表达基因(DEGs),建立蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络识别关键基因,利用Spearman相关系数对免疫因子和免疫检查点与关键基因进行相关性分析。结果 鉴定出两种与氧化应激相关的GBM分子亚型(Cluster1和Cluster2),Cluster1型GBM生存期明显高于Cluster2型(P<0.05)。共筛选出54个DEGs,在细胞因子/趋化因子相关功能中显著富集。PPI网络鉴定出10个关键基因,即CSF2、CSF3、CCL7、LCN2、CXCL6、MMP8、CCR8、TNFSF11、IL22RA2和ORM1。大多数免疫因子和免疫检查点与关键基因呈正相关。结论 本文基于氧化应激相关基因将GBM划分为两个亚型,并且筛选出10个氧化应激基因,可能在GBM的发生、发展过程中起重要作用,也可能对GBM预后评估具有一定的价值。  相似文献   

12.
目的筛选原发胶质母细胞瘤放化疗敏感性相关基因,基于相关基因构建原发胶质母细胞瘤患者的预后预测模型并验证。方法回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)2019数据库(102例,试验组)和CGGA数据库(54例,验证组)中术后接受规范放化疗的原发胶质母细胞瘤患者的临床资料及转录组测序数据。在试验组中筛选长生存期亚组(≥18个月,49例)与短生存期亚组(≤9个月,22例)患者的差异基因,进一步将患者的年龄、肿瘤异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、染色体1p/19q共缺失状态、O6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)启动子区甲基化状态以及差异基因均纳入多因素Cox回归分析,筛选其中为独立预后因素的目标差异基因,取其风险比的自然对数作为各基因相应的系数,计算预后风险评分。采用单因素和多因素Cox回归分析法评估预后风险评分是否为独立预后因素;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,log-rank检验比较高风险组(预后风险评分>0分)与低风险组(预后风险评分≤0分)患者生存期的差异。通过Pearson相关性分析筛选与风险评分呈正相关的基因,并对其进行功能富集分析。结果试验组中,长生存期亚组与短生存期亚组患者的性别、年龄、肿瘤切除程度、IDH突变状态、染色体1p/19q缺失状态以及MGMT启动子甲基化状态的差异均无统计学意义(均P>0.05)。长生存期亚组与短生存期亚组比较,9个基因表达量显著升高(均P<0.05),28个基因表达量显著降低(均P<0.05)。采用多因素Cox回归分析法筛选出4个目标差异基因,分别为AKR1C1(HR=0.910,95%CI:0.850~0.974,P=0.006)、CPZ(HR=0.947,95%CI:0.898~0.999,P=0.044)、HIST1H3H(HR=1.299,95%CI:1.025~1.647,P=0.031)以及TBX5(HR=1.104,95%CI:1.034~1.179,P=0.003),其对应的预测模型中的系数分别为-0.0947、-0.0547、0.2624、0.0994。试验组和验证组中,预后风险评分(高风险)均为预后的独立危险因素(试验组中,HR=2.407,95%CI:1.470~3.939,P<0.001;验证组中,HR=2.054,95%CI:1.101~3.830,P=0.024)。试验组和验证组中,高风险亚组(分别为51、22例)患者的总生存期均比低风险亚组(分别为51例、32例)短,差异均有统计学意义(均P<0.05)。功能富集分析结果显示,在试验组与验证组中,与预后风险评分正相关的基因更多地富集在细胞增殖、基因表观遗传学调控、DNA修复及核因子κB信号通路的激活等生物学功能上。结论基于放化疗敏感性相关基因AKR1C1、CPZ、HIST1H3H以及TBX5构建的预后预测模型或可用于预测原发胶质母细胞瘤患者的预后。  相似文献   

13.
目的探讨与幕上大脑半球高级别星形细胞瘤生存预后相关的临床因素。方法回顾接受手术与术后辅助性放疗及化疗的97例高级别星形细胞瘤的临床资料,其中间变性星形细胞瘤(AA)60例,胶质母细胞瘤(GB)37例。随访其生存状况,用Kaplan-Meier单因素生存分析与COX多元回归分析作统计学处理。结果间变性星形细胞瘤和胶质母细胞瘤的无进展生存时间(PFS)分别为18和10个月,两者总生存时间(OS)分别为21和12个月;年龄“≤40岁”与“>40岁”者PFS各为18和10个月,OS各为21和13个月;治疗前“KPS≥80”与“<80”PFS各为15和10个月,OS为18和12个月;术前有抽搐症状与否的PFS各为21和11个月,OS为24和14个月;术前MR检查肿瘤强化与否的PFS各为11和18个月,OS为14和21个月。单因素分析显示,上述各因素与病人PFS和OS相关(P<0.05)。性别、肿瘤直径、肿瘤部位、肿瘤切除程度与病人PFS、OS关系无统计学意义(P>0.05)。COX回归分析显示年龄大小、肿瘤级别的高低、治疗前KPS评分、术前有无抽搐症状是影响预后的显著因素。结论年龄较小、高KPS评分、低病理级别及术前有抽搐症状被提示是高级别星形细胞瘤患者获得较长生存期的保护因素,而性别、肿瘤部位、肿瘤大小和手术切除程度对预后影响无统计学意义。肿瘤强化与预后的关系有待进一步研究证实。  相似文献   

