云南省楚雄州汉坦病毒宿主动物及分子流行病学研究

目的 掌握汉坦病毒(HV)在云南省啮齿动物中的流行情况及其遗传特征.方法 采用笼夜法捕鼠,鼠肺标本用直接免疫荧光法检测HV抗原,用RT-PCR法检测HV核酸及分型,对产物进行序列测定,用PHYLIP软件包进行系统发生分析.结果 2005-2006年在云南省楚雄州10个县(市)居民区共捕获鼠类4属8种1421只,其中褐家鼠1056只,构成比高达74.31%,其次为黄胸鼠(19.70%).检测鼠肺组织1029份,HV抗原阳性53份,总带病毒率为5.15%,带病毒鼠种为褐家鼠(5.08%,38/748))、黄胸鼠(5.97%,12/201)、大足鼠(7.69%,2/26)和斯氏家鼠(6.25%,1/16).HV汉城型(SEO)核酸检测阳性21份(褐家鼠15份,黄胸鼠4份,大足鼠2份).获得的12个病毒S片段核苷酸序列与GenBank中国SEO型病毒R22、L99和HLD65株同源性较高,为87.1%～99.7%;与汉滩型(HTN)76-118株同源性仅为64.4%～69.1%.系统进化分析显示,楚雄州12个病毒S片段核苷酸序列与SEO型亲缘关系较近,与HTN型及其他型HV相距较远,证实这12份病毒标本均为SEO型病毒,并可分S1和S3两个亚型.结论 首次证实楚雄州10个县(市)广泛存在以褐家鼠为主要传染源的HFRS家鼠型疫源地及SEO型病毒的流行.分析发现SEO型不同亚型病毒的分布有其地域特点和独立性.     

汉坦病毒宿主动物生态流行病学研究进展

发生在欧亚大陆的肾综合征出血热 (Hemorrhagicfeverwithrenalsyndrome ,HFRS)和美洲的汉坦病毒肺综合征(Hantavirus pulmonarysyndrome ,HPS )是由汉坦病毒(Hantaivrus ,HV)所致的自然疫源性疾病。其发病流行取决于宿主动物的生态学、环境因素变化、人的行为及流行毒株的特点 ,其中环境条件变化引起宿主动物种群密度及行为的改变是疾病流行的重要环节。因此 ,掌握HV宿主生态学特点及其与生境之间的关系、分析人类HV感染的流行和危险因素 ,对预测疾病流行及其防制对策与措施的制定有着十分重要的意义。1993年 ,在美国西南部暴发HPS…     

北京市城区鼠间汉坦病毒感染的流行病学研究

目的了解北京城区中心地带鼠间汉坦病毒（Hv）感染状况及其病毒型别差异。方法选取北京城区某方圆约1km两街区之内的食物资源丰富、场所隐蔽的中、小餐饮行业、蔬菜集贸市场及周边垃圾堆、卫生死角等生态环境，从2003年12月至2004年11月每月连续采用夹夜法捕鼠，计算鼠密度和鼠种构成。应用间接ELISA法检测鼠血清IgG抗体；针对汉坦病毒M基因部分片段设计汉城型汉坦病毒（SEOV）特异性引物，应用RT-PCR法检测宿主动物携带HV情况，阳性标本直接测序。利用Excel和SPSS软件分析宿主动物HV感染的动态特征。最后用DNASTAR软件对获得序列进行比较分析。结果共捕获啮齿动物229只，平均鼠密度6．41％（229／3570），褐家鼠和小家鼠分别为餐饮业、农贸市场生境的优势鼠种。褐家鼠血清抗体阳性率3．51％（6／171），带病毒率为0．58％（1／171）；小家鼠血清抗体阳性率为6．90％（4／58），带病毒率为172％（1／58）。病毒检出率以11、12月最高，抗体水平冬春季（1、4月）最高，与春季人群肾综合征出血热（HFRS）流行季节基本一致。2份扩增阳性标本（分别来源于小家鼠和褐家鼠）均为SEOV，差异为5．40％，系统发育分析显示他们位于2个不同的较小分支，但均位于Z37支系。结论北京城区2种主要的HV宿主在一些鼠害重点行业密度仍较高，虽然HV基础感染率不高，但持续存在，为春季人群HFRS发病高峰的重要影响因素。来自2个不同宿主的HV基因有一定的差异。小家鼠的传播作用有所加强，应予重视。     

