基于网络药理学分析三七治疗肝细胞癌的作用机制

目的:预测三七主要活性成分治疗肝细胞癌的作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选三七的主要活性成分,并利用SEA数据库预测上述成分的潜在作用靶点;从人类基因组注释(Genecards)数据库获得肝细胞癌相关靶点;利用Venn软件对两者取交集获得三七治疗肝细胞癌的作用靶点。使用Cytoscape3.7.1软件构建有效成分-靶点网络。应用R语言软件包clusterProfiler对上述靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)与代谢通路(metabolic pathway,KEGG)富集分析。结合BioGrid、InWeb_IM、OmniPath数据库构建靶点蛋白相互作用(target protein interaction,PPI),由Cytoscape软件进行可视化并进行网络拓扑分析以获得核心靶点。利用SYBYL-X2软件对核心靶点和对应活性成分进行分子对接验证结合强度。结果:共获得槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、人参皂苷rh2等7个主要活性成分,可作用于肝细胞癌相关的32个靶点;这些靶点显著富集于核受体活性、转录因子活性,直接配体调节序列特异性DNA结合、类固醇激素受体活性、癌症中的蛋白多糖、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药等多个GO和KEGG条目。结论:三七治疗肝细胞癌作用体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,为三七有效成分的筛选及深入研究提供一定科学依据。     

基于网络药理学解析青蒿素治疗结直肠癌的分子机制

目的 基于网络药理学解析青蒿素治疗结直肠癌的分子机制。方法 通过TCMSP、OMIM等数据库对青蒿素的作用靶点及结直肠癌的疾病靶点进行检索筛选,将药物成分靶点与疾病靶点取交集,采用STRING数据库、Cytoscape3.8.2软件及相关插件构建蛋白相互作用网络图,利用DAVID对核心靶点进行GO富集分析、KEGG通路富集分析。采用AutoDock Vina进行分子对接。结果 共筛选获得青蒿素活性成分22个,作用靶点499个,将药物成分靶点与青蒿素疾病靶点取交集共获得靶点12个,构建PPI网络,经拓扑及聚类分析后获得TP53、EGFR、CCND1、CDKN2A、AKT1和RB1等关键靶点。GO分析显示,青蒿素对结直肠癌的作用机制涉及从RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、蛋白质磷酸化、对雌激素的反应等过程。KEGG通路富集为Pathways in cancer通路等;分子对接结果显示,关键靶点TP53与活性成分青蒿素结合能为-4.0Kcal/mol;免疫浸润结果显示TP53表达与CD8⁺T Cell呈正相关。结论 青蒿素治疗结直肠癌具有多靶点、多通路的特点,可能通过关键靶点T...     

基于网络药理学预测红花治疗心肌缺血的作用机制

目的基于网络药理学方法预测红花治疗心肌缺血的潜在靶点及信号通路。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选红花中口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的活性成分及作用靶点。采用OMIM数据库和GeneCards数据库检索心肌缺血相关疾病靶点。获取红花中有效成分的靶点和心肌缺血疾病相关靶基因的共同靶基因。针对共同靶基因,通过在线STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape软件构建可视化的"化合物-靶点-通路"网络,并进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选得到22种潜在的药效成分,218个化合物靶点,531个心肌缺血相关靶基因;后两者取交集后获得39个共同靶点。PPI网络自由度较高的节点为白细胞介素(IL)-6、白蛋白、血管内皮生长因子A、丝裂原激活蛋白激酶8、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3。GO功能富集分析得到48个GO条目,KEGG通路富集分析得到114条信号通路。结论红花可能是通过调节激活转录因子结合、雌激素受体结合、半胱氨酸型内肽酶活性、核激素受体结合、DNA结合转录激活活性等靶点,调控流体切应力...     

