人类白细胞抗原-DP基因多态性与卵巢癌患者临床病理参数的相关性分析

目的探讨人类白细胞抗原-DP (HLA-DP)基因多态性与卵巢癌患者临床病理参数的相关性,为临床诊治卵巢提供参考依据。方法应用Taq Man探针方法检测248例卵巢癌患者和454例健康对照组rs3077和rs9277535位点基因型,比较不同基因型与卵巢癌患病风险以及卵巢癌患者临床病理参数的相关性。结果 rs3077和rs9277535位点突变纯合基因型AA在病例组人群中均显著高于对照组(调整OR=1.82,95%CI=1.11～3.01;调整OR=1.89,95%CI=1.26～2.97);此外,与携带rs3077 GG+GA和rs9277535 GG+GA基因型的个体相比,携带1～2个危险基因型的个体发生卵巢癌的风险显著,差异有统计学意义(P0.01);然而,未发现HLA-DP基因遗传多态性与卵巢癌临床病理参数存在相关性。结论 HLA-DP基因多态性与卵巢癌的发病风险存在关联。     

HLA-DP基因多态性与卵巢癌临床病理参数的关联研究

目的探讨人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigens,HLA)DP基因多态性与卵巢癌临床病理参数的关联性。方法应用TaqMan探针方法,检测rs3077和rs9277535位点基因型,比较卵巢癌患者和健康对照者,探讨不同基因型与卵巢癌患病风险以及卵巢癌临床病理参数的关系。结果 rs3077和rs9277353位点突变纯合基因型AA病例组中占比均显著高于对照组(调整OR=1.82,95%CI:1.11~3.01;调整OR=1.89,95%CI:1.26~2.97);与携带rs3077 GG+GA和rs9377357GG+GA基因型的个体相比,携带1~2个危险基因型的个体发生卵巢癌的风险显著(P0.01);尚未发现HLADP基因遗传多态性与卵巢癌临床病理参数存在关联。结论 HLA-DP基因多态性与卵巢癌的发病风险存在关联。     

人类白细胞抗原DP基因多态性与特发性膜性肾病遗传易感性研究

目的探讨人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DP基因多态性与中国人群特发性膜性肾病(Idiopathic Membranous Nephropathy,IMN)遗传易感性的关系。方法选取185例特发性膜性肾病患者和405位健康对照作为研究对象,应用Taq Man-MGB探针基因分型方法检测HLA-DP基因多态性位点(rs3077和rs9277535)的基因型分布。结果采用多因素logistic回归分析,rs3077位点结果显示,突变基因型AA在特发性膜性肾病组中的频率均显著高于健康对照组(调整OR=1.92,95%CI=1.09-3.38);单倍型分析显示,与GG单倍型相比,携带AA单倍型的个体可增加特发性膜性肾病的患病风险;(调整OR=2.86,95%CI=1.58-5.58);此外,rs3077位点的突变基因型AA可增加特发性膜性肾病患者发生肾功能衰竭的风险(调整OR=3.11,95%CI=1.53-6.32)。结论 HLA-DP基因多态性与特发性膜性肾病遗传易感性存在关联,且与特发性膜性肾病患者的肾功能也具有相关性。     

