EZH2基因在胃癌中的表达及意义

目的 检测胃癌组织中EZH2 mRNA及蛋白的表达,探讨EZH2蛋白的表达与临床病理指标的关系.方法 选取30例术前胃镜和术后病理确诊的胃癌组织及相应癌旁胃组织,应用RT-PCR方法对EZH2 mRNA的表达水平进行半定量检测;采用免疫组织化学 SP 法检测76例胃癌组织和45例癌旁正常胃组织中 EZH2蛋白的表达水平.结果 30例胃癌组织中EZH2 mRNA的表达量为0.994±0.129,高于癌旁胃组织中EZH2 mRNA的表达(0.332±0.080),差异有统计学意义(P=0.000).76例胃癌组织中,EZH2 蛋白的阳性表达率为 51.3%,45 例癌旁正常胃组织中未发现 EZH2的阳性表达.EZH2蛋白的表达与胃癌肿瘤的大小、浸润深度、淋巴结转移和 TNM 分期显著相关(P<0.05),与患者性别、年龄、肿瘤部位及分化情况等临床因素无关(P>0.05).结论 EZH2基因在胃癌组织中表达增强,检测胃癌组织中 EZH2蛋白的表达可能对判断胃癌的恶性程度及病情进展有一定的价值.     

Cdx2基因过表达对胃癌细胞免疫相关基因表达的影响

目的 利用基因表达谱芯片技术筛选过表达Cdx2的胃癌MGC-803细胞与对照组间差异表达的免疫相关基因. 探讨Cdx2对胃癌细胞免疫相关基因表达的影响。 方法 分别抽取Cdx2转染组和对照组的细胞总RNA,分离纯化mRNA并逆转录合成荧光分子(Cy3/ Cy5)标记cDNA 探针,与含有21522条人类22k基因表达谱芯片进行杂交。采用LuxScan 10K/A双通道激光扫描仪扫描芯片上两种信号,应用LuxScan3.0图像分析软件对芯片图像进行处理和分析。 结果 在21522条基因中,胃癌细胞间差异性表达基因为有551条,其中302条上调,249条下调。其中与免疫相关的基因共有7个,分别为HLA-E、RRAS、ULBP2、HLA-G、HLA-C、CTSB、CTSL,均表达上调。结论 Cdx2过表达上调了胃癌MGC803细胞免疫相关基因的表达,这可能与胃癌细胞生物学行为的改变有关。     

基于生物信息学的胃癌预后基因的筛选和分析

目的 应用生物信息学方法筛选和分析胃癌预后基因。方法 从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据集GSE54129、GSE81948、GSE118916,使用在线分析工具GEO2R筛选出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。利用在线数据库DAVID对筛选的DEGs进行功能和通路富集分析。然后使用在线网站STRING和Cytoscape软件对DEGs构建蛋白互作网络,并筛选hub基因。最后使用Kaplan Meier-Plotter和GEPIA在线数据库对hub基因进行生存和表达水平分析。结果本研究共发现362个总DEGs,包含164个上调基因,192个下调基因。通过GO功能富集分析,发现DEGs主要富集在细胞外基质和胶原蛋白。KEGG富集通路分析显示,DEGs主要参与的信号通路包括ECM-受体相互作用、阿米巴病、蛋白质的消化和吸收、局部黏附和PI₃K-Akt信号通路。CytoHubba插件共筛选出10个DEGs作为hub基因,通过Kaplan Meier-Plotter数据库验证这10个hub基因,发现COL1A1、COL3A1、FN1、MMP2、COL5A1、BGN、COL4A1、COL4A2和COL6A3这9个基因和胃癌预后相关,并且高表达组预后差(P<0.05);GEPIA数据库发现这9个与胃癌预后相关的基因在胃癌组织中均呈高表达水平(P<0.05)。结论 通过生物信息学方法,本研究发现了9个胃癌预后基因,其中BGN、COL3A1和COL5A1这3个基因可能成为胃癌预后的新的标志物。     

