UGT1A1基因多态性与伊立替康为主方案治疗晚期结直肠癌的毒性和疗效的相关性分析

目的 探讨中国汉族人结直肠癌患者尿苷二磷酸葡糖苷酸转移酶1A1（UGT1A1）基因多态性分布,评价UGT1A1基因多态性与伊立替康（CPT-11）为主方案治疗晚期结直肠癌的毒性和疗效的关系。方法 以CPT-11为主的FOLFIRI方案（CPT-11 180mg／m²）和IFL方案（CPT-11 125mg／m²）治疗晚期结直肠癌,检测患者的UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型,分析UGT1A1基因多态性及其与化疗毒性、疗效和预后的相关性。结果 共纳入192例患者,189例行UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型检测,野生型占37.6％,1个位点变异型占43.9％,2个位点突变异型占18.5％。183例可评价毒副反应,3～4级中性粒细胞减少的发生率为26.6％（51／183）;3～4级迟发性腹泻的发生率为15.1％（29／183）。2个位点变异的患者3～4级迟发性腹泻发生率显著高于野生型患者（26.5％vs.9.0％,P=0.021）。UGT1A1*28野生型、杂合突变型、纯合突变型的2～4级迟发性腹泻的发生率分别为29.6％、37.5％和88.9％,差异具有统计学意义（P=0.02）。UGT1A1*28纯合突变者4级中性粒细胞减少的发生率为33.3％,高于UGT1A1*28野生型的9.6％,但差异无统计学意义（P=0.07）。Logistic多因素分析显示UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型是2～4级迟发性腹泻的影响因素。CPT-11剂量高者的3～4级中性粒细胞减少（OR=5.666,95%CI：2.088～15.377,P=0.001）和2～4级迟发性腹泻（OR=4.481,95%CI：1.568～12.807,P=0.005）发生率也显著升高。158例可评价疗效,获CR 3例、PR 30例、SD 91例、PD 34例,总有效率为20.9％。2个位点变异患者的有效率为33.3％,高于野生型的15.3％,但差异无统计学意义（P=0.063）。治疗时间在6周以下者疾病进展的风险显著增加（OR=6.106,95％CI：1.680～22.197,P=0.006）。Cox多因素分析显示,ECOG评分、治疗时间及治疗方案是影响患者预后的独立因素,而UGT1A1基因多态性与预后无关。结论 UGT1A1*28和UGT1A1*6基因型2个位点变异的患者应用CPT.11为主方案化疗的不良反应发生率较高,但疗效较好,由不良反应导致的治疗时间缩短可能会影响其获得更好的疗效。     

β-catenin与大肠癌干细胞标记物EpCAMhigh／CD44+在大肠癌中的表达及临床意义

目的 探讨Wnt／β-catenin通路对大肠癌干细胞的调节及侵袭转移能力的影响。方法 免疫组化双重染色法检测80例大肠癌患者原发灶及10例肝转移灶组织中大肠癌干细胞标记物EpCAM^high／CD44⁺的表达,免疫组化SP法检测上述组织中Wnt通路关键蛋白β-catenin的表达,分析β-catenin、EpCAM／CD44蛋白在大肠癌组织中的表达与临床病理特征之间的关系及两者的相关性。结果 β-catenin在大肠癌及癌旁正常肠黏膜组织的异常表达率分别为55.0％（44／80）和10.0％（2／20）,差异有统计学意义（P＜0.05）。β-catenin在肝转移灶中的异常表达率为90.0%（9／10）。EpCAM／CD44在大肠癌及癌旁正常肠黏膜组织中的阳性表达率分别为66.3％（53／80）和0（0/20）。大肠癌原发灶中β-catenin的异常表达与性别、年龄、肿瘤大小无关,而与分化程度、浸润深度、Dukes分期及转移密切相关（P＜0.05）;EpCAM^high／CD44⁺表达与性别、肿瘤大小无关,而与年龄、分化程度、浸润深度、Dukes分期及转移密切相关（P＜0.05）。EpCAM／CD44在β-catenin异常表达组中的阳性表达率为84.1％,显著高于在其正常表达组的44.4％,差异有统计学意义（P＜0.05）。经Pearson相关性分析,β-catenin与EpCAM／CD44的表达呈正相关,差异有统计学意义（r=0.417,P=0.000）。结论 Wnt／β-catenin通路的异常激活有可能参与大肠癌干细胞的异常增殖,进而导致肿瘤的复发转移。     