着色性干皮病基因多态性及单体型与肺癌遗传易感的关联

目的探讨DNA的修复基因着色性干皮病基因B(XPB)、XPD、XPG的单核苷酸多态性和单体型与肺癌遗传易感的关联。方法用病例-对照研究的方法,选择海南省有吸烟暴露史、诊断明确的肺癌患者100例为病例组,与其有相近吸烟暴露史、胸外科其他疾病(如胸外伤、支气管扩张、肺结核等)患者100例为对照组。采用质谱法检测XPB基因rs4150441和rs4150434,XPD基因rs171140和rs11878544,XPG基因rs4771436、rs2094258、rs17655位点的多态性,采用Halopview软件进行单体型构建,探讨XP基因多态性及单体型与肺癌遗传易感性的关联。结果 XPB基因的rs4150434位点,携带GA基因型个体患肺癌的易感性是携带GG基因型个体的2. 071倍(OR=2. 071,95%CI 1. 055～4. 067),携带AA基因型个体患肺癌的易感性是携带GG基因型个体的2. 535倍(OR=2. 535,95%CI 1. 063～6. 044)。XPG基因的rs4771436位点,携带GG基因型个体患肺癌的风险是携带TT基因型个体的2. 494倍(OR=2. 494,95%CI 1. 038～5. 992)。XPG基因的rs2094258位点,携带AA基因型个体对肺癌的易感性是携带GG基因型个体的3. 020倍(OR=3. 020,95%CI1. 015～8. 980)。单体型结果显示,XPB基因rs4150441位点(G> A)和XPB rs4150434位点(G>A)所构成的单体型中,GA单体型的肺癌易感性是GG单体型的3. 643倍(OR=3. 643,95%CI 1. 113～11. 921)。XPG基因rs2094258位点(G>A)、rs4771436位点(T>G)和rs17655位点(C>G)所构成的单体型中,ATC单体型的肺癌易感性是GTC单体型的3. 800倍(OR=3. 800,95%CI 1. 073～13. 459)。结论XPB rs4150434、XPG rs4771436、XPG rs2094258位点多态性与肺癌的遗传易感性相关联,XPB基因的GA单体型和XPG基因的ATC单体型可能增加肺癌的发病风险。     

HLA-DP基因多态性与丙型肝炎病毒感染转归的关系

摘要:目的　探讨人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigens,HLA）DP基因多态性与高危人群丙型肝炎病毒（Hepatitis C Virus,HCV）感染转归的关系。方法　采用病例对照研究设计,运用Taqman-MGB技术检测401例HCV持续感染者,268例HCV自限感染者和984例健康对照者HLA-DP基因rs3077、rs9277535、rs2395309位点的基因多态性,比较不同基因型与HCV感染转归的关系。结果　采用Logistic回归分析调整性别、年龄和高危人群种类混杂因素后结果显示,rs3077位点:杂合基因型CT和突变型TT在感染组（持续感染组+自限清除组）中的频率均显著高于对照组（调整OR值及其95%CI分别为1.31,1.05～1.64和1.93,1.36～2.73）;rs2395309位点:杂合基因型GA和突变型AA在感染组中的频率均显著高于对照组（调整OR值及其95%CI分别为1.29,1.03～1.61和1.89,1.34～2.68）;rs9277535位点:杂合基因型GA和突变型AA在持续性感染组中的频率均高于自限清除组（P＝0.018,P＝0.037）。结论　rs3077、rs9277535、rs2395309三个位点的基因多态性可能与丙型肝炎转归有一定的关联。     

HLA-DQ基因遗传变异与丙型肝炎病毒感染转归的相关性研究

目的 探讨遗人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）DQ基因多态性与丙型肝炎感染转归的关联。方法 应用TaqMan探针方法检测339例丙型肝炎病毒（hepatitis C virus,HCV）持续感染者,262例HCV自限感染者和942例健康对照者HLA-DQ基因rs2856718和rs7453920位点的基因多态性,比较不同基因型与丙型肝炎病毒感染转归的关系。结果 采用多因素Logistic回归分析,结果显示rs2856718位点杂合基因型AG在感染组中的频率均低于对照组（调整OR=0.73,95%CI:0.56~0.94）;另外,rs7453920 AA基因型可增加个体对HCV的易感性（调整OR=1.75,95%CI:1.01~3.03）。结果显示,与AG单倍型相比,携带AA单倍型的个体可增加丙型肝炎易感性（调整OR=1.67,95%CI:1.11~2.52）。分层分析结果发现,在男性人群中,rs2856718位点的杂合基因型AG在感染组中的频率低于对照组（调整OR=0.68,95%CI:0.51~0.93）;在45~60岁人群中,rs7453920位点突变纯合基因型GG在感染组中的频率高于对照组（调整OR=2.35,95%CI:1.11~4.98）。结论 HLA-DQ基因多态性与丙型肝炎病毒感染转归存在关联。     

