中国人面肩肱型营养不良症的分子遗传学特征及基因诊断研究

目的 (1)探讨中国人群4q35区EcoR I片段长度多态性及中国人面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者4q35区D4Z4的缺失规律。(2)研究中国人4q35的不稳定性及4q-10q相互易位的规律及其与FSHD的关系。(3)研究基因突变与FSHD临床表型的关系，初步探讨其分子发病机制。(4)建立适合我国人群和民族特点的FSHD基因诊断方法体系，为本病防治奠定基础。方法 (1)采用EcoR I／Hind Ⅲ双酶切gDNA p13E-ll Southern杂交方法检测正常人群及FSHD患者4q35区EcoR Ⅰ／p13E-ll片段，并应用Image分析软件计算分析片段大小。(2)采用EcoR I／Bln t双酶切 p13E-11 Southern杂交方法检测和区分来自10q26的同源性片段。(3)应用Bgl Ⅱ／Btn t双酶切、Southern杂交方法检测4q-型和10q-型D4Z4片段，应用剂量分析软件检测片段的杂交信号强度，计算4q:l0q剂量比，推测4q-10q相互易位形式。采用χ2检验比较正常人、散发型FSHD和家族型FSHD的易位率差异。(4)采用线性回归法分析患者发病年龄、丧失行走能力的年龄与EcoR Ⅰ片段长度的相关关系，采用t检验比较易位和非易位组及不同性别患者的片段长度及发病年龄差异。(5)联合应用双酶切 剂量检测方法进行基因诊断。结果 (1)EcoR I片段检测及来源判断：33名正常人检测到1个来自4q35、37．2-40kb的EcoR I／p13E-ll片段，而25例家族性FSHD患者和17例散发性患者均检测到2个来自4q35的片段，大小介于18-30．1kb。另外3名正常人和4例散发性患者还监测到21．5-28kb的10q26同源性片段。(2)剂量分析与易位判断：在所有受捡对象共检测到5种不同的4q1 10q剂量比，提示存在4种易位形式，其中散发性患者只存在4q→10q易位，家族性患者存在10q→4q易位，而正常人群存在各种易位形式。正常人、散发性患者、家族性患者的易位频率分别为16．7％，64．7％和8％。散发性患者易位发生率明显高于家族性患者(P＜0．001)和正常人群(P＜0．01)，家族性患者与正常人群间差异无显著性(P＞0．05)。(3)基因型-表型关系分析：在散发性患者及家系先证者中发现患者的发病年龄及丧失行走能力的年龄均与EcoR I片段大小密切相关(r＝0．960，P＜0．01；P＜0．05)；易位型患者的EcoR I片段及发病年龄均较非易位患者小(P＜0．05)；男女患者在EcoR I片段大小和发病年龄上无明显差异(P＞0．05)。在家族性患者中，家系内部的所有患者均携带相同大小的致病片段，在发病年龄及病情严重程度上有很大差异．(4)基因诊断；所有家族性和散发性待诊患者均检测到1个＜31 kb的致病性片段，可疑患者未检测到此片段。联合应用剂量检测分析，基因诊断与临床符合程度达100％。结论 (1)中国人群存在4q35区EcoR I片段的多态性，正常人此片段在37．2kb以上，患者因D4Z4重复序列的缺失仅剩20.1-31kb家族型和散发型FSHD与此片段长度密切相关，二者在D4Z4缺失程度上无明显差异。(2)中国人群在10q26区也存在4q35 EcoR I同源性片段，大小与4q35者接近，应用EcoR I／Bln I双酶切方法可有效地区分两种不同来源的片段。(3)我国人群也存在4q-10q易位，易位仅与散发型FSHD有关，与家族型者无关。所有易位者中仅4q-10q的易位形式与发病有关。4q-10q相互作用引起4q35区的D4Z4重复单位过多丢失或转移至10q26，可能是导致散发型FSHD患者发生致病性D4Z4缺失及当代突变的根本原因。(4)FSHD临床变异很大，差异广泛存在于不同家系、不同性别以及同一家系的不同患者之间。不同家系的临床差异主要与4q35区EcoR I片段的长度和是否发生4q-10q易位有关，而性别间的差异及家系内部的变异与EcoR I片段长度无关，前者可能主要源于两性对致病片段的“耐受性”不同，后者则可能与某种未知的动态突变有关。(5)双酶切 剂量分析综合检测方法是一个准确、可靠、相对完善的基因诊断体系，可用于我国FSHD患者的基因诊断，具有较好的临床应用价值。     

