北京地区2009-2010年流感监测季乙型流感病毒HA基因特征分析

目的了解2010年1~4月间北京地区流感病原学监测中分离到的乙型流感病毒株血凝素(HA)基因的特征,探讨2009-2010年流感监测季乙型流感病毒的分子流行病学特征。方法采用一步法RT-PCR方法,随机抽取32株本监测季分离到的乙型流感病毒毒株进行血凝素基因的扩增,将扩增产物进行序列测定,采用相应的生物信息软件进行核酸及氨基酸序列比对以及进化树分析。结果 2009-2010年流感监测季期间,北京地区人群中乙型流感病毒以Victoria系的活动占优势,其间分离的32株病毒的HA基因与2009-2011年北半球的疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,31株在HA1区发生I73P的变化,32株发生I161V的变化,氨基酸的替换均发生在抗原决定簇A区。绘制的种系发生树显示这些毒株与B/Brisbane/60/2008亲缘关系最近,而与B/Malaysia/2506/2004以及B/Hong Kong/330/2001差异较大。结论 2010年1~4月间北京地区人群中Victoria系乙型流感病毒的HA基因发生变化,导致其抗原性发生改变,表明北京地区人群中流行的乙型流感病毒的抗原性和基因特性在逐渐发生变异,今...     

深圳市2005—2007年H1N1亚型流感病毒HAl基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征。方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株，提取病毒RNA，用RT-PCR扩增HA1区基因片段，产物纯化后测序并进行基因序列分析。结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%，H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%，而2007年仅占3.61%。核苷酸同源性和基因进化树结果一致，2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支，2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支，而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支。氨基酸序列分析显示，绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸；2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异：T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N，2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异，同时也发生A区R146K的置换。但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守。发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性，经与参照毒株比较，其326个氨基酸中有50个发生变化，其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点，且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失。结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株；由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移，其代表株为A/GDLH/219/2006；发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性，其抗原特性和流行病学意义还有待探讨。     

2017-2019年丽水市流感监测和甲型流感病毒HA基因进化分析

目的 对2017-2019年丽水市流行性感冒(简称流感)监测数据和甲型流感病毒HA基因进行分析,以了解丽水市流感的流行情况、病毒亚型构成和基因进化特征.方法 收集2017-2019年丽水市流感监测哨点医院的流感样病例(influenza-like illness,ILI)数据以及流感病毒病原学检测结果,采用描述性流行病...     

北京地区2005～2006年流感病原监测结果与乙型流感病毒HA1序列分析

目的：分析2005～2006年冬春季北京地区流感病原监测及乙型流感病毒种系分布情况。方法：采用狗肾传代细胞（MDCK）和鸡胚培养分离流感病毒，经血清学试验鉴定分型。选取部分乙型流感提取病毒RNA，经RT—PCR扩增得到HA1基因片段并进行核苷酸序列测定，用信息软件进行种系发生树分析。结果：共采集流感样病例标本1874份，经MDCK细胞分离到510株流感病毒。其中H1N1亚型244株（47．84％）；H3N2亚型57株（11．18％）；B型209株（40．98％），208株为Victoria系，1株为Yamagata系。对210份细胞分离阳性标本进行鸡胚培养，共分离到流感病毒9株，全部为H1N1亚型。28株B型优势流行株与当年疫苗株不属于同一谱系，相差较远；与新预测（2006～2007年）的疫苗株亲缘关系最近。结论：北京地区2005～2006年冬春季节存在H1N1、H3N2、B型3种流感病毒流行，以H1N1、B型为优势毒株。B型Victoria系优势株正在通过变异逐步在流行中占据主导地位。新预测流感疫苗可对人群产生良好的保护效果。     

2008年珠海市Victoria系B型流感病毒HA1基因特性分析

目的了解2008年珠海市Victoria系B型流感病毒的HA1基因特性。方法采集珠海市流感样病例咽拭子样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的B型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录一聚合酶链反应（RT—PCR）扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,用Mega、DNAStar、GeneDoc软件对测序结果进行分析。结果2008年分离到的4株Victoria系B型流感毒株通过基因进化树分析均在1个分支上,与同时段的疫苗株B／Malaysia／2506／2004的核苷酸同源性高达98．6％～99．1％。通过氨基酸分析发现,在HA1基因的第70～90位区域未发现氨基酸变异,而在110～210区域,均在134号位点发生丝氨酸到脯氨酸的替换,在165位有个别株出现了天冬酰胺到赖氨酸的替换。与B／Malaysia／2506／2004和B／Shenzhert／155／05比较,在199位出现了苏氨酸的替换,使毒株在197～199位上的氨基酸形成Asn—Glu—Thr的结果,导致在该处增加了1个潜在的糖基化位点。结论2008年珠海市人群中流行的Victoria系B型流感病毒与疫苗株B／Malaysia／2506／2004相比抗原性已经发生了变化。     

