Role of TMS5: staphylococcal multidrug-efflux protein QacA

Background QacA, a main exporter mediating the multidrug-resistance of Staphylococcus aureus to a variety of antiseptics and disinfectants, possesses a topology of 14 α-helical transmembrane segments (TMS). Our study aimed to determine the importance and topology of amino acid residues in and flanking the cytoplasmic end of TMS5. Methods Site-directed mutagenesis was used to mutate 5 residues, including L146, A147, V148, W149 and S150, into cysteine. A minimum inhibitory concentration (MIC) and transport assay with or without N-ethylmaleimide (NEM) were performed to analyse the function of these mutants. Results All of the mutants showed comparable protein expression levels. MIC analysis suggested that mutant W149C showed low resistance levels to the drugs, but the mutations at L146, A147, V148, and S150C had little or no effect on the resistance level. And the results of the fluorimetric transport assay were in agreement with those of MIC analysis, that is to say, W149C did not allow transport to the substrates to be tested, while the other mutants retained significant transport ability. The reaction of the different mutant proteins with Fluorescein-NEM revealed that the mutant L146C was highly reactive with NEM; the W149C and S150C mutants were moderately reactive; A147C was barely reactive and V148C showed no reactivity. Conclusions The study identified that residues W149 and S150 situated at the interface of the aqueous: lipid junction as functionally important residues, probably involved in the substrate binding and translocation of QacA.     

乳腺癌新辅助化疗疗效预测因子的研究现状

新辅助化疗作为局部晚期乳腺癌的标准治疗方案已经获得一致公认．并且扩展应用到可手术的早期乳腺癌以提高保留乳房手术率。临床研究已证实新辅助化疗后获得病理完全缓解（pathologic conplete remission,pCR）的病人的生存率得到显著的改善。临床试验中还发现10％～35％的乳腺癌病人对新辅助化疗不敏感。对于这些病人来说新辅助化疗在未增加疗效的同时，     

Retraction: Role of helix 5: staphylococcal multidrug efflux protein QacA

Background  Blood culture contamination is a significant adverse event. The aim of this project was to evaluate the efficacy of a strict blood collection procedure in reducing the blood culture contamination rate.

Methods  A prospectively controlled study was performed in two different medical areas in Peking Union Medical College Hospital (PUMCH) for 16 months (from May 2006 to September 2007). In test group, a strict blood collection procedure was carried out by trained nurses with the veinpuncture sites were scrupulously disinfected with 2.5% tincture of iodine plus 70% alcohol. In control group, commonly used procedure in PUMCH was performed with 0.45% chlorhexidine acetate plus 0.2% iodine. Blood culture positive results for 4 target organisms (Coagulase-negative staphylococci, Propionibacterium acnes, Corynebacterium species and Bacillus species) were further assessed by physicians from infectious department to determine whether a sample was true positive (pathogen) or false positive (contamination).

Results  Total 9321 blood culture collections were analyzed. The blood culture contamination rate in test group was significantly lower than that in control group (5/3177 (0.16%) vs. 77/6144 (1.25%); x²=13.382, P <0.001). The most common contaminant was Coagulase-negative staphylococcus (76.83%). The average cultural time during which contaminated samples became positive was longer than that for true pathogen samples (42.0 hours vs. 13.9 hours, P=0.041).

Conclusion  Using a strict blood collection procedure can significantly reduce blood culture contamination rate.

     

