慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究

探讨乙型肝炎病毒（HBV）在慢性患者中存在状态，以HBV基因序列为依据。设计特异性多聚酶链反应（PCR）引物，自2例慢性患者体内扩增HBV全S基因片段，克隆入T载体。限制片段长度多态性（RFLP）法确定HBV的变异现象，DNA测序确定病毒的变异程度，质粒EcoRI酶切RFLP结果提示自2例患者血清中克隆出的29和28个阳性克隆中各有5种不同的长度带型，PCR产物XhoI酶切RFLP结果则表现为高度保守，测序结果发现HBV体内毒株碱基序高度一致，同一患者两株全S区序列测序结果表明DNA序列的同源性大于97%。本结果提示HBV慢性患者体内有HBV准种共存，且呈现出一定的优势克隆现象。     

慢性乙型肝炎患者病毒准种特性的初步研究

目的 探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者血清中乙型肝炎病毒(HBV)是否存在准种特性,并初步了解HBV准种的复杂性和遗传差异性。 方法用多聚酶链反应(PCR)技术从1例CHB患者血清中扩增HBV整个PreC/C基因区,然后用T载体克隆PCR产物,从转化阳性的克隆中随机选出34个克隆进行核酸序列分析。结果在34个测序克隆中发现存在28种不同的序列,序列间差异性介于0.2％～2.1％。变异位点分布于整个区域。所有序列nt1896位均无变异。 结论 在CHB患者体内HBV存在复杂的准种特性。     

乙型肝炎病毒前S2序列异质性的初步研究

目的 通过对乙型肝炎病毒（HBV）前S2基因序列的研究,证实HBV在慢性感染者中以准种状态存在,并对前S2序列异质性进行初步的阐明。方法 以中国株HBV基因序列为依据,设计特异性PCR引物,自51例慢性HBV感染患者血清中扩增HBV前S2基因序列,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术展示缺失突变,随机选择克隆测序,确定病毒的变异程度。结果 聚丙烯酰胺凝胶电泳结果发现,52.9%（27／51）患者血清中可获得2或3条扩增条带;测序结果发现前S2基因序列存在缺失突变高发区,氨基酸序列分析示缺失突变主要位于前S2编码蛋白的氨基端。结论 HBV前S2序列内有一缺失高变区,并在患者体内表现为多种变异形式;氨基端附近的变异可能影响中和抗体的识别作用。结果提示HBV慢性携带者体内有HBV准种共存。     

应用巢式聚合酶链反应-限制性片段长度多态技术检测乙型肝炎病毒阿德福韦耐药变异-rtN236T变异

目的 建立一种简便、快速、实用的乙型肝炎病毒（HBV）阿德福韦（ADV）耐药变异-rtN236T变异的快速检测方法。方法 根据GenBank收录的HBV基因全序设计巢式PCR引物，使野生株（rt236N）PCR产物中含有DraⅠ酶切位点（5’TITAAA3’），而变异株（rt236T）无此限制性酶切位点。选取4份应用ADV治疗1年以上出现HBV DNA反跳的临床耐药慢性乙型肝炎患者血清，经PCR扩增、DraⅠ酶切、3％琼脂糖凝胶电泳，进行限制性片段长度多态性（RFLP）分析。并选择经该方法鉴定的野生株及变异株各1例进行HBV RT区基因序列分析。结果 自4份血清标本中检测到1例rtN236T变异。所建立的ntPCR-RFLP方法灵敏度高，可以检测到10^3copies／L的HBV DNA；特异性强，其RFLP分析结果与DNA测序结果一致。结论 应用ntPCR-RFLP方法检测rtN236T变异具有灵敏、特异、简便的优点，适用于ADV耐药变异的临床监测工作。     

23株HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者病毒的全基因组分析

目的研究HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者HBV变异特点。方法PCR扩增并克隆HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者血清中HBV全基因组DNA,测序并进行基因结构分析。结果获得23株HBV全基因组DNA,它们均属于c或B基因型。与中国HBVB、C基因型参照序列相比,HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者来源的HBV在表面抗原、P蛋白、X蛋白的反式激活区及增强子II／核心启动子区发生了一些有意义的共有变异。结论HBV变异可能与HBeAg阳性慢性乙型肝炎的发生、发展有关。     