面肩肱型肌营养不良症染色体4q35和10q26的易位

目的 了解面肩肱型肌营养不良症(facioscapulohumeral muscular dystrophy,FSHD)患者及中国正常人群中染色体4q35和10q26易位的分布状况。方法 采用BgtⅡ-BinⅠ剂量检测方法,对70名FSHD患者、55名FSHD患者的亲属及52名正常人的染色体4q35和10q26易位的分布状况进行研究。结果 (1)正常人群中4q35和10q26之间总的易位率为19．23％,其中4q35至10q26的易位率为9．62％,10q26至4q35的易位率为9．62％。(2)FSHD患者中4q35和10q26之间总的易位率为18．57％,其中4q35至10q26的易位率为12．86％,10q26至4q35的易位率为5．71％。结论 在中国正常人群与FSHD患者中,染色体4q35和10q26之间较频繁地发生易位,两组之间的易位率差异没有显著性。     

面肩肱型肌营养不良症染色体4q35和10q26易位的研究

面肩肱型肌营养不良症(Facioscapulohumeral musculardystrophy,FSHD)呈常染色体显性遗传,4q35上3.3kb Kpn Ⅰ串联重复单位不同拷贝数缺失与FSHD发病相关。10q26与4q35上(均含P13E-11探针结合位点)具有高度同源序列,两者间容易发生易位。本实验应用BglⅡ-BlnⅠ 剂量检测方法(BglⅡ-BlnⅠdosage test)研究70例FSHD患者、55名FSHD血缘亲属及52名中国正常人群中4q35和10q26易位的分布状况。     

汉族面肩肱型肌营养不良症4q35致病区域基因结构特征及其与临床表型的关系

目的 研究汉族面肩肱型肌营养不良症(FSHD)4q35致病区域基因结构特征,分析位点4qA和4qB的分布规律,探讨基因型与临床表型的关系.方法 研究对象来自52个无亲缘关系家系的62例患者及57名患者血缘亲属.低熔点胶包埋法抽提基因组DNA.同一样品分别进行EcoR Ⅰ酶切、EcoR Ⅰ/Bln Ⅰ双酶切和Hind Ⅲ酶切,脉冲电场凝胶电泳分离,p13E-11、4qA和4qB探针Southern杂交,计算致病性4qA型EcoR Ⅰ片段长度和分布、易位和嵌合体情况、4qA/4qB的频率和基因型分布及基因型-临床表型关系.结果 共榆出携带致病性4qA型EcoR Ⅰ片段患者69例,范围10～38 kb,平均值20 kb±7 kb,散发型和家族型分布差异无统计学意义(t=1.413,P>0.05);检测到3种染色体易位形式,检出率14.49%,4q→10q频率(13.04%)高于10q→4q频率(1.45%)(X2= 6.900,P<0.05);标准型患者中,4qA/4qB杂合型频率(61.40%)高于4qA/4qA纯合型频率(38.60%)(X2=5.930,P<0.05),但两型片段长度分布差异无统计学意义(t=-0.039,P>0.05),不同基因型的临床严重程度(CS评分)差异无统计学意义(H=0.693,P>0.05).结论 95.0%患者携带30 kb以下的4qA型EcoRI片段,4q-10q之间存在高频率的易位蓖组现象,4qA/4qB的杂合型频率明显高于纯合刑频率,但基因型分布对临床表型的异质性无直接影响.     

