LOC105375840基因单核苷酸多态性位点与四川地区汉族人群颅内动脉瘤的关联研究

目的探讨LOC105375840基因单核苷酸多态性(SNP)位点与四川地区汉族人群颅内动脉瘤(IA)的关联性。方法入选279例IA患者和670例正常对照样本,利用病例-对照关联研究的方法,选取LOC105375840基因内含子区2个SNP位点(rs6473928和rs4738837),并采用单碱基延伸法(SNa Pshot)进行基因分型,研究这2个SNP位点与颅内动脉瘤发病是否相关。结果 LOC105375840基因rs6473928和rs4738837位点基因型分布均符合哈迪-温伯格平衡(P0.05)。两个位点基因型(rs6473928 P=0.0327,rs4738837 P=0.0277)和等位基因(rs6473928 P=0.0106,rs4738837 P=0.0098)频率在IA组与对照组之间差异具有统计学意义。通过Haploview单倍体型分析显示,rs6473928和rs4738837位于8号染色体同一连锁不平衡区,其中:AG为风险单倍体型,可增加IA患病风险54%(OR=1.54,P=0.0133),而GA则为保护型单倍体型,可降低IA易感性34%(OR=0.66,P=0.0274)。结论 LOC105375840基因内含子区SNP位点(rs6473928和rs4738837)与四川地区汉族人群颅内动脉瘤发病相关。     

QKI基因多态位点与四川地区汉族人群冠心病的相关性分析

目的研究QKI基因单核苷酸多态性(SNP)位点与四川地区汉族人群冠心病(coronary heart disease,CHD)发病的相关性。方法入选570例CHD患者和735例正常对照(NC)样本,通过病例-对照关联研究方法,选择QKI基因上4个标签SNP(rs7756185、rs6941513、rs7745161、rs7751144),以单碱基延伸(SNa Pshot)方法进行基因分型,并分析其与CHD的相关性。结果 QKI基因4个SNP位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。其等位基因频率在CHD组与NC组之间差异有统计学意义(均P0.01)。通过单倍体型分析发现,这4个SNP位点处于同一个连锁不平衡区域,其风险单倍体型TGGG可以增加CHD易感性0.25倍(P=0.0051),而保护型的单倍体型GACA可降低CHD患病风险31%(P=0.0003)。结论 QKI基因多态性位点与四川地区汉族人群CHD发病显著相关,其保护型等位基因可降低CHD的易感性。     

LMX1A基因多态性与中国汉族人群先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联

背景:先天性脊柱侧凸是由于胚胎期脊柱椎体发育异常引起的脊柱侧凸,其遗传病因学假说开始引起许多学者的重视.目的:通过候选基因LMX1A上关键单核苷酸多态性位点的筛查,探索LMX1A与中国汉族人群先天性脊柱侧凸及其不同临床表型之间的关联.方法:入选127例中国汉族先天性脊柱侧凸患者,另选取外伤、感染、炎症性疾病等患者127例为对照组.根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,应用Haploview 4.1软件选取LMX1A的标签和功能单核苷酸多态性位点.根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型.所有样本应用SNPstream UHT Genotyping系统对所选单核苷酸多态性位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组单核苷酸多态性位点间是否存在连锁不平衡.结果与结论:共筛选6个位点:SNP1(rs1819768)、SNP2(rs12023709)、SNP3(rs16841013)、SNP4(rs4656435)和SNP5(rs4657412)和SNP6(rs4657411),其基因型分布在病例组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;在基于基因型的关联分析中发现阳性位点SNP1和SNP2,单位点分析显示两位点基因型在病例组和对照组中的分布频率差异有显著性意义(P=0.026和P=0.026),在进一步非条件Logistic回归分析中发现这两个位点的基因型分布最符合Ressessive(OR=0.38;95%CI=0.15~0.94,P=0.029,AIC=354.9)遗传模型;SNP1、SNP2、SNP3和SNP6处于连锁不平衡状态,SNP4和SNP5也处于完全连锁不平衡状态,但单倍体型与先天性脊柱侧凸的发生风险之间不存在相关性;在进一步与先天性脊柱侧凸临床表型的关联分析中发现SNP1基因型AC型、SNP2基因型AG型、SNP3基因型CT型与有椎体形成障碍先天性脊柱侧凸的易感性升高有关.结果提示在中国汉族人群中LMX1A基因可能和先天性脊柱侧凸的发生、发展相关,是一个重要的易感基因.     

