蛋白与蛋白相互作用研究的生物信息学进展

通过研究蛋白与蛋白相互作用，从而更好地对蛋白功能进行注释，甚至应用于药物开发，是蛋白组学的主要任务之一。人类基因组的大规模测序和其他各种高通量的生物技术的采用为蛋白质调控网络的研究创造了条件。本文回顾了近年来生物信息学在蛋白与蛋白相互作用方面取得的最新研究成果，对各种计算方法进行了比较，并对该领域今后的发展方向做了预测。     

决定朊蛋白扩散的关键蛋白Hsp104

据医学空间网2007年1月29日报道，美国布朗大学的一项新研究证实，一种蛋白通过“撞击”传染性朊蛋白的聚集体，让朊蛋白像种子一样扩散开来，从而加快了朊蛋白病的进程。[第一段]     

促酰基化蛋白和趋化蛋白受体样蛋白的研究进展

促酰基化蛋白是由脂肪组织分泌的一种碱性小分子蛋白,可刺激脂肪组织摄取脂肪酸,增强原位脂蛋白脂酶活性,增加甘油三酯的储存,降低血甘油三酯水平;还可增加葡萄糖的转运,促进脂肪细胞合成甘油三酯。趋化蛋白受体样蛋白是促酰基化蛋白的特异功能性受体。促酰基化蛋白．趋化蛋白受体样蛋白信号通路的失衡可导致肥胖、代谢综合征和高脂血症等多种疾病。     

β—淀粉样蛋白及Tau蛋白和Alzheimer病关系的研究

β－淀粉样蛋白是一种正常细胞的代谢产物，是因β－淀粉样蛋白前体基国 变或“α－分泌酶”作用后产生的，并与载脂蛋白Ｅ结合而沉积于脑内形成老年斑，新的观点认为α－淀粉样蛋白沉积是Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ病的病因和结果。Ｔａｕ蛋白异常磷酸化可以形成神经原纤维缠结，Ｔａｕ蛋白异常磷酸化的原因可能是促细胞激活蛋白激酶的结果和载脂蛋白Ｅ、ε４与Ｔａｕ蛋白结合，使Ｔａｕ不与微小管蛋白结合，降低其稳定性的结果。     

Ahr蛋白是类风湿关节炎致病蛋白

日本研究人员目前发表研究报告指出，细胞内的芳香烃受体蛋白（Ahr蛋白）对类风湿关节炎形成发挥了关键作用。这一发现将有助于开发治疗类风湿性关节炎的新药物。     

β淀粉样蛋白及其前体蛋白与缺血性脑损伤

β淀粉样蛋白（Ａβ）及其前体蛋白（ＡＰＰ）沉积被认为是Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ病的特征性病理改变之一。近年的研究表明,在缺血性脑损伤后,ＡＰＰ／Ａβ也发生沉积,因此ＡＰＰ／Ａβ可能参与了脑缺血后脑损伤的发生与发展。文章综述了ＡＰＰ／Ａβ在缺血性脑损伤后的表达,作用和机制。     

高血压大鼠心脏细胞骨架蛋白α-微管蛋白和结蛋白

目的探讨高血压大鼠心血管重构时,心肌细胞骨架蛋白α-微管蛋白(tubulin)和结蛋白(desmin)的变化.方法建立腹主动脉缩窄高血压大鼠模型,术后2周、4周用尾动脉测压法观察大鼠血压和心率的变化,术后11周用免疫组织化学和形态计量学方法,观察心血管形态改变、细胞骨架蛋白α-微管蛋白、结蛋白在心脏原位蛋白表达的变化.结果与假手术组比较,高血压大鼠2周和4周血压显著升高[(144.7±4.9比110.0±4.0)mm Hg,P<0.01; (151.4±14.9比114.4±5.5)mm Hg,P<0.01)、心血管重构,细胞骨架蛋白在心脏过表达和聚集、分布异常,而且阳性表达面积和阳性表达面积百分数增大,α-微管蛋白[(102 927.8±20 561.9比18 304.4±9 661.0)μm 2,P<0.01]、结蛋白[(153 271.7±15 193.7 比 48 686.1±14 693.3)μm 2,P<0.01].结论细胞骨架蛋白α-微管蛋白、结蛋白表达上调,参与了高血压心血管重构时心肌细胞骨架重构.     