舒尼替尼促进人肝癌细胞HepG2的凋亡及其分子机制

目的：探讨苹果酸舒尼替尼对人肝癌HepG2细胞凋亡的作用及其机制。方法：常规体外培养HepG2细胞,利用MTT法检测舒尼替尼杀伤HepG2细胞的IC50,Western blotting 检测药物处理前后HepG2细胞分子靶点蛋白表达,膜联蛋白(Annexin-V)/碘化丙啶(PI)双标法和TUNEL染色法检测舒尼替尼处理前后HepG2细胞凋亡情况,实时荧光定量PCR检测药物处理前后HepG2细胞凋亡基因 mRNA的表达情况。结果：舒尼替尼杀伤HepG2细胞的IC50值为（3.22±0.50）μmol/L。以对HepG2细胞无明显抑制作用的剂量1 μmol/L舒尼替尼处理HepG2细胞后,细胞内VEGFR1、VEGFR2、PDGFRα、Kit、FLT3蛋白表达均有不同水平下降（均P<0.05）,HepG2细胞的凋亡率\[(15.18±1.28)% vs (5.90±0.45)%,P<0.05\]、凋亡指数（AI）\[(23.54±4.73) vs (4.17±0.64), P<0.05\]均显著升高。舒尼替尼处理HepG2细胞后,上调促凋亡基因Bax、NOXA、PUMA、P53 mRNA表达水平（均P<0.05),降低抑凋亡基因Bcl-2、X-IAP mRNA表达水平（均P<0.05）。结论： 舒尼替尼能够诱导肝癌HepG2细胞凋亡,其机制可能是通过上调促凋亡基因的表达及降低抑凋亡基因表达水平来实现的。     

NSCLC患者CYP2D6基因多态性与吉非替尼不良反应相关性研究

目的:探索口服吉非替尼片后代谢过程中不良反应发生与CYP2D6基因多态性的关系。方法:收集2016.01-2018.12于新疆医科大学附属肿瘤医院病理确诊的NSCLC患者180例,使用ARMS法行基因检测具有EGFR19del或21L858R敏感突变,并口服吉非替尼,随访过程中根据是否发生不良反应分为肝损组和非肝损组,皮疹组与非皮疹组并收集患者的外周血。应用聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR)-限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism,RFLP）检测以上患者CYP2D6基因rs1065852位点的基因型。通过χ2检验探究吉非替尼靶向治疗肝损害及皮疹发生的危险因素。结果:非小细胞肺癌患者CYP2D6基因rs1065852位点的基因型、肿瘤分期、基因突变类型与使用吉非替尼发生肝损害相关,CYP2D6基因rs1065852位点的基因型,肿瘤分期与吉非替尼靶向治疗皮疹发生相关,对临床用药有指导意义。结论:口服吉非替尼片的晚期非小细胞肺癌患者,CYP2D6的rs1065852位点基因多态性可预测肝功能及皮疹发生可能性。     

ATM基因多态性与乳腺癌患病风险及临床病理特征的相关性分析

目的:探讨共济失调毛细血管扩张突变基因（ataxia-telangiectasia mutated gene,ATM）单核苷酸多态性（SNP）rs189037和rs609261两个位点多态性与乳腺癌患病风险及临床病理特征的关系。方法:收集我院未接受放、化疗的乳腺癌根治标本和乳腺良性肿瘤标本。采用多重SNaPshot法检测ATM基因rs189037和rs609261两个位点多态性,分析其与乳腺癌患病风险及临床病理特征的关系。结果:ATM基因rs189037位点多态性与乳腺癌患癌风险及临床病理特征无关（GA基因型,P=0.667）;rs609261位点携带TC、CC基因型的淋巴结转移患者患癌风险高于TT基因型携带者（TC+CC显性模型,P=0.015）。ATM基因rs189037和rs609261两个位点等位基因频率和基因型分布与免疫组化指标（ER、PR、HER2、Ki-67）无相关性（rs189037位点GA+AA显性模型和rs609261位点TC+CC显性模型,ER:P=0.676、0.675;PR:P=0.758、0.573;HER2:P=0.203、0.327;Ki-67:P=0.189、0.405）。结论:ATM基因rs189037位点与乳腺癌患癌风险及临床病理特征、免疫组化指标无明显相关性。rs609261位点携带TC、CC基因型的淋巴结转移患者可能增加患病风险。     

