阿尔茨海默病患者外周血和海马组织共表达差异基因的生物信息学分析

目的 基于生物信息学筛选阿尔茨海默病（Alzheimer''s disease,AD）患者外周血和海马组织中有共同表达趋势的差异基因,为AD的诊断、治疗靶点的筛选提供新的思路。方法 从基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）下载关于AD的数据集GSE97760（9例AD、10例健康对照）、GSE5281（10例AD、13例健康对照）进行生物信息学分析。分别筛选AD患者外周血和海马组织的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）,并确定2个数据集中有共同表达趋势的DEGs。对共表达DEGs进行基因本体论（Gene Ontology,GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路分析,构建蛋白互作（protein-protein interaction,PPI）网络进一步筛选关键基因,并对关键基因进行验证。结果 基于对2个GEO数据集的综合分析,共筛选出669个共表达DEGs,包括64个上调DEGs、605个下调DEGs,GO和KEGG分析分别揭示了174个关键条目、40个关键通路,主要在RNA聚合酶的转录调控、神经胶质瘤通路等方面显著富集。通过PPI网络进一步筛选出10个与AD相关的关键基因TP53、PTEN、HNRNPC、EIF4G1、SF3B1、SRSF11、PIK3R1、RBM39、LUC7L3、RBM25,其中PTEN、HNRNPC、SF3B1、PIK3R1、LUC7L3在数据集GSE48350中得到了验证。结论 本研究筛选得出的5个值得进一步研究的关键基因（PTEN、HNRNPC、SF3B1、PIK3R1、LUC7L3）,可作为AD诊断的潜在生物标志物。     

基于生物信息学分析食管鳞癌差异基因和预后价值

目的 鉴定食管鳞癌发生发展过程中的核心基因,寻找新的分子靶标.方法 GEO数据库筛选出食管鳞癌数据集GSE20347,GSE20344,GEO2R分析差异基因.利用STRING和Cytoscape建立并修饰蛋白与蛋白相互作用网络,GO功能和KEGG通路富集分析.Cytohubba计算核心基因,TCGA数据验证核心基因的...     

消遥散治疗帕金森病伴抑郁症临床研究

目的:观察消遥散对帕金森病伴抑郁症的临床疗效。方法:治疗组和对照组均应用美多巴片0.125～0.25g,每天3次和氟西汀胶囊20mg,每天1次作为基础治疗,治疗组同时加用逍遥散治疗。结果:治疗组总有效率90.70%,对照组79.07%,两组对比,经秩和检验,U=2.019,P=0.0430.05,差别有统计学意义;两组治疗前后HAMD评分情况比较,治疗组明显优于对照组。结论:消遥散对帕金森病伴抑郁症有较好的临床疗效。     

帕金森病的生物信息学分析及潜在治疗中药的预测

目的 对帕金森病(PD)差异表达基因进行生物信息学分析,并预测潜在治疗中药,为PD的防治提供新的研究方向和思路.方法 采用GEO2R分析PD数据集(GSE22491)、(GSE54536),获得差异基因,利用String进行蛋白质-蛋白质相互作用网络构建,并进行GO和KEGG分析,构建靶点-信号通路网络图,筛选PD发展...     

帕金森病合并抑郁症的研究进展

帕金森病是最常见、最严重的神经疾病之一,典型的运动症状包括静止性震颤,运动迟缓,肌肉强直,姿势和步态不稳定,在疾病后期导致严重残疾,生活质量下降。与PD相关的最常见的精神疾病是抑郁症,合并性抑郁影响了PD的临床表现和预后,增加了PD的治疗难度,但不幸的是抑郁症经常得不到充分的认识和治疗,随着病情的发展对患者及其照顾者的生活质量产生巨大影响。本文对帕金森病与抑郁症的关系、帕金森合并抑郁症的发病因素、帕金森患者合并抑郁症的发病机制以及帕金森合并抑郁症患者的几种非药物治疗方法进行综述。     

帕金森病患者抑郁状况的调查和护理

目的: 调查帕金森病患者抑郁状况,并对其制订出相应的护理措施。方法: 采用Zung氏抑郁自评量表,对50例患者进行问卷调查,并给予对应护理。结果: 抑郁发生率58%,不同性别、年龄和职业间抑郁发生率的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论: 帕金森病患者伴发抑郁发病率高,应加强对该类患者心理支持、用药指导、功能锻练、维护安全等护理。     

