陕西省汉中市轮状病毒和诺如病毒感染性腹泻监测结果

目的 了解2016—2019年汉中市病毒性感染性腹泻中常见的病原型别变化和流行趋势,为病毒性感染性腹泻防控提供科学依据。 方法 对采集的感染性腹泻病例的粪便标本,分别用胶体金法、Real-time RT-PCR方法进行A组轮状病毒抗原、诺如病毒核酸检测。 结果 822份标本中检出阳性243份,阳性率为29.56%,A组轮状病毒、诺如病毒GⅠ亚型、诺如病毒GⅡ亚型、诺如病毒GⅠ/GⅡ混合型阳性构成比分别为42.80%、5.76%、50.62%、0.82%;不同性别间阳性率差异有统计学意义（P<0.05）;各年龄组间阳性率差异有统计学意义（P<0. 05）;A组轮状病毒、诺如病毒引起的病毒性感染性腹泻有明显的季节性。 结论 2016—2019年汉中市感染性腹泻发病率基本呈现下降趋势,其中病毒性感染性腹泻主要以A组轮状病毒、诺如病毒GⅡ亚型为主,在加强推广接种口服A组轮状病毒疫苗减少3岁以下儿童发病的基础上,应进一步加强诺如病毒的日常监测。     

深圳市龙华区2019年札如病毒基因分型以及进化分析

目的 分析2019年深圳市龙华区札如病毒的基因型别,掌握辖区内札如病毒的流行情况。方法 采用实时荧光定量PCR对283份龙华区感染性腹泻疫情样本进行轮状病毒、诺如病毒和札如病毒核酸检测,对札如病毒阳性样本核酸采用RT-PCR（反转录-聚合酶链式反应）扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传进化分析。结果 2019年龙华区共发生感染性腹泻聚集性疫情24起,共采集283份样本。其中由诺如病毒引起15起（占62.5%）,札如病毒引起4起（占16.6%）,札如和诺如病毒共同引起1起（占4.1%）,未检测出病原体4起（占16.6%）。283份感染性腹泻疫情样本中,诺如病毒检测阳性率为17.7%（50/283）;札如病毒阳性率为8.1%（23/283）,轮状病毒未检出,所有病例无混合感染情况。23例札如阳性样本有5例VP1条带扩增成功,扩增效率为21.7%,基因亚型鉴定分析结果表明2株为GII.3型,3株为GII.4型。结论 在2019年龙华区腹泻疫情方面,GⅡ.3和GⅡ.4型是札如病毒的主要型别。诺如依然是龙华区感染性腹泻中引起散发和暴发的首要病原体,星状,轮状,腺状仅在散发病例中发现,而札如已成为引起急性腹泻病的重要病原体,应尽快开展龙华区对札如病毒的常规检测和进一步的分子分型工作。     

东莞市病毒性腹泻病原学分析

目的了解东莞市病毒性腹泻的病原学分布情况。方法收集2010年7月至2012年9月东莞市东华医院感染性腹泻患者的粪便样品,采用ELISA方法检测轮状病毒,采用Realtime RT-PCR方法检测诺如病毒,采用RT-PCR方法检测星状病毒,采用Realtime PCR方法检测腺病毒。结果检测粪便样品共224份,诺如病毒、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测阳性率分别为17.9%、11.6%、4.5%,0.4%,总检测阳性率为31.3%。对其中22份轮状病毒阳性样品进行血清分型,结果G血清型中,G1型10株,G2型1株,G3型8株,G9型3株。P血清型中,P6型1株,P8型12株,9株未能分型。40株诺如病毒全部为GⅡ型。1株星状病毒经测序分析为1型。结论东莞市腹泻病毒主要感染3岁以下的婴幼儿,诺如病毒和轮状病毒为主要病原体,轮状病毒的分布呈多样性,以G1型为主。     

