血吸虫基因组研究进展

2000年3月30日至4月1日在美国Smith学院（Smith College,Northampton,Connecticut,USA)召开了WHO/UNDP/World Bank血吸虫基因组网络会议。会议总结了上一年血吸虫基因组取得的进展,讨论并解决遇到的问题,确定未来的发展方向并制定了下一年度的工作计划。本文节译了其工作报告内容,供有关研究人员参考。     

表达序列标签分析在血吸虫基因组研究中的应用

表达序列标签分析是借助于100－400个核苷酸长度的标记引物，在随机选取cDNA克隆，进行5′端或（和）3′端进行大规模一次性测序，将得到的片段与数据本就EST分析在血吸虫基因组研究中的应用进行综述。     

日本血吸虫中国大陆株安徽品系基因组文库的构建

以日本血吸虫中国大陆株安徽品系为材料，采用酚－氯仿抽提，纯化基因组ＤＮＡ。经ＢａｍＨＩ酶切后，与质粒ＰＵＣ＾１８重组，转化入大肠杆菌ＪＭ１０３，转化率为１０＾４。并对重组质粒ＤＮＡ进行酶切鉴定。     

开展“中药基因组计划”的研究

“中药基因组计划”的根本点就是在于从基因组学的高度,从分子水平上来发现、研究中药的基因,寻找有效成分基因,将功能基因克隆表达进行“工厂化生产”或转入植物（转基因植物）进行“田间种植”;寻找,发现克隆表达那些用于合成具有生物活性小分子有机物的酶基因,利用代谢工种在实际室合成这部分中药的有效成分,阐述开展中药基因组计划的主要内容和意义。     

基因组研究和基因组工业的现状及思考

1人类基因组计划和后基因组时代1.1人类基因组测序将提前完成：人类基因组计划（HumanGenomeProject,HGP）旨在阐明人类基因组的全部序列,从整体上破译人类遗传信息,使人类第一次在分子水平上全面地认识自我。主要包括三项任务：人遗传图谱和物理图谱的建立;B．DNA测序;C．基因识别。自1990年实施以来,人类基因组测序已完成测序和正在测序的共计约330Mb,占人基因组的11％左右;已识别出与人类疾病相关的基因200个左右。此外,细菌、支原体等共17种模式生物全基因组序列已测定。随着技术更新和大公司的介入,人类基因组测序将提…     

血吸虫新基因筛选技术及其应用

自1992年血吸虫基因组计划开展以来，越来越多的血吸虫基因信息被公开，对了解血吸虫的进化、血吸虫与宿主之间的相互作用、血吸虫感染及致病的免疫机制等起了明显的推动作用。如何充分地利用这些基因信息是血吸虫研究一个重要的课题。     

微生物基因组测序策略

在复习近年来有关基因测序的文献基础上,综述了有关测序策略方面的进展。     

寄生虫基因组计划的启动

从1993年至1994年，发展中国家及发达国家的科学家制定并启动了许多寄生虫基因组计划，并在已有的合作基础上建立了几个绘制及测序这些中等大小基因组的联合组织。资金及其它支持来自WHO／TDR，如Welcome Trust及其它基金。因而，恶性疟原虫、曼氏血吸虫、克氏锥虫、布氏锥虫、利什曼原虫、马来丝虫及其它致病线虫的基因组已在研究之中。从最初阶段网络系统的建立、作图、资源的建库（EST、GSS、噬菌体、粘粒、BAC及YAC库的构建），测序工作以基因发现为开端，很快发展到小片段染色体，现在则是整个成熟基因组阶段。蛋白质组学，功能分析，基因操作及微阵列分析都在不同的水平上进行，由于用于全基因组测序的经费是固定的，因此除大型测序中心外大多参与此项计划的实验室，都开始定位于后基因组学。为了资料的处理、注解及深层分析，生物信息学网络在包括发展中国家扩展开来。     

