胃癌组织环状RNA表达谱分析

目的: 研究胃癌组织环状RNA（circular RNAs,circRNAs）表达的变化,以及circRNAs-miRNAs-mRNAs的竞争性内源RNA网络调控的机制。方法: 从GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中选出GSE78092、GPL19978（GSE83521和GSE89143）、GSE100170和STAD（未上传）共5个数据集,分析其差异表达circRNAs,并利用Starbase、TargetScan等数据库进行生物信息学分析。结果： 从胃癌组织与癌旁组织共获得734个差异表达的circ-RNAs,根据P＜0.05、差异表达倍数＞1.5倍筛选得到17个circRNAs。用Starbase数据库分析circRNAs和miRNAs的互作关系,共发现354个靶miRNAs,并利用GEO数据库（GSE23739）验证筛选得到46个miRNAs,利用TargetScan数据库分析其靶向的mRNAs。京都基因与基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）分析和基因本体论（gene ontology,GO）分析表明靶基因主要在转录调控、RNA代谢过程、细胞内信号级联和蛋白质定位等方面促进或者抑制胃癌的发生发展。结论： 差异分析表达的17个circRNAs形成circRNAs-miRNAs-mRNAs的竞争性内源RNA网络,可通过调控转录和RNA代谢等过程调节胃癌的发生发展。     

环状RNA在帕金森病中作用机制研究进展

帕金森病(Parkinson’s disease, PD)是一种以黑质中多巴胺能神经元退行性死亡为特征的神经退行性疾病,表现出一系列运动症状和非运动症状,对患者的生存质量产生严重影响。circRNA是一种共价闭环非编码RNA,在PD病程进展中发挥重要作用。本文就circRNA参与氧化应激、调节转录水平、神经炎症、自噬和α-synuclein方面进行综述。     

环状RNA在免疫相关疾病中的作用

环状RNA（circRNAs）是一种无3’聚腺苷化［poly-(A)］尾或5’帽的共价闭合环结构非编码RNA（ncRNA）,是一个崭新的研究领域。环状RNA最早于20世纪70年代在RNA病毒中被发现,但由于传统的多聚腺苷酸转录组分析的局限性,最初发现的circRNAs数量很少。由于特定的生化和计算方法的发展,近年来的研究表明,大量circRNAs在真核转录组中自然而广泛地存在。研究发现circRNAs在多种生理和病理过程中发挥重要作用,如充当miRNA海绵、与RNA结合蛋白（RBP）结合、作为转录调控因子,甚至作为翻译模板。研究者认为circRNAs可能是与各种疾病的诊断、疗效和预后相关的潜在生物标志物,由于其稳定性和组织及发育阶段的特异性,可能成为有效的治疗靶点。本综述重点讨论circRNAs的特性及其免疫功能并揭示其在免疫相关疾病中的作用。     

肝癌细胞来源的外泌体作用正常肝细胞后差异表达环状RNA的筛选

目的 筛选肝癌HepG2细胞外泌体处理LO2细胞后差异表达的环状RNA(circRNA),并通过生物信息学预测分析其可能在肝癌发生、发展中的作用.方法 收集经HepG2细胞外泌体共同培养后的LO2细胞和正常培养的LO2细胞样本,采用Arraystar Human circRNA Arrays V2芯片检测、筛选差异表达的cir-cRNA;进行聚类分析筛选明显差异表达的circRNA,并用实时荧光定量聚合酶链反应方法进行初步验证.筛选获得的circRNA利用基因本体论和京都基因与基因组百科全书分别进行基因功能注释分析及信号通路富集分析.结果 经HepG2细胞外泌体处理的LO2细胞与正常培养的LO2细胞比较,以差异表达倍数(FC)>2且P<0.05为筛选标准,筛选出235个差异表达的circRNA,其中50个circRNA上调表达,185个circRNA下调表达.经生物信息学分析,筛选出5个明显上调的circRNA(hsa_circRNA_0010044、hsa_circRNA_009012、hsa_circRNA_101016、hsa_circRNA_100917、hsa_circRNA_007918)和5个明显下调的circRNA(hsa_circRNA_002082、hsa_circRNA_103128、hsa_circRNA_092388、hsa_circRNA_007343、hsa_circRNA_071935).这些cir-cRNA经HepG2细胞外泌体处理后的LO2细胞中的表达水平与筛选结果一致.被富集的宿主基因主要参与蛋白质结合、细胞周期、转录调节、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等.结论 筛选出5个明显上调和5个明显下调与肝癌发生、发展相关的circRNA.     

