基于16S rRNA基因测序的黄褐斑病人肠道菌群差异研究

目的：利用新一代16S rRNA测序技术比较黄褐斑病人与健康人的肠道菌群多样性和细菌表型差异。方法：纳入30例黄褐斑病人为研究组,以20名正常人作为健康对照,测序分析粪便样品中细菌群落的结构组成和表型特征。结果：研究组肠道微生物群落丰度、多样性相对降低。研究组拟杆菌门、拟杆菌纲、拟杆菌目、普雷沃菌科、拟杆菌科、普雷沃氏菌、拟杆菌属等丰度显著降低,而厚壁菌门、放射菌门、放线菌纲、乳杆菌目、双歧杆菌目、毛螺菌科、布劳特氏菌等升高,差异均有统计学意义(P<0.05～P<0.01)。结论：黄褐斑病人与健康人肠道菌群存在一定差异。     

清肺通络合剂对气阴两虚兼痰热型社区获得性肺炎患者肠道菌群多样性的影响

目的 探讨中药清肺通络合剂（QFTLM）对气阴两虚兼痰热型社区获得性肺炎（CAP）患者肠道菌群多样性的影响。方法 采用前瞻性临床对照研究方法,根据患者采用的治疗方法不同,将23例气阴两虚兼痰热型CAP患者分为两组：予抗菌药物治疗组10例,予抗菌药物联合QFTLM治疗组13例。收集治疗前后患者粪便样本46份,利用PacBio测序平台进行16S rRNA测序,分析两组患者治疗前后样本中肠道菌群的组成、多样性和显著性差异物种。结果 （1）两组治疗前后肠道菌群的组成：在门水平为厚壁菌门、变形杆菌门、拟杆菌门、疣微菌门和放线菌门;在纲水平为梭菌纲、革兰阴性菌纲、芽孢杆菌纲、丹毒丝菌纲、拟杆菌纲、γ-变形杆菌纲、疣微菌纲和放线菌纲;在目水平为拟杆菌目、梭菌目、单胞菌目、肠杆菌目、乳杆菌目、丹毒丝菌目和颤螺菌目;在科水平为拟杆菌科、乳球菌科、肠杆菌科、韦荣球菌科、艾克曼菌科、毛螺菌科、喜热菌科、链球菌科、丹毒丝菌科和肠球菌科;在属水平为拟杆菌属、粪杆菌属、埃希氏菌属、罕见小球菌属、巨单胞菌属、艾克曼菌属、梭菌属、链球菌属和肠球菌属。（2）两组治疗前后梭菌纲的相对丰度抗菌药物组治疗前后为（0.48±0...     

强化期抗结核治疗对肺结核患者肠道菌群的影响

目的 探讨肠道菌群多样性及丰度在抗结核治疗强化期的变化。方法 收集广州市胸科医院20例初治菌阳肺结核患者使用强化方案治疗1周及强化期结束的粪便标本,所有标本进行16S rDNA测序,进行生物信息学分析。结果 强化期结束治疗组的Alpha多样性指标Chao1和observed_otus指数分别为（97.8±28.3）和（97.6±28.2）,高于治疗1周组的（81±34.7）和（81±34.7）,差异有统计学意义（P=0.04;P=0.038）。基于加权和未加权Unifrac距离的PCoA分析显示两组整体菌群结构无明显差异。在相对丰度较高的菌科中,强化期结束治疗组的拟杆菌科、肠球菌科、肠杆菌科、丹毒菌科、卟啉单胞菌科、双歧杆菌科等相对丰度下降,毛螺菌科、梭杆菌科、普氏菌科、瘤胃球菌科、韦氏菌科等相对丰度增加。通过线性判别分析效应量LEfse分析两组数据,发现在属水平上,厚壁菌门的瘤胃球菌、乳杆菌及放线菌门的柯林氏菌为组间显著差异菌种。结论 强化期治疗结束与治疗1周相比,肠道菌群多样性增加,但肠道菌群结构无明显差异。肠道拟杆菌科丰度减少,毛螺菌科丰度增加。     