藤梨根通过PI3K/AKT信号通路治疗肝癌的网络药理学研究和实验验证

目的 通过网络药理学和体外实验的方法,探讨藤梨根治疗肝细胞癌的有效成分和可能机制。方法使用药物数据库筛选出藤梨根的主要成分和靶点蛋白,利用疾病数据库挖掘肝细胞癌疾病靶点。筛选并标准化处理药物和疾病靶点,使用FunRich 3.1.3软件计算交叉核心基因,绘制韦恩图;将核心基因导入Cytoscape 3.8.2软件构建靶点网络图,通过STRING 11.0数据库构建蛋白质互作网络,通过Metascape数据库进行富集分析。对主要成分和关键靶点,利用Swiss Dock平台进行分子对接。最后通过MTT实验、侵袭实验、划痕实验和Western blot实验验证藤梨根对肝癌细胞的抑制作用。结果 本研究筛选出藤梨根治疗肝细胞癌的主要有效成分有4种:槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素、儿茶素;作用靶点86个;蛋白质互作网络中主要的基因是TP53、AKT1、MAPK1、JUN及RELA等。藤梨根治疗HCC可能的生物过程是:凋亡信号通路、对无机物质的应答等。参与的主要信号通路有:肿瘤信号通路、乙肝相关通路等。各主要成分与AKT1靶点表现出极佳的对接活性。细胞实验证实了藤梨根水提取物可以抑制肝癌细胞的增殖、...     

基于网络药理学探讨白花蛇舌草-半枝莲抗肝细胞癌的作用机制

[目的]基于网络药理学探讨白花蛇舌草-半枝莲药对治疗肝细胞癌的潜在靶点及作用机制。[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索白花蛇舌草和半枝莲活性成分,导入Drugbank数据库进行蛋白靶点匹配,使用GeneCards数据库、人类在线孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、治疗目标数据库(Therapeutic Target Database,TTD)、Drugbank、肝细胞癌肿瘤数据库(Oncogenomic Database of Hepatocellular Carcinoma,OncoDB.HCC)和Liverome数据库等获取肝细胞癌相关靶点,运用Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点”网络,String数据库构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选关键成分及核心靶点,最后利用R语言及Cluego对预测得到的核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。[结果]白花蛇舌草-半枝莲药治疗肝细胞癌的潜在靶点 89个,通过网络拓扑分析筛选得到6个核心靶点、5种关键成分。GO功能富集分析显示,白花蛇舌草-半枝莲药对主要参与细胞增殖、细胞凋亡、炎症反应和血管生成等生物学途径。KEGG通路富集分析显示,p53抑癌基因通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol-3-kinase/protein kinase B,PI3K-Akt)通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)通路、核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)通路等是其关键信号通路。[结论]白花蛇舌草-半枝莲药对中有效成分主要是槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇等,通过调节p53、PI3K-Akt、HIF-1、NF-κB和VEGF等信号通路抑制肝癌细胞增殖,并促进细胞凋亡,减少炎症反应,抑制血管生成,从而实现对肝细胞癌的治疗作用。     

基于网络药理学的左归丸治疗骨质疏松作用机制探讨

目的:采用网络药理学方法探究左归丸对治疗骨质疏松的有效活性成分、作用靶点和潜在分子机制.方法:利用TC-MSP数据库预测左归丸活性成分,筛选潜在的活性成分及作用靶点,在GeneCards数据库检索出骨质疏松相关的疾病靶点基因,通过Drugbank和Uniprot数据库筛选后,得到左归丸—骨质疏松疾病交集基因.采用Cytoscape3.8.2软件构建药物成分—疾病网络图,利用交集基因构建蛋白质互作网络,并获得左归丸治疗骨质疏松的核心网络和核心靶点基因,利用MCODE和Metascape数据库分析核心靶点基因,通过Metascape数据库对相关靶点进行GO生物富集分析和KEGG通路分析.最后,利用体外细胞实验进一步验证.结果:预测得到左归丸245个有效靶点和骨质疏松相关的疾病靶点4576个,两者共同靶点有171个.有效成分中度值较高的是槲皮素、山奈酚、异鼠李素、β-谷甾醇、24-亚甲基苯酚,PPI网络中核心基因是APP、NTRK1、EGFR、CUL3、HSP90AA1.GO富集分析涉及DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、核受体活性;KEGG通路富集分析结果显示,共同靶点可通过AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路等多条信号通路发挥作用.体外细胞实验表明左归丸可能抑制破骨细胞的形成.结论:左归丸可能通过抑制破骨细胞生成相关作用机制发挥预防和治疗骨质疏松症,为后续基础实验研究提供新的思考路线及方法.     