非霍奇金淋巴瘤ＭＤＲ１基因Ｃ３４３５Ｔ位点多态性的临床研究

目的　探讨ＭＤＲ１基因Ｃ３４３５Ｔ位点多态性与非霍奇金淋巴瘤（ＮＨＬ）临床特征、病理类型、化疗疗效及血液毒性的关系。方法　收集６７例ＮＨＬ患者外周静脉血及相关的临床资料;应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析技术检测患者ＭＤＲ１基因Ｃ３４３５Ｔ位点基因型,采用卡方检验,评估ＭＤＲ１基因Ｃ３４３５Ｔ位点多态性与ＮＨＬ患者临床病理特征、化疗疗效及化疗后血液毒性的关系。结果　（１）ＭＤＲ１基因Ｃ３４３５Ｔ位点的ＣＣ／ＣＴ基因型和ＴＴ基因型在年龄、病理细胞来源、临床分期、体能状况、结外器官受累数目、化疗前乳酸脱氢酶水平方面的差异均无统计学意义（Ｐ＞０.０５）。（２）ＣＣ／ＣＴ基因型和ＴＴ基因型患者的缓解率差异无统计学意义（Ｐ＞０.０５）。（３）ＴＴ基因型患者４级白细胞减少的发生率显著高于ＣＣ／ＣＴ基因型（Ｐ＜０.０５）,但两组患者血红蛋白减少和血小板减少的发生率差异无统计学意义（Ｐ＞０.０５）。结论　ＭＤＲ１基因Ｃ３４３５Ｔ位点多态性与ＮＨＬ化疗后的缓解率无关,与ＮＨＬ的临床病理特征亦无关,ＴＴ基因型患者化疗后出现４级白细胞减少的风险增大。     

VEGFR2基因rs10013228多态性对R0切除结直肠癌患者预后的影响

目的   探讨血管内皮生长因子受体2（VEGFR2）基因rs10013228位点多态性与R0切除结直肠癌患者预后的关系。方法 收集2010年1月至2015年12月接受R0手术切除的154例结直肠癌患者的外周血及术后93例结直肠癌组织标本,采用Tagman探针PCR基因分型技术对VEGFR2基因rs10013228位点进行基因分型,采用实时定量PCR（QPCR）检测组织中VEGFR2 mRNA水平,分析rs10013228基因型分布与临床病理特征（年龄、性别、肿瘤部位、分化程度、病理分期和辅助化疗）及VEGFR2 mRNA水平的关系,根据随访数据分析rs10013228不同基因型的预后情况,采用 Cox 风险比例模型分析影响结直肠癌预后的因素。结果   全组154例患者外周血中共有VEGFR2基因rs10013228 AA型95例（61.69％）、AG型51例（33.12％）和GG型8例（5.19％）,最小等位基因频率为0.22。不同基因型分布与年龄、性别、肿瘤部位、分化程度、病理分期和辅助化疗均无关（P＞0.05）。154例结直肠癌患者的中位总生存期（OS）为4.90年。单因素分析显示性别和肿瘤部位与OS无关,而年龄、分化程度、病理分期、辅助化疗和rs10013228基因型与OS有关,其中rs10013228 AG/GG型的中位OS为5.60年,长于AA型的4.40年（P＜0.05）。多因素分析显示,年龄、病理分期及rs10013228基因型为影响结直肠癌患者预后的独立因素。QPCR检测发现结直肠癌组织中rs10013228 AA型的VEGFR2 mRNA水平高于AG、GG型（4.26±1.21 vs. 2.94±0.88）,差异有统计学意义（P＜0.05）。结论   结直肠癌患者中VEGFR2 rs10013228与VEGFR2表达和预后有关,其中携带突变等位基因者的VEGFR2表达降低且预后较好,该位点可能是通过影响VEGFR2表达来影响预后。     