HLA-DQ基因多态性与汉族人群丙型肝炎感染转归的相关性研究

目的探讨人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)DQ基因多态性与汉族人群丙型肝炎病毒(HCV)感染转归的关联。方法应用TaqMan探针方法,在江苏地区HCV高危人群中检测339例持续感染者、262例自限感染者和942例健康对照者的HLA-DQ基因rs2856718和rs7453920位点的基因多态性,分析不同基因型与HCV感染转归的关系。结果多因素logistic回归分析结果显示,rs2856718位点杂合基因型AG在感染组中的频率均低于对照组(调整OR=0.73,95%CI:0.56~0.94);单倍型分析显示,与AG单倍型相比,携带AA单倍型的个体可增加丙型肝炎易感性(调整OR=1.67,95%CI:1.11~2.52)。结论 HLA-DQ基因多态性与汉族人群丙型肝炎病毒感染转归存在关联。     

SMAD4基因多态性与煤工尘肺易感性

目的 探讨SMAD4基因单核苷酸多态性(SNPs)与煤工尘肺易感性的关系.方法 采用病例-对照的研究方法,选择438例煤工尘肺患者为病例组,448例同单位、同工种、工龄接近、无尘肺的煤尘接触者为对照组,进行统一的问卷调查;拍摄高仟伏X线后前位胸片;采集外周静脉血,酚-氯仿法提取DNA;根据中国人群HapMap database数据库查找SNP位点,多聚酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测SMAD4 6个SNPs位点的基因型.结果 6个SNPs位点的基因型分布频率中,仅SMAD4(rs10502913)病例组和对照组各基因型分布频率比较,差异有统计学意义(x2=6.512,P=0.038).携带SMAD4(rs10502913)AA基因型者发生煤工尘肺的危险性明显增高(调整后OR=1.63,95%CI=1.00～2.69,P=0.05);以是否吸烟为分层分析显示,携带SMAD4(rs10502913)AG基因型的不吸烟者发生煤工尘肺的危险性降低(调整后OR=0.54,95%CI=0.37～0.78,P＜0.01),而携带SMAD4(rs10502913)AG、AA基因型的吸烟者发生煤工尘肺危险性均增高(AG调整后OR=1.59,95%CI=1.01～2.50,P＜0.05;AA调整后OR=2.28,95%CI=1.09～4.80,P＜0.05);以煤工尘肺分期为分层分析显示,Ⅰ期尘肺组携带SMAD4(rs10502913)AA基因型者发生尘肺的危险性是携带GG型的2.42倍(调整后OR=2.42,95%CI=1.41～4.14,P＜0.01).携带SMAD4(rs9304407)GG基因型者煤工尘肺患病危险性与CC基因型比较明显降低(调整后OR=0.65,95%CI=0.43～0.98,P＜0.05);以是否吸烟为分层分析显示,不吸烟携带SMAD4(rs9304407)GC、GG基因型者发生煤工尘肺危险性明显降低(GC基因型调整后OR=0.60,95%CI=0.36～1.00,P＜0.05;GG基因型调整后OR=0.43,95%CI=0.25～0.74,P＜0.01).结论 SMAD4(rs10502913)位点AA基因型增加了煤工尘肺的危险性,SMAD4(rs9304407)位点GG基因型可能在尘肺的发生发展中起保护性作用.     

Regulome - SNP: shc1 rs11264233与延边地区原发性肝癌风险性的研究

目的 探讨shc1 rs11264233与延边地区肝癌风险性的关系。方法 选取延边地区599名肝癌患者和599名健康对照组人群为研究对象。采用PCR - RFLP方法检测基因型及等位基因分布频率。二元logistic 回归模型分析shc1 rs11264233位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 shc1 rs11264233位点存在G和A两种等位基因,GG、GA和AA基因型。shc1 rs11264233位点基因型符合哈迪-温伯格遗传平衡规律。共显性模型中与携带GG基因型的个体相比携带AA基因型的个体更容易患PHC（调整OR = 1.512,95% CI:1.087～2.102,P = 0.014）,隐性模型中AA基因型PHC组风险度显著高于GG和GA组合型中（调整 OR = 1.461,95% CI:1.101～1.940,P = 0.009)。结论 shc1 rs11264233位点单核苷酸多态性与延边地区肝癌风险有明显相关性。     

