昆明地区丙型肝炎患者基因分型及其临床意义

近年研究显示,在我国不同地区HCV基因型存在差异。HCV基因型与肝病严重程度、干扰素应答等关系密切[1],因此越来越多地受到人们的重视。本研究对我院2008年7月至2009年3月收治的176例慢性丙型肝炎患者的血清进行基因分型,探讨昆明地区HCV基因型与HCVRNA含量,基因型与ALT、AST的关系。     

HCV基因型对慢性丙型肝炎干扰素疗效的影响

目的 探讨HCV基因型对慢性丙型肝炎的干扰素（IFN）治疗效果的影响。方法 采用随机、开放和对照的多中心临床试验设计。208例受试者按1：1随机分到聚乙二醇干扰素α—2a(Peg-IFN）组和IFN-α-2a组。在治疗之前，用Simmonds基因分型法酶切分型，在治疗24周结束和完成24周的随访后检测患者的ALT和HCV RNA，以HCV RNA的阴转率作为主要评价指标，经ITT人群的统计学分析。结果 202例患者确定了HCV基因型，基因1型158例（78.2%），非基因1型44例（21.8%），治疗结束病毒应答率（ETVR）和持续病毒应答率（SVR）基因1型患者分别为53.8%和25.3%，非基因1型患者分别为61.4%和43.2%，SVR两组患者差异有显著性，x^2=5.313,P=0.021。Peg IFN组基因1型和非1型患者的ETVR分别为76.8%和81.0%，SVR分别为35.4%和66.7%，SVR两组患者差异有显著性，x^2=6.735,P=0.01。病毒复发率基因1型和非基因1型患者分别为55.6%和23.5%，差异有显著性，x^2=5.496,P=0.02.IFN-α-2a组，ETVR和SVR基因1型患者分别为29.0%和14.5%，非基因1型患者分别43.5%和21.7%，差异无显著性。病毒复发率基因1型患者为72.7%，非基因1型患者为50.0%，差异无显著性。结论 IFN对基因1型丙型肝炎患者的疗效低于非基因1型，HCV基因型主要影响IFN对慢性丙型肝炎的持续应答，也与药物和IFN的疗程相关。     

四川省丙型肝炎患者HCV基因分型及基线HCV NS5A耐药突变位点分析

目的检测四川省丙型肝炎患者HCV基因分型及HCV NS5A耐药突变位点的分布特征。方法收集2017年-2018年在四川省人民医院确诊的来自四川省的丙型肝炎患者160例,采集外周静脉血标本,使用Sanger测序法鉴定每一样本的HCV基因型及其亚型和HCV NS5A的基因序列。结果 160例丙型肝炎患者共测出1、2、3、6四种基因型和1b、2a、3a、3b、6a、6n六种基因亚型,其中以1b亚型检出率最高,占86.25%(138/160),其次为3b、6a亚型,均各占3.75%(6/160),余下6n型占2.50%(4/160),2a、3a型均各占1.875%(3/160)。在HCV 1b亚型丙型肝炎患者在中,HCV NS5A基因耐药突变检出率为18.84%(26/138),其中以Y93H耐药突变率较高,占17.39%(24/138),其次L31M耐药突变率为1.45%(2/138)。结论分析四川省丙型肝炎患者HCV基因型及HCV NS5A耐药突变位点的分布特点,可为该地区丙型肝炎患者基因型分布及耐药性研究和个体化抗病毒治疗提供指导依据。     

昆明地区丙型肝炎基因型分析

HCV是造成慢性肝炎、肝硬化及肝癌的重要原因之一。现研究已知HCV基因组高度的变异性是HCV持续感染及严重预后的重要因素,且HCV基因型与感染途径、临床病情及抗病毒治疗、疫苗制备等有明显的相互关系。根据HCV基因的遗传差异性可将HCV分为不同的基因型和亚型。根据HCV基因型可以明确病毒的种系发育和传播来源,了解不同基因型和亚型的地理分布,可能与HCV治疗的疗程及效果相关。因此,针对当地流行的HCV基因型进行检测鉴定,具有重要的临床意义。本研究即以型特异性探针杂交法对176例HCV感染者进行HCV基因型研究,以探讨昆明地区HCV感染基因型流行特征。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因分型与血清HCV RNA水平的关系探讨