宏基因组测序技术在发热患者咽部微生物菌群研究中的应用

目的 通过宏基因组高通量测序分析,研究不同发热患者咽部微生物菌群多样性。方法 采用随机法选取2020年1—4月石家庄市五所医院发热门诊就诊21例发热患者作为实验组,选取同期10例健康人作为对照组,采集咽拭子样本并提取核酸,应用Illumina测序平台进行宏基因组测序并进行微生物菌群分析。结果 实验组共获得1 716 802 816条优质序列,鉴定出4 079个物种,归属于97个门,951个属。实验组和对照组咽部微生物菌群分析显示,在门水平上,梭杆菌门和厚壁菌门在对照组中升高,拟杆菌门在实验组中升高;在纲水平上,梭杆菌纲和梭菌纲在对照组中升高,拟杆菌纲在实验组中升高;在目水平上,拟杆菌目在实验组中升高;在科水平上,瘤胃菌科在对照组中升高,拟杆菌科、理研菌科、阿克曼氏菌科、红细菌科和火色杆菌科在实验组中升高;在属水平上,拟普雷沃菌属、拟杆菌属、理研菌属、副拟杆菌属等在实验组中升高,瘤胃球菌属在对照组中升高;在种水平上,紫单胞菌科细菌（Porphyromonadaceae bacterium KA00676）、两个拟杆菌属（Bcteroidales bacterium Barb7, Bcte...     

基于高通道测序的肠道菌群与冠心病的相关性研究

背景　冠心病是发达国家及发展中国家最常见的死亡原因之一,肠道菌群的组成在冠心病的病理过程中起重要作用,越来越多证据表明,肠道菌群失调可导致脂质代谢紊乱、低度炎性反应、胰岛素抵抗、血压升高等,进而增加冠心病风险。目的　通过检测冠心病患者肠道菌群结构及多样性,了解其肠道菌群特点,进一步寻找冠心病危险因素,为冠心病患者提供新的诊疗方法。方法　选取2016年7月-2017年6月入住新乡医学院第一附属医院心血管内科及心脏重症监护病房（CCU）的冠心病患者62例,应用Gensini评分将其分为轻度组27例,中重度组35例;同时选取同期于本院体检的30例健康者作为对照组。采集研究对象的粪便样本,提取粪便样本的DNA并对其进行细菌16S rDNA V3区的聚合酶链式反应（PCR）扩增,对最终的PCR扩增产物进行生物信息学分析。结果　三组原始PE reads数目（PE_reads）、去除嵌合体后有效序列数目（Nochimera）、有效序列平均长度（AvgLen）、有效数据的GC百分比含量（GC）、Nochimera与PE_reads的百分比（Effective）比较,差异均无统计学意义（P>0.05）。三组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;其中,轻度组与中重度组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数均低于对照组（P<0.05）。三组拟杆菌门、变形菌门相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组拟杆菌门相对丰度低于对照组,变形菌门相对丰度高于对照组（P<0.05）;三组拟杆菌纲、梭菌纲相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组拟杆菌纲相对丰度低于轻度组、梭菌纲相对丰度高于轻度组,轻度组拟杆菌纲相对丰度低于对照组、梭菌纲相对丰度高于对照组（P<0.05）;三组拟杆菌属相对丰度比较,差异有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组相对丰度低于轻度组和对照组,轻度组相对丰度低于对照组（P<0.05）。Metastats差异分析结果显示对照组与轻度组拟杆菌属、巴斯德菌属、脱磷弧菌属、埃希杆菌-志贺杆菌属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;对照组与中重度组巴斯德菌属、Dialister属、黄杆菌属、Parasutterella属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;轻度组与中重度组脱磷弧菌属、Dialister属、埃希杆菌-志贺杆菌属、黄杆菌属、帕拉普菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）。结论　肠道菌群多样性、结构的改变,是冠心病的危险因素,因此调节肠道菌群、粪菌移植等方法可能成为冠心病新的治疗方法。     

