2504例汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多态性研究

目的分析2 504例汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多态性及分布特征。方法采用基于Illumina Miseq二代测序技术,对岳阳地区2 504例汉族造血干细胞捐献志愿者的HLA-A、B、C、DRB1和DQB1基因进行高分辨分型,采用Py Pop软件计算等位基因频率、单体型频率核对连锁不平衡参数。结果 HLA-Ⅰ类基因中,A、B和C基因座分别检出55、117和67个等位基因,其中频率>0.05常见等位基因为A*11:01:01:01、A*24:02:01:01、A*02:07:01、A*02:01:01:01、A*33:03:01,B*40:01:02、B*58:01:01、B*15:02:01、B*13:01:01、B*46:01:01、C*03:03:01、C*03:02:02:01、C*08:01:01、C*03:04:01:02、C*07:02:01:01、C*01:02:01;HLA-Ⅱ类基因中,共检出50个DRB1和26个DQB1等位基因,频率>0.05常见等位基因见于DRB1*11:01:01、DRB1*08:03:02、DRB1*12:02:01、DRB1*15:01、DRB1*09:01:02,DQB1*03:01:01、DQB1*03:02:01、DQB1*03:03:02、DQB1*05:02:01、DQB1*06:01:01。HLA-A、B、C、DRB1和DQB1位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。任意2个HLA基因间均具有强的连锁不平衡,其中频率≥0.01有统计学意义的单体型有196条。结论获得了岳阳地区汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因频率数据,为人类学、移植配型、疾病相关性等研究提供了参考数据。     

PCR-SSP技术应用于海南汉族HLA-A、B、DRB1基因多态性研究

[目的]研究海南汉族HLA-A、B、DRB1基因多态性.分析该群体HLA等位基因分布特点.[方法]应用顺序引物聚合酶链反应技术对3 140名海南汉族健康、无血缘关系的捐献造血干细胞血样者进行HLA-A、B、DRB1基因分型检测,并与其他汉族群体进行比较.[结果]检出A等位基因17个,B等位基因28个,DRB1等位基因13个.其中HLA-A*11(0.355 3)、A*02(0.287 3)、A*24(0.194 6)、A*33(0.104 5)、HLA-B*40(0.189 6)、B*15(0.152 6)、B*13(0.145 1)、B*46(0.128 5)、B*58(0.101 8)、HLA-DRB1*15(0.164 9)、DRB1*12(0.141 4)、DRB1*04(0.133 6)、DRB1*09(0.128 7)等位基因具有较高的基因频率.[结论]海南汉族HLA等位基因多态性具有南方汉族人群共同的特征,但可能受北方汉族的影响,具有自身的特点.     

海南黎族人群HLA-A、B、DRB1基因分型

[目的]研究海南黎族人群HLA-A、B、DRB1遗传特征.[方法]应用顺序引物聚合酶链反应技术对301名海南黎族健康、无血缘关系的捐献造血干细胞血样者进行HLA-A、B、DRB1基因分型检测,并与南北汉族、其他少数民族群体进行比较.[结果]检出HLA-A等位基因11个,B等位基因20个,DRB1等位基因13个,其中A、B、DRB1座位频率最高的等位基固依次是:HLA-A*11(O.3634)、A*02(O.2507)、A*33(0.1767)、A*24(O.1451)、HLA-B*58(0.1972)、B*13(0.1788)、B*40(0.1278)、B*46(0.1259)、HLA-DRB1*03(0.1808)、DRB1*15(0.1667)、DRB1*16(0.1627)、DRB1*09(0.1240).[结论]海南黎族在HLA分布上属于南方民族类型,与西南少数民族壮族、布依族、傣族具有相似的遗传基因背景,并且在长期进化中形成自己的优势基因.     