中英美科学家宣布启动国际千人基因组计划

由中国、英国和美国的科学家组成的“国际协作组”，1月22日在深圳、伦敦和华盛顿同时宣布：国际“千人基因组计划”正式启动。这一宏伟计划将测定选自全世界各地的至少一千个人类个体的全基因组DNA序列，绘制迄今为止最详尽的、最有医学应用价值的人类基因组遗传多态性图谱：这一国际合作计划的主要发起者和承担者包括英国的Sanger研究所，中国的深圳华大基因研究院（BGIShenzhen）．以及美国的国立卫生研究院（NIH）下属的美国人类基因组研究所（NHGRI）。     

基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台的构建及应用

[目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台。[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合。[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等。[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段。     

血吸虫全长编码基因序列获取方法概述

通常取日本血吸虫全长编码序列会面对以下三种情况：其因可能为已知序列的基因，已知部分序列的基因或不知序列的基因，本针对以上常见的每一种情况。总结从cDNA库、RNA和基因组中获取日本血吸虫全长编码序列的各种方法，为运用分子生物学方法研究日本血吸虫的学提供参考。     

日本血吸虫基因组DNA的提纯与鉴定

本研究采用酚─氯仿法提纯了日本血吸虫基因组ＤＮＡ，并对基因组ＤＮＡ进行了定量分析及微电泳鉴定。结果表明，１００ｍｇ日本血吸虫成虫（湿重）可提纯出约８０μｇ的ＤＮＡ，其基因组ＤＮＡ的大小＞３１Ｋｂ。该法提取的血吸虫基因组ＤＮＡ较纯，适合于以后进行ＤＮＡ限制性核酸内切酶谱分析和Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ分析。     

日本血吸虫细菌人工染色体文库的初步构建(英文)

初步构建了一个日本血吸虫细菌人工染色体（BAC）文库,该文库已包含1000多个含基因组DNA插入片段的重组pEcBAC1克隆,平均插入片段为120kb。BAC文库将为日本血吸虫基因的结构与功能研究提供新的资源。     

基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台的构建及应用

 [目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台。[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合。[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等。[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段。     

寄生虫基因组:现状及未来展望

1 测序计划的现状不同于几年前的情况,许多寄生虫基因组研究工作正在进行中并且大量资料已被收集。获得的序列资料可分为3种基本类型:完成或接近完成的基因组序列,通常被称为‘contigs’重叠序列;基因组序列扫描(GSS)标签,由漂浮基因组序列产生(或随机克隆或人工细菌染色体末端序列);以及表达序列标签(ESTS),由来自寄生虫生活史的一个或多个阶段的mRNAs表达产生。至2001年3月30日,在基因库中共有136214寄生虫ESTs及177172寄生虫GSSs的描述。请注意,这些数字是被低估的,因为在序列产生、登上局域网以及在基因库被正式注册之间有一相当长的滞后期。     

“千人基因组计划”测序人群包括丹佛的中国人

1月22日21时，南中国、英国和美国科学家组成的“国际协作组”在深圳、伦敦和华盛顿，同时宣布正式启动一个庞大的国际“千人基因组计划”。     

“千人基因组计划”测序人群包括丹佛的中国人

1月22日21时,由中国、英国和美国科学家组成的"国际协作组"在深圳、伦敦和华盛顿,同时宣布正式启动一个庞大的国际"千人基因组计划"。     

1000美元基因组计划的可行性分析

通过对目前几种主要测序方法的分析,探讨了1 000美元测定哺乳动物全基因组序列计划的可行性.本研究认为以高保真酶介导的纳米级分子开关是解决1 000美金基因组计划的方案,或方案之一.     

生物技术在医药领域中的发展趋势

本文综述生物技术在医药领域中的发展新趋势，包括人类基因组计划、转基因植物及转基因动物、个性化药品、通用名药品、基因治疗和平台技术。