基于分子对接和网络药理学的参附注射液干预深静脉血栓的机制探析

目的利用网络药理学研究方法和分子对接技术预测参附注射液干预深静脉血栓形成的作用机制。方法利用CNKI数据库进行文献检索,挖掘参附注射液主要有效成分,利用SIB数据库预测有效成分作用靶点,通过GeneCards、DisGeNET等数据库筛选出深静脉血栓形成的相关靶标,进而得到参附注射液治疗深静脉血栓的潜在靶点。通过STRING数据库分析潜在治疗靶点蛋白相互作用网络并筛选关键靶点,与利用Cytoscape软件构建的“成分-靶标”网络中的核心有效成分进行分子对接。利用Cluego和David6.8v数据库分别对药物和疾病的潜在治疗靶点进行GO分析和KEGG富集通路分析。结果来自参附注射液中红参和附片中22个有效成分通过干预114个靶点、85条通路发挥干预深静脉血栓形成的作用。AKT1、VEGFA、HSP90AA1、MAPK1、PIK3CA等可能是参附注射液治疗深静脉血栓形成的关键靶点。结论参附注射液有效成分可能通过抑制血管壁细胞炎性反应、抗氧化应激、调节血管稳态等药理作用治疗深静脉血栓形成。     

基于网络药理学和GEO数据研究三七、黄芪和丹参防治缺血性脑卒中作用机制

目的 基于网络药理学和GEO数据研究中药三七、黄芪、丹参防治缺血性脑卒中作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选得到三七、黄芪、丹参中活性成分以及潜在靶点,在OMIM和Genecards数据库中检索获取缺血性脑卒中疾病相关靶点,用Cytoscape软件构建“中药-活性成分-作用靶点”以及“疾病-中药-活性成分-作用靶点”网络图。将三七、黄芪、丹参有效成分靶点与缺血性脑卒中（ischemic stroke,IS）疾病靶点交集后所得相关靶点蛋白通过STRING平台以及Cytoscape软件构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络和潜在核心靶蛋白。利用DAVID平台对潜在核心靶蛋白进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。同时结合GEO数据集对核心靶蛋白进行验证。结果 中药三七中活性成分为13个,黄芪活性成分为21个,丹参活性成分为65个。三七、黄芪、丹参活性成分在IS中的潜在作用靶蛋白160个,其中筛选得到潜在核心靶蛋白8个。核心蛋白在GO富集和KFGG通路富集中涉及脂多糖介导的信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的正调控蛋白磷酸酶、MAPK信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路等...     

基于网络药理学探讨左归丸治疗早发性卵巢功能不全机制

目的基于网络药理学分析左归丸治疗早发性卵巢功能不全的有效活性成分,预测其作用靶点,并探讨其潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台筛选左归丸的活性成分及预测作用靶点,并在Uniprot数据库搜索靶点基因,在GeneCards数据库、CTD数据库、OMIM数据库筛选出早发性卵巢功能不全的靶点基因,通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络和"药物-活性成分-靶点"网络,通过DAVID数据库对核心靶点进行GO富集分析及KEGG通路富集分析并利用R语言和Cytoscape软件绘图。结果以OB值和DL值两个参数筛选得到83个有效化合物,包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇等。与疾病相关的候选作用靶点共181个,关键靶点涉及细胞肿瘤抗原53(TP53)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、转录因子AP-1家族成员(JUN)、肿瘤坏死因子(TNF)。GO富集分析涉及对药物、毒物的应答,基因转录,抑制凋亡等。KEGG通路富集分析显示含靶点数较多的是癌症信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、叉头框蛋白O亚家族信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B通路和丝裂原活化蛋白激酶信号通路。结论研究通过网络药理学系统探讨了左归丸有效成分对应的靶点,以及治疗早发性卵巢功能不全的作用机制,可为今后基础或临床研究提供科学依据。     

