HLA-DP基因多态性与肺癌遗传易感性研究

目的 探讨人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigens,HLA）DP基因多态性与中国汉族人群肺癌遗传易感性的关联。方法 应用TaqMan探针方法检测401例肺癌患者和843例对照者 rs3077和rs9277535位点基因型,比较不同基因型与肺癌患病风险的关系。结果 采用多因素Logistic回归分析,结果显示rs3077和rs9277535位点突变基因型AA显著增加肺癌的发病风险（调整OR = 1.69,95%CI = 1.16～2.51;调整OR = 1.58,95%CI = 1.10～2.25）;单倍型分析显示,与GG单倍型相比,携带AA单倍型的个体可增加肺癌发病风险（调整OR = 1.41,95%CI = 1.61～1.71）;与携带rs3077 GG+GA and rs9377357 GG基因型的个体相比,携带1～4个危险等位基因的个体发生肺癌的风险显著（P趋势 ＜0.01）。结论 HLA基因多态性与中国汉族人群肺癌的发病风险存在关联。     

CDKAL1基因rs7754840和rs7756992位点多态性与妊娠期糖尿病相关性的Meta分析

目的 评价CDKAL1基因rs7754840和rs7756992位点多态性与妊娠期糖尿病(GDM)的相关性。方法 检索PubMed、EBSCO、中国知网、万方数据库中CDKAL1基因rs7754840和rs7756992多态性与GDM相关性的研究,日期截至2019年10月。采用RevMan 5.3软件进行Meta分析。结果 共纳入9篇病例对照研究,包含病例3 115例,对照4 112例。Meta分析显示,CDKAL1基因rs7754840多态性与GDM有相关性(等位基因模型:OR = 1.19,95%CI:1.10～1.28,P＜0.001;显性模型:OR = 1.26,95%CI:1.07～1.48,P = 0.006;隐性模型:OR = 1.26,95%CI:1.10～1.44,P = 0.0007),亚组分析中国人群rs7754840多态性与GDM有相关性(等位基因模型:OR = 1.15,95%CI:1.06～1.25,P = 0.0008;隐性模型:OR = 1.18,95%CI:1.01～1.36,P = 0.03)。CDKAL1基因rs7756992多态性与GDM无相关性(5个模型均P＞0.05),中国人群也显示rs7756992位点多态性与GDM无相关性。结论 CDKAL1基因rs7754840位点多态性与GDM的发病风险有显著相关性,但未发现rs7756992位点多态性与GDM易感性有关。     

硒蛋白单核苷酸多态性与幽门螺旋杆菌感染的关联性

目的 探讨硒蛋白S（selenoprotein S,SelS）rs34713741位点、硒蛋白P（selenoprotein P,Sepp1）rs7579位点单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）与幽门螺旋杆菌（Helicobacter pylori,Hp）感染的关联性。方法 采用等位基因特异性PCR（allele - specific PCR,AS - PCR）技术检测195例Hp感染者和200例对照者SelS（rs34713741）、Sepp1（rs7579）SNPs,统计分析其与Hp感染的关系。结果 rs34713741位点SelS基因SNP与Hp感染存在关联（P＜0.05)。与C等位基因携带者相比,携带T等位基因者感染Hp风险增高1.578倍（OR = 1.578,95%CI:1.191～2.091）;与CC基因型者相比,CT和TT基因型者感染Hp风险均增高（OR = 1.890,95%CI:1.134～3.148;OR = 1.807,95%CI:1.140～2.864）;rs7579位点Sepp1基因SNP与Hp感染无关联（P＞0.05)。结论 SelS基因rs34713741位点T等位基因提高了Hp感染风险,是Hp感染遗传易感基因。     

