非医学信息学专业医学信息学教育课程的设置

以国际医学信息学会 （ International Medical Informatics Association, IMIA）2010年修订的《关于开展生物医学与健康信息学教育的建议》为依据,结合我国目前医学生基本临床信息技能及医学信息学教育现状,以医学文献检索为课程基础,构建适合高等医学院校非医学信息学专业教育的医学信息学课程,使医学生毕业后能够适应信息化条件下医疗卫生实践对基本信息技能的要求。     

The emerging role of clinical informatics fellows in service learning during the COVID-19 pandemic

ObjectiveThe study sought to describe the contributions of clinical informatics (CI) fellows to their institutions’ coronavirus disease 2019 (COVID-19) response.Materials and MethodsWe designed a survey to capture key domains of health informatics and perceptions regarding fellows’ application of their CI skills. We also conducted detailed interviews with select fellows and described their specific projects in a brief case series.ResultsForty-one of the 99 CI fellows responded to our survey. Seventy-five percent agreed that they were “able to apply clinical informatics training and interest to the COVID-19 response.” The most common project types were telemedicine (63%), reporting and analytics (49%), and electronic health record builds and governance (32%). Telehealth projects included training providers on existing telehealth tools, building entirely new virtual clinics for video triage of COVID-19 patients, and pioneering workflows and implementation of brand-new emergency department and inpatient video visit types. Analytics projects included reports and dashboards for institutional leadership, as well as developing digital contact tracing tools. For electronic health record builds, fellows directly contributed to note templates with embedded screening and testing guidance, adding COVID-19 tests to order sets, and validating clinical triage workflows.DiscussionFellows were engaged in projects that span the breadth of the CI specialty and were able to make system-wide contributions in line with their educational milestones.ConclusionsCI fellows contributed meaningfully and rapidly to their institutions’ response to the COVID-19 pandemic.     

医学信息学课程师资队伍建设探析

介绍医学信息学师资建设国内外现状,指出我国医学信息学师资建设在师资来源和师资学历方面的差距,从拓宽师资来源途径、建立能力素质标准、制定个性化培养方案、构建科学评价体系四个方面阐述医学信息学课程组师资建设方案。     

医学信息学教学模式改革探索

本文介绍了国内外医学信息学教学模式现状,指出我国医学信息学教学存在着模式单一、不适应现代医疗活动的问题,并从课堂讲授、网上教学、移动教学、模拟教学以及教学评估等方面阐述了医学信息学教学模式的规划方案.     

基于GMDS倡议的医学信息学教育课程体系的构建

分析和总结了德国医学信息学、生物测量和流行病学协会（GMDS）倡议的医学信息学本科课程体系,结合我国医学信息学教育的课程体系设置的现状,提出了构建医学信息学本科课程体系的五原则：特色性、整体性、科学性、实用性、针对性,并以中南大学医药信息系的课程体系为基础,提出了新课程设置方案,以培养社会需要的医学信息学复合型人才,实现医学信息学的长足健康发展。     

Research and applications: Automatic glaucoma diagnosis through medical imaging informatics

Background

Computer-aided diagnosis for screening utilizes computer-based analytical methodologies to process patient information. Glaucoma is the leading irreversible cause of blindness. Due to the lack of an effective and standard screening practice, more than 50% of the cases are undiagnosed, which prevents the early treatment of the disease.

Objective

To design an automatic glaucoma diagnosis architecture automatic glaucoma diagnosis through medical imaging informatics (AGLAIA-MII) that combines patient personal data, medical retinal fundus image, and patient''s genome information for screening.

Materials and methods

2258 cases from a population study were used to evaluate the screening software. These cases were attributed with patient personal data, retinal images and quality controlled genome data. Utilizing the multiple kernel learning-based classifier, AGLAIA-MII, combined patient personal data, major image features, and important genome single nucleotide polymorphism (SNP) features.

Results and discussion

Receiver operating characteristic curves were plotted to compare AGLAIA-MII''s performance with classifiers using patient personal data, images, and genome SNP separately. AGLAIA-MII was able to achieve an area under curve value of 0.866, better than 0.551, 0.722 and 0.810 by the individual personal data, image and genome information components, respectively. AGLAIA-MII also demonstrated a substantial improvement over the current glaucoma screening approach based on intraocular pressure.

