肿瘤抗原SCCAg B细胞抗原表位及HLA I类限制性CTL表位的生物信息学分析

目的预测鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCCAg)的B细胞抗原表位及HLA I类限制性细胞毒性T细胞表位。方法获得SCCAg的三维结构后,采用生物信息学方法预测SCCAg蛋白存在的B细胞表位;而后,采用Net CTL、Prot Param等软件方法预测SCCAg中可能存在的HLA I类限制性CTL表位。结果 SCCAg蛋白中包含10个线性B细胞表位和5个构象B细胞表位;结合与HLA I类分子结合力、蛋白酶体切割效率和TAP转运效率,经Net CTL预测发现,针对不同的HLA I类分子,肿瘤抗原SCCAg蛋白中存在多个HLA I类分子的限制性CTL表位。结论综合运用多种方法预测了肿瘤抗原SCCAg蛋白中存在的B细胞抗原表位和HLA I限制性的CTL表位,为下一步针对SCCAg蛋白开展靶向免疫治疗提供了基础。     

小麦过敏原Tri a Bd 27k蛋白抗原表位预测及三维结构模拟

目的 通过生物信息学方法了解小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构特征,为小麦变态反应性疾病的诊断和预防提供依据.方法 在Uniprot数据库中获得Tri a Bd 27k蛋白序列,通过DNAStar预测B细胞抗原表位,NetMHCⅡ和Syfpeithi预测T细胞抗原表位;使用Swiss-Model软件预测其三维结构并用Ramachandran进行稳定性评估.在Uniport 数据库搜索Tria Bd 27k的同源蛋白,应用Clustalx 1.83及Mega 3.1构建同源进化树.结果 小麦过敏原Tri a Bd 27k的B/T细胞共同抗原表位优势区域为34-42、102-117,Ramachandran软件预测结果显示小麦Tri a Bd 27k蛋白的空间构象稳定.结论 通过对小麦过敏原Tria Bd 27k进行生物信息学分析获得了该过敏原优势区域及三维结构模型,为进一步了解和掌握小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构功能打下理论基础.     

汉坦病毒G2糖蛋白多表位抗原基因的设计与构建

目的构建汉坦病毒SEO型代表株L99G2蛋白的多表位抗原基因(mea)。方法通过生物信息学软件对L99株G2蛋白氨基酸序列进行综合分析及预测,优选B细胞表位,引入GPG间隔序列串联表位,设计mea,然后应用重叠PCR法构建mea,并将其克隆到原核表达质粒pET32a(+)。结果优选出5个B细胞表位,设计并成功构建mea,PCR定向克隆获得pET32a-mea重组表达质粒。结论首次构建了汉坦病毒G2糖蛋白mea及其原核表达系统E.coliBL21/pET32a-mea,为其表达及免疫学应用奠定基础。     

肠道病毒71型衣壳蛋白的抗原表位及其单克隆抗体

肠道病毒71(EV71)是手足口病的主要致病原之一,可引发大部分重症病例和死亡病例,其衣壳蛋白VP1～VP4作为免疫原包含了能够诱导体液免疫(产生抗体)和细胞免疫的抗原表位.迄今为止已有多个免疫显性的线性或构象性B细胞抗原表位被确定,与之相关的单克隆抗体在EV71感染的早期诊断和单克隆抗体治疗方面也已显示一定程度的应用前景,同时也有少数T细胞抗原表位被确定.本文对上述研究情况进行综述.     

旋毛虫53kDa ES抗原蛋白二级结构及B细胞表位预测

目的　分析旋毛虫 5 3kDaES抗原蛋白二级结构及B细胞表位。方法　应用生物信息分析软件DNASTAR和Anthep ro5 .0 ,按照Kyte -Doolittle氨基酸亲水性标准对旋毛虫 5 3kDaES抗原的亲水性基序、二级结构及B细胞表位进行分析预测。结果　在旋毛虫 5 3kDaES抗原蛋白中 ,第 1 9- 2 5、4 0 - 5 1、6 1 - 6 7、99- 1 0 5、1 1 1 - 1 1 9、1 2 6 - 1 34、1 37- 1 5 2、1 79- 1 85、1 91 - 2 0 0、2 1 9- 2 38、2 6 1 - 2 6 7、2 81 - 2 95、31 2 - 32 3、331 - 343、36 7- 372、2 90 - 393位氨基酸残基具有较强的抗原性 ,第 1 9- 2 5、4 0 - 5 1、6 1 -6 7、99- 1 0 5、1 1 1 - 1 1 9、1 2 6 - 1 34、1 37- 1 5 2、1 79- 1 85、1 91 - 2 0 0、2 1 9- 2 38、2 6 1 - 2 6 7、2 81 - 2 95、31 2 - 32 3、331 - 343、36 7- 372、390- 393位氨基酸残基可能是B细胞的表位。结论　对旋毛虫 5 3kDaES抗原蛋白和B细胞表位的分析为研制旋毛虫病新的诊断抗原奠定了基础     

