人多种组织中线粒体DNA存在13.1 kb片段缺失突变

目的:在人外周血细胞中筛选到新的线粒体DNA大片段缺失突变后,进一步探讨该缺失在稳定组织内的分布.方法:以人外周血细胞及人体多种组织DNA为模板,进行PCR扩增,筛选该突变.结果:在人外周血细胞及多种稳定组织中发现13.1 kb缺失突变的存在.结论:这种广泛分布于健康人多种组织中的线粒体DNA缺失突变可能与衰老有关.     

Rett综合征患者线粒体DNA突变的初步分析

目的 探讨线粒体ＤＮＡ在Ｒｅｔｔ综合征发病中的作用。方法应用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交、聚合酶链反应（ＰＣＲ）－单链构象多态性（ＳＳＣＰ）分析及ＤＮＡ直接测序结合错配ＰＣＲ的方法，对１５例Ｒｅｔｔ综合征患儿及其中１４例的母亲的外周血白细胞线粒体ＤＮＡ的部分片段进行分析。结果１３例患儿及其中１１例的母亲的线粒体ＤＮＡ上，编码１６ＳｒＲＮＡ基因的２６５０－３０００区域ＤＮＡ突变，其中７例患儿及其中６例的母亲存在２８３５位点的点突变（Ｃ－Ｔ），３０例正常对照均未发现有此点突变。结论线粒体ＤＮＡ在Ｒｅｔｔ综合征的发病中起一定作用。     

一个氨基甙类抗生素致聋家系线粒体DNA序列分析

目的：通过对一个氨基甙类抗生素致聋家系１１名成员的线粒体ＤＮＡ进行分析，探讨该病的遗传方式及与线粒体ＤＮＡ突变的关系。方法：对１１名成员外周血线粒体ＤＮＡ进行ＰＣＲ－ＲＦＬＰ及测序分析。结果：８例标本的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ结果异常，测序表明其均存在１５５位点Ｃ－Ｔ突变。结论：氨基甙类抗生素致聋与线粒体ＤＮＡ突变有关，该家系呈典型母系遗传。     

肥厚型心肌病患者心肌线粒体DNA的大片段缺失

目的：研究肥厚型心肌病与线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）缺失的关系。方法：应用ＬｏｎｇＰＣＲ技术扩增１例肥厚型心肌病（ＨＣＭ）患者心肌标本和血细胞ｍｔＤＮＡ。结果：在心肌ｍｔＤＮＡ中发现至少５ｋｂ缺失，而血细胞中未见缺失。结论：这支持ｍｔＤＮＡ缺失是心肌病的一个重要病因，且具有组织差异性。     

一个氨基甙类抗生素致聋家系线粒体DNA序列分析

目的：通过对一个氨基甙类抗生素致聋家系１１名成员的线粒体ＤＮＡ进行分析，探讨该病的遗传方式及与线粒体ＤＮＡ突变的关系。方法：对１１名成员外周血线粒体ＤＮＡ进行ＰＣＲ－ＲＦＬＰ及测序分析。结果：８例标本的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ结果异常，测序表明其均存在１５５５位点Ｃ－Ｔ突变。结论：氨基甙类抗生素致聋与线粒体ＤＮＡ突变有关，该家系呈典型母系遗传。     

线粒体肌病和脑肌病外周血细胞线粒体DNA的定量分析

目的：了解线粒体肌病／脑肌病患者外周血细胞线粒体ＤＮＡ的拷贝数量有无异常。方法：用分子杂交技术对１０例线粒体肌病／脑肌病患者和１６例正常对照者的外周血细胞线粒体ＤＮＡ进行定量分析。结果：在线粒体肌病／脑肌病患者及正常对照者中,均未发现外周血细胞线粒体ＤＮＡ的片段缺失;但前者线粒体ＤＮＡ的拷贝数量较后者明显增多。结论：在线粒体肌病／脑肌病患者的外周血细胞中,线粒体ＤＮＡ的数量较正常人明显增加,与其肌肉中线粒体的异常增生相一致。这一实验方法对线粒体肌病／脑肌病的初筛有一定价值。     

