lncRNA的基因调节功能以及与肿瘤的发生

目的 本文对以下几方面最新的研究进行综述：（1）长链非编码RNA的生物学特性;（2）长链非编码RNA的转录调控;（3）长链非编码RNA在肿瘤发展过程中作用的近期研究。 数据来源 本文所引用的数据主要来自于2002年到2010年6月间PubMed、HighWire出版的论文。检索词为“非编码RNA”、“基因调控”和“肿瘤”。 资料选择 （1）长链非编码RNA在基因表达调控中的机制;（2）肿瘤与长链非编码RNA的关系以及长链非编码RNA在肿瘤中所发挥的作用。 结果 长链非编码RNA通过染色体重塑、转录控制及转录后控制而在转录调控中发挥着非常重要的作用。事实证明,长链非编码RNA和多种肿瘤相关;既可以作为肿瘤抑制因子又可以作为肿瘤促进因子而发挥作用。 结论 长链非编码RNA可以完美地调节基因表达系统的平衡,在肿瘤细胞转化过程中发挥重要作用。 传统的观点认为RNA是DNA和蛋白质之间传递信息的中介,随着DNA测序技术的发展,非常惊奇的的发现：人的基因组不到2%的基因为蛋白编码基因(Birney, et al.,2007;Mercer, et al.,2009)。而主要的基因序列转录为非编码RNA（Non-coding RNAs ,ncRNA）,大量的ncRNA构成巨大的分子网络,在真核生物的生命活动调节中发挥中枢的作用。虽然近十年来对于非编码RNAs的研究取得了不少成果,但大部分研究都集中于短链非编码RNAs(包括 siRNA、miRNA、piRNA)。长链非编码RNAs（Long noncoding RNAs,lncRNA）,起初被认为是基因转录的“噪音”,是RNA聚合酶的副产物,无生物学功能(Struhl,2007),所以被学者冷落,近几年研究表明lncRNA参与了基因的转录调控,是基因调控网络中的关键成员之一,参与了很多疾病的发展。本文就lncRNA的调控机制及与肿瘤的关系进行综述。     

长非编码RNA的研究进展

基因表达与调控方面的研究改变了我们对RNA的认识。近年的研发现,长非编码RNA(lncRNA通常大于200碱基而区别于microRNA)参与了一些重要的生命过程,包括染色质修饰、基因转录和转录后调节、蛋白质的活性调节和亚细胞定位以及细胞结构的维持等。新的发现引起越来越多的重视,但这些仍只是非编码RNA的一小部分,人们相信随着研究的深入,lncRNA的调控网络将渐渐浮出水面,不仅对我们认识生命过程的新调节层面有很大帮助,而且具有极大的应用潜力,例如用于基因治疗等方面。     

Expression profile of altered long non-coding RNAs in patients with HBV-associated hepatocellular carcinoma

In China, hepatitis B virus (HBV) infection is the major cause of hepatocellular carcinoma (HCC), which is called HBV-related HCC (HBV-HCC), but the pathogenesis has not been clearly elucidated. Long non-coding RNAs (lncRNAs) have been paid increasing attention to, as an important regulatory molecule involved in many biological processes, as well as a variety of diseases. This study examined lncRNA that might play an important role in HBV-HCC pathogenesis by conducting lncRNA and mRNA profile comparison between HBV-HCC and normal liver tissues. The differentially expressed lncRNA and mRNA profiles between HBV-HCC and normal liver tissues were analyzed by microarrays. The potential protein-encoding gene regulated by lncRNA, and the biological function (gene ontology, pathway analysis) of the target gene were investigated. The results showed that the expression levels of lncRNA and mRNA in HBV-HCC tissues were different from those in normal liver tissues. As compared with normal liver tissue, 837 (4.30%) lncRNAs exhibited more than two-fold change (P<0.05); 325 were up-regulated, and 512 were down-regulated; 991 (5.70%) mRNAs exhibited more than 2-fold change (P<0.05); 733 were up-regulated and 258 were down-regulated in HBV-HCC tissue. Besides, there were 7 lncRNAs with above 10-fold elevation, 6 lncRNAs with above 10-fold decrease, 18 mRNAs with above 10-fold elevation and 11 mRNAs with above 10-fold decrease. 444 (53.05%) lncRNAs had their corresponding mRNAs, some of which were adjacent to lncRNAs. The biological analysis showed that the target gene of differentially expressed lncRNAs took part in the important bio- logical regulatory function. Target gene-related pathway analysis revealed the pathways in carcinoma and mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling pathways significantly changed in the HBV-HCC tissues as compared with normal liver tissues (P<0.05). It was suggested that as compared with normal liver tissues, the expression of lncRNAs in HBV-HCC tissues changed significantly, and lncRNAs played a key role in the pathogenesis of HBV-HCC probably by mainly regulating the carcinoma-related signaling pathway and MAPK signaling pathways.     

