基于生物信息学的结直肠癌生物标志物的筛选与分析

目的:采用生物信息学方法分析结直肠癌（colorectal cancer,CRC）在转录组中的差异基因,建立基因互作网络,以期筛选出关键基因并探索其发病机制。方法:从TCGA数据库下载CRC转录组数据集,采用edgeR包筛选其差异基因。使用DAVID数据库对差异基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过STRING数据库分析蛋白质互作网络,运用Cytoscape进行关键子网提取并构建KEGG通路-基因互作网络,最后结合生存分析等筛选并验证CRC潜在生物标志物。结果:对转录组数据集分析筛选出5 037个差异基因,其中上调基因1 571个、下调基因3 466个,从5 037个差异基因中提取到1 781个lncRNA。GO富集分析表明CRC的差异基因主要富集在钙离子结合、受体结合及结构分子活性等功能。KEGG富集分析表明其主要参与神经活性配体-受体相互作用和药物代谢-细胞色素p450等通路。使用Cytoscape软件提取出6个关键子网,通过各互作网络共筛选出288个关键基因,结合Kaplan Meier预后分析最终筛选发现67个CRC潜在调控基因（其中已有报道证实22个mRNA和7个lncRNA）具有预后价值,并采用ONCOMINE数据库进行了CRC临床样本验证。结论:本研究筛选出的67个潜在调控基因可作为CRC潜在生物标志物,为研究者创新CRC药物及治疗方案提供了新思路。     

NF-κB与结直肠癌

核因子κB（nuclear factor- κB, NF-κB）是一种重要的核转录因子,在调控细胞周期、凋亡和代谢等生理过程中发挥重要作用;然而,NF-κB在人类多种恶性肿瘤中过表达,在肿瘤的发生、发展和免疫炎症反应中也起着重要的调控作用。在结直肠癌中NF-κB同样呈高表达,且呈激活状态。NF-κB信号通路被激活后,NF-κB转入细胞核内,通过与下游靶基因结合,促进目的基因的转录,从而调控目的蛋白的表达,并介导多条信号通路,促进肿瘤细胞血管生成、增加肿瘤细胞增殖、抗凋亡和促进肿瘤细胞的侵袭、迁移和转移能力,以及对放化疗的抵抗,甚至诱导肿瘤细胞获得干性等恶性表型。研究表明,NF-κB过表达的结直肠癌患者病情进展较快,生存时间较短,NF-κB可作为结直肠癌患者疗效监测和预后监测的一个生物标志物,针对NF-κB及其信号通路的分子靶向治疗为结直肠癌患者治疗提供潜在的策略。     

基于生物信息学和转录组测序分析结直肠癌5-FU耐药关键靶点北大核心

目的:筛选结直肠癌5-氟尿嘧啶(5-FU)耐药靶基因,并探究该基因对结直肠癌耐药细胞的作用及其作用机制。方法:通过GEO数据库分析GSE28702芯片筛选结直肠癌患者5-FU耐药与5-FU敏感的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);利用GO与KEGG数据库对DEGs进行通路富集分析;通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用Cytoscpae的cytohubba工具筛选枢纽基因。构建5-FU耐药细胞株HCT8/5-FU,利用高通量转录组测序鉴定;采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)对诊断价值进行评价并基于TCGA数据库COAD数据集分析关键基因表达及预后;构建TF基因过表达载体转染到HCT8/5-FU细胞系,MTT法检测细胞活力;流式细胞术测定细胞凋亡与细胞周期;qRT-PCR与Western Blot检测基因mRNA和蛋白水平。结果:共筛选出239个DEGs;DEGs主要富集在细胞外囊泡、内吞囊泡腔、药物代谢等通路;PPI得到20个枢纽基因;转录组学显示转铁蛋白(transferrin,TF)在耐药株中显著下调(P<0.05)与生物信息学分析得到的DEGs中TF基因改变趋势相同;与正常结直肠组织相比,癌组织中TF低表达(P<0.05);TF高表达患者总体生存期更长(P<0.05);上调TF表达增强了耐药细胞的5-FU敏感性(P<0.05);上调TF表达增加了5-FU诱导的细胞凋亡与G_(0)/G_(1)期的阻滞(P<0.05);上调TF表达抑制了耐药细胞ABCC1的表达(P<0.05)。结论:基于生物信息学和转录组测序筛选出结直肠癌5-FU耐药靶基因TF,TF基因可能通过调控ABCC1表达降低结直肠癌5-FU的耐药性。     

