两种常见缺失型α-地中海贫血快速检测技术的研究

目的：建立简便快速准确可推广使用的检测α－地中海贫血（α-Thal)右侧失型（－α^3.7)和左侧缺失型（－α^4.2)的聚合酶链反应（PCR）方法。方法：自行研究设计两组引物。优化PCR反应条件。PCR反应产物用1％琼脂糖凝胶电泳分离,溴化乙啶染色,UVP凝胶成像仪下观察记录电泳图谱。结果：运用引物A′、B′、C3进行PCR,出现1700bp扩增带表示－α^3.7,出现1900bp扩增带表示α－珠蛋白基因正常或为野生型。二条扩增带同时出现表示是－α^3.7缺失杂合子。无任何扩增带表示是是东南亚型缺失纯合子。运用引物G′、E、F′进行PCR,根据出现1580bp扩增带和1180bp扩增带可诊断为－α^4.2,还可区分杂合子与纯合子。结论：本研究设计的两组引物及优化的PCR条件,可以简便准确地检测出α－Thal标本中有无－α^4.2和－α^3.7。     

聚合酶链反应检测真菌感染的临床评价

用聚合酶链反应 (PCR)检测真菌 ,已有较多报道[1 2 ] ,我们也曾报道过初步研究[3 ] 。为给临床提供快速、灵敏、非创伤的真菌感染诊断方法 ,本文就采用真菌通用引物PCR检测真菌DNA的灵敏度、特异性、可检测真菌范围及临床适用性作进一步评价。1　材料和方法1 1　引物　真菌 18S亚基rRNA多拷贝基因的保守序列通用引物序列为 5′ ATTGGAGGGCAAGTCTGGTG 3′和 5′ CCGATCCCTAGTCGGCATAG 3′ ,扩增产物大小因真菌病原体而异 ,为 4 82～ 5 0 3bp[4] ,白色念珠菌为 4 90bp。由北京赛百盛生物工程公司合成。1 2　临床无菌性…     

核酸检测技术在襄阳地区献血筛查中的应用分析

目的 评估核酸检测技术(NAT)应用于献血者血液筛查的必要性和可行性.方法 采用上海浩源生物科技公司乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、人类免疫缺陷病毒(1型)核酸检测试剂盒(PCR-荧光法),对2011年8月～2012年5月本血站ELISA检测合格的献血者36 678人份血液标本进行HBV DNA、HCV RNA和HIV RNA-1项联合检测,先对8人份混样标本进行检测,如为非反应性,则该合并检测池中的标本均为非反应性,如合并检测呈反应性,再进行拆分检测.本试剂盒合并和拆分检测使用相同的复合PCR扩增系统,单管实时荧光PCR检测3种病原体,通过将探针标记不同的荧光信号分辨HBV、HCV、HIV-1反应性病原体种类.结果 对36 678人份ELISA法检测抗-HIV、抗-HCV、HBsAg均为阴性的合格血液标本共检测出HBV DNA阳性57例,阳性率为0.16％;未检测出HCV RNA和HIV RNA.结论 NAT能在ELISA检测阴性的献血者血液标本中筛查到HBV、HCV和HIV-1反应性的标本,常规开展NAT能进一步提高血液及输血安全.     

实时荧光定量RT-PCR检测TGF-β1 mRNA表达

利用荧光TaqMan技术 (5′核酸外切酶活性 )和一种可以实时检测荧光信号的仪器 (ABIPrism 770 0序列检测系统 ) ,在PCR反应完全封闭的情况下可实时检测PCR扩增的动力学变化 ,能够对标本扩增过程中的起始拷贝数快速、准确地定量 ,极大地克服了原有PCR技术存在的不足 ,已逐步成为PCR更新换代的新技术[1 ,2 ] 。目前常规检测 β1 转化生长因子(TGF β1 )表达多采用竞争RT PCR及内源性参比基因RT PCR ,它们都属于PCR终点法检测 ,很难对起始模板数准确定量。我们利用实时荧光定量RT PCR技术建立了检测TGF β1 mRNA表达的方法。…     