札如病毒实时荧光RT-PCR的建立与应用

目的 建立一种可快速、全面、准确检测人感染札如病毒的TaqMan探针荧光实时RT-PCR方法。方法 利用Bioedit2.0、MAGE6.0软件对可感染人的GⅠ、GⅡ、GⅣ、GⅤ基因群札如病毒进行保守序列比对,应用Primer6.0、Primer Express 3.0进行引物和TaqMan探针的设计与评价,分别设计了两套引物及TaqMan探针,克隆相应靶基因并构建阳性标准品,建立及优化一步法实时荧光RT-PCR反应体系,并进行灵敏度、特异度、临床标本验证试验。结果 根据基因序列比对分析,札如病毒ORF1与ORF2连接区具有相对高保守序列,针对GⅠ、GⅡ、GⅣ及GⅤ设计了一条共用的下游引物、以及两套上游引物和TaqMan探针,能覆盖当前GenBank可见的感染人的札如病毒基因型,在同一反应管中建立了同时检测札如病毒四个基因群的实时荧光RT-PCR,并可将GⅤ与GⅠ、GⅡ、GⅣ进行初步分型,对人柯萨奇病毒、诺如病毒、轮状病毒、腺病毒等非靶标病原体无扩增,仅对札如病毒有特异扩增,最低检测下限为10拷贝/反应。结论 本研究建立了札如病毒一步法实时荧光RT-PCR反应体系,可将GⅤ与GⅠ、GⅡ、GⅣ区分开来,为腹泻疫情防控和风险评估提供快速、准确的病原学依据。     

长沙市诺如病毒暴发疫情中GⅡ.2[P16]型全基因组分子进化特征分析

目的 对长沙市2020年急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒GⅡ.2[P16]型进行全基因组序列测定以及遗传进化特征分析。方法 采集2020年诺如病毒暴发疫情标本,采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增开放阅读框（ORF）1和ORF 2连接区进行分型鉴定。GⅡ.2[P16]型阳性标本在二代测序Miseq平台进行测序。测序结果进行序列比对及进化分析。结果 2020年本市共发生诺如病毒暴发疫情29起,共采集标本277份,阳性检出率为44.04%（122/277）。分型鉴定发现诺如病毒GⅡ.2[P16]型占比45.08%（55/122）。从疫情分布月份和机构来看,9—12月为暴发高峰,疫情发生在幼儿园和学校占比89.66%（26/29）。对53份GⅡ.2[P16]型ORF1和ORF2连接区序列进行进化树分析发现毒株处于多个分支,序列之间的同源性为98.5%~100%。对4株GⅡ.2[P16]型全基因组序列进行同源性比较发现毒株之间的同源性为98.5%~99.5%,与GⅡ.2[P16]2016-2017（KY771081）毒株同源性为97.9%~98.2%,进化树处于不同亚分支。RdRp区域氨基酸位点发生T396A和T464A突变,HBGA结合位点保守未发生突变。结论 长沙地区诺如病毒暴发疫情中以GⅡ.2[P16]型突变株传播为主,毒株由GⅡ.2[P16]2016-2017持续传播进化而来,并进化为另一个分支。本地区暴发的诺如病毒疫情主要发生在学校以及幼托机构,应持续加强对诺如病毒的监测。     

2011年广东省深圳市病毒性腹泻的病原学监测

目的了解广东省深圳市病毒性腹泻的病原学特征,为腹泻的防治提供依据。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)对2011年深圳市1 158例疑似腹泻患者粪便标本同时进行轮状病毒、诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒四种常见腹泻病毒的核酸检测。结果轮状病毒、诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒的阳性率分别为22.02%、19.43%、1.30%和1.47%。轮状病毒和诺如病毒全年各月均维持较高的感染率;轮状病毒感染有明显的季节特征,秋冬季为发病高峰;诺如病毒感染的季节特征则相反,秋冬季较低,春夏季较高。5岁以下年龄组患者的病毒性腹泻感染率显著高于5岁以上年龄组患者。结论 2011年深圳市病毒性腹泻呈高发状态,轮状病毒和诺如病毒是最主要的病原,其次为星状病毒与肠道腺病毒。应全年加强对病毒性腹泻,尤其是婴幼儿病毒性腹泻病原的监测。     

