基于网络药理学探讨黄芪桂枝五物汤防治糖尿病周围神经病变作用机制

目的 基于网络药理学探讨黄芪桂枝五物汤防治糖尿病周围神经病变（DPN）的作用靶点及分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选黄芪桂枝五物汤组方药物的化学成分,运用SwissTargetPrediction数据库预测成分的潜在作用靶点;通过TTD、DisGeNET、GeneCards数据库获得DPN基因靶标。经韦恩分析得到交集靶点;利用STRING 11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络;运用Cytoscape 3.7.2构建黄芪桂枝五物汤防治DPN的药味-成分-靶点-通路-疾病网络,通过拓扑学分析筛选核心靶点及核心成分,利用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析,预测黄芪桂枝五物汤防治DPN的作用机制。结果 获得黄芪桂枝五物汤74个有效成分,包括槲皮素、山柰酚、儿茶素等,得到黄芪桂枝五物汤防治DPN靶点108个,有效成分核心靶点主要有AKT1、MAPK8、AKT2等。KEGG通路富集结果表明,黄芪桂枝五物汤主要作用于缺氧诱导因子信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、糖尿病并发症中晚期糖基化终产物-AGE...     

基于网络药理学三七治疗缺血性脑卒中的作用机制研究

目的探讨三七治疗缺血性脑卒中的有效成分、靶点及通路,以及可能的分子机制。方法通过中药系统药理学分析平台获取三七活性成分;利用UniProtKB数据库、DisGeNET数据库筛选出三七治疗缺血性脑卒中关联的作用靶标;采用Cytoscape3.6.0软件建立三七有效成分-缺血性脑卒中作用靶标网络;通过DAVID数据库构建作用靶标之间互相作用网络,获得京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路、基因肿瘤学(GO)分类富集分析结果,建立有效成分-作用靶标-信号通路网络。结果筛选出了三七治疗缺血性脑卒中5个有效成分(豆甾醇、β-谷固醇、人参皂苷rh2、槲皮素、三七皂苷r1),141种交集靶标,5个核心靶标(白细胞介素-6、蛋白激酶B、c-JUN蛋白、肝磷脂结合表皮生长因子、血管内皮生长因子A)。低氧诱导因子-1通路、磷酯酰肌醇3激酶/蛋白激酶B通路、丝裂原活化蛋白激酶通路是三七治疗缺血性脑卒中的重要信号通路。结论三七通过自身有效成分作用多个靶标基因治疗缺血性脑卒中,其作用机制可能是通过信号通路获得非常复杂的网络药理调节完成的。     

基于网络药理学研究十全育真汤治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的运用网络药理学方法预测十全育真汤治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubMed等相关数据库,筛选出十全育真汤的活性成分及对应靶点;通过GeneCards等疾病数据库筛选出NSCLC相关靶点;将药物靶点与疾病靶点相映射得到十全育真汤治疗NSCLC的靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件筛选出关键活性成分,并构建"药物-靶点-疾病"网络;采用DAVID 6.8数据库分析基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路;采用STRING V11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。结果筛选出十全育真汤治疗NSCLC的关键活性成分26个,包括槲皮素、木犀草素和山柰酚等,关键活性成分对应的靶点182个; GO功能及KEGG富集分析显示,信号通路主要涉及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路和血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等15条通路; PPI网络分析显示,十全育真汤治疗NSCLC的核心靶点主要集中在细胞增殖、凋亡、细胞周期、炎症及血管生成等方面。结论十全育真汤治疗NSCLC的作用机制可能与提高免疫、抑制血管生成及促进细胞凋亡等有关。     

