2007年四川省鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源

目的 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术.研究四川省2007年鼠伤寒沙门菌分子流行病学,查找沙门菌污染源,为预测疫情和制定防治措施提供依据.方法 选择Xba I酶对12株鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切,用PFGE对菌株进行分子分型,Bionumerisc统计软件聚类分析.结果 12株鼠伤寒沙门菌用XbaI限制性酶切后,分成5个PFGE图谱类型,其中1个PFGE图谱类型有7株菌株,其指纹图谱的相似性达到100%,该型别占分析菌株的58.33%.其余4个PFGE图谱类型分别有2株菌和1株菌.含7株菌的PFGE图谱型中,源于成都市的菌株4株,攀枝花、自贡和内江市的菌株各1株.结论 PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对鼠伤寒沙门菌食源性疾病的溯源和预警.     

脉冲场凝胶电泳技术在鼠伤寒沙门菌分型中的应用

[目的]探讨脉冲场凝胶电泳(PFGE)在鼠伤寒沙门菌分型中的应用。[方法]选择XbaⅠ酶对鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切、脉冲场凝胶电泳。电泳带用Freeview软件进行相似性比较。[结果]13株鼠伤寒沙门菌经PFGE，根据其条带的差异可分为10个PFGE型别。[结论]PFGE法重复实验结果稳定，分型力较强，适合鼠伤寒沙门菌分型应用。     

应用脉冲凝胶电泳研究伤寒与鼠伤寒沙门菌染色体结构差异

[目的]比较伤寒沙门菌与鼠伤寒沙门菌染色体结构差异,追溯其进化根源,以便对其进行流行病学研究。[方法]用I-CeuI脉冲凝胶电泳技术对哈市几所医院分离的12株伤寒沙门菌和3株鼠伤寒沙门菌进行染色体结构分析,并构建I-CeuI物理图。[结果]两型沙门菌染色体经酶切电泳后均产生7个片段;其染色体总长度分别为4765kb和4725kb。[结论]实验中全部沙门菌染色体结构大致相同,但伤寒沙门菌染色体中存在插入与删除序列,推测可能是两者感染宿主与致病性不同的原因。     

伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳分型方法研究

目的：运用脉冲场凝胶电泳研究宁波市伤寒沙门菌的分子流行病学。方法：选择XbaⅠ酶对伤寒沙门菌染色体DNA进行酶切，采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱，了解其流行状况。结果：14株伤寒沙门菌，根据电泳图谱分析，可分为3个带型。结论：PFGE具有分辨力高，重复性好的特点，是研究伤寒沙门菌分子流行病学较好的基因分型方法。     

2009年江苏省伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳基因分型分析

目的:对江苏省2009年分离出的伤寒沙门菌进行同源性分析.方法:用生化和血清学方法,对江苏省2009年从肠道传染病患者中分离到的伤寒沙门菌进行鉴定.伤寒沙门菌基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,采用脉冲场电泳获得电泳图谱,再利用BioNumerics软件对电泳图谱进行同源性分析.结果:共从江苏省9个地区分离得到39株伤寒沙门菌,BioNumerics分析结果显示,共有31个不同的PFGE带型出现,除5株以外,其余34株分布于8个相似性在85%以上的簇内.结论:江苏省2009年可能存在8个主要的伤寒沙门菌克隆,这些克隆传播可能是同期伤寒流行的主要病原.PFGE指纹图谱为伤寒沙门菌分子分型网络监测打下了良好的基础,为疾病主动监测和传染来源追踪提供了技术支持.     

上海市闵行区鼠伤寒沙门菌病原学与PFGE分型研究

目的了解2015年-2017年闵行区腹泻病监测点鼠伤寒沙门菌的病原学及脉冲场凝胶电泳(PFGE)特征。方法按照《上海市腹泻病综合监测实施方案》进行沙门菌分离鉴定;药物敏感试验采用纸片扩散法(K-B法);PFGE参照Pulse Net China沙门菌PFGE分子分型标准操作规程。结果鼠伤寒沙门菌在2015年-2017年检出率呈逐年增长趋势;鼠伤寒沙门菌对10种抗生素耐药率为四环素56.32%、萘啶酸31.03%、氯霉素20.69%、复方新诺明17.24%、头孢噻肟8.05%、头孢呋辛8.05%、庆大霉素5.75%、环丙沙星3.45%、头孢西丁1.15%、诺氟沙星1.15%,存在多重耐药。PFGE将87株鼠伤寒沙门菌分为62个带型,每个带型含1株~5株菌,分为A、B两大聚类,相似度为57.2%~100%。结论经过多种抗生素共同作用筛选得到的菌株成为鼠伤寒沙门菌扩散的主要来源,在PFGE优势克隆系中能体现。PFGE技术为聚集性病例的追踪溯源提供了分子生物学依据。     

广东省佛山市鼠伤寒沙门菌分子分型及其多重耐药分析

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2005年河南省局部地区伤寒副伤寒沙门菌株脉冲场凝胶电泳分型研究

目的 了解河南省伤寒、副伤寒沙门菌主要流行菌型.方法 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型,NTSYSpc 2.1软件聚类分析.结果 来自河南省两个监测点的伤寒、副伤寒沙门菌6株分离菌,根据XbaI酶切PFGE基因指纹图谱分析,6株菌出现5个PFGE基因型别:甲、乙副伤寒沙门菌,伤寒沙门菌3个PFGE型别.结论明确了2...     

