一起炭疽疫情中炭疽病原检测方法的应用与评价

目的分析总结一起炭疽疫情中应急检测的经验与问题,为炭疽疾病预防控制提供参考依据。方法采集报告的疑似皮肤炭疽患者皮损渗出液和静脉血标本,与病例相关的病死动物和土壤标本,渗出液采集采用载玻片直接蘸取和无菌棉签擦取2种方法,用涂片镜检、直接分离培养和肉汤增菌后分离培养细菌以及炭疽芽胞杆菌毒力基因PCR扩增方法检测病原,分析检测结果。结果共采集标本57份,病例标本占91.23%,病死牛肉及剖牛处土壤标本占8.77%。病例标本采集时间距发病时间最短1d,最长23d,平均6.62d。29例疑似皮肤炭疽患者在采样时其中16例(占55.17%)已使用抗生素类药物治疗,4例(占13.79%)未曾使用抗生素。从2例未使用抗生素的患者皮损渗出液和1份病死牛肉中分离到炭疽芽胞杆菌,分离阳性率为5.26%;其中1例患者皮损渗出液涂片镜检阳性;全部标本PCR扩增结果均为阴性。结论标本炭疽芽胞杆菌阳性检出率较低,与采样方法和采样时机关系较大,应加强部门间的沟通协作和人群的健康教育,做到疫情早报告、早确诊、早控制。     

利用荧光定量PCR快速鉴定炭疽疫情和种群分型

目的应用实时荧光定量PCR技术对2015年陕西炭疽疫情快速鉴定和种群分析。方法对甘泉县炭疽病例水泡液或病灶涂抹物及血液标本进行细菌分离,同时提取核酸进行荧光定量PCR试验。结果从1例病灶涂抹物中分离到1株炭疽芽胞杆菌。在19例病例中检出16例核酸阳性,疫情相关菌株种群确定为A.Br.001/002群。结论炭疽杆菌实时荧光定量PCR可用于炭疽疫情迅速判定,确定病例菌株种群,可克服传统病原培养分离阳性率低,血清学诊断时间长的缺点。     

2021年山东省菏泽市曹县一起皮肤炭疽疫情调查报告

目的分析山东省菏泽市曹县一起皮肤炭疽疫情的暴发原因与流行病学特征, 为炭疽防控提供科学依据。方法采用现场流行病学调查方法, 使用《炭疽流行病学个案调查表》, 根据全民健保系统报告的炭疽疑似病例流行病学接触史及密切接触者进行个案调查(n = 83)。采集病例皮肤焦痂涂抹物、病牛组织、屠宰场地土壤样本及屠宰器具涂抹物, 分别进行Real-time PCR检测、病原菌分离培养。炭疽判定标准参照《炭疽诊断》(WS 283-2020)进行。结果本次疫情共发现皮肤炭疽病例13例, 其中临床诊断病例12例, 确诊1例(Real-time PCR检测阳性且分离出1株炭疽芽孢杆菌)。经流行病学调查确定, 本次疫情传染源为病牛, 传播途径为屠宰病牛、接触被污染的用具及相关牛产品, 患者主要是从事牛屠宰或牛产品收售相关职业。实验室共收集样本84份, 其中皮肤焦痂涂抹物13份、环境样本64份、牛肉样本7份。PCR检测结果阳性36份, 阳性率为42.86%(36/84)。其中皮肤焦痂涂抹物标本阳性率为100.00%(13/13), 环境样本阳性率为29.69%(19/64), 牛肉样本阳性率为4/7。共分离到8...     

聚合酶链反应在嗜肺军团菌性肺炎诊断中的应用

目的 探讨聚合酶链反应在嗜肺军团菌肺炎快速诊断中的应用价值.方法 53例呼吸系感染病原不明性肺炎住院患者,采集痰液标本47份,支气管灌洗液标本6份,应用聚合酶链反应检测嗜肺军团菌DNA(LPN-DNA).结果 53例病原不明性肺炎患者检出LPN-DNA阳性5例,总阳性率为9.4%,其中47份痰液标本检出LPN-DNA阳性3例(6.4%),6份支气管洗液标本检出LPN-DNA阳性2例(33.3%).结论 聚合酶链反应检测临床标本中LPN-DNA诊断病原不明性肺炎具有良好的临床实际应用价值.     