慢性乙型肝炎患者HGV感染情况分析

为了解慢乙肝患者 HGV感染率及其对病变程度和 HBV复制合成的影响 ,采用逆转录 -套式 -聚合酶链反应 ( RT- nested- PCR)检测慢乙肝患者血清中HGV RNA,并与乙肝病毒血清标志及 ALT对比分析。一、病例　临床确诊的慢乙肝患者 68例。平均38.6岁。其中慢肝轻度 2 6例 ,中度 2 2例 ,重度 2 0例。二、方法　乙肝五项血清标志检测采用上海科华公司 ELISA试剂盒 ;HBV DNA采用 PCR法 ,北京医科大学肝病研究所试剂盒 ,ALT测定采用上海科华公司试剂盒 ,HGV RNA检测采用 RT- nested-PCR法 ,扩增 HGV基因组 NS3区 83bp片段 ,北京…     

大理地区志贺菌的血清型分布及多重PCR检测技术的应用

目的 探讨大理地区志贺菌的血清型分布以及多重PCR技术在志贺菌检测中的应用.方法 用常规分离培养、生化鉴定和血清学分型法对腹泻患者粪标本进行检测,分离到的标本再用多重PCR法对志贺菌的毒力基因shetA、shetB、ial和ipaH进行扩增检测.结果 通过常规培养和生化反应鉴定,得到68株志贺菌.血清学鉴定显示福氏志贺菌41株,宋内志贺菌25株,鲍氏志贺菌2株.通过多重PCR扩增后68株志贺菌均在423 bp(ipaH)处出现了条带,检出率为100%,其余在147 bp(shetB)、309 bp(shetA)处以及320 bp(ial)处均出现了至少一个条带,与常规鉴定法的符合率达100%.5份直接用阳性粪便标本提取DNA为模板进行多重PCR扩增后,也得到了同样的结果.结论 大理地区细菌性痢疾患者感染以福氏志贺菌为主,多重PCR技术可用于志贺菌的快速检测和流行病学调查.     

血清唾液尿液HCV RNA定量检测与分析

丙型肝炎病毒 (HCV)感染常引起慢性活动性肝炎并导致肝纤维化 ,在患病早期使用 IFNa有一定疗效。过去丙型肝炎的检测主要靠转氨酶和 Anti- HCV的测定 ,而血清中 HCV RNA才是病毒复制和肝炎进程的更确切的标准。因此定量 PCR检测 HCV RNA为 HCV感染及其疗效的判定提供了一项重要指标。本室采用定量 PCR法 ,对 12 0例患者同时检测血清唾液尿液中 HCV RNA的含量报道如下。1　对象和方法1.1　对象　本院住院患者。1.2　定量 PCR试剂盒　深圳匹基生物技术开发有限公司生产的 Fluorogenic PCR Kit。1.3　仪器　美国 BIO- RAD…     

3种临床检验方法检测细菌性阴道病的结果比较

目的研究3种临床检验方法在细菌性阴道病诊断中的应用价值。方法选取2018年1-6月该单位妇女病普查对象共1 635例,进行阴道分泌物显微镜Amsel′s标准法及两种细菌性阴道病快速检测试剂盒检测,对结果进行分析。结果两种细菌性阴道病快速检测试剂盒检出率略高于Amsel′s标准法,但差异均无统计学意义(P0.05)。结论诊断细菌性阴道病时可采用常规镜检(Amsel′s标准法)联合快速检测试剂盒进行检测。     

113份抗-HCV(+)和200份抗-HCV(-)献血者血浆中HCV RNA检测结果

<正>目前,我国主要通过采用酶联免疫法(ELIAS)检测献血者抗丙型肝炎病毒抗体(抗-HCV)。笔者对1994年113份(ELISA)抗-HCV(+)和200份(ELISA)抗-HCV(一)血样,采用套式聚合酶链反应(PCR)技术检测丙型肝炎病毒核糖核酸(HCV RNA),并与ELIAS检测HC的意义进行了比较。     