长链非编码RNA在肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）在癌症中的研究崭露头角,研究显示其在肿瘤的形成中具有潜在的促癌或抑癌作用。人们发现lncRNA在不同肿瘤中经常出现异常表达,但其具体的生物学功能大多数至今尚不清楚。越来越多研究者相继报道了一些lncRNA在肿瘤中潜在的功能及其分子机制,提示lncRNA在肿瘤的发生、发展中具有重要作用。     

长非编码RNA在HIV-1感染单核细胞中的作用

目的 观察外周血单核细胞的长非编码RNA(lncRNA)在感染人类免疫缺陷病毒(HIV)-1前后的表达差异,并研究差异表达的lncRNAs在HIV-1感染单核细胞中的作用. 方法 采用基因芯片从HIV-1感染的单核细胞和未感染的对照单核细胞中筛选出表达差异最大的lncRNAs,并进行qRT-PCR验证.设计siRNA并转染到单核细胞中,ELISA检测转染siRNAs前后单核细胞表达白介素(IL)-1β、IL-10和肿瘤坏死因子(TNF)-α的变化. 结果 基因芯片和qRT-PCR结果均显示,单核细胞感染HIV-1后,lncRNA-n266623表达显著上升;在转染lncRNA-n266623的siRNA后,单核细胞分泌IL-1β、IL-10和TNF-α的能力增强.结论 HIV感染单核细胞后能促进单核细胞高表达lncRNA-n266623;lncRNA-n266623可能抑制单核细胞的IL-1β、IL-10和TNF-α的分泌,从而负向调控机体对HIV-1感染的免疫应答.     

前列腺癌相关长链非编码RNA在前列腺癌中的表达及生物学功能

目的 探讨前列腺癌相关长链非编码RNA(prostate cancer related long non-coding RNA,PCRL)在前列腺癌中的表达情况及其潜在的生物学功能。方法 采用qRT-PCR检测PCRL在前列腺癌组织、癌旁组织及其他组织中的表达,同法检测并比较PCRL在雄激素依赖(LNCaP-AD) 与雄激素非依赖(LNCaP-AI) 前列腺癌细胞和正常前列腺上皮细胞(RWPE-1)中的表达差异。以siRNA干扰PCRL后,采用qRT-PCR方法检测LNCaP-AI细胞和LNCaP-AD细胞中雄激素受体的表达变化。结果 PCRL在前列腺及前列腺癌组织中特异高表达,LNCaP-AI细胞中PCRL水平高于LNCaP-AD细胞和RWPE-1细胞。干扰PCRL后LNCaP-AI细胞和LNCaP-AD细胞中雄激素受体的表达量上升(前者P<0.000 1)。结论 在前列腺癌中特异高表达的PCRL与前列腺癌的进展有关,PCRL和雄激素受体之间可能存在一定的调控关系。     

长链非编码RNA在心力衰竭中的作用及临床意义

长链非编码RNA(lncRNA)曾被认为是基因组转录的"噪音",不具有生物学功能.近年来,越来越多的证据表明,lncRNA在不同发育阶段或疾病状态中动态表达,并且在基因表达和翻译的诸多环节中都发挥调节作用.作为一种调节因子,lncRNA已被证实参与心脏生长发育的基因调控,同时参与心力衰竭的多个病理变化,主要包括心肌肥大...     