一般易位和复杂易位对表型和生育遗传效应的比较研究

目的　探讨一般平衡易位和复杂易位对表型和生育的遗传效应。方法　对遗传咨询中的两例平衡易位携带者进行细胞遗传学检测 ,并对 13 6例平衡易位携带者的临床资料进行统计学处理和分析。结果两例携带者的核型分别为 :46,XX ,t(10 ;2 2 ) (10q2 2 ;2 2 q 13 )和 46,XX ,t(1;14;10 ) (1q2 1;14q3 2 ;10p11)。统计学结果显示 ,一般易位导致智能低下和多发畸形的频率各为 3 5 % ;复杂易位所致智能低下频率为 2 1 73 % ,多发畸形的频率为17 3 9%。结论　复杂易位所致智力低下和畸形频率明显高于一般易位 ,其所致畸形程度也较一般易位更严重     

荧光原位杂交在多发性骨髓瘤中的应用

目的:探讨我国多发性骨髓瘤(multiple myloma,MM)常见的染色体异常及其与各项血清学指标和疗效的关系,旨在筛选有效预测疾病预后的指标,为个体化治疗提供依据.方法:运用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)对31例MM患者进行del(13q)、14q32易位、del(17p13)、1q21扩增等细胞遗传学异常检测,其中del(13q)的检测采用了D13S319、RB1两种探针,14q32易位的检测采用IgH探针,del(17p13)的检测采用P53探针,1q21扩增的检测采用1q21探针.分析细胞遗传学异常与患者临床特征、疗效之间的相关性.结果:MM患者13号染色体缺失、14q32易位、1q21异常、17p13缺失的检出率分别为45%、68%、50%、35%;35%的患者同时检出13号染色体部分缺失和14q32易位,79% del(13q)者伴有14q32易位,其中D13S319探针检测阳性者100%伴有14q32易位.31例MM患者诱导治疗后有21例患者达到了轻微反应(欧洲血液和骨髓移植协作组EBMT疗效标准)以上的疗效,总反应率为67.7%,未发现del(13q)、14q32易位、del(17p13)和1q21扩增阳性患者与细胞遗传学异常阴性患者在总反应率上存在差异.结论:国人MM患者的常见染色体异常是del(13q)、14q32相关的易位、1q21异常、del(17p13),其中del(13q)与14q32相关的易位具有密切相关性.     

易位型先天愚型(病例报告)

本文报导一名9岁男性先天愚型患者。用G-显带方法对患者及其父母进行了检查,证实为散发性易位型患者,其核型为:46,xy-14+t(14q21q)。并就易位型先天愚型产生的机理和临床进行了讨论。     

急性早幼粒细胞白血病染色体易位联合R显带和间期荧光原位杂交技术分析

目的探讨荧光原位杂交(FISH)及常规细胞遗传学染色体核型分析技术对急性早幼粒细胞白血病(APL)患者PML/RARa融合基因检测的灵敏度和特异度及其在临床中应用价值。方法选取51例APL患者,应用常规细胞遗传学染色体核型分析方法及FISH技术检测患者PML/RARa融合基因的表达情况。结果在进行常规染色体核型分析的51例患者中41例(80.4%)为t(15;17)(q22;q21)易位的核型异常,其中38例(74.5%)为单纯t(15;17)(q22;q21)易位的核型异常,3例(5.9%)为伴t(15;17)(q22;q21)易位的复杂核型异常;10例(19.6%)无t(15;17)(q22;q21)易位的核型异常中1例(2.0%)为不伴t(15;17)(q22;q21)易位的复杂核型异常,1例(2.0%)为t(11;17)(q13;q21)易位的核型异常,3例(5.9%)为正常核型,5例(9.8%)未见分裂相。在进行FISH检测的51例患者标本中48例(94.1%)有PML/RARa融合基因异常,同时进行常规染色体核型分析和FISH检测的41例患者同时存在t(15;17)(q22;q21)易位的核型异常和PML/RARa融合基因异常,两者符合率为100%;在15例正常骨髓标本的FISH检测中15例标本结果均未发现有PML/RARa融合基因,提示FISH检测技术具有较高的敏感度和特异性。结论对于初发的APL患者,常规染色体核型分析和间期荧光杂交技术结合分析APL患者细胞遗传学特征是诊断该病的有力工具,FISH技术操作更为简单,省时直观。     