神经肌肉性疲劳患者线粒体DNA的缺失

目的：证实神经肌肉性疾病与线粒体ＤＮＡ缺失有效，方法：应用ＰＣＲ技术研究了９例神经肌肉性疾病患者的血细胞或（和）肌肉组织中的线粒体ＤＮＡ，共１５份标本，结果：１例线粒体脑肌病患者ｍｔＤＮＡ中存在至少２９６８ｂｐ的大片断缺失，缺失区位于呼吸链复合物１，４，５的编码区，结论：该ｍｔＤＮＡ突变可能导致神经肌肉性疾病。     

Rett综合征患儿一例多种组织的线粒体DNA突变分析

目的：探讨线粒体ＤＮＡ在Ｒｅｔｔ综合征发病中的作用。方法：利用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交、聚合酶链式反应（ＰＣＲ）－单链构象多态性（ＳＳＣＰ）分析及ＤＮＡ直接测序等方法，对一例Ｒｅｔｔ综合征患儿的外周血白细胞、死后的脑、骨骼肌组织及其母亲外周血白细胞的线粒体ＤＮＡ的部分片段进行分析。结果：患儿３种组织及其母亲外周血白细胞的线粒体ＤＮＡ上编码１６Ｓ ｒＲＮＡ的２６５０￣３０００区域的ＤＮＡ存在突变，进一步     

三种血痕DNA抽提方法的比较研究

在用聚合酶链反应技术进行基因扩增研究过程中，采用／氯仿常规方法从人血痕中抽提ＤＮＡ，所抽提ＤＮＡ数量不足用于ＰＣＲ扩增。为提高模板ＤＮＡ的数量，昼避免抽提过程所用试剂对ＰＣＲ的干扰，先后采用裂解法，水煮法抽提ＤＮＡ。结果表明，此两种方法要比酚／氯仿法简便，迅速，效果好。而在后两种方法比较下，水煮法要比裂解法更具优越性，是一种从血痕中提取ＤＮＡ的良好方法。     

人白细胞介素－6受体cDNA的克隆

应用ＲＴ－ＰＣＲ技术，从人的外周血单个核细胞中扩增出人ＩＬ－６受体的特异性ｃＤＮＡ片段，经琼脂糖电泳证实扩增片段大约为１４００碱基对。运用ＤＮＡ重组技术，将获得的片段连接到ＰＵＣ１８质粒中，经转化、筛选、酶切鉴定构建出重组质粒ｐＵＣＩＬ－６受体；经序列分析证实为编码人ＩＬ－６受体的ｃＤＮＡ片段。     

骨关节炎关节软骨中软骨细胞线粒体DNA缺失突变的分析

目的：分析骨关节炎病人关节软骨组织中软骨细胞线粒体DNA序列变化,探讨骨关节炎发病的潜在病理机制。方法：应用gap—PCR扩增方法检测10例骨关节炎病人和3例正常关节软骨中软骨细胞线粒体DNA的4977bp缺失突变。采用2轮PCR扩增,第1轮PCR反应以骨关节炎病人的关节软骨中软骨细胞线粒体DNA为模板;第2轮PCR扩增反应以第1轮PCR扩增反应的产物为模板,再次进行扩增。结果：第1轮PCR反应结果显示,mtDNA524bp扩增产物呈阴性,而533bp扩增产物均呈阳性;第2轮PCR扩增反应结果显示,10例骨关节炎病人病例标本中有2例出现524bp区带,而533bp扩增产物均呈阳性。两次扩增,正常关节软骨中软骨细胞和外周血对照524bp扩增产物全部为阴性。结论：骨关节炎病人关节软骨组织中软骨细胞线粒体DNA有8470～13447nt之间4977bp大片段缺失,提示骨关节炎的发病与关节软骨中软骨细胞线粒体DNA的突变关系密切。     

Detection of mitochondrial DNA deletion by a modified PCR method

Objective: To develop a simple and efficient method for detecting small populations of mitochondrial DNA deletion. Methods: Peripheral blood cell DNA was obtained from a victim who was aecidently exposed to a ^60Co radiation source 11 years ago. Using the DNA as template, PCR was performed to generate multiple products including true deletions and artifacts. The full length product was recovered and used as template of secondary PCR. The suspicious deletion product of mtDNA could be confirmed if it was only yielded by first PCR. Using either original primers or their nested primem, the suspicious deletion product was amplified and authenticated as true deletion product. The template was recovered and determined to be a deletion by sequencing directly. Results: A new mtDNA deletion, spanning 889 bp from nt11688 to nt12576, was detected in the peripheral blood cells of the victim. Conclusion: The new PCR-based method is more efficient in detecting small populations of mtDNA deletion than other routine methods. MtDNA deletion is found in the victim, suggesting there is relationship between the deletion and phenotypes of the disease.     