基于数据挖掘分析KIF14与SSK1在卵巢癌组织中的表达及临床意义

目的:应用生物信息学方法挖掘卵巢癌的相关基因,探讨其表达情况及临床意义,为卵巢癌的诊断和靶向治疗提供依据。方法:从GEO（Gene Expression Omnibus）数据库下载基因芯片数据集GSE23391、GSE18520和GSE54388,利用其在线分析工具GEO2R筛选卵巢癌的差异表达基因（DEGs）。运用数据库DAVID进行GO功能和KEGG通路富集分析,应用Cytoscape软件和STRING数据库构建蛋白互作网络和关键基因模块,挖掘卵巢癌靶基因。利用Oncomine在线分析网站,分析癌症公共数据基因组中卵巢癌KIF14及SSK1 mRNA的表达信息,利用GEPIA、Kaplan-Meier Plotter进行患者生存分析。结果:共筛选出251个DEGs,富集分析显示差异基因在减数分裂、丝氨酸/苏氨酸代谢、启动DNA复制、细胞衰老等方面富集。筛选获得22个DEGs均呈高表达,其中KIF14与SSK1的表达水平与卵巢癌的FIGO分期及总生存率明显相关。结论:本研究通过生物信息学挖掘,发现KIF14与SSK1基因在卵巢癌组织中呈高表达,并且与卵巢癌的预后关系密切,具有指导意义。     

基于网络药理学的参芪扶正注射液治疗癌因性疲乏作用机制探析

目的:探讨参芪扶正注射液（Shenqi Fuzheng Injection,SFI）治疗癌因性疲乏(cancer-related fatigue,CRF)的物质基础与潜在的作用机制。方法:利用TCMSP数据库筛选SFI的活性成分及对应作用靶点基因,检索GeneCards数据库获得疾病CRF相关靶点基因,将两者映射得到SFI作用于CRF的预测靶基因。利用Cytoscape 3.7.2构建SFI活性成分-作用靶点-疾病网络图,采用STRING数据库构建SFI作用于CRF的预测靶基因蛋白互作网络并进行模块分析和关键基因筛选。利用Clue GO插件进行GO 分析和KEGG通路富集分析。结果:获得参芪扶正注射液治疗癌因性疲乏的共27个成分,包括槲皮素(quercetin)、山奈酚（kaempferol）等,主要作用于TP53、IL-6、JUN、VEGFA、MAPK1、PTGS2 6个关键靶基因,涉及AGE-RAGE、IL-17、TNF、Relaxin、CLR、HIF-1、TCR等信号通路,通过改善氧化应激和线粒体功能障碍、调控免疫激活及炎症反应、调节细胞因子等过程共同发挥抗CRF作用。结论:本研究通过网络药理学的方法初步预测了参芪扶正注射液治疗癌因性疲乏的分子机制,可为后续临床及基础研究提供参考。     

基于TCGA数据库筛选胆管癌肿瘤微环境相关的预后基因

目的:运用ESTIMATE肿瘤微环境评分算法,从来自TCGA数据库的胆管癌数据中筛选与肿瘤微环境相关的基因,并利用生物信息学方法分析所得基因在胆管癌中的预后意义。方法:从TCGA数据库中获得45个胆管癌基因表达数据,利用ESTIMATE肿瘤微环境评分算法对其进行评分后,分为高分/低分组,分别筛选差异表达基因后,取交集获取共表达基因。利用DAVID在线分析工具根据对共表达基因进行 GO 功能富集分析和 KEGG通路富集分析。利用来自TCGA数据库中的胆管癌生存数据对共表达基因进行Kaplan-Meier生存分析,筛选后获得预后基因。结合STRING网站中对差异表达基因构建的蛋白互作网络（protein-protein interaction,PPI）,得到网络枢纽基因后使用其他生物学分析工具验证。结果:在45例胆管癌样本中分析筛选出11个与肿瘤微环境相关的预后基因,这些基因表达的上调对胆管癌的不良预后具有显著意义（P＜0.05）。通过蛋白互作网络分析和其他生物学工具分析获得VAV1基因,该基因在免疫调控、细胞凋亡、RET信号通路调控等方面有重要作用。结论:从本研究中筛选出的VAV1基因可作为胆管癌的分子标志物,为胆管癌的诊断、免疫治疗靶点及预后提供参考。     