基于网络药理学探讨青蒿治疗狼疮性肾炎的作用靶点分析

目的 基于网络药理学探究青蒿治疗狼疮性肾炎的作用靶点及潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索出青蒿中所含有的化学有效成分及作用靶点,并经Uniprot数据库进行名称标准化处理。再利用OMIM和GeneCards数据库检索LN相关基因,利用R软件绘制韦恩图并筛选出青蒿治疗LN的共同作用靶点,利用String数据库构建蛋白互作PPI网络,利用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-疾病-靶点网络可视图并筛选出核心基因,对共同作用靶基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果 从青蒿中筛选得到22个有效成分,去除重复靶点得青蒿靶点42个,LN中相关靶点有842个,利用韦恩图筛选出药物-疾病共同靶点10个。GO功能富集分析显示青蒿治疗LN生物学过程和功能主要集中在细菌反应、膜微区、细胞因子受体结合、信号受体调节活性等。KEGG通路富集分析显示,青蒿治疗LN主要与AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力、TNF信号通路、血脂和动脉粥样硬化、PI3K/AKT信号通路和IL-17信号通路等相关。结论 通过分析药物主要活性成分,构建PPI网络和青蒿-活性成分-靶点-疾病网络图并进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,揭示青蒿治疗LN具有多成分、多靶点和多通路的作用特点,为青蒿临床应用治疗LN的机制提供了思路和方法。     

基于网络药理学鸡血藤治疗肝细胞癌的作用机制研究

目的采用网络药理学研究方法探索鸡血藤的有效成分治疗肝细胞癌的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选鸡血藤口服生物利用度≥30%及类药性≥0.18的有效成分,采用Perl软件预测有效成分的作用靶标。采用GeneCards数据库及OMIM数据库筛选肝细胞癌疾病靶标。将鸡血藤有效成分作用靶标及肝细胞癌疾病靶标取交集后得到中药-疾病共同靶标,采用Cytoscape软件构建中药-成分-疾病-靶标调控网络,并构建中药-疾病靶标的蛋白互作网络及条形图,并筛选出核心靶标。对核心靶标进行功能富集分析与通路富集分析。结果鸡血藤主要通过22种有效成分作用于46个中药-疾病共同靶标,其治疗肝细胞癌的核心基因有EGFR、MYC、Caspase3、cyclinD1、IL-6、VEGFA、ERBB2、ESR1、MDM2、Caspase8等。核心基因涉及的功能主要包括类固醇激素受体活性、半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程、泛素样蛋白连接酶结合、核受体活性、转录因子活性、直接的配体调节序列特异性DNA结合、泛素蛋白连接酶结合、核激素受体结合等;涉及的通路主要包括前列腺癌信息通路、人巨细胞病毒感染信号通路、乙...     

乳香-没药治疗癌性疼痛的网络药理学研究

目的采用网络药理学方法研究乳香-没药缓解癌性疼痛的分子靶点及通路。方法应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选药物主要成分,Uniprot网站获取药物化学成分相对应的人类相关基因,Genecards网站获取癌性疼痛相关基因,绘制韦恩图寻找共表达基因,利用STRING数据平台进行蛋白相互作用网络(PPI)分析,使用软件Cytoscape3.7.2构建成分-靶点相互作用图。利用基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库对核心基因进行富集分析。结果获取乳香-没药有效成分53个,对应人相关基因92个,癌性疼痛相关基因8 585个。通过调控DNA盲转录激活活性、RNA聚合酶Ⅱ特异性等分子功能或过程,调节PI3K-Akt信号通路、MAPK通路来缓解疼痛。结论乳香-没药通过多种化学成分作用于多个靶基因有效缓解癌性疼痛,具体作用有待进一步实验验证。     

基于“成分-靶点-通路”的余甘子网络药理学研究

目的：运用网络药理学方法,研究余甘子的有效成分和作用机制。方法：从中药系统药理学数据库和分析平台检索余甘子的生物活性成分、作用靶点和相关疾病,利用STRING数据库研究靶点间的相互作用关系,利用DAVID数据库分析GO和KEGG,利用Cytoscape及Hiplot软件建立“化合物-靶点”网络、蛋白质相互作用网络（PPI）、“化合物-靶点-疾病-通路”网络进行基因本体（GO）和KEGG富集分析。结果：筛选得到12个有效生物活性成分、59个靶点、107种疾病和113条通路,基因功能分析得到生物学过程（BP）相关通路479条、细胞成分（CC）相关通路44条、分子功能（MF）相关通路78条。结论：余甘子通过广泛作用于多条细胞代谢通路,调节细胞增殖、分化、凋亡的过程,发挥抗炎、抗癌活性作用。网络药理学研究有助于揭示余甘子多成分作用的协同机制。     

