轮状病毒结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位的初步鉴定

目的预测并初步鉴定轮状病毒Wa株结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位,为轮状病毒免疫保护机制研究及疫苗的研制奠定基础.方法应用表位亲和力预测软件SYFPEITHI及蛋白酶切位点预测软件PAProc和Fragpredict相结合预测VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位;用分子模拟对候选肽作进一步筛选;标准Fmoc方案合成候选肽,RP-HPLC纯化、分析,质谱进行鉴定;最后用T2细胞株测定候选肽与HLA-A*0201分子的亲和力及稳定性.结果结合SYFPEITHI、蛋白酶切位点预测结果及分子模建结果,选择分值最高同时在C-末端含有蛋白酶切位点的4条肽作为候选表位肽;标准Fmoc方案合成的各肽纯度均大于95%,质谱检测结果表明,各肽的相对分子质量与理论值基本一致;在候选的4条表位肽中,TLLANVTAV(340-348)和VLADANETL(333-341)与HLA-A*0201呈高亲和力结合,荧光系数(flurorescene index,FI)分别为2.66和2.64,同时肽-HLA-A*0201复合物半数解离时间(dissociation complex50,DC50)均大于8 h.结论TLLANVTAV(340-348)和VLADANETL(333-341)为潜在的HLA-A*0201限制性CTL表位.     

丙型肝炎病毒HLA-A＊0201限制性CTL表位免疫学效应研究

目的：研究前期实验鉴定的2条丙型肝炎病毒HLA-A＊0201限制性CTL（活化的CD8＋T细胞）表位的体内外免疫学效应。方法：采用丙型肝炎病毒HLA-A＊0201限制性CTL表位肽C_181（LLSCLTTPV）和NS2_172（VLQAGLIRV）分别体外刺激HLA-A＊0201阳性健康志愿者外周血单个核细胞（PBMCs）和免疫HLA-A＊0201转基因小鼠,采用酶联免疫斑点实验（ELISPOT）和细胞内细胞因子染色（ICS）/流式细胞术检测表位肽特异性CD8＋T细胞的水平。结果：C_181和NS2_172诱导HLA-A＊0201阳性PBMCs产生了高水平的肽特异性分泌IFN-γ的细胞和肽特异性IFN-γ＋CD8＋T细胞;在C_181和NS2_172免疫的HLA-A＊0201转基因小鼠脾细胞中检测到了肽特异性分泌IFN-γ的细胞和肽特异性IFN-γ＋CD8＋T细胞。结论：C_181和NS2_172具有较好免疫学效应,有望用于研发CTL表位肽疫苗。     

MUC4 HLA-A*0201限制性CTL表位的预测及结合力分析

目的：寻找并鉴定MUC4 HLA-A^＊0201限制性细胞毒性T细胞（CTL）表位.方法：结合2种常用表位预测数据库（SYFPEITHI和ProPred-I）和工具,应用多种参数和方法进行综合分析,包括MHC结合力、蛋白酶体切割位点等综合预测方法.预测得到的抗原表位合成相应抗原肽.用T2细胞株测定各肽与HLA-A^＊0201分子的亲和力.结果：综合分析预测得到HLA-A^＊0201的5个可能表位;合成抗原肽经纯化后纯度＞95%;在5个候选表位肽中,LLLGVGTFV（u25-33）和LLGVGTFVV（1126-34）2个九肽与HLA-A^＊0201的结合力较强.结论：多参数表位预测结果和结合力分析实验结果一致性较好,两者联合应用初步认为LLLGVGTFV（1125-33）和LLGVGTFVV（1126-34）2个九肽为MUC4 HLA-A^＊0201限制性CTL表位的可能性最大.     

MART-1 HLA-A2限制性CTL表位的预测

目的 预测黑色素瘤分化抗原ＭＡＲＴ－１的ＨＬＡ－Ａ２限制性细胞毒性Ｔ淋巴细胞（ＣＴＬ）表位。方法 采用超基序与量化基序多项式方案相结合的办法,对目的抗原ＭＡＲＴ－１的ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位进行预测。结果 预测出了６个九肽表位。结论 两种方法预测结果的一致性较好,所预测出的６个ＭＡＲＴ－１的ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位经后续实验筛选,鉴定后,可望用于新型ＭＡＲＴ－１肿瘤治疗性多肽疫苗的设计研究     