高分辨率熔解曲线技术检测冠心病患者APOB、APOC-Ⅰ和LDLR基因rs693、rs4420638、rs688位点多态性

目的建立APOB基因rs693位点、LDLR基因rs688位点和APOC-Ⅰ基因rs4420638位点单核苷酸多态性(SNP)的聚合酶链式反应-高分辨率熔解曲线分析(PCR-HRM)的检测方法,并探讨该3个SNP位点与冠心病(CHD)易感的相关性。方法针对rs693、rs688和rs4420638 3个位点分别设计引物,建立PCR-HRM分子诊断方法,并通过直接测序进行验证。对311例CHD患者和300例体检健康者进行病例-对照研究,分析其与CHD易感性及血脂指标(TC、TG、HDL-C、LDL-C)的关系。结果rs693和rs4420638位点的基因频率和基因型频率在CHD组与对照组之间差异有统计学意义(P0.05)。rs693位点CT基因型降低CHD患病风险(OR=0.448,95%CI:0.246~0.817,P=0.009);rs4420638位点AG基因型增加CHD患病风险(OR=2.140,95%CI:1.241~3.688,P=0.006)。rs688(CT)和rs4420638(AG)位点组成的单倍型CG增加CHD患病风险(OR=1.715,95%CI:1.091~2.697,P=0.018)。病例组rs4420638位点AG基因型患者的血清TC水平显著高于AA基因型(F=4.281,P=0.040)。结论成功建立了rs693、rs688和rs4420638 3个SNP位点的PCR-HRM基因分型方法。rs693和rs4420638位点以及单倍型CG与中国兰州地区汉族人群CHD易感性有关,rs4420638位点联合血清TC水平检测可预警CHD发生。     

调控miRNA成熟通路的相关基因多态性与四川汉族人群胃癌的相关性研究

目的探讨调控微小RNAs(miRNAs)成熟通路相关基因与四川汉族人群胃癌易感的相关性。方法纳入207名四川汉族胃癌患者(病例组)和219名性别与年龄和病例组匹配的四川汉族人群(健康对照组)。运用高分辨率熔点曲线法(HRM)做基因分型,分别检测探讨调控mi RNAs成熟通路相关基因的2个SNP位点(DGCR8基因内的rs3757 G/A和AGO1基因内的rs636832A/G)的基因型和等位基因,比较2组人群基因及等位基因频率分布。结果病例组与对照组的基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡;2个位点的基因型频率在病例组和对照组之间无明显差异:rs3757G/A为χ2=4.31,P=0.12;rs636832A/G为χ2=0.65,P=0.72。同时,这2个位点的等位基因频率在2组之间亦无明显差异:rs3757G/A为χ2=1.22,P=0.27,OR=1.22,95%CI为0.85-1.77;rs636832A/G为χ2=0.65,P=0.42,OR=0.88,95%CI=0.65为1.19。结论本组数据并未发现调控mi RNA成熟通路的相关基因的rs3757G/A和rs636832A/G位点的基因多态性与四川汉族人群胃癌的易感相关。     

胆固醇酯转运蛋白基因rs3764261多态性对中国汉族人群血脂水平的影响

目的 探讨胆固醇酯转运蛋白基因的rs3764261多态性与血脂水平的相关性.方法 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱( MALDI-TOF MS)技术进行rs3764261多态性的检测,Hardy-Weinberg平衡进行群体遗传平衡检验,logistic回归分析基因型对血脂异常发病风险的大小.结果 遗传平衡检验(x2=3.958,P＞0.05),符合遗传平衡定律,样本群体具有代表性;男性的总胆固醇(TC)低于女性(P＜0.01),高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)也低于女性(P＜0.01),甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)明显高于女性(均P＜0.01);在女性群体中,rs3764261位点GT和TT基因型的低HDL-C血症发病率为GG基因型的0.503倍(P＜0.05).结论 在我国汉族女性人群中rs3764261位点多态性与低高密度脂蛋白血症相关.     

