消食颗粒化学成分鉴定及其治疗功能性消化不良的潜在作用机制研究

目的 对消食颗粒进行化学成分鉴定,并探讨其治疗功能性消化不良（FD）的潜在作用机制。方法 首先采用超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱对消食颗粒进行成分分析,再利用网络药理学方法筛选消食颗粒治疗FD的潜在作用靶点。利用AutoDock Tools 1.5.6软件对核心成分、靶点进行分子对接。结果 从消食颗粒中共鉴定出53种主要化学成分,主要是黄酮类与有机酸类化合物。网络药理学筛选出槲皮素、异鼠李素、山柰酚、芦丁等核心成分与雌激素受体（ESR1）、信号转导与转录激活因子（STAT3）、雄激素受体（AR）、细胞肿瘤抗原（TP53）、乳腺癌组织中缺氧诱导因子1亚基α(HIF1A)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶（SRC）6个核心靶点,获得磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-蛋白激酶B(Akt)、晚期糖基化产物（AGE）-晚期糖基化终末产物受体（RAGE）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等主要信号通路。分子对接结果表明,核心成分与核心靶点间具有较好的对接活性。结论 消食颗粒可能是通过槲皮素、异鼠李素、山柰酚等活性成分作用于STAT3、HIF1A、SRC等靶点,调节PI3K-Akt、AGE-RAGE、MAP...     

基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗(IR)的分子机制。方法 运用中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库,筛选菟丝子的化合物和有效靶点;使用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库预测IR的相关靶点,并利用Uniprot数据库转换成相应的基因名称;选取Cytoscape软件构建菟丝子—活性成分—靶点网络关系图、String数据库构建靶点蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络;利用David数据库进行GO生物学功能富集分析和KEGG通路富集分析,并绘制柱状图和气泡图;使用Autodocktools软件对活性成分与核心靶点进行分子对接分析。结果 获得菟丝子的关键化合物10个、药物靶点207个、疾病靶点1 279个、交集靶点122个,得到JUN、AKT1、TP53、RELA、MAPK1和TNF 6个PPI网络核心分子,网络药理学结果提示菟丝子可能通过TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路和FoxO信号通路等121条信号通路参与调控IR。分子对接结果显示,菟丝子中活性成分槲皮素、苦参碱、β-谷甾醇与核心靶点JUN、TP53、MAPK1和RELA间存在结合位点。...     

橘红痰咳液联合复方甲氧那明治疗感染后咳嗽的疗效观察

目的 运用网络药理学研究芍药甘草汤治疗乙型病毒性肝炎所致肝损伤的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取芍药甘草汤的化合物及靶点,以口服生物利用度（OB）≥30%和类药（DL）≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对应的基因Symbol;从TTD、OMIM等数据库获取乙型病毒性肝炎的相关靶点并筛选出与芍药甘草汤靶点基因的交集基因;运用Cytoscape3.8.0软件绘制活性成分-靶点、疾病-中药-化合物-交集靶点（基因）网络图;运用String构建蛋白相互作用网络,再用R语言的Bioconductor安装包,进行GO富集及KEGG通路富集分析,并联合主要化合物、交集基因与通路分析结果,绘制成分-靶点-通路网络图;用Vina软件对筛选出来的结果进行分子对接。结果 筛选得到芍药甘草汤有效成分105种、有效成分靶点214个;筛选得到乙型病毒性肝炎疾病靶点5 984个,药物-疾病交集基因198个;经蛋白互作网络及拓扑结构分析得到21个核心靶点,121条相互作用关系;槲皮素、山柰酚、柚皮素等为芍药甘草汤的主要活性成分,PPARA、RB1、TP53、MAPK3、AKT1、STAT3、JUN等为主要作用靶点。GO富集分析显示靶点所在的细胞组分主要为薄膜筏、膜微域、膜区域;生物学过程主要富集在有对金属离子的响应、对脂多糖的反应;分子功能主要为核受体活性、转录因子活性。KEGG富集发现膜区由糖基化终末产物介导的AGE-RAGE通路、乙型肝炎通路等为主要通路。进一步筛选核心靶点及化合物成分进行分子对接显示MAPK3、AKT1、STAT3、JUN作为核心靶点可与槲皮素、山柰酚、柚皮素稳定对接。结论 通过网络药理学及分子对接的方法,找到了芍药甘草汤治疗慢性乙型病毒性肝炎肝损伤可能的潜在靶点,预测了其发挥药理作用的关键通路。     

