中国南方汉族人群HLA-Cw座位基因多态性分析

目的 分析中国南方汉族人群HLA－Cw座位基因多态性。方法 采用ARMS／PCR技术对60名随机选择的南方汉族健康个体作HLA－Cw基因分型。结果 共检出12种HLA－Cw等位基因或等位基因组（allele group)，其中HLA－Cw*07、＊01、＊03为该人群最常见HLA－Cw基因，频率之和为0．6932；证实该群体中HLA－Cw＊08频率为0．1056，检出率明显高于血清学分型；检出HLA－Cw*1202、＊1203、＊14、＊15等4种经典血清学分型不能鉴定的HLA－Cw基因，频率之和为0．0673。结论 提供了中国南方汉族人群HLA－Cw座位基因频率正常值，证实ARMS／PCR作HLA－Cw分型具有准确、快捷的优点。     

广东汉族人群HLA-Cw基因多态性分析

检测HLA Cw在广东汉族人群中的基因频率 ,与其他人群进行比较 ,分析该人群HLA Cw等位基因多态性及其特点。骨髓移植供者 15 8例 ,抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR RSSO分型检测Cw。结果显示 ,广东汉族人群HLA Cw基因频率分布由高至低依次为 :Cw 0 3(0 2 5 80 ) >Cw 0 7(0 1887) >Cw 0 1(0 1732 ) >Cw 0 8(0 10 70 ) >Cw 14 (0 0 6 5 4 ) >Cw 0 4(0 0 5 87) >Cw 15 (0 0 4 5 3) >Cw 12 (0 0 387) >Cw 0 6 (0 0 32 2 ) >Cw 0 5 (0 0 12 7) >Cw 16 (0 0 0 32 )。Hardy Weinberg平衡检验 χ2 =6 0 35 ,υ =5 4 ,P >0 1。表明广东汉族群体Cw 0 3、 0 7、 0 1、 0 8出现频率较高 ,该人群Cw等位基因处于遗传平衡状态 ,具有较为丰富的多态性及特点。     

中国北方汉族HLA基因C位点遗传多态性研究

目的：研究北方汉族人群HLA(人类白细胞抗原)基因c位点的遗传特征。方法：采用序列特异性引物扩增(Polymerase Chain Reaction-Sequence-Specific Primers PCR-SSP)方法对205个样本进行HLA-C及-A、-B基因特异性分析。结果：检出C位点特异性14个，其中Cw*01、*07基因表现频率最高，分别为30．73％和27．80％；血清学方法检测不出的HLA-Cw*12、*14、*15表现频率分别为13．17％、4．88％、8．78％。统计显示显著性连锁不平衡的HLA-B-C单倍型24个，HLAs-A-C单倍型5个。结论：作为中国北方人HLA遗传多态性群体调查，提供了一套比较完整准确的基因频率和连锁不平衡参数，为人类学及疾病相关性等研究提供了较为完整的正常参考数据。     

中国南方汉族人群HLA—DQA1位点多态性与系统性红斑狼疮易感…

应用多聚酶链反应／序列特异寡核苷酸探针杂交（ＰＣＲ／ＳＳＯＰＨ）方法，探讨了我国东南沿海汉族人群ＨＬＡ－ＤＱＡ１等位基因多态性与系统性红斑狼疮（ＳＬＥ）的易感性关系，对５０例ＳＬＥ患者和６７例健康人对照血样本分析，表明ＳＬＥ患者具有显著高的ＤＱＡ１＊０１０２等位基因频率，ＯＲ＝４６．０４，Ｐ＜０．００１，可能是一易感等位基因，而ＤＱＡ１＊０５０１在病例与对照中呈相反结果，ＯＲ＝０．０４２，Ｐ＝０。     

造血干细胞移植供受体人群HLA-Cw基因遗传多态性研究

目的调查了人类白细胞抗原（human leucocyte antigen，HLA）Cw位点在中国汉族人群中的等位基因分布规律，为进一步研究Cw位点的遗传特征提供背景资料。方法采用序列特异性引物扩增技术对1285名无关个体进行HLA-Cw基因特异性分析，并对其分布规律进行统计学分析。结果共检测到23种HLA-Cw位点的等位基因，其中HLA-Cw＊01、＊03、＊07、＊08为主要基因型，其基因频率分别为0．1529、0．2385、0．1747、0．1004，并检出HLA-Cw＊12、＊14、＊15、＊16、＊17等血清学方法不能鉴定的HLA-Cw基因；统计结果表明HLA-Cw位点的基因分布符合Hardy-Weinberg平衡（χ^2=73．74，df=98，P〉0．5）。结论本研究结果为中国汉族人群提供了一套较为完整HLA-Cw基因遗传学参数。     