一种改进的提取人外周血和组织线粒体DNA的方法

目的：建立一种简便、快捷地从人外周血和组织中制备高质量线粒体DNA的方法。方法：以差速离心法分离线粒体,用碱性SDS法裂解线粒体膜,释放线粒体DNA后用酚／氯仿抽提,TE或ddH2O溶解。然后将所得线粒体DNA进行纯度鉴定并和其他现有方法制备的线粒体DNA用PCR进行长片段扩增,比较扩增效果。结果：用改进的方法制备的线粒体DNA中没有检测到核DNA,并能有效扩增8kb长的目的片段。结论：改进后的方法简便、快捷,制备的线粒体DNA纯度高,也有利于长片段PCR扩增。     

乳腺肿瘤发生与线粒体DNA体细胞突变的初步探讨

目的 基于线粒体DNA(mtDNA)的全基因组信息研究体细胞突变与乳腺肿瘤发生的相关性.方法 对来自云南省昆明市第一人民医院乳腺科2009年8-12月收治的4例乳腺纤维腺瘤患者的肿瘤组织及外周血mtDNA全基因组序列进行聚合酶链反应(PCR)扩增及DNA测序,比较其突变分布差异,揭示可能存在的肿瘤组织特有的体细胞突变.结果 研究获得了患者肿瘤组织mtDNA全基因组的突变图谱,并构建了系统发育关系树,结果揭示,4例患者的mtDNA分别归属为单倍型类群D4i、G1、R9b及N9a.通过在外周血mtDNA中检测肿瘤样本中发现的私有突变,研究显示仅在单倍型类群归属为R9b的患者中存在16292位置的体细胞变异.结论 基于4例良性乳腺肿瘤患者的肿瘤组织的mtDNA全基因组信息,仅发现1个mtDNA控制区体细胞变异,未能发现存在于mtDNA编码区中的可能具有功能性的体细胞突变.

Abstract：

Objective To investigate the correlation of somatic mutations in whole genome of mitochondrial DNA ( mtDNA ) in patients with breast tumor. Methods The DNA of tumor tissue and peripheral blood in 4 benign breast tumor patients from August 2009 to December 2009 in our hospital were extracted. The mtDNA whole genomes were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and the mutations of products screened by sequencing to compare the difference of mutation distribution between tumor tissue and peripheral blood. The likelihood of somatic mutations in tumor tissue was determined. Results The mutation spectrum of mtDNA genomes was obtained by PGR and sequencing. Then a phylogenetic tree was constructed to identify their haplogroups (D4i, G1, R9b, N9a). Their private mutations in peripheral blood were detected and the somatic mutation at 16292 position was found in one patient ( haplogroups: R9b).Conclusion Based on the extensively study on the mtDNA genomes from the tumor issues of 4 patients, our current report observed only a single somatic variation from the control region, no any further mutations with potential function from the coding region were observed.     

人颗粒细胞线粒体DNA缺失的研究

目的 探讨颗粒细胞线粒体DNA突变在女性生殖老化中的可能机制，并为颗粒细胞线粒体移植提供理论基础。方法 分离70例临床行常规体外受精(IVF)和胞质内单精子注射(ICSI)患者的颗粒细胞，抽提DNA，PCR检测颗粒细胞线粒体DNA(mitochondrial DNA，mtDNA)4977bp缺失情况。结果所有颗粒细胞均未检测到mtDNA4977bp缺失。结论 人颗粒细胞mtDNA并不发生4977bp缺失．这可能与其不是有丝分裂后细胞，仍具有增殖能力，受到的氧化损伤较少有关。颗粒细胞参与生殖老化的机制可能与其mtDNA突变无关。     