基于网络药理学探讨左归丸治疗早发性卵巢功能不全机制

目的基于网络药理学分析左归丸治疗早发性卵巢功能不全的有效活性成分,预测其作用靶点,并探讨其潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台筛选左归丸的活性成分及预测作用靶点,并在Uniprot数据库搜索靶点基因,在GeneCards数据库、CTD数据库、OMIM数据库筛选出早发性卵巢功能不全的靶点基因,通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络和"药物-活性成分-靶点"网络,通过DAVID数据库对核心靶点进行GO富集分析及KEGG通路富集分析并利用R语言和Cytoscape软件绘图。结果以OB值和DL值两个参数筛选得到83个有效化合物,包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇等。与疾病相关的候选作用靶点共181个,关键靶点涉及细胞肿瘤抗原53(TP53)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、转录因子AP-1家族成员(JUN)、肿瘤坏死因子(TNF)。GO富集分析涉及对药物、毒物的应答,基因转录,抑制凋亡等。KEGG通路富集分析显示含靶点数较多的是癌症信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、叉头框蛋白O亚家族信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B通路和丝裂原活化蛋白激酶信号通路。结论研究通过网络药理学系统探讨了左归丸有效成分对应的靶点,以及治疗早发性卵巢功能不全的作用机制,可为今后基础或临床研究提供科学依据。     

基于网络药理学探究大泻心汤治疗肺癌的作用机制

目的 运用网络药理学方法探究大泻心汤治疗肺癌的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取大泻心汤中单味药的活性成分及其靶点。利用疗效药靶数据库(TTD)、DisGeNET数据库查找肺癌相关靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件确定该复方治疗肺癌的关键靶标,绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)图,同时构建“中药-化合物-靶点-疾病”网络构建图。使用DAVID平台对共同靶点进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,并使用Omicshare Tools进行可视化。结果 大泻心汤共筛选获得164个活性成分,与肺癌疾病靶点交集出154个共同靶点,通过筛选共同靶点得到27个关键靶点,主要为信号转导和转录活化因子3(STAT3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)及肿瘤抑制基因TP53等。GO功能分析显示与细胞氧化应激反应、核受体、转录因子调节等有关;KEGG信号通路富集分析得到173条信号通路,主要涉及乙型肝炎、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、小细胞...     

西洋参茎叶三醇组皂苷抗缺血性脑卒中作用机制的网络药理学和分子对接分析

目的：利用网络药理学和分子对接技术探讨西洋参茎叶三醇组皂苷(PQTS)在缺血性脑卒中(IS)发生发展过程中潜在的作用机制。方法：整合Swiss Target Prediction、中医药百科全书(ETCM)、 SEA Search Server和DisGeNET等数据库获取PQTS作用于IS的潜在靶点。利用STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件构建潜在作用靶点的蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并通过拓扑网络分析得到PQTS作用于IS的核心靶点。通过DAVID在线分析网站进行潜在作用靶点的基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,获取相关信号通路。应用Cytoscape 3.9.1软件构建PQTS-靶点-信号通路网络,进行拓扑网络分析,筛选PQTS潜在主要活性成分。通过AutoDock Vina软件对活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果：得到PQTS作用IS的潜在作用靶点122个,GO功能富集分析主要涉及细胞凋亡调控、细胞内信号传导过程和细胞对外源性物质的调控等生物学过程,KEGG富集分析涉及白细胞介素信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白...     

基于网络药理学探讨振中汤治疗类风湿关节炎作用机制

目的:采用网络药理学的方法,对振中汤治疗类风湿关节炎(rheumatic arthritis,RA)的作用机制进行探讨研究.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对振中汤活性成分进行筛选,运用Cytoscape3.8.2构建化合物-靶点网络;以"rheumatic arthritis"、"RA"为关键词,检索Drugbank和Genecard数据库获取疾病靶标;通过韦恩图,得到疾病与药物的共同靶点;基于String11.0和Analyze Network插件对振中汤治疗类风湿关节炎的关键靶点进行构建分析;采用WebGestalt富集分析工具对关键靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:研究显示共挖掘到振中汤51种有效成分及234个潜在靶点,类风湿关节炎1223个相关靶点,得到振中汤-类风湿关节炎共同靶点120个,共同作用靶点主要富集于119个生物过程和104条信号通路上.结论:振中汤可能是通过原癌基因(JUN)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、白细胞介素-6(IL6)、蛋白激酶(ATK1)等靶点,调控TNF信号通路、AGE-RAGE信号通路、白介素-17信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路等,从而发挥抗炎、调节免疫、调节内分泌功能、抑制滑膜细胞增殖、减少破骨细胞生成、抗缺氧应激来治疗类风湿关节炎.     