HPV18E7抗原HLA-A2限制性CTL表位的初步筛选

目的:初步筛选人乳头瘤病毒18型E7抗原的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位,为表位免疫原性鉴定提供靶肽.方法:采用超基序、多项式和量化基序方案相结合的方法,对靶抗原HPV18E7的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位进行预测,并应用固相合成法合成多肽,经RP-HPLC纯化及纯度分析,用质谱进行定性鉴定.结果:分别预测出5条、1条和6条九肽表位,综合三种预测方案确定其中1条为候选合成表位,合成肽的纯度大于95%,经质谱分析合成肽的分子量测定值与理论值相符.结论:超基序、多项式和量化基序方案联合应用提高预测效率,避免了在研究HPV18E7抗原表位时盲目合成多肽;所合成的多肽为高纯度靶肽,为后继的抗原表位的免疫原性的鉴定奠定了实验基础.     

CTL表位预测的方法学进展

ＣＤ8 +αβＴ细胞在机体抗感染和抗肿瘤免疫中发挥着极为重要的作用。现已知 ,ＣＤ8+αβＴ细胞所识别的靶抗原需先经抗原递呈途径以“抗原肽 ＭＨＣＩ类分子”复合物的形式呈现于抗原递呈细胞 (Ａｎｔｉｇｅｎｐｒｅｓｅｎｔｉｎｇｃｅｌｌｓ ,ＡＰＣｓ)或靶细胞表面方可被表达有相应αβＴＣＲ(Ｔｃｅｌｌｒｅｃｅｐｔｏｒ)的ＣＤ8+Ｔ细胞所识别 ,相应的与ＭＨＣＩ类分子结合的抗原肽即为ＣＴＬ表位 (ＣｙｔｏｔｏｘｉｃＴｌｙｍ ｐｈｏｃｙｔｅｅｐｉｔｏｐｅｓ)。对于一个已知序列的蛋白抗原 ,若单纯用实验方法来鉴定其ＣＴＬ表位 ,常…     

肿瘤抗原MAGE-2 HLA-A2限制性CTL表位的预测

目的 预测黑色素抗原ＭＡＧＥ－２的ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位。方法 采用超基序法与量化基序法的联合应用。结果 发现８个ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位。结论 超基序法与量化基序法联合应用可以提高预测效率。     

乙肝病毒X蛋白HLA-A0201限制性CTL表位的筛选与鉴定

目的:应用T2细胞结合实验以及亲和力稳定性实验鉴定由网络表位预测服务和通用原则预测得到的乙肝病毒X蛋白(HBx)来源的HLA-A0201限制性CTL表位.方法:选择中国人群最常见的B、C基因型中的adw、adr血清型的乙肝病毒X基因序列,通过网络在线表位筛选服务,分析得到共同并且得分较高的表位,并根据超基序、延展基序及量化基序方案等通用表位筛选原则进行进一步的筛选,得到4条较为理想的九肽(HBx1,HBx2,HBx3,HBx4)作为候选表位.随后借助于流式细胞技术,通过T2细胞实验分析各候选肽以及阳性、阴性、空白对照的荧光系数,从而对所筛选的表位进行体外鉴定.结果:获得的4个候选表位 (HBx1:VLCLRPVGA,HBx2:CLFKDWEEL,HBx3:VLHKRTLGL,HBx4:HLSLRGLPV) 中HBx2的亲和力较高,HBx2和HBx4的稳定性较好.结论:CLFKDWEEL是一种乙肝病毒X蛋白潜在的HLA-A0201限制性CTL表位,下一步可通过体内试验对其免疫原性作一步的验证.     

HLA-A* 0201限制性GPC3表位肽的初步预测与筛选

目的:筛选HLA-A*0201限制性GPC3优势表位肽,为肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)特异性的免疫细胞治疗提供新的靶标。方法:通过表位预测网站初步筛选HLA-A*0201限制性GPC3表位肽,T2细胞结合实验筛选优势表位肽。结果:通过三大常用的表位预测网站,共筛选了13个评分较高的表位肽,化学合成表位肽,采用T2细胞结合实验显示,有4个表位肽与HLA-A2呈现较高亲和力。结论:抗原表位预测网站结合T2细胞结合实验能初步筛选亲和力较高的HLA-A*0201限制性GPC3表位肽,可能用于HCC特异性CTL治疗的候选标靶。     