枳椇子抗肝纤维化作用网络药理学研究

目的 探讨枳椇子抗肝纤维化的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取枳椇子的活性成分,构建活性成分库。利用GeneCards和人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获取肝纤维化的潜在靶点,利用Venny平台与枳椇子活性成分靶点取交集,通过Cytoscape软件构建成分-靶点网络,并根据节点度值筛选得到核心成分。将共有靶点导入String构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,并根据节点度值筛选得核心靶点;采用R语言软件进行基因本体论（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 共获得活性成分7个,对应靶点183个,与肝纤维化共同靶点166个;枳椇子中槲皮素、山柰酚、柚皮素等6个成分为抗肝纤维化的核心成分;PPI网络分析得到AKT1,JUN,MAPK3等10个核心靶点;GO功能富集分析主要涉及金属离子应答、药物应答及化学刺激细胞应答等生物学过程,KEGG通路富集分析主要涉及肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素17(IL-17)及晚期糖基化终末产物及其受体等信号通路。结论 枳椇子可能通过槲皮素、山柰酚及柚皮素等多种成分,作用于AKT1,JU...     

基于网络药理学探究筋痛灵膏外用治疗肩关节周围炎的作用机制

目的　通过网络药理学对筋痛灵膏外用治疗肩关节周围炎的主要活性成分及其潜在的作用机制进行研究。方法　筋痛灵膏的主要活性成分和靶标于中药系统药理学分析平台（TCMSP）获取,肩关节周围炎的靶标通过五大疾病数据库查找获得。药物-疾病交互靶点在Venny平台上获取,并建立蛋白质相互作用网络来筛选出核心靶点。交集靶点在Metascape平台上进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组大百科全书数据库（KEGG）的富集分析。最后对药物主要成分和核心靶点进行分子对接。结果　共筛选出53个活性成分,121个重要靶点;其中,核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、谷甾醇、黄芩素,关键靶点为JUN、ESR1、TP53。GO功能富集分析得出筋痛灵膏作用的生物途径包括对异生素刺激的反应、细菌来源分子的反应、伤口愈合以及氧气水平的反应等。KEGG通路富集分析表明筋痛灵膏治疗肩关节周围炎主要富集在白细胞介素17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。结论　筋痛灵膏通过核心成分调控JUN、ESR1、TP53关键靶点,作用于多种生物途径来参与调节免疫反应、减少炎性反应,以达到治疗肩关节周围炎的作用。     

基于网络药理学和反向分子对接的西红花抗肿瘤作用机制研究

目的 运用网络药理学和反向分子对接技术探讨西红花抗肿瘤的作用机制。方法 通过检索文献和从中药系统药理学数据库（TCMSP）获取西红花的主要化学成分,利用PharmMapper服务器预测西红花活性成分的潜在靶点,通过UniProt数据库将西红花潜在靶点转换为对应的靶标基因,与GeneCards、OMIM和TTD数据库获得的肿瘤相关靶点进行映射分析,得到西红花抗肿瘤的潜在作用靶点。采用Cytoscape软件构建西红花“活性成分-靶点-疾病”相互作用网络,通过String数据库进行蛋白-蛋白相互作用分析,并利用Metascape平台进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用AutoDock、Pymol软件对活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出西红花中槲皮素、山柰酚、异鼠李素、苦番红花素和西红花苷Ⅰ等9个活性成分,可能作用于AKT1、CCND1、MMP9、EGFR、TP53等37个关键靶点,涉及P53信号通路及TNF信号通路等。分子对接显示可通过氢键、疏水作用等产生稳定结合。结论 初步探讨了西红花抗肿瘤的主要活性成分、关键靶点及通路,提示可通过诱导细胞凋亡等方式发挥抗肿瘤作用,为后...     