基于网络药理学的鸡血藤抗肝纤维化机制研究

目的运用网络药理学探讨鸡血藤抗肝纤维化的分子生物学机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台检索鸡血藤的所有化学成分,并筛选鸡血藤中的活性成分。对筛选出的活性成分进行靶点预测、基因注释。采用GeneCards、OMIM数据库筛选肝纤维化相关的疾病靶点,通过取活性成分靶点和疾病靶点的交集获得鸡血藤抗肝纤维化的潜在靶点。针对鸡血藤抗肝纤维化潜在靶点,利用STRING数据库构建蛋白互作网络图,并进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果最终筛选出鸡血藤的活性成分24个及其对应靶点56个,肝纤维化的疾病靶点共6 899个。取交集后,获得鸡血藤抗肝纤维化的潜在靶点49个,其中度值排前5位的靶点依次为表皮生长因子受体、MYC、白细胞介素6、雌激素受体1和血管内皮生长因子。GO功能富集分析和KEGG通路分析结果显示,鸡血藤抗肝纤维化的潜在靶点参与了154个生物学过程、23个细胞成分和46个分子功能,涉及前列腺癌信号通路、人类巨细胞病毒感染信号通路、乙型肝炎信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信号通路、EB病毒感染...     

大黄治疗慢性肾衰竭的网络药理学机制

【目的】基于网络药理学探讨大黄治疗慢性肾衰竭的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索大黄化学成分,通过SwissTargetPrediction数据库得到大黄的预测靶点,通过GeneCards数据库获取慢性肾衰竭相关靶点。将大黄的预测靶点与慢性肾衰竭相关靶点进行映射,得到大黄治疗慢性肾衰竭的预测靶点。通过Cytoscape 3.6.0软件,生成大黄治疗慢性肾衰竭的蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络,再在DAVID网站进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。【结果】大黄活性化合物有16种,筛选出大黄可能与慢性肾衰竭相关的靶点93个,关键靶点共30个,包括SRC、ESR1、CSNK2A1、FYN、STAT3、MAPK1、EGFR、SMAD3、STAT1、MAPK3、AKT1等。通过KEGG通路分析得到122条通路,结合文献检索,筛选出治疗慢性肾衰竭的可能通路为20条,主要通路包含磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)—苏氨酸激酶(Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Foxo信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、Wnt信号路、Hippo信号通路、转化生长因子β(TGF-β)信号通路等。【结论】大黄通过多成分、多靶点、多通路治疗慢性肾衰竭,其机制主要与调控肾纤维化相关通路有关。     

基于网络药理学探讨麻黄治疗儿童哮喘作用机制

目的:利用网络药理学相关资源研究麻黄治疗儿童哮喘的作用机制,以期为临床研发儿童哮喘药物提供新的思路和方向。方法:利用BATMAN-TCM数据库获取麻黄的活性成分及靶点,于人类基因组注释数据库Gene Cards检索儿童哮喘的靶标基因,筛选出两者共同的靶标基因,视为麻黄治疗儿童哮喘的潜在靶点,运用STRING平台构建这些潜在靶点蛋白之间相互作用的网络模型,使用DAVID数据库进行潜在靶点的GO分析和KEGG通路富集分析。结果:麻黄治疗儿童哮喘的活性成分共有104个活性成分,即麻黄素、麻黄碱、去甲基麻黄碱、毛果碱、伪麻黄碱、乙酸薄荷酯、亚油酸、芹菜素等,潜在作用靶点432个,主要涉及Ras signaling pathway、PI3KAkt[磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B信号通路,Phosphatidylinositol-3kinase(P13K)-protein Kinase B(AKT)]、MAPK(丝裂原活化蛋白激酶信号通路Mitogen-activated protein kinase)、Rap1 signaling pathway、TNF signaling pathway、HIF-1 signaling pathway 6条通路。结论:麻黄治疗儿童哮喘的作用机制可能是通过共同调节Ras、PI3KAkt、MAPK、Rap1、TNF、HIF-1等信号通路,作用于NFKB、IL-2、IL-4,IL-6、IL-9、IL-13、EGFR、AR、BCL2等相关受体,进而促进嗜酸性粒细胞、肥大细胞、中性粒细胞等多种细胞的凋亡,抑制炎症因子释放,降低血管壁通透性,减轻局部组织肿胀,从而进一步抑制炎症反应,避免气道重塑以及气流受限。     

