结核分枝杆菌rpoB基因突变的研究

目的 研究农村结核病人中利福平（RIF）耐药结核分枝杆菌（M．TB）临床分离株rpoB基因突变情况。为农村结核病防制提供分子遗传学依据。方法 以标准菌株H37Rv为对照，采用聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR—SSCP）分析技术，对来自苏北2个县2001年的145株M．TB分离株（其中敏感株117株。耐RIF或含RIF耐多药株28株）的rpoB基因突变的发生率进行研究。结果 农村RIF耐药或含RIF耐多药M．TB临床分离株中rpoB基因突变的发生率平均为71．4％，所有受试117株敏感株rpoB基因均无突变。与药敏试验结果对比PCR—SSCP试验的灵敏度为71．4％；其特异度为100％。结论 M．TB耐RIF与rpoB基因突变密切相关，PCR—SSCP方法可检出RIF耐药M．TB的rpoB基因突变。有助于M．TB耐药性的快速检测和耐药性防治。     

合肥地区结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB突变特征研究

目的:了解合肥地区结核分枝杆菌利福平(RFP)耐药株rpoB基因突变特点。方法:应用PCR-直接测序法对合肥地区肺结核病人痰液中分离的90株结核分枝杆菌的rpoB基因629 bp(包括rpoB基因利福平耐药决定区(RRDR)的81 bp)序列进行测定分析。结果:90株结核分枝杆菌中69株对RFP耐药,21株对RFP敏感;69株耐利福平临床分离株中53株发生rpoB基因突变,突变率为76.8%;突变发生在531位丝氨酸的31株,发生率为44.9%,发生在526位组氨酸的8株,发生率为11.6%;还有6株发生了联合突变,发生率为8.7%。21株敏感株中1株rpoB基因发生突变,突变位点是533位亮氨酸。结论:合肥地区结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB基因的RRDR发生了突变,其中531位丝氨酸和526位组氨酸是最常见的突变位点。     

建立5种结核分枝杆菌耐药基因的检测方法

本文通过PCR -SSCP技术 ,以期建立敏感、快速、特异的M .T菌 5种耐药基因的检测方法 ,分析 134例临床耐药株的基因突变情况 ,探讨M .T菌耐药基因突变是否有内在的变化规律。1　材料与方法1·1　标本来源　本研究中所用的M .T标准株由卫生部生物制品鉴定所提供 ,134例临床耐多药株源于我院住院患者痰标本。1·2　试剂　M .T耐药基因检测试剂由本院结核病分子生物学实验室提供。 7H9培养基由美国BD公司提供。1·3　方法　我院住院患者痰标本经Bacter - 96 0培养、药敏后 ,提取DNA ,至 - 2 0℃保存备用。聚合酶链(PCR)扩增 :利用我院…     

结核分枝杆菌利福平耐药株rpoB基因突变特征研究

目的了解郑州市结核分枝杆菌耐利福平临床分离株的相关耐药rpoB基因突变特征。方法应用PCR方法对40株结核分枝杆菌利福平耐药、40株结核分枝杆菌利福平敏感临床分离株及1株H37Rv结核分枝杆菌标准株中包含利福平耐药决定区(RRDR)在内的rpoB基因片段(385bp)进行扩增,并将扩增产物进行测序,以H37Rv结核分枝杆菌标准株的DNA序列作为参比序列,分析结核分枝杆菌临床分离株的突变特征。结果 40株结核分枝杆菌利福平敏感临床分离株及1株H37Rv结核分枝杆菌标准株均未检测到突变,结核分枝杆菌耐利福平临床分离株中有36株检测到突变,突变率92.3%,且突变均位于RRDR区域内;突变位点为8个,共有8个突变类型;最常见的突变热点依次为531位点,该位点突变率为64.1%;526位点,其突变率为12.8%和516位点,其突变率为10.3%。结论 rpoB基因是郑州市结核分枝杆菌对利福平耐药的最相关基因,其中在RRDR内的531位点基因突变率最高,并可通过对rpoB基因的突变检测,对耐多药结核病进行预测。     

