大鼠创伤性脑损伤早期基因差异表达的研究

目的研究创伤性脑损伤早期基因表达谱与正常脑组织基因表达谱的差异,以期阐明脑损伤后早期基因表达的改变规律,阐明脑损伤发生发展的分子机制,从而为临床治疗提供帮助,同时为法医损伤时间推断研究寻找标志物提供帮助。方法以大鼠自由落体损伤模型为对象,从损伤区脑组织和假手术对照组脑组织分别提取mRNA,经反转录成cDNA后与含有4096个随机基因的基因表达谱芯片杂交,杂交后的芯片经扫描仪扫描,并用GenePix3.0软件分析结果。结果发现有124个差异表达基因或表达序列标签（expression sequencetags,ESTs）;其中有46个基因和26个EST表达下调;28个基因和24个EST表达上调;在这些表达有差异的基因中,有涉及细胞内信号传导、神经递质释放、参与炎症的蛋白、离子通道及其受体蛋白和参与炎症反应的蛋白等被发现。结论创伤性脑损伤的发生发展涉及多个基因的改变;研究一个或少数几个基因很难解释其损伤后分子变化机制;基因芯片是研究颅脑损伤这种多基因改变、多因素作用的理想工具。     

应用基因芯片技术检测人脐带血CD34+细胞体外扩增的巨核细胞基因表达

目的 研究人脐带血CD34+细胞体外扩增巨核细胞的基因表达,从分子水平探讨巨核细胞的表达机制.方法 采用密度梯度离心法和免疫磁珠分选系统获取人脐带血CD34+细胞.100 ng/ml TPO诱导培养12 d后,应用抗CD+41单克隆抗体免疫磁珠法分选巨核细胞.应用基因芯片技术检测巨核细胞、非巨核细胞和meg-01细胞株...     

胰腺癌相关自身抗原47原核表达、纯化及其抗体检测胰腺癌的价值初探

目的 验证胰腺癌相关性自身抗原47(PAA47)的质谱鉴定结果，初探抗PAA47检测在诊断胰腺癌中的意义。方法 构建pQE—30—PAA47重组表达载体；在大肠杆菌M15中诱导表达KIAA0111编码蛋白质；经纯化后用点印迹、免疫印证法验证表达产物与相应胰腺癌相关性自身抗体阳性血清的抗原反应性；建立间接酶联免疫吸附实验(ELISA)，检测60名健康体检者、60例胰腺癌、20例慢性胰腺炎及120例其他肿瘤(大肠癌、肝癌、胃癌及肺癌各30例)患者血清中的抗PAA47，并与回顾性糖链抗原19—9(CAl9—9)检测结果相比较。结果 表达产物的序列与KIAA0111编码序列一致；点印迹法和免疫印迹法显示纯化表达产物与抗PAA47血清具有抗原反应性。ELISA结果显示，胰腺癌患者中，该抗体阳性率为31．67％(19／60)，大肠癌、肝癌、胃癌分别为10．00％、3．33％、6．67％，正常人、慢性胰腺炎及肺癌患者中未见阳性。抗PAA47对胰腺癌的灵敏度为31．67％，特异性为95．89％。与慢性胰腺炎患者比较，PAA47的灵敏度为31．67％，特异性为100％，CAl9—9的灵敏度为75．00％，特异性为86．96％。平行法联合检测2项指标，既保持了相同的特异性，又提高了检测的灵敏度(90％，P＜0．05)。采用顺序法联合检测，灵敏度和特异性分别为70％和100％。结论 本研究成功克隆了人KIAA0111编码基因，并将其在大肠杆菌中成功表达；新鉴定的PAA47，其抗体血清学检测与CAl9—9等肿瘤标志物联合，对提高胰腺癌诊断的灵敏度和特异性具有一定的意义。     

弥漫型胃癌基因表达谱聚类分析

目的:从转录组水平识别弥漫型胃癌与正常胃黏膜间的基因表达差异,探讨胃癌分子发生、发展的机制。方法:收集22例弥漫型胃癌患者的胃癌组织及其相应远切端的正常胃黏膜。采用含14592个点的cDNA表达谱芯片建立胃癌基因表达谱。差异表达基因筛选标准为该基因在50%以上样本中肿瘤比正常组织荧光强度大2倍或以上(P<0.05)。采用系统聚类、方差分析(P<0.05)等方法进行差异表达分析,实时定量RT-PCR方法验证芯片结果。结果:胃癌组织与正常胃黏膜间的差异表达基因共357个,其中表达上调者153个;表达下调者204个。上调基因的功能主要与细胞骨架运动、基质重建和细胞黏附、细胞周期调控及信号传导相关;下调基因主要与消化功能、细胞免疫防御、代谢、凋亡抑制及电子传递相关。实时定量PCR验证结果与芯片结果一致。结论:运用cDNA芯片进行弥漫型胃癌基因表达谱分析,有助于从分子水平全方位理解弥漫型胃癌发病机制及生物学特性,也有助于发现新的分子诊断指标和基因治疗靶标。     

