噬菌体表达短肽模拟乙脑病毒糖蛋白的研究

为研究日本脑炎病毒 (JEV )E蛋白模拟肽 ,将抗JEVE蛋白的mAb 2H4淘筛噬菌体 15肽库。经夹心ELISA、竞争ELISA鉴定后 ,随机挑取 10个阳性克隆 ,测序并与JEVE蛋白同源比较。将阳性噬菌体免疫小鼠 ,检测血清中特异性抗体。ELISA结果显示筛选到的噬菌体能特异地与mAb 2H4结合 ,并且这种结合可被JEV天然抗原所竞争抑制。 10个阳性克隆的氨基酸序列相同 :—RQDPQWPYANSTIAR— ,同源分析得到的序列STXAR可能为mAb 2H4识别的模拟表位。阳性噬菌体表达的 15肽能够刺激小鼠产生特异性抗体。该噬菌体表达短肽模拟JEVE蛋白的部分抗原性。     

用噬菌体肽库筛选IBDV单克隆抗体的模拟表位

目的:筛选法氏囊病毒(IBDV)单克隆抗体所针对的模拟抗原表位。方法:以纯化的3株IBDV单克隆抗体为靶分子用噬菌体12肽库筛选相应抗原模拟表位;应用间接和竞争ELISA鉴定所筛选的阳性样品;最后对与抗体高亲和结合的噬菌体进行测序分析。结果:经过四轮淘洗,随机挑取30个克隆经间接ELISA鉴定,发现其中22个克隆结合活性较高。进一步应用竞争ELISA,获得14个噬菌体克隆,其抑制率高达50%以上。对这些噬菌体进行DNA测序,并分析比对了IBDV相应序列,确定了3个抗原模拟表位。结论:通过噬菌体随机肽库成功筛选出3个IBDV模拟表位,为进一步研究IBDV抗原性质奠定了基础。     

从噬菌体环肽库中筛选TNF-α表位模拟肽的研究

目的：用具有中和活性的抗TNF—α单抗(mAb)J1D9筛选噬菌体环七肽库，从中获得可模拟TNF—α表位的短肽。方法：筛选TNF—α表位模拟肽，并用夹心ELISA法鉴定阳性克隆。结果：对环七肽库进行3轮筛选后，随机挑选20个噬菌体克隆，经ELISA鉴定出9个阳性克隆。DNA序列分析后，推导的氨基酸序列共3种：c—RRPAQSG—c、c—NKHNRKI—c和c—RGMSRKI—c。结论：筛选的环七肽克隆展示肽具有TNF—α的抗原性，为TNF—α表位模拟肽。     

从噬菌体12肽库筛选旋毛虫抗原模拟表位

为研究和开发新的旋毛虫病诊断抗原和疫苗 ,以纯化旋毛虫病患者血清免疫球蛋白 (Ts Ig)对噬菌体1 2肽库进行 5轮筛选获得旋毛虫抗原模拟表位 ,随机挑选 2 4个克隆 ,通过ELISA选取吸光度 (A)较高的 6个克隆 (T1～T6 )并检测其灵敏性和特异性。结果显示 :T1～T6灵敏性与旋毛虫幼虫抗原 (TsA)相同 (阳性反应率 :1 0 0 % ,P >0 0 5 ) ,特异性与TsA无明显差异 (阳性反应率 :0～ 4 0 % ,P >0 0 5 ) ,其中T3,T6与肺吸虫病患者血清无交叉反应 ,特异性高于TsA(P <0 0 5 ) ,T6与日本血吸虫病患者血清无交叉反应 ,特异性亦高于TsA(P<0 0 5 ) ,证实利用噬菌体 1 2肽库可以成功地筛选到旋毛虫抗原模拟表位 ,为旋毛虫病诊断抗原和疫苗的研究和开发提供了新的研究途径     