高血压大鼠心脏细胞骨架蛋白α-微管蛋白和结蛋白

目的探讨高血压大鼠心血管重构时,心肌细胞骨架蛋白α-微管蛋白(tubulin)和结蛋白(desmin)的变化。方法建立腹主动脉缩窄高血压大鼠模型,术后2周、4周用尾动脉测压法观察大鼠血压和心率的变化,术后11周用免疫组织化学和形态计量学方法,观察心血管形态改变、细胞骨架蛋白α-微管蛋白、结蛋白在心脏原位蛋白表达的变化。结果与假手术组比较,高血压大鼠2周和4周血压显著升高[(144·7±4·9比110·0±4·0)mm Hg,P<0·01;(151·4±14·9比114·4±5·5)mm Hg,P<0·01)、心血管重构,细胞骨架蛋白在心脏过表达和聚集、分布异常,而且阳性表达面积和阳性表达面积百分数增大,α-微管蛋白[(102927·8±20561·9比18304·4±9661·0)μm2,P<0·01]、结蛋白[(153271·7±15193·7比48686·1±14693·3)μm2,P<0·01]。结论细胞骨架蛋白α-微管蛋白、结蛋白表达上调,参与了高血压心血管重构时心肌细胞骨架重构。     

促酰化蛋白与促酰化蛋白受体

促酰化蛋白是由脂肪细胞分泌的一种生物活性物质，是调节脂肪功能与脂肪储备的关键因素之一。促酰化蛋白与其效应细胞表面的特异性受体相互作用，在胞内信号转导途径(包括蛋白激酶C途径)参与下，可调控细胞内甘油三酯合成的关键酶-二酰基甘油转酰酶的活性，并影响激素敏感性脂肪酶活性，从而促进细胞内甘油三酯的合成，并调控脂肪细胞的分化及成脂作用。同时，影响糖代谢，调节胰岛素的敏感性。促酰化蛋白代谢途径功能失调，将引起一系列脂质代谢紊乱，并认为与肥胖症、糖尿病和心血管疾病密切相关。     

硫氧还蛋白和硫氧还蛋白相互作用蛋白与糖尿病肾病关系的研究进展

糖尿病肾病(DN)是糖尿病最常见的微血管并发症之一,临床上一旦发生,肾脏损害常呈不可逆进展,透析病人中DN患者占20%~40%[1],故DN的早期诊断及治疗对于改善患者生活质量及预后具有重要的临床意义.     

硫氧还蛋白、硫氧还蛋白相互作用蛋白与消化系疾病的关系

硫氧还蛋白系统是一类具有氧化还原活性的小分子蛋白系统,由硫氧还蛋白(TRX)、还原型辅酶Ⅱ(NADPH)和硫氧还蛋白还原酶(TRX-R)3部分组成,具有调节细胞氧化还原状态、对抗氧化应激、激活转录因子促进细胞生长以及抑制细胞凋亡等作用.硫氧还蛋白相互作用蛋白\硫氧还蛋白结合蛋白2\维生素D3上调蛋白1(TXNIP\TBP-2\VDUP-1)属于硫氧还蛋白结合蛋白的家族成员,通过抑制硫氧还蛋白系统的功能而发挥介导氧化应激、抑制细胞增殖及诱导细胞凋亡等作用,是TRX的负性调节因子.氧化应激与细胞凋亡参与了许多消化系疾病的发生发展.TRX与TXNIP作为氧化应激相关因子,可能在消化性疾病中发挥一定的作用.本文就TRX及TXNIP的结构特点、生物学功能以及与消化系疾病的关系等方面作一综述.     