汉坦病毒感染生态流行病学研究现状

汉坦病毒由啮齿动物携带遍及世界各地,在人群中主要导致肾综合征出血热和肺综合征出血热两种疾病,对公共卫生安全持续构成重大威胁。目前随着新发病例的出现以及新宿主、病毒新亚种的不断发现,汉坦病毒更加受到人们的关注,本文主要介绍了汉坦病毒、储存宿主、人群感染与环境生态之间关系等方面的研究现状,为研究疾病传播机理和疾病防控提供依据。     

浙江省龙泉市汉坦病毒宿主动物自然感染状况研究

目的 调查浙江省龙泉市肾综合征出血热(HFRS)疫源地小动物中汉坦病毒(HV)的自然感染情况及其流行的基因型.方法 用鼠笼在龙泉市查田镇、小梅镇、小梅镇黄南村捕鼠.捕获的小动物进行分类鉴定并解剖取肺脏,用间接免疫荧光法(IFA)检测肺组织中HV抗原,用RT-PCR对HV抗原阳性的样本扩增部分S片段核苷酸序列并测序,构建系统发生树进行基因分型.结果 共捕获小动物319只,其中野外312只,室内7只.黑线姬鼠和东方田鼠为野外优势鼠种.肺组织标本中共检测到9份抗原阳性,带病毒率为4.97%,用部分S片段(620～999nt)的核苷酸序列构建系统发生树,结果表明均为汉滩病毒(HTNV),并与Z251分离株的亲缘关系最近.结论 龙泉市野外主要存在以黑线姬鼠为宿主的HTNV感染,且携带率较高.

Abstract：

Objective To investigate the situation of the natural infection of hantaviruses (HV) in small mammals and to provide evidence for the control and prevention of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) in Longquan area,Zhejiang province. Methods Small mammals were captured by night trap, and lung tissue samples were collected and stored in liquid nitrogen. HV antigens were detected by indirect immuno-fluorescence assay (IFA). The partial S genome segment sequences were amplified by RT-PCR. DNAStar program was used for editing and comparing the sequences. Phylogeny was analyzed through PAUP*4.0 software. Results 319 small animals were collected in Longquan, and 9 hantavirus antigen-positive samples were identified. The positive rate of hantavirus in Apodemus agrarius was 4.97% . Phylogenetic tree constructed by partial S segment (620-999 nt) showed that the 9 strains carried by A agrarius from Longquan all belonged to HTNV,and had a closer evolutionary relationship with isolate Z251 from Zhejiang province. Conclusion Our results indicated that the main host was A. agrarius and the infection rate of HTNV was high in Longquan area.     

吉林省出血热宿主动物汉坦病毒型别分析

人类感染汉坦病毒能够导致两种严重的疾病：肾综合征出血热（出血热）和汉坦病毒肺综合征（迄今仅美洲发现）,汉坦病毒的主要宿主是啮齿类动物。吉林省为了科学防控出血热疫情,掌握汉坦病毒的型别分臣情况,在国家相关业务部门的大力支持下,开展了出血热宿主动物汉坦病毒（HV）的型别研究工作。本文主要针对该省HV的型别进行分析,对出血热科学防控起到积极推动作用。     

北京地区汉坦病毒宿主动物生态流行病学调查

目的了解北京地区啮齿动物问汉坦病毒（HV）感染状况、HV基因型及其与宿主动物的关系。方法夹夜法捕鼠，计算鼠密度，确定鼠种构成。针对HV基因M片段部分序列设计2种型特异性引物，应用RT—PCR法检测宿主动物带毒情况，并用ClustalX（5．0）和DNAClub软件对序列进行分析。采用SPSS软件分析宿主动物HV感染的流行病学特征。结果共捕获宿主动物295只，褐家鼠为优势鼠种，占71．53％。其次为小家鼠。占14．58％。RT—PCR检测宿主带病毒率，其中褐家鼠阳性率为18．01％，小家鼠为2．33％。对5份扩增阳性标本进行序列测定并对其核苷酸序列进行分析，结果显示均为汉城型（SEO）病毒。不同性别的褐家鼠HV感染率之间差异无统计学意义（X^2=0．032，P〉0．05）；不同体重的褐家鼠HV感染率之间差异有统计学意义（X^2=16．900，P〈0．001），体表有、无疤痕的褐家鼠之间HV感染，差异有统计学意义（X^2=30．441，P〈0．001）。结论北京地区存在较为广泛的汉城型HV感染，目前尚未发现汉滩型HV疫源地。褐家鼠为北京地区HV优势宿主和主要带毒鼠，宿主动物种群特征与HV感染具有不同程度的相关性。     