膳食纤维摄入情况对骨质疏松症患者肠道菌群的影响

目的 探讨骨质疏松症患者膳食纤维摄入量对肠道菌群组成和结构变化的影响。方法 选取2022年9月至12月于广西医科大学第一附属医院72例初诊骨质疏松症的患者。通过半定量食物频率调查问卷和中国营养食物成分表第六版获取膳食纤维摄入量信息。根据膳食纤维中位摄入量分为：高膳食纤维组(≥11.92 g/d,n=36)及低膳食纤维组(<11.92 g/d,n=36)。使用Illumina MiSeq测序平台进行16S rRNA基因高通量测序,运用R语言和Qiime程序对测序结果进行物种注释和菌群结构差异分析。结果 两组样本Beta多样性差异有统计学意义(P=0.007)。LefSe分析结果显示,变形菌门、γ-变形菌纲、肠杆菌目、肠杆菌科是低膳食纤维组相对丰度显著增加的菌群,Agathobacter和缠结真杆菌是高膳食纤维组相对丰度显著增加的菌群。广义线性回归模型结果显示,与膳食纤维摄入水平正相关的肠道菌群包括厚壁菌门、疣微菌门、梭杆菌门、疣微菌纲、疣微菌目、梭杆菌目、阿克曼氏菌科、乳酸乳球菌、Agathobacter、阿克曼氏菌属、脆弱类杆菌和梭杆菌属;与膳食纤维摄入水平负相关的属或种水平的肠...     

冠状动脉粥样硬化性心脏病患者肠道菌群丰度与血脂和血尿酸水平的相关性

目的探讨冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAHD)患者肠道菌群丰度与血脂、血尿酸水平的相关性。方法选取2016年9月至2017年11月新乡医学院第一附属医院心血管内科收治的疑似CAHD进行冠状动脉造影患者106例为研究对象,根据冠状动脉造影结果分为CAHD组(n=68)和非CAHD组(对照组,n=38),均于入院次日清晨空腹抽取肘静脉血,检测血清总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、血尿酸(UA)水平;并于治疗前收集2组受试者新鲜粪便样本5 g,参照粪便样本DNA提取试剂盒方法提取粪便样本DNA,采用Illumina MiSeq平台实施高通量测序,检测受试者肠道菌群丰度,对肠道菌群丰度与血脂、血尿酸水平进行相关性分析。结果与对照组受试者比较,CAHD组受试者的血清UA、TC、LDL水平显著升高,HDL水平显著降低(P <0. 05)。2组受试者肠道菌群共检测到8个菌门,其中拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、放线菌门的检出率均为100%,梭杆菌门、软壁菌门、互养菌门、广古菌门检出率比较差异均无统计学意义(χ2=0. 009、0. 000、0. 000、0. 000,P> 0. 05);与对照组受试者比较,CAHD组拟杆菌门细菌丰度减小(P <0. 05),厚壁菌门细菌丰度增加(P <0. 05)。CAHD组受试者β-变形菌纲细菌丰度小于对照组受试者(P <0. 05),梭菌纲细菌丰度大于对照组(P <0. 05),2组受试者β-变形菌纲、梭菌纲细菌检出率均为100%。CAHD组受试者拟杆菌目、Burkholderiales目、双歧杆菌目、乳酸杆菌目细菌丰度小于对照组(P <0. 05),2组受试者拟杆菌目、Burkholderiales目、双歧杆菌目、乳酸杆菌目细菌检出率均为100%。CAHD组受试者消化链球菌科、Erysipelotrichaceae科细菌丰度大于对照组(P <0. 05),2组受试者消化链球菌科、Erysipelotrichaceae科细菌检出率均为100%。CAHD组受试者拟杆菌属、Roseburia属、乳酸杆菌属、双歧杆菌属细菌丰度小于对照组(P <0. 05),Blautia属、Odoribacter属、Ruminococcus-2属、Faecalibacterium属、Alistipes属、Subdoligranulum属、埃希氏菌属、Stercoris种细菌丰度大于对照组(P <0. 05); CAHD组受试者Odoribacter属、Alistipe属细菌检出率小于对照组(χ2=3. 892、8. 853,P <0. 05)。2组受试者血UA水平与双歧杆菌目、乳酸杆菌属细菌丰度呈负相关(r=-0. 562、-0. 112、-0. 429、-0. 045,P <0. 05),与埃希氏菌属细菌丰度成正相关(r=0. 781、0. 193,P <0. 05); CAHD组受试者血UA水平与Burkholderiales目细菌丰度呈正相关(r=0. 716,P <0. 05),与乳酸杆菌目细菌丰度呈负相关(r=-0. 687,P <0. 05)。2组受试者血TG水平与拟杆菌目、Odoribacter属细菌丰度呈负相关(r=-0. 761、-0. 354、-0. 323、-0. 256,P <0. 05),与梭菌纲细菌丰度呈正相关(r=0. 867、0. 447,P <0. 05); CAHD组受试者血TG水平与Stercoris种细菌丰度呈正相关(r=0. 258,P <0. 05)。2组受试者血HDL水平与消化链球菌科、梭菌纲细菌丰度呈正相关(r=0. 650、0. 146、0. 597、0. 012,P <0. 05); CAHD组受试者血HDL水平与软壁菌门细菌丰度呈正相关(r=0. 656,P <0. 05)。2组受试者血LDL水平与消化链球菌科、梭菌纲细菌丰度均呈负相关(r=-0. 497、-0. 036、-0. 839、-0. 181,P <0. 05)。结论 CAHD受试者与对照组的肠道菌群丰度在门、纲、目、科、属、种水平存在一定差异;肠道菌群丰度与CAHD患者的血脂、血尿酸水平相关。     