survivin、Ki-67、雌激素受体和肿瘤学分级对局部晚期乳腺癌以多西紫杉醇为基础的新辅助化疗的疗效预测作用

目的探讨survivin阳性表达、Ki-67高表达、雌激素受体（ER）阳性表达和高肿瘤学分级在局部晚期乳腺癌患者中为了实施保乳手术而应用以多西紫杉醇为基础的新辅助化疗方案的疗效预测作用。方法68例（Ⅱb—Ⅲb）患者完成了4—6个周期的每3周TAC方案化疗（多西紫杉醇75mg／m^2，吡哺阿霉素60mg／m^2，环磷酰胺500mg／m^2）。化疗前粗针穿刺获得肿瘤组织标本免疫组化方法检测survivin、Ki-67和ER的表达，按照Elston和Ellis标准进行肿瘤学分级，结合临床和病理因素预测疗效。化疗后患者接受保乳手术或者改良根治术。结果68例患者中，总缓解率（ORR）为85％，其中21例（31％）获得临床完全缓解，37例（54％）获得部分缓解，14例（20％）获得病理完全缓解（pCR），37例（54％）实行了保乳手术。）（2检验：survivin阳性表达、Ki-67高表达、高肿瘤学分级（Ⅲ级）分别和高的ORR相关（P值分别为0．007、0．024和0．047），survivin阳性表达和Ki-67高表达和高的pCR相关（P值分别为0．029和0．048），ER和ORR及pCR不相关。多因素Logistic回归分析：survivin阳性表达、高肿瘤学分级和高的ORR相关（P值分别为0．030和0．036），所有因素和pCR无明显相关。结论survivin阳性表达和高肿瘤学分级是以多西紫杉醇为基础的新辅助化疗方案获得高ORR的独立预测因子。     

新辅助化疗后的保乳手术:MD Anderson癌症中心的经验

1 文献类型 治疗。 2 证据水平 2a。     

紫杉醇序贯表阿霉素新辅助化疗联合曲妥珠单抗显著提高病理完全缓解率

4背景 HER-2／neu过度表达的乳腺癌患者在辅助化疗中联合曲妥珠单抗治疗的结果是鼓舞人心的。NSABP B31／NCCTG N9831研究证实曲妥珠单抗辅助治疗复发风险降低52％，死亡风险降低33％，显著提高无进展生存期并延长总的生存时间。HERA研究显示曲妥珠单抗辅助治疗肿瘤复发风险降低46％。在乳腺癌新辅助治疗后，达到病理完全缓解（pathologic complete remission，pCR）是被认为能提高无病生存及总生存的预测因素。然而。在乳腺癌新辅助化疗中，没有研究特别设计HER-2／neu阳性乳腺癌患者联用曲妥珠单抗对病理缓解率的影响。     

SPAG5在原发性乳腺癌中的表达与TEC方案新辅助化疗敏感性的关系

目的 观察精子相关抗原5(SPAG5)在乳腺癌组织中的表达,探讨其表达情况与临床病理因素及TEC方案(T:多西他赛,E:表柔比星,C:环磷酰胺)新辅助化疗疗效之间的关系.方法 收集107例接受TEC方案新辅助化疗的乳腺癌患者化疗前的组织标本,通过免疫组织化学法检测各标本中SPAG5蛋白的表达,结合临床病理因素及新辅助化疗疗效进行分析.结果 107例原发性乳腺癌组织中SPAG5蛋白高表达率48.6％ (52/107),与人类表皮生长因子受体2过表达呈正相关性(P=0.000),与细胞增殖核抗原过表达呈正相关性(P =0.019).SPAG5的表达在患者年龄、肿瘤大小、肿瘤分期、组织学分级、淋巴结状况、雌激素受体及孕激素受体的表达情况中均差异无统计学意义.化疗总体客观缓解(OR)率为70.1％(75/107),其中病理完全缓解(pCR)率9.3％(10/107),SPAG5高表达组OR率为82.7％(43/52),低表达组56.1％(32/57),差异有统计学意义(P=0.006).SPAG5高表达组pCR率为15.4％ (8/44),SPAG5低表达组pCR率为3.6％(2/53),差异有统计学意义(P=0.048).结论 SPAG5作为肿瘤增殖指标,其表达状态对于乳腺癌患者TEC方案新辅助化疗的疗效具有预测作用.     

HER-2表达与乳腺癌不同方案新辅助化疗疗效的关系

目的 探讨HER-2表达与乳腺癌不同方案新辅助化疗疗效的关系,为HER-2阳性患者筛选有效的化疗方案.方法 应用CMF、CEF、NEF 3种化疗方案对132例局部进展期乳腺癌进行新辅助化疗.所有患者完成2个周期新辅助化疗后评价疗效,免疫组织化学SP法检测标本中HER-2的表达.结果 CMF、CEF、NEF三组总有效率分别为39.5%(17/43)、54.3%(25/46)和72.1%(31/43).常见不良反应主要表现为骨髓抑制、胃肠道反应和脱发.CMF、CEF和NEF三组白细胞下降发生率分别为34.9%(15/43)、58.7%(27/46)、60.5%(26/43),CMF组明显低于其余两组.三组其他不良反应均无显著性差异(P＞0.05).CMF、CEF、NEF三组患者化疗前后HER-2阳性表达率均无显著性差异.CMF组HER-2阳、阴性患者总有效率分别为21.1(4/19)、54.2(13/24),差异有显著性(P＜0.05);CEF组HER-2阳、阴性患者总有效率分别为42.9(9/21)、64.0(16/25),NEF组HER-2阳、阴性患者总有效率分别为65.0(13/20)、78.3(18/23),差异无显著性(P＞0.05).结论 新辅助化疗对乳腺癌HER-2表达无影响,HER-2阳性患者对CMF方案不敏感,对CEF、NEF较敏感.     