巢式聚合酶链式反应检测布鲁氏菌核酸DNA方法的建立

目的建立一种具有灵敏性高,特异性强的巢式聚合酶链式反应(PCR)方法检测血液标本中布鲁氏菌核酸DNA。方法使用细菌基因组提取试剂盒提取纯菌核酸DNA;使用血液等组织基因组核酸DNA提取试剂盒提取血液标本核酸DNA,对提取的核酸DNA先行常规PCR预扩增,以扩增的PCR产物为模板进行荧光定量PCR第二次扩增(即巢式PCR)。对纯菌提取的核酸DNA进行灵敏度和和特异性测试,构建巢式PCR的Ct值与核酸DNA拷贝数之关系曲线;检测临床血液标本核酸DNA,同时比较常规两种PCR方法检测结果。结果常规PCR检测的灵敏度为512个核酸DNA拷贝数;巢氏PCR检测有效范围为921.6 ng/μl^6.8 fg/μl,对应的Ct值为12.04~37.50,其指数关系为:y=(e-0.695x)×1012;R2=0.9986,巢式PCR扩增效率为2.28×109倍,检测限为2个布鲁氏核酸DNA拷贝数。巢式PCR的灵敏度为91.67%,特异度为93.10%,阳性预测值为91.67%,阴性预测值为93.10%。对一起羊养殖场采集的25份血液标本应用巢式PCR方法检测,结果阳性率为92.00%(23/25);27份健康人群血液标本没有检测出(无Ct值)。结论巢式PCR具有较好的灵敏性和特异性,特别适合于血液标本布鲁氏菌核酸DNA的检测。     

丙型肝炎病毒检测方法的应用评价

目的评价酶联免疫吸附法（ELISA法）检测丙型肝炎病毒核心抗原（HCV—cAg）和抗体（HCV—Ab）以及反转录多聚酶链反应（RT—PCR）检测丙肝RNA,了解三种方法对丙肝病毒检测的优点和缺点。方法采用HCV—cAgELISA试剂盒．HCV—AbELISA试剂盒和丙肝病毒PCR检测试剂盒对来自临床的225例样本进行HCV—cAg、HCV—Ab和HCV—RNA检测。结果225例样本中检出抗HCV阳性28例,其中HCV—cAg阳性14例,RT—PCR阳性16例,剩余的197例抗HCV阴性标本中,检出HCV—cAg阳性3例,其中RT—PCR阳性2例。结论RT—PCR技术检测HCV—RNA是判断丙肝感染的最有效方法。HCV核心抗原检出时间早于抗体,联合运用抗HCV和HCV—cAg或者抗HCV和HCV—RNA检测HCV,能有效降低HCV—Ab检测带来的漏检风险。     

复合PCR系统检测间日疟原虫的应用研究

应用一种简易、快速的复合 PCR扩增系统检测间日疟原虫 (P.v)及混合感染。方法 :以间日疟原虫和恶性疟原虫 (P.f)小亚单位核糖体核糖核酸基因 (SSUr DNA)特定片段为靶基因 ,设计并合成引物 ,建立复合 PCR扩增系统。采用煮沸法快速制备 DNA模板研究该系统的敏感性和特异性 ,并用于临床血样的检测。结果 :从间日疟原虫和恶性疟原虫感染血样中分别扩增出分子量大小为 70 5bp和 575bp的特定扩增带。而食蟹猴疟原虫、诺氏疟原虫及正常人血样均无扩增带出现。单独检测 P.v敏感度达到 0 .1 5× 1 0 -5(约 7个原虫 /μl全血 ) ,在 P.f存在的情况下检测 P.v敏感度为 0 .1 5× 1 0 -4 。检测 1 32例疟区门诊病人冻存血标本 ,1 0 4份与镜检法结果相同。并发现 1 4份混合感染和 5份为镜检虫种鉴别失误。结论 :该系统敏感性高 ,特异性强 ,操作简单 ,并可在一次扩增中同时检出间日疟原虫和恶性疟原虫 ,具有一定的推广应用价值。     

计划无偿献血与自愿无偿献血人群血液安全性指标检测结果比较

为探讨献血模式改变对提高输血安全性的意义 ,笔者比较分析了 5 5 4 1 0例上海市区 2 0 0 2年 3～ 5月同期计划无偿献血 (初筛 )与自愿无偿献血人群的血液安全性检测指标 ,现将结果报告如下。材料与方法1　检测对象　 2 0 0 2年 3～ 5月上海市区的献血者5 5 4 1 0人 ,其中自愿无偿献血者 1 2 32 9人 ,计划无偿献血者 (初筛 ) 430 81人。2　试剂与仪器　 HBs Ag、抗 - HCV、抗 - HIV的检测均采用上海科华生物技术有限公司 ELISA试剂盒 ,HBs Ag试剂盒的批号为 2 0 0 1 1 1 2 5、2 0 0 1 1 2 0 7;抗 - HCV试剂盒的批号为 2 0 0 1 1 0 0…     