Conclusions

AGLAIA-MII demonstrates for the first time the capability of integrating patients’ personal data, medical retinal image and genome information for automatic glaucoma diagnosis and screening in a large dataset from a population study. It paves the way for a holistic approach for automatic objective glaucoma diagnosis and screening.     

医学信息学专业的差异化发展策略与实践探索

介绍了医学信息学专业的发展现状及其面临的挑战,提出了适合本学科发展的特色化、差异化战略,即在本专业教育过程中,通过实施差异化战略,将电子信息技术与医学信息实践技能和医学知识结合,培养更加适应社会需求的卫生信息化人才,提升我国卫生信息化领域的整体水平,实现医学信息学专业的可持续发展。     

国内“医学信息学概论”教材建设现状

介绍了我国医学信息学概论教材的发展历程、基本情况、知识体系、主要特点,分析了目前教材存在的整体框架结构不统一、内容更新不及时、缺乏案例研究、缺乏层次性与针对性等问题,并提出了相应的建议。     

医药信息学教育结构重组探析

医药信息学日益成为医药教育界关注的热点,随之而来的医药信息学人力资源建设和医院信息技术(IT) 复合型人才培养模式,必然面临着系统化和科学化的重大变革。本文就广东省近年来医药信息学的发展和医院对 IT专业人员的需求,以及省内各医药院校对医药信息学人才的培养措施进行了探讨,并介绍了广东药学院对医药信息学教育进行结构重组的尝试。     

基于Web of Science的Meta分析在医学信息学领域中的应用

目的：探讨Meta分析在医学信息学领域的研究前沿,并对其跨学科属性进行分析,为科研人员提供借鉴和参考。方法：以Web of Science核心合集中医学信息学领域发表的Meta分析相关文献为研究对象分析学科领域分布,利用Netdraw建立学科共现网络探讨跨学科属性。对高频被引论文进行双向聚类分析,分析当前该领域的研究前沿。结果：近5年医学信息领域中Meta分析研究涉及最多的学科有卫生保健科学与服务、数学与计算生物学等,研究前沿主要集中在网状Meta分析的方法学研究、诊断性试验Meta分析方法、基于互联网和医疗信息技术干预模式对疾病或健康结局影响的系统评价和Meta分析、Meta分析的统计学方法及统计模型构建与模拟等5个方面。结论：医学信息学领域Meta分析研究的跨学科属性和5个研究前沿,为后续研究指明了方向。     

大数据环境下医学信息学教育的变革与发展

从医学信息学教育的新目标、新内容、新准则、新挑战等角度探讨了大数据环境下医学信息学教育的变革,从资源观念、教学模式、教育决策、培养方案等角度探讨了大数据环境下医学信息学教育的发展,以期引发大数据时代对于医学信息学教育的思考。     

网上免费医学生物学数据库指南的建立

目的:建立一个网上免费的医学、生物学数据库的查询指南(directory of biomedical databases,DBD),方便研究者查询相关数据库.改变目前医学、生物学数据库查询不便的现状,推动医学、生物学的发展.方法:以PubMed和Google作为主要检索工具,制定检索策略,根据收录的标准筛选找到的数据库,入选项管理平台采用Microsoft SQL-Server 2000,利用Macromedia Dreamwaver MX设计DBD的Web发布页面,ASP(active server pages)技术处理用户提交的关键词和评分值.结果:目前收集到医学、生物学数据库66类1258个,中英文版同时发布(http://cmbi.bjmu.edu.cn/DBList/index.htm,http://cmbi.bjmu.edu.cn/DBList/index_en.htm),用户可以通过分类、关键词和入选项名称字顺查询相关数据库,并建立基于内容的数据库评分系统和数据库点击记录.使页面简洁易用.结论:DBD为建立网上核心医学、生物学数据库的评价体系奠定了基础,DBD将有助于数据库在未来医学、生物学研究中发挥强大的作用.     