基于数据库分析CDCA基因家族在胃癌中的表达及预后意义

目的:基于数据库分析CDCA基因家族在胃癌中的表达及对胃癌患者预后的影响.方法:采用Oncomine数据库检索分析CDCA基因家族中8个成员在胃癌组织中mRNA的表达情况;利用GEPIA数据库验证CDCA基因家族8个成员在胃癌组织中mRNA的表达结果;结合Ka-plan-Meier Plotter数据库的临床信息进一步分析CDCA基因家族中8个成员在胃癌患者中的潜在预后价值;利用STRING数据库得到CDCA基因家族的共表达基因,将共表达基因输入到metascape数据库,进行通路富集分析.结果:CDCA基因家族8个成员在胃癌组织中mRNA表达均高于正常组织(P<0.05).CDCA1、CDCA2、CDCA3、CDCA5、CDCA7、CDCA8基因高表达胃癌患者的预后较好(HR<1,Logrank P<0.05);CDCA4基因低表达胃癌患者的预后较好(HR>1,Logrank P<0.05);CDCA6基因高表达患者与低表达患者预后差异无统计学意义(Logrank P>0.05).结论:CDCA基因家族8个成员的mRNA表达在胃癌和正常胃组织中有明显差异,其中CDCA1、CDCA2、CDCA3、CDCA5、CDCA7、CDCA8基因高表达胃癌患者预后较好,CDCA4基因高表达患者预后较差,提示CDCA基因家族的部分基因的表达水平与胃癌患者的预后有一定的相关性.     

RASSF1基因在胃癌组织和细胞中的表达及意义

目的 研究RASSF1基因的3种剪接体(RASSF1A、RASSF1B、RASSF1C)在胃癌组织及细胞中的表达特点.方法 应用生物信息学分析RASSF1基因的3种剪接体的结构特点; 同时利用半定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测胃癌组织、癌旁组织及不同胃癌细胞系BGC-823和SGC-7901细胞中3种剪接体的mRNA表达水平.结果 RASSF1基因3种剪接体在胃癌不同分化程度的细胞系BGC-823和SGC-7901细胞中均有表达,在60例胃癌组织中RASSF1A、RASSF1B表达缺失率分别为60.2%(37/60)、25%(15/60),RASSF1C基因在胃癌组织及癌旁组织表达率相近约为86.7%(55/60).结论 RASSF1 3种剪接体在胃癌组织中的表达下调, RASSF1B和RASSF1C在胃癌中的表达差异无显著性,其余基因比较差异有显著性.RASSF1B的表达可能与细胞的分化程度有关.     

HER-2/neu蛋白在胃癌中的表达及意义

[目的] 探讨表皮生长因子受体HER-2/neu在胃癌组织表达的临床病理学意义.[方法] 采用免疫组织化学法检测67例胃癌标本HER-2/neu蛋白的表达,并分析检测结果与患者的随访资料及临床病理学参数的关系.[结果] HER-2/neu蛋白在胃癌组织的阳性表达率为22.4%(15/67),而在癌旁正常组织无表达.HER-2/neu表达与患者的性别、年龄、分化程度均无相关关系(P>0.05),而与肿瘤的Lauren分类、临床分期及淋巴结转移相关(P<0.05).HER-2/neu蛋白表达阳性患者的中位生存期为30.0个月,表达阴性的为50.0个月,二者差异有显著性意义(P<0.05).运用COX比例风险模型分析提示HER-2/neu和临床分期为胃癌独立预后因素.[结论] 检测胃癌组织中HER-2/neu蛋白的表达,有助于判断患者预后.     

抑癌基因RASSF1A在胃癌中的表达及意义

目的 研究胃癌组织中抑癌基因RASSF1A的表达并探讨其临床意义.方法 应用免疫组化法分别检测39例胃癌组织标本和18例正常对照胃组织标本RASSF1A蛋白表达; RT-PCR法检测4株胃癌细胞株、正常胃黏膜细胞株GES-1以及阳性对照Hela细胞中RASSF1A mRNA的表达;结合病理学特征进行分析.结果 胃癌组织RASSF1A表达阳性细胞明显少于正常对照胃组织(P＜0.01);不同分化程度、临床分期及浸润深度的胃癌组织,其RASSF1A表达存在显著性差异(P＜0.05).4株胃癌细胞株中仅MKN45细胞有RASSF1A mRNA表达;而正常胃黏膜细胞株GES-1和阳性对照Hela细胞均表达RASSF1A mRNA.结论 胃癌组织中RASSF1A基因表达明显减少,其可作为评估胃癌恶性程度和预后的一项有意义的指标.     

抑癌基因RASSF1A在胃癌中的表达及意义

目的研究胃癌组织中抑癌基因RASSF1A的表达并探讨其临床意义。方法应用免疫组化法分别检测39例胃癌组织标本和18例正常对照胃组织标本RASSF1A蛋白表达;RT-PCR法检测4株胃癌细胞株、正常胃黏膜细胞株GES-1以及阳性对照Hela细胞中RASSF1A mRNA的表达;结合病理学特征进行分析。结果胃癌组织RASSF1A表达阳性细胞明显少于正常对照胃组织(P<0.01);不同分化程度、临床分期及浸润深度的胃癌组织,其RASSF1A表达存在显著性差异(P<0.05)。4株胃癌细胞株中仅MKN45细胞有RASSF1A mRNA表达;而正常胃黏膜细胞株GES-1和阳性对照Hela细胞均表达RASSF1A mRNA。结论胃癌组织中RASSF1A基因表达明显减少,其可作为评估胃癌恶性程度和预后的一项有意义的指标。     