帕金森病伴抑郁症的临床特点与脑电图分析

目的:帕金森病伴抑郁症的临床特点与脑电图分析.方法:研究对象选择该院2014年至2016年所收治的30例PDD患者,使用日本光电4418K型脑电图仪对所有患者进行脑电图检查.结果:在30例患者中,患者脑电图表现α波前移/泛化有5例、α波不对称有4例、α波慢化有4例、额区θ波增加有7例、正常图形有10例,异常率为66.67%.脑电图异常和患者年龄以及病程有关,和患者性别无关.结论:帕金森病伴抑郁症的临床特点主要表现为躯体化、焦虑、睡眠障碍、认知障碍、迟缓等方面,而针对PDD患者脑电图其主要表现为α波前移/泛化、α波不对称、α波慢化、额区θ波增加等方面.     

基于生物信息学方法分析影响胆管癌发生发展的差异基因

目的：通过生物信息学的方法挖掘基因综合表达数据库（GEO）中影响胆管癌（cholangiocarcinoma,CCA）发生发展的核心基因,并分析其生物学功能,为CCA的诊断、治疗和评估预后提供理论依据。方法：分析来自GEO数据库中的3个微阵列数据集（GSE32879、GSE45001和GSE76297）。使用GEO2R进行在线差异基因的分析,DAVID进行差异基因的GO和KEGG通路分析。使用STRING和Cytoscape进行蛋白互作网络分析（PPI）和枢纽基因（HUB）的筛选。结果：共筛选出151个上调基因,通过PPI筛选出连接度最高的10个基因,分析发现APOA1、AGXT、F13B、FETUB、FERPINC1、SLC2A2这些枢纽基因过度表达与胆管癌的不良预后相关。结论：通过生物信息学探索的枢纽基因可能在胆管癌的发生发展中起着重要作用,并为进一步研究胆管癌的分子机制提供了一定的理论依据。     

肌层与非肌层浸润性膀胱癌差异基因的生物信息学分析

目的:筛选膀胱癌(bladder cancer,BC)进展关键基因,探讨其生物学作用并为寻找潜在的治疗靶点提供依据.方法:从GEO数据库中检索获取BC患者的基因芯片数据,经R软件筛选肌层浸润性膀胱癌(muscular invasive bladder cancer,MIBC)与非肌层浸润性膀胱癌(non-muscle ...     

帕金森病关键基因及通路的筛选及其生物信息学分析

目的 通过分析帕金森病患者与健康人基因芯片数据,寻找差异基因及其关键通路。方法 利用GEO 数据库中高通量基因芯片数据库筛选出帕金森病患者与健康对照的芯片。采用GO 基因功能注释和KEGG 通路富集分析,筛选出帕金森病的特征基因簇和通路,并进行蛋白质相互作用网络可视化分析。结果 筛选出15 个差异基因及7 个关键节点蛋白。经差异基因分析后,发现神经丝、网格蛋白包被组装及多巴胺受体信号通路富集程度最高。结论 本研究利用生物信息学方法,从不同的角度研究帕金森病的遗传学背景,在基因层面为帕金森病的诊断学标志与精准治疗提供新的思路。     

帕金森病并发抑郁症39例临床分析

目的:探讨帕金森病并发抑郁症的临床特点。方法:对39例帕金森病患者采用采用汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分,评定帕金森病患者是否并发抑郁,以及帕金森病类型与并发抑郁的关系。结果:39例帕金森病患者中23例(59.0%)无抑郁症状,16例(41.0%)出现抑郁症状。其中轻度抑郁9例,占23.1%;中度抑郁5例,占12.8%;重度抑郁2例,占5.1%。病程≤5年并发抑郁5例,占12.9%;<5年伴发抑郁11例,占28.2%;年龄<60岁并发抑郁7例,占17.9%;年龄≤60岁伴发抑郁9例,占23.1%;震颤强直型伴发抑郁10例,占25.6%;少动强直型伴发抑郁6例,占15.4%。结论:帕金森病并发抑郁的发生率明显高于无躯体性疾病患者。抑郁的发生与疾病的病程、类型密切相关。治疗帕金森病并发抑郁症时,应在帕金森病的同时治疗抑郁症。     