应用噬菌体随机肽库技术筛选SARS-CoV S蛋白模拟表位

目的筛选SARS病毒(Severe acutere spiratorysyndromeas sociated coronavirus,SARSCoV)结构蛋白S(Spike)特异性的模拟表位,为抗SARS疫苗研究提供基础。方法以抗SARS病毒S蛋白的单克隆抗体为固相筛选分子,对人工合成的噬菌体随机12肽库进行5轮“吸附洗脱扩增”的筛选,随机挑选30个克隆,经噬菌体酶联免疫吸附(ELISA)法和交叉反应实验鉴定阳性克隆,再进行DNA序列分析和竞争抑制结合实验,以确定SARS病毒S蛋白的模拟表位。结果经噬菌体富集后,从随机挑选的30个克隆中得到了29个编码8种12肽的阳性克隆,8条肽与S蛋白的320～350氨基酸序列有较高同源性,确定YF、W、E和K氨基酸残基为模拟表位的骨架结构。结论用噬菌体12肽库成功筛选到了SARS病毒S蛋白的模拟表位,为基于S蛋白的肽疫苗研制提供了基础。     

从噬菌体短肽库中筛选模拟乳腺血清抗原表位

目的： 从１５ 肽 ＰⅢ融合噬菌体库中筛选乳腺血清抗原（ Ｍ Ｓ Ａ） 的模拟表位， 并验证免疫 Ｐ Ｃ Ｒ 筛选法是否与传统的 Ｅ Ｌ Ｉ Ｓ Ａ 筛选方法具有一致的结果。方法： 用 Ｍ Ｓ Ａ 的特异单克隆抗体３ Ｅ１２ 作 “诱饵”， 亲和选择法（ｐａｎｎｉｎｇ ） 富集特异噬菌体， 用 Ｅ Ｌ Ｉ Ｓ Ａ 及免疫 Ｐ Ｃ Ｒ 法挑选阳性克隆并验证特异性。结果： 经过四轮ｐａｎｎｉｎｇ ， 特异噬菌体产出率约为第一轮的１８８倍， 说明抗体３ Ｅ１２ 对噬菌体进行了选择性富集。选出了１０ 个 Ｅ Ｌ Ｉ Ｓ Ａ 反应呈明显阳性克隆， 其中４ 个克隆能抑制天然 Ｍ Ｓ Ａ 抗原抗体的结合。免疫 Ｐ Ｃ Ｒ 的筛选结果与前者基本一致， 但竞争抑制试验中， 未能达到理想效果。结论： 推测这４个克隆表达的短肽与抗体３ Ｅ１２ 识别的表位具有一致或相似的结构。免疫 Ｐ Ｃ Ｒ 的筛选法可以同 Ｅ Ｌ Ｉ Ｓ Ａ 方法结合起来作为常规方法之一， 但它不适于做竞争抑制试验。     

用噬菌体肽库筛选重组日本血吸虫线粒体相关蛋白的表位

目的：筛选和鉴定重组的日本血吸虫（中国大陆株）线粒体相关蛋白rSj38的表位。方法：用纯化的rSj338/26GST免疫家兔获得抗rSj338/26GST的多克隆抗体IgG，将抗体进一步纯化，获得抗rSj338单特异多克隆抗体IgG。用纯化抗rSj338抗体对噬菌体12肽库进行5轮免疫学筛选，挑取克隆。采用Western blot免疫识别，核苷酸序列测定分析其获得的表位并与rSj338/26GST进行同源性比较。将获得的不同表位的阳性克隆分别免疫小鼠，并采用Western blot及dot-ELISA方法筛选能刺激小鼠产生较高滴度抗rSj338抗体的阳性克隆，并将阳性噬菌体免疫的小鼠血清对纯化的rSj338/26GST,26GST，日本血吸虫成虫及虫卵抗原进行Western blot识别。结果：经5轮免疫学筛选后挑取的32个克隆，用Western blot方法30个克隆能被抗rSj338抗体识别，核苷酸序列分析发现共有11种表位，与rSj338无一级结构的同源性。经动物免疫初步实验筛选。共获得4个免疫原性较强的阳性克隆，其免疫鼠血清均可识别rSj338/26GST，日本血吸虫成虫及虫卵抗原。结论：获得了4种日本血吸虫中国大陆株线粒体相关蛋白rSj338的表位，均为模拟表位，这将为日本血吸虫病的疫苗研究开辟新的途径。     