长链非编码RNA在天然免疫中的功能效应及分子机制

在哺乳动物的基因组转录本中,长链非编码RNA（lncRNA）绝对数量大、种类多,是一个重要的类群。LncRNA可以通过碱基互补配对或折叠成特殊三维空间结构等方式,与蛋白质、RNA、DNA等其他生物分子相互作用,发挥着多种生物学功能,共同构成了一个复杂而精细的调控网络。越来越多的研究表明lncRNA在天然免疫中有重要的调控作用,如调控免疫细胞分化、调节炎性细胞因子的分泌以及参与病毒等病原体和宿主的相互作用等。笔者结合近年来天然免疫相关lncRNA的研究发现,讨论lncRNA相关生物学效应,着重阐述其分子机制,并讨论天然免疫相关的lncRNA研究策略和技术进展。     

长链非编码RNA在胃癌发生发展中的作用

通过回顾近年来与胃癌相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)研究进展,进一步了解其在胃癌发生、发展调控过程中的作用,对认识lncRNA在胃癌的生物学行为、胃癌诊断及预后中的价值具有重要的意义.lncRNA有希望成为胃癌重要的生物标记物以及诊断和治疗方面的新靶点.     

骨质疏松相关长链非编码RNA的研究进展

骨质疏松是一种较为常见的全身性骨骼代谢疾病,受环境和基因的共同影响,以骨量减少及骨小梁微结构改变为特征,导致骨脆性增加和骨折风险增高,给患者的生活质量产生严重的负面影响。随着骨质疏松病因研究的深入,越来越多的证据表明,表观遗传修饰可能是遗传和环境因素与骨质疏松之间联系的机制。长链非编码RNA(LncRNA)是一种重要的表观遗传调节因子,在基因表达调控中发挥着重要的作用,影响着包括骨代谢在内的多种生物学过程。该文综述LncRNA介导的与骨髓间充质干细胞、成骨细胞和破骨细胞相关的骨质疏松机制的最新研究结果,深入了解LncRNA在骨质疏松中的作用,为骨质疏松的诊断及治疗提供理论依据。     

结直肠癌RNA结合蛋白相关长链非编码RNA预后模型的构建与应用

目的 构建RNA结合蛋白(RBP)相关长链非编码RNA(IncRNA)预后模型,为临床预测结直肠癌(CRC)患者的生存提供指导.方法 分析TCGA数据库中的398例结直肠癌组织标本及39例正常对照样本的数据,从EBI-CA网站(https://ebiac.uk/GOA/)获取RBP相关基因列表.应用R软件分析RBP相关...     

长链非编码RNA EPIC1在肝细胞肝癌中的表达及临床意义

目的：研究长链非编码RNA表观遗传诱发长链非编码RNA1(epigenetically induced long non-coding RNA 1, EPIC1)在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达情况及临床价值。方法：收集2013年9月—2018年3月被确诊为HCC患者48例的肿瘤及癌旁组织,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)检测HCC组织、细胞中EPIC1的表达情况;分析EPIC1表达与患者临床参数的相关性。结果：EPIC1在肝癌组织中平均表达量为(13.28±36.66),显著低于癌旁组织(62.84±108.93)(P=0.006)。相较于正常的肝细胞系L-02,EPIC1在HCC细胞系中低表达(P<0.05)。HCC患者EPIC1表达量与患者的TNM分期相关(P=0.033)。结论：EPIC1在HCC中低表达,可能为潜在的治疗靶点。     