基于高通量芯片和生物信息学挖掘多发性骨髓瘤的发病差异基因

目的 筛选多发性骨髓瘤(MM)患者与正常人群之间的差异表达基因(DEGs),探究MM的发病机制,为MM的基因诊断和治疗提供导向.方法 从GE数据库中检索获取MM患者的芯片数据,通过Morpheus在线工具进行芯片数据质量控制和DEGs的筛选,运用DAVID数据库对筛选获得的DEGs行基因富集和通路分析,通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并采用Cytoscape软件行模块分析.结果 共获得16 211个DEGs,包括7 586个上调基因和8 625个下调基因(P＜0.05).基因本体(GO)分析结果表明,生物学过程中上调DEGs主要涉及鞘糖脂代谢等30个功能簇,下调DEGs涉及细胞分裂等163个功能簇;分子功能中上调DEGs主要涉及蛋白质结合等29个功能簇,下调DEGs主要涉及组蛋白结合等59个功能簇;细胞成分中上调DEGs主要集中在细胞溶质等27个功能簇中,而下调DEGs主要集中在核质等78个功能簇中.京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果表明,上调DEGs主要涉及溶酶体相关通路等26条通路,下调DEGs主要涉及DNA复制等27条通路.蛋白互作网络分析示CDK1、TOP2A、A URKB、BRCA1、CHEK1、PTEN、RAD51、GMPS、CDC45和CDKN2A 10个基因为富集程度最高的核心DEGs,模块分析显示得分最高的3个基因模块主要与核分裂、DNA复制和核酸代谢过程相关.结论 通过多种生物信息学方法筛选获得了MM患者和健康对照组的DEGs,并从不同角度阐释了MM发病机制的相关基因及其表达特征,为MM特异性诊断标志和靶向治疗等提供了依据.     

对合并有抑郁症的帕金森病患者进行综合性护理的效果观察

目的：探讨对合并有抑郁症的帕金森病患者进行综合性护理的效果观察。方法：对2011年1月～2013年12月期间我院收治的56例合并有抑郁症的帕金森病患者的临床资料进行回顾性研究。我们将这56例患者随机分为观察组和对照组,每组各有28例患者。在这两组患者住院期间,我院对对照组患者进行常规护理,对观察组患者在进行常规护理（方法与对照组患者相同）的基础上,进行综合性护理。治疗结束后,比较两组患者治疗前后HAMD（汉密尔顿抑郁量表）的评分和治疗的效果。结果：在治疗前,两组患者HAMD的评分相比无显著性差异（P>0.05）。在治疗后,两组患者HAMD的评分均较治疗前有明显的下降,其中观察组患者治疗后的HAMD评分明显低于对照组患者,二者相比差异具有显著性（P<0.05）。观察组患者治疗的总有效率为89.3%,对照组患者治疗的总有效率为75%。观察组患者治疗的总有效率明显高于对照组患者,二者相比差异具有显著性（P<0.05）。结论：对合并有抑郁症的帕金森病患者进行综合性护理可有效地缓解其抑郁症的病情,提高其治疗的效果。此护理方法值得在临床上推广使用。     

帕金森病合并睡眠障碍或抑郁症临床分析

目的探讨帕金森病（PD）伴抑郁症和睡眠障碍对患者临床康复的影响。方法采用汉密顿抑郁量表为抑郁症评定工具对PD伴抑郁症患者进行评分分度。结果PD患者易合并抑郁症状和睡眠障碍,随疾病进展而加重并且直接影响患者生活质量和临床康复,抗抑郁药物治疗结合有效的心理治疗后随抑郁和睡眠障碍的好转,运动障碍症状减轻。结论PD患者伴发抑郁症状发生率高,临床医生必须重视PD合并抑郁症和睡眠障碍,改善帕金森病患者的生活质量,强调整体化,个体化处理,控制病情是治疗的关键。     