肿瘤抗原MAGE-2 HLA-A2限制性新CTL表位的鉴定

目的：寻求新的HLA-A2限制性肿瘤抗原MAGE-2 CTL表位。方法：经超基序与量公基序相结合预测的肿瘤抗原MA-GE-2的4个表位作为研究对象，标准的^51Cr实验与肽结合实验相结合进行验证。结果：预测表位肽MAGE-2220-228，MAGE-2271-279经体外刺激PBMC后可有效的诱导CTL效应产生，当效/靶为100：1时溶破靶细胞效率分别为74.4％，68.2％。HLA-A2分子亲和力分析，荧光系数分别为0.61、0.24阳性肽荧光系数为0.79。结论：多肽MAGE-2 220-228可作为新的HLA-A2限制性CTL表位。     

Identification of an HLA-A＂ 0201-restricted CD8~ T-cell epitope SSp-1 of SARS-CoV spike protein

Identification of an HLA-A~* 0201-restricted CD8~+ T-cell epitope SSp-1 of SARS-CoV spike protein     

Identification of an HLA-A ＊ 0201-restricted CD8^＋ T-cell epitope SSp-1 of SARS-CoV spike protein

Identification of an HLA-A*0201-restricted CD8~+ T-cell epitope SSp-1 of SARS-CoV spike protein     

Identification of an HLA-A* 0201-restricted CD8+ T-cell epitope SSp-1 of SARS-CoV spike protein

A novel coronavirus, severe acute respiratory syndrome (SARS)-associated coronavirus (SARS-CoV), has been identified as the causal agent of SARS. Spike (S) protein is a major structural glycoprotein of the SARS virus and a potential target for SARS-specific cell-mediated immune responses. A panel of S protein-derived peptides was tested for their binding affinity to HLA-A * 0201 molecules. Peptides with high affinity for HLA-A * 0201 were then assessed for their capacity to elicit specific immune responses mediated by cytotoxic T lymphocytes (CTLs) both in vivo, in HLA-A2. 1/Kb transgenic mice, and in vitro, from peripheral blood lymphocytes (PBLs) harvested from healthy HLA-A2.1 donors. SARS-CoV protein-derived peptide-1 (SSp-1 RLNEVAKNL), induced peptide-specific CTLs both in vivo (transgenic mice) and in vitro (human PBLs), which specifically released interferon-gamma (IFN-gamma) upon stimulation with SSp-1-pulsed autologous dendritic cells (DCs) or T2 cells. SSp-1-specific CTLs also lysed major histocompatibility complex (MHC)-matched tumor cell lines engineered to express S proteins. HLA-A * 0201-SSp-1 tetramer staining revealed the presence of significant populations of SSp-1-specific CTLs in SSp-1-induced CD8 T cells. We propose that the newly identified epitope SSp-1 will help in the characterization of virus control mechanisms and immunopathology in SARS-CoV infection, and may be relevant to the development of immunotherapeutic approaches for SARS.     

Prediction of HLA-A 2.1-restricted CTL epitopes from IGFBP7 antigen of lung carcinoma

Objective： With the development of peptide-based cancer specific immunotherapy, the prediction of CTL epitopes from insulin-like growth factor-binding protein 7 （IGFBP7） is very important for some research about tumor metastasis. Because HLA-A2.1-expressing individuals cover 〉50% in the population of China, we aimed at identifying IGFBPT-encoded peptide presented by HLA-A2.1. Methods： In our study, a HLA-A2.1 restricted CTL epitope was identified by using the following two-step procedure： （a） computer-based epitope prediction from the amino acid sequence of IGFBP7 antigen; （b） Validation with epitope molecular modeling. Results： We obtained four epitopes with high immunogenicity scores by all of the three algorithms, i.e., BIMAS, SYFPEITH1 and IMTECH. Each of the four candidates satisfied the criteria of the HLA-A2.1- restricted CTL epitopes in molecular modeling analysis. Conclusion： The combination of BIMAS, SYFPEITHI and IMTECH method can improve the prediction efficiency and accuracy. Due to this research herein, this four epitopes have potential value for further studied, also have potential application in peptide-mediated immunotherapy. These epitopes may be useful in the design of therapeutic peptide vaccine for lung carcinoma and as immunotherapeutic strategies against lung carcinoma after identified by immunology experiment.