一起诺如病毒感染性腹泻暴发的病原学调查分析

目的检测某高校一起感染性腹泻暴发疫情的标本,以明确其致病原,为制定防控措施提供依据。方法采集患者的粪便、呕吐物、唾液、手涂抹样标本,健康人群的粪便标本,患者宿舍外环境标本进行检测。采用四号琼脂、Mac、SS、沙门科玛嘉培养基对标本进行划线分离培养与系统生化鉴定常见肠道致病菌细菌学种类。采用普通PCR、多重RT-PCR和实时荧光RT-PCR方法进行诺如GⅡ型病毒和C组轮状病毒检测,并对阳性标本进行测序鉴定。结果共检测291份标本,病毒总阳性率17.53%,其中诺如GⅡ型病毒检测阳性45份,阳性率15.47%,C组轮状病毒阳性率2.06%。98份病例标本检出阳性率高,总阳性率37.76%,其中诺如GⅡ型病毒阳性率31.63%。54份健康人群标本诺如GⅡ型病毒阳性检出率7.41%,环境标本诺如GⅡ型病毒检测阳性率7.19%。结论本起疫情为主要由诺如GⅡ型病毒引起的诺如病毒感染性腹泻暴发,致病病原中同时混杂有C组轮状病毒。     

外环境霍乱弧菌疫源监测研究

目的了解外环境霍乱弧菌疫源现状,探讨霍乱弧菌来源,为疫情分析、预警、预测及制订防控策略提供科学依椐。方法选择玉林市玉州区为监测区域,监测时间为2006年5-10月。对外环境水体、海(水)产品及腹泻病人和重点人群进行采样监测。病原检测和生物学分型按《霍乱诊断标准及处理原则(GB15984─1995)》的检测方法进行;对霍乱弧菌毒力基因检测按《霍乱防治手册(第五版.1999)》的打点杂交方法进行。结果共检测各类样本2908份,检出14份阳性标本,阳性率为0.48%。其中,水体检测阳性率为0.64%(5/772),海(水)产品检测阳性率为1.16%(9/775),腹泻病人及从事饮食服务行业重点人群粪便监测未检出霍乱弧菌;血清学分型稻叶型11份,O139型2份,小川型1份;毒力检测1份O139型为产毒流行株,其余均为不产毒非流行株;阳性样本来源:水体样本5份全部来源于内陆河水体;海(水)产品阳性样本77.78%来源于沿海地区,22.22%来源于玉林本土。结论玉林城区外环境具备霍乱弧菌的生存条件,应加强监测和研究,及时发现致病性疫源,以便采取相应的控制措施。     

吉林省珲春市3株肾综合征出血热汉城型病毒的分离与鉴定

目的对2006年吉林省珲春市采集的鼠肺标本进行病毒分离与鉴定。方法采集鼠肺组织活体标本132份，用免疫荧光法筛检出阳性标本20份，用VeroE6细胞培养分离病毒，对病毒分离株进行血清学（EUSA和IFA方法）、分子生物学（RT-PCR）鉴定。结果本实验共筛检出阳性标本20份，分离到3株病毒，分离率为15％，分别命名为H156、H158、H162。结论在珲春市采集的褐家鼠标本中分离到3株病毒，经血清学和分子生物学鉴定为汉坦病毒汉城型，这是在珲春市首次分离到汉城型病毒。     

一步RT-PCR方法在黑龙江省手足口病病原检测中的应用

目的了解核酸检测方法在黑龙江省手足口病病原谱调查中的应用价值,为疾病防控提供依据。方法在全省范围内收集2009年和2010年疑似手足口病病人疱疹液、咽拭子或肛拭子标本,使用人肠道病毒通用引物、肠道病毒71型(EV71)引物和萨奇病毒A组16型(CVA16)引物,采用一步RT-PCR方法进行病原核酸检测,进而分析病原构成,并对部分核酸检测阳性标本进行病毒分离。结果 2009年检测标本985份,其中EV71阳性226份、CVA16阳性191份、EV71和CVA16合并阳性3份,其他肠道病毒阳性100份。2010年检测标本1696份,其中EV71阳性354份、CVA16阳性356份、其他肠道病毒阳性188份。两年标本肠道病毒阳性率平均为52.87%,其中EV71和CVA16占阳性标本中病原总数的79.69%。选取353份核酸检测阳性标本进行病毒分离,共获得毒株265株。结论一步RT-PCR方法用于手足口病病原检测稳定、特异、快捷、易于分型,EV71和CVA16是黑龙江省近两年手足口病的主要病原体。     