CEF方案新辅助化疗对乳腺癌患者血浆基质金属蛋白酶-2,-9活性的影响

目的 探讨CEF联合化疗方案的新辅助化疗对乳腺癌患者血浆MMP-2，MMP-9的影响。方法 利用光密度酶谱方法测定乳腺癌患者新辅助化疗期间血浆MMP-2，MMP-9活性水平。结果 新辅助化疗第3个周期后血浆MMP-2，MMP-9活性水平均显著降低（P〈0．01），化疗后部分缓解病例血浆MMP-2，MMP-9活性低于无效病例（P〈0．01）。结论 CEF方案新辅助化疗可能抑制乳腺癌患者血浆MMP-2，MMP-9活性，并且这两种酶的活性的变化可作为判定新辅助化疗疗效的指标。     

进展期乳腺癌术前新辅助化疗86例

目的:探讨进展期乳腺癌新辅助化疗的临床意义. 方法:2000-01/2004-12应用CEF方案对86例Ⅱb-Ⅲ期乳腺癌患者进行新辅助化疗. 环磷酰胺(CTX) 500 mg/m2, d1, d8;表阿霉素(EPI) 50 mg/m2, d1, d8;氟尿嘧啶(5-Fu) 500 mg/m2, d1, d8. 28 d为1个周期,所有患者完成2个周期新辅助化疗后评价疗效. 结果:35例(40.7%)降低了临床分期;4例(4.7%)获得完全缓解(CR),37例(43.0%)部分缓解(PR),全组无疾病进展(PD)者,总有效率(CR PR)为47.7%(43/86). 新辅助化疗2个周期后有24例(28.9%) 未触及肿大淋巴结,腋窝淋巴结总有效率为61.4%(51/83). 副反应为白细胞下降、恶心呕吐和脱发等,患者均可耐受. 结论:进展期乳腺癌新辅助化疗对原发肿瘤和腋窝淋巴结均有较好疗效,不良反应可耐受,值得推广.     

基于机器学习的病理组学特征可预测乳腺癌患者对新辅助化疗的反应

目的：利用病理组学的方法开发用于预测乳腺癌（breast cancer,BC）患者新辅助化疗（neoadjuvant chemotherapy,NAC反应的新型标志物。方法：回顾性纳入211例西南医科大学附属医院的非特殊浸润性BC患者（训练组：155例,验证组：56例）,使用CellProfiler软件提取患者数字病理切片中的高维病理组学特征,利用Mann-Whitney U检验、Spearman相关系数和最小绝对值收敛和选择算子（least absolute shrinkage and selection operator,LASSO）算法进行特征逐层筛选。筛选后的最优特征通过支持向量机（support vector machine,SVM）方法在训练集中开发了病理组学特征（pathomics signature,PS）并在独立验证集中进行验证。PS与单因素有意义的临床病理因素（P<0.05）纳入多因素逻辑回归进行进一步验证。结果：PS的曲线下面积（area under the curve,AUC）为0.749(95%CI=0.672～0.827),验证集中AUC为0.737(...     