朝阳地区腹泻儿童病毒感染情况分析

目的了解朝阳地区腹泻儿童中轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒病原体的流行病学特点。方法收集朝阳市第二医院儿科2011年5月-2012年5月因急性腹泻住院的415例患儿（排除细菌性腹泻）,用胶体金法进行轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒病原体的检测,并对检测阳性的标本进行对比分析。结果单纯的轮状病毒、肠道腺病毒及诺如病毒感染腹泻患儿的年龄中位数,不同性别和不同居住地的检出率相似,P〉0.05表示差异无统计学意义。三种病毒的感染率由高到低分别为轮状病毒、肠道腺病毒、诺如病毒和混合感染,检出率分别为64.8%、26.5%、10.8%、2.2%,P〈0.05,差异有统计学意义。各年龄段的病毒病原体分布中,〈6个月的患儿阳性率较低,6~23个月患儿阳性率增高并达到高峰,〉24个月龄患儿减低。结论朝阳市儿童病毒性腹泻的病原体呈多样性,以轮状病毒最为多见,肠道腺病毒次之,诺如病毒最少,且出现了各种病原体混合感染现象。     

朝阳地区腹泻儿童病毒感染情况分析

目的了解朝阳地区腹泻儿童中轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒病原体的流行病学特点。方法收集朝阳市第二医院儿科2011年5月-2012年5月因急性腹泻住院的415例患儿(排除细菌性腹泻),用胶体金法进行轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒病原体的检测,并对检测阳性的标本进行对比分析。结果单纯的轮状病毒、肠道腺病毒及诺如病毒感染腹泻患儿的年龄中位数,不同性别和不同居住地的检出率相似,P>0.05表示差异无统计学意义。三种病毒的感染率由高到低分别为轮状病毒、肠道腺病毒、诺如病毒和混合感染,检出率分别为64.8%、26.5%、10.8%、2.2%,P<0.05,差异有统计学意义。各年龄段的病毒病原体分布中,<6个月的患儿阳性率较低,6~23个月患儿阳性率增高并达到高峰,>24个月龄患儿减低。结论朝阳市儿童病毒性腹泻的病原体呈多样性,以轮状病毒最为多见,肠道腺病毒次之,诺如病毒最少,且出现了各种病原体混合感染现象。     

昌江县某电厂一起诺如病毒暴发疫情的调查

目的 了解诺如病毒感染引起腹泻暴发的特点和流行原因,探讨暴发疫情调查处理的经验,为制定防治对策提供科学依据,预防今后类似事件的发生。方法 采用描述流行病学的方法对昌江县某电厂2016年3月份发生的一起诺如病毒暴发疫情进行调查和分析。结果 本次疫情该电厂第一食堂就餐人员及食堂员工出现腹泻、呕吐等症状的病例41例（含病例搜索）,罹患率为1.64%。采集就餐人员病例和食堂员工肛拭子37份标本,其中10份检出诺如病毒阳性（GⅠ型8份、GⅡ型2份）,10份阳性标本中6例为患者(注：食堂员工4例、到食堂就餐人员2例) 、4例为隐性感染者。经对患者和隐性感染者居家隔离治疗,终末消毒食堂餐具、厨房、餐厅等疫点、疫区,开展爱国卫生运动和健康教育等综合措施后疫情得到控制。结论 本起疫情是由诺如病毒GⅠ型、GⅡ型混合感染引起的急性胃肠炎暴发,可疑的传播途径是食堂员工感染了诺如病毒,在食堂工作过程中,污染了食物、食堂的环境等,导致食堂其他员工和到食堂就餐人员被感染而引起暴发疫情。严格食堂食品卫生安全监督检查,开展健康教育是控制疫情的关键。     

上海市浦东新区2012-2013年病毒性腹泻检测情况分析

目的 了解上海市浦东新区2012-2013年间常见病毒性腹泻的病原学特征,为腹泻病的防控提供依据.方法 收集2012-2013年上海市浦东新区14家监测医院腹泻患者的粪便标本,采用实时荧光定量-聚合酶链式反应(real-time PCR)检测轮状病毒、诺如病毒GⅠ型、诺如病毒GⅡ型、星状病毒、扎如病毒和肠腺病毒.结果 共检测粪便样本4 214份.1 255份样本检出至少1种病毒核酸,核酸阳性检出率为29.78％.轮状病毒、诺如病毒GⅠ型、诺如病毒GⅡ型、扎如病毒、星状病毒以及肠腺病毒的检出率分别为7.6％、1.4％、18.6％、1.6％、1.5％和1.1％.各年龄组均有病毒检出,其中年龄最小的为1岁,最大为92岁,分别为感染轮状病毒和诺如病毒.病毒性腹泻感染不存在男女差异,但不同年龄组的病毒性腹泻感染有差异.不同病毒病原的感染存在不同的高峰期,但主要集中在秋冬季.结论 诺如病毒和轮状病毒是浦东地区病毒性腹泻的主要病原.应该加强对病毒性腹泻的监测,尤其是诺如病毒和轮状病毒.     