脂氧酶12 -183G＞A变异影响非小细胞肺癌发病风险

摘要:目的　探讨位于脂氧酶12（LOX12）基因启动子区-183G＞A单核苷酸多态与非小细胞肺癌发病风险之间的关系。方法　选取非小细胞肺癌患者956例及健康对照994例,利用PCR-限制性片段长度多态性方法进行基因分型,以多变量Logistic回归分析比值比（OR）及其95%可信区间（95%CI）。结果　LOX12 -183GG、GA、AA各基因型频率在病例组分别是20.8%、53.6%、25.6%,在正常对照组分别为26.8%、52.2%、21.0%。与-183GG基因型相比,AA基因型明显增加非小细胞肺癌的发病风险,其OR（95%CI）为1.53（1.17～2.00）;而GA基因型并不增加非小细胞肺癌发病风险,其OR（95%CI）值为1.23（0.98～1.55）。吸烟分层分析显示,以携带-183GG基因型的不吸烟者为参照,携带-183AA基因型的重度吸烟者发生非小细胞肺癌的风险为9.12（95% CI:5.07～16.41,P＜0.001）,大于不吸烟但携带-183AA 基因型者的OR值（OR＝2.03,95% CI:1.34～3.09,P＝0.001）与重度吸烟但携带-183GG基因型OR值（OR＝6.84,95%CI:3.81～12.31,P＜0.001）之和。结论　LOX12 基因启动子区-183G＞A单核苷酸多态可与吸烟交互作用共同增加非小细胞肺癌发病风险。     

Relationship between HLA-DP gene polymorphisms and clearance of chronic hepatitis B virus infections: case-control study and meta-analysis

Hepatitis B virus (HBV) infection is a serious public health problem worldwide. Two common genetic variants (rs3077 and rs9277535) of human leukocyte antigen DP (HLA-DP) have been reported to be associated with persistent HBV infection in populations of Japan and Thailand. To confirm whether the association can be replicated in Chinese populations, an independent case-control study were conducted, and two polymorphisms (rs3077 and rs9277535) were genotyped using the TaqMan SNP genotyping assay in 282 persistent chronic HBV carriers and 64 spontaneously HBV recovered carriers. To provide a more definitive conclusion, a meta-analysis combining and summarizing five studies was performed by random-effects model using the DerSimonian and Laird's method. By using logistic regression analysis with adjustment for covariates, including age, sex, and alcohol consumption, the results of our independent case-control study showed that the minor allele's homozygote (AA genotype) of rs3077 and rs9277535 was significantly associated with decreasing risk/protection of HBV persistent chronic infection (for rs3077: P=0.0017, OR=0.29, 95% CI=0.13-0.62; for rs9277535, P=0.0004, OR=0.26, 95% CI=0.12-0.54). The results of meta-analysis pooling all eligible studies also showed that rs3077-A and rs9277535-A alleles were associated with an increased clearance rate to HBV infection (rs3077: OR=0.57, 95% CI=0.44-0.75; rs9277535: OR=0.56, 95% CI=0.47-0.63). These results further confirmed the strong influence of HLA-DP gene variants on risk of spontaneous HBV clearance from persistent HBV infection. Both A alleles of HLA-DP SNP rs3077 and rs9277535 showed strong protective effects for spontaneous HBV clearance from persistent HBV infection in the Han Chinese population.     

Protective effects of HLA-DPA1/DPB1 variants against Hepatitis B virus infection in an Indonesian population