rpoB基因突变与结核分枝杆菌利福平耐药相关性研究

目的 探讨临床患者痰标本中分离的结核分枝杆菌rpoB基因突变与利福平耐药之间的关系. 方法 对115株结核分枝杆菌应用L-J药敏培养法,检测对利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、氧氟沙星的耐药情况;根据rpoB基因序列设计包含利福平耐药决定区（RRDR）的扩增引物,PCR法进行扩增,运用生物信息学方法对耐药决定区扩增产物序列进行比对分析,对耐药株与非耐药株基因突变率进行统计学分析. 结果 115株结核分枝杆菌经比例法药敏试验,RIF耐药株53株,占所有菌株的46.09％;53株RIF耐药株中39株rpoB基因存在不同位点的变异,突变率为73.58％,突变位点包括531、526、522、516、513、511,最主要的突变位点集中在531位,引起氨基酸呈Ser531Gln、Ser531Leu、Ser531Trp 3种形式改变;RIF敏感株62株,其中有2株检测到rpoB基因的突变,敏感株与耐药株突变率经McNemar统计检验,差异有统计学意义（P＜0.05）. 结论 岳阳地区rpoB基因变异与利福平耐药呈高度相关,rpoB基因最主要的突变位点位于531位和526位.     

结核分枝杆菌耐RFP快速检测的方法研究

目的应用PCR—SSCP技术直接快速检测痰标本中结核分枝杆菌rpoB基因突变，评价此方法用于结核分枝杆菌利福平（RFP）耐药性的意义。方法采用PCR—SSCP检测痰标本和菌株中结核杆菌rpoB基因突变。结果50例耐RFP菌株中有45例PCR—SSCP条带与结核分枝杆菌H37Rv条带有明显差别，与药敏试验结果做对比，PCR—SSCP检测敏感性为90％，特异性为100％；12例敏感菌株与H37Rv条带一致，35份肺结核病人痰标本，21份痰PCR扩增阳性，15份SSCP图谱与H37Rv图谱有差别，而且PCR—SSCP28份图谱与H37Rv有差别，阳性率为80％。结论PCR—SSCP检测结核分枝杆菌rpoB基因突变快速、简便、易行，有望用于结核分枝杆菌RFP耐药性的快速测定，并将成为直接检测临床标本中结核分枝杆菌耐RFP快速方法。     

宁波地区不同基因型利福平耐药结核分枝杆菌耐药特征

目的 应用全基因组测序技术分析宁波市利福平耐药结核分枝杆菌(RR-TB)耐药特征,为RR-TB感染患者的临床诊疗及疫情防控提供科学依据。方法 选取宁波市耐药肺结核唯一定点诊疗机构(宁波市第二医院)耐药监测期间保存的2018-2019年59株RR-TB临床分离株,提取总DNA后进行全基因组测序。应用Perl脚本处理原始数据,并通过结核分枝杆菌(MTB)耐药基因数据库确定耐药基因相关突变,同时结合表型药敏试验结果综合分析本地区RR-TB临床分离株对异烟肼(INH)、利福平(RIF)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)、阿米卡星(AM)、卷曲霉素(CAP)、左氧氟沙星(LFX)、丙硫异烟胺(PTO)及对氨基水杨酸(PAS)9种抗结核药物的耐药特征。结果 59株RR-TB菌株INH、RIF的耐药率分别为83.05%、100.00%;基于全基因组测序的59株RR-TB菌株共检测到40种耐药相关基因突变类型,其中以katG基因Ser315Thr(62.71%),rpoB基因Ser450Leu(62.71%),rpsL基因Lys43Arg(50.85%)和embB基因Met306Val(30.51%...     

云南省结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB突变特征分析

目的 分析云南省结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB突变特征。方法 应用聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）法对1株H37Rv结核分枝杆菌标准株及102株结核分枝杆菌临床分离株中包含"利福平耐药决定区"在内的rpoB基因片段进行扩增,并将扩增产物进行直接基因测序,测序结果用MEGA 5软件进行分析。结果 利福平耐药基因型与表型的符合率为92.00%（69/75）,突变类型11种,涉及氨基酸11种,均为碱基的点突变,单位点突变占92.96%,联合突变占7.04%,突变率最高的位点依次是rpoB531（43.66%）、rpoB526（26.76%）、rpoB516（9.86%）,前3个位点的突变占总突变的80.28%。初复治患者临床分离株rpoB耐药突变位点构成差异无统计学意义（（口恶）2=7.653,P=0.354）;耐多药结核与单耐利福平临床分离株rpoB突变位点构成差异有统计学意义（（口恶）2=16.917,P=0.010）。结论 对rpoB的突变的检测在云南省可作为利福平耐药筛查的重要指标。rpoB基因突变可能不受是否使用过利福平和使用时间长短的影响,但是异烟肼可能会影响结核分枝杆菌rpoB基因突变的分子机制。     