宫颈癌相关生物标志物的研究进展

<正>宫颈癌是女性常见的恶性肿瘤之一,每年全世界有47万新发病例和23.3万死亡病例,其中,我国每年新发病例在11万以上,有2~3万患者死于宫颈癌~([1])。随着对宫颈癌的深入研究,对其标志物的研究也取得了快速进展,现就与宫颈癌相关的生物标志物综述如下。1与表观遗传学相关的生物标志物最初研究表明微小RNA(miRNAs)无功能并被降     

相关环状RNA与汉族2型糖尿病发生风险的关系研究

背景 糖尿病患病率逐年上升,目前的诊断方法对2型糖尿病（T2DM）的早期诊断存在很多不足之处。表观遗传学可影响胰岛β细胞的发育和分泌功能、降低机体对胰岛素的敏感性等,最终导致T2DM的发生。 目的 观察汉族T2DM患者外周血hsa_circ_0005414、hsa_circ_0139634、hsa_circ_0032491、hsa_circ_0002922的差异表达情况及临床意义,探讨候选环状RNA（circRNAs）与汉族T2DM的关系。 方法 选取2020年9月至2021年6月在石河子大学医学院第一附属医院内分泌代谢科就诊的21例汉族T2DM患者（T2DM组）,并选取同期体检的汉族健康者22例（健康对照组）。检测各组糖代谢相关指标和4个候选circRNAs的相对表达水平（2-ΔΔCT）。采用多元线性回归分析探究候选circRNAs与糖代谢相关指标的关系;采用受试者工作特征（ROC）曲线和单因素Logistic回归分析探究候选circRNAs与T2DM患病风险之间的相关性,并评估其对T2DM的诊断价值。 结果 T2DM组hsa_circ_0032491、hsa_circ_0002922相对表达水平均高于健康对照组,hsa_circ_0005414、hsa_circ_0139634均低于健康对照组（P<0.05）。多元线性回归分析结果显示,空腹血糖（FPG）、Log2空腹胰岛素（FINS）是影响汉族人群hsa_circ_0032491相对表达水平的影响因素（P<0.05）,且R2=0.503。hsa_circ_0005414、hsa_circ_0139634、hsa_circ_0032491、hsa_circ_0002922诊断T2DM的ROC曲线下面积分别为0、0.199、0.968、0.844。单因素Logistic回归分析结果显示,hsa_circ_0139634相对表达水平升高可降低T2DM的患病风险〔OR=0.092,95%CI（0.016,0.520）,P=0.007〕,hsa_circ_0032491〔OR=3.607,95%CI（1.625,8.004）,P=0.002〕、hsa_circ_0002922〔OR=5.105,95%CI（1.683,15.482）,P=0.004〕相对表达水平升高可增加T2DM的患病风险。 结论 hsa_circ_0032491、hsa_circ_0002922可作为诊断汉族T2DM的生物学标志物;hsa_circ_0139634、hsa_circ_0032491、hsa_circ_0002922是汉族T2DM患病的独立预测因子,hsa_circ_0139634相对表达水平升高可降低T2DM的患病风险,hsa_circ_0032491、hsa_circ_0002922相对表达水平升高可增加T2DM患病风险,其可能在T2DM发病机制中起重要作用。     

环状RNA在神经退行性疾病中的作用及机制研究进展

环状RNA(circRNA)是一类保守、稳定、含量相对丰富的单链闭环非编码RNA,可在转录前后多个水平调控基因表达,从而广泛参与多种生理、病理生物学过程。近年研究表明,circRNA在许多神经退行性疾病（NDD）发生、发展过程中起重要作用,可能成为NDDs敏感、准确的诊断和预后标志物;靶向起关键调控作用的circRNA有望提高NDDs治疗效果,改善患者预后。该文综述了circRNA在各种神经退行性疾病中作用及机制研究进展。     

环状RNA在鼻咽癌中的研究进展

鼻咽癌是头颈部最常见的恶性肿瘤,发病主要位于东非和亚洲,其中中国南部发病率最高.鼻咽癌病因尚不明确,可能与遗传,环境或EB病毒感染有关.近年来研究表明环状RNA(circular RNA,circRNA)作为一类具有共价闭环结构的内源性非编码RNA,可成为鼻咽癌研究领域新的肿瘤标记物.本综述主要阐述circRNA在鼻咽...     