目的研究HCV基因型的分布,以探讨不同基因型感染者血清HCV RNA载量的差异。方法采用PCR法检测218例慢性丙型肝炎患者血清HCV RNA;采用ELISA法检测抗-HCV抗体;使用全自动生化分析仪测定丙氨酸氨基转移酶;采用化学发光免疫分析法测定血清肝纤维化指标;采用基因芯片法进行HCV基因分型。结果在218例HCV RNA阳性血清中共检出9种基因型,分别是lb、2a、3a、3b、6型单基因型共208例和lb+2a、lb+3b、lb+6型、2a+3a共10例四种混合基因型,其中以lb型168例(77.1%)、2a型19例(8.7%)为主;在208例HCV单基因型感染患者中发现不同基因型感染者血清HCV RNA载量无统计学差异(F=0.932,P>0.05);在168例1b基因型和40例非lb基因型感染者,性别差异无统计学意义(x2=0.857,P>0.05),两型感染者之间肝纤维化指标差别比较也无统计学意义。结论我国HCV基因型以lb型为主,基因型与HCV RNA载量及ALT水平之间无相关性。     

慢性丙型肝炎患者HCV基因型分析

目的研究慢性丙型肝炎患者HCV基因型概况。方法采用基因芯片法检测HCV基因分型;采用PCR法测定HCV RNA定量。结果在570例患者中,HCV RNA阳性552例（95%）,其中1b型400例（72.4%）,2a型63例（11.4%）,3a型20例（3.6%）,3b型20例（3.6%）,1b＋2a型12例（2.1%）,1a型2例（0.4%）,6型7例（1.26%）,1b＋3a型1例（0.18%）,2a＋1b型3例（0.5%）,未定型24例（4.3%）;不同HCV基因型感染者血清HCVRNA水平无统计学差异（P〉0.05）。结论本组患者HCV基因型以1b型为主,2a型次之,多种混合型的出现提示HCV基因型呈现多样化趋势。     

慢性丙型肝炎患者感染病毒基因型对抗病毒治疗应答的影响

目的：探讨丙型肝炎病毒基因型与抗病毒治疗后病毒学应答之间的关系。方法113例慢性丙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素（PEG-IFNα-2a）联合利巴韦林治疗48周。采用 Simmonds 基因分型法进行 HCV 基因分型。结果在113例患者中,基因1型88例（78.0%）,非基因1型25例（22.0%）;非基因1型患者快速病毒学应答率（RVR）明显高于基因1型患者（80%对48.8%,P＜0.05）;非基因1型患者持续病毒学应答率（SVR）明显高于基因1型患者（80.0%对64.8%,P＜0.05）;低病毒载量患者RVR 明显高于高病毒载量患者（78.9%对46.7%,P＜0.05）。结论 HCV 基因型和 HCV RNA 复制水平对 PEG-IFNα-2a 联合利巴韦林抗病毒治疗的疗效有一定的影响,提示 HCV 基因分型有重要的临床意义。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因型与IL-28B基因型分布

目的：了解慢性丙型肝炎患者白细胞介素-28B（IL-28B）基因型多态性分布的特点及其临床意义。方法在27例慢性丙型肝炎患者,分离外周血细胞DNA,采用IPLEX Gold法检测宿主IL-28B基因多态性;分析患者IL-28B基因型与血清丙型肝炎病毒（HCV）基因型、HCV RNA载量和肝功能指标的相关性。结果在27例慢性丙型肝炎患者中,感染HCV基因1型1例（3.7%）,1b基因型7例（25.9%）,其它基因型19例（19/27,70.4%）;在IL-28B基因型中,rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型及rs8099917 TT基因型共24例（88.9%）,而IL28B rs12979860 CT基因型、rs12980275 GA基因型和rs8099917 GT基因型共3例（11.1%）;在HCV基因1型或1b型感染者中,IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占62.5%（5/8）,而HCV其他基因型感染者IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占100%（19/19）;HCV基因1型或1b型感染者与HCV其他基因型感染者比,其IL28B rs12979860位点、rs12980275位点和rs8099917位点基因型分布有显著性差异（P＆lt;0.01）;IL-28B基因多态性分布与患者血清HCV RNA载量或肝功能指标的变化无显著性相关。结论本组慢性丙型肝炎患者HCV基因型大多为非1型;大多数感染者IL-28B基因为rs12979860 CC、rs12980275 AA和rs8099917 TT基因型。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因分型与肝生化、脂代谢血清学指标的相关性研究