阿尔茨海默病与NQO1和载脂蛋白E基因多态性关联分析

目的　探讨NQO1基因C6 0 9T位点突变及其与载脂蛋白 (Apo)E基因相互作用在散发性阿尔茨海默病 (SAD)发病机制中的作用。方法　应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)方法检测了 92例SAD患者和 10 8例正常老年人NQO1基因和ApoE基因多态性分布特征。结果　NQO1T等位基因和T/C +T/T基因型频率SAD组分别为 5 6 %和 89% ,对照组分别为 4 5 %和 71%。SAD组ApoE2等位基因频率显著低于对照组 (χ2 =3.75 3,P <0 .0 5 ) ,而ApoE4等位基因频率高于对照组 ,但差异无显著意义 (χ2 =1.86 3,P =0 .172 )。同时 ,NQO1T/T和T/C基因型与SAD发病相关不受ApoE基因型影响。结论　NQO1基因多态性与中国汉族人SAD发病有明显关联。NQO1基因可能是中国汉族人SAD发病独立的易感基因。     

一般易位和复杂易位对表型和生育遗传效应的比例研究

目的：探讨一般平衡易位和复杂易位对表型和生育的遗传效应。方法：对遗传咨询中的两例平衡易位携带者进行细菌遗传学检测，并对136例平衡易位携带者的临床资料进行统计学处理和分析。结果：两例携带者的核型分别为：46，XX，t(10;22)(10q22;22q13)和46，XX，t(1;14;10)(1q21;14q32;10p11)。统计学结果显示，一般易位导致智能低下和多发畸形的频率各为3．5％；复杂易位所致智能低下频率为21．73％，多发畸形的频率为17．39％。结论：复杂易位所致智力低下和畸形频率明显高于一般易位，其所致畸形程度也较一般易位更严重。     

伴等臂20q-髓系疾病的临床和分子细胞遗传学特征

目的 探讨7例以i(20q-)异常为特征的髓系疾病的临床和分子细胞遗传学特征。方法 采用骨髓细胞直接法和／或短期培养法按常规制备染色体,采用R显带技术进行核型分析,以20q亚端粒探针和20q12单一序列DNA探针进行双色荧光原位杂交(D-FISH)检测。结果 7例患者中骨髓增生异常综合征(MDS)6例,急性髓细胞白血病(AML)1例。3例现尚存活,其余4例均已死亡,他们的生存期分别为6个月(例1),7个月(例2),17d(例4),28d(例5)。染色体核型分析揭示7例均丢失1个正常20号染色体而代之以1或2个比20号染色体还小的中着丝粒等臂染色体,其中6例经FISH检查证实它是伴有20q12中间缺失的20q等臂染色体ider(20)(q10)del(20)(q11q13),即i(20q-)。结论 i(20q-)核型是一种新的少见的再现性染色体异常,它可能和髓系疾病及不良预后有特别的联系。     