基于网络药理学和分子对接探讨八珍汤治疗乳腺癌的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨八珍汤防治乳腺癌的分子机制。方法 利用数据平台筛选八珍汤活性成分,利用数据库筛选乳腺癌相关靶点。以软件构建“药物-化合物-靶点”网络,并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出八珍汤有效成分2 336个,潜在靶点211个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、柚皮素、山柰酚与关键靶点ATK1、CASP3具有良好亲和力。结论 初步明确八珍汤治疗乳腺癌的作用机制是通过山柰酚、槲皮素、柚皮素等活性成分作用于AKT1、CASP3等关键靶点。     

基于网络药理学和分子对接探讨参苓白术散治疗代谢相关脂肪性肝病作用机制

目的 应用网络药理学方法和分子对接探讨参苓白术散治疗代谢相关脂肪性肝病的潜在作用机制。方法 根据TCMSP数据库搜集中药活性成分及其作用靶点,GeneCards、Drugbank数据库搜集疾病靶点,借助Cytoscape 3.9.1软件预测关键活性成分及核心靶点。交集靶点通过STRING数据库进行蛋白互作分析,Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后借助AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接验证。结果 筛得关键活性成分有槲皮素、豆甾醇、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、7-甲氧基-2甲基异黄酮、柚皮素等,核心靶点有AKT1、TNF、IL6、TP53、VEGFA、IL1B、CASP3、ESR1、MAPK3、PTGS2,潜在作用靶点主要富集在P53、TNF、IL17、Th17细胞分化等信号通路。分子对接结果显示结合力均良好。结论 参苓白术散治疗代谢相关脂肪性肝病具有多成分、多靶点、多通路的特点。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨六味地黄丸治疗胃腺癌的作用机制研究

目的 探讨六味地黄丸治疗胃腺癌的有效成分及其靶点的作用机制.方法 本研究通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索六味地黄丸中所有有效成分信息以及相关靶点,并运用Genecard、OMIM、TTD、Drugbank、DisGeNET数据库检索胃腺癌相关靶点,将疾病靶点与药物靶点进行比对,得出六味地黄丸治疗胃腺癌的相关靶点.利用Metascape数据库,对获取的靶点进行基因本体(GO)富集和京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析,并将有效靶点、通路导入Cytoscape 3.6.2构建网络图进行分析,再使用Autodock1.1.2软件对核心化合物与关键靶点进行分子对接.结果 通过筛选,六味地黄丸共有69个有效成分和156个与疾病相关的靶点;JUN、MAPK1、IL-6、AKT1、MAPK8、VEGFA、MYC、ESR1、EGF、HSP90AA1、RELA、FOS、EGFR、CCND1、AR、MMP9、STAT1、IL1B、PPARG、PTGS2是六味地黄丸抗胃腺癌的核心靶点.根据核心靶点筛选,发现六味地黄丸抗胃腺癌主要成分为槲皮素、山柰酚、薯蓣皂苷和四氢鸭脚木碱.将156个靶点通过GO富集发现其涉及细胞毒性、氧化应激、代谢、凋亡等多个方面,共得的36条通路,涉及肿瘤、代谢、免疫、信号转导、细胞凋亡等多个方面,其中肿瘤信号通路、晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路是其发挥功能的主要通路.结论 六味地黄丸可通过多成分、多靶点、多通路治疗胃腺癌.槲皮素、山柰酚、薯蓣皂苷和四氢鸭脚木碱可能是其中比较重要的4个成分,肿瘤信号通路、AGE-RAGE信号通路和TNF信号通路可能是本方发挥重要作用的3个通路.     