胃癌患者KAI1基因的表达及意义

目的探讨转移抑制基因KAI1在胃癌中的表达以及与肿瘤恶性程度的关系。方法采用免疫组织化学法S-P法．检测92例胃癌石蜡标本及正常胃黏膜KAI1的表达水平。结果92例胃癌组织中KAI1的阳性率为42．8％，而正常胃组织的阳性率为80．0％。KAI1的低表达与胃癌的临床分期、病理分级、淋巴结转移及远处转移有显著相关性（P〈0．05）。结论胃癌患者广泛存在KAI1的表达异常，其表达异常可作为胃癌生物行为恶性程度、转移和复发以及疗效观察的重要指标。     

黏附分子在胃癌中的表达及意义

目的:探讨黏附分子上皮钙黏素(E-cadherin,E-CD)、CD44H在胃癌组织中的表达及与生物学行为的关系。方法:应用免疫组织化学SP法研究20例慢性胃炎,20例胃黏膜异型增生及50例胃癌组织中E-CD、CD44H的表达。结果:慢性胃炎,胃黏膜异型增生及胃癌组织中E-CD的阳性表达率分别为95％(19/20例)、85％(17/20例)、42％(21/50例),良、恶性病变差异有显著性(P<0.01);CD44H的阳性表达率分别为10％(2/20例)、15％(3/20例)、72％(36/50例),两者差异有显著性(P<0.05或0.01);同时E-CD及CD44H在胃癌组织中的表达与其分化程度、浸润深度、淋巴结转移及临床分期等有相关关系(P<0.05或0.01)。结论:E-CD及C]M4H参与了肿瘤的发生、发展、浸润及转移。     

基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义

目的 研究GLIS3在胃癌中的表达与预后价值,探索GLIS3在胃癌中免疫细胞浸润情况及其参与的生物学功能。方法 从TCGA数据库中下载胃癌患者GLIS3基因表达谱数据及临床病理信息,比较胃癌组织和癌旁组织中GLIS3的表达差异,分析GLIS3表达与胃癌患者临床病理特征的关系。利用Kaplan-Meier法和Cox回归分析GLIS3表达与胃癌患者临床预后相关性。运用miRWALK、TargetScan及TCGA数据库,预测调控GLIS3异常表达的miRNA。利用GSEA富集分析预测GLIS3在胃癌中可能参与的信号通路。使用TIMER2.0分析GLIS3表达与免疫细胞浸润之间的关系。结果 GLIS3在胃癌组织中表达明显上调,且GLIS3的表达与肿瘤组织学分级相关(P<0.05)。生存分析显示GLIS3高表达患者比低表达患者预后更差,差异有统计学意义(P<0.05),是胃癌的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.004～1.653,P<0.05)。miR-204-5p在胃癌中表达明显下调,且与GLIS3表达负相关(P<0.05)。富集分析结果显示：GLIS3...     

凋亡相关基因Survivin在人胃癌组织中的表达及其意义

目的探讨Survivin基因在人胃癌发生、发展中的作用及其与胃癌预后的关系.方法采用Western blot方法检测Survivin蛋白在30例胃癌组织、30例胃癌旁组织、10例正常胃组织标本中的表达.结果30例胃癌组织中22例Survivin表达阳性,30例胃癌旁组织及10例正常胃组织无Survivin蛋白表达,Suvivin蛋白阳性表达与胃癌的临床分期、腹膜和(或)远处转移有关,而与患者性别、年龄及胃癌附近淋巴结转移无关.结论Survivin在胃癌发生、发展中起有一定重要作用,对胃癌患者临床预后有参数价值.     

PTTG基因在人胃癌中的表达及意义

PTTG是新近发现的一种垂体肿瘤转化基因,其高表达在促进细胞增殖、转化及肿瘤发生中有着十分重要的作用。已有研究表明PTTG可在多种肿瘤细胞中高表达,但其在胃癌中表达的研究目前国内外尚未见文献报道。本文利用连续切片免疫组化技术检测PTTG在胃癌组织中的表达,旨在探讨基因PT     

胃癌及癌前病变组织中MUC1基因的表达及其意义

为了了解ＭＵＣ１基因表达改变所致的胃癌细胞表面及细胞外分子的生物学改变与胃癌发生发展的生物学行为之间的联系，以及胃癌癌前病变至胃癌演进中ＭＵＣ１基因表达的规律。我们应用ＢＣ１抗体（ＩｇＧ３）［１］检测组织中的ＭＵＣ１核心肽的表达，以揭示ＭＵＣ１基因异...     