从噬菌体随机十五肽库中筛选类脂A模拟肽的研究

目的用具交叉保护性的针对类脂 A的单抗 (1B6 )筛选噬菌体十五肽库 ,旨在研究类脂 A的模拟肽。方法对噬菌体十五肽库进行亲合筛选 ,用噬菌体 EL ISA法鉴定阳性克隆。结果经 3轮筛选后 ,随机挑选 14个噬菌体克隆 ,做夹心EL ISA试验 ,其中 5个克隆显示较强的阳性结果。将上述 5个阳性克隆 DNA测序 ,序列均为 ACTCATTGGCATCAGTGGAGGCATCATCAGTTTCCTGCTCCTACT,相应的氨基酸序列为 THSHQWRHHQFPAPT。竞争性噬菌体 EL ISA的结果显示大肠杆菌 L PS和伤寒杆菌 L PS均可特异性抑制阳性噬菌体克隆与类脂 A抗体的结合。结论该噬菌体克隆展示肽具有 L PS表位的抗原性 ,且模拟了 L PS的共同部分类脂 A。     

用抗HCV多抗从随机15肽库中筛选抗原表位

目的:分析丙肝患者血清中抗HCV抗体的抗原表位。方法: 制备Protein A亲和层析柱,从丙肝患者血清中纯化、制备抗HCV多克隆抗体;并以此为筛选配基,对噬菌体表面展示的随机15肽库进行亲和筛选。结果:三轮筛选的投入产出比逐轮升高至3.3×10-3,假阳性率逐轮降低至0.2％,提示具有良好的富集效果。对从第3轮挑选出的16个克隆进行结合试验,发现9个克隆只与HCV抗体有较强的结合力而不与正常人血清起反应。测序表明,8个克隆的外源肽含有核心序列WPWS。用阳性噬菌体克隆检测20例丙肝患者血清,有程度不等的阳性反应。结论:用多克隆抗体从噬菌体随机肽库中,筛选到有一定功能的模拟表位。     

从噬菌体随机肽库中筛选IL-6抗体的识别表位

目的：从噬菌体随机６肽文库中筛选ＩＬ－６抗体的识别表位。方法：利用具有ＩＬ－６中和活性的单抗Ｃ２２０筛选呈现于丝状噬菌体表面Ｐ３蛋白的随机６肽文库。结果：从噬菌体随机６肽文库中选出３６株可与单抗特异结合的噬菌体克隆,其中多数克隆呈现核心序列ＳＥＬＲ,该序列与ＩＬ－６的育列具有一定同源性。竞争结合实验的Ｗｅｓｔｅｍ印迹分析,带有ＳＷＦＮＬＲ和ＨＳＷＬＲＹ小肽的２株噬菌体克隆可与ＩＬ－６竞争结合单抗Ｃ     

脂多糖结合蛋白抑制肽的筛选和鉴定

目的：获得具有抑制脂多糖结合蛋白（LBP）致炎作用的可溶性多肽。 方法： 以LPS为目标分子,对噬菌体12肽库进行亲和筛选, 4轮筛选后，检测随机挑取的100个噬菌体克隆的结合活性和竞争抑制活性，将得到的可与LBP竞争性结合LPS的噬菌体克隆进行功能筛选，对获得的阳性克隆进行DNA序列测定，推导外源肽氨基酸序列，并与LBP序列比较，确定LBP致炎作用位点。固相法合成 LBP抑制性多肽，并检测其生物学活性。 结果： 16个噬菌体克隆可与LBP竞争性结合LPS，其中9个噬菌体克隆可显著抑制LBP增敏LPS的致炎作用。9个阳性克隆融合多肽的核心序列为WKXRKXFXKXXG，与LBP的91-102位氨基酸序列有明显同源性。化学合成的12肽WKVRKSFFKLQG-NH2具有显著的抑制LBP致炎功能的作用。 结论： 此12肽具有抑制LBP致炎功能的活性。     