丙型肝炎病毒总抗原检测用于病程监测的研究

目的探讨丙型肝炎病毒(HCV)总抗原检测方法在丙肝病程监测方面的临床意义。方法对来本院就诊的40位丙肝患者于治疗前、治疗1个月时、治疗3个月时、治疗6个月(停药)时,停药6个月后等不同时期进行采血,收集血清或血浆标本,用抗-HCV检测试剂盒(酶联免疫法)、HCV核酸(RNA)扩增(PCR)荧光定量检测试剂盒、HCV总抗原检测试剂盒(酶联免疫法)进行检测。结果从患者确认感染丙肝到治疗结束抗-HCV检测均呈阳性,而HCV-RNA检测和HCV总抗原检测会随着病程的变化而变化。本次共检测了189例标本(40位患者不同时期标本总例数),其中HCV-RNA阳性51例,该51例阳性标本中,HCV总抗原检测阳性44例,阳性检出率为86.27%;138例HCV-RNA阴性标本,有3例HCV总抗原检测为阳性(2.2%)。2种方法比较,差异无统计学意义(χ2=1.6,P>0.05)。HCV总抗原检测其OD值会随着病程的变化而相应改变,可以较好地反应丙肝患者的病程状况。结论 HCV总抗原检测方法在丙肝病程监测方面具有很好的临床意义,适合在缺少荧光定量PCR检测能力的中小医院使用,可在一定程度上替代HCV-RNA检测,对抗-HCV阳性患者作进一步的验证检测或补充,更好地应用于丙肝患者的病程监测。     

HCV基因型与2′- 5′寡腺苷酸合成酶活性的相关性研究

目的 了解丙型肝炎病毒基因型在不同人群中的分布规律与流行优势型及其与2′—5′寡腺苷酸合成酶(2-5AS)的相关性。方法 分别对门诊体检、住院病人和血液透析患者抗-HCVIgG阳性标本,采用RT-nested-PCR方法检测HCV RNA;用5′端非编码区(5′NCR)1、2、3、1b型特异性引物进行扩增和基因分型;用PEI-cellulose薄板层析法检测外周血单个核细胞的2-5AS。结果 三组人群HCV RNA感染率分别为1．21％、2．66％、38．84％;HCV基因型以1b亚型为主,1b及1b的相关型占91．67％。以ATP转化率表示2-5AS活性水平,1b型和1b相关的混合感染2-5AS活性显著升高。而其他基因型与健康对照组无明显差别。结论 2-5AS活性的基础水平显著升高可能是HCV1b亚型对干扰素反应低下的原因。     

逆转录—半套式—聚合酶链反应单管法检测血清中HCV RNA

目的 探讨建立一种更简便，更特异灵敏的逆转录－聚合酶链反应（RT－PCR）单管法。方法 采用蜡隔将RT和PCR扩增2个独立的反应体系在1个Eppendoff(Ep)管中分隔开来，设计内外引物，优化反应体系及条件，使整个检测反应经高温启动继而连续封闭地完成。结果 在60例血透析患者血清中，33例（55％）抗－HCV－IgG阳性和27例抗－HCV－IgG阴性血清用单管RT－PCR分别检出28例（85％）和3例（9％）HCV RNA阳性，并对3份阳性PCR产物作核酸序列测定。本方法的检测灵敏度为10^2拷贝／ml。结论 RT－PCR单管法在保持高灵敏度的前提下，提高了特异性，具有简单高效，杜绝外源性污染等优点。     

