高胆固醇血症低密度脂蛋白受体基因点突变的研究

目的：建立低密度脂蛋白－受体（ＬＤＬ－Ｒ）基因点突变监测方法,从基因水平对３０例原发性高胆固醇血症患者进行筛选、明确诊断。 方法：将聚合酶链式反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）与银染技术相结合,用１９对引物对ＬＤＬ－Ｒ基因的全部１８个外显子进行检测,３０例患者中,对筛查出的突变用ＰＣＲ产物直接测序或克隆测序的方法明确突变的性质和位置。 结果：确立的ＰＣＲ－ＳＳＣＰ条件稳定,银染方法灵敏度高、重复性好,且避免了同位素污染。３０例患者中,发现１例定位于外显子１４的杂合子点突变患者,ＰＣＲ产物直接测序证实第６７１位密码子发生错义突变：ＣＣＣ→ＣＧＣ,导致脯氨酸→精氨酸;１例纯合子家族性高胆固醇血症患者外显子７发生点突变,克隆测序证实密码子３０８位发生错义突变：ＴＡＣ→ＴＧＣ,导致半胱氨酸→酪氨酸;２例杂合子患者外显子４的３’部分ＳＳＣＰ出现相同异常带型。查阅文献,测序证实的突变皆是新的突变。 结论：建立的ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法可用于高胆固醇血症患者ＬＤＬＲ基因点突变的筛检。研究结果从基因水平证实中国家族性高胆固醇血症患者ＬＤＬ－Ｒ基因突变具有多样性的特点。     

运用PCR－SSCP及免疫组化方法检测大肠肿瘤及粪便脱落细胞中P_53基因的突变

运用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ及免疫组化方法检测大肠肿瘤及粪便脱落细胞中Ｐ５３基因的突变宁向群，宫恩聪，吕愈敏，薛卫成，刘叔平，鄂文，廖松林本研究应用非同位素ＰＣＲ－ＳＳＣＰ（聚合酶链式反应－单链构象多态性）方法及免疫组化方法检测大肠肿瘤中Ｐ５３基因的突变，并...     

PCR—SSCP方法用于痰标本中结核分支杆菌rpoB基因突变检测

本文用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法直接检测痰标本中结核分支杆菌ｒｐｏ基在变，评价此方法用于结核分支杆菌利福平耐性试验的意义，以期建立一种直接检测分支杆菌耐利福平的快速方法。本文用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法分析了３０例结核病人和２０例非结核性肺部疾病病人痰标本。３０份肺结核病人的痰用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ检测痰中结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变：２１份痰ＰＣＲ扩增阳性，其中１３份ＳＳＣＰ图谱与参考株Ｈ３７ＲｖＳＳＣＰ图谱有     

结核分支杆菌利福平耐药基因突变的研究

目的了解我国结核分支杆菌耐利福平（ＲＦＰ）分离株ｒｐｏＢ基因突变情况，建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法通过聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）和ＰＣＲ－直接测序法（ＰＣＲ－ＤＳ）分析５０株结核分支杆菌临床分离株的ｒｐｏＢ基因。结果３株结核分支杆菌药物敏感株和２株非ＲＦＰ耐药株中，仅１株ｒｐｏＢＳＳＣＰ图谱异常的药物敏感株出现５３１位密码子ＴＣＧ→ＴＴＧ突变。４５株ＲＦＰ耐药株中，１０株ＳＳＣＰ和ＤＳ分析均未见ｒｐｏＢ突变，３５株ＳＳＣＰ和ＤＳ分析异常，其中１４株为５３１位密码子ＴＣＧ→ＴＴＧ或ＴＧＧ或ＴＡＣ突变，１４株为５２６位ＣＡＣ→ＴＡＣ或ＧＡＣ或ＣＣＣ或ＣＴＣ或ＧＴＣ突变，２株为５１６位ＧＡＣ→ＧＴＣ或ＴＡＣ突变，２株为５１６位和５２６位及５１５位和５１６位密码子双点突变，３株ｒｐｏＢ序列与结核分支杆菌不同。结论大多数结核分支杆菌耐ＲＦＰ是由于其ｒｐｏＢ基因突变所致，采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＰＣＲ－ＤＳ方法可快速测定结核分支杆菌ＲＦＰ耐药基因型     