多系统萎缩患者肠道菌群的变化

目的:探讨多系统萎缩(MSA)患者肠道菌群的变化。方法:收集2020年6月至2022年1月于郑州大学第一附属医院招募的MSA患者(MSA组)22例及其健康配偶(HC组)21例的临床资料及粪便样本,基于粪便菌群16S rRNA的测序结果,分析MSA患者肠道菌群组成和丰度的变化。结果:MSA组菌群丰度及多样性小于HC组(P<0.05)。在门水平,MSA组变形菌门丰度高于HC组,而拟杆菌门丰度低于HC组(P<0.05)。在科水平,MSA组乳杆菌科、链球菌科、肠杆菌科、肠球菌科、拜叶林克氏菌科、鞘脂单胞菌科、韦荣球菌科相对丰度高于HC组,而拟杆菌科、瘤胃球菌科相对丰度降于HC组(P<0.05)。在属水平,MSA组克雷伯氏杆菌属、柠檬酸杆菌属和利莫西乳杆菌属相对丰度明显高于HC组,而拟杆菌属、粪杆菌属、另枝菌属、芽孢杆菌属、毛螺旋菌属、副杆菌属、罗氏菌属、链球菌属、丁酸球菌属相对丰度低于HC组(P<0.05)。结论:MSA患者肠道菌群结构在门、科及属水平上均有明显变化,这些变化可能与MSA的发生有关。     

基于16S rRNA测序对2型糖尿病患者肠道菌群特征的分析

目的 分析比较2型糖尿病患者(T2D)与正常人群肠道菌群结构、丰度及多样性的差异。方法 收集30例临床粪便样本(健康样本15例为研究组,2型糖尿病病例样本15例为对照组),应用Illumina MiSeq高通量测序技术进行Alpha、Beta多样性分析,比较研究组和对照组肠道菌群丰富度和多样性以及两组间的肠道菌群差异。采用Tax4Fun软件进行差异菌群功能预测。结果 研究组和对照组OTU共有1 565个,其中两组共有OTU为767个。与对照组比较,研究组肠道菌群α多样性下降;Unweighted Unifrac距离显著降低,差异有统计学意义(P<0.05),β多样性存在差异。在门水平上,研究组中厚壁菌门(Fimicutes)、变形杆菌门(Proteobacteria)的相对丰度明显高于对照组,而拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线杆菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobiota)相对丰度低于对照组。在属水平上,研究组克雷伯氏菌(Klebsiella)、普拉梭菌(Faecalibacterium)的相对丰度明显高于对照组,狄氏副拟杆菌(P...     