结核分枝杆菌利福平耐药基因突变的研究

目的评价检测rpoB基因突变在结核分枝杆菌耐利福平（I肝）耐药性测定中的应用价值。方法采用DNA序列分析法和聚合酶链反应-单链构象多态性（PER—SSCP）法对91株结核分枝杆菌临床分离株（其中药物敏感株35株，耐RFP或含耐RFP耐多药株56株）rpoB基因核心区域的突变情况进行检测。结果以结核分枝杆菌H37RV为对照，所有35株药物敏感株的rpoB基因均无突变，用DNA序列分析方法检测56株耐药株中53株发生突变，敏感性为94．6％（53／56），其中最常见的突变位点是531位丝氨酸和526位组氨酸。PER—SSCP检测56株耐RFP分离株中，52株rpoB基因SSCP图谱异常，其敏感性为92．9％（52／56）。结论DNA序列分析对判断结核分枝杆菌耐利福平非常有价值。PER—SSCP可初步筛选结核分枝杆菌RFP耐药性。     

结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药与embB基因突变的相关性研究

目的分析西安地区耐乙胺丁醇(EMB)结核杆菌临床分离株embB基因突变的特点,建立快速检测结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药性的方法。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测104株结核分枝杆菌临床分离株的embB基因。结果以H37Rv标准株为对照,35株药物敏感株的SSCP和RFLP分析结果均与标准株一致,不存在突变;69株耐乙胺丁醇分离株中,39株(56.52%)SSCP泳动与标准株不一致,存在基因异常;19株(27.54%)RFLP分析存在基因异常。结论西安地区结核杆菌临床分离株对乙胺丁醇耐药与embB基因(尤其是306位密码子)突变有关,PCR-SSCP和PCR-RFLP技术可快速、准确地检测结核分枝杆菌对EMB的耐药性。     

唐山地区结核分枝杆菌耐药及基因突变特征

目的 了解唐山地区结核分枝杆菌的耐药特征及其药物靶基因位点突变特征。方法 问卷调查193名研究对象的一般情况和疾病相关情况,并分析其特征与分离菌株药敏类型的相关性;抗酸染色和胶体金法确定结核分枝杆菌感染;采用试剂盒鉴定药敏类型;通过测序鉴定靶基因位点突变情况。结果 不同药敏类型菌株宿主的BMI、职业、居住地和抗生素用药史的差异具有统计学意义（P＜0.05）;193株临床分离株对一线、二线药物耐药率为37.31%和75.65%;耐药率排序前三位的药物为阿莫西林（53.37%）、氯法齐明（39.38%）和对氨基水杨酸（25.39%）;总突变率前三位分别为embB 306位点（80.66%）,ropB 531位点（72.62%）和rpoB 526位点（55.36%）;60%的基因位点只测得一种突变类型。结论 唐山地区结核分枝杆菌耐药率较高,药物靶基因位点突变率与其他研究报道相近但突变类型较为单一。     

山东地区结核分枝杆菌临床菌株基因型特征研究

目的 探讨山东地区结核分枝杆菌临床分离菌株的基因型特征,评估不同基因型分布对于耐药结核菌近期传播的影响.方法 在山东地区选取13个结核病防治机构作为监测哨点收集临床分离菌株和相关信息,应用分枝杆菌散在重复单位(MIRU)技术分析结核分枝杆菌DNA多态性.结果 1年的研究期内共获得558株结核分枝杆菌,对12个MIRU位点进行检测共产生143个基因型,其中成簇基因型66个,成簇率86.2%.74.6%的菌株属于北京家族,177个(31.7%)菌株属于山东基因型.耐多药菌株的近期感染估计值明显低于敏感菌株.结论 山东地区结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,山东基因型菌株在人群中具有较强的传播能力.     