结核分支杆菌链霉素耐药基因的检测

目的了解结核分支杆菌链霉素（Ｓｍ）耐药基因突变情况，建立快速检测耐药突变株的方法。方法通过聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）分析了２２株结核分支杆菌临床分离株的ｒｐｓＬ基因，并应用ＰＣＲ－限制性片段长度多态性（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）进一步分析其突变的部位和性质。结果以Ｈ３７Ｒｖ标准株为对照，５株敏感株的ｒｐｓＬ基因未见ＳＳＣＰ泳动异常、有ＭｂｏⅡ酶切位点；１３株耐Ｓｍ株中，１１株（８６％）有ｒｐｓＬ基因泳动异常、无ＭｂｏⅡ酶切位点；４株耐其它抗结核药物株中，也有１株ＳＳＣＰ泳动异常、并无ＭｂｏⅡ酶切位点。结论大多数结核分支杆菌Ｓｍ耐药分离株有ｒｐｓＬ突变，而突变位点大多位于第４３位密码子。应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＰＣＲ－ＲＦＬＰ可能成为快速检测结核分支杆菌耐药突变株的新方法。     

球形幽门螺杆菌致细胞空泡变性毒力研究

目的 揭示球菌幽门螺杆菌致细胞空泡变性毒力的变异情况。方法 采用延期培养和加亚抑菌浓度抗生素,对细胞毒相关蛋白基因阳性（ｃａｇＡ＾＋）,和细胞空泡毒素基因阳性（ｖａｃＡ＾＋）的高毒株幽门螺杆菌（Ｈｐ）进行球形诱变,进而检测该Ｈｐ至Ｈｅｌａ细胞空泡变性的毒力,并用ＳＤＳ－ＰＡＧＥ、ＰＣＲ及ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术,分析球形Ｈｐ蛋白产物及决定细胞空泡变性的ｃａｇＡ和ｖａｃＡ基因的变异情况。结果与结论 球形     

结核分支杆菌利用福平药物敏感性的直接快速检测

探讨利用分子生物 学方法直接快速检测临床标本结核分支杆菌利福平（ＲＦＰ）药物敏感性的可行性。方法自行设计针对ｒｐｏＢ基因特异扩增的引物（扩增产物为１８３ｂｐ片段）,运用聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）银染色法,检测４５株结核分支杆菌临床分离株,对其中部分菌株进行ｒｐｏＢ基因ＤＮＡ序列分析,运用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ银染色法对７０份结核病患痰标本进行直接快速检测,并与药敏试验结果做对照分     

聚合酶链反应－单链构象多态性用于耐利福平结核分支杆菌rpoB基因突变的研究

目的研究结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变及其与利福平（ＲＦＰ）耐药性的关系。方法以参考菌株结核分支杆菌Ｈ３７Ｒｖ为对照，用聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）方法分析了４０株结核分支杆菌临床分离株。ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法由ＰＣＲ扩增和扩增产物ＤＮＡ单链多态性分析组成。结果两对引物ＰＣＲ扩增产物分别为４１１和２５８ｂｐ，其敏感性分别为５ｐｇ／μｌ、５００个菌／ｍｌ和１ｐｇ／μｌ、５００个菌／ｍｌ；均为属特异性。４０株结核分支杆菌临床分离株２５８ｂｐ扩增片段ＳＳＣＰ图谱的特点：以参考菌株结核分支杆菌Ｈ３７Ｒｖ为对照，１０株敏感株均无区别；单耐ＲＦＰ或包括ＲＦＰ多种抗结核药３０株，除３株外，其余２７株ＳＳＣＰ图谱有明显的区别；检测阳性率为９０％，特异性为１００％。结论ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法可检测出耐ＲＦＰ结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变；该基因是ＲＦＰ的药物靶编码基因，它的突变与ＲＦＰ耐药性有密切关系，这有助于结核分支杆菌耐药性的快速检测和研究     