注意缺陷多动障碍合并肥胖患儿肠道菌群特点观察

  目的  探究注意缺陷多动障碍(ADHD)合并肥胖患儿发病过程中肠道菌群特点。  方法  选取2018年8月—2019年10月期间杭州市第七人民医院接诊的64例ADHD患儿作为本次研究对象,根据体重指数将其分为正常体重ADHD患儿(对照组,32例)和肥胖伴ADHD患儿(观察组,32例),采用宏基因组测序的方法测定粪便菌群,比较2组儿童之间菌群α多样性、物种分类的相对丰度及菌数量的差异。  结果  观察组和对照组儿童肠道菌群α多样性差异较小(均P＞0.05)。从菌属方面来看,观察组患儿的韦荣球菌属和粪肠杆菌属丰度低于对照组,但气味杆菌属和肠球菌属丰度高于对照组(均P＜0.05)。从菌种方面来看,观察组患儿的毛螺科菌、普氏栖粪杆菌、小韦荣球菌以及活泼瘤胃球菌丰度低于对照组,木假单胞菌、粪拟杆菌以及内脏拟杆菌丰度高于对照组(均P＜0.05)。对照组患儿的直肠真杆菌菌数明显高于观察组,多形拟杆菌、双歧杆菌属以及乳酸杆菌菌数明显低于观察组(均P＜0.05)。  结论  ADHD合并肥胖患儿肠道菌群发生了改变,或可为ADHD患儿治疗提供参考资料。      

哮喘患者中不同气流阻塞表型的肠道微生态特征研究

目的 探讨固定气流阻塞哮喘、可逆气流阻塞哮喘患者与健康人之间肠道微生物群的组成,并分析关键差异菌群分布与临床特征之间的相关性。方法 纳入固定气流阻塞哮喘组15例(FAO)、可逆气流阻塞哮喘组13例(RAO),并纳入与之匹配的健康对照组11例,收集临床资料,行肺功能及诱导痰检查,对血液、粪便标本进行检测,比较各组肠道菌群状态,分析肠道菌群丰度与患者血常规、IgE、肺功能及诱导痰的关系。结果 三组的优势菌群构成相似,但存在部分物种丰度差异;与RAO组相比,FAO组拟杆菌属、大肠杆菌属显著增多、巨单胞菌属显著减少。厚壁菌门与哮喘病程呈负相关;拟杆菌门、拟杆菌属与哮喘病程呈正相关;拟杆菌门与Pre-BD FEV₁/FVC呈负相关;巨单胞菌属与Pre-BD FEV1呈正相关,大肠杆菌属与Post-BD FEV₁/FVC、Post-BD MMEF呈负相关,拟杆菌属与Post-BD MMEF呈负相关。厚壁菌纲、月形单孢菌目与外周血EOS%呈负相关;肠杆菌目、肠杆菌科与外周血IgE水平呈正相关;厚壁菌纲、月形单孢菌目与诱导痰EOS%呈负相关。结论 固定气流阻...     

长蛇灸治疗脾肾阳虚型功能性腹泻的临床研究

【目的】观察长蛇灸疗法对脾肾阳虚型功能性腹泻患者的临床疗效及对肠道菌群的影响。【方法】将60例脾肾阳虚型功能性腹泻患者随机分为观察组和对照组,每组各30例。观察组给予长蛇灸治疗,每周1次,连续治疗4周。对照组给予四神丸合附子理中丸治疗,每次各9 g,每日2次,7 d为1个疗程,共治疗4个疗程。评价2组临床疗效,比较2组患者治疗前后各项中医症状积分及症状总积分的变化情况,以及观察组患者肠道菌群物种丰度、Alpha多样性指数、优势菌群、菌群分布及治疗前后群落差异等指标。【结果】(1)观察组总有效率为73.33%,对照组为56.67%。观察组疗效优于对照组(P<0.05)。(2)治疗后,2组患者的各项临床症状积分均明显改善,但差异无统计学意义(P>0.05);治疗后,2组患者症状总积分明显改善(P<0.05),且观察组优于对照组(P<0.05)。2组患者治疗前后症状总积分差值比较,观察组优于对照组(P<0.05)。(3)治疗前后能够检测到的比例在1%以上的肠道菌群共有5个门,即拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、放线菌门、梭杆菌门。其中长蛇灸疗法治疗后梭杆菌门的相对丰度明显高于治疗前(P<0.05),其他菌门相对丰度值治疗前后比较,差异无统计学意义(P>0.05)。(4)治疗后观察组毛螺菌属、嗜血杆菌属、萨特氏菌属相对丰度值明显低于治疗前,而梭杆菌属相对丰度值明显高于治疗前(P<0.05)。(5)观察组属分类水平物种丰度聚类热图结果显示:普雷沃氏菌属、拟杆菌属、栖粪杆菌属在各样本中丰度较高;患者治疗前后样本肠道菌群的优势菌群存在明显区别。(6)观察组患者治疗后Observed species指数较治疗前下降(P<0.05),治疗前后Chao1指数、Shannon指数、Simpson指数和PD whole tree指数变化无统计学意义(P>0.05)。(7)Beta多样性检测显示,治疗前5个样本分布比较集中;治疗后3个样本较集中、2个样本分布离散,可能是由于个体差异的存在,治疗对不同个体的肠道菌群结构的作用也存在一定差异。(8)观察组治疗后毛螺菌科梭菌属较治疗前显著升高,梭菌科梭菌属、毛螺菌属以及厚壁菌门梭菌目菌属均较治疗前显著下降。(9)2组患者中仅有1例患者在长蛇灸治疗后出现了少量局部的水泡,其余患者均无不良反应发生。【结论】长蛇灸疗法治疗脾肾阳虚型功能性腹泻具有良好的临床疗效,其疗效可能是通过改善肠道菌群结构来实现的。     

