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相似文献
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1.
[目的]了解2010年德阳市手足口病患者中肠道病毒的主要血清型及EV71毒株的基因型别,为德阳市手足口病的预防控制提供科学依据。[方法]采用实时荧光PCR方法对四川省德阳市手足口病疑似病例的68份咽拭子或疱疹液标本进行肠道病毒通用型(EV)、肠道病毒71型(EV71)型和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)的病毒核酸检测。并对2份EV71阳性标本进行VP1区核苷酸序列测序和进化树分析。[结果]68份标本中,CoxA16阳性率41.18%(28/68),EV71阳性率17.65%(12/68),其他肠道病毒阳性率为7.35%(5/68)。2份EV71毒株VP1区的核苷酸序列进化树分析,证实均属C4基因亚型。[结论]2010年德阳市手足口病以CoxA16感染为主,EV71及其他非CoxA16、非EV71肠道病毒并存。2份德阳EV71毒株经VP1区测序证实为C4基因亚型,与中国内地流行株基因亚型一致。  相似文献   

2.
[目的]分析杭州地区手足口病的病原谱构成,并对肠道病毒(EV)71型的VP1基因进行核苷酸和氨基酸的序列的比对分析,了解杭州地区EV71的基因特征。[方法]采集98份手足口病确诊病例的粪便标本,用EV71和柯萨奇病毒A组(CoxA)16型特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定,并选择6例EV71检测结果阳性的标本进行病毒分离并进行VP1基因的特异性扩增并进行测序,结合EV71各亚型的代表株构建系统进化树,并对VP1蛋白的氨基酸序列进行分析。[结果]通过RT-PCR特异性检测,发现EV71阳性结果22份,阳性率为22.4%;CoxA16阳性结果27份,阳性率为27.6%。测序结果表明6株EV71之间的VP1基因核苷酸同源性为92.2%~98.5%,氨基酸同源性为99.0%~100%。通过与各代表亚型进行核苷酸同源性比较后发现此次分离得到的EV71病毒都属于C4亚型。6株EV71与部分亚型代表株间在BCloop区域的氨基酸序列存在着差别,而SP70区域的氨基酸序列则完全一致。[结论]在手足口病患者中,由EV71感染引起的比例越来越大;此外,此次在杭州地区分离的EV71病毒都属于C基因型的C4亚型,尚没有证据说明此次在杭州地区分离的6株EV71毒株的毒力有增强。  相似文献   

3.
目的:对引起一起手足口病聚集性疫情的未分型肠道病毒进行病原学鉴定,并分析其基因型。方法:对采集的标本用Real-time PCR方法检测肠道病毒核酸,并选取其中通用阳性,EV71和CoxA16阴性的标本用自行设计长距离PCR通用引物进行两步法RT-PCR,将得到的PCR产物进行测序,将所得序列在GenBank中进行同源性搜索以确定是何种血清型肠道病毒,同时选取部分标本进行全序列的测定并构建分子系统树,从而确定引起本次手足口肠道病毒为何种基因型。结果:34份标本经Real-time PCR检测,19份标本肠道病毒核酸通用阳性,EV71阴性和COX16阴性,选取其中的10份测定其VP1区序列,经同源性搜索确定为肠道病毒CoxB4,且10标本的序列同源性均在99%以上。全序列测定结果与其他CoxB4进行系统发生分析显示,本次分离到的CoxB4属于第VIII类基因型。结论:引起本次手足口病聚集性病例的病原为肠道病毒CoxB4,第VIII类基因型。  相似文献   

4.
目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%~99.4%,氩基酸同源性为96.6%~100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.  相似文献   

5.
目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%~99.4%,氩基酸同源性为96.6%~100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.  相似文献   

6.
目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%~99.4%,氩基酸同源性为96.6%~100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.  相似文献   

7.
宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析   总被引:2,自引:1,他引:1  
目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%~99.4%,氩基酸同源性为96.6%~100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.  相似文献   