莫西沙星抗结核分枝杆菌浓度标准的研究

目的 通过比较新患者与复治患者分离结核分枝杆菌的莫西沙星最低抑菌浓度(MIC)的差异,确定莫西沙星的临床耐药界限.方法 根据患者治疗史,选取109例肺结核病新患者分离出的菌株以及使用过莫西沙星治疗复治患者31例分离出的菌株,共140株,以罗氏含药培养基测定MIC,并分析MIC分布状况,比较MIC累计百分比,通过新患者菌株和复治患者菌株差值最大时的MIC作为耐药界限.结果 来自既往未用过莫西沙星治疗新患者的临床分离株中,94.50％的菌株MIC＜0.4 μg/ml,既往曾接受莫西沙星治疗的临床分离株中,MIC＞1.0 μg/ml占93.55％.结论 根据MIC分布,两类患者分离的结核分枝杆菌对莫西沙星MIC的差异,提示使用罗氏培养基的莫西沙星药敏试验耐药界限采用1 μg/ml为宜,复治患者中仍有6.45％对莫西沙星敏感.     

2018年珠海市某医院227株结核分枝杆菌药敏特征分析

目的掌握珠海地区结核分枝杆菌耐药水平,为给结核病患者制定合理的抗结核方案提供科学依据。方法收集中山大学附属第五医院2018年1月至2018年12月肺结核患者的痰液或肺泡灌洗液的标本,进行分枝杆菌培养、菌种鉴定和药敏试验,最终纳入227例进行统计分析。结果 227株结核分枝杆菌,对12种结核药物全敏感占71.8%(163/227),总耐药、单耐药、多耐药、耐多药、广泛耐药、利福平耐药比率分别为28.2%(64/227)、11.9%(27/227)、4.4%(10/227)、4.8%(11/227)、1.3%(3/227)和6.6%(15/227),其中初治患者分别为26.6%(54/203)、11.8%(24/203)、4.4%(9/203)、4.4%(9/203)、0%(0/203)、4.9%(10/203),复治患者分别为41.7%(10/24)、12.5%(3/24)、4.2%(1/24)、8.3%(2/24)、12.5%(3/24)和20.8%(5/24)。四种一线抗结核药的耐药率依次是:S(16.7%)、H(12.8%)、R(6.6%)、E(3.5%)。复治患者的结核分枝杆菌对...     

2014—2015年宜昌市新患者结核分支杆菌基因突变及耐药情况

目的检测宜昌地区结核分枝杆菌(MTB)的感染及耐药情况,为本地结核病的防治和分子流行病学研究提供科学依据。方法收集宜昌地区2014年1月到2015年12月所有新患者涂阳痰标本和涂阴培阳菌株提取DNA,采用基因芯片技术检测利福平相关rop B基因511(T→C)、513(C→A)、516(G→T,A→T,A→G)、526(C→T,C→G,A→T,A→G)、531(C→T,C→G)、533(T→C)位点及异烟肼耐药相关Kat G基因的315(G→C,G→A)位点和inh A基因的-15(G→T)位点突变情况。结果基因芯片法共检测2 271位新感染MTB患者,其中男性占72.35%(1 643/2 271),女性占27.65%(628/2 271),两个年度中结核病新患者利福平、异烟肼总耐药率为8.72%(198/2 271),rop B基因一共有171例发生突变,突变频率最高的是531(C→T),突变频率为57.31%(98/171),其次是511(T→C)和526(C→T),突变频率分别为11.11%(19/171)和10.53%(18/171)。katG和inhA基因一共有211例发生突变,其中150例为kat G基因突变,突变率为71.09%,51例为inh A基因突变,突变率为24.17%,kat G和inh A基因同时突变的有10例,突变频率为4.74%,突变频率最高的是315(G→C),突变频率为67.78%(143/211)。结论宜昌地区结核病新患者对利福平和异烟肼的总耐药率为8.72%,男性感染者高于女性,且随着年龄增大感染率增高。     