基于网络药理学和分子对接探讨西帕依麦孜彼子口服液抗良性前列腺增生的作用机制

摘要：目的:基于网络药理学和分子对接探讨西帕依麦孜彼子口服液抗良性前列腺增生（BPH）的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取西帕依麦孜彼子口服液的活性成分及靶点;通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank数据库获取BPH的靶点;获取药物-疾病交集靶点;构建"药物-成分-靶点"网络;建立蛋白互作网络（PPI）并进行拓扑分析;核心靶点进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析;核心成分与靶点进行分子对接验证。结果:西帕依麦孜彼子口服液治疗BPH的活性成分19个,作用靶点162个;排名前4的核心成分为槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、β-胡萝卜素,靶点为RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（AKT1）、转录因子AP-1（JUN）、丝裂原激活的蛋白激酶1（MAPK1）、抑癌剂p53（TP53）;主要涉及PI3K-AKT和MAPK等多条信号通路;核心成分与靶点具有较好的亲和力。结论:西帕依麦孜彼子口服液治疗BPH是通过多成分-多靶点-多通路共同作用实现的,为后续其机制研究提供依据。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤治疗膝骨关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术分析桃红四物汤治疗膝骨关节炎的作用机制。方法 通过TCMSP数据库,OMIM、Dis Ge NET、Gene Cards数据库,获取桃红四物汤有效成分及膝骨关节炎相关靶点,利用String平台和Cytoscape 3.9.1软件,构建并可视化中药-化合物-靶点-疾病多层次分子网络。运用Metascape数据库导入交集靶点,进行GO及KEGG富集分析。最后,利用Autodock Tools 1.5.6、Auto Dock Vina、Py Mol等软件开展分子对接虚拟计算。结果 网络分析结果表明,桃红四物汤治疗膝骨关节炎的潜在活性成分44个,主要包括槲皮素、山柰酚、木犀草素等,潜在靶点有218个,主要包括TNF、IL-6、AKT1等。富集分析结果显示,桃红四物汤治疗膝骨关节炎的核心靶点主要通过TNF信号通路、IL-17信号通路及PI3K/Atk信号通路等,调控炎性反应、细胞凋亡、转录因子反应等实现延缓膝骨关节炎进展的目的。分子对接计算结果表明,桃红四物汤所含的槲皮素、山柰酚、木犀草素等主要成分与TNF、IL-6、AKT1等核心靶点有着较好的结合活性。结论 ...     

复方黄连汤治疗食管癌的作用机制分析

目的 应用网络药理学和分子对接技术探讨复方黄连汤治疗食管癌的主要活性成分及分子作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库分析平台及GeneCards、OMIM等数据库,通过生物信息学分析方法获取复方黄连汤治疗食管癌的有效活性成分及对应潜在靶标,进行基因本体论（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析及分子对接分析。结果 筛选出药物化学成分30个,对应靶点183个,食管癌相关靶点5 625个,最终得出药物与疾病共同靶标154个。筛选出核心基因11个,分别为JUN、RELA、TP53、TNF、MAPK1、FOS、MYC、CDKN1A、CCND1、IL6、RB1。GO富集分析集中在对脂多糖、细菌起源分子、金属离子的反应等。KEGG通路富集分析主要涉及脂质和动脉粥样硬化信号通路等。槲皮素、山柰酚与食管癌的核心基因具有较好的结合性。结论 复方黄连汤中有效成分山柰酚、槲皮素可能通过MAPK等信号通路发挥抑制食管癌的作用。复方黄连汤治疗食管癌具有多成分、多靶点、多通路特点,为其临床应用提供了基础。     