VAV2基因多态性与原发性开角型青光眼的相关性研究

目的探讨西南地区汉族人群原发性开角型青光眼(primary open-angle glaucoma,POAG)与VAV2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs7852459和rs2156323的关联性。方法采用病例-对照研究,选择中国西南地区的病例组1021例和对照组1012例,通过Sequenom MassARRAY方法基因分型VAV2基因关联位点,进一步Meta分析验证其与青光眼易感的关联性。结果 VAV2基因的SNP位点rs7852459与POAG显著相关(P0. 05,OR=1. 46),另一个SNP位点rs2156323与POAG无相关性(P=0. 224,OR=0. 93)。结论本次西南地区的病例对照样本中VAV2基因SNP位点rs7852459与POAG显著相关。提示该基因在POAG的发生发展的致病机制值得进一步探索。     

宁夏汉族人群eNOS基因3个SNP位点与原发性高血压相关性的研究

目的:探讨在宁夏地区汉族人群中eNOS基因3个SNP位点与原发性高血压(EH)的相关性.方法:采用PCR-RFLP方法对204例EH患者及219例健康个体eNOS基因rs2070744(T＞ C)、rs1800780(A＞G)和rs3918181 (A＞ G)共3个SNP位点检测.用x2检验比较病例组-对照组间基因型频率、等位基因频率的差异,用SHEsis在线分析软件分析单倍型 结果:EH组和对照组间,rs1800780位点基因型频率的分布存在显著性差异(P＜ 0.05).rs2070744位点及rs3918181位点基因型频率及等位基因频率的分布均无显著性差异(P＞ 0.05).3个SNP位点共检出8种单倍型,其中单倍型TGA在对照组及EH患者中有统计学差异(P＜0.05),且OR (95％ CI)为1.549 (1.116 ～ 2.150).结论:单倍型TGA的出现可能会增加汉族EH的患病风险.     

P2RX7基因单核苷酸多态性与原发性痛风及高尿酸血症的相关性

目的探讨P2RX7基因的五个位点(rs2230911,rs208294,rs435309,rs1718119和rs3751143)的单核苷酸多态性与宁波地区汉族男性原发性痛风发病和高尿酸血症的相关性。方法男性原发性痛风患者293例、男性高尿酸血症患者187例和男性健康对照者269例,用SNaPshot SNP分型技术对P2RX7基因五个位点的基因型进行检测。用Logistic回归来评估基因型与疾病的易感性程度。对各组基因型均进行Hardy-Weinberg平衡检验,用SHEsis软件对SNP位点进行连锁不平衡检验,并进行单倍型分析。结果P2RX7基因rs2230911,rs208294和rs1752809三个位点在研究人群中符合Hardy-Weinberg平衡检验(P0.05)。其中原发性痛风和健康对照组基因型频率差异有统计学意义(P=0.002),且原发性痛风组等位基因rs2230911-G的频率明显高于健康对照组(OR=1.755,95%CI=1.278~2.410,P0.01);在显性模型中,原发性痛风的基因型(CG+GG)频率明显高于健康对照组(OR=1.876,95%CI=1.303~2.701,P=0.001)。结论 P2RX7基因rs2230911位点单核苷酸多态性可能与宁波地区汉族男性原发性痛风发病相关,等位基因G是痛风发病的危险因素。该研究为原发性痛风的诊疗提供了可能的新靶点。     

RBP4与FOXO1基因单核苷酸多态性与2型糖尿病的相关性研究

目的 探讨视黄醛结合蛋白(RBP4)基因、叉头框因子-1(FOXO1)基因单核苷酸多态性(SNPs)在中国汉族人群中的频率分布及其与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 采用TaqMan探针基因分型技术结合琼脂糖凝胶电泳技术,检测384例T2DM患者和384例健康者RBP4、FOXO1共10个SNP位点的基因型及等位基因频率分布,同时测定其空腹血糖(FBG)、总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)水平.结果 T2DM组RBP4-803,G>A;+5169,C>T;+6969,G>C 3个SNP位点的基因型频率和等位基因频率分布与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05).经logistic回归分析,各位点均未发现与T2DM有关的基因型.单倍体表型分析也未发现与T2DM有关的单倍型.FOXO1的7个SNP位点检测结果显示,rs7324943 G/T的等位基因频率与基因型频宰在T2DM组和对照组间差异均有统计学意义(χ~2=4.02,P=0.044).分层分析显示,在年龄40岁和非高血压的人群中,GT基因型患T2DM的风险较GG纯合子高[比值比(OR)分别为1.47,1.80].T等位基因携带者患T2DM的风险较非T等位基因携带者高(OR分别为1.42,1.79).两组间rs17592236 C/T的等位基因频率和基因型频率(χ~2=0.39,P=0.401),差异均无统计学意义,但分层分析发现,在年龄≤40岁的人群中,CT与TT基因型患T2DM风险较CC纯合子高(OR分别为6.33,10.15),T等位基因携带者患T2DM风险较非T等位基因携带者高(OR=7.11).单倍体表型分析结果显示,单倍型CT可使T2DM患病风险下降约28%.结论 中国汉族人群RBP4-803,G>A;+5169,C>T;+6969,G>C的3个SNP位点与T2DM发病风险无关.FOXO1的rs7324943 G/T、rs17592236 C/T和单倍型CT与中国汉族人群T2DM发病风险有关,但其作用机制需深入研究.     