湖南地区人群HLA-DRB1基因多态性的研究

目的 研究湖南地区人群HLA-DRB1位点等位基因的多态性.方法 采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)技术对3 664名湖南地区健康汉族人群进行HLA-DRB1等位基因的低分辨分型.结果 检出的13种DRB1位点等位基因中,频率最高的为DRB1*09(19.693%),其次为DRB1*15(14.014%)、DRB1*12(12.973%)、DRB1*04(11.960%)、DRB1*08(9.017%),频率较低的为DRB1*10(1.167%)和DRB1*01(0.877%),DRB1*09频率较其它地区人群为高.从遗传距离分析发现,湖南人群和广东人群距离最近(0.1378),和辽宁人群距离最远(0.3356).结论 湖南地区人群的HLA-DRB1位点等位基因具有复杂的多态性,以DRB1*09、DRB1*15、DRB1*12和DRB1*04频率为高,其等位基因频率的分布属于中国南方人群,但有其自身特点.     

湖南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因多态性的研究

目的研究湖南地区人群HLA-A、B、DRB1位点等位基因的多态性。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)技术对3 664名湖南籍健康人进行HLA-A、B、DRB1等位基因的低分辨分型。结果本次研究共检出HLA-A、B、DRB1位点等位基因74种,其中A位点17种,B位点44种,DRB1位点13种。A位点中A*11(34.42%)、A*02(31.88%)、A*24(18.01%)、A*33(6.18%)为湖南人群的优势基因。B位点中B*40(23.70%)>B*46(17.76%)>B*15(13.99%)>B*13(8.60%)。DRB1位点中,频率最高的为DRB1*09(19.69%),其次为DRB1*15(14.01%)、DRB1*12(12.97%)、DRB1*04(11.96%)、DRB1*08(9.02%),频率最低的为DRB1*01(0.88%)。与其他地区不同人群相比,HLA-A、B、DRB1各位点等位基因的分布均有显著的差异。结论湖南人群的HLA-A、B、DRB1位点等位基因具有复杂的多态性,中国各地常见的基因均有分布,白血病患者在湖南不难找到合适的造血干细胞供者。本研究结果可作为湖南地区人群正常参考值,为人类学及HLA与疾病相关的研究提供了有力的背景资料。     

中国南方人DQB1、DRB1等位基因与妊娠期高血压疾病的关系

目的:探讨DQB1及DRB1座位等位基因与妊娠期高血压疾病的关系,阐明妊娠期高血压疾病发生发展的免疫机制。方法:采用快速离心柱法提取对象外周血白细胞DNA,以荧光分光光度计测定DNA含量,应用顺序特异性引物聚合酶链反应技术(PCR-SSP)进行基因测定;取20例妊娠期高血压疾病者作为研究组,18例正常孕妇作为对照组。结果:从单一基因分析,研究组频率显著增高的基因有:DRB1*0303、DRB1*0405、DRB1*0403、DRB1*06011/12、DQB1*0502、DOB1*0402,其中DRB1*0405、DQB1*0502风险处于最高值(RR值分别为9.76、6.34),基因频率显著高于对照组(P<0.05),频率显著降低的基因是:DRB1*0407、DRB1*0315、DQB1*03011/12、DQB1*05031,基因频率显著低于对照组(P<0.05)。2个PIH相关基因组成1个单倍型,其中DRB1*0315-DQB1*0502、DRB1*0405-DOB1*06012单倍型与妊娠期高血压疾病患者尿蛋白及血压呈正相关关系(Pc<0.05)。结论:DRB1和DQB1两座位上等位基因与妊娠期高血压疾病发生密切相关。     