成人散发性病毒性胃肠炎的病原学分析

目的了解北京地区成人散发性病毒性胃肠炎中诺如病毒、轮状病毒及肠道腺病毒感染情况和流行病学特点,为临床防治提供理论依据。方法收集北京大学人民医院2005年至2006年成人肠道门诊散发非霍乱水样便腹泻患者粪便标本312份,用聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）进行轮状病毒核酸的检测;分别用德国R—Biopharm公司的酶免疫试剂盒进行诺如病毒和肠道腺病毒抗原的检测。结果312份粪便标本中,轮状病毒核酸检测全部阴性;125份粪便标本中诺如病毒阳性22份,阳性检出率17．6％（22／125）,其中10月份检出率最高,为32．4％（11／34）;92份粪便标本中肠道腺病毒阳性3例,检出率3．3％（3／92）,其中1例诺如病毒和腺病毒混合感染。结论北京地区成人散发性病毒性胃肠炎病原以诺如病毒多见,秋季多发;轮状病毒感染率可能很低。     

基于聚合酶区和衣壳区测序的诺如病毒暴发疫情溯源

目的 分析一起厨工相关诺如病毒暴发的病原学特征,为诺如病毒感染的溯源提供证据。方法 利用Filmarray病原体检测系统初筛,根据感染性腹泻诊断标准WS 271-2007进行细菌分离,同时进行诺如病毒荧光PCR检测,对诺如病毒阳性核酸进行聚合酶区和衣壳区序列扩增,测序比对,利用Mega软件分析同源性。结果 49份患者标本中,诺如GⅡ型阳性率为48.98%(24/49),GⅠ型阳性率为2.04%(1/49),GⅠ、GⅡ混合阳性率为2.04%(1/49);115份厨工及餐饮工作人员标本中,GⅡ型阳性率为13.04%(15/115),GⅠ型阳性率为0.87%(1/115)。38份环境涂抹样中,GⅡ型阳性率为2.63%(1/38)。有17份标本诺如病毒聚合酶区和衣壳区测序成功,其中患者GⅡ型14份,GⅠ型1份,厨工GⅡ型2份。比对结果显示1份GⅠ亚型为GⅠ.P4-GⅠ.5,16份GⅡ亚型均为GⅡ.P7-GⅡ.6。两份厨工和14份患者标本的诺如病毒核酸序列同源性达99%。49份患者标本中,致泻性大肠埃希菌毒力基因阳性率为34.69%(17/49),患者标本中合并诺如病毒核酸阳性和致泻性大肠埃希菌...     

广州市5岁以下儿童病毒性腹泻流行特征

目的了解广州市5岁以下儿童4种主要腹泻病毒的流行病学特征。方法收集广州市2008年哨点医院门诊腹泻患儿粪便686份,采用ELISA法检测轮状病毒、腺病毒和星状病毒抗原,用RIDASCREENELISA试剂盒进行诺如病毒抗原检测,并对以上腹泻患儿的临床资料进行分析。结果686份标本中,4种病毒的阳性率:轮状病毒为34.0%、诺如病毒为20.7%、腺病毒为6.0%、星状病毒为1.2%,其中有混合感染的病例数占5.1%,以轮状病毒混合其他病毒感染为主,占85.7%。4种病毒阳性率男女差异无统计学意义,不同年龄组间阳性率差异有统计学意义(P<0.05),与年龄有关,均以2岁以下患儿为主,分别占阳性总数的93.1%、92.3%、87.8%和100%。轮状病毒有明显的季节特征,10～12月份为发病高峰,诺如病毒等常年均有发病,无特殊的时间分布。混合感染的患儿腹泻症状较重(P<0.05)。结论4种病毒均有检出,以轮状病毒和诺如病毒为主,秋冬季为发病高峰,2岁以下为发病高危人群,同时混合感染现象值得关注。     

