诺如病毒GⅡ.4型变异株感染流行的研究进展

诺如病毒是-种在全球范围广泛分布并引起急性感染性胃肠炎的病原体^[1].美国每年约有1.79亿例急性胃肠炎感染者,其中超过50％(36％-59％)为感染诺如病毒所致;每年因诺如病毒感染导致住院病例可达70 000例,其中死亡800例,带来医疗负担高达2.84亿美元^[2,3].包括美国在内,许多发达国家已建立了诺如病毒胃肠炎监测系统.本文主要对诺如病毒病原学和流行病学特征以及GⅡ.4型变异株在多国的流行概况进行综述.     

南宁市朝阳溪污水中诺如病毒GⅡ.4型变异株基因分析

目的了解南宁市朝阳溪污水中诺如病毒(Norovirus,NV)GⅡ.4变异株的基因特征。方法 2011年1~12月采集72份南宁市朝阳溪污水,经实时荧光逆转录-聚合酶反应(Realtime RT-PCR)方法进行NV核糖核酸(RNA)检测,阳性标本进行基因克隆测序和遗传进化分析。结果 72份污水中均能检测到NV RNA,基因Ⅰ组(GenogroupⅠ,GⅠ)NV RNA阳性率为70.83%,基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ)阳性率则达100.00%,共为16个基因型,有18株为GⅡ.4型,其中2株为2006b变异株,其余16株均为2010变异株。检测到的2006b变异株和2010变异株在衣壳蛋白N/S区第94位氨基酸均发生变异,而在第6位、第15位仅2010变异株发生了变异,2006b变异株(除SW2011041-2株外)均无变异。这些变异株与同年南宁市腹泻病例中NV GⅡ.4型变异株核苷酸型内同源性分别为96.70%~98.93%和97.42%~99.64%。结论南宁市朝阳溪污水中NV存在很高的遗传多样性,其来源可能是周边居民中的感染者;GⅡ.4型NV中2010变异株为优势株,其在人群中可能存在隐性感染;污水监测是人间NV感染监测的重要补充。     

诺如病毒GⅡ．4型Sydney 2012变异株与GⅡ．3型混合感染事件调查

目的 调查某大学一起急性胃肠炎暴发事件的感染来源和流行病学特征。方法 开展病例搜索,用描述性流行病学方法分析;用RT PCR法检测诺如病毒核酸,进行基因测序和核酸分型。结果 事件共发生感染性腹泻疑似病例473例,罹患率7.7%,确诊97例（20.5%）;临床症状以腹泻（100%）和呕吐（67%）为主,病例分布无聚集性,无性别差异;采集病例和厨工肛拭子、食堂剩余食物、环境涂抹样和生活饮用水样本共53份,细菌分离培养阴性,肛拭子诺如病毒RT PCR阳性率60.0%（9/15）,经基因测序分型5份为诺如病毒GⅡ.4型Sydney 2012变异株,4份为GⅡ.3型。结论 该起事件由诺如病毒GⅡ.4型Sydney 2012变异株和GⅡ.3型混合感染所致,传播途径可能为食源性传播和接触传播,卫生监管部门应加强对集体单位食堂的监管。     

中国7个地区诺如病毒G II．4／Sydney 2012变异株分析

目的　分析2012--2013年冬季中国地区诺如病毒新流行株GII．4／Sydney 2012的衣壳蛋白区核苷酸与氨基酸变异特点。方法　对已获得的22份2012--2013年冬季北京地区GⅡ．4／Sydney2012株进行全衣壳蛋白区基因扩增。从GenBank检索中国其他地区的GⅡ．4／Sydney 2012株衣壳蛋白区核苷酸序列。对获得的GII．4／Sydney 2012株的衣壳蛋白区核苷酸及氨基酸序列与往年GⅡ．4流行株进行系谱分析。结果　获得中国7个地区（北京、上海、江苏、湖州、荆州、香港和台湾）的GⅡ．4／Sydney 2012株资料共38份（至少包含完整VPl核苷酸序列）。GH．4／Sydney 2012株之间VPl核苷酸差异为0．1％～3．3％,氨基酸差异为0～3．1％。系谱分析发现GⅡ．4／Sydney2012株与Apeldoorn 2008和NewOrleans 2009起自共同的分支。中国和悉尼GH．4／Sydney 2012代表株的A、D、E抗原表位氨基酸序列组合有两种：TSRN-GTT-SNT和TSRN-STT-SNT。结论　G II．4／Sydney 2012株已在中国多个地区出现,各地区病毒株同源性较高。G H．4／Sydney 2012株的抗原表位氨基酸组合发生明显改变。     