广西壮族人群线粒体DNA单个碱基突变的分析

目的：探讨广西壮族人群的线粒体DNA（mtDNA）单个碱基的突变，了解突变的频率，为进一步研究壮族人群的遗传基础和相关的线粒体遗传病提供基础资料，方法：从83例广西壮族人血液标本中提取DNA，通过PCR扩增，分离和回收，用377全自动序列分析仪进行序列测定，分析了mtDNA第一高变区单个碱基的突变。结果：来自南宁第四个地区的76个样本共有66个单倍型，71个多态位点，共发生了298次转换，39次，颠换和1个缺失，88％的碱基替换为转换，12％为颠换，南宁、百色、柳州和河池地区的转换，颠换和缺失的频率分别为6．31％，6．40％，6．79％和5．90％，对上述频率进行多样本率比较的卡方检验，均无显著性差异（P＞0．05）。结论：壮族人九mtDNA的单个碱基突变比较丰富，各位点发生突变的频率不同。     

Identification of Two Novel Mitochondrial DNA Deletions Induced by Ionizing Radiation

ObjectiveWe identify ionizing radiation-induced mitochondrial DNA (mtDNA) deletions in human lymphocytes and their distribution in normal populations.MethodsLong-range polymerase chain reactions (PCR) using two pairs of primers specific for the human mitochondrial genome were used to analyze the lymphoblastoid cell line following exposure to 10 Gy ⁶⁰Co γ-rays. Limited-condition PCR, cloning and sequencing techniques were applied to verify the mtDNA deletions detected with long-range PCR. Human peripheral blood samples were irradiated with 0, 2 and 6 Gy ⁶⁰Co γ-rays, and real-time PCR analysis was performed to validate the mtDNA deletions. In order to know the distribution of mtDNA deletions in normal population, 222 healthy Chinese adults were also investigated.ResultsTwo mtDNA deletions, a 7455-bp deletion (nt475-nt7929 in heavy strand) and a 9225-bp deletion (nt7714 -nt369 in heavy strand), occurring between two 8-bp direct repeats, were identified in lymphoblastoid cells using long-range PCR, limited-condition PCR and sequencing. These results were also observed for ⁶⁰Co γ-rays irradiated human peripheral blood cells.ConclusionTwo novel mtDNA deletions, a 7455-bp deletion and a 9225-bp deletion, were induced by ionizing radiation. The rate of the mtDNA deletions within a normal population was related to the donors' age, but was independent of gender.     

JAK2V617F基因突变在骨髓增生性疾病中的发生率及其临床意义

目的:探讨JAK2V617F基因突变在骨髓增生性疾病(MPD)中的发生率及其与血液学变化的相关性.方法:68例MPD患者骨髓及外周血细胞抽提DNA,应用等位基因特异性PCR技术,检测JAK2V617F基因突变,对突变基因进行序列分析,结合临床资料以及外周血细胞计数作进一步分析.结果:68例MPD患者中JAK2V617F突变的阳性率为65.28%,其中真性红细胞增多症(PV)患者阳性率为77.77%(28∕36例),原发性血小板增多症(ET)患者阳性率为56.52%(13∕23例),慢性骨髓纤维化(IMF)患者阳性率为44.44%(4∕9例). 各组患者骨髓及外周血JAK2V617F基因突变阳性率大致相同.PV突变阳性患者的白细胞计数及血红蛋白较突变阴性患者高,差异具有统计学意义(P<0.05);ET突变阳性患者的白细胞计数较突变阴性患者的高,差异具有统计学意义(P<0.05).结论:JAK2V617F基因突变有助于BCR/ABL阴性的MPD的诊断.JAK2V617F突变对血液学特征有一定影响.     

人非抗凝血块中基因组DNA提取不同方法的比较

目的:比较三种不同方法提取人非抗凝血块基因组DNA的效果差异。方法:分别采用酚/氯仿法,天根试剂盒,Invitrigen purelinkTM试剂盒提取冻存时间较长的非抗凝血块基因组DNA,测定浓度、OD260/280值,琼脂糖凝胶电泳检测提取的DNA浓度和纯度,测定PCR产物灰度值。结果:三种方法都可以提取出基因组DNA,测定DNA浓度分别为:(35.56±15.27)ng/μL,(45.13±16.54)ng/μL,(57.93±14.5)ng/μL,组间存在统计学差异(P<0.01),A260/A280值分别为:1.46±0.19,1.49±0.16,1.519±0.23,三组间比较差异无统计学意义(P>0.05);三种方法提取的基因组DNA都能通过PCR扩增出目的条带,PCR产物电泳灰度值结果分别为:75.421±3.435,149.32±6.875和229.52±19.55,组间比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论:三种不同方法都能提取出冻存时间较长的非抗凝血块基因组DNA,但Invitrigen purelinkTM试剂盒法效果最好。