槲皮素和山柰酚对痤疮相关致病菌抗菌作用及网络药理学研究

目的通过体外实验探究槲皮素和山柰酚对痤疮相关致病菌的抗菌作用，运用网络药理学和分子对接技术预测二者治疗痤疮的作用机制。方法 2022年 1月至 2022年 6月通过体外实验测定抑菌环直径、最小抑菌浓度( MIC)和最小杀菌浓度(MBC)、药物时间抑菌曲线评判槲皮素和山柰酚的抗菌活性；检索 DrugBank、HERB及 BATMAN-TCM数据库收集槲皮素和山柰酚作用靶点，检索 GeneCards、OMIM、DisGeNET、DrugBank数据库获得痤疮靶点；取两靶点集交集，通过 STRING数据库获得蛋白互作网络， CytoHubba拓扑分析得到核心靶点， Metascape数据库进行基因本体( GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析， AutoDock软件进行活性成分与核心靶点的分子对接验证。结果槲皮素和山柰酚对三种痤疮相关致病菌均有较好抗菌活性；槲皮素对三种菌的 MIC≤78.13 mg/L，MBC≤156.25 mg/L；山柰酚对金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的 MIC≤39.06 mg/L，MBC≤78.13 mg/L，对痤疮丙酸杆菌的 MIC≤78.13 mg/L，MBC≤156.25 mg/L。通过网络药理学筛选出 AP-1转录因子亚基( JUN)、转录因子 p65(RELA)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6等 8个核心靶点； KEGG富集分析示 IL-17信号通路、 TNF信号通路等 7条信号通路发挥关键作用；将两种化合物与 JUN、RELA、TNF、IL-6进行对接，结合自由能均小于 ?20.92 kJ/mol，表明化合物与核心靶点蛋白形成稳定构象。结论槲皮素和山柰酚对三种痤疮致病菌均有抗菌活性；网络药理学研究显示两种中药成分治疗痤疮具有多靶点、多通路协同特点，具有进一步开发和研究的价值。     

基于网络药理学和分子对接探讨芪参益心颗粒治疗射血分数保留型心力衰竭的作用机制

目的：基于网络药理学和药理学实验揭示芪参益心颗粒治疗射血分数保留型心力衰竭（heart failure with preserved ejection fraction,HFpEF）的生物活性化合物和分子机制。方法：通过TCMSP数据库收集芪参益心颗粒有效化学成分信息；DisGeNET、GeneCards、OMIM数据库获取HFpEF相关靶点；Metascape对芪参益心颗粒及HFpEF交集靶点进行GO及KEGG富集分析。利用STRING数据库PPI网络的构建与分析；Cytoscape3.7.2软件构建网络图；对主要活性成分与核心靶点用AutoDock Vina软件分子对接，用pymol对结果进行可视化分析。用CCK8法检测各组细胞存活率，对结果分析出的重要蛋白进行蛋白免疫印迹法（Western blot）验证。结果：共得到芪参益心颗粒66个成分及对应240个靶点，HFpEF对应靶点1 931个，芪参益心颗粒与HFpEF二者交集靶点127个，主要活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等；TNF、AKT1、IL-6、P53、JUN为核心靶点，分子对接显示关键成分与核心靶点对接良好；主要涉及...     

基于生物信息学和分子对接技术研究当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎潜在活性成分及分子机制

目的 采用生物信息学和分子对接技术,探讨当归六黄汤（DGLHD）治疗溃疡性结肠炎（UC）的作用机制。方法 采用公共数据库(TCMSP、DrugBank和UniProt)寻找当归六黄汤的有效活性成分和相应的靶基因,构建DGLHD活性成分-靶蛋白相互作用网络。基于DisGeNET数据库、Genecards数据库和DrugBank数据库检索溃疡性结肠炎相关基因,获取当归六黄汤与溃疡性结肠炎的交集靶点基因。利用STRING在线数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用关系（PPI）分析,获取核心靶点基因。采用Metascape在线数据库进行基因本体（GO）功能注释及KEGG通路富集。通过DiscoveryStudio 2016进行分子对接,确定药物活性成分与核心靶标相互作用的分子基础。结果 共筛选出82种活性化合物和132个交集靶基因。核心靶点基因涉及信号传导与转录激活因子3（STAT3）、TP53、AKT1、MAPK1、JUN和血管内皮生长因子A（VEGFA）;通路富集主要为“肿瘤信号通路”、“糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路”“内分泌抵抗”、“NF-κB信号通路”、“Th17细胞分化”。分子对接结果表明,当归六黄汤核心活性成分可以通过氢键等相互作用与核心靶基因形成稳定的对接模式。结论 基于生物信息学和分子对接技术,筛选出当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎的活性成分、核心靶点及主要信号通路,为当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎提供了新的理论基础。     