蛋白电泳凝胶放置时间对蛋白丰度的影响分析

目的利用高分辨力的双向电泳技术检测蛋白电泳后凝胶中的蛋白含量随时间推移的损失情况。方法用双向电泳蛋白裂解液提取鼠疫EV菌株(无毒疫苗株)全菌蛋白并定量。取800μg EV蛋白,平行进行两块双向电泳凝胶电泳,电泳结束后一块凝胶立刻固定并染色,另一块凝胶4℃放置8h后固定并染色,使用ImageMaster 2DElite软件比较分析两块凝胶蛋白点数量及蛋白丰度。结果相比直接固定染色的凝胶,8h后固定染色的凝胶中蛋白点扩散丢失严重,比电泳后直接固定凝胶少346个蛋白点,且部分相邻蛋白点发生融合,含量在20~350ng的低丰度蛋白65.9%因蛋白扩散丢失。结论蛋白凝胶放置8h后大量低丰度蛋白由于扩散会丢失,并直接影响后续免疫印迹、质谱鉴定等实验结果的可靠性。     

β淀粉样蛋白及其前体蛋白与缺血性脑损伤

β淀粉样蛋白 (Aβ)及其前体蛋白 (APP)沉积被认为是Alzheimer病的特征性病理改变之一。近年的研究表明 ,在缺血性脑损伤后 ,APP Aβ也发生沉积 ,因此APP Aβ可能参与了脑缺血后脑损伤的发生与发展。文章综述了APP Aβ在缺血性脑损伤后的表达、作用和机制     

β淀粉样蛋白及tau蛋白相关机制在阿尔茨海默病中的研究进展

<正>阿尔茨海默病(AD)又称老年性痴呆,临床上患者表现为精神状态改变,包括记忆、定向、智力、判断能力及情感障碍和行为失常等。女性发病为男性的2倍,患者常在发病后2~8年死于营养不良、支气管肺炎及全身衰竭[1]。本病的病变以额叶、顶叶及颞叶最明显。主要病理变化有:(1)老年斑(SP),为一种细胞外结构,其中心为β淀粉样蛋白(Aβ)。(2)神经纤维缠结(NFT),以磷酸化的微管相关蛋白tau蛋白为主。此变化是     

SARS-CoV N蛋白研究进展

SARS-CoV(severe acute respiratory syndrome coronavirus)N蛋白是病毒的重要结构蛋白,也是目前倍受关注的蛋白组分.N蛋白位于病毒颗粒的核心,以与基因组RNA结合的形式存在,具有多种重要的生物学功能.本文就近期对SARSCoV N蛋白的研究进展作一综述.     

肝纤维化组织中抗衰老蛋白及抗增殖蛋白的表达及其作用机制

目的探讨肝纤维化大鼠肝组织中抗衰老标志蛋白(RGN)及抗增殖蛋白(PHB)的表达及其作用机制。方法 48只Wistar雄性大鼠随机分为正常对照组(12只)、造模组(36只)。使用猪血清诱导大鼠肝纤维化,造模成功后随机分为肝纤维化组(16只)、CGII干预组(16只)。CGII干预组给予60 mg/ml CGII肌肉注射,肝纤维化组和正常对照组给予等量的等渗盐水肌肉注射,1次/d,连续6 w。取大鼠肝组织行HE和Masson染色;RT-PCR检测肝组织中RGN和PHB mRNA表达,免疫组化检测蛋白表达。结果 HE和Masson染色显示,肝纤维化组大鼠纤维化程度明显高于正常对照组;CGII干预组大鼠肝组织胶原变细、减少,纤维化程度较肝纤维化组明显改善。纤维化组大鼠肝组织中RGN和PHB蛋白表达量明显少于正常对照组(P0.01);CGII干预组RGN和PHB蛋白表达量明显高于纤维化组(P0.01)。肝纤维化组RGN和PHB mRNA表达水平明显低于正常对照组(P0.05);CGII干预组RGN和PHB mRNA表达水平明显高于肝纤维化组(P0.01)。结论 RGN和PHB在大鼠肝纤维化组织中表达降低,与肝纤维化存在相关性。     

糖尿病肾病与硫氧还蛋白及其相互作用蛋白关系的研究进展

随着人们生活行为,饮食结构及人口老龄化的改变,糖尿病(DM)的发病率与日剧增,成为严重威胁人类健康的慢性代谢性疾病,据国际糖尿病联盟统计,2000年全球有DM患者约1.51亿,而估计到2030年全球将5亿人患DM,DM是DM肾病