2009年广西253例疑似肠道病毒感染病例病原学监测结果分析

目的了解广西肠道病毒的感染情况,为制定预防和控制肠道病毒感染策略提供依据。方法采用实时荧光定量PCR方法,对广西253例疑似肠道病毒感染者咽拭子、疱疹液和粪便标本共505份进行肠道病毒、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)核酸检测。结果共检出290份肠道病毒核酸阳性,阳性率为57.43%,其中EV71核酸阳性105份,阳性率为20.79%,CoxA16核酸阳性143份,阳性率为28.32%。结论 505份标本中CoxA16核酸的阳性率高于EV71;疱疹液标本的阳性检出率高于肛拭子、咽拭子、粪便标本的阳性检出率;CoxA16和EV71是引起儿童手足口病的主要病原体,要加强对CoxA16和EV71的的鉴别诊断。开展手足口病流行病学和病原学研究,将有助于提出更好的预防和控制措施。     

2016-2018年陕西省炭疽监测及基因溯源分析

目的 调查了解2016-2018年陕西省炭疽流行情况、病原学特征及分子流行病学特征。方法 对2016-2018年报告炭疽病例开展个案调查,进行流行病学三间分布分析;采集病例生物样本及环境样本,进行炭疽杆菌分离培养、炭疽ELISA抗体检测及荧光定量PCR检测,对分离到的阳性标本以canSNP及MLVA15的方法进行分子分型,与陕西省历史菌株及国内部分省份菌株基因型进行聚类分析。结果 2016-2018年陕西省共炭疽病例14例,发病到诊断平均9天,地理分布以关中及陕北地区为主,8月份发病较多,人群分布性别比为6∶1(12/2),26~59岁占85.7%(12/14),农民占71.4%(10/14)。人体标本病原培养17份,分离到炭疽杆菌1株,阳性5.9%,环境标本培养77份均为阴性,ELISA检测阳性率83.3%(10/12),荧光定量PCR阳性率21.4%(3/14);陕西省炭疽菌株canSNP基因型为A.Br.001/002型,2015年、2018年及1953年菌株MLVA分型分别为MLVA15-38、31、CHN17基因型。结论 2016-2018年陕西省炭疽疫情属较低散发水平,主要分布在关中及陕北地区,8月为发病高峰,人群以青壮年男性农民为主。炭疽杆菌canSNP基因型为A.Br.001/002,与国内主要流行株相同。存在3种不同的MLVA15基因型。陕北地区MLVA15-38型,与北部内蒙古相近;关中地区MLVA15-31型,与甘肃省及新疆类似;历史上还曾有MLVA15-CHN17型。     

2009年泰安市流感监测资料分析

[目的]分析2009年泰安市流感流行特征及病原变化情况。[方法]对2009年5月11日至12月31日泰安市流感监测哨点医院和流感暴发疫情监测资料进行分析。[结果]2009年,监测哨点医院门诊流感样病例占同期门急诊就诊总数的4.97%,这一比例,第20～35周为2.71%,第35～42周为7.06%,第43～50周为7.84%,第51～53周为3.70%;检测690例病人鼻咽拭子或下呼吸道标本,流感病毒核酸阳性率为45.36%,阳性标本中甲型H1N1流感病毒占87.54%。期间发生流感样疾病暴发疫情61起,其中由甲型H1N1流感病毒引起的占83.61%。[结论]甲型H1N1流感病毒是2009年流感流行季节的优势毒株。     

2010—2019年天水市腹泻症候群病例监测结果分析

目的 了解天水市腹泻症候群病例的病原构成和流行特征。 方法 采集2010年7月—2019年7月天水市2所哨点医院门诊、急诊就诊的腹泻患者粪便标本,依据科技重大专项传染病监测技术平台项目 《腹泻症候群监测技术方案》要求进行监测,对结果进行统计分析。 结果 2010 年7月—2019年7月,共监测腹泻症候群病例750例,其中男性477例(占63.60%),女性273例(占36.40%);职业以散居儿童为主,占59.33%(445/750);共采样750份,粪便形状以水样便为主,占66.13%(496/750)。标本中共检出病毒105份,检出率14.00%(105/750),其中检出率最高者是诺如病毒39份(5.20%);检出细菌33份,检出率4.40%(33/750),其中检出最高者是致泻性大肠埃希菌20份(2.67%);有2份标本细菌和病毒同时监测阳性;细菌检出集中在7月和8月,病毒相对集中在1、10、11和12月。 结论 2010—2019年天水市腹泻症候群病例监测的主要病原体为诺如病毒和致泻性大肠埃希菌,婴幼儿高发,建议要密切关注儿童,根据优势病原和高发月份,采取针对性防控措施。     