矽肺与人类白细胞抗原-DRB1·和-DQB1·基因相关性的研究

目的 探讨我国北方汉族人矽肺的易感性与人类白细胞抗原（HLA）－DRB1＊、DQB1＊位点等位基因多态的相关性。方法 用序列特异性引物的聚合酶链式反应（PCR－SSP）方法，分析48名汉族矽肺患者及100名汉族无血缘关系对照者（均为有过14年以上接尘史的井下凿岩工）HLA－DRB1＊、DQB1＊位点的基因频率分布，以相对危险度（RR）代表相关程度。结果 在矽肺患者组中，DRB1＊1401、DQB1＊05的等位基因频率明显高于对照组，经统计学处理，两组间差异具有显著性（χ^2=5.61,P=0.0066,RR=17.40;χ^2=10.70,P=0.0011,RR=3.81)；而DRB1＊09的等位基因频率则明显低于对照组，差异有显著性（χ^2=5.70,P=0.0187,RR=0.21)；其他等位基因频率的分布差异无显著性（P＞0．05）。结论 HLA－DRB1＊1401、DQB1＊05可能与矽肺的易感性有关，而DRB1＊09则可能与机体抗矽肺的保护性有关。HLA－DR位点与机体易感及保护的双重作用有关，等位基因之间的共同作用可能是影响矽肺发生的原因之一。     

职业中毒

GPA基因突变与慢性苯中毒的关系；三氯乙烯职业中毒皮肤损害与HLA—DR、DQ基因相关性研究     

人类白细胞抗原DRB1基因多态性与三氯乙烯药疹样皮炎易感性的关系

目的研究人类白细胞抗原DRB1(HLA-DRB1)基因多态性与三氯乙烯药疹样皮炎易感性的关系。方法应用聚合酶链反应产物直接测序方法,比较112例三氯乙烯药疹样皮炎病例和142例健康三氯乙烯接触工人HLA-DRB1基因第2外显子氨基酸密码子多态性及等位基因频率分布,并计算相对危险度(OR)及其95%可信区间(95%CI)。结果病例组与接触对照组HLA-DRB1等位基因频率差异有显著性,病例组DRB1*1501、*1202和*04等位基因频率显著高于对照组(分别为18.8%vs7.7%,OR=2.748,95%CI=1.587～4.761;12.5%vs6.0%,OR=2.244,95%CI=1.195～4.214;17.4%vs11.3%,OR=1.660,95%CI=1.002～2.750),而DRB1*0301、*0901、*13和*1502等位基因频率显著低于对照组(分别为0.4%vs4.6%,OR=0.093,95%CI0.012～0.720;7.6%vs13.7%,OR=0.516,95%CI=0.283～0.939;1.3%vs6.7%,OR=0.189,95%CI=0.055～0.648;2.7%vs8.5%,OR=0.298,95%CI=0.120～0.743);病例组与接触对照组间12个位点(密码子9、11、12、13、26、28、30、33、37、70、71、74)氨基酸密码子多态性分布频率差异有显著性。结论HLA-DRB1基因多态性可能是导致三氯乙烯药疹样皮炎个体易感性差异的原因之一。     

多囊卵巢综合征与HLA-DRB基因相关性研究

目的探讨HLA-DRB1基因与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法,检测32例汉族PCOS患者和58例对照组(正常人)的HLA等位基因频率。结果PCOS患者HLA-DRB1*09、DRB1*11、DRB1*13、DRB1*14、DRB4的等位基因频率较对照组明显升高(P<0.05或P<0.01)。结论HLA-DRB1*09、DRB1*11、DRB1*13、DRB1*14、DRB4等位基因可能是PCOS的易感基因或与易感基因相连锁。     

HLA class II restriction of HIV-1 clade-specific neutralizing antibody responses in ethnic Thai recipients of the RV144 prime-boost vaccine combination of ALVAC-HIV and AIDSVAX(®) B/E

Immune responses to vaccines may be influenced or associated with allelic variants of host genes such as those encoding human leucocyte antigens (HLA). We have molecularly determined the HLA class II DR and DQ gene, allele and haploype profiles in HIV-1 negative ethnic Thai recipients of an HIV-1 prime boost vaccine regimen, designed to induce neutralizing antibody (NAb) responses to HIV-1 CRF01_AE. Non-response to vaccine associated with DRB1*11 (3/32 responders vs. 7/13 non-responders, p(c)=0.027) and DRB1*16:02 (0/32 responders vs. 4/13 non-responders, p(c)=0.078) alleles. Furthermore, vaccine recipients with HLA-DQ heterodimers encoded by DQA1*05:01 and DQB1*03:01 alleles, were much less likely to produce NAb (p=0.009). These data suggest that the lack of response to a vaccine designed to induce clade-specific NAb to HIV-1 is associated with the presence of certain HLA class II alleles and heterodimers in some Southeast Asians.     