导流杂交基因芯片检测人乳头状瘤病毒21种亚型的应用评价

目的了解基因芯片检测人乳头状瘤病毒(HPV)21种亚型感染的临床应用价值。评价导流杂交基因芯片技术(凯普导流杂交)HPV DNA检测法(HybriMax)在女性生殖道HPV感染检测中的临床效用,初步探讨最常见的HPV基因型。方法利用标记有生物素的HPV通用引物进行PCR扩增,扩增产物变性后与固定在尼龙膜上21种HPV特异性分型探针进行反向斑点杂交检测HPV亚型。结果 591例患者标本中,基因芯片阳性率69.2%,其中单一亚型感染266例,重叠感染143例。共检出亚型20种。结论基因芯片一次试验可联合检测多种HPV亚型感染并分型,可研究HPV感染型别的分布,提高由HPV引起的肿瘤防治水平。     

氟达拉滨诱导多发性骨髓瘤细胞凋亡及其基因表达分析

目的 探讨氟达拉滨诱导多发性骨髓瘤(MM)细胞凋亡及其分子机制.方法 用MTT法检测氟达拉滨对MM细胞的生长抑制作用;用流式细胞术检测细胞凋亡;Western blot法分析凋亡蛋白表达;采用细胞凋亡基因芯片技术检测并分析对照组与氟达拉滨处理组间的基因表达差异.结果 氟达拉滨显著抑制RPMI8226和KM3细胞生长,呈时间和剂量依赖性.24 h半数生长抑制值(IC50)分别为2.13μg/ml和0.36 μg/ml.流式细胞术分析显示,氟达拉滨作用24 h后MM细胞凋亡呈剂量依赖性,同时伴有caspase-3和PRAP激活,具有典型的细胞凋亡生物学特征.在97个凋亡相关基因中,筛选出25个差异表达基因.氟达拉滨处理组与对照组比较,表达上调的基因有13个,主要涉及Bcl-2家族促凋亡基因、肿瘤坏死因子及其受体超家族基因,以及胱天蛋白酶募集结构域家族.表达下调的基因有12个,主要涉及Bcl-2家族抗凋亡基因、肿瘤坏死因子超家族及其受体相关因子基因,以及凋亡抑制蛋白家族.结论 氟达拉滨显著抑制MM细胞生长,诱导细胞凋亡;其作用机制涉及多个凋亡相关基因表达改变.     

RNA干扰生存素基因表达对肺腺癌细胞增殖及凋亡的影响

目的采用RNA干扰技术探讨生存素（survivin）对人肺腺癌细胞增殖及凋亡的影响及其可能的分子机制。方法采用脂质体介导将pGCsi—shsurvivin与pGCsi质粒转染人肺腺癌细胞株A549,经G418筛选获得稳定抑制survivin表达的肺腺癌细胞模型;Westernblot检测转染细胞survivin、p21、鼠双微体基因2（MDM2）蛋白表达;M,丌比色法检测阳性细胞克隆的增殖活性;流式细胞仪检测各组细胞凋亡。结果成功构建稳定抑制survivin表达的肺腺癌细胞模型。与对照组相比,反义组p21表达及细胞凋亡率显著增加,而MDM2表达及细胞增殖显著降低。结论下调A549细胞survivin表达后,细胞增殖降低而细胞凋亡增加,其作用机制与p21表达增加和MDM2降低有关。     