VEGFR2 基因V297I 位点对贝伐珠单抗联合化疗一线治疗晚期非小细胞肺癌患者临床疗效的影响

[摘要] 目的：探讨血管内皮生长因子受体2（VEGFR2）基因V297I 位点对贝伐珠单抗联合化疗治疗晚期非小细胞肺癌（nonsmallcell lung cancer,NSCLC）患者疗效的影响。方法：收集2010 年1 月到2017 年1 月在河南中医药大学第三附属医院肿瘤科135 例一线接受贝伐珠单抗联合含铂双药化疗的晚期NSCLC患者的临床资料,用PCR-RFLP 法检测患者外周血VEGFR2 基因型,qPCR法检测患者癌组织中VEGFR2 mRNA的表达。通过Logistic 回归模型分析多态性位点的基因型和其他变量的相关性,用Kaplan-Meier 法分析基因型和预后的相关性,以Cox风险模型分析患者PFS的危险因素。结果：在VEGFR2 的多态性位点中,只发现了V297I 位点其有临床意义。V297I 位点位于该基因的编码区,在研究人群的基因分布频率为CC型99 例（73.33%）、CT型33 例（24.44%）、TT 型3 例（2.23%）,最小等位基因频率为0.14,3 种基因型分布频率符合哈迪温-伯格平衡（P>0.05）。135 例NSCLC 患者的ORR 为45.93%,中位PFS 为8.2 个月,中位OS 为20.8 个月。CT/TT 型和CC 型患者的ORR 分别为41.67%和47.47%（P>0.05）,中位PFS 分别为6.2 和8.6 个月（P<0.01）,中位OS分别为18.9 和21.5 个月（P<0.05）。CT/TT基因型患者癌组织中VEGFR2 mRNA水平明显高于CC 型患者（P<0.01）。影响NSCLC 患者PFS 的危险因素有：V297I 位点和性别、ECOG评分。结论：在接受贝伐珠单抗联合化疗治疗的晚期NSCLC患者中,VEGFR2 基因V297I 位点可能通过VEGFR2 基因的表达影响贝伐珠单抗一线治疗NSCLC患者的疗效和预后。     

新疆ABCG2基因多态性与乳腺癌复发的相关性研究

背景与目的:复发转移是影响乳腺癌患者生存预后的关键因素,其涉及的病理学机制复杂,临床上尚未开发出早期监测的生物学标志物。探讨三磷酸腺苷结合盒家族G2(adenosine triphosphate-binding cassette family G2,ABCG2)基因多态性与新疆地区乳腺癌患者辅助化疗2年后复发的相关性,分析其作为乳腺癌复发标志物的可能性。方法:收集2014年12月-2015年12月于新疆医科大学第三临床医学院接受手术治疗后2年内复发的乳腺癌患者150例,同期收集手术后2年内未出现复发的患者162例作为对照。收集临床资料,并检测rs2032582、rs1045642、rs2231137和rs2231142位点的多态性,比较4个位点与乳腺癌2年内复发的相关性。结果:两组患者在年龄、淋巴结转移个数、雌激素受体(estrogen receptor,ER)(+)、孕激素受体(progesterone receptor,PR)(+)、组织学分级中存在差异;rs2032582在两组之间表达存在差异,rs2032582 GG型在复发组中表达显著高于其他突变类型(P<0.05)。2年复发组中rs2032582位点G/T等位基因组的年龄显著高于A等位基因组(P<0.01),而A等位基因组的肿块大小、淋巴结转移个数和ER(+)显著高于G/T等位基因组(P<0.05)。结论:rs2032582位点可能与乳腺癌治疗2年后复发相关,rs2032582 GG基因型是乳腺癌复发的危险因素,ABCG2可作为早期监测乳腺癌复发的标志基因。     