8.
目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%~99.4%,氩基酸同源性为96.6%~100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.  相似文献   

9.
目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%~99.4%,氩基酸同源性为96.6%~100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.  相似文献   

10.
目的调查分析患手足口病儿童的肠道病毒71型以及柯萨奇病毒A组16型的病原学。方法从250例患手足口病儿童中抽选出69例作为病原学分析对象。分析方法:①收集标本。②分离病毒。③血清学鉴定(病毒分离株)。④鉴定Prr—PCR(病毒分离株)。结果55例77份检出标本显示病毒分离株类型:CA16,10例12份检出标本显示病毒分离株类型:EV71。结论手足口病儿童病原主要为:EV71、CA16,因此应当对EV71、CA16加强预防。  相似文献   

11.
目的 分析上海市静安区2007 -2009年手足口病发病情况,并分析2009-2010年静安区监测点儿童手足口病病原型别及肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71) VP1区基因特征.方法 分析上海市静安区2007 -2009年手足口病流行概况;收集2009年4月~2010年12月辖区内儿童医院、幼托机构手足口病患儿咽拭标本,并进行实时荧光RT-PCR检测,确定手足口病病原型别.选择2010年不同月份共19份(含1份重症病例)EV71 PCR阳性标本,接种Vero细胞进行病毒分离培养,并设计特异引物对EV71 VP1全序列进行核苷酸序列测定、比对,构建系统发生树.结果 2008年静安区手足口病发病率明显增高,2009年发病数稳中略降,病例以发生在幼托机构为主.2009年病例咽拭标本实时荧光RT-PCR检测结果显示,柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CoxA16)阳性率为51.0% (52/102),EV71阳性率为15.7% (16/102),其他肠道病毒属阳性率2.9% (3/102);2010年CoxA16和EV71阳性率均为31.3% (36/115),其他肠道病毒属阳性率10.4%( 12/115).19株EV71分离株与2008年安徽阜阳EV71分离株同属C基因型中的C4a亚型,核苷酸同源性达95.0% ~97.1%,氨基酸同源性为95.1% ~98.3%.结论 静安区手足口病发病率2008年明显增高,2009年发病数稳中略降.2009-2010年静安区手足口病主要病原体为EV71和CoxA16,其他肠道病毒属引起的手足口病有所增加,需加强对其他肠道病毒属的鉴定.  相似文献   

12.
目的分析上海市静安区2007-2009年手足口病发病情况,并分析2009-2010年静安区监测点儿童手足口病病原型别及肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)VP1区基因特征。方法分析上海市静安区2007-2009年手足口病流行概况;收集2009年4月~2010年12月辖区内儿童医院、幼托机构手足口病患儿咽拭标本,并进行实时荧光RT-PCR检测,确定手足口病病原型别。选择2010年不同月份共19份(含1份重症病例)EV71 PCR阳性标本,接种Vero细胞进行病毒分离培养,并设计特异引物对EV71 VP1全序列进行核苷酸序列测定、比对,构建系统发生树。结果 2008年静安区手足口病发病率明显增高,2009年发病数稳中略降,病例以发生在幼托机构为主。2009年病例咽拭标本实时荧光RT-PCR检测结果显示,柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CoxA16)阳性率为51.0%(52/102),EV71阳性率为15.7%(16/102),其他肠道病毒属阳性率2.9%(3/102);2010年CoxA16和EV71阳性率均为31.3%(36/115),其他...  相似文献   

