广东省2007年度非伤寒沙门菌监测及病原学特征分析

目的 了解广东省腹泻病患者中非伤寒沙门菌感染情况和菌株的血清型别、分布、耐药性变化.方法 对纳入研究的腹泻病患者进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型.结果 2007年度共检测1128份腹泻粪便标本,分离到71株沙门菌,阳性检出率为6.29%;共分得29种血清型,肠炎和鼠伤寒沙门菌居多;大多数沙门菌对常用的头孢类和喹诺酮类抗生素敏感,鼠伤寒沙门菌的耐药率普遍较肠炎和斯坦利沙门菌高;除肠炎沙门菌外,其余的血清型没有同一PFGE型别的菌株;用Xba Ⅰ酶切17株肠炎沙门菌可分为PFGE-XbaⅠ 1～8型,其中PFGE-XbaⅠ 4型为优势型别.用Sfi Ⅰ和Not Ⅰ酶对12株肠炎沙门菌进行再分型,综合用Xba Ⅰ/Sfi Ⅰ/Not Ⅰ三种酶的结果 发现仍有三组菌的PFGE图谱是完全一致的.结论 2007年度广东省非伤寒沙门菌的感染多数为散发病例,头孢类和喹诺酮类抗生素是治疗非伤寒沙门菌感染的首选药物.     

2018年陕西省感染性腹泻患者中分离沙门菌的病原学特征分析

目的 了解陕西省腹泻监测病例中沙门菌的血清型别及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子型别特点。方法 对2018年陕西省14家哨点医院的临床腹泻患者中分离到的沙门菌进行血清学分析,并用Xba I 酶切进行PFGE电泳分析其分子型别特征。结果 2294份病例标本中检出沙门菌101株,检出率4.4%。沙门菌腹泻病例的高发时间为8月和9月,感染人群以≤3 岁婴幼儿为主,101株沙门菌有9株血清型未定,其余92株可分为8 种血清型,其中血清型为鼠伤寒沙门氏菌检出最高,其次为肠炎沙门氏菌。101株沙门菌经XbaI 酶切,可分为71种PFGE 带型,每种带型包含1～10 株沙门菌,其中鼠伤寒沙门菌共产生42 种带型,肠炎沙门氏菌共产生6种带型。结论 陕西省临床腹泻患者沙门菌血清型和PFGE带型呈现多样性,鼠伤寒沙门氏菌是陕西地区的优势菌。本研究建立了陕西沙门菌PFGE指纹图谱库,积累了沙门菌分子流行病学基线数据,为沙门菌引发疾病的处置和溯源提供了重要依据。     

综合医院非伤寒沙门菌感染腹泻患者病原学分析

目的了解综合医院腹泻患者非伤寒沙门菌感染情况,分析非伤寒沙门菌的血清分型、耐药性和分子特征。方法对2009年9月-2011年6月腹泻病患者送检的767份粪便标本进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果从767份腹泻粪便标本中分离到36株非伤寒沙门菌,阳性检出率为4.56%;以儿童为主,占65.71%;共分为10种血清型,主要以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主,分别占37.14%和28.57%;10个血清型非伤寒沙门菌对头孢类和环丙沙星的敏感率>84.00%,除斯坦利沙门菌和山夫登宝沙门菌外,其他血清型均对多种抗菌药物产生不同程度的耐药或交叉耐药;将13株鼠伤寒沙门菌和10株肠炎沙门菌共分离出19个PFGE分型,其中2株肠炎沙门菌PFGE同型,3株鼠伤寒沙门菌PFGE同型,存在不同耐药谱。结论综合医院引起感染性腹泻的非伤寒沙门菌主要为鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,儿童多见;非伤寒沙门菌多药耐药严重,临床在应用氟喹诺酮类治疗非肠外沙门菌属感染时,应根据药敏结果慎重选择。     