硒蛋白S基因多态性与布鲁氏菌病遗传易感性的关联性

目的 检测内蒙古包头地区布鲁氏菌病患者硒蛋白S（selenoprotein S,SelS）基因rs28665122、rs34713741位点基因型和等位基因分布频率,探讨SelS基因多态性与本地区布鲁氏菌病患者遗传易感性的关联性。方法 采用一种快速点突变检测技术-等位基因特异性PCR（allele - specific PCR,AS - PCR）技术检测32例慢性期布鲁氏菌病患者和30例健康对照者SelS基因（rs28665122、rs34713741）基因型和等位基因分布频率。结果 布鲁氏菌病患者组与对照组SelS基因rs28665122位点GG、GA、AA基因型及G、A等位基因频率比较无统计学差异（χ2分别为0.203,0.852,均P＞0.05 ）;rs34713741位点CT、CC、TT基因型和C、T等位基因分布频率比较存在统计学差异（χ2分别为9.209,6.580,均P＜0.05）,与C等位基因相比,携带T等位基因者感染布鲁氏菌风险增高3.194倍（OR = 3.194,95%CI:1.489～6.847）,与CC基因型相比,CT和TT基因型者感染布鲁氏菌风险均增高（OR = 3.273,95%CI:0.876～12.223;OR = 4.364,95%CI:1.217～15.641）。结论 本地区布鲁氏菌病与SelS基因rs34713741位点基因多态性有关联,T等位基因可能是其风险易感基因。     

女性脑卒中与纤溶酶原激活物抑制剂1基因关系

摘要:目的　探讨口服避孕药（Oral Contraceptive,OC）暴露、纤溶酶原激活物抑制剂1（Plasminogen Activator Inhibitor-1,PAI-1）基因多态性联合作用与中国女性脑卒中发病风险的关系。方法　采用Taqman-MGB方法和普通聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction,PCR）方法检测PAI-1位点各基因型频率。结果　服用OC女性脑卒中发病风险明显升高（OR＝1.31;95%CI:1.01～1.71）。与4G4G基因型相比,携带rs1799889位点5G/5G基因型显著降低梗塞型脑卒中的发病风险（OR＝0.35;95%CI:0.18～0.67）。与未服用OC且不携带4G等位基因的妇女相比,服用OC同时携带rs1799889位点5G等位基因可降低梗塞型脑卒中的发病风险（OR＝0.53;95%CI:0.34～0.83）。结论　服用OC会显著增加中国女性脑卒中的发病风险;PAI-1基因多态性与中国女性梗塞型脑卒中发病有关;OC与PAI-1基因多态性之间的联合作用会与女性脑卒中的发病风险存在关联。     

RTEL1基因多态性与冠心病患病风险的相关性研究

目的研究RTEL1基因多态性与冠心病(CHD)患病风险的相关性。方法选择2015年1月至2016年12月于西安医学院第二附属医院就诊的符合入选条件的CHD患者共300例,以及健康对照人群300例,分别采集血样。采用Mass ARRAY方法对RTEL1基因上rs6089953、rs6010620、rs6010621、rs4809324和rs2297441共五个位点的基因型进行测定,用SPSS 19.0软件统计基因多态性与CHD患病风险的相关性。结果采用χ2检验比较病例对照两组间各位点的等位基因频率差异,结果显示RTEL1基因上的rs6010620位点的等位基因"G"与降低冠心病患病风险具有相关性(OR=0.776,95%CI:0.649~0.928,P=0.005)。引入遗传模型后,结果显示rs6010620位点在隐性模型下,携带G/G基因型的个体患冠心病风险显著降低,是携带A/A和G/A基因型的0.49倍(OR=0.49,95%CI:0.30~0.80,P=0.0039);rs4809324在隐性模型下,携带C/C基因型的个体患冠心病风险显著降低,是携带T/T和T/C基因型的0.3倍(OR=0.30,95%CI:0.11~0.83,P=0.015);rs2297441在显性模型下,携带A/G和A/A基因型的个体患冠心病风险显著降低,是携带G/G基因型的0.62倍(OR=0.62,95%CI:0.43~0.91,P=0.014)。连锁不平衡分析发现,由rs6010620,rs6010621和rs4809324三个位点组成的GTT单体型与降低冠心病风险显著相关(OR=0.03,95%CI:0.01-0.12,P0.0001),结论 RTEL1基因上rs6010620、rs4809324和rs2297441三个位点与降低冠心病患病风险显著相关。     