C1q结合十二肽的筛选与初步鉴定

目的　从噬菌体十二肽库中筛选结合C1q的短肽并进行初步鉴定。方法　以C1q为钓饵蛋白筛选噬菌体十二肽库 ,利用ELISA、U937细胞配体结合抑制试验、多聚IgG(AIgG)竞争抑制试验鉴定阳性克隆 ,再进行单链DNA测序和分析。结果　经 3轮筛选后 ,随机挑选 2 5个噬菌体克隆做ELISA鉴定 ,14个克隆显示与C1q有较强的结合。经过U937细胞配体结合抑制试验和AIgG竞争抑制试验鉴定后 ,将此 14个阳性克隆测序 ,从其展示肽DNA测序结果推导氨基酸序列 ,获得 9条氨基酸序列 :HWDPFSLSAYFP、WTPVRTNPFLLH、NGHLFSLSAYFP、RTQRNSPFFLCP、SPAFHPEHMGRG、SRAFHPFYRGRA、WYEGPFTLQTWP、LTQHNSPFFLLP和TSNPFFLWYPQP。结论　获得结合C1q的一些抑制性短肽 ,它们可能成为抑制补体经典途径激活的肽类先导化合物     

利用噬菌体肽库筛选抗黏附的活性多肽

目的 :筛选抗内皮细胞与单核细胞黏附的活性多肽。方法 :①以氧化型低密度脂蛋白 (ox LDL ,10 0mg/L)损伤的内皮细胞作为筛选的“靶”细胞 ,从XCX15肽文库 (X代表随机氨基酸 ,C为半胱氨酸 ,X15代表编码随机 15肽 )中 ,筛选能与受损内皮细胞特异性结合的多肽。②用ELISA法鉴定部分阳性克隆 ,经DNA序列测定确定其插入的氨基酸序列。③以计数法检测特异性噬菌体多肽对内皮细胞与单核细胞黏附率的影响。结果 :①从挑选鉴定的 14个克隆中 ,得到 6个阳性克隆 ,测序结果有两个克隆的外源多肽序列相同 ,4个克隆的外源多肽中含有亮氨酸 亮氨酸重复序列。②两个序列相同的克隆的噬菌体多肽 ,能明显降低内皮细胞与单核细胞的黏附率(分别降低 17.0 %和 17.6 % ,P <0 .0 1,n =4 )。结论 :从XCX15肽文库中 ,初步鉴定出 1个具有较明显地抗内皮细胞与单核细胞黏附作用的活性多肽     

汉坦病毒S基因－多肽噬菌体表面呈现文库的构建

目的：构建汉坦病毒S基因—多肽片断噬菌体表面呈现文库，以期筛检出抗汉坦病毒InAb识别的病毒核衣壳蛋白抗原表位。方法：用DNaseI随机降解汉坦病毒76－118株S基因，回收50bp～300bp小的DNA片断，与克隆接头连接后插入经SfiI线性化的噬菌体载体fuse5，电穿孔导入MC1061菌建库。转化菌培养扩增后提取重组噬菌体，感染K91细胞测定库容，并随机挑选若干克隆测序。结果：构建的S基因噬菌体文库库容（以转导单位TU表示）为3．375X1010。抽检的8个克隆中有5个含有4种大小和组成不同的正确插人的S基因片断，另外3个克隆均为野生型载体的回复突变。结论：所建文库有足够大的库容和较好的多样性，预计可以满足筛检汉坦病毒核衣壳蛋白抗原表位的需要。     

噬菌体随机肽库筛选动脉粥样硬化相关多肽

目的 利用噬菌体展示技术筛选动脉粥样硬化疾病相关多肽,并验证所筛选的阳性噬菌体以及合成蛋白片段结合活性.方法 以动脉粥样硬化患者血清为靶分子,噬菌体12肽库亲和筛选与之结合的阳性噬菌体.经过3轮筛选,从滴度测定平板上随机挑取10个阳性克隆,ELISA鉴定其亲和性.提取阳性噬菌体单链DNA并测序得到12肽序列,通过生物信息学查找相似天然蛋白,合成24肽,最后鉴定其结合活性.结果 ELISA显示阳性噬菌体均与患者血清有较强的结合力,序列为GPRPPSAPNMPL,合成24肽也呈现出较高的结合活性.结论 噬菌体展示可以获得动脉粥样硬化相关多肽序列,为该病的免疫研究奠定了基础.     