应用ntPCR-RFLP技术检测乙型肝炎病毒阿德福韦耐药变异

目的建立一种简便、快速、实用的乙型肝炎病毒（HBV）阿德福韦（ADV）耐药变异-rtN236T变异及rtA181V变异的快速检测方法。方法根据GenBank收录的HBV基因全序设计巢式PCR引物，使野生株rt236NPCR产物中含有DraⅠ酶切位点（5′-TTTAAA-3′），而变异株rt236T无此限制性酶切位点；使野生株rt181APCR产物中含有BlpⅠ酶切位点（5′-GCTNAGC-3′），而变异株rt181V无此限制性酶切位点。选取4份应用ADV治疗1年以上出现HBVDNA反跳的临床耐药慢性乙型肝炎患者血清，经PCR扩增、限制性内切酶酶切及凝胶电泳，进行限制性片段长度多态性（RFLP）分析。并选择经该方法鉴定的野生株及变异株各1例进行HBVRT区基因序列分析。结果建立的ntPCR-RFLP方法可以检测到10^2copies／L的HBVDNA；RFLP分析结果与DNA测序结果一致，4份血清标本中检测到1份rtN236T变异，2份rtA181V变异。结论应用ntPCR-RFLP方法检测HBV阿德福韦耐药变异具有灵敏、特异、简便的优点，适用于HBV耐药变异的监测。     

重型乙型肝炎患者肝组织和血清中乙型肝炎病毒前C区准种的比较

乙型肝炎病毒存在准种现象。为研究重型乙型肝炎患者血清和肝组织中乙型肝炎病毒（HBV）DNA前C区准种组成特点，本研究从3例重型乙型肝炎患者的血清和肝组织中提取HBV DNA，经巢式聚合酶链反应（PCR）扩增出HBV前C区，产物克隆后经单链构象多态性／异源双链分析（SSCP／HDA）筛选不同的克隆并测序，比较血清和肝组织中HBV前C区准种组成的异同。     

外周血中乙型肝炎病毒截短型囊膜蛋白基因的克隆化与序列分析

目的 研究乙型肝炎病毒（HBV）在慢性感染者体内存在的特殊状态。方法 采用特异性引物设计,以多聚酶链反应（PCR）自身患者血清中扩增全S基因片段,测序以明确变异的部位,并与既往已发表的HBV adr亚型进行序列比较。结果 经测序发现慢性HBV感染者体内存有变异病毒株编码的截短型表面抗原中蛋白基因,并存有HBsAg和多聚酶区缺陷型病毒基因。结论 在外周血中存在HBV截短型囊膜蛋白编码基因,可能与患者不良预后有关。     

ntPCR-RFLP检测HBV阿德福韦耐药变异-rtA181V变异

目的:建立一种简便、快速、实用的乙型肝炎病毒(HBV)阿德福韦(ADV)耐药变异- rtA181V变异的快速检测方法．方法:根据GenBank收录的HBV基因全序设计巢式PCR引物,使野生株(rt181 A)PCR产物中含有Blp Ⅰ酶切位点(5’GCTNAGC3’),而变异株(rt181V)无此限制性酶切位点．选取4份应用ADV治疗1 a以上出现HBV DNA反跳的临床耐药慢性乙型肝炎患者血清,经PCR扩增、Blp Ⅰ酶切、30 g／L琼脂糖凝胶电泳,进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析．并选择经该方法鉴定的野生株及变异株各一例进行 HBV RT区基因序列分析及对照质粒的构建．结果:自4份血清标本中检测到2例rtA181V变异．所建立的ntPCR—RFLP方法灵敏度高,可以检测到103 copies／L的HBV DNA;特异性强,其 RFLP分析结果与DNA测序结果一致．结论:应用ntPCR-RFLP方法检测rtA181V 变异具有灵敏、特异、简便的优点,适用于 ADV耐药变异的临床监测工作．     

重型乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒全基因克隆及测序

目的建立重型乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒（HBV）DNA克隆并测序，从全基因水平分析HBV基因变异与重型乙型肝炎发病的关系。方法10例重型乙型肝炎患者血清提取HBV DNA，聚合酶链反应（PCR）扩增HBV全基因。PCR产物构建到PUCm-T载体上，转化至大肠杆菌感受态DH-5α细胞，经酶切鉴定，获得含3．2Kb HBVDNA的重组克隆菌，全基因测序，分析各读码框核苷酸和氨基酸变化。结果4例成功构建HBV DNA克隆，并完成全基因测序。其中3例在前C区发生G1896A变异，产生一个终止密码子，导致HBeAg缺失；1例在C启动子区1762、1764双位点出现突变；有多处点突变及缺失变异分布于PreS2区及C区已知细胞毒T淋巴细胞、B淋巴细胞和T淋巴细胞的细胞表位。结论该法可用于临床研究HBV病毒基因结构与重型乙型肝炎发病的关系，并为进一步研究其HBV基因功能奠定基础。     