啮齿类宿主动物与人感染汉坦病毒相关性

目的监测山东省2003-2004年汉坦病毒（HV）宿主动物感染状况，为制定防治措施提供依据。方法采用夹夜法捕捉HV宿主动物，液氮保存，用直接荧光法检测宿主动物肺抗原，间接荧光检测血清抗体。结果宿主动物HV带毒率分别为褐家鼠6．24％，小家鼠2．55％，黑线姬鼠5．00％，莉腈5．56％，其余鼠种未发现带毒，核酸分析均为汉城型HV；室内以褐家鼠和小家鼠为优势鼠种，野外以褐家鼠、黑线姬鼠和大仓鼠为优势鼠种；鼠带毒率与人间疫情间存在着明显的相关关系（r=0．920）。结论山东省HV宿主以褐家鼠和小家鼠为主。     

中国宿主动物中Amur汉坦病毒M片段全基因序列分析

目的 测定中国宿主动物中Amur病毒M片段全基因序列,以了解其分子特征.方法 设计特异的PCR引物,用RT-PCR法分段扩增JilinAP06株M片段全长,PCR产物经克隆后进行序列测定,然后进行系统发育分析和重组分析.结果 JilinAP06株M片段全基因序列共3615个核苷酸,A+T含量为59.3%,G+C含量为40.7%,包含1个单一的开放读码框架,其最大读码框架从41～3448,由3408个核苷酸组成,共编码1135个氨基酸.序列同源分析表明,JilinAP06株与中国的人源Amur HV株同源性为96.0%～97.8%,与韩国大林姬鼠来源的Soochong HV同源性为85.6%～86.7%,与HTNV原型株76-118同源性仅为79.5%,而与其他各型病毒间的同源性均低于79.0%.氨基酸同源分析,其氨基酸序列与中国的人源株Amur HV同源性为98.1%～98.4%,与韩国大林姬鼠来源的Soochong HV同源性为96.4%～97.0%,与HTNV原型株76-118同源性为91.7%,而与其他各型病毒间的同源性均低于92.0%.系统发育分析结果显示,JilinAP06与Amur病毒构成一个相对独立的分支.结论 从中国宿主动物中获得了AmurHV的M片段全基因序列.     

汉坦病毒宿主动物及其相互关系

汉坦病毒（Hantavirus）属于布尼亚病毒科汉坦病毒属，主要由啮齿动物传播。尽管人感染汉坦病毒后能导致2种严重的疾病：肾综合征出血热（HFRS）和汉坦病毒肺综合征（HPS），但啮齿类宿主动物感染后几乎无临床症状，其生长繁殖也不受影响，甚至可以终身携带并排泄病毒。这也使得汉坦病毒与宿主之间形成共进化（co—evolution或co—speciation）。在已发现的20多个血清型和（或）基因型汉坦病毒中，每一型均来自一种或少数几种密切相关的啮齿动物。由于汉坦病毒与宿主动物间的这种对应关系，宿主动物的种群类型及其分布决定了疫区的性质及其分布，     