聚合酶链反应－冷单链构象多态性快速检测结核分支杆菌rpoB基因突变

目的评估ｒｐｏＢ基因突变检测在结核分支杆菌利福平耐药性测定中的应用价值。方法采用聚合酶链反应－冷单链构象多态性（ＰＣＲ－冷ＳＳＣＰ）方法对８７株结核分支杆菌临床分离株及有药敏结果的２２份相应肺结核患者痰标本进行分析。结果ＰＣＲ扩增ｒｐｏＢ基因的敏感性为１００ｐｇＤＮＡ及５０００个菌体，属于分支杆菌特异。所有分离菌的ｒｐｏＢ基因ＰＣＲ扩增均为阳性。采用套式ＰＣＲ可使扩增敏感性提高１００倍。与传统药敏试验方法相比，ＰＣＲ－冷ＳＳＣＰ对８７株结核分支杆菌临床分离菌利福平耐药性的检测敏感性和特异性分别为８９．６％及１００％。２２份涂阳培阳痰标本中套式ＰＣＲ扩增阳性的６份均为高度利福平耐药，其ＳＳＣＰ结果也与相应分离株的药物敏感性试验相符。结论ＰＣＲ－冷ＳＳＣＰ检测结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变快速、简便、易行，适用于结核分支杆菌分离株利福平耐药性的快速测定。如进一步提高引物增特异性及敏感性，该技术可望用于临床标本直接检测     

耐多药结核病耐药分子机制的研究

目的 研究耐多药结核分支杆菌耐药的分子机理，建立快速检测耐药基因的分子药敏试验方法。方法 通过ＰＣＲ和ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析结构分支杆菌耐多药临床分离株的ｒｐｏＢ、ｒｐｓＬ、ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列。结果 ＰＣＲ分析耐药基因的敏感性为１－０ｐｇＤＮＡ；除ｒｐｏＢ基因引物ＰＣＲ扩增为属特异性外，余耐药基因引物ＰＣＲ扩增都具有较高的的特异性。２０株耐多药分离株中，９０％有２种以上耐药遗传标志改变，     

Detection of mutations in the human insulin gene by single strand conformation polymorphisms.

Single strand conformation polymorphisms (SSCP) is the method by which mutations can be detected in DNA amplified by the polymerase chain reaction (PCR). This method utilizes the fact that the electrophoretic mobility of single stranded DNA under nondenaturing condition depends not only on its size but also on its conformation. We examined whether this technique could detect five mutations that had previously been identified in the insulin genes of patients with abnormal insulin or familial hyperproinsulinemia. Five mutant insulin genes were constructed by site directed mutagenesis, and the cloned mutant insulin genes were amplified by PCR. All five mutations were detected because they were associated with shifts in the electrophoretic mobility of the DNA fragments. In addition, we analyzed amplified genomic DNA from a patient who is heterozygotes for the Insulin Wakayama mutation A3(Val----Leu). This mutation was also detected by the SSCP technique. We conclude that PCR-SSCP method is a simple, fast, and efficient method for detection of mutations in the human insulin gene.     

聚合酶链反应-单链构象多态性技术检测耐多药结核分支杆菌rpoB、KatG、rpsL突变的研究

目的　应用PCRSSCP技术快速检测耐INH,RFP,SM结核分支杆菌分离株KatG、rpoB、rpsL基因突变,评价其在检测结核分支杆菌耐药性方面的价值。方法 32株耐INH、RFP、SM结核分支杆菌临床分离株及25株结核分支杆菌敏感分离株用PCRSSCP方法分别检测,rpoB、KatG、rpsL基因突变。结果 32株耐多药结核分支杆菌分离株中,rpoB、KatG、rpsL PCR扩增产物PCR-SSCP分别有28株(87.5%)rpoB基因,19株(59.3%)KatG基因和23株(71.9%)rpsL基因电泳条带与结核分支杆菌标准株H₃₇Rv电泳条带相比有明显差异,而25株结核分支杆菌敏感株的PCR-SSCP条带与结核分支杆菌H₃₇Rv相似,特异性为100%。结论 PCR-SSCP方法敏感、特异,可快速检测结核分支杆菌rpoB、KatG、rpsL耐药基因突变,有利于耐多药结核分支杆菌耐药性的快速检测。     