Synergistic effect of two HLA heterodimers in the susceptibility to celiac disease in Tunisia

The DR and DQ HLA genotypes of 94 Tunisian children affected with celiac disease are analyzed so that we can gain a better understanding of the HLA component of this disease. All of them carry at least one of two specific heterodimers: a DQ heterodimer, encoded by DQA1*0501, DQB1*0201 and/or a DR heterodimer, encoded by the nonpolymorphic gene DRA and the DRB4 gene. Quantifying the relative penetrances of all susceptible genotypes gives evidence for a synergistic effect of these two heterodimers and for a dose effect of the alleles encoding the β chains of these two heterodimers. The DR3DR7 individuals have the greatest risk. They present the two kinds of heterodimers and carry two DQB1*0201 alleles. Celiac disease is the first HLA-associated disease for which the at-risk genotypes are so well delineated. Genet. Epidemiol. 14:413–422,1997. © 1997 Wiley-Liss, Inc.     

HLA-DRB1基因多态性与陕西汉族妇女患中重度EM风险的相关性

目的 探讨HLA-DRB1基因多态性在陕西汉族中重度子宫内膜异位症(EM)人群中的分布及其与EM发病风险的关联性.方法 采用聚合酶链反应-直接测序技术(PCR-SBT),检测50例中重度EM患者和52例正常对照人群中HLA-DRB1的基因多态性分型,分析其基因型分布及其与中重度EM发病风险的相关性.结果 HLA-DRB1基因在EM组和对照组人群中均呈高度多态性分布;EM组人群中检测到22种HLA-DRB1基因型,其中基因型频率大于5%分别为HLA-DRB1*07:01(18%),DRB1*15:01(12%),DRB1*09:01(11%),DRB1*12:01(7%),DRB1*12:02(7%),DRB1*14:54(6%),DRB1*15:02(6%)和DRB1*14:05(5%).在对照组中人群中检测到24种HLA-DRB1基因型,其中基因型频率大于5%分别为HLA-DRB1*15:01(16.3%),DRB1*07:01(14.4%),DRB1*12:02(8.7%),DRB1*12:01(8.7%),DRB1*09:01(6.7%)和DRB1*04:05(5.8%).HLA-DRB1各基因型在EM组与对照组中的分布未见明显统计学差异.结论 HLA-DRB1基因多态性与陕西汉族中重度EM发病风险无明显关联.     

哈尔滨市儿童Ⅰ型糖尿病与HLA-DRB1等位基因的关联研究

目的　哈尔滨市儿童Ⅰ型糖尿病与人类白细胞抗原DR位点 (HLA DRB1)等位基因的关联关系。方法　选取 47例 0～ 14岁发病的患者和 94名非Ⅰ型糖尿病健康儿童对照 ,运用PCR SSP技术测定HLA DRB1等位基因型别。结果　在DR位点上 ,病例组的DRB1 0 30 1频率和DR3/4杂合子频率显著高于非Ⅰ型糖尿病对照组 ,而DR2的频率显著低于对照组 ;DR4亚型中的DRB1 0 40 5频率为病例组高于对照组 ,RB1 0 40 6频率低于对照组 ;DRB1 0 90 1频率在两组之间差异无显著性。结论　DR位点的DRB1 0 30 1等位基因为哈尔滨市儿童Ⅰ型糖尿病的强易感基因 ,而DR2为保护性基因。DR3/ 4杂合子为易感性杂合子。证实了DR4亚型具有双重作用。未证实DRB1 0 90 1有强易感性 ,因此 ,其在中国人Ⅰ型糖尿病患者的易感性作用还有待于进一步探索     