先天性巨结肠患儿Soave术前、术后肠道菌群组成及丰度

目的分析先天性巨结肠(HD)患儿Soave术前、术后肠道菌群组成及丰度,为HD的进展及治疗提供理论依据。方法选取2016年6月至2017年8月郑州大学附属儿童医院收治的29例Soave术前HD患儿作为术前组,选取同时期11例Soave术后1周患儿作为术后组。提取两组粪便样品细菌基因组DNA,采用16S rDNA高通量测序技术检测肠道菌群的组成及丰度。结果术前组拟杆菌门、拟杆菌科、普雷沃菌科、梭菌纲、梭菌目、消化链球菌科、韦荣球菌属、罗氏菌属、肠球菌属丰度均高于术后组,差异有统计学意义(均P<0.05);术后组芽孢杆菌目、芽孢杆菌科、屎肠球菌、微球菌目、微球菌科丰度均高于术前组,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论 HD患儿Soave术前、术后肠道菌群丰度发生了变化。     

海军潜艇官兵代谢指标与肠道菌群关联研究

目的 调查某部海军潜艇官兵代谢性疾病的患病情况,并探讨其与肠道菌群多性性的关联。方法 随机抽取某部潜艇官兵30名作为研究组,选取年龄和体重指数（BMI）匹配的健康体检30人作为对照组,进行代谢指标检测及粪便肠道菌群多样性分析。结果 研究组舒张压低于对照组,而血尿酸、血红蛋白及总胆固醇（TC）等代谢指标均高于对照组（P<0.05）。2组肠道菌群在各细菌学分类水平差异有统计学意义（P<0.05）。研究组肠道菌群中的厚壁菌门、栖粪杆菌属和普氏栖粪杆菌丰度高于对照组,拟杆菌门、变形菌门则低于对照组（P<0.05）。其中拟杆菌属丰度与BMI和TC水平均呈现负相关,栖粪杆菌与血尿酸及TC水平呈现正相关（P<0.05）。结论 血尿酸、TC等代谢指标在海军潜艇官兵中有增高趋势,且与特定肠道菌群结构多样性改变有一定关联。     

结直肠癌患者肠道菌群组成及其代谢产物LPS和SCFAs的变化

目的 研究结直肠癌患者肠道菌群及其代谢产物脂多糖(LPS)和短链脂肪酸(SCFAs)的变化规律。方法 分别收集结直肠癌(CRC)患者和健康对照组的粪便标本,采用16S rRNA基因测序分析肠道菌群组成,采用鲎试剂法分析外周血LPS水平,采用气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)检测肠道菌群代谢产物SCFAs含量的变化。结果 与健康对照组相比,结直肠癌患者肠道菌群ɑ多样性发生显著变化,表明肠菌组成丰度明显改变。肠道菌群主坐标分析(PCoA)与非度量多维尺度分析(NMDS)结果显示,在健康对照组与结直肠癌患者之间差异有统计学意义,提示肠道菌群β多样性在该疾病状态下发生明显变化。进一步分析发现,结直肠癌患者肠道菌群在门水平上的厚壁菌门(Firmicutes)显著增加(P<0.05),而变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)显著降低(P<0.05);在属水平上显著增加的有肠杆菌(Enterobacteriaceae)、变形菌门(Prevotellaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)、链球菌科(Streptococcaceae)...     