脉冲场凝胶电泳技术在鼠伤寒沙门菌分型中的应用

[目的]探讨脉冲场凝胶电泳(PFGE)在鼠伤寒沙门菌分型中的应用。[方法]选择XbaⅠ酶对鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切、脉冲场凝胶电泳。电泳带用Freeview软件进行相似性比较。[结果]13株鼠伤寒沙门菌经PFGE，根据其条带的差异可分为10个PFGE型别。[结论]PFGE法重复实验结果稳定，分型力较强，适合鼠伤寒沙门菌分型应用。     

两起伤寒沙门菌感染暴发流行病原的相似度研究

目的 应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对两起由伤寒沙门菌引起的聚集性暴发流行中所分离到的伤寒沙门菌进行分离鉴定和基因分型,对其病原进行同源性分析和分子流行病学探讨,为科学防治提供实验室检测依据. 方法 用传统方法对11株伤寒沙门菌菌株进行生化、血清学复核鉴定.对确认的伤寒沙门菌菌株,采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱. 结果 11株伤寒沙门菌经PFGE,根据其条带的差异可分为3个PFGE型别. 结论 两起伤寒沙门菌感染为不同亚型所致.     

2005年河南省局部地区伤寒副伤寒沙门菌株脉冲场凝胶电泳分型研究

目的 了解河南省伤寒、副伤寒沙门菌主要流行菌型.方法 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型,NTSYSpc 2.1软件聚类分析.结果 来自河南省两个监测点的伤寒、副伤寒沙门菌6株分离菌,根据XbaI酶切PFGE基因指纹图谱分析,6株菌出现5个PFGE基因型别:甲、乙副伤寒沙门菌,伤寒沙门菌3个PFGE型别.结论明确了2...     

2007年四川省鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源

目的 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术.研究四川省2007年鼠伤寒沙门菌分子流行病学,查找沙门菌污染源,为预测疫情和制定防治措施提供依据.方法 选择Xba I酶对12株鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切,用PFGE对菌株进行分子分型,Bionumerisc统计软件聚类分析.结果 12株鼠伤寒沙门菌用XbaI限制性酶切后,分成5个PFGE图谱类型,其中1个PFGE图谱类型有7株菌株,其指纹图谱的相似性达到100%,该型别占分析菌株的58.33%.其余4个PFGE图谱类型分别有2株菌和1株菌.含7株菌的PFGE图谱型中,源于成都市的菌株4株,攀枝花、自贡和内江市的菌株各1株.结论 PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对鼠伤寒沙门菌食源性疾病的溯源和预警.     

舟山市2018—2020年肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌 PFGE分子分型特征分析

目的 了解舟山市肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特征,为聚集性暴发事件溯源追踪提供依据。方法 用Pulse Net网络实验室标准方法对肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型,并进行聚类分析。结果 舟山市2018—2020年分离到106株肠炎沙门菌和60株鼠伤寒沙门菌,性别比1.1∶1和0.9∶1,集中于每年6～8月(78.3%和80.0%),主要以0～5岁年龄组居多(37.7%和66.7%)。106株肠炎沙门菌分12种带型,菌株间条带相似度84.0%～100.0%;优势带型为P1、P6和P7。60株鼠伤寒沙门菌分53种带型,菌株间条带相似度56.0%～100.0%;各带型包含1～4株菌,B1为优势带型。结论 舟山市肠炎沙门菌PFGE分子分型有明显优势带型,遗传同源性较高;鼠伤寒沙门菌PFGE分子型别众多,条带分散,呈遗传多样性。     