乳腺癌新辅助化疗对ER、PR、Her-2 表达的影响

乳腺癌是目前女性恶性肿瘤中发病率最高的恶性肿瘤,且发病率呈逐年递增趋势,新辅助化疗 具有降低乳腺癌患者术前临床分期,缩小原发灶范围,控制远端转移及体内药敏试验的作用,同时为术后辅助 治疗提供指导。乳腺癌同时也是一种激素依赖性恶性肿瘤,临床上通常通过检测乳腺癌组织中的雌激素受体 （ER）、孕激素受体（PR）及人表皮生长因子受体-2（Her-2）来制订术前新辅助化疗的方案及术后是否需 要内分泌或靶向治疗。由于术后的内分泌及靶向治疗主要取决于以上标志物的表达水平,所以在新辅助化疗 作用于残余癌组织中,这些肿瘤标志物的表达是否一致还存在争议,这些标志物表达的变化对于后续治疗方 案的影响尚无定论。该文通过检索阅读相关文献,总结归纳了乳腺癌新辅助化疗对ER、PR 及Her-2 表达的 影响。     

乳腺癌ER、PR、HER2表达与FEC新辅助化疗疗效的相关性研究

目的 探讨乳腺癌雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、人类表皮生长因子受体2(HER2)表达与FEC(5-氟尿嘧啶、表柔比星、环磷酰胺)方案新辅助化疗疗效的相关性.方法 乳腺癌患者在接受FEC方案新辅助化疗前用免疫组织化学法检测乳腺癌组织中ER、PR和HER2的表达情况,新辅助化疗3周期结束后进行疗效评价,分析它们之间的相关性.结果 ER和PR阴性表达组47例,有效率(RR)为80.85%,其中病理完全缓解(pCR)率为23.40%.ER和(或)PR阳性表达组43例,RR为60.47%,其中pCR 率为6.98%.两组RR及pCR率比较,差异均有统计学意义(P＜0.05).HER2阳性表达组32例,RR为65.63%,其中pCR 率为12.50%.HER2阴性表达组58例,RR为74.14%,其中pCR 率为17.24%.两组RR及pCR率比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 ER、PR双阴性者可能较单阳性或双阳性者对FEC方案化疗的敏感性更高.     

查体、超声及钼靶检查对乳腺癌新辅助化疗后病理缓解程度预测价值的比较

目的：通过对查体、超声和钼靶片测量化疗前后乳腺肿物大小的变化与术后病理Miller and Payne (MP)分级的比较,探讨预测新辅助化疗(NAC)后病灶病理缓解程度的方法。方法：选择本科室乳腺癌NAC并手术的患者65例,采用麦默通(14G)行穿刺活检,病理诊断明确后行1～6个疗程TAC方案（多西他赛、多柔比星和环...     

乳腺癌中MCM7的表达及其与新辅助化疗关系的研究

目的探讨乳腺癌新辅助化疗前后MCM7蛋白的表达状况,分析其与化疗效果的关系。方法采用免疫组织化学法检测55例乳腺癌新辅助化疗前后标本中MCM7的表达。结果新辅助化疗有效率为76.36%。化疗前MCM7蛋白阳性表达显著高于化疗后(P<0.01)。化疗有效组(42例增殖期)MCM7蛋白阳性表达显著高于无效组(13例静止期)(P<0.01)。结论ET方案新辅助化疗有较好的疗效,可能通过抑制MCM7蛋白的表达来阻止乳腺癌细胞的增殖。MCM7蛋白高表达者化疗更为敏感,MCM7可作为临床指导乳腺癌化疗并预测化疗敏感性的分子生物学指标。     

吡柔比星或表柔比星联合紫杉醇新辅助化疗治疗局部晚期乳腺癌的随机对照研究

目的观察吡柔比星或表柔比星联合紫杉醇新辅助化疗治疗局部晚期乳腺癌(LABC)的近期临床疗效和毒副反应。方法采用随机对照研究,40例LABC行吡柔比星联合紫杉醇方案(PT组)或表柔比星联合紫杉醇方案(PE组)行新辅助化疗。记录患者每周期肿块大小、术后病理以及毒副反应分度。结果两组患者均接受共6个疗程的化疗。其中39例新辅助化疗2～4个周期后行手术治疗,手术后完成剩余疗程;1例新辅助化疗6周期后行手术治疗。PT组20例病理完全缓解率(pCR)、临床完全缓解率(cCR)以及临床部分缓解率(cPR)分别为10.0%、20.0%和75.0%,PE组为5.0%、30.0%、70.0%,两组总有效率(RR)无统计学差异。化疗过程中两组心脏毒性和造血系统毒性均为Ⅰ～Ⅱ度,且无统计学差异;PT组Ⅲ度胃肠道反应(恶心、呕吐)发生率45.0%,低于PE组的90.0%(P<0.05)。结论吡柔比星或表柔比星联合紫杉类新辅助化疗治疗LABC近期疗效较好,化疗后手术切除率高,心脏毒性及骨髓抑制较轻,但PT较PE方案胃肠道毒副反应有显著改善。     