KDR基因遗传变异与接受5-FU辅助化疗的结直肠癌患者预后的关系

[摘要] 目的：探讨激酶插入区受体（kinase insert domain receptor,KDR）基因遗传变异与接受5-FU 为基础辅助化疗的结直肠癌（colorectal cancer, CRC）患者预后的关系。方法：回顾性分析2012 年1 月至2017 年12 月在郑州人民医院肛肠外科接受手术切除治疗的CRC 患者共176 例的临床资料,并收集93 例术后癌组织标本。采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCRRFLP)技术检测KDR基因多态性位点基因型,采用qPCR检测癌组织中KDR基因mRNA的表达水平。通过logistic 回归模型分析多态性位点的基因型与其他变量的相关性,非参数检验分析KDR不同基因型的表达,采用Kaplan-Meier 生存分析单变量KDR基因型与患者预后的关系,并通过Cox 风险比例模型对其他变量进行校正。结果：在KDR 的多态性位点中,仅发现了rs2071559 位点具有临床意义。该位点在176 例CRC患者中的分布频率：TT基因型95 例（53.98%）,TC基因型70 例（39.77%）,CC基因型11 例（6.25%）;最小等位基因频率为0.26;3 种基因型分布符合Hardy-Weinberg 遗传平衡定律（P=0.690）。携带C等位基因的TC/CC基因型患者与野生型TT基因型患者的中位无复发生存期（mDFS）分别为4.4 和3.2 年（P< 0.05）;TC/CC基因型和TT基因型患者的中位总生存期（mOS）分别为5.2 和4.0 年（P<0.05）。对OS构建多变量的Cox模型校正后,TC/CC基因型对mOS具有明显影响（OR=0.55,P<0.05）。rs2071559 位点TC/CC基因型患者相对于野生型TT 基因型患者KDR mRNA 表达水平显著降低（P<0.01）。结论：KDR基因rs2071559 位点多态性与CRC患者临床治疗效果相关,其机制是可能通过影响KDR mRNA表达水平进而影响CRC患者的预后。     

长链非编码RNA H19单核苷酸多态性与前列腺癌易感性的关系分析

目的 探讨长链非编码RNA H19单核苷酸多态性（SNPs）与前列腺癌易感性的关系。 方法收集本院2013年1月至2016年9月经病理确诊的145例前列腺癌患者和162健康体检者的外周静脉血,根据最小等位基因频率（MAF）＞0.05和连锁不平衡参数r2＞0.8的原则筛选H19的4个TagSNPs（rs2839698、rs3024270、rs217727和rs2735971）并采用TaqMan MGB等位基因分型试剂盒进行基因分型,分析两组以上TagSNPs的基因型和等位基因分布差异及Hardy Weinberg平衡情况,以比值比（OR）及其95％置信区间（95％CI）评估前列腺癌的相对风险。结果 145例前列腺癌患者和162例健康体检者H19的4个TagSNPs均处于Hardy-Weinberg平衡状态。前列腺癌组与对照组rs3024270、rs217727基因型及等位基因分布的差异无统计学意义（P＞0.05）;rs2839698分布上,前列腺癌组AA基因型及等位基因A的分布频率分别为28.3％（41／145）和47.6％（138／290）,高于对照组的14.2％（23／162）和36.1％（117／324）,差异有统计学意义（P＜0.05）;rs2735971分布上,前列腺癌组CC基因型及等位基因C的分布频率分别为35.2％（51／145）和54.1％（157／290）,均高于对照组的19.7％（32／162）和38.6％（125／324）,差异有统计学意义（P＜0.05）。rs3024270、rs217727与前列腺癌易感性无关。与rs2839698 GG基因型相比,AA基因型的前列腺癌发生风险升高至2.525倍,而等位基因A较G升高至1.606倍;与rs2735971 TT基因型相比,CC及TC+CC基因型的前列腺癌发生风险升高分别至2.820和2.017倍（P＜0.05）;等位基因C较T升高至1.879倍（P＜0.05）。 结论 H19 rs2839698、rs2735971与前列腺癌易感性有关,其中携带突变等位基因的人群前列腺癌发生风险升高,作为前列腺癌易感人群的筛查有一定价值。     