白介素-10基因多态性与结核病易感性的病例对照家系研究

目的探讨IL-10基因-1082G/A的基因多态性与肺结核易感性的关系。方法通过家系病例对照设计,用聚合酶联反应-限制性片段长度多态性检测IL-10基因rs1800896位点,分析基因型和等位基因的频率在病例家系人群和对照家系人群及其一级亲属中的分布差异;采用logistic回归模型进行所研究基因的遗传变异与结核病发病风险的关联性分析。结果 180例样本中病例家系组有28组,共89人,患病人数为41人,一级亲属患病23人;对照家系组有35组,共91人。对于IL-10基因rs1800896位点,与A等位基因携带者相比,携带G等位基因的个体结核病发病风险显著增高(OR=4.48,95%CI=1.14-17.61)。结论 IL-10基因rs1800896位点可能为结核病的易感位点,与A等位基因携带者相比,携带G等位基因的个体结核病发病风险显著增高。     

TERT基因rs2736100位点多态性与中国人群肺癌易感性关联的Meta分析

目的探讨TERT基因rs2736100位点多态性与中国人群肺癌易感性的关联。方法检索PubMed、CNKI、万方、维普等数据库,收集以中国人群为研究对象的关于rs2736100位点多态性与肺癌易感性关联的文献,用RevMan 5.0软件进行Meta分析,并评估文献的发表偏倚。结果最终纳入12篇文献,累计病例组8 651例,对照组11 484例。Meta分析结果显示,rs2736100位点的等位基因模型(G vs T)增加了肺癌的易感性[OR=1.23,95%CI:1.18～1.28,P0.01]。进一步根据基因分型进行分层研究,结果表明显性基因模型(GG+GT vs TT)[OR=1.31,95%CI:1.24～1.40,P0.01]、隐性基因模型(GG vs GT+TT)[OR=1.30,95%CI:1.21～1.40,P0.01]、共显性基因模型(GG vs TT)[OR=1.50,95%CI:1.38～1.63,P0.01和共显性基因模型(GT vs TT)[OR=1.26,95%CI:1.18～1.35,P0.01]均增加了肺癌的易感性。结论 TERT基因上的rs2736100位点多态性与中国人群肺癌的易感性密切相关,携带有rs2736100-G等位基因的基因型增加了肺癌的发病风险。     

白细胞介素 - 1α基因rs3783553插入/缺失多态性与肿瘤遗传易感性关系评价

目的 探讨白细胞介素 - 1α（interleukin - 1α,IL - 1α）基因插入/缺失（Ins/Del,I/D）多态性rs3783553与肿瘤易感性的关系。方法 截至2020年6月30日,联合应用NCBI PubMed、中国知网（CNKI）、万方和中国生物医学文献数据库（CBM）,检索rs3783553与肿瘤易感性相关研究。以合并优势比(OR)及其95%置信区间（CI）,估计rs3783553与肿瘤遗传易感性关系。结果 共纳入15篇研究,包含肿瘤患者5 968例、非肿瘤对照6 955例。meta分析结果显示,rs3783553与肿瘤易感性显著关联,在显性模型（II/ID vs DD:OR = 0.78,95%CI: 0.70～0.87）、隐性模型（II vs DD/ID:OR = 0.63,95%CI: 0.54～0.73）、纯合子模型（II vs DD:OR = 0.56,95%CI: 0.46～0.67）、杂合子模型（ID vs DD:OR = 0.85,95%CI: 0.77～0.94）和等位基因模型（I vs D:OR = 0.78,95%CI: 0.72～0.85）下,I等位基因可降低个体罹患肿瘤的风险。结论 IL - 1α rs3783553 I/D多态性可影响个体对肿瘤的易感性,I等位基因是预防肿瘤发生的保护性遗传因素。     