乳腺癌新辅助化疗疗效与雌、孕激素受体表达的变化

目的:探讨新辅助化疗前后乳腺癌组织中雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)的变化及临床价值.方法:行新辅助化疗的乳腺癌患者123例,术前穿刺取病变部位组织活检和手术时取癌组织标本,采用免疫组化Powervision两步法检测ER、PR的蛋白表达,观察化疗后临床病理特征与新辅助化疗疗效,分析新辅助化疗前后ER和PR蛋白表达变化与临床病理特征的关系.结果:新辅助化疗临床有效率为85.4％,其中CR为28.5％、PR为56.9％及SD为14.6％,术后证实病理完全缓解5例(4.1％);年龄、淋巴结状态、临床分期与新辅助化疗疗效无明显关系(P＞0.05),而肿瘤大小、ER及PR状态与新辅助化疗疗效具有一定关系(P＜0.05),肿瘤越大,ER及PR阴性患者,新辅助化疗效果较好;ER新辅助化疗前阳性表达率低于化疗后(P＜0.05),PR新辅助化疗前阳性表达率与化疗后差异无统计学意义(P＞0.05);ER和PR阳性表达在年龄＜50岁组、肿瘤大小、淋巴结状态及分期组间比较,差异无统计学意义(P＞0.05),仅ER表达在年龄≥50岁组,差异有统计学意义(P＜0.05).结论:乳腺癌ER和PR状态与新辅助化疗疗效可能有关,新辅助化疗可使部分乳腺癌组织中的ER表达发生改变,但对PR表达无影响.     

三维及彩色多普勒超声评估乳腺癌 新辅助化疗疗效的价值

目的 探讨三维超声及彩色多普勒超声在乳腺癌新辅助化疗（NAC）疗效评估中的应用价值。 方法 收集中南大学湘雅医院经病理学证实并行NAC 的乳腺癌患者80 例,化疗前后均行临床评估（触诊）、 二维及三维超声检查,根据化疗前后乳腺肿块变化与病理评估结果进行比较。结果 触诊与病理学评估有 效率比较,差异有统计学意义（P <0.05）。二维、三维超声评估与病理学评估有效率比较,差异无统计学意 义（P >0.05）。NAC 后残存肿瘤二维、三维超声测量体积与病理学测量体积均呈正相关（P <0.05）。有效组 NAC 前后病灶内血流分级变化数、血流阻力指数比较,差异有统计学意义（P <0.05）。结论 三维超声评估 NAC 疗效与病理学评估具有较高的一致性,良好的临床价值可作为乳腺癌NAC 疗效评估的有效方法,乳腺 癌病灶超声血流信号的变化有助于乳腺癌NAC 疗效判断。     

Research and applications: Machine learning for predicting the response of breast cancer to neoadjuvant chemotherapy

Objective

To employ machine learning methods to predict the eventual therapeutic response of breast cancer patients after a single cycle of neoadjuvant chemotherapy (NAC).

Materials and methods

Quantitative dynamic contrast-enhanced MRI and diffusion-weighted MRI data were acquired on 28 patients before and after one cycle of NAC. A total of 118 semiquantitative and quantitative parameters were derived from these data and combined with 11 clinical variables. We used Bayesian logistic regression in combination with feature selection using a machine learning framework for predictive model building.

Results

The best predictive models using feature selection obtained an area under the curve of 0.86 and an accuracy of 0.86, with a sensitivity of 0.88 and a specificity of 0.82.

Discussion

With the numerous options for NAC available, development of a method to predict response early in the course of therapy is needed. Unfortunately, by the time most patients are found not to be responding, their disease may no longer be surgically resectable, and this situation could be avoided by the development of techniques to assess response earlier in the treatment regimen. The method outlined here is one possible solution to this important clinical problem.

Conclusions

Predictive modeling approaches based on machine learning using readily available clinical and quantitative MRI data show promise in distinguishing breast cancer responders from non-responders after the first cycle of NAC.