河南省腹泻患者中鼠伤寒沙门菌单相变异株的分子流行特征研究

目的 了解河南省腹泻患者中鼠伤寒沙门菌单相变异株的分布及其分子学特征。方法 对我省监测到的历史鼠伤寒沙门菌进行血清学复核,使用双重PCR法鉴定第2相鞭毛缺失菌株并对其进行脉冲场凝胶电泳分析。结果1 576株沙门菌中有401株鼠伤寒沙门菌,经双重PCR方法鉴定出113株鼠伤寒沙门菌单相变异株,分别占沙门菌和鼠伤寒沙门菌的7.17%和28.18%,其中79.64%(90例)来源于<2岁的婴幼儿。113株鼠伤寒沙门菌单相变异株经XbaⅠ酶切后,共分为88种带型,各带型包含菌株数为1～5株,带型相似度在58%～100%,带型无明显的地域、时间聚集特征。结论 河南省腹泻患者中鼠伤寒沙门菌单相变异株检出率较高,且人群分布不均,分子分型表现出较大的多样性,没有形成较大规模的流行。     

1例Ⅱ型脊髓灰质炎病毒疫苗变异株病例

继1994年世界卫生组织（WHO）美洲区宣布消灭脊髓灰质炎（脊灰）后，中国所在的西太平洋区在2000年被证实为无脊灰区。近年来，我国周边一些国家发现了脊灰疫苗衍生病毒（VDPV），给我国维持无脊灰状态带来了严峻的挑战。2005年10月，福州市闽清县东桥镇1例AFP病例经国家和福建省AFP病例分类专家诊断小组诊断为Ⅱ型脊灰疫苗变异株病例。     

诺如病毒GII.17型流行特征和基因变异进化研究进展

诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。2014年,亚洲开始集中出现诺如病毒GII.17型导致的聚集性腹泻暴发疫情,随后逐渐向世界各地蔓延,给公众健康带来了新的威胁。本文综述了诺如病毒GII.17型流行特征和基因特征以及变异进化规律的研究进展。     

苏州地区婴幼儿腹泻轮状病毒G和P型别的特征

A组轮状病毒(RV)是引起婴幼儿腹泻的最主要病因。为了解苏州地区RV的分子流行病学特点,为今后的RV疫苗的开发和使用奠定基础,我们收集2001年12月至2002年11月5岁以下的腹泻住院患儿的粪标本,进行病毒抗原鉴定和血清分型。     

南宁市2007～2008年诺如病毒感染所致成人腹泻散发病例的流行病学特征和诺如病毒基因型分布

目的研究诺如病毒(Norovirus,NV)感染所致成人腹泻散发病例的流行病学特征和NV基因型分布。方法对南宁市2007～2008年某医院门诊696例成人腹泻散发病例资料进行流行病学分析,并采集粪便标本,应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应检测NV及其基因组别。随机选择部分阳性标本进行NV衣壳蛋白N/S区核苷酸序列测定,确定基因型。结果NV所致散发性成人腹泻在冬春季节呈现高发。在696份散发成人腹泻的粪便标本中,NV核酸检测阳性183份,总阳性率26.30%。其中180份(98.36%)NV属于基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ),另外3份(1.64%)为基因Ⅰ组(GⅠ)。随机选择10株GⅡNV进行核苷酸序列分析,它们均属于GⅡ.4基因型,而3株GⅠNV分属于GⅠ.2、GⅠ.4、GⅠ.8基因型。结论NV是南宁市2007～2008年成人腹泻散发病例的主要病原体,优势毒株为GⅡ.4型,也存在GⅠ型NV感染。     

青海高原地区婴幼儿腹泻病例中检出G9型A组轮状病毒

目的:对2010年西宁地区秋冬季婴幼儿病毒性腹泻病例进行监测,分析青海省A组轮状病毒主要流行株。方法:采集婴幼儿腹泻病例粪便标本,实验室采用巢氏PCR方法对标本进行A组HRV检测。结果:25例A组轮状病毒感染病例中G3型14例,G9型11例,分别占阳性病例的56%和44%。结论:2010年西宁地区婴幼儿腹泻病例中检出G9型A组轮状病毒,近年来各地报道较多的G9型A组轮状病毒将要或已经成为青海省重要的流行株。     

武汉市儿童医院婴幼儿腹泻轮状病毒的VP4型别分析

目的研究武汉市儿童医院腹泻门诊A组轮状病毒VP4基因的分子流行病学特征. 方法利用聚丙烯酰胺凝胶电泳,将检测出的A组轮状病毒阳性样利用多重RT-PCR技术对VP4基因进行分型研究. 结果武汉地区793份腹泻患儿粪便样本经检测轮状病毒阳性257例,阳性率为32.4%.其中P [8]型232例(90.3%),P [4]型3例(1.2%),P [8]与P [4]混合感染15例(5.8%),尚有7例(2.7%)未能分出型别.对检测结果按采样时间、年龄和性别分布分别进行了分析. 结论武汉地区A组轮状病毒以P[8]型为主要流行基因型,患儿以6月至1岁为主,男女性别差异不大,武汉地区婴幼儿腹泻A组轮状病毒VP4基因分型研究将为轮状病毒疫苗的研制提供基础.     