青海地区结核分枝杆菌快速检测及耐药特征研究

目的探讨青海地区耐药结核分枝杆菌(MTB)的相关基因型特点,为开展耐药结核病快速诊断提供依据。方法选择2011年6月-2012年12月西宁市区、农村和农牧区结核病患者的MTB标本各300份,采用MTB微量最低抑菌浓度(MIC)法对耐药结核病进行快速诊断,同时用传统的罗氏药敏法作为对照,采用测序方法分析耐药MTB在不同人群中的分布率,了解青海地区MTB耐药的基因突变特征,基因突变分布和主要流行突变位点。结果西宁市区与农牧区单一耐药及多耐药MTB耐药率比较,牧区明显高于西宁市区和农村,差异有统计学意义(P<0.05);rpoB、katG、gyrA突变率西宁市区分别为52.83%、52.83%、37.74%,农村分别为70.97%、62.90%、45.16%,牧区分别为92.55%、86.17%、81.91%,牧区的基因突变率与西宁市区、农村比较,差异有统计学意义(P<0.05);利福平最常见的突变位点为drpoB(531)占43.66%,异烟肼最常见的突变位点为katG(315),占61.27%;氧氟沙星最常见的突变位点为gyrA占59.52%。结论对青海地区耐药结核分枝杆菌的耐药特征有了进一步了解,为临床医师治疗结核病合理选药提供了依据。     

结核分枝杆菌耐多药情况分析

目的：评估上海市近年来耐多药结核病（MDR—TB）发生情况。方法：对本市2749株结核分枝杆菌耐药性测定结果进行分析。结果：共查出234株耐多药菌株，其中新发病。组156株（6．8％），复治病人组35株（18．9％），外地病人组43株（15．8％）。234株耐多药菌株中，耐2药133株（56．8％），耐3药66株（28．2％），耐4药35株（15．0％）。耐2药菌株中，以HR耐药为主，占27．8％。耐3药菌株中，以HRS耐药为主，占66．7％。复治病人和外地病人组的耐多药率显著高于新发病人组，P＜0．01。结论：必须加强对复治病人和外地病人的管理和治疗。     

兰州地区结核分支杆菌耐药性分析

目的 分析兰州地区2005～2007年结核分支杆菌耐药情况,为结核病的防治提供科学依据.方法 利用比例法对215株菌株进行药物敏感性检测,用SPSS 11.0进行统计分析.结果 兰州地区结核分支杆菌总耐药率为47.51％,耐多药率4.75％,低于2001～2004年统计结果,原发性耐药占耐药菌株总数的55％,获得性耐药率为46.59％.结论 兰州地区结核病患者结核分枝杆菌耐药率有所下降,但结核病传染源的控制、结核病防治宣教及结核病短程化疗(DOTS)健康教育和促进工作都需进一步加强.     

重庆市结核患者耐药结核杆菌embB306分子突变特征研究

目的 了解重庆结核杆菌的embB306突变特征,评价其作为诊断乙胺丁醇(ethambutol,EMB)耐药结核杆菌分子标记物的临床应用价值.方法 采用DNA测序方法分析重庆市结核患者痰中分离的51株EMB耐药结核杆菌和50株EMB敏感株的embB基因突变特征,与传统药敏实验进行诊断学试验评价embB306突变作为EMB耐药株分子标记物的临床应用价值.结果 embB306突变率在51株EMB耐药和50株敏感结核杆菌中分别为75.5%、6%;其中来自复治病例的EMB耐药菌株的embB306突变率是87.5%,高于来自初治病例的48.1%;embB306突变率随菌株耐药数量增加而升高,embB306在EMB耐药的耐多药菌株(Multidrug-Resistant Tuberculosis,MDR-TB)中的突变率高于EMB耐药的非MDR-TB和EMB敏感的MDR-TB的突变率;以embB306突变诊断EMB耐药菌株的诊断学试验评价主要指标为:灵敏度为66.7%;特异度为94.0%;准确度为80.2%;Youden指数为60.7%.结论embB306突变是重庆地区结核杆菌产生EMB耐药性的主要分子机制,且与耐药数量和治疗时间有关,其作为EMB耐药菌株诊断的分子标记物具有一定临床应用价值.