尼古丁受体基因rs1051730多态性 与慢性阻塞性肺疾病的Meta分析

摘要:目的　探讨尼古丁乙酰胆碱受体α3亚基（α-3 nicotinic acetylcholine receptor,CHRNA3）基因rs1051730位点多态性与慢性阻塞性肺疾病（Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD）发病风险的关系。方法　检索PubMed、CNKI等中、英文数据库,收集有关rs1051730位点多态性与COPD关联性的病例对照研究,提取相关数据进行Meta分析,计算OR值及其95%置信区间（95% Confidence Intervals,95% CI）,根据研究对象种族进行亚组分析。结果　共有7篇文献纳入本研究,累计病例数5259名,对照组11913名。Meta分析结果显示,在显性遗传模型（CT+TT vs CC）条件下,rs1051730与COPD发病风险相关（OR＝1.22,95% CI＝1.12～1.32,P＜0.001）;亚组分析结果显示,该关联性仅存在于欧洲人种中（OR＝1.11,95% CI＝1.12～1.32,P＜0.001）,而在中国汉族人群中,rs1051730与COPD无关联（OR＝1.23,95% CI＝0.90～1.67,P＝0.191）。等位基因模型（T vs C）和隐性模型（TT vs CT+CC）条件下均得出类似结论。结论　CHRNA3基因rs1051730位点多态性与欧洲人群COPD发病相关,携带T等位基因能够显著增加COPD的发病风险。     

Regulome - SNP: shc1 rs11264233与延边地区原发性肝癌风险性的研究

目的 探讨shc1 rs11264233与延边地区肝癌风险性的关系。方法 选取延边地区599名肝癌患者和599名健康对照组人群为研究对象。采用PCR - RFLP方法检测基因型及等位基因分布频率。二元logistic 回归模型分析shc1 rs11264233位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 shc1 rs11264233位点存在G和A两种等位基因,GG、GA和AA基因型。shc1 rs11264233位点基因型符合哈迪-温伯格遗传平衡规律。共显性模型中与携带GG基因型的个体相比携带AA基因型的个体更容易患PHC（调整OR = 1.512,95% CI:1.087～2.102,P = 0.014）,隐性模型中AA基因型PHC组风险度显著高于GG和GA组合型中（调整 OR = 1.461,95% CI:1.101～1.940,P = 0.009)。结论 shc1 rs11264233位点单核苷酸多态性与延边地区肝癌风险有明显相关性。     

中国老年人HDAC9和PPP3CA基因多态性与衰弱的关联

  目的  探讨组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9, HDAC9) rs2074633及钙调神经磷酸酶催化亚基A(calcineurin catalytic subunit A, PPP3CA) rs17030795的多态性与中国老年人衰弱发生的关联。  方法  本研究纳入衰弱组665例,对照组3 388例。基于基因型频率及五种遗传模型(共显性、加性、显性、隐性和超显性),评估rs2074633及rs17030795多态性与衰弱之间的关联。  结果  在共显性模型中,与携带rs2074633 TT基因型相比,携带TC型(OR=1.99,95% CI: 1.36~2.90)、CC型(OR=2.15,95% CI: 1.48~3.13)的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95% CI: 1.11~1.47)、显性(OR=2.07,95% CI: 1.44~2.98)及隐形模型(OR=1.21,95% CI: 1.01~1.45)中rs2074633多态性均增加衰弱的发生风险;在共显性模型中,与携带rs17030795 AA基因型相比,携带AG(OR=1.72,95% CI: 1.19~2.51)、GG(OR=1.98,95% CI: 1.37~2.87)型的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95% CI: 1.11~1.48)、显性(OR=1.85,95% CI: 1.29~2.66)及隐性(OR=1.25,95% CI: 1.04~1.50)中rs17030795多态性均增加衰弱的发生风险。   结论  HDAC9 rs2074633及PPP3CA rs17030795多态性与中国老年人衰弱发生风险有关。     

中国七省人群PPARγ2基因Pro12Ala多态性与肥胖相关性的Meta分析

目的 探讨中国人群过氧化物酶体增殖子激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptor γ,PPARγ)2基因 Pro12Ala 多态性与肥胖发病风险的关系.方法 以"过氧化物酶体增殖子激活受体 γ2"、"PPARγ2"、"pparg2"、"peroxisome proli...     

Keap1 rs11668429和 AHSA2 rs728825与延边地区原发性肝癌发病风险的研究

目的 探讨Keap1 rs11668429和AHSA2rs728825与延边地区肝癌易感性的关系.方法 选取延边地区192名肝癌患者为病例组、190名健康人为对照组进行研究.采用PCR-RFLP方法检测基因型及基因频率.采用二元logistic回归模型分析Keap1 rs11668429位点和AHSA2rs728825...     