携带人血管内皮生长因子165慢病毒表达载体的构建与表达

背景:已有研究证实血管内皮生长因子在正常肝脏肝部分切除后余肝的再生过程中发挥着重要的作用,但关于其对肝硬化肝脏是否也有相同作用国内外鲜有报道。目的:构建携带人血管内皮生长因子165基因的慢病毒载体,体外转染BLR3A大鼠肝细胞并观察该细胞中人血管内皮生长因子165基因的表达。方法:采用DNA重组技术将人血管内皮生长因子165基因克隆入pLenti6/V5-D-TOPO慢病毒表达载体中,筛选出阳性克隆与慢病毒包装系统ViraPowerTM Packaging Mix共转染293T细胞产生病毒颗粒,通过实时定量-聚合酶链反应法测定病毒滴度;携带人血管内皮生长因子165基因的慢病毒载体体外转染BLR3A大鼠肝细胞72h后,利用反转录-聚合酶链反应及Western blot法检测细胞中人VEGF165mRNA及蛋白的表达。结果与结论:成功构建了表达人VEGF165基因的慢病毒载体pLenti6/V5-D-TOPO-VEGF165,测得病毒滴度为1.18×107VP/mL。重组慢病毒载体转染BLR3A大鼠肝细胞72h后,荧光蛋白表达率超过80%,反转录-聚合酶链反应及Western blot法测得转染组人血管内皮生长因子165mRNA及血管内皮生长因子165蛋白表达阳性。提示构建的携带人血管内皮生长因子165的慢病毒载体可有效转染BLR3A大鼠肝细胞,并促使该细胞表达人血管内皮生长因子165mRNA及蛋白。     

内毒素活化巨噬细胞早期和晚期基因表达的cDNA芯片分析

目的　利用 c DNA芯片技术分析内毒素活化的小鼠腹腔巨噬细胞早期和晚期基因表达 ,以更全面了解内毒素在感染、创伤反应中通过巨噬细胞介导的炎症和免疫反应。方法　以未刺激的和用 1mg/ L脂多糖 ( L PS)分别刺激 2 h(早期 )和 2 4 h(晚期 )的小鼠腹腔巨噬细胞制备 33P标记的 c DNA探针 ,并分别与小鼠 c DNA表达芯片 (含 1176个已知基因 )杂交。结果　巨噬细胞活化早期的 3倍差异表达基因为 6 9个 ,其中4 4个上调 ,2 5个下调 ;巨噬细胞活化晚期的 3倍差异表达基因中有 11个上调 ,2 6个下调 ;只有 8个基因同时出现于活化早期和晚期的差异表达基因中。许多转录因子、细胞内信号转导调节蛋白、炎症细胞因子和细胞凋亡相关基因的表达均发生了明显的调节变化。发现 BTB和 CNC同源 1( BACH1)、早期生长反应蛋白 2( EGR2 )、E4 7反应蛋白 1( EIP1)、Ngfi A结合蛋白 2 ( NAB2 )、成髓细胞白血病癌基因样蛋白 ( MYBL2 )、神经纤维癌蛋白基因 1( NF1)、睫状神经营养因子 ( CNTF)和 Sema4 A等一些以前未曾报道与 L PS诱导的巨噬细胞活化相关的基因。结论　采用 c DNA芯片技术了解内毒素诱导的巨噬细胞活化早期和晚期的综合基因表达信息 ,有助于更好地了解感染、创伤后细菌内毒素诱导的炎症免疫反应     

人血管内皮生长因子165基因转染兔骨髓间充质干细胞的蛋白表达

背景：骨髓间充质干细胞是最好的组织工程种子细胞来源,含有血管内皮生长因子165（vascular endothelial growth factor 165,VEGF165）不仅对血管再生和启动成骨修复有重要意义,其持续稳定的释放还能够提高新生骨的矿化程度,增强修复组织的力学性能。目的：观察hVEG F165基因转染的兔骨髓间充质干细胞分泌血管内皮生长因子的蛋白功能。方法：体外分离、培养兔骨髓间充质干细胞,纯化并鉴定兔骨髓间充质干细胞;免疫荧光法检测细胞表面标志;传代培养后的骨髓间充质干细胞以pcDNA3.1-VEGF165质粒和脂质体1：3比例的混合液转染,并分为3组：转染组应用pcDNA3.1-VEGF165转染细胞,空载体转染组应用pcDNA3.1-空载体转染,未转染组不处理。通过ELISA和Western-blot检测转染后细胞中外源性血管内皮生长因子的表达。结果与结论：转染组与其他两组比较,VEGF165蛋白含量显著增高,差异有显著性意义（P〈0.05）,但空载体转染组与未转染组之间差异无显著性意义（P〉0.05）,转染组不同时间点之间VEGF165蛋白含量差异均有显著性意义（P〈0.05）,hVEGF165基因转染的骨髓间充质干细胞能成功分泌VEGF165蛋白。提示采用基因转染技术可将hVEGF165基因转染到骨髓间充质干细胞中并可有效表达具有生物活性的VEGF165。