卡氏肺孢子虫MSG抗原片段细胞表位的预测

[目的]预测卡氏肺孢子虫主要表面抗原(MSG)片段的B细胞和T细胞抗原表位. [方法]运用Sig-nalp3.0、EMBOSS等网络服务器推测卡氏肺孢子虫MSG抗原片段的B细胞和T细胞抗原表位,分析预测结果. [结果]MSG抗原片段存在3个潜在的B细胞抗原表位及6个潜在的T细胞抗原表位.B细胞抗原表位在氨基酸序列的位置为69-79、96-101、133-140aa 3个区域内或其附近;T细胞抗原表位在氨基酸残基的位置为7-22、28-43、20-35、40-55、53-68、86-101aa. [结论]MSG抗原表位的预测为有目的的克隆基因片段,研究高效的表位疫苗奠定基础.     

汉坦病毒核衣壳蛋白抗原表位的研究进展

汉坦病毒核衣壳蛋白具有很强的抗原性和免疫原性,其氨基端约100个氨基酸大多具有亲水性,且能被患者和免疫动物的血清及许多抗汉坦病毒的单克隆抗体所识别,是汉坦病毒核衣壳蛋白的主要抗原表位区。本文就近年来这一方面的研究作一简要综述。     

哺乳动物卵透明带蛋白B细胞表位的研究进展

研制组合靶抗原B细胞表位和外源或自身“广谱性”T细胞表位的嵌合肽疫苗,正成为免疫学和疫苗学界新的分支领域。很清楚,构成其基础的是越来越多靶抗原B细胞表位的被鉴别。以小鼠、猪和人的卵透明带为重点,概述它们的B细胞表位研究进展,并兼顾介绍鉴定这些表位所用的主要方法和策略。     

哺乳动物卵透明带蛋白B细胞表位的研究进展

研制组合靶抗原B细胞表位和外源或自身"广谱性"T细胞表位的嵌合肽疫苗,正成为免疫学和疫苗学界新的分支领域.很清楚,构成其基础的是越来越多靶抗原B细胞表位的被鉴别.以小鼠、猪和人的卵透明带为重点,概述它们的B细胞表位研究进展,并兼顾介绍鉴定这些表位所用的主要方法和策略.     

哺乳动物卵透明带蛋白B细胞表位的研究进展

研制组合靶抗原B细胞表位和外源或自身“广谱性”T细胞表位的嵌合肽疫苗，正成为免疫学和疫苗学界新的分支领域。很清楚，构成其基础的是越来越多靶抗原B细胞表位的被鉴别。以小鼠、猪和人的卵透明带为重点，概述它们的B细胞表位研究进展，并兼顾介绍鉴定这些表位所用的主要方法和策略。     

淮南市不同生境中主要尘螨变应原的基因检测

目的检测3种不同生境中尘螨4种变应原。方法于2009年6—8月在淮南地区仓储、居室及公共环境采集样本各40份,提取样本总RNA,RT-PCR合成cDNA,应用PCR特异性扩增Der f 1、Der f 2、Der p 1、Der p 2,并对不同生境中变应原检测结果进行统计学分析。结果从尘螨基因组中特异扩增出大小约646、4559、23、408 bp的基因片段。仓储环境和居室环境中尘螨变应原的检测阳性率均高于公共环境(P0.05),仓储环境中粉尘螨变应原阳性率较高(Der f 1为65.0%,Der f 2为62.5%),居室环境中屋尘螨变应原阳性率较高(Der p 1为80.0%,Der p 2为62.5%)。结论不同生境中不同尘螨变应原具有较大差异,可能与温湿度差异及尘螨的食性、习性有关。对尘螨基因组进行RT-PCR及PCR检测是简便有效的尘螨变应原检测方法。     