Human leukocyte antigen (HLA) DPA1/DPB1 variants have been reported to influence Hepatitis B virus (HBV) infection. HLA-DPA1/DPB1 plays a pivotal role in antigen presentation to CD4⁺ helper T cells and influences the outcome of HBV infection. To investigate the influence of HLA-DP variants on the outcome of HBV infection in an Indonesian population where it has the third-highest prevalence of HBV infection worldwide, we performed a case–control study of 686 participants, including patients with HBV-related advanced or nonadvanced liver disease, patients with spontaneously resolved HBV, and healthy controls. Single-nucleotide polymorphisms in HLA-DPA1 (rs3077) and HLA-DPB1 (rs3135021, rs9277535, and rs228388) were genotyped using real-time TaqMan® genotyping assays. Because rs2281388 deviated from Hardy–Weinberg equilibrium, it was excluded from subsequent analyses. The results of logistic regression analyses showed that the HLA-DPB1 rs9277535 variants were associated with a reduced risk of persistent HBV infection (odds ratio [OR] 0.70, 95% confidence interval [95% CI] 0.52–0.96, P = 0.026, additive genetic model; OR 0.60, 95% CI 0.38–0.96, P = 0.033, dominant genetic model). The HLA-DPA1 rs3077 variant was associated with a protective effect increasing the spontaneously resolved HBV infection (OR 0.64, 95% CI 0.41–0.98, P = 0.039, dominant genetic model). By contrast, the HLA-DPB1 rs3135021 variant was not associated with the outcome of HBV infection, including susceptibility, spontaneously resolved, or disease progression. Combinations of haplotype markers were also associated with HBV susceptibility (CA for rs3077–rs9277535, OR 0.57, 95% CI 0.36–0.92, P = 0.021; GA for rs3135021–rs9277535, OR 0.56, 95% CI 0.36–0.86, P = 0.0087). In conclusion, these findings confirm that HLA-DPA1/DPB1 variants were associated with the outcomes of HBV infection in an Indonesian population.     

HFE基因多态性与丙型肝炎病程进展的相关性研究

目的 探讨遗传性血色素沉着病蛋白(Hemochromatosis,HFE)基因多态性与中国汉族人群丙型肝炎病程进展的关联。方法 应用TaqMan探针方法检测262例无症状携带者和253例进展性肝炎组rs2071303和rs9366637位点基因型,比较不同基因型与与丙型肝炎病程进展相关性。结果 采用多因素logistic回归分析,结果显示rs2071303位点突变基因型AA可以增加丙型肝炎进一步进展的风险(调整 OR=1.78,95% CI:1.08-2.92);单倍型分析显示,与GC单倍型相比,携带AC单倍型的个体可增加丙型肝炎进一步进展的风险;(调整 OR=2.86,95% CI:1.58-5.58)。结论 HFE基因多态性与中国汉族人群丙型肝炎病程进展存在关联。     

Keap1 rs11668429和 AHSA2 rs728825与延边地区原发性肝癌发病风险的研究

目的 探讨Keap1 rs11668429和AHSA2rs728825与延边地区肝癌易感性的关系.方法 选取延边地区192名肝癌患者为病例组、190名健康人为对照组进行研究.采用PCR-RFLP方法检测基因型及基因频率.采用二元logistic回归模型分析Keap1 rs11668429位点和AHSA2rs728825...     

DNA双链断裂修复基因NBS 1多态性与肺癌易感性的关联研究

目的 探讨DNA双链断裂修复基因NBS1多态性与肺癌遗传易感性的关系.方法 采用病例对照设计,应用PCR-RFLP技术检测575例患者和575名对照的NBS1基因多态.结果 对照组和病例组NBS1 rs1805794的C/C、C/G、G/G基因型频率分别为25.9%、51.8%、22.3%和20.5%、52.3%、27.1%,两组分布差异有统计学意义(χ~2=6.38,P=0.04),携带C/G+G/G基因型个体患肺癌的风险是携带C/C基因型者的1.46倍(OR=1.46,95%C1:1.09～1.97).对照组和病例组NBS1 rs2735383的G/G、G/C、C/C基因型频率分别为37.9%、47.0%、15.1%和35.5%、48.5%、16.0%,两组分布差异无统计学意义(χ~2=0.75,P=0.69).携带Hap4-GC单体型或Hap4/Hap2单体型对者患肺癌的风险增加,OR值分别为1.70(95%CI:1.24～2.31)和1.75(95%CI:1.11～2.76),NBS1基因多态与吸烟有联合作用(P＜0.05).结论 NBS1 rs1805794 G/G基因型可能是肺癌的易感基因型,rs1805794和rs2735383位点构建的Hap4-GC单体型及Hap4/Hap2单体型对可能是肺癌的易感单体型和单体型对.     