基于肿瘤数据库分析IGFBP5基因在结直肠癌中的表达及意义

目的研究IGFBP5基因在结直肠癌中的表达水平及临床意义,探讨IGFBP5在结直肠癌发生发展中的作用及其分子机制。方法使用RT-qPCR实验检测IGFBP5在结直肠癌组织和癌旁组织中的表达水平;分别从GEPIA2和Linked Omics数据库分析IGFBP5在结直肠癌组织中的表达与临床病理参数之间的相关性和对预后的影响;使用Linked Omics数据库导出结直肠癌中与IGFBP5相关的前1000位相关基因,并使用DAVID网站分析IGFBP5的分子功能和相关信号通路;使用STRING网站和Cytoscape软件预测与其可能与IGFBP5发生相互作用的蛋白网络。结果RT-qPCR结果显示:IGFBP5基因在结直肠癌组织中表达水平显著性升高(P<0.05);IGFBP5表达水平与结直肠癌N分期呈正相关(P<0.05),而与结直肠癌病理分级、T分期和M分期均无显著相关性(P均>0.05);IGFBP5表达水平越高,患者的总生存期和无病生存期越差(P均<0.05);GO分析结果显示:IGFBP5在结直肠癌中与细胞黏附、血管生成和血管内皮生长因子等多种促癌功能有关(P均<0.05);KEGG分析结果显示:IGFBP5基因与PI3K-Akt信号通路激活有关(P均<0.05);蛋白互作网络图结果显示:在结直肠癌中IGF1、IGF2、SPP1、LTBP1和FAM20C基因与IGFBP5基因关联最紧密。结论IGFBP5基因在结直肠癌组织中表达水平升高,并且IGFBP5的表达与结直肠癌淋巴结转移正相关,与临床预后负相关,因此IGFBP5可作为结直肠癌初步诊断和判断预后的标志物。     

乳腺癌预后相关基因的生物信息学筛选与分析

目的 运用生物信息学技术方法,分析影响乳腺癌患者生存的关键基因,为乳腺癌预后评估及靶向治疗提供理论依据。方法 通过TCGA数据库筛选出乳腺癌样本与正常乳腺样本间的差异表达基因,进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析。构建蛋白互作网络并筛选出关键基因。运用Kaplan-Meier法寻找可能作为乳腺癌潜在预后生物标志物的基因并进行验证,探究预后相关靶基因与分子分型及分期的相关性。运用Timer数据库分析预后相关靶基因与免疫细胞浸润相关性。结果 共筛选出差异表达基因1 285个,其中上调基因318个,下调基因967个(|log₂FC|≥1,P<0.05)。差异表达基因主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、cAMP信号通路等。蛋白互作网络共筛选出10个关键基因(AURKB、CDC20、CCNA2、NCAPG、BUB1、TOP2A、BUB1B、CCNB1、CDK1、KIF11),其中CCNA2、NCAPG、BUB1在乳腺癌组织中表达水平高于正常组织,其高表达与患者总生存期的不良预后相关(P<0.05),同...     

基于生物信息技术探讨雷公藤调控透明细胞肾细胞癌的分子作用机制

目的 通过生物信息学技术筛选雷公藤与透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的共同靶基因，为ccRCC治疗提供新的思路和靶点。方法 从GEO数据库下载ccRCC芯片数据集GSE168845,用在线分析工具GEO2R筛选癌组织与配对的非癌性肾组织间的差异表达基因。从中药分子机制的生物信息数据平台(BATMAN-TCM)获取雷公藤的作用靶点，并与差异表达基因相交，得到共同靶基因。利用STRING和DAVID在线数据库进行共同靶基因功能分析、通路富集分析和蛋白相互作用网络分析，Cytoscape3.7.1版软件对蛋白互作网络行可视化和关键靶点分析。结果 ccRCC组织和正常肾组织间有535个差异表达基因，其中上调基因123个，下调基因412个。BATMAN-TCM数据库预测到雷公藤调控靶点478个，两者共同靶点58个。蛋白互作网络关键基因涉及IL-6、INS、CFTR、IL-4、IL-1B、CASR、ADORA3和PTGER3;基因本体分析显示，共同靶基因主要富集在对刺激反应、对药物反应、参与多细胞生物过程的调节等生物过程。京都基因与基因组百科全书通路主要富集在PI3K/Akt信号通路、环磷酸腺苷信号...     