医学信息学“金课”建设模式

目的：探索医学信息学线上“金课”、线下“金课”及线上线下混合“金课”的建设模式。方法：对线上“金课”、线下“金课”及线上线下混合“金课”进行分析，并对不同类型的精品课程资源进行分析比较。结果：不同类型“金课”具有不同特点且差异较大，线下课堂需打造体验式学习环境，不同类型的“金课”课堂建设需进一步探讨。结论：由于医学信息学课程体系涉及多个学科理论与技术，不同课程差异较大，因此在探索实践不同类型“金课”建设模式时，需充分结合课程建设需求与不同类型“金课”特色与优势，多方协作，共同打造适合医学信息学教育发展道路的具有高阶性、创新性和挑战度的高水平“金课”。     

Review: Pathology imaging informatics for quantitative analysis of whole-slide images

Objectives

With the objective of bringing clinical decision support systems to reality, this article reviews histopathological whole-slide imaging informatics methods, associated challenges, and future research opportunities.

Target audience

This review targets pathologists and informaticians who have a limited understanding of the key aspects of whole-slide image (WSI) analysis and/or a limited knowledge of state-of-the-art technologies and analysis methods.

Scope

First, we discuss the importance of imaging informatics in pathology and highlight the challenges posed by histopathological WSI. Next, we provide a thorough review of current methods for: quality control of histopathological images; feature extraction that captures image properties at the pixel, object, and semantic levels; predictive modeling that utilizes image features for diagnostic or prognostic applications; and data and information visualization that explores WSI for de novo discovery. In addition, we highlight future research directions and discuss the impact of large public repositories of histopathological data, such as the Cancer Genome Atlas, on the field of pathology informatics. Following the review, we present a case study to illustrate a clinical decision support system that begins with quality control and ends with predictive modeling for several cancer endpoints. Currently, state-of-the-art software tools only provide limited image processing capabilities instead of complete data analysis for clinical decision-making. We aim to inspire researchers to conduct more research in pathology imaging informatics so that clinical decision support can become a reality.     

从我国医药企业医学信息专员职位看我国医学信息学教育现状

介绍了我国医药企业医学信息专员的职能设置、技能要求、企业和地域分布等特点,结合我国医学信息学人才培养的现状,分析了我国医学信息学教育中医学课程学时数较少、专业定位不明确等问题,提出了对我国医学信息学教育方向的思考和建议。     

信息链视角下的医学信息学研究的重点及其未来发展方向

医学信息学作为一门独立的学科发展方兴未艾,并取得了巨大进展。透过信息链这一独特视角对医学信息学的未来发展重点和方向进行了研究与预测,对医学信息学发展中所面临的问题提出了相应对策。     

基于课程整合的医学信息学专业教育模式

整合课程内容、加强能力培养是目前教育模式改革的趋势,在分析医学信息学专业主要培养卫生相关信息系统开发和维护能力、医学信息处理能力、医学信息服务能力等的基础上,根据能力培养的要求和学科知识结构的特点,提出了对应每项能力进行无重复、无缝隙课程内容整合及综合性、连续性实践教学改革的建议。     

医学信息学跨学科测度指标与论文影响力关系

目的：分析医学信息学领域的跨学科特征及其与论文影响力的关系,为医学信息学研究的深入提供参考。方法：基于Web of Science核心合集中学科分类体系和医学信息学领域发文的参考文献数据集,选取布里渊指数（BI）和跨学科种数测度论文的跨学科程度。选取年度总被引频次、学科规范化的引文影响力和相对于全球平均水平的影响力作为论文学术影响力指标,年度总使用次数作为论文的社会影响力指标,分析跨学科测度指标与其相关性。结果：涉及33个核心学科;BI、跨学科种数平均值分别为1.536 1和137,BI与跨学科种数呈高度正相关性,二者均与影响力评价指标呈正相关性,与被引频次、使用次数呈高度相关性。结论：医学信息学领域的跨学科性明显,一直处于稳步发展中。随着跨学科种数的增加,BI变大,论文的影响力和关注度会相应增强。     

医学信息学课程群的构建

结合我国医疗卫生信息化发展对专业人才的需求,以济宁医学院为例,构建了由《医学信息学》、《医院管理学》、《数据库原理》、《软件工程》、《病案信息学》以及《医院信息系统》组成的医学信息学课程群,并对其内容整合优化、教学模式改革、师资培养、教材建设等方面进行了分析与探讨。     

医学信息学实验教学存在的问题与对策

分析了医学信息学实验教学中存在的问题,并就优化实验类课程设置和改进相关教学内容提出了建议。