超氧化物歧化酶2基因rs4880位点单核苷酸多态性与食管癌易感性的关系

目的探讨超氧化物歧化酶2（SOD2）基因rs4880位点单核苷酸多态性与食管鳞状细胞癌发生的关系。方法 收集2013年10月至2015年11月经病理确诊的380例食管鳞状细胞癌患者（食管癌组）的外周静脉血用基质辅助激光解吸／电离飞行时间质谱法（MALDI TOF MS）分析SOD2 rs4880的基因分型,同时收集380例非肿瘤患者（对照组）的外周静脉血进行对比。采用Hardy-Weinberg平衡分析SOD2 rs4880的遗传平衡情况,采用两分类Logistic多元回归比较两组SOD2 rs4880基因型和等位基因的分布差异,并计算比值比（OR）及其95％可信区间（95％CI）来评价发生食管鳞状细胞癌的相对风险。结果 食管癌组和对照组的SOD2 rs4880基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡。食管癌组和对照组的SOD2 rs4880 T＞C 3种基因型TT、TC、CC的分布频率分别为71.84％、22.37％、3.68％和74.74％、20.79％、3.42％,两组基因型分布频率的差异无统计学意义（P＞0.05）。两分类Logistic多元回归分析的结果显示：（1）与携带SOD2 rs4880 TT基因型的个体相比较,SOD2 rs4880 TC基因型、CC基因型发生食管癌的风险升高1.12倍,但差异无统计学意义（OR=1.12,95%CI：0.79～1.59,P＞0.05;OR=1.12,95%CI：0.52～2.43,P＞0.05）;（2）隐性模型中相对于TT+TC基因型,携带纯合突变CC基因型发生食管癌的风险升高1.09倍,差异无统计学意义（OR=1.09,95%CI：0.51～2.36,P＞0.05）;（3）经调整年龄、性别、吸烟及饮酒状态后,与携带SOD2 rs4880 TT基因型的个体相比较,携带SOD2 rs4880 CC基因型发生食管癌的风险升高1.10倍,差异亦无统计学意义（OR=1.10,95%CI：0.50～2.39,P＞0.05）。结论 SOD2 rs4880位点基因多态性可能不是食管鳞状细胞癌发生的易感因素,需要进一步扩大样本量予以证实。     

VEGFA and VEGFR2 genetic polymorphisms and survival in patients with diffuse large B cell lymphoma

We evaluated the impact of functional polymorphisms in the vascular endothelial growth factor A (VEGFA) and vascular endothelial growth factor 2 (VEGFR2) genes on the survival of patients with diffuse large B cell lymphoma (DLBCL). Five potentially functional polymorphisms in the VEGFA (rs699947, rs2010963 and rs3025039) and VEGFR2 (rs1870377 and rs2305948) genes were assessed in 494 DLBCL patients treated with rituximab plus CHOP chemotherapy. The associations of genotype and haplotype with overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) were analyzed. Of the five polymorphisms, VEGFR2 rs1870377T>A was significantly associated with both OS and PFS; in the dominant model, patients with the AA + TA genotypes had significantly better OS (P = 0.002) and PFS (P = 0.004) than those with the TT genotype. The association between significantly better OS and the AA + TA genotypes was observed separately in patients with low (0-2; P = 0.035) and high (3-5; P = 0.043) International Prognostic Index scores. Multivariate analysis showed that, relative to the AA + TA genotypes, the TT genotype was an independent prognostic factor for poor OS (HR, 1.71; 95% CI, 1.21-2.43; P = 0.002) and PFS (HR, 1.57; 1.13-2.17; P = 0.004). Other independent significant predictors of survival in patients with DLBCL were International Prognostic Index score, age > 60 years, lactate dehydrogenase concentration >normal, extranodal disease >1 and presence of B symptoms. The VEGFR2 rs1870377 polymorphism might affect survival in patients with DLBCL, suggesting that angiogenesis might be related to poor survival in these patients.     

MTHFR基因A1298C多态性与肠癌遗传易感相关性研究

目的：探讨亚甲基四氢还原酶基因（MTHFR）第7外显子区单核苷酸多态（single nucleotide polymo-rphism,SNP）位点A1298C（rs1801131）与中国南方人群肠癌发生的相关性。方法：应用基质辅助激光解吸电离飞行时间（MALDI-TOF）质谱检测224例肠癌和224例对照MTHFR基因多态位点rs1801131的基因型。结果：MTHFR rs1801131多态位点AA、AC、CC三种基因型在肠癌的频率为63.4%、32.6%和4.0%,与对照组（68.8%,29.9%和3%）相比差异不显著（P=0.12）;但男性人群中病例组和正常组的基因型差异接近显著（P=0.05）,携带CC基因型男性个体的肠癌发病风险显著增加（OR=8.38,95%CI：1.01-69.64）;相对于直肠癌,结肠癌与正常对照的基因型频率差别更大,P值分别为0.84和0.08;且男性结肠癌患者基因型分布和对照差异显著（P=0.01）。结论：MTHFR基因第7外显子区rs1801131位点的单核苷酸多态性可能与中国南方人群结肠癌的遗传易感性相关,而与直肠癌无关,特别是在男性人群中rs1801131 CC和CA基因型可能增加个体患结肠癌的风险。     