基于网络药理学分析角药葛根-鹿衔草-羌活治疗颈椎病的作用机制

目的 采用网络药理学方法探讨角药葛根-鹿衔草-羌活治疗颈椎病的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台筛选葛根、鹿衔草、羌活的主要有效活性成分及其作用靶点。采用CTD、GeneCards及OMIM数据库获取颈椎病的相关基因靶点,并将其与角药的有效活性成分作用靶点进行交集,获取共同靶点。针对共同靶点,构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络,以及蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络,同时进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 共获得葛根-鹿衔草-羌活的有效活性成分28个及其靶点86个,与12 097个颈椎病相关基因靶点取交集后得到共同靶点72个。根据PPI网络筛选出白细胞介素6(IL-6)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase3)、雌激素受体1(ESR1)等关键靶点蛋白。GO功能富集分析结果显示,共同靶点主要涉及核受体活性、转录因子活性/直接配体调节的序列特异性、类固醇激素受体活性等生物过程或功能;KEGG通路富集分析结果显示,葛根-鹿衔草-羌活治疗颈椎病的信号通路主要涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇...     

基于网络药理学探讨黄芩治疗痤疮的作用机制

目的 采用网络药理学方法研究黄芩治疗痤疮的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索黄芩的活性成分和靶标,采用GeneCards和在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库筛选痤疮的潜在靶点;通过Cytoscape3.7.1软件绘制黄芩治疗痤疮的“成分-靶点-通路-疾病”网络图,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并对关键靶点进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 从黄芩中筛选出与痤疮有关的活性成分29个,通过干预36个靶点、247条通路治疗痤疮;富集分析显著的生物功能主要为核受体活性、转录因子活性,直接配体调节的序列特异性DNA结合、类固醇激素受体活性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、四吡咯结合等。KEGG信号通路结果显示,黄芩治疗痤疮的关键基因显著富集在白细胞介素-7(IL-7)信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、松弛素信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等。结论 黄芩主要通过多成分、多靶点、多通路的作用治疗痤疮,而非通过单一机制...     

基于网络药理学和分子对接探讨二仙汤治疗卵巢早衰的作用机制

目的：对二仙汤治疗卵巢早衰（premature ovarian failure,POF）作用机制进行探讨。方法：基于网络药理学和分子对接的方法,通过检索TCMSP数据库获取二仙汤中各药物的活性成分;通过Gene Cards、OMIM、Pharm Gkb和Drugbank数据库收集卵巢早衰疾病靶点,将活性成分与疾病基因靶点取交集,得到二仙汤治疗卵巢早衰的预测靶点。采用Cytoscape 3.8.0构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;通过STRING数据库和Cytoscape构建蛋白互作网络（PPI）及精简核心网络;运用R Studio软件对二仙汤治疗POF进行GO富集和KEGG通路富集分析。采用分子对接技术对“药物-成分-靶点-疾病”网络结果进行验证。结果：筛选出68个主要活性成分,涉及182个基因靶点,其中主要活性成分包括槲皮素（Quercetin）、木犀草素（Luteolin）、山柰酚（Kaempferol）等;核心靶点基因包括RB1、TP53、FOS、CDKN1A、ESR1、AKT1、MAPK1、TNF等;富集到GO生物过程（biological process,BP）2545条、...     