基于数据挖掘分析COL1A1在胃腺癌中的表达及意义

目的:通过生物信息数据库挖掘分析胃腺癌中COL1A1基因的表达并探讨其临床意义。方法:使用Oncomine数据库分析COL1A1基因在胃腺癌中的表达水平;通过Oncomine数据库摘录数据信息,进行COL1A1基因表达程度与临床病理参数及胃腺癌生存期的相关性分析;最后使用STRING数据库分析COL1A1蛋白-蛋白互作网络,并进行GO基因富集和KEGG通路富集分析。结果:通过Oncomine数据库分析显示,在mRNA水平上,COL1A1在胃腺癌中高表达（P＜0.05）,表达水平与近期预后负相关（P＜0.05）,且Lauren弥漫型胃腺癌COL1A1表达水平高于肠型胃腺癌（P＜0.05）。通过STRING数据库分析显示与COL1A1相关的蛋白有COL6A3、COL5A1、COL6A1、COL5A2等,互作基因的GO基因富集及KEGG信号通路富集分析显示其蛋白涉及的生物学过程、分子功能及细胞定位等方面均与细胞外基质的调控有关,互作基因涉及的主要信号通路为细胞外基质通路、PI3K-AKT等与胃癌的发生发展有关的信号通路。结论:通过对肿瘤基因数据库Oncomine进行数据挖掘分析发现,COL1A1在胃腺癌组织中显著高表达且与患者预后负相关,为胃腺癌的致病机制研究和抗肿瘤靶向治疗提供了理论依据。     

小细胞肺癌差异表达基因的生物信息学分析

目的:应用生物信息学方法挖掘小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)的相关基因,探讨其发病机制,为SCLC诊断和治疗提供靶点。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中下载基因芯片数据集GSE43346和GSE6044,利用在线分析工具GEO2R筛选SCLC的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。应用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络和关键基因模块,筛选SCLC关键基因。运用UCSC和ONCOMINE数据库中的临床组织样本验证靶基因与SCLC的关系。结果:初筛出114个DEGs,富集分析发现差异基因在细胞分裂、细胞周期、有丝分裂、DNA复制等方面存在显著富集。共筛选出12个SCLC靶基因,经临床SCLC组织样本验证关键基因在SCLC组织中存在显著高表达。其中FBXO5、NCAPG、GINS2、GMNN、MCM6、ESPL1、MCM2、NDC80、BUB1B、CCNB2基因可能是SCLC分子发病机制的新靶点。结论:通过生物信息学筛选出10个与SCLC相关的新靶点,表明其可能是未来研究SCLC发病机制、临床诊断和治疗的重要靶基因。     

绿茶提取物EGCG治疗卵巢癌分子机制的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法分析绿茶提取物茶多酚—表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)治疗卵巢癌的分子机制。方法:在PubChem 数据库中查找EGCG活性靶蛋白,在Gene 数据库中查找卵巢癌相关基因,运用Ingenuity Pathway Analysis(IPA)软件,构建二者的信号通路和分子网络并进行分析。结果:二者共同作用的通路有232条,排在前面的主要是癌症分子机制通路、炎症反应通路、细胞因子信号通路;共同的分子网络有6个,也主要体现在“细胞死亡与生存,细胞生长、增殖,细胞发育,DNA的复制、重组、修复,转录后修饰与调控,蛋白质合成”等生物学功能上。预测EGCG作用于卵巢癌的靶点主要为Jun、FADD、NF-κB、BCL2、HIF1α和MMP。结论:EGCG 可通过干预卵巢癌相关癌症分子信号通路上多个靶点发挥治疗卵巢癌的作用。     

胶质母细胞瘤差异表达基因的生物信息学分析

目的:应用生物信息学方法挖掘胶质母细胞瘤(GBM)的相关基因,进而探讨发病机制,为GBM临床诊断和靶向治疗提供理论依据。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载基因芯片数据集GSE4290和GSE15824,应用GEO2R筛选GBM的差异表达基因(DEGs)。采用DAVID数据库进行GO富集和KEGG通路富集分析,分别应用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络和关键基因模块,筛选GBM靶基因。进一步运用ONCOMINE数据库验证临床组织样本中靶基因与GBM的关系。结果:共筛选出76个DEGs,富集分析结果显示DEGs在血管生成的正调节、抗原的呈递和处理、信号转导、调节自噬等方面存在显著富集。共挖掘出POSTN、TAGLN、CALD1、EPCAM 4个GBM靶基因,经证实均在临床GBM组织样本中存在显著上调且靶基因的上调与患者的不良预后密切相关。结论:通过生物信息学共挖掘出4个与GBM显著相关的靶基因,可能是未来GBM发病机制、临床诊断、治疗的重要研究靶点。     