MTHFR 677C/T基因多态性与培美曲塞对晚期肺腺癌患者疗效的关系

目的 探索亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)677C/T基因多态性在预测培美曲塞治疗晚期肺腺癌疗效中的作用.方法 39例初治晚期肺腺癌患者入组并行培美曲塞/顺铂方案化疗,37例患者按要求完成治疗并进行随访.通过Taqman MGB探针实时荧光定量PCR方法检测患者MTHFR677 C/T位点的基因多态性,分析基因多态性与化疗客观缓解率(response rate,RR)和无进展生存时间(progressionfree survival,PFS)的关系.结果 MTHFR 677C/T基因频率:CC 40.5％ (15/37),CT 43.2％(16/37),TT16.2％ (6/37),MTHFR CC、CT和TT基因型客观缓解率之间差异无统计学意义(26.7％ vs 31.3％vs50.0％,P=0.582).CC基因型与CT或TT基因型之间PFS差异无统计学意义(4.7月vs 6.9月,P=0.499).结论 MTHFR 677C/T多态性可能与晚期肺腺癌培美曲塞化疗疗效无相关性.     

Pharmacogenetic determinants associated with sunitinib-induced toxicity and ethnic difference in Korean metastatic renal cell carcinoma patients

Purpose

The aim of this study was to investigate the pharmacogenetic determinants of sunitinib-related toxicity and ethnic difference in metastatic renal cell carcinoma (mRCC) among Korean patients.

Methods

A pharmacogenetic study was performed in 65 patients with mRCC treated with the standard schedule of sunitinib (50 mg orally once daily for 4 weeks-on/2 weeks-off). Detailed data regarding the toxicity of sunitinib, including thrombocytopenia, neutropenia, anemia, and hand–foot syndrome (HFS), were prospectively collected in a clinical trial program (n = 38) or standard oncology practice (n = 27). Total of 12 genetic polymorphisms in 8 candidate genes (CYP1A1, CYP3A5, ABCB1, ABCG2, PDGFRα, VEGFR2, RET, and FLT3) were analyzed for an association with treatment-related toxicity from sunitinib using Pearson χ ² test.

Results

Common grade 3 or grade 4 treatment-related toxicities were thrombocytopenia (36.9 %, 24/65), neutropenia (18.4 %, 12/65), anemia (7.7 %, 5/65), and HFS (12.3 %, 8/65). Patients carrying an ABCG2 421 AA genotype developed significantly more grade 3 or grade 4 thrombocytopenia, neutropenia, and HFS adjusted for age, sex, and Eastern Cooperative Oncology Group performance status, and body surface area (odds ratio compared with AC/CC genotypes [OR] 9.90, P = 0.04, thrombocytopenia; OR 18.20, P = 0.02, neutropenia; and OR 28.46, P = 0.01, HFS). In addition, total and surface protein ABCG2 protein expression was decreased in ABCG2 421 AA mutant cells compared to wild type.

Conclusion

Among 12 genetic polymorphisms, polymorphism in the ABCG2 421C>A gene may be mostly associated with the risk of sunitinib-related toxicity in mRCC patients. Considering the high frequency of 421C>A SNP in Asian, this may be related to differential toxicities among ethnic groups.     

miRNA-146a rs2910164基因多态性与肝癌易感性的Meta分析

目的系统评价miRNA-146ars2910164基因多态性与肝癌易感性之间的相关性。方法全面检索PubMed、Excerpta Medica Database（Embase）、中国生物医学文献数据库（Chinese Biomedical Literature Database,CBM）、the Cochrane Library、维普、谷歌学术和万方数据库,文献检索起止时间均为从建库至2013-11。搜集研究miRNA-146a rs2910164基因多态性与肝癌相关性的文献。对miRNA-146ars2910164G/C各基因型比较模型,包括G与C、GG与CC、GG与GC、GC与CC、GG＋GC与CC以及GG与GC＋CC,在病例组和对照组的分布情况进行定量综合分析。结果共纳入9篇文献,共有2 951例肝癌及3 217名健康对照。miRNA-146ars2910164基因多态性与肝癌易感性之间具有相关性,GG与CC比较的OR=1.21,95%CI为1.04～1.42,P=0.02;GC与CC比较的OR=1.15,95%CI为1.02～1.29,P=0.02;GG＋GC与CC比较的OR=1.16,95%CI为1.04～1.29,P=0.009。亚组分析结果发现,在亚洲人群中也有相似的结论,GC与CC比较的OR=1.15,95%CI为1.02～1.29,P=0.02;GG＋GC与CC比较的OR=1.16,95%CI为1.04～1.30,P=0.009。结论 miRNA-146ars2910164基因多态性与肝癌易感性之间具有相关性,并且miRNA-146a rs2910164基因多态性的CC基因型可能是肝癌的保护因素。     