连云港地区2017—2018年乙型流感病毒HA1基因特征分析

目的了解连云港地区2017—2018年乙型流感病毒表面血凝素HA1基因特征及抗原变异情况。方法随机选取2017—2018年连云港地区分离的6株乙型流感病毒株,用一步RT-PCR法对HA1基因进行扩增测序,采用Lasergene软件包中MegAlign进行核苷酸和氨基酸同源性分析,用MEGA6.0软件进行基因种系进化分析。结果 2017—2018年连云港地区人群中同时流行着乙型Yamagata系和Victoria系毒株。分离的Yamagata系毒株与B/Brisbane/9/2014比较,在血凝素基因HA1区发生3个氨基酸替换,在248位少了一个糖基化位点;分离的Victoria系毒株与B/Brisbane/63/2014、B/Florida/33/2014比较,在血凝素基因HA1区发生6个氨基酸替换,在248位增加一个糖基化位点。结论连云港地区人群中流行的乙型流感病毒与疫苗推荐株相比,基因特性已发生一定改变。     

2006年～2010年无锡地区乙型流感病毒HA基因特性分析

目的：了解无锡地区2006年～2010年流行的乙型流感病毒HA基因变异特点及种系进化分布。方法：取哨点医院送检的疑似流感标本,经MDCK细胞培养、血清鉴定为乙型流感病毒,提取病毒RNA,经逆转录聚合酶链式反应扩增,产物经纯化后,进行血凝素基因HA区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,用Bioedit和MEGA version 4.0分析软件进行基因种系进化特性分析。结果：2006年Victoria系毒株为主要优势流行株,2007～2010年Yamagata系和Victoria系同时流行。2010年Victoria系在第163位、174位、203位、269位氨基酸分别转换为Y-C、G-E、Y-G、P-L;2010年Yamagata系在第84位、133位、182位、357位、363位、369位有氨基酸的转换,分别位于G-D、T-D、G-E、L-P、N-Y、K-P。结论：2010年无锡地区人群中流行的乙型流感病毒Yamagata系和Victoria系基因位点有一定的替换,抗原已发生漂移,但不会引起大的流行。     

涟水县一起B型流感暴发疫情的流行病学分析

目的分析涟水县一起流感暴发疫情的流行病学特征,为制定防控措施提供依据。方法采用描述性流行病学分析方法对病例进行个案调查,用荧光定量RT-PCR检测患者咽拭子标本中的流感病毒核酸。结果2006年2月23日至3月1日淮安市涟水县清华中学发生了一起流感暴发疫情,共报告病例37例,发病班级罹患率为4.46%。病例年龄在13~17岁,男女病例性别比为6.4∶1。用RT-PCR法从5例患者的咽拭子标本中检出B型流感病毒核酸,病毒分离检出2株B型(Victoria系)流感病毒。结论该次疫情为B型流感暴发。今后应加强学校流感防治,流行季节要做好流感疫情防控工作。     

北京市西城区2009年-2011年乙型流感病毒血凝素HA1基因特性分析

目的:了解2009年10月-2011年9月期间北京市西城区乙型流感病毒的血凝素基因(HA1)的变异情况以及WHO推荐的流感疫苗株对北京地区人群的保护情况。方法:对流感样病例的咽拭子进行病毒分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增其HA1基因,用DNAStar生物软件对HA1的序列进行分析处理,并与WHO推荐的疫苗株进行系统进化分析。结果:HA1片段序列分析显示本地区的乙型流感病毒属于Victoria系,与WHO推荐流感2009年-2010年疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,其核苷酸、氨基酸的同源性分别为96.4%～99.1%和98.2%～99.1%。未发现核苷酸的丢失和插入。氨基酸序列中有3个位点发生改变。结论:本地区的优势流行株其抗原性未发生明显改变,提示2010年WHO推荐乙型流感疫苗株对北京地区人群仍有较好的保护效果。     