荷叶黑茶提取物对内生湿热证患者肠道菌群及临床症候的影响

目的 研究荷叶黑茶提取物对内生湿热证患者肠道菌群、临床症状及糖脂代谢等相关指标的影响。方法 采用自身前后对照的方法，选取2022年4—7月江苏省第二中医院门诊内生湿热证患者23例，服用荷叶黑茶提取物(6 g/d),治疗1个月后评估其临床疗效和不良反应，并通过Illumina MiSeq平台对患者治疗前后的肠道菌群进行16S rDNA基因V3～V4可变区检测，运用QIIME、STAMP及LEfSe进行Alpha、Beta多样性分析，鉴定差异性菌属。结果 内生湿热症候经治疗显著改善(有效率>60%);体质量指数(BMI)、体脂率、腰臀脂肪比、空腹血糖(FPG)、空腹胰岛素(FINS)、胰岛素抵抗(IR)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白(LDL-C)均较治疗前下降，差异有统计学意义(P<0.05);2例(8.70%)患者在服药期间有失眠症状；与治疗前相比，治疗后蓝藻菌门(Cyanobacteria)的相对丰度上升，拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度下降，差异有统计学意义(P<0.05);属分类水平上，罗斯氏菌属(Roseburia)、克雷伯氏...     

基于16SrDNA扩增子测序探究脱氧胆酸对肠型胃癌模型INS⁃GAS小鼠胃内菌群结构的影响

目的：探究次级胆汁酸脱氧胆酸(deoxycholic acid,DCA)对肠型胃癌模型INS-GAS小鼠胃内菌群结构的影响。方法：将10只8周龄雄性INS-GAS小鼠随机分为2组,每组5只,一组予以0.2% DCA饮水,另一组饮用生理盐水(normal saline, NS)溶剂。另有5只同窝雄性FVB/N野生型小鼠予以0.2% DCA饮水作为基因型对照组。3个月饮水干预结束后收集各组小鼠胃内容物行16S rDNA扩增子测序,进行胃内菌群相对丰度、α多样性指数、β多样性及差异物种分析。分离胃体和胃窦黏膜组织,qRT-PCR检测肠化标志物cdx2、klf5、vil1和muc2 mRNA表达。结果：与对照组小鼠相比,DCA改变了INS-GAS小鼠胃内优势菌种,属水平上相对丰度最高的菌种由乳杆菌科菌属(61.93%)变为未定义蓝藻细菌属(58.70%)。两组小鼠胃内菌群丰度及多样性均无显著差异(ACE指数P=0.213,Chao1指数P=0.280;Shannon指数P=0.391,Simpson指数P=0.205)。主成分分析发现两组小鼠胃内菌群结构差异度大,组间差异大于组内差异(R=0.368,P=0.032)。DCA饮水促进INS-GAS小鼠胃内蓝藻细菌在门、纲、目、科和属各个水平上显著增高,毛螺菌科Anaerostipes菌属以及两种蓝藻细菌属菌种Lolium perenne和Phaseolus vulgaris丰度也显著增高。此外,DCA饮水同样导致INS-GAS小鼠胃内厚壁菌门、杆菌纲和乳杆菌(目、科和属水平)丰度显著降低,罗伊氏乳杆菌丰度也显著降低。DCA饮水的INS-GAS小鼠胃体及胃窦部黏膜组织muc2 mRNA表达均显著高于NS饮水的INS-GAS小鼠(P均＜ 0.05)。此外,同为DCA饮水的INS-GAS小鼠胃内菌群丰度显著高于FVB/N小鼠(ACE指数P=0.022; Chao1指数P=0.028),两组小鼠组内差异大于组间差异,但尚无统计学意义(R=-0.056,P=0.647)。结论：DCA改变了INS-GAS 小鼠胃内菌群结构,主要为蓝藻细菌属和毛螺菌科Anaerostipes菌属相对丰度增高,乳杆菌属相对丰度降低,且促进了胃黏膜肠化标志物muc2表达。     