Clinical relevance of vascular endothelial growth factor (VEGFA) and VEGF receptor (VEGFR2) gene polymorphism on the treatment outcome following imatinib therapy

BackgroundImatinib could reverse marrow angiogenesis and decrease the plasma level of vascular endothelial growth factor (VEGF) in chronic myeloid leukemia (CML) patients.Methods, materials and patientsThe current study investigated the impact of four vascular endothelial growth factor type A (VEGFA) and three vascular endothelial growth factor receptor type 2 (VEGFR2) gene polymorphisms on the outcomes of 228 CML patients following imatinib therapy. VEGFA genotypes such as -2578C>A (rs699947), -460T>C (rs833061), +405G>C (rs2010963) and +936C>T (rs3025039) loci and VEGFR2 genotypes (rs1531289, rs1870377 and rs2305948) were analyzed using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight-based method.ResultsIn single marker analyses, strong correlations were noted between complete cytogenetic response (CCyR) and VEGFR2 genotypes (rs1531289/rs1870377), between treatment failure and VEGFR2 genotype (rs1870377) and between progression to advanced disease and VEGFA genotypes (rs699947/rs833061). Three haplotypes of VEGFR2 gene were generated as follows: GT (46.1%), AT (27.9%) and GA (25.7%). Haplotype analyses showed good correlations between VEGFR2 haplotype and CCyR and treatment failure to imatinib. Multivariate analyses confirmed strong correlations of VEGFR2 polymorphisms (especially rs1531289, rs1870377 or VEGFR2 haplotype) with CCyR, treatment failure and of VEGFA genotype (rs699947) with progression to advanced disease.ConclusionThe VEGFR2 gene polymorphism correlates with cytogenetic response, treatment failure following imatinib therapy for CML, while VEGFA genotype correlates with progression to advanced disease.     

Association of RAD51 and XRCC2 Gene Polymorphisms with Cervical Cancer Risk in the Bangladeshi Women

Objective: Alterations in common DNA repair genes (RAD51 and XRCC2) may lead to cervical cancer (CC) development. In the present study, we analyzed the association between RAD51 rs1801320 and XRCC2 rs3218536 polymorphisms and CC. Methods: Variants were selected based on their associations with some cancers in several ethnicities and the risk allele frequency (>0.05) in different populations. The variants were detected using the PCR-RFLP method. Adjusted odds ratios (aOR) and 95% confidence intervals (CI) were determined by logistic regression models. Result: Significantly increased risk (p <0.05) were detected for both SNPs with CC (rs1801320- GC vs. GG: aOR=2.21, 95% CI=1.43-3.42; CC vs. GG: aOR=4.48, 95% CI=1.76-11.42; dominant model: aOR=2.49, 95% CI=1.65-3.76; recessive model: aOR=3.52, 95% CI=1.40-8.88; allele model: OR=2.30, 95% CI=1.63-3.26, and rs3218536- GA vs. GG: aOR=2.77, 95% CI=1.85-4.17; AA vs. GG: aOR=5.86, 95% CI=2.08-16.50; dominant model: aOR=2.97, 95% CI=1.99-4.42; recessive model: aOR=3.56, 95% CI=1.30-9.73; and allele model: aOR=2.21, 95% CI=1.62-3.00). Besides, older patients (>60 years) with rs1801320 showed significantly reduced risk (OR=0.53, 95% CI=0.29-0.96, p=0.04) but with rs3218536 depicted significantly increased risk (aOR=2.44, 95% CI=1.20-4.96, p=0.01) for CC. Conclusion: This study indicates an association of rs1801320 and rs3218536 polymorphisms with CC and confirms that patients older than 60 years are more likely to develop CC for rs3218536 polymorphism.