A meta-analysis of association of Human Leukocyte Antigens A,B, C,DR and DQ with Human Papillomavirus 16 infection

Human Papillomavirus (HPV) induced cervical cancer (CaCx) is a major health problem in women from both developing and developed regions of the world. This virus accounts for >95% of the CaCx cases with a preponderance of HPV type −16 (65%). Paradoxically HPV-16 is prevalent even in the cervix of healthier women and anti HPV-16 T-cell response is considered critical for the viral clearance. Studies on HLA association with HPV-16 infection and cervical cancer have yielded varied HLA associations in different epidemiological settings. To validate these associations, we performed a meta-analysis of HLA-A, B, C, DR and DQ association with HPV-16 infection. Of the 1409 studies retrieved, 26 qualified for meta-analysis based on stringent inclusion and exclusion criteria.HLA-B*47, B*57, DRB1*10, DRB1*15 and DQB1*0303 were significantly associated with HPV-16 infection (OR = 3.4, 1.8, 1.5, 1.1 and 1.5 respectively). HLA-B*49, B*39, A28 (serotype), C*04 and DRB1*13 were negatively associated with HPV-16 (OR = 0.5, 0.6, 0.7, 0.7, and 0.7 respectively). Certain HLA alleles such as B*07, DRB1*15, DRB1*11 and DRB1*07 showed weakly positive associations. A comprehensive analysis coupling HPV-16 antigenic diversity and the HLA variation in various global populations shall provide further insights into the immunogenetic predisposition to HPV-16 and shall help identify host-parasite co-evolution.     

深圳龙岗区2000～2005有机溶剂职业性危害事故调查分析

[目的]了解分析深圳市龙岗区2000～2005年间共发生的25起有机溶剂职业性危害事故。[方法]按职业病诊断标准对收集的25起有机溶剂职业性损害资料进行分析。按照GB/T4754-94《国民经济行业分类和代码》大类划分行业,职业损害原因划分按卫生部卫统19表中的规定。[结果]25起事故中,损害38人,死亡6人,死亡率15.79%。三氯乙烯15起,列首位（60.00%）;患者16人,死亡4人,死亡率高达25.00%,占全区有机溶剂死亡人数构成比的首位（66.67%）。[结论]三氯乙烯是引起我区有机溶剂中毒的主要毒物;造成事故原因主要为密闭通风排毒措施不佳,个人防护较差,职工缺乏安全防护知识所致。     

湖北地区肾综合征出血热与HLA-DRB基因多态性关联的研究

目的 探索湖北省汉族人白细胞抗原(HLA)-DRB基因多态性与肾综合征出血热(HFRS)的相关性.方法 采用PCR/SSP方法对湖北省汉族病例组114例、对照组213例进行HLA-DRB基因多态性分析,同时采用RT-heminested PCR方法对汉坦病毒(HV)进行病毒分型.结果 HLA- DRB1*0401-0411、*1101-1105基因频率在HFRS患者组明显升高,分别为3.1%、2.2%、15.7%,与对照组比较,RR=13.87、9.72、2.00,χ2=10.006、6.324、6.472,P<0.05;DRB1*1501-1502、DRB4、DRB5基因频率在对照组分别为11.0%、19.0%、16.9%,与HFRS患者组比较,RR=0.45、0.58、0.23,χ2=6.138、4.583、21.076,P<0.05,而其他HLA-DRB基因频率差异无统计学意义.湖北地区为HV混合感染疫区且两型病毒多集中于江汉平原地区,汉滩型(THNV)略多于汉城型(SEOV),湖北地区HFRS患者中具有HLA-DRB1*1101-1105等位基因的有81.8%(27/33)为THNV感染,而SEOV感染只有18.2%,差异有统计学意义(P<0.05).结论 湖北省汉族人中,HFRS与DRB1*0401-0411、*1001、*1101-1105呈正相关;HFRS与DRB1*1501-1502、DRB4、DRB5呈负相关.THNv的HV变异株在湖北地区具有一定的地理聚簇性.