XRCC1、hOGG1基因多态性与喉癌遗传易感性的关系

目的 探讨X线修复交叉互补组1基因(X-ray repair cross complementing group 1,XRCC1)、8-羟基鸟嘌呤修复酶基因(human 8-oxoguanine glycosylase I,hOGG1)多态性与喉癌遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照设计,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法检测了72例经病理确诊的喉癌患者和随机抽样的72例无肿瘤、无遗传病对照者XRCC1-Arg399Gln、hOGG1-Ser326Cys多态性.结果 病例组XRCC1第399位密码子杂合型(Arg/Gln)及突变型(Gln/Gln)和hOGG1第326位密码子杂合型(Ser/Cys)及突变型(Cys/Cys)分布频率均高于对照组(P＜0.05),与携带XRCC1-399野生型(Arg/Arg)、hOGG1-326野生型(Ser/Ser)个体相比,携带该基因型的个体喉癌的发病风险分别升高了3.37和2.54倍.交互作用分析显示,吸烟组与不吸烟组相比,携带XRCC1、hOGG1各基因型的个体的喉癌发病风险差异未发现存在统计学意义(xH12=0.15,xH22=0.28,P＞0.05).结论 XRCC1-399位点Arg→Gln和hOGG1-326位点Ser→Cys的氨基酸替换可能导致喉癌的发病风险增加,XRCC1-Arg399Gln、hOGG1-Ser326Cys多态性可能与喉癌的遗传易感性有关.     

XRCC1基因多态性与乳腺癌遗传易感性的Meta分析

目的综合评估XRCC1（X-Ray Repair Cross Complementing Protein 1,XRCC1）基因单核苷酸多态性与乳腺癌易感性的关系。方法以＂Breast cancer＂、＂Polymorphism＂、＂XRCC1＂、＂Arg399Gln＂、＂Arg194Trp＂、＂Arg280His＂以及＂-77T〉C＂等为主题词检索Pubmed等英文数据库,同时以＂乳腺癌＂及＂基因多态性＂等为主题词检索中文数据库,利用Stata10.0软件进行Meta分析。结果 XRCC1 Arg399Gln显著增加患乳腺癌风险,其纯合遗传模型（Gln/Gln vsArg/Arg）与隐性遗传模型Gln/Gln vs（Gln/Arg＋Arg/Arg）的相对危险度（Odds Ratio,OR）分别为1.12（95%CI=1.02-1.22）及1.12（95%CI=1.03-1.22）。此外,XRCC1-77T〉C亦显著增加了患乳腺癌风险,其纯合遗传模型C/C vs T/T与隐性遗传模型C/C vs（T/C＋T/T）的OR值分别为1.47（95%CI=1.00-2.17）及1.52（95%CI=1.06-2.18）。结论 XRCC1基因Arg399Gln位点Gln/Gln突变型以及-77T〉C位点C/C突变型均与乳腺癌发生相关。     

原发性肝细胞癌与X线修复交叉互补基因1遗传位点的相关研究

目的研究X线修复交叉互补基因1(XRCC1)遗传位点399多态性对中国人群原发性肝细胞癌的相关性。方法通过检索PubMed和CNKI等数据库,收集有关XRCC1多态性与原发性肝细胞癌关联的6篇相互独立研究文献,对1072原发肝癌病例和1400健康人进行Meta分析和关联研究。结果通过XRCC1 399位点所有数据研究,经等位基因病例对照,等位基因G的OR值(95%CI)为1.23(0.96,1.59),=0.11;与基因型AA比较,基因型AG+GG的OR值(95%CI)为1.33(0.92,1.92),=0.13,说明该位点多态性对原发性肝癌发生不是危险因子。通过层次分析,在乙肝或黄曲霉素暴露所诱导的那80%的肝癌患者中,该位点是原发性肝癌发生的危险因子在未知病因所诱导的肝癌患者中,该位点未显示对原发性肝癌发生危险作用。结论中国人群XRCC1基因遗传位点399与乙肝或黄曲霉素暴露所诱导的肝癌发生相关。     

细胞代谢解毒酶CYP1A1、GSTM1基因多态性与吸烟对男性肺鳞癌发病的影响

 目的 探讨细胞代谢解毒酶细胞色素P450酶1A1（CYP1A1）、谷胱甘肽S-转硫酶M1（GSTM1）基因多态性和吸烟因素对男性肺鳞癌发病的影响。方法 采用基因芯片技术对125例男性肺鳞癌患者和125例男性健康对照者CYP1A1、GSTM1基因多态性进行检测。结果 CYP1A1 m2位点GG基因型和GSTM1缺失基因型在肺鳞癌组与健康对照者间存在显著性差异(P<0.05 )。吸烟者携带CYP1A1 m2位点至少一个变异G等位基因或携带GSTM1缺失型者患肺鳞癌的危险性进一步显著增加,OR值分别为4.50和3.81(P<0.01)。结论 吸烟与CYP1A1、GSTM1基因多态性与男性肺鳞癌的发生有关。     