中医辨证远程智能护理对肠内营养相关性腹泻患者生活质量和肠道菌群的影响

目的 探讨中医辨证远程智能护理对肠内营养相关性腹泻(ENAD)患者生活质量和肠道菌群的影响。方法 选取82例ENAD患者作为研究对象,随机分为对照组和观察组,每组41例。给予对照组常规延续护理,给予观察组中医辨证远程智能护理,两组均连续干预3个月。比较干预前后两组肠道菌群(厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门)相对丰度、肠道菌群Alpha多样性(Chao、Simpson、Shannon、Ace指数)和肠道菌群Beta多样性(菌群整体结构),以及胃肠道生活质量指数(GIQLI)评分。结果 干预后,两组患者变形菌门、放线菌门相对丰度,Simpson指数均较干预前降低,厚壁菌门、拟杆菌门相对丰度,Chao、Shannon、Ace指数均较干预前升高,且观察组上述指标改善程度均优于对照组(均P<0.05);观察组和对照组肠道菌群整体结构相差较大,菌种发生明显分离;两组患者GIQLI评分较干预前升高,且观察组GIQLI评分高于对照组(均P<0.05)。结论 相比于常规延续护理,中医辨证远程智能护理可更好地调节ENAD患者肠道菌群,提高患者生活质量。     

氨基酸配方替代喂养对重度牛奶蛋白过敏婴儿肠道菌群特征的影响

目的 探讨氨基酸配方（AAF）替代喂养对重度牛奶蛋白过敏（CMPA）婴儿肠道菌群特征的影响。方法 纳入23例确诊为重度CMPA且人工喂养的≤3月龄婴儿,采用同一品牌AAF进行喂养干预。干预前及干预3个月后,收集所有婴儿的粪便样本,通过16S rRNA高通量测序及生物信息学分析评估肠道菌群的特征变化。结果 干预前后,重度CMPA婴儿肠道菌群Chao1指数、Shannon指数、observed species指数、 Simpson指数差异具有统计学意义（P<0.05）,Beta多样性具有差异,且组间差异大于组内差异。门水平的相对丰度分析及LEfSe分析结果均显示,AAF干预后重度CMPA婴儿肠道中厚壁菌门、拟杆菌门显著富集。属水平的相对丰度分析结果显示,AAF干预后重度CMPA婴儿肠道中拟杆菌属、粪杆菌属、双歧杆菌属的相对丰度较干预前明显升高,弓形菌属、克雷伯菌属、梭菌属的相对丰度较干预前降低,LEfSe分析结果显示拟杆菌属、粪杆菌属、弓形菌属、克雷伯菌属为在丰度上有显著差异的标志物种。在种水平上相对丰度排名前10的菌群中,产气荚膜梭菌、产酸拟杆菌、丁酸梭菌、格氏乳杆菌、罗伊氏乳杆菌...     

Hp相关性胃病脾胃湿热证、脾气虚证的胃黏膜菌群特征及炎症水平分析

  目的  探讨幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)相关性胃病脾胃湿热证、脾气虚证形成的生物学机制。  方法  收集107例Hp相关性胃病患者的胃黏膜样本, 其中脾胃湿热证70例,脾气虚证37例, 同时招募平和体质健康受试者10名作为正常对照组。采用16S rDNA技术检测胃黏膜样本菌群组成, 免疫组织化学法检测胃黏膜NLRP3和白介素-1β(Interleukin-1β, IL-1β)蛋白表达水平。  结果  与正常对照组比较, 脾胃湿热证患者胃黏膜菌群放线菌门、拟杆菌门的相对丰度显著降低(P < 0.05), 脾气虚证组患者胃黏膜菌群的门水平物种丰度无明显差异;线性判别分析显示, 与正常对照组比较, 幽门螺杆菌属为Hp相关性胃病脾胃湿热证、脾气虚证患者的胃黏膜标志菌属。与正常对照组比较, 脾胃湿热证、脾气虚证患者胃黏膜NLRP3和IL-1β蛋白表达水平均显著升高(P < 0.05)。  结论  胃黏膜菌群结构差异、炎症水平升高可能是Hp相关性胃病脾胃湿热证、脾气虚证形成的内在生物学机理。