Inactivation of Dust Mites,Dust Mite Allergen,and Mold from Carpet

Carpet is known to be a reservoir for biological contaminants, such as dust mites, dust mite allergen, and mold, if it is not kept clean. The accumulation of these contaminants in carpet might trigger allergies or asthma symptoms in both children and adults. The purpose of this study is to compare methods for removal of dust mites, dust mite allergens, and mold from carpet. Carpets were artificially worn to simulate 1 to 2 years of wear in a four-person household. The worn carpets were inoculated together with a common indoor mold (Cladosporium species) and house dust mites and incubated for 6 weeks to allow time for dust mite growth on the carpet. The carpets were randomly assigned to one of the four treatment groups. Available treatment regimens for controlling carpet contaminants were evaluated through a literature review and experimentation. Four moderately low-hazard, nondestructive methods were selected as treatments: vacuuming, steam-vapor, Neem oil (a natural tree extract), and benzalkonium chloride (a quaternary ammonium compound). Steam vapor treatment demonstrated the greatest dust mite population reduction (p < 0.05) when compared to other methods. The two physical methods, steam vapor and vacuuming, have no statistically significant efficacy in inactivating dust mite allergens (p = 0.084), but have higher efficacy when compared to the chemical method on dust mite allergens (p = 0.002). There is no statistically significant difference in the efficacy for reducing mold in carpet (p > 0.05) for both physical and chemical methods. The steam-vapor treatment effectively killed dust mites and denatured dust mite allergen in the laboratory environment.     

血清尘螨特异性IgE检测在小儿哮喘防治中的应用研究

目的：探讨血清尘螨特异性IgE检测在小儿哮喘诊断与防治中的应用。方法：选取本院在2009年3月-2012年10月收治的52例小儿哮喘患儿为观察组,其中〈3岁者11例,4-6岁者18例,7-12岁者23例;选取正常儿童44例作为对照组,其中〈3岁者8例,4-6岁者16例,7-12岁者20例。两组儿童均进行血清尘螨特异性IgE检测,比较其结果。结果：观察组患儿的血清尘螨特异性IgE浓度为（152.78±48.95）U/mL;对照组儿童的血清尘螨特异性IgE浓度为（25.62±6.49）U/mL,观察组患儿的血清尘螨特异性IgE浓度明显高于对照组,差异有统计学意义（P〈0.01）。结论：小儿哮喘患儿的血清尘螨特异性IgE阳性率很高,尤其7-12岁患儿阳性率最高,所以尘螨过敏原是诱发小儿哮喘的重要因素,通过血清尘螨特异性IgE检查有助于发现尘螨过敏原,对防治由尘螨过敏原诱发小儿哮喘的重要手段,值得临床推广应用。     

尘螨变应原Der p2基因克隆及原核表达

目的 原核表达尘螨主要变应原DerP 2。方法分离屋尘螨总RNA，根据GenBank已公布的DerP2核酸序列设计引物用RT-PcR扩增DerP2编码基因，克隆至pMD19-T载体、亚克隆至表达载体pET28a（＋），将表达质粒转化至Escherichia coliBL21（DE3）并用IFFG诱导表达，并对表达产物进行免疫印迹鉴定。结果成功构建了表达质粒pET28a（＋）-DerP2，SDS-PAGE和Western blotting显示原核表达获得成功。序列分析表明所获得的DerP2编码基因与参考序列同源性达99．54％，推测其编码氨基酸130个，相对分子质量约为14348．5。结论尘螨变应原DerP2原核表达获得成功，为进一步生产重组变应原奠定了基础。     

工作场所及居室内尘螨变应原及脂多糖调查

目的 探讨特殊职业人群工作场所对其居室内尘螨变应原及脂多糖含量的影响.方法 2005年6月选取面粉加工作业(尘螨变应原暴露组,设为A组)及皮革加工作业人员(脂多糖暴露组,设为B组)各15名,收集其工作环境的浮尘、落尘及居室内地板尘、床铺尘,另选取某校教职工15名为对照组(设为C组),同样取上述尘样,共计360份.ELISA法检测样品中尘螨变应原Der p1、Der f1含量,鲎试剂动态比色法检测样品中脂多糖含量.结果 A组变应原含量较高,其浮尘变应原含量与床铺尘、地板尘具有相关性(rs=0.661,P＜0.01;rs=0.534,P＜0.05);B组脂多糖含量较高,浮尘脂多糖含量与床铺尘、地板尘具有相关性(rs=0.689,P＜0.01;rs=0.531,P＜0.05).结论 工作环境中高水平的变应原及脂多糖含量是导致居室内相应污染物升高的重要原因.     