XRCC1基因多态性影响奥沙利铂对晚期胃癌患者化疗疗效敏感性的关系

目的:研究DNA修复酶X射线损伤交叉互补蛋白1(X-ray repair cross-complementary protein 1,XRCC1)基因Arg399Gln多态性与晚期胃癌对奥沙利铂化疗敏感性的关系.方法:确诊的晚期胃癌患者68例,接受以奥沙利铂为主的化疗方案化疗.采用PCR-连接酶反应技术检测XRCC1 Arg399Gln多态性.比较不同基因型患者与化疗疗效及疾病进展时间(TTP)的关系.结果:68例胃癌患者中,38例(55.9%)携带XRCC 1 399Arg/Arg基因型,24例(35.3%)携带Arg/Gln基因型,6例(8.8%)携带Gln/Gln基因型.68例病人化疗总有效率(CR+PR)为48.5%(33/68),其中Arg/Arg基因型患者化疗有效率显著高于Arg/Gln+Gln/Gln基因型患者(60.5% vs 33.3%,χ2=4.963,P=0.026).68例患者中位TTP为8.0个月,其中Arg/Arg基因型患者为10个月,Arg/Gln+Gln/Gln基因型患者7.5个月,两者比较差异有显著性(χ2=17.383,P＜0.001).结论:XRCC1 Arg399Gln基因可以在一定程度上判断晚期胃癌患者接受奥沙利铂化疗后的预后情况.     

DNA修复基因XPC Ala499Val、Lys939Gln多态与肺癌易感性

目的 探讨中国人DNA修复基因XPC Ala499Val、Lys939Gln多态与肺癌易感性的关系。方法 以社区为基础的病例对照研究。经组织学确诊的肺癌病例320例,相同地区年龄和性别频数匹配的人群对照322人,以PER为基础的方法进行多态性检测,比较不同基因型与肺癌风险的关系,并探讨吸烟在其中的影响。结果 与携带499 Ala／Ala基因型者比较,携带至少1个499Val等位基因者（即Ala／Val和Val／Val基因型）肺癌风险增加1．54倍（95％CI=1．11～2．14）,而同时有499和939两个位点变异等位基因者肺癌风险增加2．55倍（95％CI=1．45～4．52）。交互作用分析显示,XPC 499Val变异基因型与吸烟具有超相乘模型的交互作用,同时有两个位点变异等位基因并吸烟者肺癌风险增加可高达7．36倍（95％CI=3．19～17．0）。结论 XPC Ala499Val和Lys939Gln多态可能与中国汉族人群肺癌遗传易感性有关,并可显著增加吸烟对肺癌的危险性。     

儿童脓毒症纤溶酶原激活物抑制剂-1基因启动子区4G/5G多态性的研究

目的探讨纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）基因启动子区单核苷酸插入或缺失（4G/5G）多态性与广州地区汉族脓毒症患儿的相关性,对脓毒症的发生、发展和临床预后的影响。方法选取2007年4-12月广州市妇女儿童医疗中心诊治的汉族脓毒症患儿为病例组,同期收集健康查体儿童为对照组。应用等位基因特异性扩增多聚酶链（AS-PCR）法对病例组和对照组行PAI-1基因启动子区4G/5G多态性检测和分析。采用基因计数法计算各组基因型频率和等位基因频率,χ^2检验分析比较两组人群各基因型的分布差异,计算OR值及其95%CI评估各基因型的风险。结果研究期间病例组纳入148例,对照组181名。病例组和对照组PAI-1基因启动子区4G/5G多态性的基因型和等位基因频率分布差异无统计学意义（χ^2=0.79,P〉0.05）。等位基因4G（χ^2=4.35,P〈0.05）及其纯合子（χ^2=4.44,P〈0.05）与脓毒症发展相关;携带等位基因4G患儿发展至重症脓毒症的风险比5G高,OR=4.05（95%CI：1.09-15.08）,4G/4G纯合子患儿发展至重症脓毒症的风险比其他基因型高,OR=4.57（95%CI：1.11-18.78）。等位基因4G（χ^2=9.17,P〈0.05）及其纯合子（χ^2=7.35,P〈0.05）与脓毒症病死率相关,携带等位基因4G患儿脓毒症病死风险较5G高,OR=4.30（95%CI：1.50-12.29）,4G/4G纯合子患儿脓毒症病死风险较其他基因型高,OR=3.14（95%CI：1.49-6.61）。结论PAI-1基因启动子区4G/5G多态性与广州地区汉族脓毒症患儿进展及预后相关,等位基因4G及其纯合子是其高危遗传因素;PAI-1基因启动子区4G/5G点多态性与脓毒症的易感性无关。     

PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系

目的探讨PD-1基因多态性与肺结核发病风险以及临床特征的相关性。方法采用PCRRFLP分析方法,检测262例肺结核患者和255例健康志愿者基因组DNA中PD-1基因SNP位点rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布情况,分析PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系;并收集了肺结核患者的临床资料,考察PD-1基因多态性与肺结核临床特征的相关性。结果对照组rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;rs2227981位点T等位基因(OR=2.721,95%CI:2.003~3.697,0.001)、rs2227982位点C等位基因(OR=1.614,95%CI:1.262~2.064,0.001)均与肺结核易感性相关;与rs2227981 CC基因型相比,携带PD-1 rs2227981 CT或TT基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=2.937,95%CI:2.018~4.274,0.001),且患者病灶范围较大(=0.009),痰菌阳性率较高(0.001);与rs2227982 TT基因型相比,携带rs2227982 TC或CC基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=1.706,95%CI:1.187~2.452,=0.004),且患者结核空洞的发生率较高(=0.021)。结论 PD-1基因rs2227981和rs2227982位点SNP多态性与肺结核易感性及临床特征相关。     

5-羟色胺1A受体基因-1019C/G多态性与自杀行为关联的meta分析

目的:采用meta分析方法评价5-羟色胺1A受体(5-HTR1A)基因多态性与自杀行为相关的研究。方法:通过计算机检索Pub Med、Embase、Web of Science、中国生物医学文献数据库(CBM)、万方、维普、知网(CNKI)等中英文数据库,严格按照制定的纳入与排除标准,选择5-HTR1A基因多态性与自杀行为相关病例对照研究,检索范围为2003年12月30日-2013年12月30日。采用STATA12.0软件进行meta分析,计算优势比(OR)及其95%可信区间(95%CI),分析5-HTR1A基因多态性与自杀行为的关联性。结果:共纳入8项研究,包括1357例有自杀行为的患者及1675例正常对照。meta分析结果表明,5-HTR1A基因CG(-1019)多态性与自杀行为的相关有统计学意义(等位基因模型,OR=0.65,95%CI:0.46~0.92,P=0.015;显性基因模型,OR=0.76,95%CI:0.64~0.91,P=0.002)。根据种族进行亚组分析发现,在亚洲人群中5-HTR1A基因单核苷酸-1019 C/G多态性与自杀行为有显著关联(等位基因模型:OR=0.48,95%CI:0.25~0.93,P=0.029;显性基因模型:OR=0.37,95%CI:0.24~0.56,P0.001);而在高加索人群中5-HTR1A基因多态性与自杀行为无显著关联(等位基因模型:OR=0.71,95%CI:0.49~1.02,P=0.065;显性基因模型:OR=0.89,95%CI:0.73~1.08,P=0.247)。结论:本meta分析的结果提示5-HTR1A基因多态性与自杀行为的发生有关,其基因多态性可能是人们产生自杀行为的一个潜在危险因素。     

武汉地区IGT患者瘦素受体基因变异与高血压关系的研究

目的:研究瘦素受体(LR)基因Gln223Arg变异与武汉地区糖耐量减低(IGT)合并高血压的关系。方法:运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RELP)方法,测定无亲缘关系,且有完整临床资料的572例(包括252例糖耐量正常者及320例IGT患者)武汉地区汉族人群的LR基因Gln223 Arg变异频率。同时测血糖、血脂、身高、体重,按公式计算体重指数(BMI)。结果:(1)IGT合并高血压病组Gln 223 ArgAA、AG和GG基因型及A、G等位基因频率与正常对照组比较有非常显著性差异(均P<0.01);(2)男性IGT合并高血压病组与女性IGT合并高血压病组Gln 223 Arg变异基因型及等位基因比较具有显著统计学差异(均P<0.01);(3)IGT合并高血压病组Gln 223 Arg变异与收缩压和舒张压显著正相关(r分别为0.91和0.90,均P<0.05),A等位基因与肥胖型IGT合并高血压男性患者收缩压和舒张压呈正相关,携带A等位基因的肥胖型男性IGT其高血压发生的比数比(OR)为3.88(95%CI为2.77～5.44)。结论:LR基因Gln 223 Arg变异与肥胖男性IGT合并高血压相关,且与收缩压和舒张压均相关。     