长链非编码RNA遗传多态性作为肿瘤标志物的研究进展

长链非编码RNA（long non?coding RNA,lncRNA）是一类长度超过200个核苷酸残基,能够调控基因表达并在机体生理和病理过程中发挥重要作用的非编码RNA,差异表达的lncRNA与肿瘤的发生发展显著相关。研究表明lncRNA的遗传多态性可以改变基因结构从而产生广泛的基因多态性,大多数lncRNA基因多态性与肿瘤的发生、转移和预后密切相关,有望成为新型肿瘤标志物和肿瘤治疗的靶点。本文结合国内外最新报道,综述lncRNA遗传多态性作为肿瘤标志物,对恶性肿瘤的风险评估、疗效预测和预后判断有着极其重要的意义。     

系统性红斑狼疮患者长链非编码RNA差异性表达研究

目的利用长链非编码RNA表达谱芯片技术筛选系统性红斑狼疮(SLE)患者的差异表达长链非编码RNA并对其进行分析,以进一步阐明系统性红斑狼疮发病的分子机制。方法分采用利用长链非编码RNA表达谱芯片检测技术,筛查系统性红斑狼疮及健康对照组单个核细胞中的差异表达长链非编码RNA,并通过Rreal-time PCR对部分差异表达基因进行验证。结果 uc003ngn、uc010loq、uc003wbg、uc003wax、HM-lincRNA1145、uc010jsn、uc003wax、HMlincRNA1145等lncRNA在SLE患者外周血单个核细胞中显著上调,AK022005、uc010cik、uc010gdp、uc010nwn、uc010imt、HMlincRNA678等lncRNA在SLE患者外周血单个核细胞中显著下调。结论多个长链非编码RNA在SLE患者外周血单个核细胞中异常表达,提示它们可能在SLE的发生发展中起着重要的调控作用。     

非酒精性脂肪肝病中长链非编码 RNA的表达谱

目的：分析非酒精性脂肪肝病(non-alcoholic fatt y liver disease,NAFLD)中长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱 特征。方法：采用lncRNA-mRNA基因芯片检测单纯性胆囊结石伴或不伴NAFLD患者的肝组织样本,获得lncRNA差异 性表达谱。进一步使用生物信息学技术对差异表达的基因予以分析。结果：与正常样本相比,NAFLD肝样本内共有 1 735个lncRNAs和1 485个mRNAs异常表达,其中535个lncRNAs和760个mRNAs上调,1 200个lncRNAs和725个mRNAs下 调。结论：与正常肝组织相比,NAFLD组织中lncRNA表达谱明显异常,这些lncRNAs可能在NAFLD的发生和发展中 发挥重要作用。     

长链非编码 RNA HOTAIR 对肾癌细胞增殖和凋亡的影响

目的：探讨长链非编码 RNA(LncRNA) HOTAIR 对肾癌细胞系786-O 和 ACHN 增殖和凋亡的影响。方法两种细胞系转染针对 HOTAIR 的小干扰 RNA(siRNA),利用qRT-PCR 检测干扰效率,再分别以噻唑蓝(MTT)法、ELISA法和 Hochest 染色法检测 HOTAIR 表达降低后786-O 和ACHN 细胞在增殖和凋亡方面的变化。结果 siRNA 可有效降低 HOTAIR 表达(P <0．05);减少 HOTAIR 含量可显著抑制两种细胞的增殖(P <0．05),同时增加细胞凋亡(P <0．05)。结论 HOTAIR 具有促进肾癌细胞生长的作用。     

长链非编码RNA HOTAIR的信号通路、作用机制及与消化系统肿瘤的关系

长链非编码RNA（LncRNA）广泛参与机体生理和病理过程。其中,HOX转录反义RNA（HOTAIR）由HOXC基因座的反义链转录,却主要调控HOXD基因。HOTAIR能引导多梳抑制复合体2（PRC2）和赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1（LSDI）复合体靶向特定目标基因,使组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化（H3K27me3）和组蛋白H3第4位赖氨酸二甲基化（H3K4me2）,引起染色体状态重编程,从而使染色体封闭,继而导致靶基因沉默。HOTAIR与人类多种肿瘤如肝细胞癌、胰腺癌、胃肠道间质瘤和大肠癌等的发生、发展、复发以及转移有着相关性,有望成为相关肿瘤的预测指标和新的治疗靶点。该文阐述了HOTAIR的可能作用机制及其信号通路,并总结了其与上述各类肿瘤关系研究的最新进展。     