结核分支杆菌五种耐药基因检测的临床应用及评价

目的　检测结核分支杆菌rpoBkatG、rpsL、pncA和embB耐药基因 ,评价其临床应用价值。方法　采用聚合酶链反应 单链构象多态性 (PCR SSCP)分析和药敏试验 (比例法 ) ,了解 10 9例肺结核患者结核分支杆菌耐药情况 ,并分析、比较临床治疗效果。结果　 1/ 2以上的肺结核患者至少耐两种抗结核药物 ,对RFP、INH、SM、PZA和EB总耐药率分别为 80 7%、71 5 %、78 8%、5 7 7%和48 6%。rpoB、katG、rpsL、pncA和embB基因突变率分别为 76%、68%、71%、5 1%和 3 0 %。结核分支杆菌耐药基因突变率与耐药水平联系密切 ,多数结核分支杆菌耐药基因突变易发生在高耐药株 ,也有少数基因突变发生在低耐药株。根据药敏试验和耐药基因检测结果 ,6个月耐多药结核治愈率分别达到 5 4 8%和 62 8% ,治疗效果满意 ,两种方法差异无显著性 (P >0 0 5 )。结论　耐药基因检测指导治疗是一种新探索 ,PCR SSCP方法敏感、特异 ,可以快速检测结核分支杆菌rpoB、katG、rpsL、pncA和embB耐药基因突变 ,可能会成为临床指导用药的好方法     

Identification of G protein alpha subunit mutations in human growth hormone (GH)- and GH/prolactin-secreting pituitary tumors by single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis.

We have applied the polymerase chain reaction (PCR) and single-strand conformation polymorphism analysis (SSCP) to detect activating mutations in the Gs alpha subunit gene, amplifying genomic DNA extracted from growth hormone (GH)- and GH/prolactin (PRL)-secreting human pituitary tumors. Of 15 tumors tested six contained mutations in the analyzed regions of the Gs alpha. SSCP analysis revealed band shift in exon 8 in four GH- and in one GH/PRL-secreting tumors, and in exon 9 in one GH/PRL-secreting tumor. Direct sequencing of PCR reaction products identified the mutations as R201-H, R201-S and R201-C in exon 8 and Q227-L in exon 9. These results show the efficacy of PCR/SSCP analysis in the detection of G protein mutations and extend the generalization that these sites are hot spots in tumor-inducing mutations.     

Rapid detection of common Chinese glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) mutations by microarray-based assay

Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) deficiency is the most common human enzymopathy, affecting more than 200 million people worldwide. To date more than 123 mutations in the G6PD gene have been discovered, among which 12 point mutations are found in the Chinese. Setting up a simple and accurate method for detecting these mutations is not only useful for diagnosing G6PD deficiency under some circumstances that it is difficult to measure the activity of the enzyme, but also for studying the frequency of the G6PD genotypes. The purpose of this study was to develop a simple, inexpensive and accurate method for detecting these common mutations. Microarray-based assay was described in this study. Samples from 198 G6PD-deficient persons were investigated. The DNA sequencing data supported the results obtained by microarray-based assay. Thus, we concluded that the microarray-based assay is a rapid, simple, inexpensive, and accurate method for detecting the most common G6PD gene mutations among the Chinese. This method involves the selective amplification of human G6PD gene with specific oligonucleotide primers, fragmentation and labeling of PCR products, followed by hybridization with allele-specific oligonucleotide (ASO) probes on chip.     

幽门螺杆菌flaA基因的变异

目的鞭毛是幽门螺杆菌（Ｈｐ）的重要侵袭因子,本研究拟检测Ｈｐ鞭毛素Ａ基因的变异性,进而研究其与Ｈｐ致病性的关系．方法我们对５２例胃粘膜活检标本和１８株Ｈｐ临床分离株进行Ｈｐ特异的１６ＳｒＲＮＡ基因和鞭毛素Ａ基因ＰＣＲ扩增和ＰＣＲＲＦＬＰ及ＰＣＲＲＦＬＰＳＳＣＰ分析．结果对４３例Ｈｐ（＋）的ｆｌａＡ基因ＰＣＲＲＦＬＰ（ＨｉｎｄⅢ）大约可分７个型（变异检出率为１６３％）,而ＰＣＲＲＦＬＰＳＳＣＰ可分３７个型（变异检出率为８６０％）,两者有非常显著性差异．结论ｆｌａＡ基因变异性极大,ＰＣＲＲＦＬＰＳＳＣＰ优于ＰＣＲＲＦＬＰ,是检测其变异的有效方法．     

Diagnosis of glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) mutations by DNA amplification and allele-specific oligonucleotide probes.