先兆子痫患者HLA-DQA1、-DQB、-DPA1基因多态性

目的：探讨人类白细胞抗原HLA-DQA1、-DQB1、-DPA1基因多态性与先兆子痫发病的关系。方法：采用序列特异性引物技术（PCR-SSP） 对46例先兆子痫患者和105例正常孕妇及其新生儿进行HLA-DQ-DPA1等位基因分型。结果：所有标本共检出11种HLA-DQA1基因表型、16种HLA-DQB1基因表型、6种HLA-DPA1基因表型。先兆子痫患者HLA-DQB1＊0301基因频率高于正常孕妇，差异有显著性（Pc=0．032，RR=2．43，AR=0．30），其余各基因表型频率两组比较差异均无显著性。结论：HLA-DQB1＊0301基因可能是一种先兆子痫发病的易感基因。     

Comprehensive sequence analysis of HLA-DQA1 and -DQB1 alleles and characterization of DRB1-QAP-DQA1-DQB1 haplotypes

It is well known that both chain and β chain of HLA-DQ are highly polymorphic. However the polymorphisms outside the hypervariable region were not fully examined so far. To further clarify the polymorphisms in DQ genes, we determined the nucleotide sequences of full length cDNA, spanning from the leader sequence to the stop codon, from 15 DQA1 alleles and 15 DQB1 alleles. We identified several new DQ alleles which had identical exon 2 sequence and were different in other exons. On the basis of the sequence analyses, a comprehensive PCR-based oligotyping system for DQA1 gene was established. We then characterized DRB1-QAP(DQA1 promoter)-DQA1-DQB1 haplotypes of B-lymphoblastoid cell lines homozygous for HLA and healthy unrelated Japanese and Norwegian populations. It was revealed that DQA1 alleles, which were identical in exon 2 but different in other exons, showed close linkage disequilibrium with diferent characteristic DRB1, QAP and DQB1 alleles. These results suggest that DR-DQ haplotypes have been generated in the early stage of molecular evolution.     

HLA-DRB1, -DQA1, -DQB1, -DPA1 and -DPB1 genes in Japanese multiple sclerosis patients

Japanese MS patients and controls were examined for the distribution of HLA-DRB1, -DQA1, -DQB1, -DPA1 and -DPB1 alleles using in vitro amplification of genomic DNA and probing with sequence-specific oligonucleotides. No significant difference in frequency of the examined alleles was observed among the two groups. This is in contrast to Norwegian MS patients, where an association to a combination of certain DQA1 and DQB1 alleles has previously been demonstrated.     

HLA-DRB1, -DQA1, -DQB1 and DPB1 susceptibility alleles in Cameroonian type 1 diabetes patients and controls

It is known that certain combinations of alleles within the human leucocyte antigen (HLA) complex are associated with susceptibility or resistance to type 1 diabetes. Variable associations of DR and DQ with type 1 diabetes are documented in Caucasians but rarely in African populations; however, the role of HLA-DP genes in type 1 diabetes remains uncertain. In order to investigate the HLA class II associations with type 1 diabetes in Cameroonians, we used sequence-specific oligonucleotide probing (SSOP) to identify DRB1, DQA1, DQB1 and DPB1 alleles in 10 unrelated C-peptide negative patients with type 1 diabetes and 90 controls from a homogeneous population of rural Cameroon. We found a significantly higher frequency of the alleles DRB1*03 (χ² = 17.9; P = 0.001), DRB1*1301 (χ² = 37.4; P < 0.0001), DQA1*0301 (χ² = 18.5; P = 0.001) and DQB1*0201 (χ² = 37.4; P < 0.001) in diabetes patients compared to the control group. The most frequent alleles in the control population were DQA1*01, DQB1*0602 and DRB1*15. The DRB1*04 allele was not significantly associated with type I diabetes in our study population. We observed no significant difference between patients and controls in DPB1 allele frequency. In conclusion, the data in Cameroonian diabetes patients suggest the existence of HLA class II predisposing and specific protective markers, but do not support previous reports of a primary association between HLA-DP polymorphism and development of type I diabetes .     

The Rad9-Hus1-Rad1 (9-1-1) clamp activates checkpoint signaling via TopBP1

DNA replication stress triggers the activation of Checkpoint Kinase 1 (Chk1) in a pathway that requires the independent chromatin loading of the ATRIP-ATR (ATR-interacting protein/ATM [ataxia-telangiectasia mutated]-Rad3-related kinase) complex and the Rad9-Hus1-Rad1 (9-1-1) clamp. We show that Rad9's role in Chk1 activation is to bind TopBP1, which stimulates ATR-mediated Chk1 phosphorylation via TopBP1's activation domain (AD), a domain that binds and activates ATR. Notably, fusion of the AD to proliferating cell nuclear antigen (PCNA) or histone H2B bypasses the requirement for the 9-1-1 clamp, indicating that the 9-1-1 clamp's primary role in activating Chk1 is to localize the AD to a stalled replication fork.