基于生物信息学筛选胰腺导管腺癌关键基因

目的:利用生物信息学方法分析胰腺导管腺癌（PDAC）基因表达谱芯片并筛选关键基因。方法:从公共数据库基因表达数据库（GEO）中下载PDAC基因表达谱芯片GSE28735、GSE15471、GSE101448,共纳入108例PDAC样本和97例癌旁组织样本。应用R语言limma包和impute包筛选差异表达基因。利用DAVID数据库和在线分析工具Kobas分别对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建差异蛋白互作网络并进一步筛选关键基因。结果:3个基因表达谱芯片共有161个差异表达基因（|log2 fold-change(FC)|>2,P<0.05）,包括54个上调基因,107个下调基因。GO功能富集分析显示差异基因与extracellular exosome、extracellular space、extracellular matrix organization密切相关。KEGG通路分析显示差异基因主要富集在protein digestion and absorption、ECM-receptor interaction和focal adhesion等通路。蛋白质相互作用网络图中显示节点最多的10个枢纽基因分别是ALB、COL11A1、COL3A1、FN1、EGF、COL1A1、MMP9、COL5A2、ITGA2、COL6A3。结论:筛选所得的10个关键基因可能在PDAC发生发展中发挥重要作用,有望成为PDAC诊断及治疗的生物学靶标,为进一步研究PDAC发生发展的分子机制提供了理论依据。     

三氧化二砷诱导A375细胞凋亡过程中的信号传导途径研究

背景与目的： 探讨三氧化二砷(arsenic trioxide, As2O3)在诱导人黑素瘤A375细胞凋亡中,对NF-κB、C-IAP2以及Caspase-3信号传导途径的影响。 材料与方法： 将As2O3和Caspase-3 抑制剂Ac-devd-cho单独或联合作用A375细胞后,采用Western blot 法检测NF-κB p65和Caspase-3表达水平,免疫组织化学法检测Caspase-3蛋白的表达,RT-PCR法检测C-IAP2 mRNA表达。 结果： 5.0 μmol/L As2O3单独处理A375细胞12 h和24 h以及As2O3联合Ac-devd-cho处理24 h组,随着As2O3作用时间的延长,Caspase-3激活蛋白增多、NF-κB p65核蛋白和C-IAP2 mRNA表达下降,Ac-devd-cho能够阻断Caspase-3蛋白的活化,而对NF-κBp 65核蛋白和C-IAP2 mRNA表达无明显影响;免疫组织化学法也显示,Caspase-3激活型蛋白随着As2O3作用时间的延长而增高,但能被Ac-devd-cho阻断。 结论： As2O3可诱导A375细胞凋亡,能抑制A375细胞NF-κB、C-IAP2基因的表达,且不被Ac-devd-cho所阻断; As2O3能活化Caspase-3蛋白表达,而此效应可被Ac-devd-cho阻断。推测NF-κB-C-IAP2-Caspase-3通路可能是As2O3诱导A375细胞凋亡的途径之一。     

Identification and characterization of biomarkers and their functions for Lapatinib-resistant breast cancer

Lapatinib, a novel oral dual tyrosine kinase inhibitor blocking HER1 and HER2 pathways, has presented beneficial effects on breast cancer with positive HER2. However, its efficacy is largely limited by the occurrence of acquired drug resistance. In this study, we aimed to explore the underlying molecular mechanisms of Lapatinib resistance using bioinformatics strategies. The gene expression profile of SKBR3-R (acquired Lapatinib-resistant) and SKBR3 (Lapatinib-sensitive) cell line was downloaded from gene expression omnibus database. Then, the differentially expressed genes (DEGs) were selected using dChip software. Furthermore, gene ontology (GO) and pathway enrichment analyses were carried out by using DAVID database. Finally, the protein–protein interaction network was constructed, and the hub genes in the network were analyzed by using STRING database. A total of 300 DEGs, such as HSPA5, MAP1LC3A and RASSF2, were screened out. GO functional enrichment analysis showed that the genes were associated with cell membrane component-related, stimulus-related and binding-related items. KEGG pathway analysis indicated that three dysfunctional pathways, including PPAR signaling pathway, cytokine–cytokine receptor interaction and pathways in cancer, were enriched. Protein–protein interaction network construction revealed that some hub genes, such as PPARG, TGFBI, TGFBR2, TIMP1, CTGF, UBA52 and JUN, might have an association with Lapatinib resistance. The present study offered new insights into the molecular mechanisms of Lapatinib resistance and identified a series of important hub genes that have the potential to be the targets for treatment of Lapatinib-resistant breast cancer.     