汉族人多囊肾病1型致病基因突变检测体系的建立及初步应用

目的 建立适合筛查汉族人多囊肾病1型致病基因（PKD1）突变的检测体系。方法 利用设计的82对引物[8对针对PKD15′端多拷贝区的长链聚合酶链式反应（PCR）引物和57对巢式PCR引物，17对针对3′端单拷贝区PCR引物]分别对PKD1的46个外显子进行扩增，扩增产物通过单链构象多态性（SSCP）分析筛检出异常条带后，再经测序确定基因突变位点。利用建立的PCR－SSCP检测体系对汉族人2个常染色体显性遗传性多囊肾病患者家系进行PKDA1突变检测，健康献血员为对照。结果 用82对PCR引物，可成功扩增PKD1各个外显子区域，并经测序证实为PKD1目的片段。将建立的SSCP－PCR基因突变检测体系，分别从2个汉族人常染色体显性多囊肾病（ADPKD）家系检测出PKD1基因Del 3 bp(G49761-G49763)和C47629T2个突变，其可分别导致编码产物第3827位缺失谷氨酸（Glu3827)和第3555位丝氨酸，而产生由苯丙氨酸(S3555F)替代的改变。结论 本研究建立的PCR－SSCP检测体系，可完成PKD1各外显子区域特异性扩增，并成功检测出汉族人2个ADPKD家系基因突变位点，不仅为PKD1基因突变的致病机理研究提供宝贵资料，而且为下一步汉族人多囊肾病的大规模基因突变筛查和临床诊断试剂盒的研制奠定了基础。     

RT-PCR检测白血病细胞VEGF异构体及其受体基因

目的 建立逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测白血病细胞血管内皮生长因子(VEGF)异构体及其受体基因的方法。方法 用TRIZOL试剂提取体外培养的细胞系总RNA,M—MLV逆转录酶生成模板cDNA,PCR扩增VEGF异构体基因以及VEGF受体Flt-1基因,扩增产物用含溴化乙锭的2％琼脂糖凝胶电泳后,直接分析电泳结果。结果 白血病细胞(K562和HL-60)出现3条VEGF条带(516bp、588bp、648bp),分别代表VEGF3种异构体(VEGF121,VEGF145,VEGF165)的基因扩增产物,而人脐静脉血管内皮细胞(ECV304)无VEGF条带出现;此外,2种白血病细胞都可以测出VEGF的Flt-1受体基因,与Flt-1阳性细胞ECV304相似。结论 RT-PCR可用于白血病细胞VEGF多种异构体及其Flt-1受体基因的检测。     

云南和山西无偿献血人群HCV部分基因的核苷酸序列测定及基因分型

目的了解云南和山西2地无偿献血人群丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布及其差异。方法采用荧光定量PCR(Q-PCR),对所收集的203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本(云南102份,山西101份)做核酸检测,对核酸阳性的标本做E1基因扩增和测序;E1基因阴性者,进一步做NS5B基因扩增;采用DNASTAR、Bi-oedit和Mega4等软件对E1、NS5B基因进行分析及分子进化研究。结果203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本中,云南102份标本经Q-PCR检测出核酸阳性55份,从中扩增出E1基因43份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果8份;山西省101份标本经Q-PCR检测出阳性46份,从中扩增出E1基因33份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果6份。云南省献血者HCV基因型(亚型)可分为7种:1b[7.84%(4/51)]、2a[13.73%(7/51)]、3a[17.65%(9/51)]、3b[41.18%(21/51)]、6a[7.84%(4/51)]、6n[9.80%(5/51)]和6v[1.96%(1/51)];山西省献血者HCV基因型(亚型)较简单,可分为3种:1b[89.74%(35/39)]、2a[7.69%(3/39)]和3b[2.56%(1/39)]。结论我国云南和山西2地无偿献血人群中的HCV基因型(亚型)的分布存在明显的差异。     

多重PCR检测缺失型α地中海贫血

目的　针对中国人常见的缺失型α地中海贫血建立一种快速、简便、可靠的多重聚合酶链反应 (PCR)基因诊断技术。方法　设计 4对引物 ,利用单管多重PCR方法进行扩增 ,同时检测 3种缺失型和正常的α2 珠蛋白基因。结果　成功检测出正常人及 3种缺失型的杂合子、双重杂合子 ;正常α2 基因的扩增片段为 180 0bp ,东南亚型缺失基因的扩增片段为 70 8bp ,右侧缺失基因的扩增片段为 2 0 2 2bp ,左侧缺失基因的扩增片段为 16 2 8bp , α3 .7/ SEA双重杂合子的扩增片段为 2 0 2 2bp和 70 8bp , α4.2 / SEA双重杂合子的扩增片段为 16 2 8bp和 70 8bp。结论　 790例标本的基因检测结果分析表明 ,该法快速、准确 ,可用于常规临床标本的检测。