广西2005～2006年流感监测结果分析

目的对广西流感监测网络下属的4家医院送检的咽拭子进行检测,探讨流感病毒优势株的变化,了解广西流感流行规律,为流感防制提供科学依据。方法选择广西区妇幼保健院、隆安县人民医院、南宁市妇幼保健院和南宁市第一人民医院作为监测点,对流感样病例进行逐日统计,对符合采样条件的流感样病例进行采样,采用细胞培养法分离鉴定流感病毒。结果2005、2006年广西流感监测医院的流感样病例春、夏季高峰明显,4家流感监测医院的流感样病例数占门诊总病例数的百分比为10.04%～26.30%。2005年分离到125株流感病毒,其中B型63株(占50.40%),H3N2亚型46株(占36.80%),H1N1亚型16株(占12.80%),2006年分离到191株流感病毒,其中B型78株(占40.84%),H3N2亚型3株(占1.57%),H1N1亚型110株(占57.59%)。结论2005、2006两年广西流感监测医院的流感样病例全年均有发生,春、夏季为高发季节,2005年的流行株为B型流感毒株,2006年流行株为H1N1型流感毒株。     

2005—2012年无锡市流感流行特征分析

目的掌握2005-2012年无锡市流感流行规律和流感病毒优势株的变化。方法分别采用实时荧光聚合酶链反应（Real-time polymerase chain reaction,Real-time PCR）方法和狗肾传代细胞（Madin-Darby canine kid-ney,MDCK）细胞培养法进行流感病毒检测和流感病毒分离。结果 2005年10月～2012年12月,无锡市流感样病例（influenza like illness,ILI）年龄构成以0～5岁为主（62.31%）,流感病毒分离平均阳性率为19.29%,其中季节性A（H1N1）占11.99%,季节性A（H3N2）占28.15%,B型占34.17%,甲型H1N1占25.70%。各年龄组人群感染流感毒株型别不同（2=250.60,P〈0.001）。总阳性率每隔2年升高一次,ILI与流感病毒活动度之间呈正相关（r=0.241,P=0.024）。ILI暴发疫情主要集中在2006年3～4月份和2009年9月份,主要由B型和甲型H1N1引起。结论 ILI、ILI%和流感病毒阳性率三者的高峰基本吻合,并与流感优势毒株交替变化一致,上述验证了流感哨点监测在预警预测流感流行趋势和暴发疫情中的实际作用。     

2005-2012年无锡市流感流行特征分析

目的掌握2005-2012年无锡市流感流行规律和流感病毒优势株的变化。方法分别采用实时荧光聚合酶链反应（Real-time polymerase chain reaction,Real-time PCR）方法和狗肾传代细胞（Madin-Darby canine kid-ney,MDCK）细胞培养法进行流感病毒检测和流感病毒分离。结果 2005年10月～2012年12月,无锡市流感样病例（influenza like illness,ILI）年龄构成以0～5岁为主（62.31%）,流感病毒分离平均阳性率为19.29%,其中季节性A（H1N1）占11.99%,季节性A（H3N2）占28.15%,B型占34.17%,甲型H1N1占25.70%。各年龄组人群感染流感毒株型别不同（2=250.60,P<0.001）。总阳性率每隔2年升高一次,ILI与流感病毒活动度之间呈正相关（r=0.241,P=0.024）。ILI暴发疫情主要集中在2006年3～4月份和2009年9月份,主要由B型和甲型H1N1引起。结论 ILI、ILI%和流感病毒阳性率三者的高峰基本吻合,并与流感优势毒株交替变化一致...     

深圳市2005-2007年H1N1亚型流感病毒HA1基因分子流行病学研究

目的 探讨2005-2007年深圳市H1N1流感病毒HA1基因变异特征.方法 选取深圳市2005-2007年分离的H1N1流感毒株,提取病毒RNA,用RT-PCR扩增HA1区基因片段,产物纯化后测序并进行基因序列分析.结果 2005-2007年流感病毒分离率平均为7.16%,H1N1流感病毒在2005年和2006年的分离数占总分离数的比例分别为56.14%和66.03%,而2007年仅占3.61%.核苷酸同源性和基因进化树结果一致,2005年4月份之前分离株与A/New Caledonia/20/1999为同一分支,2005年5月份之后的分离株与A/Solomon Island/3/2006为一支,而2006-2007年分离株又与国家代表株A/GDLH/219/2006在一个分支.氨基酸序列分析显示,绝大多数的毒株均在第130位点缺失一个赖氨酸;2005年5月以后的大部分毒株出现以下氨基酸变异:T82K、Y94H、R146K、R209K、T267N,2006年5月份之后的毒株在抗原决定簇B区发生了A190T、H193Y、E195D氨基酸变异,同时也发生A区R146K的置换.但所有毒株的潜在糖基化和受体结合位点均比较保守.发现1株病毒A/SZ/68/2007具特殊性,经与参照毒株比较,其326个氨基酸中有50个发生变化,其中有11个位于抗原决定簇位点、6个位于受体结合位点,且有4个氨基酸变化导致糖基化位点丢失.结论 2005-2007年深圳市人群中至少有3个类型HA1基因不同的H1N1流感病毒株;由于氨基酸变异引起病毒发生抗原漂移,其代表株为A/GDLH/219/2006;发现的A/SZ/68/2007病毒毒株具有特殊性,其抗原特性和流行病学意义还有待探讨.     