散发性结直肠癌染色体10q23～24区域杂合缺失分析

目的抑癌基因的杂合缺失（LOH）被认为是结直肠癌形成的通路之一,本实验拟通过对染色体10q23～24区的LOH分析,发现高频杂合缺失区域并筛查与结直肠癌相关的抑癌基因。方法7个荧光标记的微卫星引物（围绕D10S185位点）与83例结直肠癌的肿瘤和正常组织进行聚合酶链反应（PCR）反应。产物在ABI Prism377自动荧光测序仪进行电泳,以GeneSean3．1和Genotyper2．1软件进行扫描以及杂合缺失分析LOH。与临床病理因素之间的关系比较采用X^2检验。结果7个位点平均杂合缺失率为36．11％,以D10S583位点最高,达54．84％;最低是D10S205,21．3％。发现两个高频杂合缺失区域：一个在D10S583和D10S185之间,大约0．9cM（10q23．33）的距离;另一个在D10S1709和D10S1265位点之间,大约1．5cM（10q24．2～24．31）的距离。D10S1265位点的杂合缺失与Dukes分期显著相关,其余位点与临床病理因素均无显著相关。结论在散发性结直肠癌10q23-24发现了两个高频LOH区域：10q23．33和10q24．2～24．31。除对磷脂酶同族蛋白（PTEN）基因外,10q上可能存在与散发性结直肠癌相关的其他抑癌基因。     

应用微卫星多态标记进行大肠癌中5q21-q22杂合性丢失的初步研究

应用ＡＰＣ基因下游４０Ｋｂ处的微卫星多态标记Ｄ５Ｓ３４６，检测３０例大肠癌组织ＤＮＡ，在可提供信息的１５例杂合子中检出５例５ｑ２１＿ｑ２２的杂合性丢失，占３３％。提示ＡＰＣ基因缺失也是中国人大肠癌的遗传改变之一     

河南林州市居民贲门癌组织的比较基因组杂交分析

目的：探讨贲门癌高发区河南林州市贲门癌组织中的基因组变化，寻找相关未知基因。方法：采用比较基因组杂交的方法（comparative genomic hybridization,CGH)分析10例原发性贲门癌组织基因组变化。结果；CGH分析显示1q(4/10),11q(3/10),3q(2/10),8q(3/10),8p(2/10)为出现频率较高的扩增区，9q(3/10)的缺失可能是贲门癌的特征性变化。结论：1q,11q,3q,8q,8p,9q可能存在与贲门癌相关的未知基因。     

Chromosomal imbalances revealed in primary rhabdomyo- sarcomas by comparative genomic hybridization

Background Previous cytogenetic studies revealed rhabdomyosarcoma. We profiled chromosomal imbalances aberrations varied among the three subtypes of n the different subtypes and investigated the relationships between clinical parameters and genomic aberrations. Methods Comparative genomic hybridization was used to investigate genomic imbalances in 25 cases of primary rhabdomyosarcomas and two rhabdomyosarcoma cell lines. Specimens were reviewed to determine histological type, pathological grading and clinical staging. Results Changes involving one or more regions of the genome were seen in all rhabdomyosarcomal patients. For rhabdomyosarcoma, DNA sequence gains were most frequently （〉30%） seen in chromosomes 2p, 12q, 6p, 9q, 10q, lp, 2q, 6q, 8q, 15q and 18q; losses from 3p, 11p and 6p. In aggressive alveolar rhabdomyosarcoma, frequent gains were seen on chromosomes 12q, 2p, 6p, 2q, 4q, 10q and 15q; losses from 3p, 6p, lq and 5q. For embryonic rhabdomyosarcoma, frequent gains were on 7p, 9q, 2p, 18q, lp and 8q; losses only from 11p. Frequently gained chromosome arms of translocation associated with rhabdomyosarcoma were 12q, 2, 6, 10q, 4q and 15q; losses from 3p, 6p and 5q. The frequently gained chromosome arms of nontranslocation associated with rhabdomyosarcoma were 2p, 9q and 18q, while 11p and 14q were the frequently lost chromosome arms. Gains on chromosome 12q were significantly correlated with translocation type. Gains on chromosome 9q were significantly correlated with clinical staging. Conclusions Gains on chromosomes 2p, 12q, 6p, 9q, 10q, lp, 2q, 6q, 8q, 15q and 18q and losses on chromosomes 3p, 11p and 6p may be related to rhabdomyosarcomal carcinogenesis. Furthermore, gains on chromosome 12q may be correlated with translocation and gains on chromosome 9q with the early stages of rhabdomyosarcoma.     