目的：探讨慢性丙型肝炎患者病毒基因型分布特点,以及不同 HCV 基因型患者肝生化和脂代谢指标的差异。方法应用荧光定量 PCR 和基因分型芯片对慢性丙型肝炎患者血清样本进行 HCV RNA 检测和基因分型,同时检测患者 GGT、ALT、AST、LDL-C、Apo-AⅠ、Apo-B、TG 和 TC。采用 SPSS19．0统计分析软件比较不同 HCV 基因型患者病毒载量、肝生化和脂代谢血清学指标的差异。结果我院慢性丙型肝炎患者中1b 型占77．1％,3b 型10．8％,2a 型7．4％,1b／2a 型3．5％,3a 型1．3％;1b 型和3b 型患者病毒载量高于2a 型和1b／2a 型（P ＜0．05）;3b 型患者 Apo-B和 TC 低于1b 型和2a 型患者（P ＜0．05）;肝生化和其余几项脂代谢指标在不同 HCV 基因型患者间无统计学差异。结论慢性丙型肝炎患者感染 HCV 1b 基因型较为常见,其次是3b 型和2a 型;不同 HCV 基因型患者肝生化无显著差异,但病毒载量和脂代谢指标差异有显著性。     

不同基因型慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA与载脂蛋白B的关系

目的研究慢性丙型肝炎基因1型和非基因1型患者血清HCV—RNA水平和血清载脂蛋白B（ApoB）的关系。方法临床确诊为慢性丙型肝炎的53例患者，采用干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗至少24周，Simmonds酶切分型方法进行HCV基因分型，荧光定量聚合酶链反应法（FQ—PCR）定量检测HCV—RNA，全自动生化分析仪检测血清载脂蛋白B，对不同基因型患者血清HCV-RNA水平和载脂蛋白B的关系进行研究分析。结果基因1型和非基因1型慢性丙型肝炎患者的血清HCV-RNA及载脂蛋白B水平差异无统计学意义（P〉0．05）；基因1型患者血清载脂蛋白B水平与HCV—RNA载量无明显相关（P〉0．05）；非基因1型患者血清载脂蛋白B水平随着HCV-RNA载量的降低呈升高趋势（P〈0．05）。结论不同基因型HCV对干扰素产生不同的应答反应，感染HCV基因1型的患者对干扰素治疗应答率显著低于基因2型和3型。不同基因型HCV感染者血清载脂蛋白B无显著差异，血清ApoB水平在非基因1型患者与干扰素抗HCV应答密切相关。     

普通干扰素1b联合利巴韦林治疗非1b型慢性丙型肝炎患者临床观察

目的探讨不同基因型HCV感染者对普通干扰素联合利巴韦林治疗的疗效。方法应用型特异性探针杂交法检测106例慢性丙型肝炎患者HCV基因型。应用普通干扰素联合利巴韦林治疗,观察病毒学应答情况。结果在106例患者中,以HCV 3b（45.3%）、1b（20.8%）和3a（18.9%）型为主,6a（9.4%）和2a（5.7%）型次之;在22例1b型感染者,只有9例接受本治疗方案,82例非1b型感染者完成治疗。非1b型患者的RVR和EVR分别为50%和86.6%;在1b型HCV感染者,22.2%（2/9）获得SVR,而非1b型HCV感染者,76.8%（63/82）获得SVR。结论普通干扰素联合利巴韦林治疗非1b型慢性丙型肝炎患者疗效较好。     

儿童丙型肝炎

近年来静脉药物滥用、通过污染的针头和母婴传播等已成为丙型肝炎病毒（HCV）传播的重要方式。HCV准种多态性的增加与成人抗病毒治疗反应欠佳有关，而且也可能与儿童自然感染史有关，但临床上HCV准种的检查并非常规项目。HCV可分为6个主要基因型。HCV基因型1、2在全球最常见，但病毒基因型的分布与地域因素存在联系。在美国，成人感染中HCV1、2和3基因型分别占到70％、15％和10％。尽管对HCV基因型在儿童感染中的地域性分布知之甚少，但总体与成人报道结果基本一致。     

慢性丙型肝炎患者年龄和感染方式对抗病毒治疗应答的影响

目的探讨患者年龄和感染方式与慢性丙型肝炎患者抗病毒疗效的关系。方法应用聚乙二醇干扰素联合利巴韦林治疗113例慢性丙型肝炎患者。采用实时荧光PCR法检测血清HCV RNA定量;采用CE1区测序遗传树比对分析法检测HCV基因型。结果在20例有静脉吸毒史的患者,获得持续病毒学应答率（95.0%）明显高于54例医源性感染患者（75.9%,P〈0.05）和39例既无静脉吸毒史又无明显医源性感染患者（69.2%,P〈0.05）;在年龄≤40岁的患者,获得持续病毒学应答率（82.9%）明显高于年龄〉40岁的患者（65.1%,P〈0.05）;有静脉吸毒史的患者主要感染HCV3型（45%）和6型（50%）,而医源性感染组和其他组感染HCV1b型的比例分别为51.9%和43.6%;在无静脉吸毒史的患者中,年龄≤40岁组患者感染非HCV1型（2型、3型和6型）的比例达64.7%,而年龄〉40岁组患者感染HCV1型的比例达64.3%。结论慢性丙型肝炎患者年龄及感染方式可作为判断感染病毒基因型的参考指标,对抗病毒治疗的疗程确定和疗效预测有一定的意义。     

HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析*

目的 使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒（HIV）/丙型肝炎病毒（HCV）混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点。方法 在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证。结果 HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者（77.7%对19.6% P<0.001）,HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者（48.6%对3.2% P<0.001）;HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为（15456±6689） reads,HCV感染者为（14323±5321） reads,两组无显著差异（P>0.05）;HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为（16432±3467） reads,HCV感染者为（17611±5632） reads,也无显著差异（P>0.05）;本组228例（97.9%）HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者（分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005）,HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者（20.0%对59.4%,P<0.001）;在233例入组的HCV感染者中,发现5例（2.1%）为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者。结论 广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨。     

I型干扰素可以快速抑制HCV颗粒的产生

【据《Hepatology》2014年7月报道】题：I型干扰素可以快速抑制HCV颗粒的产生（作者Meredith LW等）干扰素（IFNα）治疗慢性丙型肝炎已超过20年，其疗效与感染的病毒基因型相关。IFNα作用机制虽尚未完全清楚，但现在一般认为其靶向在HCV生命周期的多个阶段发挥作用，如抑制病毒的转录和翻译进而使被感染细胞内病毒RNA和蛋白降解。     

丙型肝炎诊断试验及其应用分析

临床上采用丙型肝炎(丙肝)病毒(HCV)标志物来诊断丙型肝炎和评价抗病毒药物疗效,如抗HCV、HCV RNA定性和定量试验以及HCV基因型;衡量丙肝肝纤维化和肝硬化常采用肝功能试验、非创伤性肝纤维化血清学标志、影像学、肝活体组织检     

10例慢性丙型肝炎病人血清HCV RNA检测及基因分型

应用Ａｍｐｌｉｃｏｒ ＰＣＲ试剂盒检测１０例慢性丙型肝炎和３例慢性乙型肝炎病人血清ＨＣＶ ＲＮＡ,并对其中３例ＨＣＶ ＲＮＡ阳性者ＩＮＮＯ－ＬｉｐＡ基因分型试剂盒进行分型。结果３例慢性丙型肝炎为ＨＣＶ ＲＮＡ阳性,基因型均为１ｂ型。     

丙型肝炎的联合抗病毒治疗进展

丙型肝炎病毒(HCV)感染是慢性肝炎及终末期肝病的重要原因，其具有很大的隐匿性，往往在常规生化或免疫学检查时被发现。抗病毒是治疗丙型肝炎的关键；干扰素联合利巴韦林已成为抗HCV治疗的经典方案。但由于HCV具有大量基因型、亚型及高度变异性，特别是基因1b型HCV感染，各种抗病毒治疗并不能达到理想的治疗效果，随着聚乙二醇干扰素的大规模应用，联合治疗或为较好的治疗方案。     

山东地区慢性HCV感染者病毒的基因型分布

目的明确山东地区慢性丙型肝炎及丙肝肝硬化患者感染丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布,探讨HCV基因型与肝脏疾病严重程度及感染途径之间的关系。方法根据HCV 5′非编码区(NCR)设计基因芯片,对山东地区慢性HCV感染者(慢性丙型肝炎128例,丙肝肝硬化42例)应用基因芯片法检测HCV基因型,并对其中22份标本进行测序,比较慢性丙型肝炎、肝硬化病人HCV基因型分布以及不同途径感染的病HCV人基因型分布的差别。结果 168例患者标本可以分型,HCV基因型分别为:1b型106例,2a型48例,1a及3b型均为2例,1b+2a混合型9例,1a+1b混合型1例;对22例患者标本测序,1b型12例,2a型9例,3b型1例,与基因芯片法检测结果完全一致;肝硬化和慢性肝炎病人的HCV基因型分布差异无统计学意义(χ2=1.82,P>0.05),有输血史者和无输血史者HCV基因型分布差异无统计学意义(χ2=7.63,P>0.05)。结论山东地区HCV主要流行株是基因1b型,其次为2a型,同时有少量的1a、3b型以及混合感染,HCV基因型与疾病的进展及感染途径无关。     

2005年病毒性肝炎的新进展（下）

丙型肝炎 几篇章报道了感染HCV基因2／3型患短期治疗的可行性、难治患的治疗措施及新型疗法的相关资料。