14.
目的 探讨原发性脊髓胶质母细胞瘤的临床特点及其预后影响因素.方法 回顾性纳入2008年1月至2015年12月四川大学华西医院神经外科行手术治疗的14例原发性脊髓胶质母细胞瘤患者,总结其临床特征并分析影响患者预后的因素.结果 14例患者中,近全切除4例,部分切除5例,活检5例.9例术后接受放、化疗,3例仅行化疗,2例未行放、化疗.中位随访时间为15个月(5-26个月),1年和2年生存率分别为79% (11/14)和7%(1/14).中位总生存期(OS)为15个月,中位无进展生存期(PFS)为8个月.单因素Log-rank分析显示,年龄以及是否进行术后放疗均为OS和PFS的影响因素(均P〈0.05);术前Karnofsky功能状态评分(KPS)为OS的影响因素(P=0.033),但并非PFS的影响因素(P=0.106);性别、肿瘤切除程度以及病理学结果均非OS及PFS的影响因素(均P〉0.05).单因素Cox回归分析显示,年龄、术后是否放疗均影响OS和PFS(均P〈0.05);而术前KPS仅影响OS(P=0.046).多因素Cox逐步回归分析显示,术后是否放疗为影响OS和PFS的惟一因素(均P 〈0.05),放疗者较未放疗者的生存期长.结论 原发性脊髓胶质母细胞瘤临床罕见且预后极差.肿瘤切除程度与患者的预后无关,术后联合放疗能在一定程度上延长患者的生存期.  相似文献   

15.
目的探讨儿童胶质母细胞瘤的治疗效果及预后相关因素。方法回顾性分析2010年至2017年间收治的27例18岁以下儿童胶质母细胞瘤的手术、放疗与化疗情况,进行长期追踪随访,并对性别、年龄、手术切除程度,以及放化疗4个预后相关因素进行探讨。结果所有患儿均接受了开颅手术治疗。包括21名男性和6名女性。24例肿瘤位于幕上,其余3例位于幕下。22例肿瘤得到全切除,另外5例得到次全切除,围手术期无病人昏迷和死亡。8例患儿在手术后接受了放疗和化疗,9例接受了单纯的化疗,另外10例未进行任何放化疗。本组病例中位生存时间16个月,6个月总生存率81.5%,1年总生存率59.3%,2年总生存率33.3%,5年总生存率14.8%。男性患儿中位生存时间13个月,女性中位生存时间14个月,在性别上无统计学上的显著差异(P=0.87)。0~10岁组患者中位生存时间11个月,11~18岁组患者中位生存时间14个月,在年龄上无统计学显著差异(P=0.63)。单纯手术组中位生存时间8.5个月,而手术+放化疗组中位生存时间为16个月,两组在预后上有显著差异(P=0.0067)。肿瘤全切组中位生存时间为14个月,而次全切除组中位时间为12个月,虽然无明显的统计学差异(P=0.14),但是获得长期生存的病例均来自肿瘤全切患儿。结论儿童胶质母细胞瘤的总体预后较差,生存时间与性别和年龄无关,术后放化疗对延长生存期具有重要的意义。全切肿瘤不能明显延长患儿生存时间,但是患儿获得长期生存的重要前提。  相似文献   

16.
目的 探讨细胞周期相关基因在胶质瘤患者中的表达及预后价值。方法 利用CGGA数据库筛选与胶质瘤患者预后相关的细胞周期基因,并基于CGGA与TCGA中胶质瘤患者的临床数据,通过LASSO回归分析,构建预测患者生存情况的预后模型。根据计算公式,区分高低风险组患者,组间进行GSEA富集分析与ssGSEA免疫微环境分析。结果 筛选到10个与患者预后密切相关的细胞周期基因,LASSO回归分析纳入4个基因[细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2C(CDKN2C)、姐妹染色单体分离的PTTG1调控因子(PTTG1)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、WEE1 G2检查点激酶(WEE1)]构建预后模型,计算公式为:风险值(risk socre)=(0.008)×CDKN2C表达量+(0.022)×PTTG1表达量+(0.031)×CDK2表达量+(0.127)×WEE1表达量。生存分析显示,高风险组患者生存率低于低风险组,ROC曲线表明,模型在CGGA与TCGA队列中,均具有较好的预测能力。GSEA富集分析显示,高风险组富集到多个细胞周期进程相关的信号通路,提示可能参与胶质瘤的恶性进程。免疫微环境分析表明,高风险组患者的免疫细胞浸润与免疫反应激活程度均高于低风险组。结论 基于细胞周期相关基因的预后模型可较好地应用于胶质瘤患者的预后预测,纳入的关键基因可能是胶质瘤治疗的可靠靶点。 [国际神经病学神经外科学杂志, 2023, 50(4): 15-24]  相似文献   