芍药甘草汤治疗癌性疼痛作用机制的网络药理学研究

目的:探讨芍药甘草汤治疗癌性疼痛的关键靶点以及作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选芍药甘草汤的有效成分、潜在靶点,运用Genecards、OMIM数据库搜集癌性疼痛的疾病靶点,借助Cytoscape软件构建"药物—成分—靶点—疾病"网络图,使用STRING数据库绘制PPI网络,对关键靶点进行基因本体论(GO)富集分析以及KEGG通路富集分析。结果:芍药甘草汤治疗癌性疼痛的潜在靶点有98个,蛋白互作网络提示IL-6、VEGFA、CASP3、EGFR、MAPK8等可能是芍药甘草汤治疗癌性疼痛的核心靶点。GO富集分析得到127个细胞生物学过程,KEGG通路富集分析得到116条相关信号通路,主要包括MPAK、AGE-RAGE、TNF、ErbB等。结论:芍药甘草汤治疗癌性疼痛可能是多靶点、多通路及多层次的,为进一步研究提供思路与依据。     

黄芪防治糖尿病肾病的网络药理学研究

目的借助网络药理学预测黄芪作为糖尿病肾病治疗的关键化合物,其有效成分的主要作用靶点及相关通路。方法通过TCMSP数据库及文献研究筛选出黄芪的有效成分,利用TCMSP和Pharmmapper数据库预测有效成分的作用靶点,借助Genecards、OMIM、TTD数据库平台获取糖尿病肾病的作用靶点。再运用Cytoscape软件构建药物-靶点-疾病网络图,在String平台构建靶点蛋白质相互作用的网络。最后通过Bioconductor包和R语言进行基因功能注释和KEGG通路的富集分析。结果筛选得到黄芪治疗糖尿病肾病的有效成分20个和有效靶点124个,通过网络药理分析,黄芪有效化合物中槲皮素、山奈酚和异鼠李素三者可能是核心成分,PTGS2、PTGS1等靶点基因在网络中起着关键性的作用,靶点基因的功能多集中在基因转录方面,其作用的生物路径与AGE-RAGE信号通路关系最密切。结论基于网络药理学探讨了黄芪治疗糖尿病肾病多成分-多靶点-多通路的作用特点,为进一步开展黄芪治疗糖尿病肾病的研究提供了新的思路和方法。     

基于网络药理学探讨松花粉抗疟原虫的机制

[目的]应用网络药理学结合生物信息学方法探讨松花粉抗疟原虫的可能机制.[方法]通过检索TCMSP数据库筛选出松花粉活性成分及其相关靶点,并查阅文献进行补充,得到候选有效成分.通过Uniprot数据库将靶点名称转换成基因名称,在GeneCards数据库中寻找疟原虫相关靶点,选择松花粉作用靶点与疟原虫相关靶点的交集筛选出松花粉抗疟原虫的活性成分及作用靶点.利用Cytoscape 3.8.0软件构建松花粉活性成分-作用靶点网络,筛选出关键化合物,通过STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,筛选出关键靶点.采用DAVID在线分析平台对靶点基因进行GO富集分析和KEGG代谢通路分析,明确生物学机制.最后利用AutoDockTools 1.5.6和AutoDockVina软件对与抗疟原虫的相关核心靶点进行分子对接.[结果]从松花粉中筛选出10个有效成分及120个作用靶点,其中与疟原虫相关的作用靶点42个,关键靶点6个.功能分析结果显示,交集基因主要集中在氧化还原过程中.与松花粉抗疟原虫有关系的作用通路可能涉及药物代谢-细胞色素P450、细胞色素P450对异生物的代谢、NF-κB信号通路、细胞黏附分...     