2005-2009年大连市流感病毒血凝素基因遗传特性分析

目的分析大连市2005-2009年流感病毒血凝素(HA)基因变异情况。方法采用MDCK细胞分离培养季节流感H1N1亚型28株;H3N2亚型9株;B型(Yamagata系)24株,采用RT-PCR法分节段扩增各毒株血凝素基因,并进一步对各片段进行核苷酸和氨基酸序列测定分析。结果 2005-2009年,大连市分离到的甲型H1N1病毒变异较大,其中2009年分离的一株H1N1亚型毒株A/liaoningxigang/136/2009(H1)与该年WHO推荐的疫苗株相比,抗原决定簇B区上有4个位点发生了突变,属于新的变种。2005、2007年分离的H3N2流感病毒株,与疫苗株相比序列同源性较高,并未发生大的变异;2007-2008年流行的B型Yamagata系病毒与疫苗株B/Shanghai/361/02相比,有7个氨基酸位点发生改变,其中两个位于抗原决定簇,并于196位增加一个糖基化位点。结论各年度WHO推荐的疫苗株与流行株之间匹配性不完全一致,每年由于核苷酸序列的变化而引起了不同程度的抗原性漂移。     

2004～2006年江西省乙型流感病毒HA1基因特性分析

目的：了解江西省2004～2006年分离的B型流感病毒株HA1基因变异特征。方法：采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的B型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit（Version5.0）、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果：2004年和2005年分离到的B型流感病毒均为B型的Yamagata系;2006年以Victoria系为优势株,但有Yamagata系的活动。9株Yamagata系B型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为1014 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,与疫苗推荐株B/Shanghai/361/2002 HA1区相比较,不同毒株氨基酸同源性为96.4%～97.3%,替换数在10～11个,所有毒株均在9个相同的氨基酸位点发生了相同的替换,在196位增加了一个糖基化位点。12株Victoria系B型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为1017 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,与疫苗推荐株B/Malaysia/2506/2004的HA1区相比较,不同毒株氨基酸同源性为98.4%～99.5%,替换数在2～4个,所有毒株均在2个相同的氨基酸位点发生了相同的替换,在197位增加了一个糖基化位点。结论：江西省2004～2006年Yamagata系B型流感病毒HA1基因特性已发生改变,从基因水平说明Yamagata系B型流感病毒抗原性发生了改变。2006年Victoria系B型流感病毒HA1基因特性有所改变,疫苗仍有预防效果。     

2017年北京市丰台区6例乙型Victoria系流感病HA1基因特征分析

目的 了解2017年北京市丰台区流感暴发疫情中乙型Victoria系（BV）流感毒株血凝素（HA1）基因特征和变异情况。 方法 对北京市丰台区2017年6起BV流感暴发疫情病例标本中分离得到的6株毒株的HA1基因进行提核酸、扩增和测序,通过DNAStar 7.1、Bioedit v7.0.9、Mega 6.0.6 等生物信息学软件对序列进行分析。结果 6例样本中1号样本与2017年部分日本流行毒株亲缘关系较近(99.6%);另5例样本与2016年我国厦门、泰国和肯尼亚部分流行毒株的亲缘关系较紧密（99.1%～99.8%）。6例样本与WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008的同源性为98.6%。6例样本共有7个位点发生了变异,其中有5例样本发生了I132V、N144D 和E200D的变异,分别涉及到抗原决定簇A、B、D3个区。结论 北京市丰台区2017年BV系流感株的HA1基因发生了个别位点的变异,但与WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008的匹配度相对较高,继续使用疫苗对BV系病毒引起的流感能起到积极的预防作用。     

北京市朝阳区2005年11月～2006年4月流感爆发分析

目的:对北京市朝阳区2005年11月~2006年4月流感爆发进行分析,以便制定确实有效的防治措施。方法:采集集中发热疫情病人咽拭子标本,采用MDCK细胞培养法分离流感病毒,微量血凝抑制实验进行鉴定。结果:共采集标本177份,分离到流感病毒101株,流感病毒分离率57.06%。流感爆发占集中发热疫情的88.46%,以小学流感爆发为主(95.56%)。2005年11月~12月,为甲1型流感爆发,2006年3月~4月,为乙型流感爆发。结论:流感爆发是集中发热疫情的主要原因,且以小学流感爆发为主(95.56%)。北京地区3月份仍可出现流感爆发的流行高峰。