We have recently identified that at least four types of mutation are responsible for the glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) polymorphism in the Chinese of Taiwan. Two mutations (487 G-->A and 493 A-->G) occurring at nucleotide position 487 and 493, respectively, create Alu I and Ava II recognition sites which enabled us to directly examine these two mutations by PCR/restriction enzyme (RE) digestion. However, the other two mutations (1376 G-->T and 1388 G-->A), which do not generate any recognizable restriction sites, were detected by DNA sequencing method which is not suitable for rapid diagnosis. Using the PCR technique, we have successfully developed a simple and rapid method for the detection of 1376 and 1388 mutations. This method involves the selective amplification of a DNA fragment from human G6PD gene with specific oligonucleotide primers, followed by hybridization with allele-specific oligonucleotide (ASO) probes. Using the PCR/ASO and PCR/RE methods, we have successfully examined two families and 20 unrelated subjects with G6PD deficiency. Our results indicate that the PCR/ASO method is suitable for the rapid determination of 1376 and 1388 mutations. The combined use of PCR/ASO and PCR/RE methods will be suitable for rapid diagnosis of four known G6PD mutations in Chinese.     

应用基因阵列法快速检测结核分枝杆菌rpoB基因突变

目的　研制一种新型的基因阵列 ,用于结核分枝杆菌耐利福平分离株rpoB基因突变的快速检测。方法　根据结核分枝杆菌rpoB基因序列设计寡核苷酸探针并制作基因阵列 ,用生物素标记的引物扩增结核分枝杆菌rpoB基因突变热点的目的片断 ,与基因阵列杂交 ,同时以聚合酶链反应 单链构象多态性 (PCR SSCP)技术及DNA测序法为对照。结果　 111株结核分枝杆菌临床分离株经PCR SSCP分析 ,4 1株RFP敏感株SSCP图谱与结核分枝杆菌标准株相同 ;70株耐RFP菌株中 ,6 3株(90 % )SSCP图谱与结核分枝杆菌标准株不同 ,其余 7株SSCP图谱与结核分枝杆菌标准株相同。基因阵列检测结果 4 1株RFP敏感株杂交图谱与标准株完全相同 ,70株耐RFP临床分离株中 ,6 3株检测到rpoB基因突变 ,检出率为 90 % ;其中 37株 (5 3% ) 5 31位丝氨酸 (Ser)置换 ,15株 (2 1% ) 5 2 6位组氨酸(His)置换 ,11株 (16 % )其他位置的氨基酸置换。基因阵列检测结果与PCR SSCP及测序结果一致。结论　用基因阵列法可简便、快速、准确地检测出大多数结核分枝杆菌耐利福平分离株的rpoB基因突变。     

家族性高胆固醇血症患者低密度脂蛋白受体基因新的突变类型一例

目的：分析一例家庭性高胆固醇血症患的低密度脂蛋白受体基因突变位点。方法：以患儿的基因组DNA为模板，用聚合酶链反应（PCR）扩增该基因的18个外显子。用单链构象多态性（SSCP）方法分析检测PCR产物，对电泳结果异常进行DNA测序。结果：单链构象多态性分析发现患儿第10外显子存在一异常条带。DNA测序证实患儿第10外显子发生N515S纯合错义突变。结论：该病例为一个新的LDLR突变位点；聚合酶链反应－单链构象多态性分析（PCR－SSCP）可用于该突变位点的诊断。     

家族性肥厚型心肌病β型肌凝蛋白重链基因突变研究

1990年Tanigawa等连续报道了β-MHC的错义突变与FHC有关,这些突变集中在β-MHC的10个外显子,即外显子5,9,13,14,15,16,19,20,21,23.本文设计了9对PCR引物,限制性扩增β-MHC基因突变集中发生的9个外显子,用两轮扩增提高扩增产量,两步扩增法提高扩增产物的特异性.产物在中性聚丙烯酰胺上电泳进行SSCP分析.对6个肥厚型心肌病家系进行了β-MHC突变分析,结果显示,6个肥厚型心肌病家系中无一个家系找到β-MHC突变,表明突变的机率比国外报道的明显的低.