舟山市2018—2020年肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌 PFGE分子分型特征分析

目的 了解舟山市肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特征,为聚集性暴发事件溯源追踪提供依据。方法 用Pulse Net网络实验室标准方法对肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型,并进行聚类分析。结果 舟山市2018—2020年分离到106株肠炎沙门菌和60株鼠伤寒沙门菌,性别比1.1∶1和0.9∶1,集中于每年6～8月(78.3%和80.0%),主要以0～5岁年龄组居多(37.7%和66.7%)。106株肠炎沙门菌分12种带型,菌株间条带相似度84.0%～100.0%;优势带型为P1、P6和P7。60株鼠伤寒沙门菌分53种带型,菌株间条带相似度56.0%～100.0%;各带型包含1～4株菌,B1为优势带型。结论 舟山市肠炎沙门菌PFGE分子分型有明显优势带型,遗传同源性较高;鼠伤寒沙门菌PFGE分子型别众多,条带分散,呈遗传多样性。     

福建省鼠伤寒沙门菌分子流行病学研究

目的了解福建省鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况,探讨各型别的流行及分布特征。方法收集2009-2010年鼠伤寒沙门菌73株,分离自临床患者及从业体检人员,选择XbaⅠ和BlnⅠ进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准。采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱,运用BioNumerics软件进行聚类分析。结果按照100%的相似度可将菌株酶切图谱分为49个PFGE型,其中P1型有15株,占20.55%(15/73),为优势型别,P17型5株,占6.85%;BlnⅠ二次酶切后P1和P17型分别只有5株和2株条带完全一致。P1型集中分布于7～9月,占到P1型菌株总数的86.67%(13/15);其他型别分布比较分散,无明显时间和地区的聚集性。结论福建省鼠伤寒沙门菌PFGE分子分型呈现多态性,该技术可用于菌株间分子流行病学研究,应加强监测的时效性和针对性以利于疾病的溯源和早期预警。     

2005-2007年河南省甲型副伤寒沙门菌PFGE分型

目的了解2005-2007年河南省甲型副伤寒沙门菌流行基因型别。方法菌株用XbaI限制性内切酶酶切,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型,NTSYSpc 2.1软件聚类分析。结果来自河南省登封市伤寒、副伤寒沙门菌监测点的70株甲型副伤寒人源分离菌株,根据XbaI酶切PGFE基因指纹图谱分析,70株菌出现三个PFGE基因型别,分别是0001、0002、0007基因型,其中0001是首次在河南发现的甲型副伤寒基因型别。结论 0001基因型2005年在河南省首次发现,2006-2007年成为甲型副伤寒在当地流行的优势基因型。     

达州市2007-2010年沙门菌监测结果分析

目的掌握达州市腹泻病例中的沙门菌感染率和菌型分布,提高腹泻病例和暴发疫情的实验室检测能力。方法从监测点腹泻病例粪便（或肛拭法）中分离沙门菌并进行生物学鉴定。结果4年共监测腹泻1291例,检出沙门菌52株8个血清型,总感染率为4．03％。临床就诊和暴发疫情腹泻病例沙门菌感染率分别为1．24％和23．60％。检出肠炎和鼠伤寒沙门菌各15株和10株,分别引起腹泻暴发疫情7宗和4宗,是我市流行的主要沙门菌血清型和腹泻暴发疫情的主要致病菌,凉拌菜和卤肉制品是腹泻暴发的高危食品。结论达州市流行的沙门菌血清型别众多,做好沙门菌监测对提高腹泻爆发疫情的应急反应具有十分重要的现实意义。严格生熟操作分开,防止烹调后食品的再次污染是减少食物中毒发生的重要措施之一。     

深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌耐药性及脉冲场电泳分子分型研究

目的了解深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌的耐药性和同源性。方法收集深圳市龙岗区2004—2007年肠道传染病和食物中毒样品中的伤寒沙门菌并用生化和血清学方法进行鉴定,采用改良K-B法进行药敏试验,伤寒沙门菌基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,采用脉冲场电泳（PFGE）获得电泳图谱,再利用BioNumerics软件对电泳图谱进行同源性分析。结果共分离到17株伤寒沙门菌,所有菌株均对青霉素和苯唑西林耐药,对第3代头孢菌素、氨基糖苷类、氟喹诺酮类、氯霉素和复方新诺明敏感。64.7%的菌株对3种或以上抗生素中度耐药或耐药。BioNumerics分析结果显示,共有14个不同的PFGE带型出现,除2株以外其余15株分布于3个相似性在85%以上的簇内。结论深圳市龙岗区伤寒沙门菌的耐药已经成为一种非常普遍的现象,需加强监测。氟喹诺酮类和第3代头孢菌素类抗生素在临床上治疗伤寒沙门菌感染仍然可以取得满意效果。深圳市龙岗区可能存在3个伤寒沙门菌的流行克隆,其传播可能是该区伤寒沙门菌发生的主要原因。     