长链非编码RNA Linc00658在结直肠癌中的表达及其与西妥昔单抗抵抗的关系

目的：探究长链非编码RNA（LncRNA）Linc00658 在结直肠癌（CRC）中的表达及其与西妥昔单抗抵抗的关系。方法：采用生物信息学方法预测与miR-19a-3p及PTEN表达密切相关的LncRNA,分别用西妥昔单抗和DMSO诱导处理人CRC细胞CaCo2 作为抵抗组和对照组,并利用细胞转染过表达抵抗组细胞的Linc00658作为过表达组,分别转染miR-19a-3p mimic及NC于CaCo2细胞中,作为mimic组及NC组。qRT-PCR检测Linc00658、miR-19a-3p及PTEN mRNA在对照组、抵抗组和过表达组细胞中的表达水平,Western blot检测PTEN及其下游基因磷酸化AKT（p-AKT）及磷酸化mTOR（p-mTOR）的表达,CCK-8 实验检测各组细胞西妥昔单抗的半数抑制浓度（IC50）,荧光素酶报告基因实验验证Linc00658与miR-19a-3p的结合及其对miR-19a-3p与PTEN结合作用的影响。结果：相比对照组,抵抗组细胞Linc00658、PTEN mRNA及蛋白表达显著降低,miR-19a-3p、p-AKT及p-mTOR表达显著升高,西妥昔单抗IC50 显著增高（均P ＜0.01）;相比抵抗组,过表达组细胞Linc00658、PTEN mRNA及蛋白表达显著升高,miR-19a-3p、p-AKT及p-mTOR表达显著降低,西妥昔单抗IC50 显著降低（P ＜0.05）;相比NC组,mimic组西妥昔单抗IC50显著升高（P ＜0.01）;miR-19a-3p mimic可显著抑制pGL3-basic-Linc00658荧光素酶活性,提示miR-19a-3p与Linc00658存在结合作用,过表达Linc00658可使miR-19a-3p mimic对pGL3-basic-PTEN的荧光抑制作用恢复。结论：Linc00658通过吸附miR-19a-3p促进PTEN的重新表达及CRC细胞对西妥昔单抗的敏感性。     

长链非编码RNA FENDRR在子宫颈癌中的作用

目的：探讨长链非编码RNA FENDRR在子宫颈癌（下面简称宫颈癌）中的作用。方法：在宫颈癌细胞系中使用siRNA干扰技术特异性干扰FENDRR的表达,用qRT-PCR检测siRNA的干扰效率;运用CCK-8和Transwell实验分别检测干扰FENDRR表达对宫颈癌细胞体外增殖和运动能力的影响;运用裸鼠成瘤实验验证干扰FENDRR表达对宫颈癌细胞体内成瘤能力的影响。结果：siRNA转染使FENDRR在SiHa和HeLa细胞中的相对表达量分别由（1.013±0.120）、（1.001±0.025）降为（0.226±0.024）、 （0.099±0.010）,差异均有统计学意义（P＜0.01）;干扰FENDRR后宫颈癌细胞系的增殖能力明显增强（P＜0.01）,迁移和侵袭能力也显著增强（P＜0.01）;干扰FENDRR后宫颈癌细胞HeLa在裸鼠体内的成瘤能力明显增强,与对照组相比肿瘤体积从（853.2±59.4）mm3增加到（1 155.0±51.5）mm3（P＜0.01）,肿瘤的质量从（0.544±0.053）g增加到（0.814± 0.061）g（P＜0.05）。结论：干扰FENDRR的表达明显增强宫颈癌细胞的体外增殖和运动能力以及体内成瘤能力,FENDRR可能在宫颈癌的进展中发挥重要的抑癌作用。