婴幼儿A群轮状病毒腹泻的流行特征

轮状病毒（Rotavirus，RV）是引起婴幼儿急性非细菌性腹泻的主要病原体。为了解本县婴幼儿A群轮状病毒的感染现状，避免或减少在医院和社区的传播，减少不必要的抗菌药物治疗，我们于2008—2009年对绍兴县的腹泻婴幼儿病例应用胶体金法对患儿粪便标本进行抗原检测，现将结果报告如下。     

酒泉地区婴幼儿腹泻的A组轮状病毒分子基因特征研究

目的采用基因分型方法调查研究酒泉地区婴幼儿A组轮状病毒（rotavirus，RV）腹泻的基因分型特点。方法对2001年11月至2002年12月酒泉地区收集的腹泻婴幼儿324份粪便标本，电脑随机抽样选取204份采用酶联免疫吸附试验（enzyme—linked immunosorbant assay，ELISA）和逆转录聚合酶链反应（RT—PCR），进行轮状病毒病原检测，扩增A组轮状病毒VP4和VP7基因，并对阳性标本进行基因分型。结果酶联免疫吸附试验法测得204份粪便标本的A组轮状病毒阳性率为54．9％（112／204）。对酶联免疫吸附试验呈阳性的标本进行逆转录-聚合酶链反应法检测A组轮状病毒G，P基因型，结果表明，酒泉地区流行的A组轮状病毒主要基因型为G3P[8]型（50．0％），其余依次为G1P[4]（15．8％）、G3P[4]（15．8％）、G1P[8]（10．6％）、G2P[4]（2．6％）和G1G3P[4]（2．6％）、G1G3P[8]（2．6％）。结论A组轮状病毒是酒泉地区婴幼儿非细菌性腹泻的主要病原，其中G3P[8]型是主要基因型。     

GⅡ-4型诺如病毒ORF2基因克隆及序列分析

目的 获得中国流行株GⅡ-4型诺如病毒(NoV)ORF2基因序列,为进一步研究诊断、疫苗提供基础依据.方法 从GⅡ-4型NoV粪便中提取病毒RNA,经逆转录后PCR并克隆到simple PMD18-T载体获得完整开放读码柜架(ORF2)阅读框序列.结果 获得了正确序列的基因Ⅱ-4,亚型(genogroup Ⅱ-4,GⅡ-4)NOV ORF2基因序列,经软件分析,3株NOV ORF2序列编码的氨基酸大小约为54KD,与VA387(GⅡ-4)氨基酸同源性为92%～93%.ORF2编码的氨基酸序列存在3个相对保守序列.结论 获得GⅡ-4型NoV ORF2基因序列,为进一步表达病毒衣壳蛋白及Nov感染的诊断试剂及防治疫苗药物研制提供基础依据.     

荧光定量RT-PCR检测诺如病毒基因Ⅱ型方法的建立和评估

目的 建立灵敏、特异的诺如病毒基因Ⅱ型的荧光定量RT-PCR方法,用于临床腹泻粪便样本病毒的定量检测.方法 构建质粒DNA,并转录合成RNA作为标准品,建立和优化诺如病毒基因Ⅱ型荧光定量RT-PCR方法和反应体系,评价该方法的灵敏度、特异性、重复性,并进行临床粪便样本的检测.结果 此方法最低可以检出102拷贝数/μl,能特异地检出诺如病毒基因Ⅱ型,与诺如病毒基因Ⅰ型无交叉反应,与柯萨奇病毒B组、脊髓灰质炎病毒、肠道病毒、星状病毒、甲肝病毒、埃可病毒和轮状病毒无交叉反应.针对标准品,2次批内试验的荧光信号循阈值(Ct值)变异系数(CV)分别为1.60％、0.70％,2次批间试验的变异系数(CV)分别为0.40％、0.40％,均在5％以下.结论 本研究建立的实时定量RT-PCR检测诺如病毒基因Ⅱ型的方法,其灵敏度、特异性和重复性良好,可用于该病毒的快速检测.     