丝氨酸羟甲基转移酶1基因C1420T位点和3′-非翻译区3个位点单核苷酸多态性与儿童急性白血病易感性的关系

摘要：目的：研究深圳地区汉族儿童丝氨酸羟甲基转移酶1（SHMT1）基因C1420T位点和3′-非翻译区（UTR）3个位点单核苷酸多态性（SNP）与急性白血病（AL）易感性的关系。 方法：以110例AL患儿、120例上呼吸道感染患儿和健康体检儿童为研究对象,用PCR、变性梯度凝胶电泳（DGGE）及DNA测序检测研究对象SHMT1 C1420T（rs1979277）和3′-UTR 3个位点（rs3783、rs1979276及rs12952556）基因型和等位基因频率,分析其与AL易感性的关系。 结果：AL患儿SHMT1编码区C1420T位点CT（杂合型）和TT（纯合型）基因型频率较对照组升高（17.3% vs 10.8%和1.8% vs 1.7%）,但差异无统计学意义（χ²分别为2.006和0,P均>0.05）;CT和TT基因型与儿童AL发病风险无相关性,其风险比（OR）分别为0.580（0.271~1.240）、0.848（0.117~6.140）。3′-UTR rs3783、rs1979276及rs12952556与C1420T具有相同的基因型分布状态,即在同一个体内该4个位点同为野生、杂合或纯合型基因。经SNPStats在线软件分析,该4个SNP位点两两间的连锁不平衡系数均为D′=1和r2=1。 结论: 深圳地区汉族儿童SHMT1 4个位点SNP与AL易感性无关,但可能呈完全连锁不平衡。     

华法林药物遗传学基因CYP2C9和VKORC1单核苷酸多态性在广东汉族人群的分布研究

目的探讨细胞色素P450(cytochrome P450, CYP450)家族中CYP2C9的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)位点rs1057910和rs1799853以及维生素K环氧化物还原酶复合物亚基1(vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, VKORC1)的rs9923231 SNP位点在广东汉族的分布,为华法林(warfarin)个体化用药(personalized medicine)提供循证医学依据.方法利用Sequenom MassArray? iPLEX GOLD系统对215例广东地区人群的rs1057910,rs1799853和rs9923231三个位点进行基因分型,并分析各基因型分布频率.结果 rs1799853和rs9923231在广东汉族中无多态性分布,分别只有CC基因型和CT基因型.rs1057910在广东汉族中有两种基因型AA和AC,分布频率分别为0.921和0.079;等位基因A的频率为0.9605,C的频率为0.0395.结论在本研究中由于rs1799853和rs9923231在广东汉族中无多态性分布,基于本研究数据建议广东汉族华法林药物的检测位点应以rs1057910为主.     