环状RNA在胃癌研究中的意义

环状RNA(circRNA)是一类无5'帽子结构或3'末端poly(A)尾巴的单链共价闭合的非编码RNA,其丰富多样,还具有保守性、稳定性和特异性.胃癌是常见的消化道恶性肿瘤之一,发病率及病死率均较高.目前大量研究发现环状RNA通过作为微小RNA(microRNA,miRNA)的分子海绵,发挥与RNA结合蛋白(RBP)相互作用或翻译蛋白等功能,从而参与多种疾病的发生发展,其中就包括胃癌.环状RNA在胃癌中的特异表达展现了其成为新的生物标志物的潜力,对胃癌细胞的增殖、凋亡、迁移侵袭均有影响,这为胃癌的治疗提供了新思路.本文将从环状RNA的生物特性、功能及其与胃癌的关系,存在的临床意义等方面进行综述.     

环状RNA在整形外科中的研究进展

环状RNA(circRNA)是一类结构稳定的非编码RNA分子,在基因调控、生长发育、疾病发生等方面具有重要影响.在神经、心血管系统疾病、肿瘤侵袭转移等方面,circRNA可作为生物标志物,为相关疾病的精准治疗提供靶点.整形外科疾病以先天性畸形或组织缺损为主要特征,治疗方案以手术为主.近年来,关于circRNA分子的研究...     

环状RNA在胃癌研究中的意义

环状RNA(circRNA)是一类无5'帽子结构或3'末端poly(A)尾巴的单链共价闭合的非编码RNA,其丰富多样,还具有保守性、稳定性和特异性.胃癌是常见的消化道恶性肿瘤之一,发病率及病死率均较高.目前大量研究发现环状RNA通过作为微小RNA(microRNA,miRNA)的分子海绵,发挥与RNA结合蛋白(RBP)相互作用或翻译蛋白等功能,从而参与多种疾病的发生发展,其中就包括胃癌.环状RNA在胃癌中的特异表达展现了其成为新的生物标志物的潜力,对胃癌细胞的增殖、凋亡、迁移侵袭均有影响,这为胃癌的治疗提供了新思路.本文将从环状RNA的生物特性、功能及其与胃癌的关系,存在的临床意义等方面进行综述.     

环状RNA在缺血性脑卒中领域的研究进展

环状RNA(circRNA)是一种非编码RNA,其3’和5’端连接在一起,构成了一种共价闭合的环状结构。缺血性脑卒中后,机体发生了包括氧化应激、线粒体功能障碍、炎症、内质网应激、细胞凋亡和自噬在内的多种病理生理机制。circRNA主要通过海绵吸附微小RNA(microRNA),调节缺血性脑卒中相关基因表达水平,参与脑卒中的调控。在缺血性脑卒中发生后,部分circRNA对大脑发挥保护作用,而另一些circRNA则对大脑有损害作用。研究表明circRNA很有潜力在未来为缺血性脑卒中提供新的诊疗方法。本文就circRNA在缺血性脑卒中领域的研究进展进行综述,并对circRNA的未来应用进行展望。     

环状RNA在胰腺癌中的研究进展

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类特殊的内源性非编码RNA,最初在植物类病毒、酵母线粒体和丁型肝炎病毒中被发现.近些年随着研究的逐步深入,高通量测序结果显示大量circRNA在胰腺癌(pancreatic cancer,PC)组织或胰腺癌细胞系中表达异常,并通过调控下游靶分子如微小RNA(micro RNA,miRNA)或RNA结合蛋白(RNA-binding protein,RBP)参与胰腺癌的发生、发展、耐药、自噬及免疫逃逸,有潜力成为肿瘤的诊断标志物和治疗靶点,成为胰腺癌领域的又一研究热点.本文归纳了近年来胰腺癌领域研究较深入的circRNA,并就其作用机制和应用前景进行综述及探讨.     