乙型肝炎病毒表面抗原一级结构多态性的初步研究

目的 研究慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒（HBV）表面抗原一级结构的多态性。方法 设计特异性引物，自7例慢性乙型肝炎患者血清中扩增S基因全长或全基因组片段，TA克隆法克隆到T载体中，随机选择克隆测序。结果 共20个克隆被测序。20个克隆全S蛋白的总一致率仅为32．0％，13株全长为401氨基酸残基的克隆氨基酸一致效率为82．5％。患者血清中发现2株克隆编码截短型表面抗原中蛋白，在前S1或前S2的免疫决定区或可能的肝细胞结合部位均发现缺失突变。结论 慢性乙肝患者体内存在HBV准种群，病毒编码的截短型表面抗原中蛋白可为HBV诱导原发性肝癌提供一种途径，应加强对HBsAg一级结构多态性的研究。     

乙型肝炎病毒核心蛋白突变体干扰HBV包装的实验研究

目的：构建乙型肝炎病毒（HBV）核心蛋白突变体基因的真核表达载体，转染HepG2细胞，观察其表达及干扰HBV颗粒包装的显性负调节作用。方法：采用PCR从质粒pHBVadrl-A1中扩增HBVadr1-A1中扩增HBV C基因和S基因，分别克隆到pGEM-T载体上，构建成pGEM-T-C和pGEM-T-S，进而构建成pGEM-T-CS载体，用HindⅢ切出克隆基因片段与pcDNA3.1连接，经PCR鉴定后构建成真核表达载体pcDNA3.1^ -CS,DNA测序显示基因融合正确，表达载体转染HepG2细胞，经G418筛选得到高拷贝转化子，逆转录－聚合酶链反应（RT－PCR）检测重组蛋白体外表达，用HBV阳性血清感染HepG2细胞，72h后提提细胞内HBV DNA，斑点杂交法分析各组DNA，结果：核心蛋白突变体在HepG2细胞内得到表达，且表达了该重组蛋白的HepG2细胞内HBV DNA量不同程度地低于对照组，表明重组蛋白具有抗HBV包装的DN突变体作用，结论：HBV核心蛋白与表面蛋白融合基因的真核表达载体pcDNA3.1-CS能够体外表达核心蛋白突变体，该突变体具有干扰HBV颗粒包装的显性负调节作用。     

Mago nashi:一个日本血吸虫性别决定基因的发现与鉴定

目的　运用免疫学方法筛选日本血吸虫 (中国大陆株 )童虫cDNA文库 ,寻找血吸虫新基因 ,并克隆和鉴定一个日本血吸虫决定性别的Magonashi样蛋白基因。方法　用混合的血吸虫感染者血清免疫学筛选日本血吸虫童虫cDNA文库 ,随机挑取阳性重组克隆进行测序 ,以获得血吸虫基因 ,并通过BLAST程序进行比较及同源性分析 ,根据分析结果设计合成引物 ,用PCR法扩增出日本血吸虫Magonashi样蛋白基因 (SiM)编码序列 ,将其克隆入pGEM T载体和 pBKCMV载体 ,用双酶切、以质粒为模板进行PCR扩增和测序进行鉴定。结果　本研究共挑取 7个阳性克隆 ,通过测序获得了 5个有表达序列标签(ExpressedSequenceTag .EST)价值的序列 ,并进行了同源性分析 ;用PCR法扩增出大小为 4 4 1bpSjM开放阅读框 ,重组质粒pGEM SjM和 pBKCMV SjM经双酶切均可获得一条为PCR产物一致的DNA片段。 结论　本实验获得了 5个有EST价值的序列 ,并成功地克隆了其中SjM编码基因。     

Expression and clinical significance of pre-S1 and S2 proteins of HBV in sera of patients with chronic liver disease