人类ErbB2转录因子1基因多态性与陕西汉族人群胃癌的关系研究

目的探讨人类ErbB2转录因子1(TOB1)基因多态性与陕西汉族人群胃癌之间的关系。方法选取320例胃癌患者为胃癌组,350例经胃镜检查及病理活检排除胃癌的门诊患者为对照组,对TOB1基因4个候选单核苷酸多态性(SNP)位点(rs61482741、rs34700818、rs12601477、rs4626)进行基因分型。分析TOB1基因候选SNP位点等位基因、基因型、显性模式和隐性模式频率与胃癌风险的关系;分析TOB1基因候选SNP位点连锁不平衡情况。结果胃癌组与对照组TOB1基因4个候选SNP位点基因分型结果均符合哈迪-温伯格平衡(P0.05)。TOB1基因易感位点包括内含子区域rs61482741位点G等位基因(P=0.011,OR=1.42,95%CI=1.15～1.78)、GG基因型(P=0.016,OR=1.91,95%CI=1.18～3.23)、显性模式GG+CG基因型(P=0.032,OR=1.44,95%CI=1.05～1.93)、隐性模式GG基因型(P=0.043,OR=1.68,95%CI=1.03～2.74);外显子区域rs4626位点G等位基因(P=0.006,OR=1.41,95%CI=1.16～1.76)、GG基因型(P=0.006,OR=1.85,95%CI=1.20～2.85)、显性模式GG+AG基因型(P=0.023,OR=1.53,95%CI=1.10～2.16)、隐性模式GG基因型(P=0.028,OR=1.56,95%CI=1.09～2.21);内含子区域rs34700818和rs12601477位点等位基因、基因型、显性模式和隐性模式频率在胃癌组与对照组间比较,差异均无统计学意义(P0.05)。结论TOB1基因内含子区域rs61482741和外显子区域rs4626位点可能是陕西汉族人群胃癌高风险易感基因位点。     

新疆地区维吾尔族和汉族人群ABCG2基因rs2231142位点多态性与高尿酸血症的相关性

目的探讨新疆地区维吾尔族和汉族人群ABC转运蛋白2(ABCG2)基因位点rs2231142的单核苷酸多态性(SNP)与高尿酸血症的关系。方法选取2013年2~12月体检的维吾尔族和汉族人群作为研究对象,并依据尿酸水平以及纳入和排除标准分为高尿酸血症组和健康对照组;采集血液样本,提取全血基因组DNA,PCR扩增各组ABCG2基因rs2231142位点,并对扩增产物用多重高温连接酶检测反应(i MLDR)进行SNP检测。结果总人群中汉族尿酸水平高于维吾尔族(t=10.595,P0.05);不同基因型(χ2=46.007,P0.05)及等位基因(χ2=17.924,P0.05)在两民族间的分布差异有统计学意义;维吾尔族和汉族高尿酸血症组尿酸水平均高于健康对照组(χ2维=7.796,P0.05;χ2汉=9.963,P0.05),两民族高尿酸血症组TT+GT基因型(χ2维=12.02,P0.05;χ2汉=12.28,P0.05)以及T等位基因(χ2维=8.625,P0.05;χ2汉=12.05,P0.05)频率均显著高于健康对照组;Logistic回归分析发现GT+TT基因型分别使得两民族患高尿酸血症的危险性上升了2.45和1.103倍(维吾尔族OR=2.45,95%CI=1.187~5.054,P0.05,汉族OR=1.103,95%CI=1.00~1.026,P0.05)。结论 ABCG2基因rs2231142位点SNP与维吾尔族和汉族高尿酸血症有一定关联,T等位基因可能是高尿酸血症的危险因素,G等位基因则可能是保护因素。     

CFH、CFB基因单核苷酸多态性与中国人老年黄斑变性的相关性研究

目的本实验通过对中国大陆汉族人CFH和CFB基因的多态性进行病例．对照研究。探寻补体旁路途径中相关基因变异与老年黄斑变性（AMD）的发生关系。方法收集200例湿性AMD患者,120例干性AMD患者,500例匹配的正常对照,采用SNaPshot方法对其CFH基因上的7个单核苷酸多态性位点（SNP）和CFB基因上两个SNP位点进行基因型检测,并进行关联分析和单倍体型分析。结果CFH基因中的4个SNP位点与中国汉族人的湿性AMD有显著的相关性：rs3753394（P=0．0189）,rs800292（P=0．0135）,rsl061170（P=0．0036）和rsl329428（P=0．0054）,该4个位点组成的单倍体型CATA对湿性AMD起到保护作用,其P=3．33E-05,OR=0．569（95％CI：0．434～0．746）。与目前报道的其他人群不同,CFH基因上的rs7535263、rs2274700和rsl410996这3个SNP在中国汉族人中未能发现与湿性AMD有相关。所有研究的CFH基因的SNP与中国人干性AMD无显著相关性。CFB基因单核苷酸多态性与中国人AMD的发生无关。结论通过实验,我们可证实CFH基因中的rs3753394、rs800292、rsl061170和rsl329428位点与中国汉族人的湿性AMD有显著的相关性;而rs7535263、rs2274700和rsl410996这3个SNP在中国汉族人中未能发现其与湿性AMD有相关;同时CFB基因与中国人AMD的发生无关。干性AMD与CFH、CFB基因单核苷酸多态性无关。     