Selection of phage displayed peptides from a random 10-mer library recognising a peptide target

Background: Peptide display libraries are powerful tools in the search for detailed information about protein–protein interactions. Usual targets for isolation of phage displayed peptide ligands include antibodies, various receptors, other full size proteins or larger fragments thereof. Smaller protein fragments such as synthetic peptides have not been reported as targets for screening of peptide display libraries. Objectives: To investigate whether a protein target used for screening of a peptide display library could be scaled down to peptide size. As the peptide target we wanted to use a sequence derived from the cytosolic tail of MHC class II associated invariant chain containing a leucine class endosomal sorting signal, known to be recognised as an autonomous functional unit during targeting of class II complexes to antigen processing compartments. Study design: A screening procedure where a synthetic 15-mer invariant chain peptide was coupled to a methacrylate matrix of high binding capacity was developed, and three rounds of selection were performed from a random 10-mer fUSE5 display library. Results: The peptide display library was successfully enriched for phage clones with affinity for the invariant chain peptide. Furthermore, the binding phage clones were able to distinguish between a functional and a mutated form of the target. These clones therefore displayed possible peptide mimetics of signal recognition sites in the cellular sorting machinery. Conclusion: The size of a protein target may be scaled down to peptide size and be recognised by a 10-mer peptide displayed on filamentous phage. This approach may particularly be useful when the peptide target contains a functional unit for recognition.     

噬菌体技术筛选广谱炎症相关趋化因子抑制剂先导物

目的:筛选能与炎症相关趋化因子结合的广谱抑制剂先导物。方法:用内毒素刺激外周血单核细胞建立急性炎症模型,以刺激炎症相关趋化因子的产生,利用噬菌体随机12肽库进行高通量筛选得到阳性克隆,并初步分析其体外活性。结果:经过四轮肽库亲和筛选后,获得了一共同短肽(TVVGSGCVLRIQ)。结论:该短肽可有效抑制炎性趋化因子活性,说明该短肽有可能成为一种广谱的炎性趋化因子抑制先导物。     

从噬菌体构象型7肽库中筛选BLyS的抑制性短肽

目的 :从噬菌体构象型 7肽库中筛选BLyS的抑制性短肽。方法 :用重组人BLyS筛选噬菌体构象型 7肽库 ,用间接ELISA、竞争ELISA和细胞增殖活性试验鉴定噬菌体克隆。结果 :经过 3轮亲和筛选 ,噬菌体的回收率增加 ,阳性克隆得到富集。所获两个阳性噬菌体克隆能特异性地抑制BLyS刺激细胞增殖的活性。结论 :获得了噬菌体呈现的能够抑制BLyS的两个短肽。     

从噬菌体库中筛选抗SARS病毒S蛋白的Fab中和活性抗体研究

目的 从SARS病毒噬菌体抗体库中筛选出具有中和活性的抗S蛋白Fab片段抗体。方法ELISA方法对抗体库进行富集筛选及人源抗体克隆结合活性的测定，竞争ELISA初步筛选有中和活性的抗体，中和试验进一步确定中和活性，进而对其序列进行测定和分析。结果特异性富集了抗S蛋白噬菌体抗体，竞争ELISA筛选出两株抗体可部分阻断中和抗体2C5与S蛋白的结合，中和试验确定其具有一定巾和活性，编号为M1A和P8A，测序结果表明它们为两株不同的抗体克隆。结论筛选获得了两株抗体可部分中和SARS病毒活性，它们的获得为探索SARS病毒感染的被动免疫治疗打下了一定基础。