2012―2019年泰州市呼吸道感染性疾病综合监测结果分析

  目的  了解泰州市流感样病例(influenza-like illness, ILI)和严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection, SARI)病例的流行病学特征,为科学制定防控策略提供依据。  方法  收集哨点医院ILI病例和SARI病例基本信息并采集咽拭子标本,用PCR法开展13种呼吸道病原体检测,用χ2检验进行统计学分析。  结果  2012年4月―2019年12月ILI就诊百分比(ILI%)和SARI就诊百分比(SARI%)分别为7.27%和2.44%,具有秋冬季流行高峰。共检测956例ILI病例和557例SARI病例的标本,二者的病原阳性检出率分别为50.84%(486/956)、39.14%(218/557)。肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae, SP)、流感病毒(influenza virus, Flu)、流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae, HI)、人鼻病毒(Human rhinovirus, HRV)为优势病原体,其检出率分别为14.81%、9.25%、9.39%、7.73%。总混合感染率为30.11%(212/704),主要为SP合并其他病原体感染。低年龄组病原体检出阳性率高于高年龄组,0~ < 5岁儿童的检出率达34.83%(χ2=54.47, P < 0.001)。冠状病毒(human coronavirus, HCoV)的检出率为2.12%,以HCoV-OC43亚型为主(46.88%),各亚型季节分布不明显。  结论  泰州市哨点医院呼吸道综合监测发病呈秋冬季的流行高峰,主要病原体为SP、Flu、HI、HRV,15岁以下年龄组检出率较高,应针对重点人群采取综合性呼吸道疾病防控措施。     

2015-2016年度龙山县感染性腹泻病原学监测结果分析

目的了解2015-2016年度龙山县感染性腹泻病例的病原学特征,为制定相应的防控措施提供科学依据。方法2015年5月-2017年4月,收集在龙山县哨点医院就诊的符合纳入标准的腹泻病例相关信息,采集粪便标本进行肠道致病菌及病毒检测,并进行数据分析。结果共调查并检测264例感染性腹泻病例,检出阳性病例98例,总感染率为37. 1%。2015、2016年度感染率分别为45. 0%、30. 6%,差异有统计学意义(χ~2=5. 851,P=0. 016)。细菌、病毒的感染率分别为13. 3%、25. 4%,差异有统计学意义(χ~2=12. 443,P<0. 001)。共分离出致病菌35株,阳性率为13. 3%,以沙门菌为主(74. 3%);共分离出病毒78株,阳性率为29. 5%,以诺如病毒为主(61. 5%),细菌、病毒病原谱构成差异均有统计学意义(χ~2=36. 260,P<0. 001;χ~2=11. 957,P=0. 008)。不同性别病原检出阳性率及病原谱构成差异无统计学意义(P> 0. 05);青少年组、壮年组和老年组病毒检出阳性率分别为45. 2%、19. 2%、10. 8%,差异有统计学意义(χ~2=24. 175,P<0. 001)。各年龄组细菌检出阳性率及细菌、病毒病原谱构成差异均无统计学意义(P>0. 05)。7-9月份细菌检出阳性率高,检出沙门菌22份,占总数的84. 6%; 11月-次年3月病毒检出阳性率高,诺如病毒春秋季感染较多,共检出36份,占总数的75%,轮状病毒感染呈现秋冬季高峰特点,共检出9份,占总数的60%。结论 2015-2016年度龙山县腹泻病例的主要病原是沙门菌、诺如病毒和A组轮状病毒,且具有明显的季节流行特征。     

武威市食源性疾病病例实验室检测结果分析及耐药监测结果

目的分析武威市449例食源性疾病病例实验室检验结果,了解本市食源性疾病发病原因及流行趋势,为采取相应的风险监管提供科学依据;了解致病菌抗生素敏感情况,为合理用药提供依据。方法按照《2017年武威市食源性疾病监测计划》,对食源性疾病病例进行实验室检测、汇总和分析。结果共检出病原体57株(12.69%);其中诺如病毒38株(8.46%),致病菌19株(4.23%);致病菌中沙门菌检出率最高(2.90%);诺如病毒中以诺如病毒Ⅱ(8.46%)最高;男性检出率(15.75%)高于女性(8.72%),差异有统计学意义(χ^2=4.92,P<0.05);诺如病毒检出率以春季最高,差异有统计学意义(χ^2=28.18,P<0.05);致病菌检出率以秋季最高,差异有统计学意义(χ^2=8.24,P<0.05);感染者主要集中在0岁~5岁年龄组;不同菌株之间耐药性体现差异大,不同抗生素对19种菌株所体现出的抑制作用也各不相同。结论继续加强食源性疾病监测力度,防止聚集性食物中毒事件的发生和暴发,加强各类抗生素管理、使用和敏感检测。     