基于网络药理学和分子对接的栀子对缺血性脑卒中与出血性脑卒中共性干预机制探讨

目的 运用网络药理学和分子对接技术挖掘栀子对缺血性脑卒中和出血性脑卒中的共同干预机制,明确解毒中药治疗缺血性脑卒中和出血性脑卒中的共性靶点与关键通路。方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医百科全书（ETCM）、中药分子机制的生物信息学分析工具（BATMAN-TCM）以及中医药综合数据库（TCMID）收集栀子的活性成分,运用TCMSP、STTICH、Swiss数据库进行靶点预测,从在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、GeneCard数据库、DisGeNET数据库、TTD疾病数据库搜集缺血性脑卒中和出血性脑卒中的疾病靶点,将2者取交集得到的靶标导入STRING平台进行蛋白质相互作用（PPI）网络分析,运用Cytoscape软件进行网络拓扑分析,同时运用DAVID软件对交集靶标进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因组百科全书（KEGG）通路分析,最后利用分子对接技术验证栀子有效成分与核心靶点的结合作用。结果 从栀子中共筛选出68个活性成分,包括山柰酚、芹菜素、槲皮素、熊果酸、京尼平苷、栀子苷等,栀子活性化合物与缺血性脑卒中和出血性脑卒中相关的治疗靶点有205个,主要包括IL6、AKT1、INS、IL1B、VEGFA、TP53、MAPK3、CASP3、JUN、EGFR、MMP9等。分子对接显示栀子的有效成分芹菜素、槲皮素、山柰酚、熊果酸等与IL6、AKT1、IL1B、TP53、MAPK3、CASP3、MMP9具有良好的结合能力。栀子主要通过调节肿瘤坏死因子（TNF）、低氧诱导因子-1（HIF-1）、（叉头框蛋白） FoxO、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶（PI3K-Akt）等信号通路发挥缺血性脑卒中和出血性脑卒中共性干预的作用。结论 栀子对缺血性脑卒中和出血性脑卒中的共性干预主要通过抑制免疫炎症反应、调控细胞凋亡等过程发挥治疗作用。     

基于网络药理学研究孜亚比提片对2型糖尿病的潜在分子机制

目的 利用网络药理学方法研究孜亚比提片治疗2型糖尿病（T2DM）的分子机制。方法 从TCMSP、ETCM、CNKI中得到孜亚比提片化学成分和药物靶点,利用OMIM和GeneCards数据库筛选T2DM的疾病靶点;使用Cytoscape 3.6.1软件构建“药物-成分-靶点网络”筛选出核心成分;运用蛋白质相互作用网络筛选出核心靶点;通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果研究共收集到孜亚比提片活性成分144个,度值排名靠前的为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等。活性成分相关靶点823个,其中与T2DM相关的有700个,包含为SRC、MAPK1、MAPK3等。GO功能分析提示与信号传导、蛋白质磷酸化以及蛋白质结合等分子功能有关。KEGG通路富集分析所涉及的主要信号通路有脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路及HIF-1信号通路等。结论 孜亚比提片治疗T2DM具有多成分、多靶点、多通路协同干预的特点,其主要由槲皮素、山柰酚、异鼠李素等成分通过作用SRC、MAPK1、MAPK3靶点调控AGE-RAGE信号通路发挥综合治疗作用。     