深圳市2014-2015年病毒性腹泻病原学特征和流行病学分析

目的 了解深圳地区5种主要腹泻病毒的流行状况、分布特征和病原学特点.方法 收集2014年4月-2015年12月市级哨点医院的腹泻粪便标本,采用多重荧光PCR方法进行病毒检测,应用描述性流行病学方法对监测结果进行分析.结果 共采集腹泻粪便标本600份,病毒核酸阳性130份,检出率为21.67％,诺如病毒核酸阳性株检出率最高,为62份(10.33％),其次是轮状病毒、星状病毒、札如病毒和腺病毒;其中札如病毒核酸阳性检出率男女差异有统计学意义(P＜0.05);各年龄段均有腹泻病毒核酸检出,1～4岁组和30～39岁组腹泻病毒核酸的总检出率最高,分别为34.38％(22/64)和29.59％(29/98),＞60岁组检出率最低为11.94％ (8/67);流行病学资料显示,深圳市全年各月份均有病毒性腹泻发生,1月、2月和3月的检出率较高,而8月份的检出率最低.结论 深圳市病毒性腹泻全年均可发生,各年龄组男女均可感染,2014-2015年深圳市的优势病毒是诺如病毒Ⅱ型和轮状病毒,5岁以下婴幼儿是腹泻病毒监测的重点人群.     

东莞市2012年病毒性腹泻监测结果分析

目的分析东莞市病毒性腹泻中轮状病毒和诺如病毒的感染情况。方法收集2012年1月至2012年12月东莞市人民医院、高埗医院、寮步医院腹泻门诊病人粪便标本,采用ELISA法检测轮状病毒,采用Realtime RT-PCR方法检测诺如病毒。结果检测粪便样品共831份,轮状病毒和诺如病毒的检出率分别为15.64%和17.57%。轮状病毒感染有明显的季节特征,秋冬季为发病高峰;诺如病毒感染则无特殊的季节特征,阳性样品以GⅡ型为主。0~3岁年龄组患者的感染率显著高于3岁以上年龄组患者。结论病毒性腹泻全年均可发生,冬季的感染率较高。各年龄组男女性人群都可感染。应加强对病毒性腹泻,尤其是婴幼儿病毒性腹泻的监测。     

深圳市南山区2012～2013年病毒性腹泻监测分析

目的了解深圳市南山区病毒性腹泻的感染情况。方法采用实时荧光定量-聚合酶链反应对2012年1月~2013年12月南山区227例腹泻患者(非细菌性感染)的粪便标本进行诺如病毒和轮状病毒的核酸检测。结果腹泻患者的病毒阳性率为39.2%,其中诺如病毒和轮状病毒的阳性率分别为28.2%和15.4%。诺如病毒全年各月均有检出,无特殊的季节特征和年龄特征;轮状病毒秋冬季为发病高峰,婴幼儿和老人为轮状病毒感染的易感人群。结论诺如病毒和轮状病毒是辖区内病毒性腹泻的重要病原,应加强全部人群的病毒性腹泻监测工作。     

深圳市诺如病毒感染的流行病学分析

目的分析深圳市诺如病毒感染的流行特征,为制定预防与控制策略提供科学依据。方法对深圳市疾病控制信息管理系统2005～2007年诺如病毒感染性腹泻暴发疫情资料进行流行病学分析;收集2008年深圳市感染性腹泻病原谱哨点监测和福田区婴幼儿非细菌性腹泻病原谱哨点监测样本共779份应用RT-PCR方法检测诺如病毒核酸。结果诺如病毒是深圳市2005-2007年其他感染性腹泻暴发疫情的主要病原,占其他感染性腹泻暴发疫情总宗数的84.61%。深圳市感染性腹泻病原谱哨点监测结果显示,诺如病毒还是非细菌性腹泻的重要病原,在全人群组非细菌性腹泻病毒病原的检测中阳性率达24.69%,高于轮状病毒感染的15.76%。但在婴幼儿非细菌性感染性腹泻病原谱监测中,诺如病毒检出阳性率为16.83%,低于轮状病毒感染的55.77%。诺如病毒性腹泻暴发的高峰在10、11、12、1月,与诺如病毒性腹泻散发的高峰11、1月重合性较好,提示两者存在关联性。结论控制诺如病毒感染对降低法定传染病发病数,防控公共卫生应急事件具有重要意义。