贵港市沙门菌血清型、耐药性及PFGE分型特征研究

目的 了解2021年贵港市哨点医院腹泻患者中沙门菌血清型分布、脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型特征、对抗生素的耐药情况以及腹泻患者（患者株）与生鲜猪肉（猪肉株）中鼠伤寒沙门菌的同源性。方法 对110株患者株与100株猪肉株沙门菌进行血清学分型鉴定,采用微量肉汤稀释法对患者株进行15种药物敏感试验,并应用PFGE对腹泻患者的110株沙门菌、生鲜猪肉中分离出的鼠伤寒沙门菌进行指纹图谱分析。结果 患者株中共分离出12个血清型,鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为优势菌,所占比例分别为62.73%和9.09%;猪肉株中占比最高的也是鼠伤寒沙门菌,共40株（40.00%）。患者株普遍耐药,耐药菌株占比为91.82%,对氨苄西林的耐药率最高（88.18%）;多重耐药率高达83.64%。患者株可分为73种PFGE带型,有13种带型各包含2～6株相同带型;患者株与猪肉株间鼠伤寒沙门菌PFGE条带相似度为53.8%～100.0%,含5组大的克隆群,每组克隆群均含有患者株和猪肉株。结论 贵港市哨点医院腹泻患者中鼠伤寒沙门菌所占比例相对较高;沙门菌耐药较为严重;PFGE指纹图谱具有多样性,存在可能由散发的沙门菌引起食物...     

郑州市腹泻患者S.1,4,[5],12:i:-沙门菌和鼠伤寒沙门菌鉴定与分子分型

目的 对分离自郑州市腹泻患者的S.1,4,[5],12:i:-沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行鉴定和分型,为防控沙门菌引起的突发公共卫生事件提供依据.方法 2020年收集郑州市22家哨点医院腹泻患者分离的沙门菌,采用玻片凝集法和双重PCR法进行血清分型;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型.结果 共纳入67株菌株,经玻片...     

2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的分子型别分析

目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。     

Genomic diversity within phage types of Salmonella enterica ssp. enterica serotypes Enteritidis and Typhimurium

The diversity among 1354 strains of Salmonella enterica subsp. enterica, serotype Enteritidis (n = 847) and Typhimurium (n = 507) isolated in Finland in 1991-2002 (n = 608) and in 2003 (n = 746) were studied. The former strains were studied retrospectively by phage typing and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) harmonized in the European Salm-gene project. The latter strains were studied prospectively, and the results correlated to their antimicrobial susceptibility and association with travel to popular tourist destinations. During both periods, S. Enteritidis phage types (PTs) PT1 and PT4, and S. Typhimurium definite types (DTs) DT1 and DT104 were the major phenotypes. SENTXB.0001 was the dominating single PFGE type among S. Enteritidis strains (40% in 1991-2002; 57% in 2003), and accounted correspondingly for 23% and 63% of the PT1 strains, and 81% and 88% of the PT4 strains. No PFGE types dominated among the S. Typhimurium strains but a correlation was found between certain phage and PFGE types: among DT1 strains, STYMXB.0098 accounted for 66% (1991-2002) and 98% (2003) and among the DT104 strains STYMXB.0001 accounted for 84% and 97% in the two time periods, respectively. Of the S. Enteritidis strains isolated in 2003, 91% were associated with travel, most commonly to Spain, Greece, and Bulgaria. SENTXB.0001 was the major Salmonella PFGE type in these countries. In contrast, most (55%) S. Typhimurium strains were of domestic origin. While only 1.3% of the S. Enteritidis strains were multiresistant and 24% were resistant to nalidixic acid only, 30% of the S. Typhimurium strains were multiresistant. Among the multiresistant S. Typhimurium strains, R-type ACSSuT and PFGE type STYMXB.0001 of the DT104 complex dominated.     

食品中沙门氏菌血清及PFGE分型研究

目的了解吉林省食品中分离的沙门氏菌血清型与脉冲场凝胶电泳（PFGE）基因分型,探索沙门氏菌的分子多态性。方法将从市售鸡肉、鸡胴体、中式凉拌菜及婴儿配方奶中分离出的10株沙门氏菌进行血清学分型、PFGE分子分型,BioNumerics version软件分析比较同源性。结果 10株沙门氏菌血清型分别为4株肠炎沙门氏菌,3株里定沙门氏菌,2株阿贡纳沙门氏菌和1株雷摩沙门氏菌。PFGE聚类分型结果主要分为4型：1型4株,相似度超过95%;2型3株,又分2个亚型,亚型间的相似度为78%;3型2株,相似度为100%;4型1株。结论吉林省食品中沙门氏菌具有不同血清学及PFGE型别,相同来源和血清型的菌株PFGE型别显示高度同源性。     