基于网络药理学与分子对接探讨小儿豉翘清热颗粒治疗甲型流感的作用机制

目的 探讨小儿豉翘清热颗粒治疗甲型流感的网络药理学的作用机制。方法：运用TCMSP数据库筛选药物成分及靶点,并借助GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb数据库检索疾病靶点,利用Cytoscape 3.9.1构建“药物-活性成分-靶点”网络图,借助STRING构建蛋白互作网络图,筛选出核心靶点,通过DAVID数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,借助AutoDockTool运算分子对接结合能。结果 筛选出245种药物活性成分,269个药物靶点,2 045个疾病靶点,交集靶点131个。确定槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、豆甾醇、黄芩素、汉黄芩素、柚皮素为药物的关键成分,确定核心靶点为蛋白激酶B1（AKT1）、肿瘤坏死因子（TNF）、TP53、白细胞介素-6（IL-6）、IL-1B、血管内皮生长因子A（VEGFA）、信号转导和转录激活因子3（STAT3）、胱天蛋白酶3（CASP3）。分子对接结果显示各活性成分与潜在靶点结合能力良好。结论 小儿豉翘清热颗粒作用机制复杂,可能与Toll样受体信号通路相关,可通过联合多靶点、多通路、多效应达到治疗甲型流感的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨慈丹胶囊治疗肝癌的作用机制

目的 用网络药理学和分子对接方法探索慈丹胶囊治疗肝癌的潜在作用机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台及相关文献收集慈丹胶囊的活性成分和作用靶标,并用Cytoscape-3.8.0软件构建中药组分-活性成分-关键靶点网络图。用基因名片数据库筛选肝癌的潜在靶点信息。基于蛋白质相互作用数据库构建慈丹胶囊和肝癌交集靶点蛋白的互作网络图。用注释、可视化和集成发现数据库将交集靶点进行基因本体生物过程富集分析和京都基因与基因百科全书信号通路富集分析。通过分子对接考察关键活性成分与潜在靶点蛋白的作用方式。结果 慈丹胶囊可能通过槲皮素、山柰酚、木犀草素等59个主要活性成分作用于肿瘤抑制蛋白p53、肌动蛋白、丝/苏氨酸蛋白激酶1等127个关键靶点,进而调控癌症相关通路、磷脂酰肌醇3激酶-丝/苏氨酸激酶通路等肿瘤相关信号通路,诱导细胞周期阻滞和凋亡,从而达到治疗肝癌的目的。分子对接结果显示,慈丹胶囊中主要活性成分能够与多个度值较高的关键核心靶点很好地结合,进而可能对靶点蛋白产生激活或抑制作用。结论 慈丹胶囊治疗肝癌的潜在作用机制具有多成分、多靶点、多通路的作用特点。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨十九畏药对“郁金-丁香”抗肝纤维化作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨郁金-丁香药对抗肝纤维化的作用机制。方法 于2022年1月8日检索中药系统药理学数据平台（TCMSP）获取郁金和丁香的有效活性成分及相关靶点并进行筛选和预测;肝纤维化相关靶点的数据通过NCBI基因数据、OMIM数据库和Genecards数据库获取;运用软件Venny 2.1绘制药物-疾病靶点韦恩图,得到药物抗肝纤维化的作用靶点;运用Cytoscape 3.8.2软件构建药物-活性成分-靶点相互作用网络并分析其拓扑结构;运用String数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络图;利用David和Metascape数据库对关键靶点分别进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析;利用PubChem和RCSBPDB数据库对关键成分和靶点进行分子对接。结果 筛选得到郁金-丁香药活性成分44个,对应作用靶点200个,肝纤维化候选靶点3 951个,药物与疾病交集靶点155个。药物-活性成分-靶点网络和PPI网络分析显示槲皮素、山柰酚、柚皮素、β-谷甾醇等是药对治疗肝纤维化的关键成分,蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素（IL）-6、IL-1...