基于网络药理学探讨二仙汤治疗乳腺增生症的潜在作用机制

目的：运用网络药理学的研究方法,分析二仙汤治疗乳腺增生症的潜在作用靶点和机制。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选二仙汤的有效活性成分及其作用靶点,利用GeneCards数据库检索乳腺增生症的相关靶点。映射疾病靶点与药物靶点,通过String数据库预测两者间关键靶点的相互作用,构建“药物-有效成分-作用靶点”网络图,并对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,分析二仙汤治疗乳腺增生症的潜在作用机制。结果：共获得85个二仙汤有效成分,215个有效成分靶点,4 775个乳腺增生症靶点,有效成分与疾病交集靶点175个,蛋白质相互作用（PPI）核心网络包含10个靶点,并得出排名前10位的GO富集结果和排名前20位的KEGG富集结果。结论：二仙汤通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等多个活性成分作用于ESR1、TP53、AKT1等靶点,直接或间接通过调控PI3K-AKT、MAPK等多条信号通路调节雌激素的活性,发挥治疗乳腺增生症的作用。     

基于网络药理学探讨柴胡治疗卒中后抑郁的作用机制

目的 基于网络药理学探讨柴胡治疗卒中后抑郁(PSD)的潜在靶点及作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡的有效成分及对应靶点,采用在线人类孟德尔遗传(OMIM)、疗效药靶(TTD)、Drugbank、Genecards数据库检索PSD的疾病靶点,二者靶点取交集后获得柴胡治疗PSD的潜在作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制中药-成分-疾病-靶点调控网络图;运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并分析其核心靶点;采用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果 柴胡治疗PSD的核心成分为异鼠李素、曲克芦丁、豆甾醇等,潜在靶点为蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、内皮型一氧化氮合酶(NOS3)、肿瘤坏死因子(TNF)等,柴胡活性成分可以参与RNA聚合酶II启动子对转录的正调控、细胞间信号传递、对药物的反应、对凋亡过程的负调控、老化等生物过程,涉及的信号通路包括神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、癌症通路、磷脂酰肌醇-3激酶蛋白激酶B...     

基于网络药理学研究川芎嗪治疗冠心病分子机制

目的通过网络药理学方法探讨川芎嗪治疗冠心病的分子机制。方法利用Pharmmapper数据库、中药分子机制生物学分析平台(BATMAN-TCM)预测化合物靶点,通过与人类基因数据库(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)治疗冠心病的相关靶点进行匹配,得到化合物-疾病共同靶蛋白。利用Cytoscape3.7.1软件构建化合物-靶点网络,然后借助STRING数据库进行蛋白互作网络分析,最后利用R语言进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果经过筛选得到川芎嗪作用于冠心病的靶点115个,这些靶点主要富集在磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase/protein kinase B,PI3K-Akt)、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)等多条信号通路上。结论川芎嗪可能主要通过抗凋亡、抗凝血、抗炎、促进血管新生、应对缺氧等多方面对冠心病进行干预,体现了中药多靶点、多通路的作用特点。     

基于网络药理学探讨七福饮治疗阿尔茨海默病的机制

目的:基于网络药理学方法探讨七福饮治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分及其作用机制。方法:应用中药系统药理学(TCMSP)分析平台、ETCM数据库、SymMap数据库筛选七福饮的活性成分及作用靶点。利用Genecards数据库、OMIM数据库、Pubmed-Gene数据库筛选AD相关靶点,取交集得到七福饮治疗AD的靶点。将上述靶点导入STRING数据库,利用Cytoscape软件构建"活性成分-作用靶点"网络和蛋白相互作用(PPI)网络,筛选出关键成分和关键靶点,并进行GO生物功能注释和KEGG通路分析。应用Schrodinger软件进行分子对接验证。结果:对七福饮共筛选出106个活性成分、511个作用靶点,AD相关靶点369个。"活性成分-作用靶点"网络分析显示,山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇可能是七福饮治疗AD的关键活性成分。PPI网络分析显示,丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、脑源性神经营养因子(BDNF)、胰岛素(INS)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、肿瘤蛋白p53(TP53)可能是七福饮治疗AD的关键靶点。通路分析提示,七福饮治疗AD的机制可能与多巴胺能突触、cAMP信号通路、白介素-17信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路等有关。分子对接显示,AKT1与腺嘌呤、BDNF与Inermine、INS与川芎内酯E、MAPK3与异甘草黄酮醇、TP53与7-乙酰氧基-2-甲基异黄酮的结合能力较强。结论:七福饮通过多成分、多靶点、多通路减轻神经元损伤,发挥治疗AD的作用。     