福建汉族人群CD177基因单核苷酸多态性分析

目的分析福建汉族人群CD177基因中包含1-3及7、8外显子的2个基因片段的单核苷酸多态性。方法提取112例福建汉族人群健康体检者的外周血基因组DNA,分别扩增包含CD177基因的1-3外显子及7、8外显子的2个基因片段,直接测序法检测该2个基因片段的单核苷酸多态性(SNP),并做Hardy-Weinberg平衡检验、等位基因连锁不平衡分析以及本组人群与其他地区人群之间基因频率的差异比较。结果 CD177的2个基因片段内共检测到9个SNP位点,包括位于外显子1的SNP c.42GC,位于外显子7的5个位点(c.824GC、c.828AC、c.829AT、c.832GA及c.841AG)以及位于内含子的3个SNP;9个SNP位点的基因频率分布均符合H-W平衡,第7外显子的5个SNP呈完全连锁不平衡(r2=1);与"千人基因组计划"数据库中的欧洲人群、日本人群及中国北京人群和南方人群比较,福建汉族人群CD177的7个SNP位点基因频率(c.42GC:GG 4.46%,GC 47.32%、CC48.22%,rs4803613:GG 4.46%、AG 44.64%、AA 50.89%,c.824GC:GG 39.29%、GC 58.03%、CC 2.68%,c.828AC:AA 39.29%、AC 58.03%、CC 2.68%,c.829AT:AA 39.29%、AT 58.03%、TT 2.68%,c.832GA:GG 39.29%、AG58.03%、AA 2.68%,rs371812801:CC 97.32%、CG 2.68%、GG 0)与欧洲人群的差异较大(P0.05);此外,与CD177表达密切相关的SNP c.829AT的基因频率在福建人群中的分布(等位基因频率A 68.30%、T 31.70%,基因型频率AA 39.29%、AT 58.03%、TT 2.68%)与中国南方汉族人群相比差异明显(P0.05)。结论弄清了福建汉族人群CD177基因9个SNP位点的基因频率分布特征,或有助于CD177 SNPs相关的疾病研究。     

LMX1A基因多态性与中国汉族人群先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联

背景：先天性脊柱侧凸是由于胚胎期脊柱椎体发育异常引起的脊柱侧凸,其遗传病因学假说开始引起许多学者的重视。目的：通过候选基因LMX1A上关键单核苷酸多态性位点的筛查,探索LMX1A与中国汉族人群先天性脊柱侧凸及其不同临床表型之间的关联。方法：入选127例中国汉族先天性脊柱侧凸患者,另选取外伤、感染、炎症性疾病等患者127例为对照组。根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,应用Haploview 4.1软件选取LMX1A的标签和功能单核苷酸多态性位点。根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型。所有样本应用SNPstream UHT Genotyping系统对所选单核苷酸多态性位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组单核苷酸多态性位点间是否存在连锁不平衡。结果与结论：共筛选6个位点：SNP1（rs 1819768）、SNP2（rs 12023709）、SNP3（rs 16841013）、SNP4（rs 4656435）和SNP5（rs 4657412）和SNP6（rs 4657411）,其基因型分布在病例组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;在基于基因型的关联分析中发现阳性位点SNP1和SNP2,单位点分析显示两位点基因型在病例组和对照组中的分布频率差异有显著性意义（P=0.026和P=0.026）,在进一步非条件Logistic回归分析中发现这两个位点的基因型分布最符合Ressessive（OR=0.38;95%CI=0.15～0.94,P=0.029,AIC=354.9）遗传模型;SNP1、SNP2、SNP3和SNP6处于连锁不平衡状态,SNP4和SNP5也处于完全连锁不平衡状态,但单倍体型与先天性脊柱侧凸的发生风险之间不存在相关性;在进一步与先天性脊柱侧凸临床表型的关联分析中发现SNP1基因型AC型、SNP2基因型AG型、SNP3基因型CT型与有椎体形成障碍先天性脊柱侧凸的易感性升高有关。结果提示在中国汉族人群中LMX1A基因可能和先天性脊柱侧凸的发生、发展相关,是一个重要的易感基因。     