中国人群HLA-Cw、KIR2D受体基因多态性分析

目的 分析中国南、北方两个汉族人群、一个蒙古族人群的人类白细胞抗原-Cw(human leucocyte antigen-Cw,HLA-Cw)遗传多态性;进一步分析南、北方汉族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体2D(killer immunloglobulin-like receptor 2D,KIR2D)基因的遗传多态性、与HLA-Cw的组合特点.方法 采用聚合酶链反应-序列特异性引物技术(polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)检测湖南地区112名汉族人群、内蒙古地区98名汉族人群、内蒙古地区83名蒙古族人群HLA-Cw基因、第80位密码子(Lys80、Ash80)多态性;检测两个汉族人群KIR2DL 1/2/3、KIR2DS 1/2基因分布.结果 (1)湖南地区汉族人群与内蒙古地区汉族、蒙占族人群在HLA-Cw等位基因、第80位密码子的频率差异均有非常显著的统计学意义(P＜0.001),而内蒙古地区汉族、蒙古族人群之间上述频率差异无统计学意义(P＞0.05).(2)南、北方两个汉族人群间,5个KIR2D基因频率、各基因型频率差异无统计学意义(P＞0.05).(3)两个汉族人群均以Asn80/Asn80,2DL1+/2DL2-/2DL3+/2DS1-/2DS2-组合模式最为常见(45/112、29/98);其次为Asn80/Asn80,2DL1+/2DL2-/2DL3+/2DS1+/2DS2-(18/112,16/98)和Asn80/Lys80,2DL1+/2DL2-/2DL3+/2DS1-/2DS2-(11/112,17/98).Lys80/Lys80,2DL1+/2DL2-/2DL3+/2DS1-/2DS2-组合模式的频率差异有统计学意义(1/112,8/98;Fisher's P=0.0134),其余11种组合模式在两个人群间的频率差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 提供了中国南方湖南地区、北方内蒙古地区正常汉族人群的HLA-Cw、5个KIR2D受体基因多态性数据、蒙古族人群HLA-Cw DNA分型数据;提示我国南、北方汉族人群在HLA-Cw第80位密码子、KIR2D受体基因的组合层面上可能存在着以抑制性信号通路为优势的共同特点.     

湖南汉族人群HLA-DP、-DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性

目的 探讨湖南汉族人群HLA—DP、HLA—DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间的关系。方法 应用聚合酶链反应—特异性寡核苷酸探针基因分型技术对87例湖南汉族鼻咽癌患者与91名健康对照作HLA—DPAl、—DPBl、—DQAl及—DQBl的基因分型，采用x^2检验比较两组各位点等位基因频率，单倍型频率分布的差异。结果 发现鼻咽癌组DPAl*0201、DPBl*1901、DQAl*0201较对照组明显降低，DPBl*0402、DQAl*0101较对照组明显升高；单倍型DPAl*0201—DPBl*1401及DQAl*0201—DQBl*0201较对照明显降低；但P值经Bonferroni校正后，差异均无显著性(Pc＞0．05)。结论 湖南汉族人群HLA—DP和—DQ位点与鼻咽癌无明显相关，与以往用受累同胞对方法在鼻咽癌家系中未能证实鼻咽癌易感基因与HLA—DP和—DQ位点连锁的结果一致。     

山东地区汉族人 HLA-DPB1基因单核苷酸多态性

使用第十一届国际组织相容性会议提供的HLA－DPB1引物序列，由PCR技术扩增人HLA－DPB1基因第二外显子。产物纯化后，直接核酸序列分析确定个体的HLA－DPB1外显子核酸序列。使用基因定型软件与国际上公布的HLA－DPB1核酸序列构建的基因型核酸序列数据库进行比较，确定个体的基因型别、确定等位基因类型。研究结果提示中国人HLA－DPB1第二外显子基因序列与国际上公布的序列基本一致，但有不同之处，多处存在单核苷酸多态性（SNP），提示存在有新的等位基因。对51例个体研究显示，出现频率最高的等位基因是DPB1＊02012。     