To assess the significance of pre-S proteins expression during chronic hepatitis B virus (HBV) infection, we developed a sensitive labeled avidin biotin ELISA to detect pre-S1 and pre-S2 proteins. In serum specimens from 80 patients with chronic liver disease, the frequency of pre-S1 and S2 proteins was 53.7% and 47.5%, respectively. Furthermore, it reached 87.8% and 77.6%, respectively, in cases with chronic HBV infection, indicating that pre-S proteins are usually expressed in sera with chronic HBV infection. We found that the expression of pre-S proteins is closely associated with HBV replicating markers, such as HBV DNA, HBcAg and HBeAg, in sera of patients with chronic HBV infection. Both pre-S1 and S2 proteins were often concurrently expressed in liver and serum with chronic HBV infection. However, the frequency was slightly higher in liver than in serum, suggesting that it may be clinically valuable to detect pre-S proteins in serum and liver simultaneously to determine the status of HBV infection. Our results also indicated that pre-S proteins expression in serum can serve as markers of HBV infection, but cannot be used to estimate the severity and activity of hepatic pathology.     

慢性乙型肝炎免疫清除期患者HBsAg基因多态性

目的 研究慢性乙型肝炎免疫清除期患者乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)基因多态性.方法 设计特异性引物,自10例慢性乙型肝炎免疫清除期患者血清中扩增S基因片段,TA克隆法克隆到T载体中,随机选择克隆测序.结果 共20个克隆被测序,20个克隆S蛋白发现12个不同位点的32次变异.主要集中在T细胞表位,B细胞表位及a决定簇.结论 慢性乙型肝炎免疫清除期患者存在HBsAg变异,可能仍然存在HBsAg免疫耐受.     

Detection of antibodies against pre-S1 proteins in sera of patients with hepatitis B virus (HBV) infection

Pre-S1 (large S) proteins are components of the envelope of HBV. The presence of pre-S1 proteins is correlated with viral replication. To test sera of patients with HBV infection for the presence of antibodies against pre-S1 proteins (anti-pre-S1), an E. coli extract containing a pre-S fusion protein covering the greater part of the pre-S1 region was subjected to Western blotting and probed with sera of patients. Anti-pre-S1 was present in the sera of all 4 patients with acute self-limited HBV infection and in the sera of 3 patients with a fulminant course. The antibodies could not be detected in the sera of 6 patients with acute HBV infection entering chronicity, in the sera from 10 HBsAg carriers or in the sera of 25 patients with chronic liver disease, positive for HBsAg and antibodies to hepatitis Delta virus. In an additional study, anti-pre-S1 could not be found in 11 sera from 12 patients with previous HBV infection, positive for anti-HBs and anti-HBc. Antibodies to pre-S1 proteins appear at the early stage of acute resolving HBV infection and seem to play a role in the elimination of the virus. The antibodies are absent in the sera of patients with acute HBV infection entering a chronic course and in the sera of chronic HBsAg-carriers.     

HBV“相似株”与“优势株”的混杂可能为慢性重型乙型肝炎的一个特点

目的了解慢性重型乙型病毒性肝炎患者体内HBV的状况。方法选3例慢性重型乙型病毒性肝炎患者,以HBV前S基因为研究区域,采用半巢式PCR法,从此3例患者中血清中扩增出HBV前S基因,并分别将其克隆于噬菌体M13mp18、M13mp19载体中,每例患者随机筛选10个阳性克隆,进行序列分析及遗传距离分析。结果此3例病人存在着“相似株”与“优势株”的混杂及HBVadr与HPBadrwl两种亚型的混合感染。优势株内可能存在引起机体免疫性增高的区域。结论 HBV“相似株”与“优势株”的混杂可能为慢性重型乙型肝炎的一个特点。     

YMDD variants of HBV DNA polymerase gene： Rapid detection and clinicopathological analysis with long-term lamivudine therapy after liver transplantation

AIM: To look for a rapid low-cost technique for the detection of HBV variants. METHODS: Two patients who underwent orthotopic liver transplantation (OLT) for HBV infection were treated with lamivudine (100 mg daily) and HBV infection recurred in the grafted livers. The patients were monitored intensively for liver enzymes, hepatitis B surface antigen (HBsAg) and HBV DNA in serum. Liver biopsy was performed regularly. HBV DNA in a conserved polymerase domain (the YMDD locus) was amplified from serum of each patient by PCR and sequenced. HBV genotypes were analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the PCR products generated from a fragment of the polymerase gene. RESULTS: YMDD wild-type HBV was detected in one patient by PCR-RFLP and DNA sequencing 19 mo after OLT, and YIDD mutant-type HBV in the other patient, 16 mo after OLT. CONCLUSION: PCR-RFLP assay is an accurate and simple method for genotyping lamivudine-resistant HBV variants.