IKBKAP基因多态性与原发性肺癌易感性的病例对照研究

目的 探索IKBKAP基因多态性及单体型与肺癌易感性的关联。方法 采用病例对照研究,使用飞行时间质谱法对IKBKAP SNPs进行基因分型。运用非条件Logistic回归分析探究SNPs与肺癌易感性的关联。应用R软件运行Haplo.stats程序包,分析单体型与原发性肺癌的关联。结果 携带rs2230793 CC基因型者发生原发性肺癌的危险是AA+AC携带者的1.386倍（95%CI:1.007~1.907）。经一般人口学特征校正后,rs1538660 TT基因型者发生原发性肺癌的危险是携带CC基因型的0.713倍（95%CI:0.515~0.986）;携带rs1538660 TT基因型发生原发性肺癌的危险是携带CC+CT基因型的0.724倍（95%CI:0.530~0.988）。rs1538660、rs3204145 TA单体型携带者的原发性肺癌风险是CT携带者的0.862倍（95%CI:0.753~0.987）。结论 IKBKAP基因多态性与原发性肺癌的发生有关。     

MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒遗传易感性关系

目的探讨MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒易感性的关系。方法采用病例-对照研究,以268名苯中毒工人为病例组,268名接触苯而没有中毒表现的工人为对照组。应用TaqManPCR分析技术判定MPO(rs7208693),NQO1(rs1800566),GSTP1(rs947894)和UGT1A6(rs6759892,rs1105879,rs4124874,rs3755319,rs887829和rs4148323)基因型。结果携带GSTP1基因rs947894G等位基因个体患慢性苯中毒的危险性比AA基因型个体降低0.657倍(95%CI0.434~0.994,P=0.046);携带MPO基因rs7208693A等位基因人群中,UGT1 A6 rs6759892G等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT基因型的2.702倍(P=0.024),UGT1 A6 rs1105879C等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT型的2.619倍(P=0.035)。在饮酒人群中,携带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加9.000倍(95%CI1.460~55.478,P=0.021);在吸烟人群中,带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加7.000倍(95%CI1.555~31.575,P=0.012)。单倍型分析显示,本人群携带UGT1A6基因TACGGG单倍型个体慢性苯中毒的发病风险是携带TAATGG单倍型个体的1.446倍(OR=1.446,95%CI1.005~2.080,P=0.046)。结论同时携带MPO基因rs7208693A和UGT1A6基因rs6759892G或rs1105879C等位基因型个体对苯中毒易感;携带NQO1基因rs1800566TT基因型且同时吸烟或饮酒的个体对苯中毒易感;携带UGT1A6基因TAATGG单倍型个体可增加慢性苯中毒的发病风险;GSTP1基因多态与慢性苯中毒遗传易感性的关系仍需进一步研究。     

广东人群CYP1A1 MspⅠ基因多态性与肺癌易感性研究

目的：探讨广东人群CYP1A1 MspⅠ基因多态性与肺癌易感性的关系。方法：以病例-对照的研究方法，采用PCR技术，检测原发性肺癌患者、住院对照各91例及47名健康对照的CYP1A1 MspⅠ基因型，分析各基因型及与吸烟的交互作用和肺癌易感性的关系。结果：吸烟者的肺癌风险显著增加(0R＝1．87，95％CI：1．10—3．19)(P＜0．05)；MspⅠ突变型在病例组、对照组中各占39．56％、28．26％，其个体的肺癌风险增加(0R＝1．53，95％CI：0．81—2．88)，而杂合型则降低(0R＝0．83，95％CI：0．43--1．60)，携带一个以上突变基因的个体肺癌风险增加(0R＝1．15，95％CI：0．66—2．00)；分层分析发现，吸烟的突变型个体肺癌风险显著增加(0R＝2．56，95％CI：1．05—6．25)(P＜0．05)，而不吸烟对突变型(0R＝0．84，95％CI：0．11—6．21)，尤其是杂合型(0R＝0．27，95％CI：0．09—0．80)(P＜0．05)基因个体有明显的保护作用。结论：CYP1A1 MspⅠ突变型基因是吸烟者肺癌易感性的遗传标记，而杂合型基因可降低非吸烟者的肺癌风险。