昆明彝族人群HLA-DRB1、DQB1基因多态性

目的　调查昆明彝族 HL A- DRB1、DQB1基因的多态性。方法　应用聚合酶链反应 -序列特异性引物基因分型技术 ,对昆明地区 70名彝族健康儿童进行了 HL A- DRB1、DQB1位点的基因分型。结果在 HL A- DRB1位点共检出了 12种等位基因 ,其中等位基因频率大于 10 %的依次为 HL A- DRB1* 12 (33.5 7% )、DRB1* 0 90 1(11.4 3% )、DRB1* 0 4 (11.4 3% ) ,等位基因频率大于 5 %而小于 10 %的依次为 DRB1* 0 1(8.5 7% )、DRB1* 11(7.86 % )、DRB1* 14 (7.14 % )、DRB1* 15 (7.14 % )、DRB1* 0 8(5 % ) ,等位基因频率小于 5 %依次为 HL A- DRB1* 0 3(2 .86 % )、DRB1* 13(2 .14 % )、DRB1* 0 7(1.4 3% )、DRB1* 16 (1.4 3% )。在 HL A- DQB1位点共检出了 7种等位基因 ,其中等位基因频率大于 10 %的依次为 HL A- DQB1*0 30 1(45 % )、DQB1* 0 5 (2 2 .14 % )、DQB1* 0 30 3(12 .14 % ) ,等位基因频率大于 5 %而小于 10 %的依次为DQB1* 0 4 (6 .4 3% )、DQB1* 0 6 (6 .4 3% ) ,等位基因频率小于 5 %的依次为 DQB1* 0 2 0 1(4.2 9% )、DQB1* 0 30 2 (3.5 7% )。结论　昆明彝族 HL A基因多态性分布不同于北方汉族人群 ,也不同于南方汉族人群 ,有其独特性。     

上海汉族人群MICA基因第5外显子微卫星多态性研究

目的 了解上海地区汉族人群ＭＩＣＡ基因第５外显子微卫生多态性分布,以及ＭＩＣＡ基因与其紧密连锁的ＨＬＡ－Ｂ基因位点的关系。方法 用ＰＣＲ－异源双链分析法,对１７５名正常无关个体的ＭＩＣＡ基因第５外显子微卫星多态性的分布进行研究。结果 （１）上海地区汉族人群ＭＩＣＡ基因第５外显子存在５种等位基因,其中ＭＩＣＡ＊Ａ５最为常见（３９．１４％）,其次为＊Ａ５．１（２２．２９％）;（２）ＭＩＣＡ等位基因与Ｈ     

中国彝族人群HLA-A基因的DNA分型

HLA具有高度多态性 ,不同民族和地区的人群在HLA基因型别和频率分布上存在很大差异。我国是一个多民族国家 ,分析不同民族人群HLA基因的多态性可为疾病相关联研究、移植免疫及群体遗传学提供有价值的参考数据。作者利用近几年发展起来的PCR SSPDNA分型方法对中国彝族人群HLA A基因的多态性进行了分析 ,以便为以后的免疫学研究提供背景资料。1　材料与方法1.1　研究对象　样本来自四川凉山彝族自治州 ,随机选取三代均为彝族且无亲缘关系的健康个体 10 2例。1.2　模板DNA的制备　取研究对象静脉血 2 0 0 μL用QIAampDNABloodMin…     

用PCR-SSP作HLA-B位点分型及B22亚型分析

目的:用DNA分型弥补血清学HLAB位点分型的欠缺并了解南方汉族B22亚型分布情况。方法:采用标准细胞作参照,建立B位点的PCRSSP分型方法;并对血清学B22阳性标本进行B22亚型分析。结果:104株标准细胞PCRSSP分型结果与已知结果完全一致,17例白血病人及同胞分型与血清学一致,1例不符;B22亚型以B5401最多,B5601较少,1例分型格局异常,可能为新B22等位基因或错配的DNA双链。结论:PCRSSP可用于B位点的DNA分型,比血清学更直观精确,操作简便,不受疾病状态影响。     