某热电厂污染治理前后煤尘浓度的比较分析

对某热电厂煤尘污染治理前后作业场所空气中煤尘浓度进行了比较分析。结果表明,治理前38个煤尘作业点的合格率为42．1％,治理后35个煤尘作业点的合格率为85．7％。说明采取综合防尘措施,搞好企业的职业卫生管理,对作业人员进行职业卫生培训是做好该厂防尘工作的重要措施。     

Dust weight and asthma prevalence in the National Survey of Lead and Allergens in Housing (NSLAH)

BACKGROUND: Settled dust has been used in studies to assess exposures to allergens and other biologically active components, but it has not been considered in the aggregate in relation to respiratory health outcomes in the general population. OBJECTIVE: We addressed whether total house dust weight, an index of total dust exposure, was associated with respiratory health outcomes in the National Survey of Lead and Allergens in Housing (1998-1999) (NSLAH). METHODS: NSLAH was a cross-sectional survey designed to represent permanently occupied housing units in the United States. In each household, a questionnaire was administered and settled dust was vacuumed from five locations. Linear regression models were used to identify predictors of dust weight; logistic regression models were used to examine the relationship between dust weight and asthma and wheeze. RESULTS: Dust weight samples were available for 829 households, and survey information was available for 2,456 participants (children and adults). Lower income, older homes, household pets, having a smoker in the house, and less frequent cleaning predicted higher dust weight levels in U.S. households. Higher levels of dust weight were associated with greater odds of current asthma and wheeze. The strongest associations were seen for wheeze [adjusted odds ratio (OR) = 1.99; 95% confidence interval (CI), 1.21-3.28 for bedroom bed dust; OR = 2.81; 95% CI, 1.52-5.21 for upholstery dust). These associations persisted when adjusting for allergen and endotoxin exposures. CONCLUSIONS: Dust weight, an index of total dust exposure in the home, may contribute to respiratory outcomes independently of the exposure to specific components.     

叶腊石矿与雕刻粉尘危害的比较研究

本文分析了叶腊石矿尘与雕刻尘主要化学成份和接尘工人尘肺患病危险性,并进行预期尘肺发病率预测和容许浓度推算。结果表明;叶腊石尘属游离SiO_2含量在10％以上的混合矿物尘,但矿尘中游离SiO_2含量(=33.24％)明显高于雕刻尘(=14.48％)Al含量则相反,金属元素含量差异较大。叶腊石尘尘肺现患病率=33.63％,而接触矿尘工人尘肺患病危险性明显大于雕刻尘接触者,且发病工龄短,病变程度重,进展速度快。建议:叶腊石矿尘的MAC值为2mg/m~3,叶腊石雕刻尘为4mg/m~3。     

三种不同粉尘采样器及采样方法测定结果的比较

为了探讨中国、美国、德国3种不同粉尘采样器采样测定工作现场粉尘浓度的差异及其程度,分析其测定结果,为我国粉尘采样器和采样测定方法的改进提供依据。在某铁矿井下掘进、地面选矿工作地点,以3个国家不同类型粉尘采样器按照各自的粉尘采样方法平行采样,检测工作场所空气中总粉尘和呼吸性粉尘的浓度,比较其测定结果。结果显示,呼吸性粉尘不同采样测定结果的相关性:中国与美国,r=0.81(P<0.05),中国与德国,r=0.63(P>0.05),美国与德国,r=0.82(P>0.05)。总尘的相关性:中国与美国,r=0.62(P>0.05),中国与德国,r=0.24(P>0.05),美国与德国,r=0.79(P>0.05)。呼吸性粉尘和总尘浓度测定值分别在不同粉尘采样方法之间比较,差异没有显著性(P>0.05)。总尘测定结果自然对数几何标准差(GSD):美国3.61,德国2.70,中国3.58。呼吸性粉尘测定结果GSD值:美国3.2,德国3.36,中国3.52。提示,我国的采样器对总尘和呼吸性粉尘的测定值与美国和德国的采样器在本现场研究中比较,差异没有显著性,且有一定的相关,还需要增加样本继续比较研究。     

粉尘螨变应原第1组分原核表达质粒pCold-TF-Der f 1构建及鉴定

目的建立粉尘螨变应原第1组分全长基因原核表达质粒pColdTFDer f 1。方法以质粒pET-28a(+)Der f 1为模板扩增目的基因Der f 1,克隆至pColdTF DNA载体,转化大肠埃希菌BL21,IPTG诱导表达并用SDSPAGE(十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)和蛋白印迹法(Western blotting,WB)验证产物。结果 PCR扩增获得Der f 1编码全长基因,成功构建表达质粒pColdTFDer f 1,SDSPAGE和WB验证表明该质粒在大肠埃希菌中正常表达,且基本为可溶性表达。结论成功建立尘螨变应原原核表达质粒pColdTFDer f 1,并成功实现其原核表达,为进一步生产基因工程变应原提供基础依据。