17.
目的探索与胶质瘤患者预后相关的RNA,并以这些RNA建模以预测患者的生存状况。方法对TCGA数据库中653个胶质瘤的RNA测序数据作单因素生存分析,筛选与患者预后相关的基因;对所得到的基因,利用Lasso回归建模,获得可预测患者生存状况的模型并加以验证;根据模型所得的风险分数,结合临床特征做多因素Cox回归分析,验证模型是否有效且独立于临床特征。结果筛选得到31641个与预后相关的基因,Lasso回归模型中共包含40个基因表达量,多因素Cox回归分析证明模型有效(P 0. 05)且独立于临床特征(P 0. 05)。结论利用RNA测序数据和Lasso回归建模所得模型可预测患者的生存状况。  相似文献   

18.
目的 探讨原发性胶质母细胞瘤预后的危险因素。方法 收集1994~2014年收治的69例原发性胶质母细胞瘤的临床资料及肿瘤标本,以死亡作为随访终点,采用Cox比例风险模型筛选生存期危险因素。结果 本组随访时间为3.0~25.5个月,中位随访时间为11.0个月。单因素分析结果 显示,年龄≥50岁、肿瘤未全切、染色体1p/19q未缺失、异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)未突变为生存期危险因素(P <0.05);Cox多因素分析结果 显示,年龄≥50岁及染色体1p/19q未缺失为独立危险因素(P <0.05)。将危险因素进行量化并分为高、中、低危组,中位无进展生存期分别为3.5、6.5、9.0个月,中位总体生存期为6.5、11.0、15.0个月;3组中位无进展生存期和中位总体生存期均有显著差异(P <0.05)。结论 年龄≥50岁、肿瘤未全切、1p/19q未缺失和IDH1未突变,是影响原发性GBM生存期的危险因素;将GBM生存期危险因素量化后进行分组,可为GBM个体化治疗提供一定帮助。  相似文献   

19.
BackgroundPrimary brain tumors are relatively rare malignancy, with high-grade gliomas (glioblastoma multiforme and anaplastic gliomas) are the most common types. We aimed to evaluate the prognostic value of Prognostic Nutritional Index (PNI), which is calculated by lymphocyte count and albumin, in recurrent glioblastoma patients treated with systemic treatment.MethodsData of 64 patients with recurrent glioblastoma who received systemic treatment and followed in our clinic between 2012 and 2018 was retrospectively collected and analyzed. PNI was calculated as: [(10 × serum albumin (g/dL)) + (0.005 × total lymphocyte count)]. Patients were categorized according to the median PNI value. We investigated the prognostic role of PNI groups, and survival outcomes.ResultsMedian value of PNI was 45.7, and median follow-up duration was 9 months (1–68 months). Median overall survival (OS) was 7.9 months (95%CI: 5.5–10.4). Median OS was significantly longer in patients with PNI > 45.7 compared to patients with PNI  45.7 (13.9 months (95%CI: 10.5–17.4), and 4.6 months (95%CI: 2.5–6.8), p < 0.001, respectively). In multivariate analysis, PNI was found to be an independent prognostic factor for OS [HR:0.41 (95%CI:0.22–0.74), p = 0.03)].ConclusionIn our study, the PNI was found to be an independent prognostic biomarker in patients with recurrent glioblastoma, but further prospective trials are necessary to validate its prognostic role.  相似文献   

20.
目的 探讨影响胶质母细胞瘤患者预后的临床因素.方法 回顾2008年1月至2013年1月于南方医科大学南方医院行显微手术治疗的198例原发胶质母细胞瘤患者的临床资料,对性别、年龄、起病至就诊时间、术前有无癫痫发作、术前KPS评分、肿瘤部位、肿瘤直径、肿瘤是否发生囊变、手术切除程度、术后是否行同步放化疗、术后是否存在颅内感染共11项因素进行生存分析.结果 单因素分析结果示术前有无癫痫发作、肿瘤部位、术前KPS评分、手术切除程度、术后是否同步放化疗、术后是否存在颅内感染对胶质母细胞瘤患者的预后有影响(P<0.05);多因素分析结果示手术切除程度、肿瘤部位、术前KPS评分、术后是否同步放化疗、术后是否颅内感染具有统计学意义(P<0.05).结论 手术切除程度、肿瘤部位、术前KPS评分、术后同步放化疗是影响胶质母细胞瘤患者的主要预后因素,其中手术切除程度是最重要的预后因素;而术后颅内感染的患者生存时间延长,可能与感染诱导的肿瘤免疫有关.  相似文献   

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