2006-2011年福建省沙门菌监测菌株血清型分布及耐药性分析

目的分析福建省沙门菌监测病人菌株血清型分布和耐药性情况。方法依据我省制定的沙门菌监测方案,在全省5个地市设立沙门菌监测点开展工作。结果2006～2011年共分离出449株沙门菌,均为肠道沙门菌内的亚种I和亚种HIb,分属于10个群（11个亚群）,39个血清型,其中A～F群占98．89％,鼠伤寒和肠炎沙门菌是我省检出率最高的2种血清型。同时我省新增了1个P群及10个血清型（变种）。鼠伤寒沙门菌仍是我省严重耐药的血清型,沙门菌多数菌株对萘啶酸、链霉素、磺胺、甲氧苄啶、复方新诺明、四环素、氨苄西林有不同程度的耐药,对三代头孢、环丙沙星、阿莫西林＋棒酸多数菌株敏感。结论鼠伤寒和肠炎沙门菌为我省2个主要的血清型,多数菌株对萘啶酸、链霉素、磺胺类、四环素、氨苄西林有不同程度的耐药。     

杭州市2002-2008年甲型副伤寒沙门菌分子分型研究

目的研究2002-2008年杭州市甲型副伤寒疫情分离株的亲缘性,并探讨脉冲场凝胶电泳（PFGE）、多位点序列分型（MLST）在甲型副伤寒沙门菌分子分型中的应用。方法对404株甲型副伤寒沙门菌运用脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分子分型,并用K-B法测定菌株抗生素敏感性。挑选9株甲型副伤寒沙门菌进行多位点序列分型（MLST）以及稳定性试验。结果 404株甲型副伤寒沙门菌可分为6个PFGE型和4个耐药型,P1型和P2型属于同一个克隆系,该克隆系菌株占试验菌株数的99%,分离自临安市的310株菌均为P1型,分离自杭州市西湖区的主要菌型是P2型和P1型。9株甲型副伤寒沙门菌根据SucA位点的差异可分为2个MLST型。结论杭州市2002-2008年的甲型副伤寒疫情由同一克隆系的菌株主导。PFGE、MLST分型方法各有侧重,可互为补充。     

深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌耐药性及脉冲场电泳分子分型研究

目的了解深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌的耐药性和同源性。方法收集深圳市龙岗区2004—2007年肠道传染病和食物中毒样品中的伤寒沙门菌并用生化和血清学方法进行鉴定,采用改良K-B法进行药敏试验,伤寒沙门菌基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,采用脉冲场电泳（PFGE）获得电泳图谱,再利用BioNumerics软件对电泳图谱进行同源性分析。结果共分离到17株伤寒沙门菌,所有菌株均对青霉素和苯唑西林耐药,对第3代头孢菌素、氨基糖苷类、氟喹诺酮类、氯霉素和复方新诺明敏感。64.7%的菌株对3种或以上抗生素中度耐药或耐药。BioNumerics分析结果显示,共有14个不同的PFGE带型出现,除2株以外其余15株分布于3个相似性在85%以上的簇内。结论深圳市龙岗区伤寒沙门菌的耐药已经成为一种非常普遍的现象,需加强监测。氟喹诺酮类和第3代头孢菌素类抗生素在临床上治疗伤寒沙门菌感染仍然可以取得满意效果。深圳市龙岗区可能存在3个伤寒沙门菌的流行克隆,其传播可能是该区伤寒沙门菌发生的主要原因。     