江苏省食品中沙门菌的监测及其脉冲场凝胶电泳分型研究

目的:建立脉冲场凝胶电泳(PFGE)细菌分型方法,研究我省不同地区、不同种类食品中分离的沙门菌菌株间的同源关系。方法:对2008年从不同地区不同种类食品中分离出的21株沙门菌进行PFGE分子分型,所得结果用BioNumerics软件进行分析。结果:分离的沙门菌存在多种PFGE型别,扬州的生猪肉中分离的沙门菌存在一定的同源关系,2号、3号与4号菌株有88%同源。但无论是同一地区还是同种食品,都没有发现完全相同的PFGE分子型。结论:与其他分型方法相比,PFGE是一种具有高分辨率,高稳定性和高重复性的全新的细菌分子分型方法。在食品安全事件的处理中,它将成为通过细菌分子分型追踪传染源的快速有效方法。     

上海市闵行区食源性疾病监测状况分析

目的 了解上海市闵行区食源性疾病监测状况,为采取有效干措施提供依据。方法 对2006-2007年闵行区5家食源性疾病监测点肠道门诊腹泻病例的登记记录及监测月报表进行分析。结果 检出率最高的为颛桥社区卫生服务中心(9.65%),其次为七宝社区卫生服务中心(6.95%)、市五医院(6.70%);采集样品中,志贺菌、沙门菌和副溶血性弧菌3种致病菌的总检出率为5.74%,其中副溶血性弧菌检出率最高,为3.75%;夏秋季腹泻患者明显多于冬春季,5-10月病例数占全年病例总数的90.88%,病例数最高峰出现在8月,而且8月采集样品致病菌的检出率最高(9.31%);致病的可疑食品中,海水产品阳性检出率最高(12.56%),其次为淡水产品、肉与肉制品。结论 有必要建立食源性疾病监测网络并及时报告监测数据;应加强临床诊断水平,规范采样及提高实验室检测水平;加强多部门间的协作,充分利用现有资源。     

肇庆市副溶血性弧菌血清型、毒力基因和脉冲场凝胶电泳分子分型研究

目的 通过副溶血性弧菌血清型、毒力基因和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型研究,建立肇庆市副溶血性弧菌DNA指纹图谱基因库。方法 对肇庆市食物中毒分离出的28株副溶血性弧菌和食品安全风险监测的各类水产品分离的17株副溶血性弧菌进行血清分型,耐热直接溶血素相关基因(trh)和耐热直接溶血素基因(tdh)PCR检测,对45株副溶血性弧菌进行PFGE分子分型。结果 食物中毒分离的28株副溶血性弧菌,血清型以O₄:K₈(32.14%)和O₃:K₆(25.00%)为主,17株水产品分离的副溶血性弧菌,血清型以O₁:K_UT(42.11%)为主;21株(46.67%)为tdh⁺trh^-菌株,23株(51.11%)为tdh^-trh^-菌株,1株(2.22%)为tdh^-trh⁺。45株副溶血性弧菌的PFGE相似值为3.9%~100.0%,被分为36种不同的PFGE型别,带型100%相同的菌株几乎都出现在同一年代相近的时间点,但也出现了跨年代菌株。结论 肇庆市食物中毒的副溶血性弧菌以O₄:K₈和O₃:K₆血清型为主,多数菌株携带tdh基因。PFGE结果提示肇庆市流行的副溶血性弧菌存在多克隆来源。     

杭州甲型副伤寒分离菌株脉冲场凝胶电泳分型

目的研究杭州部分地区甲型副伤寒暴发与散发分离菌株的分子流行病学关系及菌株耐药状况。方法对2002～2005年杭州地区L县和X区5起暴发疫情和10起散发病例的分离菌株，采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型方法进行分子分型，采用纸片法（K—B法）测定2种分离株的抗生素敏感性。结果分离自2个地区的15株菌株被分为A、B、C、D共4型，A、B、C等3个型密切近缘，同属一个克隆系。L县2005年7月和8月2起暴发菌株和8月3株散发菌株的PFGE型别均属B型，X区2004年12月和2005年9月的2起暴发菌株和9，10月的6株散发菌株的PFGE型别同属C型。4个型别的菌株对复方磺胺甲嚷唑和利福平均100％耐药，对头孢唑啉、头孢曲松、链霉素、庆大霉素、阿米卡星、氯霉素、诺氟沙星、环丙沙星、呋喃唑酮均敏感，对氨苄西林、多西环素和四环素等不同程度耐药。结论除1株散发菌株外，2002～2005年分离自杭州L县和X区的甲型副伤寒病原菌属于同一克隆系。散发病例可能均属于暴发流行后的散发流行。