Loss of heterozygosity of chromosome 20 in sporadic colorectal cancer

Objective To analyze the loss of heterozygosity (LOH) of chromosome 20 in patients with sporadic colorectal cancer to identify additional loci involved in colorectal tumorigenesis. Methods Polymorphic microsatellite markers were analyzed in 83 colorectal cancer patients’ tumor and normal DNA by PCR. PCR products were electrophoresed on an 377 DNA sequencer. Genescan 2. 1 and Genotype 2. 1 software were used in the LOH scanning and analysis. Comparisons between LOH frequency and clinicopathological data were performed by Χ(2) test.P&lt;0. 05 was considered statistically significant. Results The average LOH frequency in the long arm, short arm and whole chromosome 20 was 21. 1%, 26. 7% and 22. 8%, respectively. Chromosome 20 exhibited relatively high LOH frequency, particularly in the regions of 20p and 20q11. 1-q13. 1.Conclusion There is notable genetic instability on chromosome 20 in sporadic colorectal carcinoma patients; that is, mutation on chromosome 20 is closely associated with sporadic colorectal carcinogenesis. Also, there may be tumor suppressor genes related to sporadic colorectal carcinoma near the region 20q11. 1-q13. 1.     

Complex t(8;13;21)(q22;q14;q22)--a novel variant of t(8;21) in a patient with acute myeloid leukemia (AML-M2)

Variants of the t(8;21)(q22;q22) involving chromosome 8, 21, and other chromosomes account for about 3% of all t(8;21)(q22;q22) in acute myeloid leukemia (AML) patients. We report a case of AML-M2 with t(8;13;21)(q22;q14;q22), not reported earlier. Using a dual-color fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis with ETO and AML1 probes, we demonstrate an ETO/AML1 fusion signal on the derivative chromosome 8. Whole chromosome painting probes were used for chromosomes 8 and 13, to demonstrate the three-way translocation t(8;13;21)(q22;q14;q22). Involvement of chromosome region 13q14 has never been reported earlier, although region 13q12 as a variant in AML with t(8;21) has been reported earlier. The possible role of genes in this region in leukemogenesis, its response to the treatment and its clinical implications are discussed.     

习惯性流产夫妇中的3;18平衡易位核型

本文观察了1对习惯性流产夫妇的染色体,其丈夫有46,XY,t(3;18)(3qter→3p22::18q23→18qter;18pter→18q23::3p22→3qter)平衡易位核型,并有一个1qh~+的标记染色体。他们曾不明原因地连续流产3次,大产1胎无脑儿。这个平衡易位携带者为产前检查提供了新的易位核型。     

荧光原位杂交检测骨髓增生异常综合征患者染色体复杂核型变化及临床意义的研究

目的:探讨骨髓增生异常综合征(MDS)患者复杂核型变化及其临床意义。方法:在常规细胞遗传学(CC)方法检测基础上,运用荧光原位杂交技术(FISH),采用多种位点特异性DNA探针(染色体全染、特殊位点、双色易位融合探针)对35例MDS患者进行染色体核型分析。结果:35例MDS患者中有24例出现染色体异常,包括染色体数目及结构的异常,阳性率占68.6%。其中6例出现5号染色体单体或5号染色体长臂丢失;4例出现7号染色体单体或7号染色体长臂丢失;1例出现等臂7号染色体;2例出现8号染色体三倍体;3例出现Y染色体丢失;2例出现16号染色体倒位;5例出现复杂的染色体易位,包括t(6;?),(t8;21)(q22;q22),(t7;?),der(19)(t19;?)(q13.3;?),der(9)(t9;?)(p11;?)(t6;9),(t8;14),(t1;8)。结论:FISH技术在MDS染色体核型分析上可作为重要技术补充手段弥补CC检查的不足,对MDS准确诊断分型、合理治疗方法的选择乃至对预后的评估都具有重要的临床意义。