丙型肝炎病毒基因型分布及HLA-Cw基因多态性的关联性分析

目的 对邯郸不同HCV基因型的分布情况进行统计,结合HLA-Cw的基因多态性,分析HCV与HLA-Cw的关联性.方法 采用荧光PCR法进行HCV基因分型检测,计算不同HCV基因型的阳性率,从而对该地区的丙肝病毒感染者进行流行病学调查;采用病例-对照研究,对所有研究对象的基因组进行HLA基因分型,统计HCV感染者和健康对照者之间HLA-Cw基因频率的差异和关联度;对所有丙型肝炎病毒感染者,采用统计学方法分析HLA基因型别和血清中HCV-RNA的基因型别的关联性,从而寻找与不同HCV基因型感染相关的HLA-Cw基因型.结果 邯郸HCV 1b亚型在人群中的分布最多,其次为混合型1b/2型;HLA-Cw* 8与HCV的慢性感染有关,而其他7个基因位点经研究关联不大,进一步研究发现,HLA-Cw * 8基因与HCV 1b亚型的易感性密切相关.结论 HLA-Cw基因与HCV感染密切相关,可进行易感人群分析,为控制HCV的传播提供可参考的理论依据.     

运用PCR-SSP技术对羊水细胞ABO血型基因定型研究

目的探讨PCR序列特异性引物（PCR-sequence specific primer,PCR-SSP）技术对胎儿羊水细胞ABO血型基因定型研究,分析母儿血型吻合情况。方法选择2008年1月～2010年2月于我院优生优育门诊及产前诊断中心就诊O型血孕妇80例,其丈夫血型分别为A型40例,B型37例,AB型3例。以上80例孕妇于孕16～21周在B超直视下经腹羊膜腔穿刺抽取羊水20～30ml,其中10ml经高速离心取沉淀的羊水细胞,用常规酚氯仿法提取羊水DNA,运用PCR-SSP技术通过PCR反应特异性扩增ABO基因片段,凝胶电泳检测PCR产物,根据产生的特异性PCR产物来鉴定相应的基因来分析血型。同期运用变性高效液相色谱分析（denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC）技术对羊水血型检测结果进行验证。余20ml羊水行细胞培养细胞遗传学分析。另回访40例已出生的胎儿,采集外周静脉血分别运用PCR-SSP技术和常规血清学检测方法鉴定ABO血型,比较产前和产后血型检测结果。结果运用PCR-SSP技术从80例羊水DNA中成功检测79例（79/80,98.75%）,其血型分别为A型21例,B型20例,O型38例。同期运用DHPLC技术对PCR-SSP技术检测结果进行验证,两种检测结果相符。已出生40例婴儿外周血血型分析结果与产前诊断血型结果相符。结论 PCR-SSP技术产前诊断胎儿羊水ABO血型具有可行性,进而分析母儿血型吻合情况,为ABO抗体效价显著增高的孕妇临床用药指导提供实验室依据。     

Low resolution DNA typing of the HLA-B5 cross-reactive group by nested PCR-SSP

Abstract: We have established a DNA typing system for the HLA-B5 serologically cross-reactive group (CREG) by means of a two-step PCR amplification with nested sequence-specific primers (nPCR-SSP). The present study provides a low resolution definition of the HLA-B5 CREG, i.e. identifying polymorphism equivalent to serology. Two different primer combinations allow group-specific amplification of all HLA-B5 CREG alleles and other related HLA class I alleles from genomic DNA. The amplified DNA is subjected to a second amplification step using eleven nested primer pairs. This assay permits the detection of the HLA-B5 CREG specificities B35, B51, B52, B53, and B7801 in all homozygous and heterozygous combinations. Sensitivity and specificity as judged by a blind quality control study investigating a reference panel (n=50) is 100%. Extension of this approach should allow rapid DNA typing of all serologically defined HLA-B specificities by nPCR-SSP.     

Allele-specific HLA-B*15 typing by PCR-SSP and its application to four distinct ethnic populations

Abstract: We present a set of primer mixes for the allele-specific typing of the HLA-B*15 group by PCR-SSP. The set comprises 46 primer mixes which are designed to unequivocally resolve all but two of the 666 possible combinations of the B*15 alleles, B*1501–37 (B*1536 sequence unavailable). A core subset of 34 of the 46 mixes can be used alone to give a high resolution B*15 typing set. This allows for the identification of each B*15 allele when present as the only B*15 allele and the majority of the possible B*15 homozygotic combinations. The method was validated using reference DNA samples and the B*15 allele frequency in 4 distinct ethnic populations was investigated. The results show that these populations contain predominantly mutually exclusive sets of B*15 alleles.     