浙江省慈溪市啮齿动物中汉坦病毒分子流行病学研究

目的 研究浙江省慈溪市啮齿动物中汉坦病毒(HV)流行情况及病毒型别.方法 采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原;用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法扩增阳性样品中HV的部分S片段;构建系统发生树进行系统发生分析及分型.结果 在慈溪市肾综合征出血热(HFRS)疫点共捕获啮齿动物243只,在7份鼠肺样品中检测到HV抗原,其中4只为褐家鼠,3只为黄胸鼠,病毒携带率为2.88%.用汉城型病毒(SEOV)特异性引物从6份HV抗原阳性样品中扩增出部分S片段(620～999 nt)并测定了序列.对扩增出的部分S片段核苷酸序列分析表明,6株病毒与现有的SEOV有最高的同源性,均为SEOV.用部分S片段核苷酸序列所构建的系统进化树显示,6株病毒构成两个单元支,其中由褐家鼠携带的3株病毒与BjHD01株病毒的亲缘关系最近,分在同一分支,由黄胸鼠携带的3株病毒构成另一分支,与L99、R22及Hb8610株的亲缘关系较近.结论 慈溪市的褐家鼠与黄胸鼠分别携带一种不同亚型的SEOV,表现出SEOV在同一地区的遗传多样性,并支持宿主与汉坦病毒共进化的理论.     

浙江省温州市啮齿动物中汉坦病毒的分子流行病学研究

目的 研究浙江省温州市啮齿动物中汉坦病毒(HV)流行情况及病毒型别,为该地区肾综合征出血热(HFRS)的预防控制提供科学依据.方法 采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原;用RT-PCR法扩增阳性样品中HV的部分S片段及部分M片段;构建系统发生树进行系统发生分析及分型.结果在温州市HFRS疫区共捕获啮齿动物96只,在6份鼠肺样品中检测到HV抗原,其中4只褐家鼠,1只黄胸鼠与1只黄毛鼠,病毒携带率为6.3%.用汉城病毒(SEOV)特异引物从其中5份HV抗原阳性样品中扩增出部分S片段(620～999nt)及部分M片段(2001～2301nt)并测定序列.对扩增出的部分S及M片段的核苷酸序列分析发现,5株病毒与现有的SEOV有高同源性,均为汉城型HV.但在用部分S片段及部分M片段核苷酸序列所构建的系统进化树上,5株病毒的聚集模式不同.结论温州市的褐家鼠、黄胸鼠、黄毛鼠均携带汉城型HV,并可能发生基因片段的重排.     

湖南省啮齿动物携带汉坦病毒的分子流行病学研究

目的研究湖南省啮齿动物中汉坦病毒(HV)流行情况及病毒型别。方法采用IFA法检测鼠肺中HV抗原;用RT-PCR法扩增阳性标本中HV的部分S和M片段;构建系统发生树进行系统发生分析及分型。结果在湖南省HV流行的地区共捕获啮齿动物344只,其中6份标本HV抗原阳性,病毒携带率为1.74%。对扩增出的部分S与M片段的核苷酸序列分析表明,5份标本中的病毒为汉城型HV(SEOV),1份为汉滩型HV(HTNV)。用S(620～990 nt)与M片段G2区(2001～2301 nt)核苷酸序列所构建的系统进化树显示,湘乡褐家鼠、黄胸鼠及黄毛鼠携带的病毒均为SEOV的S4亚型;宁远褐家鼠携带的病毒为SEOV的一个新亚型;石门小家鼠携带的病毒为HTNV的H4亚型。结论湖南省为混合型HV疫区,以汉城病毒为主,并具有宿主多样性。     

山东省HIV-1感染者分子流行病学研究

目的了解流行于山东省境内艾滋病病毒(HIV-1)毒株的亚型及各种亚型的分布特点。方法对93例HIV感染者进行详细的流行病学调查，并采集外周静脉防凝血，提取前病毒DNA进行体外扩增，获得包膜蛋白(env)、核心蛋白(gag)、tat区基因的核酸片段，并对各基因区核苷酸进行测定和分析。结果发现在所有目标人群中共存在B、B’、C3种亚型以及CRF07-BC、CRF08-BC、CRF02-AG和CRF01-AE 4种重组毒株，B’亚型在人群和地域上分布最广，涉及献血员、受血者、二者的配偶和性乱人群，分布在山东省10个地市；CRF07-BC、CRF08-BC亚型以吸毒人群为主，分布在5个地市；CRF01-AE和其他亚型则主要为性乱人群，集中在几个经济发达的城市。结论山东省HIV-1亚型众多，各亚型在我省高危人群和地域分布不平衡，各有特点，从总的亚型流行特征来看，HIV-1在我省有流行加快的趋势。     