基于网络药理学方法探究秦艽-蚕沙药对治疗类风湿性关节炎的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨秦艽-蚕沙药对治疗类风湿性关节炎（RA）的物质基础及其作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选秦艽-蚕沙药对的活性成分,结合人类基因组注释数据库Genecards筛选治疗类风湿性关节炎的潜在疾病靶点。利用Venny 2.1.0绘制秦艽、蚕沙、疾病的韦恩图,通过药对与疾病的共有交集,基于Cytoscape 3.8.2软件构建成分-靶点-疾病然网络图,利用Cytoscape 3.8.2软件和String数据库构建成分-靶点-疾病网络图和靶点间的蛋白互作网络,使用CytoNCA插件利用BC值筛选出核心靶点,采用Metoscape平台对靶点进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书通路与基因功能富集分析。结果：经过筛选,共获得秦艽-蚕沙的10个有效成分,与类风湿性关节炎（RA）相关的关键化学成分9个,药对-类风湿性关节炎疾病的共同靶点82个,PPI关键靶点21个,GO富集分析结果包括生物过程、细胞组分、分子功能,各筛选出了10条柱状图;KEGG富集分析发现相关信号通路14条。结论：秦艽-蚕沙药对治疗类风湿性关节炎具有多组分、多靶点、多途径的调控特点...     

基于网络药理学探讨康莱特注射液治疗肝癌的作用机制

目的:基于网络药理学探讨康莱特注射液治疗肝癌的作用机制.方法:通过TCMSP数据库筛选康莱特注射液中的有效成分和其作用靶点,通过GeneCards数据库获取筛选肝癌相关的疾病靶点,整合筛选药物靶点和疾病靶点交集的核心靶点,利用Cytoscape 3.6.1软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络.结合String数据库构...     

“温升三阴，肃金秘阳法”抗肝癌的网络药理学研究*

目的 通过对“温升三阴,肃金秘阳法”的网络药理学分析,探讨此治法在治疗肝细胞癌的潜在抗肿瘤靶点及作用机制,为后续实验研究提供有针对性的指导。方法 利用TCMSP数据库对“温升三阴,肃金秘阳法”下对应中药所含化学成分进行筛选并预测其作用靶点。通过Gene Cards数据库、OMIM数据库获得肝细胞癌的相关靶点,然后利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-疾病-靶标关系网络。利用R语言,获得两者的交集靶点蛋白并通过STRING平台进行蛋白质互作网络分析。对关键靶点及相关有效化学成分做分子对接验证。利用DIVID数据库进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 “温升三阴,肃金秘阳法”治疗肝细胞癌的关键成分涉及到槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、豆甾醇;关键靶基因主要有PTGS2、STAT3、HSP90AA1、AKT1等,主要生物学过程有信号转导、氧化还原过程、药物反应、凋亡过程、炎症反应等;作用机制与PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路、乙型肝炎信号通路、MAPK信号通路有关。结论 “温升三阴,肃金秘阳法”对肝细胞癌的治疗作用可能是多靶点、多途径、多层次的,并且可以推测槲皮素和山柰酚可能是其中比较重要的2个有效成分。PTGS2、STAT3、AKT可能是主要的作用靶点。PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路可能是本方发挥作用比较重要的两条信号通路。     

基于网络药理学研究补肾安坤汤治疗早发性卵巢功能不全的作用机制

目的 基于网络药理学研究补肾安坤汤治疗早发性卵巢功能不全（POI）的作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）,得到药物的有效成分和相关作用靶点;依据Uniprot数据库,找到作用靶点的标准名称;基于Cytoscape软件,得到中药成分-靶点网络图;根据Genecards和OMIM,获得疾病靶点基因;依靠STRING数据库和Cytoscape软件,取得与本病相关的核心靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络;依靠DAVID数据库、Cluego软件,进行GO富集分析和KEGG富集分析,利用PubChem数据库、Uniprot数据库、AutoDock Tools软件、DS ViewerPro软件,对主要成分与关键靶点进行分子对接。结果 根据筛选条件得到补肾安坤汤150个有效成分和1088个成分作用靶点;检索POI靶点基因2718个,并获得补肾安坤汤药物与疾病共同靶点166个;分子对接结果显示,筛选出的主要化合物与其对应靶蛋白均具有较好的结合活性。GO功能富集分析显示主要涉及细胞表面等;KEGG通路富集分析,共富集出228条通路。结论 补肾安坤汤治疗POI的作用机制,体现了中药多...