FTO基因单核苷酸多态性与2型糖尿病发病风险的相关性研究

目的探讨FTO(fat mass and obesity associated)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与中国人群Ⅱ型糖尿病(Type Ⅱ Diabetes Mellitus,T2DM)易感性的关系。方法利用Sequenom Mass ArrayiPLEX系统对238例T2DM患者及239例健康对照的FTO基因单核苷酸多态性位点rs8050136进行基因分型,并对检测结果根据共显性、显性模型、超显性和隐性模型进行χ2检验和非条件Logistic回归分析。结果 FTO基因rs8050136位点在病例组和对照组的基因型频率分布差异在显性模型和超显性模型中有显著性(χ2=8.603,P=0.003;χ2=5.428,P=0.02)。相对CC基因型而言,CA杂合型和CA-AA基因型均能增加T2DM发病的危险性,(OR=1.751,95%CI:1.129～2.717,P=0.012;OR=1.915,95%CI:1.241～2.954,P=0.003);而两组间等位基因频数分布也有显著性差异(χ2=10.614,P=0.001),相对于C位点而言,A位点是T2DM的危险等位位点,(OR=1.933,95%CI:1.298～2.880,P=0.001)。结论 FTO基因单核苷酸多态性rs8050136与T2DM的发病风险相关,CA杂合型和CA-AA基因型可显著增加T2DM的发病风险。     

MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒遗传易感性关系

目的探讨MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒易感性的关系。方法采用病例-对照研究,以268名苯中毒工人为病例组,268名接触苯而没有中毒表现的工人为对照组。应用TaqManPCR分析技术判定MPO(rs7208693),NQO1(rs1800566),GSTP1(rs947894)和UGT1A6(rs6759892,rs1105879,rs4124874,rs3755319,rs887829和rs4148323)基因型。结果携带GSTP1基因rs947894G等位基因个体患慢性苯中毒的危险性比AA基因型个体降低0.657倍(95%CI0.434~0.994,P=0.046);携带MPO基因rs7208693A等位基因人群中,UGT1 A6 rs6759892G等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT基因型的2.702倍(P=0.024),UGT1 A6 rs1105879C等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT型的2.619倍(P=0.035)。在饮酒人群中,携带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加9.000倍(95%CI1.460~55.478,P=0.021);在吸烟人群中,带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加7.000倍(95%CI1.555~31.575,P=0.012)。单倍型分析显示,本人群携带UGT1A6基因TACGGG单倍型个体慢性苯中毒的发病风险是携带TAATGG单倍型个体的1.446倍(OR=1.446,95%CI1.005~2.080,P=0.046)。结论同时携带MPO基因rs7208693A和UGT1A6基因rs6759892G或rs1105879C等位基因型个体对苯中毒易感;携带NQO1基因rs1800566TT基因型且同时吸烟或饮酒的个体对苯中毒易感;携带UGT1A6基因TAATGG单倍型个体可增加慢性苯中毒的发病风险;GSTP1基因多态与慢性苯中毒遗传易感性的关系仍需进一步研究。     

GSTM1基因多态性和环境因素的交互作用与食管癌关系的研究

[目的]探讨GSTM1基因多态位点和环境因素的交互作用与新疆地区汉族食管癌之间的关系。[方法]采用病例对照的研究方法,应用聚合酶链式反应——连接酶检测反应(PCR-LDR)技术,分别对GSTM1基因缺失型和rs2071487两个多态位点进行检测。[结果]GSTM1基因缺失/非缺失基因型在病例组和对照组之间的分布差异有统计学意义(χ2=14.67,P=0.000),即携带缺失型基因型者发生食管癌的风险增加(OR=3.01,95%CI:1.71～5.30));GSTM1缺失基因型分别与常吃熏肉、常吃酸菜之间存在正向交互作用(γ﹥1),即常吃熏肉且GSTM1缺失基因型者发生食管癌的危险性是不吃或偶尔吃熏肉的非缺失基因型者的32.51倍(OR95%CI:13.06～80.95);常吃酸菜且GSTM1缺失基因型者发生食管癌的危险性是不吃或偶尔吃酸菜的非缺失基因型者的18.37倍(OR95%CI:7.76～43.48)。[结论GSTM1缺失基因型和环境危险因素之间在食管癌的发生中存在交互效应,基因对环境危害效应具有放大作用。