绍兴市上虞区Delta变异株引起的新型冠状病毒肺炎疫情流行特征

目的对2021年绍兴市上虞区由Delta变异株引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的流行病学特征进行分析, 为优化疫情防控措施提供科学依据。方法收集2021年12月7-21日上虞区的COVID-19病例相关信息, 分析本次疫情的三间分布, 估算潜伏期以及实时再生数(Rt)。结果 2021年12月7-21日上虞区累计发现COVID-19病例380例, 均为确诊病例, 年龄M(Q1, Q3)为52(38, 61)岁;男女性别比为1∶1.25;职业以工人(36.58%)和农民(27.63%)为主;此次疫情共波及上虞区的9个乡镇/街道, 主要集中在曹娥街道(57.10%)和百官街道(31.53%)。COVID-19病例的潜伏期M(Q1, Q3)为4.00(3.00, 5.75)d。基本再生数(R0)为4.06, Rt早期最高为5.62, 在疫情发现后呈下降趋势, 10 d内降至1.00以下。疫情自发现后14 d(12月7-21日)单日发病人数首次下降为0, 主要的发现方式为集中隔离发现(55.53%)和居家隔离发现(40.00%);密切接触者(密接)和密接的密接(次密)新型冠状病毒感...     

广西壮族自治区首次检出的GⅡ.4型诺如病毒N/S区基因特征

目的 了解广西壮族自治区一起感染性腹泻疫情中GⅡ.4型诺如病毒(Norovirus)的基因特征.方法 采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应,对采集于这起疫情的34份粪便标本进行诺如病毒核糖核酸(RNA)的检测,并对随机选取的1份阳性样本进行N/S区核苷酸序列测定和分析,并构建系统进化树.结果 34份粪便标本中,有29份检测诺如病毒RNA阳性,阳性率为85.3%.随机选取的1株诺如病毒株(LC17株)的N/S区核苷酸序列与GⅡ型所有亚型参考株相比,其与第4亚型(GⅡ.4型)的参考株--Lordsdale/1993/UK株的核苷酸序列同源性为93.3%,在遗传进化树图中,与GⅡ.4型株病毒在一簇.与早年流行的GⅡ.4型流行株同源性为94.7%～96.5%,与国内外2006年流行株同源性为98.2%～98.6%,但与1株广州株相比,同源性仅为94.7%.结论 此次感染性腹泻疫情是由诺如病毒GⅡ.4型感染所致,其病毒基因型在广西壮族自治区是首次发现和报导.GⅡ.4型毒株在不断的进化,并在核甘酸序列特征和毒株地域分布上表现出多样性,需加强对诺如病毒的分子流行病学研究,了解基因型的分布,鉴别其来源和传播途径,对控制诺如病毒感染有重要意义.     

新型冠状病毒Omicron变异株亚型XBB的流行特征及其科学防控

目前新型冠状病毒感染仍处于全球大流行状态,Omicron变异株仍是全球优势株,在流行过程中不断进化和变异出现了许多新的亚型。XBB是由Omicron变异株BA.2.10.1和BA.2.75重组而成,于2022年8月在印度首次被发现,此后迅速传播成为新加坡、马来西亚及一些欧美国家的主要流行株,并演变出XBB.1、XBB.1.5等亚分支。与Omicron变异株其他亚型相比,XBB的免疫逃逸能力显著增强,但目前尚无证据表明XBB感染所致的疾病严重程度与Omicron其他亚型有差异。建议加强病毒变异监测、开展重点人群疫苗加强针接种、加速疫苗和药物研发、开展多源监测动态评估风险,及时采取科学防控措施,减少XBB毒株的威胁。     

2018-2021年云南省手足口病病例柯萨奇病毒A4型流行株基因特征

目的 分析云南省手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)病例柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)分离株基因特征。方法 在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本,进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定;构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树,分析核苷酸和氨基酸相似性。结果 从28 565例HFMD病例粪便标本中获得13株CVA4,其中2018年1株、2019年1株、2020年6株、2021年5株;C2基因亚型11株、C4基因亚型2株。C4和C2基因亚型之间核苷酸、氨基酸平均相似性分别为85.77%、93.27%;与原型株HighPoint相比,C2基因亚型核苷酸、氨基酸平均相似性分别为84.51%、93.27%,C4基因亚型分别为84.44%、93.78%。结论 2018-2021年云南省HFMD病例CVA4的优势流行株为C2基因亚型;需继续加强CVA4分子流行病学监测。     

我国Ⅱ型糖尿病的流行特征

利用１９９６年“全国糖尿病流行病学调查”资料,对各种有关因素与糖尿病的发生进行了描述性分析,分析了糖尿病流行特点。提出了糖尿病防治重点人群为年龄在４０岁以上,ＢＭＩ大于２５,轻体力劳动者和有糖尿病家族史者。大量吸烟、饮酒对糖尿病发生有一定的影响