基于TCGA数据库分析HPRT1在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义

目的:探讨次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶1(HPRT1)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达及功能.方法:下载TCGA数据库中的OSCC转录样本(n=394),包括癌症组织(n=362)及正常组织(n=32),以及381例临床数据.分析HPRT1的表达与OSCC预后的关系.利用基因集富集分析探讨HPRT1在OSCC中可能的作...     

PCNA、BCL—2在胃癌中的表达

目的：研究增殖细胞核抗原（简称PCNA）及Bcl-2在胃癌中的表达，探索PCNA，Bcl-2同胃癌预后的关系及对临床的意义。方法：用免疫组化S－P法，结果：PCNA和Bcl-2在胃癌中的表达与癌细胞的分化程度，浸润深度及肿瘤分期有关，与淋巴结转移的相关性不明显。结论：PCNA，Bcl-2的过量表达说明胃癌细胞增殖活跃。检测PCNA和Bcl-2更有助于了解胃癌的生物学行为及预测患者的预后。     

RASSF1基因在胃癌组织及细胞中的表达

[摘要] 目的 研究RASSF1基因的三种转录本(RASSF1-A, -B, -C)在胃癌组织及细胞中的表达特点。方法 应用生物信息学分析RASSF1基因的3种转录本的结构特点; 同时利用半定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测胃癌组织、癌旁组织及不同胃癌细胞系BGC和SGC细胞中三种转录本的mRNA表达水平。结果 RASSF1基因3种转录本在胃癌不同分化程度的细胞系BGC-823和SGC-7901细胞中均有表达,在60例胃癌组织中RASSF1A,RASSF1B 表达缺失率分别为60.2%(37/60),25%（15/60）,RASSF1C基因在胃癌组织及癌旁组织表达率相近约为86.7%（55/60）。结论 RASSF1三种转录本在胃癌组织中的表达下调, RASSF1B和RASSF1C在胃癌中的表达无差异,其余基因比较有差异。RASSF1B的表达可能与细胞的分化程度有关。     

基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析

目的 基于基因表达数据库（GEO）运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法 从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因（DEGs）并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络（PPI）,根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱（TCGA）中胃腺癌（STAD）的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果 共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质（ECM）与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调（P<0.05）;而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调（P<0.05）。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌...     

RASSF1A基因在胃癌中的表达及意义

目的：检测抑癌基因RASSF1A在胃癌细胞株及组织中的表达情况,探讨RASSF1A在胃癌发生发展中的作用及临床意义。方法：用RT-PCR及Western blot检测细胞株、胃癌及癌旁组织中RASSF1A基因及蛋白的表达水平。结果：RASSF1A在低分化BGC-823细胞中的表达量明显低于中分化SGC-7901细胞,在胃癌中的表达阳性率（43.48%）显著低于癌旁组织（85.51%）,且低分化胃癌中的表达低于中高分化,Ⅲ、Ⅳ期胃癌中的表达低于Ⅰ、Ⅱ期（P<0.05）。结论：在原发性胃癌组织中,RASSF1A的表达明显缺失或低下,且与肿瘤的分化程度及分期相关。     

hPMS2基因在胃癌组织中的表达及意义

目的探讨 DNA 错配修复基因 hPMS2在胃癌组织中的表达及其临床意义.方法应用 RT-PCR 检测比较82例胃癌患者癌组织(胃癌组)、74例癌旁萎缩性胃炎组织(癌旁萎缩性胃炎组)、50例慢性萎缩性胃炎组织(慢性萎缩性胃炎组)及40例慢性浅表性胃炎组织(慢性浅表性胃炎组)中 hPMS2 mRNA 的表达情况.结果胃癌组、癌旁萎缩性胃炎组、慢性萎缩性胃炎组及慢性浅表性胃炎组 hPMS2 mRNA 相对表达水平分别为27.33±15.05、18.88±11.67、6.25±9.72和2.78±1.34.胃癌组 hPMS2 mRNA相对表达水平明显高于其他3组(P<0.01),癌旁萎缩性胃炎组 hPMS2 mRNA 相对表达水平明显高于慢性萎缩性胃炎组及慢性浅表性胃炎组(P<0.01),慢性萎缩性胃炎组与慢性浅表性胃炎组 hPMS2 mRNA 相对表达水平的差异无统计学意义(P >0.05).hPMS2 mRNA 表达水平与肿瘤大小、浸润深度、有无淋巴结转移无明显相关(P >0.05).结论胃癌和癌旁萎缩性胃炎组织 hPMS2基因过度激活或表达增强,与胃癌发展关系不大.