中国傈僳族和怒族群体人类白细胞抗原Ⅰ类基因区Alu插入多态性研究

目的 研究中国两个隔离群体(傈僳族和怒族)人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)Ⅰ类基因区域内5个HLA-Alu插入多态性(AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和AluHF)的分布特征.方法 应用聚合酶链反应技术对中国两个隔离群体傈僳族(107人)和怒族(104人)进行HLA-Alu多态性分型.结合HLA基因分型数据,分析这两个群体中HLA-Alu插入与HLA-A、HLA-B和HLA-C基因的关系.根据HLA-Alu频率计算各群体间遗传距离,构建系统进化树.结果 AluTF和AluHF插入的频率在这两个群体间的差异有统计学意义(P＜0.05),其余位点差异无统计学意义.HLA-Alu插入与HLA的关联程度在两个群体中有差异,如AluTF*2与HLA-B* 56:01均有关联,但在傈僳族中呈强关联(74.0％),在怒族中仅存在中等程度的关联(30.7％).傈僳族和怒族群体中,HLA-Alu插入与HLA基因的不同亚型具有关联,如AluHG*2与HLA-A* 02的不同亚型存在关联.系统进化树显示中国傈僳族和怒族与我国南方群体及泰国人群聚为一支.结论 不同群体中HLA-Alu插入与HLA不同等位基因的关联程度存在差异,这种差异性为研究HLA Ⅰ类基因多样性的产生和进化、祖先单倍型的形成以及该区域内连锁不平衡和重组提供了新的线索.     

Anchored PCR cloning of the novel HLA-Cw*0704 allele detected by PCR-SSP

Abstract: The novel HLA-Cw*0704 allele, previously detected as the PCR-SSP variant Cw7/8v, has been cloned and sequenced from the homozygous typing cell KR03/4 after amplification by anchored PCR. The nucleotide sequence of Cw*0704 is closely related to those of other Cw*07 alleles, but carries specific changes in exon 3 consistent with its serological behavior - a short Cw7 cross-reactive with antibodies directed against HLA-Cw8. Some of the substitutions of Cw*0704 have not been previously described for HLA-C but are found in HLA-B alleles and in published C sequences of non-human primates. The new allele carries a novel polymorphism in its 5' untranslated region (5'ut) that could be shared by all Cw*07 alleles. By PCR-SSP, Cw*0704 is a relatively common allele in English Caucasoids at a frequency of 4.6%. It is most often observed on HLA-B44 haplotypes previously described as HLA-C "blank", although linkage disequilibria with other HLA-B specificities have been found.     

云南大理白族HLA-DRB1、-DQB1等位基因多态性分析

目的:了解白族人群人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA) Ⅱ类基因-DRB1、-DQB1位点的遗传多态性.方法:采用PCR-SSP方法对124名云南大理洱源白族健康个体进行HLA-DRB1、-DQB1等位基因分型.结果:共检出21种DRB1等位基因,15种DQB1等位基因.其中主要的等位基因有DRB1*1202(26.61%)、DRB1*0901(13.89%)、DRB1*0803(9.92%)、DQB1*0301(31.45%)、DQB1*0601(10.08%)和DQB1*0401(8.06%).主要单倍型包括DRB1*1202-DQB1*0301(20.08%)和DRB1*0803-DQB1*0601(7.19%).结论:大理白族同其他10个民族群体HLA-DRB1、DQB1频率比较和聚类分析显示大理白族属于中国南方人群,但与其他群体存在一定的遗传距离,有着独特的HLA基因特性,对群体遗传及疾病相关性研究具有参考意义.     

云南昆明白族、汉族、彝族儿童HLA-DQA1等位基因多态性分析

为了解昆明白族、汉族、彝族儿童HLA-DQA1等位基因多态性。采用PCR-SSP技术对昆明地区无血缘关系的3个民族儿童的HLA-DQA1等位基因进行分析。结果显示3个民族儿童HLA-DQA1基因位点上共检出14种等位基因。其中昆明白族儿童HLA-DQA1最常见的等位基因为*0601(16.67%),高频等位基因为*0103、*0102、*0303;昆明汉族儿童HLA-DQA1最常见的等位基因为*0302(26.67%),高频等位基因为*0103、*0601;昆明彝族儿童HLA-DQA1最常见的等位基因为*0601(38.57%),除*0601外没有高频等位基因,余基因频率均小余10%,同时在基因排序上3个民族也存在着差异。结果提示,昆明地区3个民族儿童HLA-DQA1基因分布既有共同特点,又有其独特性。