鄂尔多斯市2009年-2016年流感病毒监测分析

目的掌握本地流感发病趋势,为流感防控提供可靠依据。方法对ILI咽拭子标本进行实时荧光定量PCR核酸检测。结果2009年-2016年门(急)诊共接诊ILI 53093例,ILI就诊百分比为5.18%;核酸检测ILI 3386例,阳性481份,乙型流感病毒阳性率最高,占44.49%,其次为季H3和新H1N1。流感的流行高峰为每年11月-次年3月。阳性率在男、女间差异无统计学意义。0岁~4岁ILI病例数、采集标本数,阳性数均最高;5岁~14岁阳性率最高,为23.11%;≥60岁ILI病例数、采集标本数、阳性数和阳性率均最低。ILI百分比与流感病毒核酸阳性率的时间流行趋势以及ILI和ILI流感病毒核酸检测的人群年龄分布均基本一致。结论新H1N1、乙型和季H3为主要流行型别;冬春季是流感流行高峰期;男、女均普遍易感;婴幼儿和中小学生是流感流行防控重点人群。将ILI病例监测和流感病毒病原学监测紧密结合,使得流感预警和防控更及时、有效。     

铁岭市一起皮肤炭疽疫情中炭疽芽胞杆菌的快速检测与分析

目的 对2015年7月铁岭市发生一起皮肤炭疽疫情中运用UPT上转发光免疫分析仪联合荧光定量PCR技术进行描述与分析,探讨可以快速现场检测炭疽芽胞杆菌的方法。方法 采集疑似皮肤炭疽患者的焦痂下涂抹样本10份和炭疽疫区外环境样本19份,运用上转发光免疫层析技术联合荧光定量PCR技术对标本进行检测,与此同时进行细菌分离培养。结果 10份患者的痂下涂抹物样本和2份病死牛血污染土壤样本在上转发光免疫层析技术和荧光定量PCR技术检测结果均呈现阳性。细菌分离培养技术仅分离到1株炭疽芽胞杆菌。结论 实验室检测结果充分证明此次疫情的病原体为炭疽芽胞杆菌的感染。上转发光免疫层析技术和荧光定量PCR方法的联合应用,能快速、特异、灵敏检测出炭疽芽胞杆菌,具有推广应用价值。     

2010 - 2017年宝鸡市流感样病例病原学检测结果分析

目的 对宝鸡市流感样病例（ILI）标本进行病原学检测,分析检测结果和流行特征,揭示本地区流感流行规律,为流感的防控提供科学依据。方法 通过国家流感监测系统,收集2010-2017年度宝鸡市中心医院流感样病例监测数据,采集病毒咽拭子标本,进行病原学检测,分析检测结果和流行特征。结果 2010年4月 - 2017年3月共报告ILI数为11 964例,占就诊总人数的比例为2.84%。各监测年度ILI年均百分数依次为4.31%、2.86%、2.97%、1.53%、2.22%、3.14%、3.15% ;流感病毒核酸检测年均阳性率分别为16.61%、20.09%、9.09%、16.40%、21.57%、27.49%、14.90%。ILI发病年龄以15岁以下人群居多。ILI百分数和流感病毒核酸检测阳性率随时间变化均呈现出冬春季（12月 - 次年2月）高峰特征。流行的流感毒株以甲型H1N1(2009)、季节性H3、乙型Vitoria、乙型Yamagata交替流行为特征。结论 宝鸡市流感流行呈现出冬春季活动高峰的特征,病原学检测显示各亚型毒株逐年交替流行,未发现其他新亚型毒株。     

2007—2011年上海市青浦区感染性腹泻病监测结果

目的了解2007-2011年上海市青浦区感染性腹泻致病菌的发生、病原构成、流行特征及变化趋势,探讨防治对策。方法收集2007-2011年12月期间青浦区监测点医院肠道门诊腹泻病例的粪便或肛拭子标本7268份,对哨点监测医院中就诊的腹泻病患者,采集肛拭子标本进行增菌后,分别接种在以下5种培养基（双洗碱性蛋白胨水、WS琼脂、麦康凯琼脂（MAC）和木糖赖氨酸去氧胆酸钠（XLD）、山梨醇麦康凯琼脂）中作霍乱弧菌、沙门菌、志贺菌以及致病性大肠埃希菌、疑似0157的检验。结果在7268份标本中,共分离到83株菌,检出率为1．14％。其中副溶血弧菌位居阳性检出菌的首位,占86．75％（72／83）;志贺菌和沙门菌分别占7．23％（6／83）和6．02％（5／83）。将每年的阳性监测结果进行卡方检验,差异有统计学意义（X^2=173．43,P〈0．01）。结论青浦区感染性腹泻病的主要致病菌依次为副溶血性弧菌、沙门菌和志贺菌等。