鲍曼不动杆菌SHV型β-内酰胺酶耐药基因分子流行病学研究

目的 分析自临床分离的产SHV型β-内酰胺酶(β-lactamases,BLA)多重耐药鲍曼不动杆菌的SHV型BLA耐药基因序列并确定其所产BLA耐药基因亚型。方法 在2000年7月至2002年12月间从临床分离60株鲍曼不动杆菌,经药敏试验、超广谱β-内酰胺酶(FSBLs)表型确证试验和SHV型BLA耐药基因的聚合酶链反应(PCR)检测,筛选出2株具有多重耐药特性、SHV基因型均阳性的分离株(HZ02、HZ10株),对耐药基因进行序列分析。结果 在2001年6月至2002年1月间分离到的18株(30.0％)鲍曼不动杆菌质粒上携带SNV型BLA耐药基因;NZ02株和NZ10株的SHVPCR扩增阳性,其基因片段分别含825个和833个核苷酸,与Nuesch-lnderbinen等首先发现的SHV-12亚型ESBLs编码基因序列(GenBank注册号:X98105)完全相同。结论 30.0％鲍曼不动杆菌质粒上携带SHV型(超广谱)β-内酰胺酶耐药基因并引起一次医院感染爆发。同时证实在我国浙江省湖州地区临床分离的鲍曼不动杆菌中存在产SHV-12亚型ESBL_s耐药基因菌株。     

浙江省2008-2011年啮齿动物中汉坦病毒的分离及鉴定

目的 分析浙江省肾综合征出血热(HFRS)疫区鼠形动物携带汉坦病毒状况及其型别.方法 应用直接免疫荧光试验和RT-PCR方法检测汉坦病毒抗原和核酸,阳性者用长爪沙鼠和Vero-E6细胞进行病毒分离,对分离株的M片段基因进行序列测定和分析.结果 2008-2011年在浙江省HFRS疫区捕获的鼠形动物中以黑线姬鼠为优势鼠种;从该鼠鼠肺中共分离到6株汉坦病毒,序列分析表明分离株均为汉滩型汉坦病毒,其中Z521、524、534为H7亚型,TT-27、T-43、R88可能为新亚型;6株分离株之间的基因同源性较高,并与以往浙江省分离株具有较高同源性.结论 2008-2011年浙江省HFRS疫区鼠间存在汉滩型汉坦病毒流行.     

江苏省一起乙型流感暴发疫情的流行病学分析

目的 了解2006年春季江苏省一起流感疫情的流行病学和毒株的变异情况。方法对一起流感暴发疫情进行流行病学调查，使用荧光定量RT-PCR快速检测病原体，采用MDCK细胞分离流感病毒，用血凝抑制实验对病毒株分型鉴定，对该起疫情的流感毒株进行种系发生分析，并与同一时间的其他地区乙型流感毒株的HAl基因序列进行比较。结果 此起疫情发病人数为357人，发病率为13．2％，23份咽拭子标本中分离出16份毒株，病原为B型Victoria株型流感病毒。基因种系发生树分析证明了它们的HAl基因不同于B／HongKong／330／2001和B／zhejiang／2／2001病毒。结论 2006年春季江苏省人群中流行的乙型流感病毒维多利亚毒株系已发生变异，因此加强流感病毒病原学监测，对于防止流感疫情暴发具有重要意义。     

北京市昌平区西伯利亚立克次体的分离和鉴定

目的 对北京市昌平区中国疾病预防控制中心园区内刺猬携带的中华革蜱进行斑点热群立克次体（SFGR）的分离和鉴定。方法 采用形态学和分子生物学方法对SFGR进行鉴定,并进行系统进化特征分析。结果 SFGR对DH82细胞产生明显细胞病变;Gimenez染色后,可见较多清晰的立克次体被染成紫红色;细菌16S基因测定后,西伯利亚立克次体246株和西伯利亚立克次体BJ-90株相应核苷酸序列的同源性均为100%;系统进化分析显示,SFGR位于西伯利亚立克次体进化分支内,确认其为西伯利亚立克次体。结论 北京市昌平区存在西伯利亚立克次体,该地区存在北亚热自然疫源地的可能性。