基于网络药理学和分子对接的康艾注射液治疗胃癌的分子机制研究

目的:基于网络药理学从靶基因层面研究康艾注射液治疗胃癌的潜在机制。方法:系统检索Pubmed、CNKI等数据库,筛选康艾注射液有效成分;通过PubChem数据库获得所有药物成分的SMILES结构,分别在STITCH、SuperPred及Swiss Target Prediction数据库检索获取药物成分靶基因;通过Disgenet和GeneBank数据库筛选胃癌靶基因;通过R软件取康艾注射液成分及胃癌靶点的交集,根据共同靶点进行GO及KEGG分析,构建药物-疾病-靶点网络药理图;通过分子对接实验验证。结果:共检索到康艾注射液成分相关文献8篇,共筛选到康艾注射液有效成分21种;最终共获得康艾注射液成分靶点155个,胃癌相关靶基因3 720个,共同靶点84个;通过Cytoscape 3.6对STRING数据分析发现Top10-Hub基因分别是TP53、VEGFA、EGFR、TNF、STAT3、ESR1、HSP90AA1、AR、CYP3A4和HDAC1;主要涉及的通路分别是:“Wnt signaling pathway”、“p53 pathway”和“Apoptosis signaling pathway”等;分子对接实验发现VEGFA、EGFR、TNF和STAT3能够与成分稳定结合。结论:康艾注射液通过多基因、多通路发挥治疗胃癌的作用,为中成药临床有效治疗癌症提供客观依据。     

SGPL1在神经胶质瘤组织中的表达及其对细胞增殖和凋亡的影响

目的:探讨SGPL1在神经胶质瘤组织中的表达及其对神经胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响。方法:在TCGA及PROGgene在线数据库中分析SGPL1在神经胶质瘤临床肿瘤组织及正常神经组织中的表达差异,并分析其表达与神经胶质瘤预后生存的关系;在神经胶质瘤细胞系U251和U87中分别敲降和过表达SGPL1,通过RT-qPCR和Western blot实验分别检测SGPL1的mRNA和蛋白表达水平;用CCK-8法、细胞克隆形成实验检测SGPL1敲降和过表达后细胞增殖变化;通过流式细胞术和caspase3/7酶活性试剂检测分析细胞凋亡变化,Western blot实验检测caspase3、PARP及CyclinD1等凋亡相关蛋白的表达;ELISA检测细胞内S1P含量;RT-qPCR检测S1PR5的表达水平;RNA-seq分析SGPL1在神经胶质瘤细胞中调控的信号通路;Western blot实验检测SGPL1敲降和过表达后Phospho-p38-MAPK、Phospho-ERK、Phospho-STAT3及Phospho-NF-κB(p65)的表达变化。结果:TCGA及PROGgene在线数据库分析表明SGPL1在神经胶质瘤组织中高表达并与神经胶质瘤患者的预后生存成负相关。在U251中敲降SGPL1后细胞增殖受到抑制,细胞凋亡增加;在U87细胞中过表达SGPL1后能显著促进细胞的增殖能力。SGPL1表达对S1P信号通路无明显影响;RNA-seq结果表明SGPL1在神经胶质瘤细胞内调控细胞增殖死亡信号通路,SGPL1敲降和过表达可影响p38-MAPK、ERK、STAT3及NF-κB(p65)等细胞增殖生长信号的变化。结论:SGPL1在神经胶质瘤组织中高表达并与生存预后负相关。在神经胶质瘤细胞内SGPL1可调控p38-MAPK、ERK、STAT3及NF-κB(p65)等细胞增殖生长信号通路,其表达可影响神经胶质瘤细胞的增殖和凋亡,可能是一个潜在的肿瘤标志物和治疗的分子靶点。