基于生物信息学分析艾滋病患者血中相关差异基因

目的 基于生物信息学方法筛选艾滋病(AIDS)相关的关键基因,为后续生物学功能研究提供分子靶标。方法 通过GEO数据库下载基因芯片GSE140713,筛选AIDS患者血样与健康对照血样的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,并且通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),确定其中与AIDS发生发展密切相关的关键基因。结果 GEO数据分析结果显示,AIDS共有1770个DEGs (1128个上调基因,642个下调基因)。GO富集分析结果显示,DEGs主要参与DNA结合转录激活活性、信号受体激活物活性等分子功能。KEGG通路富集分析结果显示,DEGs主要富集于NOD样受体信号通路。经过构建PPI网络分析其重要的功能模块及其关键基因,结果鉴定出5个关键基因可能与AIDS的发生发展相关。结论 本研究筛选出人AIDS血液中5个关键基因(CDK1、BUB1、CCNA2、CCNB1、KIF11),它们可能成为AIDS病毒潜伏期治疗的潜在靶点。     

电针治疗帕金森病并发抑郁症临床研究

目的:观察电针治疗帕金森病并发抑郁症前后血清中多巴胺(DA)及汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分的变化。方法:60例帕金森患者随机分为治疗组和对照组各30例,两组均采用常规治疗,治疗组加用电针治疗。对比两组治疗前与治疗3个月后DA、HAMD评分变化。结果:两组治疗后DA浓度均较治疗前增高,均有显著性差异(P<0.05),且治疗组优于对照组(P<0.05);两组治疗后较治疗前HAMD评分均有所降低,均有显著性差异(P<0.05),且治疗组优于对照组(P<0.05)。治疗组总有效率90.0%,对照组83.3%,两组临床疗效比较有显著性差异(P<0.05)。结论:电针能有效调节帕金森病并发抑郁症患者血清中DA浓度,从而缓解抑郁症状。     

肺腺癌差异基因的生物信息学研究

目的 通过生物信息学筛选出肺腺癌中的差异基因,为肺腺癌分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据.方法 从GEO数据库中选择编号为GSE118370及GSE116959的基因芯片,在TCGA数据库中选择肺腺癌的转录组数据,分别通过R语言下载、整理并筛选出差异表达基因(Differentially expressed ge...     

帕金森病黑质基因的生物信息学分析

目的 挖掘帕金森病黑质改变的关键信号分子,进一步阐明帕金森病发病的生物信息学基础。方法 在GEO数据库中下载并筛选帕金森病黑质的差异表达基因,利用STRING在线数据库构建蛋白与蛋白互作网络分析,运用Cytoscape筛选出关键基因,通过DAVID数据库平台对差异基因进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果 下载得到基因芯片GSE20333的数据,获得63个差异基因,其中5个上调基因,58个下调基因。筛选出PIK3GG、P2RY10、LDHC、INADL等10个关键基因。GO分析显示差异基因主要富集在细胞外、细胞膜。KEGG分析主要设计催乳激素信号通路、造血细胞谱系和癌症中的胆碱代谢等信号通路。结论 本研究得出的关键基因和信号通路可能与帕金森病黑质改变的分子过程有关,为深入研究帕金森病的治疗提供理论参考。     

舒肝解郁胶囊联合氟西汀治疗老年帕金森病伴抑郁症患者的效果

目的:探讨舒肝解郁胶囊联合氟西汀对老年帕金森病伴抑郁症患者的疗效。方法:选取100例老年帕金森病伴抑郁症患者为研究对象,按照随机数字表法分为对照组和观察组,各50例。两组均给予左旋多巴片治疗帕金森病,在此基础上对照组患者采用氟西汀治疗,观察组患者采用舒肝解郁胶囊联合氟西汀治疗,比较两组的疗效、日常生活能力评定量表(ADL)评分、抑郁自评量表(SDS)评分及不良反应发生率。结果:观察组的治疗总有效率为88.00%,高于对照组的72.00%,差异有统计学意义(P<0.05);治疗后,两组ADL评分均升高,且观察组高于对照组;两组SDS评分均降低,且观察组低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);两组不良反应发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:舒肝解郁胶囊联合氟西汀治疗老年帕金森病伴抑郁症的效果优于单用氟西汀,可以有效改善患者病情,且用药安全。