13.
目的 探讨2010年济南地区手足口病的病原及流行特征,为手足口病防控提供科学依据.方法 选取济南地区3家代表性医院临床诊断为手足口病的病例为对象,采集患者(包括40例重症病例)发病1周内的粪便、咽拭子等标本共计808例,采用肠道病毒( enterovirus,EV)通用和肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型( coxsackievirus A16,CoxA16)特异性引物进行反转录聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定;选取7例病例标本进行EV7I-VP1区基因的扩增和核苷酸序列测定.结果 808例患者标本中,581例检测结果为阳性(71.91%),其中190例为EV71阳性(32.70%),267例为CoxA16阳性(45.96%),124例检测到其他肠道病毒(21.34%);40例重症患者的感染病原主要为EV71(75.00%).阳性病例中男女性别比为1.42∶1,发病年龄主要集中在4岁以下儿童(85.15%),尤其是2~3岁年龄段(28.34%);全年均有发病,但发病高峰主要集中于4~5月份(36.14%).7株EV71经基因测序,证实均为C4b基因亚型.结论 济南地区手足口病病原以CoxA16和EV71为主,病例多为4岁以下儿童,重症患者主要由EV71感染引起.  相似文献   

14.
吉彦莉  王永全 《现代预防医学》2012,39(11):2817-2819
目的对2009年北京市西城区某哨点医院手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)重症病例特征进行初步分析,通过病原学分子分型鉴定,全面了解其病原构成,为重症HFMD的防控提供基础。方法采集重症HFMD患者咽拭子标本,提取病毒RNA。用实时荧光RT-PCR检测肠道病毒(EV)核酸,并对肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)进行分型检测;用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR(RT-nPCR),通过测序和序列分析对非EV71、非CoxA16型EV进行分型鉴定。结果 2009年4~12月,共采集HFMD重症标本35例,发病时间主要集中在6~8月,多为3岁以下婴幼儿。通过实时荧光RT-PCR检测,8例阴性,27例EV阳性,其中,13例EV71阳性,2例CoxA16阳性;12例非EV71、非CoxA16型EV经半巢式RT-nPCR检测,均扩增出目的片段,其中10例测序成功,并通过NCBI BLAST序列比对确定病毒型别:CoxA5和CoxA10各2例,CoxA2、CoxA4、CoxA6、CoxB5、Echoll、人鼻病毒各1例。结论重症手足口病发病高峰为6~8月,3岁以下婴幼儿为主要发病人群。2009年该哨点医院重症HFMD病原型别多样,以EV71为优势型别。  相似文献   

15.
目的了解保定市2009-2012年手足病(HFMD)病原学变化,为HFMD防控提供实验室依据。方法采用荧光定量RT—PCR方法对HFMD病例咽拭子标本进行肠道病毒通用型、EV71型以及CoxA16型核酸检测,应用Excel和SPSS11.5对结果进行统计分析。结果2577例临床诊断HFMD病例中,检出肠道病毒阳性病例1140例,其中EV71阳性构成比为52.37%,CoxA16阳性构成比为25.88%,其他肠道病毒阳性构成比为21.75%。2009-2011年病原以EV71为主,2012年EV71和CoxA16构成比相当,同时成为主要病原。全年均有阳性病例检出,4—8月为其高峰,阳性病例集中于5岁以下儿童,男性多于女性;但在病原构成上,女性EV71阳性构成比高于男性;CoxA16和其他肠道病毒阳性构成比无性别差异。结论2009-2012年保定市HFMD主要病原是EV71和CoxA16,发病高峰在4—8月,5岁以下儿童为主要防护对象。  相似文献   

16.
[目的]探讨2009—2011年上海市宝山区手足口病病原学特征及诊断意义。[方法]2009年3月—2011年12月连续采集手足口病临床诊断病例的咽拭子、大便样本或肛拭子和疱疹液进行肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CoxA16)和其他肠道病毒核酸检测。[结果]2009—2011年肠道病毒的总检出率分别为59.00%、72.44%和79.00%,重症(死亡)病例中EV71型肠道病毒的阳性检出率为90.91%,明显高于普通病例(χ2=45.97,P<0.001)和聚集性病例的检出率(χ2=56.85,P<0.001);咽拭子、肛拭子或大便样本、疱疹液、咽漱液标本肠道病毒阳性检出率分别为68.02%、86.67%、71.43%、25.00%;咽拭子标本与肛拭子或大便标本和疱疹液标本检测结果符合率为83.53%和100.00%;发病0~4d肠道病毒核酸检出率为79.73%,5~10d肠道病毒核酸检出率为45.61%,差异有统计学意义(χ2=30.91,P<0.001)。[结论]2009—2011年宝山区手足口病感染的主要病原是EV71型和CoxA16型肠道病毒,肠道病毒的检出率逐年提升,且每年的优势型别有所不同;手足口病重症(死亡)病例的主要病原为EV71型肠道病毒;咽拭子、肛拭子或大便样本、疱疹液都有较高的诊断价值;病后4d内采集标本对手足口病诊断效果较好。  相似文献   