基于网络药理学探讨麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎所致发热的分子机制

目的通过网络药理学初步探讨麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎所致发热的可能作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台获得麻黄汤的有效活性成分及其作用靶点,再在UniProt数据库中利用Perl脚本获取药物靶点对应的人类基因。通过OMIM和GeneCards数据库收集与发热相关的疾病靶点。运用Venny平台获取药物-疾病交集的靶点基因后,通过STRING数据库建立蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。运用R×64 3.6.1软件对PPI网络中的30个关键基因进行可视化,并对所有交集靶点基因进行功能富集和通路富集分析。结果获得141个麻黄汤有效活性成分及194个药物-疾病交集的靶点基因,筛选出30个关键基因,包括STAT3、AKT1、JUN、MAPK1、IL-6、CXCL2、VEGFA、IL-1B等。交集靶点基因涉及DNA结合转录激活剂活性、RNA聚合酶Ⅱ特异性、细胞因子受体结合、细胞因子活性、泛素样蛋白连接酶结合、核受体活性等170个生物过程,同时主要涉及胞内磷脂酰肌醇激酶-蛋白激酶B信号通路、低氧诱导因子1信号通路、核因子κB信号通路、环磷酸鸟苷-蛋白激酶G信号通路等46个信号通路。结论麻黄汤缓解新...     

基于生物信息学及网络药理学分析丹皮酚抗瘢痕疙瘩的作用机制

目的筛选丹皮酚作用于瘢痕疙瘩(KD)的潜在药物靶点和信号通路,初步分析丹皮酚抗KD的作用机理。方法从CTD和GeneCards数据库中获取KD致病基因,从TCMSP和PubChem数据库中获取丹皮酚直接靶标基因。采用STRING数据库和Cytoscape3.7.1软件进行网络拓扑分析,筛选出KD候选基因、丹皮酚候选靶点基因和丹皮酚的潜在药物靶点。利用DIVAD软件进行基因功能富集(GO)分析和信号通路富集(KEGG)分析,并采用Cytoscape软件构建药物靶点网络图。下载GEO芯片数据进行最佳药物靶点验证。结果共筛选出KD候选基因143个、丹皮酚候选靶点基因29个,丹皮酚抗KD的潜在药物靶点11个,并构建出一个包含11个节点、86条边的潜在药物靶点PPI网络;这些潜在药物靶点与磷脂腺肌醇3激酶/蛋白质丝氨酸苏氨酸激酶(PI3K/Akt)信号通路、凋亡信号通路及核转录因子-κB(NF-κB)信号通路等相关。结论丹皮酚可能通过作用于PI3K/Akt信号通路、凋亡通路及NF-κB信号通路中的核转录因子κB抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白、B细胞淋巴瘤-2、磷脂酶和张力蛋白同源物、转化生长因子β1、Akt1、丝裂原活化蛋白激酶1、白细胞介素-6、NF-κB1、纤维连接蛋白1、半胱氨酸蛋白酶3起到抗KD的作用。     

基于黄芩汤治疗结直肠癌作用机制的网络药理学和分子对接分析

目的：通过网络药理学和分子对接技术分析黄芩汤治疗结直肠癌（CRC）的潜在作用靶点,阐明其相关分子机制。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）构建黄芩汤活性成分和作用靶点数据集,通过GeneCards、人类在线孟德尔遗传（OMIM）、药物遗传学和药物基因组学知识库（PharmGKB）等数据库构建CRC疾病相关靶点数据集。利用R软件、Cytoscape软件和STRING数据库构建药物-疾病靶点交集、黄芩汤中药复方调控网络和蛋白-蛋白互作（PPI）网络。利用R软件和Metascape平台进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。采用AutoDock和PyMol软件进行分子对接验证,评估配受体结合情况。结果：筛选黄芩汤有效活性成分136个,黄芩汤治疗CRC的潜在靶点242个,核心靶点18个,基于信号通路分析获得CRC密切相关核心关键靶点5个,分别为蛋白激酶B1 (AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、原癌基因FOS、肿瘤蛋白P53 (TP53)和原癌基因MYC。GO功能富集分析,主要参与多种细胞应激反应的生物过程。KE...