自贡市2007-2010年鼠伤寒沙门菌感染的脉冲场凝胶电泳分析

目的 回顾性分析自贡市2007-2010年分离到的沙门菌菌株,评估分子分型技术在食源性传染病暴发识别和处置中的价值。 方法 对自贡市2007-2010年从食品和腹泻患者中分离的沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用 BioNumerics软件分析菌株之间的相似度。 结果 55株沙门菌中,来源于2007-2008年的10个腹泻患者粪便和2008年的15个皮蛋中的25株鼠伤寒沙门菌菌株PFGE带型相似度为100%,均为P9带型。 结论 感染鼠伤寒沙门菌的皮蛋是导致自贡市2007-2008年10名患者腹泻暴发的污染源,为快速准确识别食源性疾病暴发并及时溯源、控制,应在食品安全监测中普及PFGE等分子分型技术。     

2011—2013年北京某城区感染性腹泻患者致病菌检测分析

目的分析北京某城区2011—2013年感染性腹泻患者致病菌分布及脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱特征,为感染溯源提供依据。方法收集2011年1月—2013年12月该区域肠道门诊感染性腹泻患者粪便标本1 179份,对其培养分离的致病菌进行血清分型及PFGE分析。结果 1 179份标本,共培养肠道病原菌330株,其中检出居前4位的肠道致病菌依次为志贺菌属93株(28.18%)、沙门菌属69株(20.91%)、副溶血性弧菌44株(13.33%)及致泻性大肠埃希菌11株(3.33%)。18株宋内志贺菌PFGE分为8个型别,聚类相似度接近88%;69株沙门菌属细菌分为18个血清型,共41种PFGE型别,其中山夫登堡沙门菌和肠炎沙门菌具有明显的优势带型;23株副溶血性弧菌PFGE型别较为分散。结论 3年间感染性腹泻患者致病菌的血清型和PFGE带型分布较为广泛,应注意沙门菌属和志贺菌属细菌的PFGE优势菌型,警惕其引发的感染性腹泻暴发流行。     

2008-2009年北京市沙门菌流行特征和分子分型

目的 分析2008-2009年北京市沙门菌流行特征及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型. 方法 对2008-2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析;利用PFGE进行分子分型. 结果 北京市2008-2009年沙门菌的流行具有明显季节性,6-9月份高发,共分离菌株84株,占64.1%(84/131);患者年龄多为18～40岁,占46.1%(58/128);男性80例,女性51例,男女比例为1.57:1.137株沙门菌分属于20种血清型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型,分别占46.7%(64/137)和17.5%(24/137).共分71种PFGE带型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都有16种PFGE型别.肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JFGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别. 结论 2008-2009年北京市沙门菌的流行具有性别、年龄和季节性分布特征;PFGE分子型别较多,且存在差异明显的多个克隆系.

Abstract：

Objective To study the epidemiological characteristics and molecular phenotypes of Salmonella by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) in Beijing from 2008 to 2009. Methods A total of one hundred thirty-seven isolates recovered from the WHO Global Samonella Surveillance system and entero clinic surveillance system were identified by biochemical tests and serotyping.The related epidemiological informations were also analyzed.The isolates were further typed by PFGE. Results The prevalence of Salmonella from 2008 to 2009 showed obvious seasonal character.High incidence occurred from June to September,and 64.1% (84/131) isolates were recovered in this period.Patients of 18-40 year-old were 46.1% (58/128) and 80 patients were male and 40 patients were female with the ratio of 1.57:1.These 137 Salmonella isolates belonged to 20 serotypes,including Enteritidis (46.7%,64/137) and Typhimurium (17.5%,24/137) as the dominant serotype.In total,71 PFGE profiles were identified.Four PFGE patterns of S.Enteritidis isolates (JEGX01.CN0001,JEGX01.CN0003,JEGXO1.CN0002,JEGX01.CN0019) and S.Typhimurium pattern of JPXX01.CN0001 were dominant patterns. Conclusion The prevalence of Salmonella from 2008 to 2009 showed distribution characteristics of sex,age and seasons.The numerous PFGE patterns of Salmonella showed diversity of these isolates and different clones existed in Beijing.