泌尿生殖系统肿瘤的表观遗传学生物标志物研究新进展

肾癌、膀胱癌、前列腺癌及睾丸癌是泌尿生殖系统常见的恶性肿瘤。现有的检验手段不能兼顾敏感性和特异性,并且难以在早期诊断疾病,导致患者错过最佳的诊治时期。表观遗传学生物标志物,如微RNA、DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等是近年的研究热点,有望革新泌尿生殖系统肿瘤的筛查、诊断和预后评估,而且还能预测疾病对治疗的反应性。     

环状RNA在心血管疾病中的研究进展

心血管疾病是人群中最主要的死亡原因,虽然目前诊疗方法在一定程度上可缓解心血管疾病的进展,但仍存在诸多不足,需进一步探索新的治疗靶点。环状RNA(circRNA)是不同于传统线性RNA的一种特殊非编码RNA,通过5’端和3’端的反向剪接或由内含子直接环化而成,其具有半衰期长、性质稳定、含量丰富、保守性好的特点,已有研究表明circRNA通过各种机制参与心血管疾病的病理发展,有望成为心血管疾病新的生物标志物。现对circRNA的形成机制、生物功能及其对多种心血管疾病的调控作用进行综述。     

环状RNA在三阴乳腺癌中的研究进展

三阴乳腺癌(TNBC)是乳腺癌中恶性程度最高的亚型,其特征为不表达雌激素受体、孕激素受体和人表皮生长因子受体2。TNBC具有易侵袭和转移、预后不良、对常规化疗或靶向治疗效果不佳的临床特点。研究表明,环状RNA(circRNA)在TNBC组织表达异常,并与TNBC患者的临床病理特征和预后相关。circRNA可通过调控转录和剪接、作为微小RNA海绵、与蛋白质结合以及作为翻译模板,参与TNBC肿瘤细胞增殖、转移和耐药过程。因此,circRNA在TNBC的早期诊断、临床治疗和预后监测方面有广泛的应用前景。本文阐述了circRNA的形成和作用机制,并总结了circRNA在TNBC中的生物学功能和临床意义。     

circRNA CPT1A在2型糖尿病患者外周血的差异表达

目的：通过观察circRNA CPT1A在2型糖尿病患者外周血中的相对表达水平,探讨circRNA CPT1A在2型糖尿病中的临床价值。方法：收集石河子大学医学院第一附属医院就诊的20例2型糖尿病患者及20例健康体检者的外周血以及一般资料,完善糖耐量试验,检测糖尿病及健康对照组外周血的相关生化指标,通过qRT-PCR技术检测circRNA CPT1A的相对表达水平;采用ROC曲线评价circRNA CPT1A在T2DM中的诊断价值;采用相关性分析探讨目标circRNA与糖脂代谢指标之间的相关性;采用Logistic回归模型分析circRNA CPT1A对T2DM患病风险的影响。结果：2型糖尿病组circRNA CPT1A相对表达水平均高于健康对照组（P<0.001）。ROC曲线显示circRNA CPT1A在2型糖尿病中具有一定的诊断价值。相关性分析中显示circRNA CPT1A的表达水平与空腹血糖、糖负荷后2 h血糖、HOMA-IR、HOMA-β、甘油三酯存在着相关关系（P<0.05）。Logistic回归分析显示circRNA CPT1A相对表达水平可升高2型糖尿病的...     

环状RNA与2型糖尿病关系及其临床应用

环状RNA(circular RNA)是一类新发现的具有共价闭合环的非编码RNA,在2型糖尿病的发生发展中扮演着重要角色。本文从环状RNA调控胰岛β细胞功能及其调控心脏、肾脏等器官的代谢活动两方面,综述了环状RNA与2型糖尿病的关系,同时指出了环状RNA作为2型糖尿病及其并发症临床诊断标志物的可能性,以期为2型糖尿病的预防、诊断和治疗提供参考和研究方向。