17.
目的分析池州地区手足口病的流行病学和病原学特征,为手足口病防控提供科学依据。方法采集2010-03/2010-12池州市各地送检的133例手足口病临床诊断患者的咽拭子,应用RT-PCR技术检测样本中肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)。结果 133例手足口病临床诊断病例咽拭子中,检测到肠道病毒阳性79份,EV71阳性28份,CoxA16阳性24份,EV71和CoxA16的阳性率为21.05%和18.05%。6例手足口病重症病例中,EV71病毒感染病例4例。结论 EV71和CoxA16是2010年池州地区手足口病的主要病原体,而EV71是引起手足口病重症病例的主要类型。  相似文献   

18.
2008年广东省儿童手足口病病原学监测   总被引:13,自引:5,他引:8  
目的监测手足口病的病原体,为预防和控制肠道病毒感染提供依据。方法采集手足口病患儿的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液进行RT-PCR定性,肠道病毒通用引物阳性的标本进行病毒分离;分离株用EV71和CA16的VP1基因的特异性引物进行RT-PCR鉴定。结果共收集患儿标本443份,肠道病毒通用引物阳性259份;做病毒分离256份,阳性150份,其中粪便158份,病毒分离阳性112份,阳性率为70.89%;肛拭子21份,病毒分离阳性10份,阳性率为47.62%;咽拭子65份,病毒分离阳性26份,阳性率为40.00%;疱疹液10份,病毒分离阳性2份,阳性率为20.00%。结论粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹液的分离率有显著差异,粪便分离率最高;EV71和CA16是引起小儿手足口病的主要病原体,死亡病例全部是由EV71病毒引起。  相似文献   

19.
目的探讨北京市手足口病死亡的危险因素,为防制手足口病、减少手足口病死亡提供科学依据。方法收集2010年北京市手足口病重症和死亡病例资料,采用多因素Logistic回归分析对手足口病死亡的危险因素进行分析。结果 2010年北京市报告重症手足口病610例,其中死亡病例18例,重症病例病死率为2.95%。结果显示:患者年龄、户口类型为流动人口、诊断重症病例的医院类型为县医院、到村级(个体)医疗机构就诊和病原检测结果为肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)是重症手足口病死亡的影响因素。结论为减少手足口病死亡病例的发生,应重视1岁以下婴幼儿,流动人口和EV71感染儿童的防控工作,手足口病患者应到正规医院就诊,发现重症早期症状者应立即转诊到具有诊治重症病例能力的医疗机构进行科学规范救治。  相似文献   

20.
目的了解贵州省从江县2011—2012年手足口病流行的主要病原体,为手足口病防控提供科学依据。方法采集临床诊断为手足口病病例的咽拭子采用RT-PCR方法扩增病毒的特异性片段,检测EV71、CoxA16核酸和其他肠道病毒核酸。结果共采集标本81份,病毒核酸检测阳性33份,阳性率为40.74%;其中EV71阳性9份(27.27%),CoxA16阳性4份(12.12%),其他肠道病毒阳性20份(60.61%)。结论从江县2011—2012年手足口病流行毒株以其他肠道病毒为主。但也不能忽视EV71引起的有中枢神经系统并发症的重症病例的监测。  相似文献   

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