IL-23R基因多态性与五邑地区汉族人群强直性脊柱炎的相关性分析

目的探讨中国五邑地区汉族人群中白细胞介素(interleukin,IL)-23R基因多态位点与强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)发病的相关性。方法选取该地区汉族人群AS患者50例和同期健康体检者70名,采用Sequenom MassArray基因分型方法检测IL-23R基因多态位点,计算等位基因及基因型频率分布,并进行统计学分析。结果 rs10489629位点基因型频率和等位基因频率在两组间分布存在显著差异(χ2=11.392,P=0.003;χ2=13.435,P=0.000),携带IL-23R基因rs2275913位点AA基因型与GG基因型比较,显著增加AS的罹患风险(OR=7.161,95%CI=1.488-34.462,P=0.014);而rs10489629位点的基因型及等位基因频率分布在AS组和对照组间无统计学差异(P0.05)。结论在中国南方五邑地区汉族人群中,IL-23R基因rs10489629多态性与AS的易感性相关,其中携带A基因增加AS的罹患风险。     

中国汉族人群不同性别和年龄血脂水平与肝脂肪酶基因C480T位点相关性研究

目的 研究不同年龄、性别汉族人群血脂水平及血脂异常发病风险与肝脂肪酶基因(LIPC) C480T(rs1800588)位点的相关性.方法 全自动生化分析仪检测2420名成人汉族健康体检人群(男1527名,女893名)空腹血脂水平；MALDI-TOF MS技术检测LIPC rs1800588位点基因型.按年龄≤44岁,45～59岁和≥60岁分为青年(男241名,女201名)、中年(男性652名,女性360名)、老年(男性634名,女性332名)3个年龄组.采用单因素方差分析同性别各年龄组内不同基因型对4项血脂指标的影响,采用二分类Logistic回归比较各型血脂异常发病风险的大小.结果 LIPCrs1800588位点T等位基因的中国汉族人群中的频率为39.4％.各年龄组男女性血脂指标有较大差异.与CC基因型比较,男性中年组和老年组的CT和TT基因型有更高的HDL-C水平,老年组TT基因型人群有更高的TC水平(P＜0.05)；女性青年组CT基因型有更高的TC水平,CT和TT基因型有更高的HDL-C水平,中年组的CT和TT基因型人群有更高的TC和TG水平,CT基因型有更高的HDL-C水平,老年组TT基因型有更高的HDL-C水平.与CC基因型比较,男性老年组TT基因型混合型高脂血症和高TC血症发病风险分别增加2.318倍(P =0.004)和2.571倍(P＜0.001),但低HDL-C血症发病风险降低1.908倍(P =0.029)；女性中年组CT和TT基因型高TC 血症发病风险是CC基因型的1.688倍(P =0.036)和2.099倍(P =0.040),TT基因型高TC血症和混合型高脂血症发病风险分别是CC基因型的2.060倍(P=0.038)和2.381倍(P =0.019).结论 LIPC rs1800588位点与中国汉族人群的血脂水平高脂血症发病风险的相关性有性别和年龄的差异,对男性老年组和女性中年组人群的血脂水平和血脂异常发病风险有较大的影响.该位点T等位基因是高脂血症的危险因素.     

高分辨率熔解技术检测冠心病患者TNF-α及其受体基因多态性

目的用高分辨率熔解(HRM)技术检测兰州地区汉族人群肿瘤坏死因子α(TNF-α)及其受体基因单核苷酸多态性(SNP),探讨其与冠心病(CHD)易感性及血脂指标的相关性。方法建立TNFA-238GA、TNFA-308GA、TNFA-857CT、TNFA-863CA、TNFR1-383AC和TNFR2-exonTG 6个SNP位点的PCR-HRM检测方法,并对207例CHD患者和274例健康对照进行病例-对照研究,分析其与CHD易感性及血脂指标的关系。结果仅TNFA-863CA位点的基因频率和基因型频率在CHD组和对照组之间差异具有统计学意义(P=0.020,0.013),性别分层后仅存在于男性患者(P=0.026,0.018),CA基因型明显增加CHD患病风险(OR=1.999,P=0.029)。针对TNF-α基因的单倍型分析显示TNFA-238G/-308G/-857C/-863A(GGCA)单倍型明显增加CHD患病风险(OR=1.695,P=0.016)。病例组的血脂分析显示TNFR2-exon位点与CHD患者的高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平有关(F=5.126,P=0.024)。结论 TNFA-863CA位点和单倍型TNFA-GGCA与兰州地区汉族人群CHD易感性相关,TNFR2-exonTG位点与CHD患者HDL-C水平相关联。