炎症性肠病与基因

近年来，对于炎症性肠病的基因学的研究进展很快，目前发现杀菌／渗透性增高蛋白基因、CTLA-4基因多态性、TN-Fα-308等位基因、孕烷8受体靶基因调节障碍和N-乙酰化转移酶1（NAT1）基因多态性与炎症性肠病有密切关系。     

Toll样受体基因多态性与中国江苏地区汉族人群和白种人群炎症性肠病的相关性

目的 探讨Toll样受体基因多态性与中国人群和白种人群炎症性肠病(IBD)易感性的相关性.方法 采用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性方法,检测113例江苏地区汉族IBD患者与120名正常对照者TLR2基因Arg677Trp、Arg753Glu,TLR4基因Asp299Gly、Thr399Ile及TLR9基因1237T/C基因型,分析这些Toll样受体基因位点的多态性与IBD发病的相关性;对白种人群中TLR4Asp299Gly、Thr399Ile两个单核苷酸多态性位点的多态性与IBD易感性及临床表型的关系进行荟萃分析.结果 在所检测的IBD患者和正常对照者中有2例溃疡性结肠炎(UC)患者、1例克罗恩病(CD)患者及1名正常对照者存在TLR91237T/C杂合突变(CD:P=0.361,UC:P=0.569),差异无统计学意义,在IBD患者及正常人群中均未发现TLR2基因Arg677Trp、Arg753Glu,TLR4基因Asp299Gly、Thr399Ile突变型;荟萃分析发现白种人CD和UC患者TLR4基因Asp299Gly(CD:OR=1.29,95%CI:1.08～1.54,P=0.004;UC:OR=1.28,95%CI:1.08～1.51,P:0.004)、Thr399Ile(CD:OR=1.37,95%CI:1.12～1.68,P=0.002;UC:OR=1.46,95%CI:1.13～1.88,P=0.003)突变发生率均明显高于正常对照者,Asp299Gly多态性与CD临床表型无明显相关性.结论 未发现TLR2基因Arg677Trp、Arg753Glu,TLR4基因Asp299Gly、Thr399Ile及TLR9基因1237T/C多态性与江苏地区汉族人群IBD的易感性相关;荟萃分析显示,TLR4基因Asp299Gly、Thr399Ile多态性与白种人CD和UC发病相关,IBD的遗传易感性具有种族差异性.     

自噬体基因ATG16L1多态性与炎症性肠病的相关性研究

目的 检测炎症性肠病(IBD)患者ATG16L1基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2241880的等位基因多态性与IBD易感性间的关系.方法 抽取80例IBD患者,其中40例克罗恩病(CD)患者、40例溃疡性结肠炎(UC)患者,50例健康者外周静脉血并提取DNA,根据目的 基因片断设计特异性引物,并应用PCR方法 扩增DNA样本中的目的 基因片断.并对扩增的目的 基因片断进行测序,其测序结果与正常序列进行比较并分析等位基因的多态性与疾病易感性之间的相关性.结果 CD和UC患者与正常对照组之间ATG16L1基因SNP位点rs2241880的等位基凼多态性之间无明显差异(X2=4.94,P=0.293).结论 国外文献报道的与CD相关的易感基因ATG16L1的多态性位点rs2241880,在本组CD患者中并未发现与CD易感性相关,国外发现的与CD易感性相关的ATG16L1基因的SNP位点可能不是中国CD患者的易感性基因位点.     

CYP8B1基因单核苷酸多态性与胆囊结石病的相关性分析

目的 了解固醇12α羟化酶(Sterol 12α-hydroxylase,CYP8B1)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国汉族人群胆囊结石病的关系.方法 采用直接测序法检测CYP8B1基因启动子和编码区序列,确定SNP的位置及类型.对频率>10%的SNP,在胆囊结石病患者和对照者中进行关联研究.结果 在5119 bp测序长度中,共发现11个SNP,1个位于编码区,启动子区5个,3′-非翻译区5个,其中3个为新发现的SNP,而数据库中有12个SNP在本次研究没有检测到.SNP rs3732860的等位基因频率在病例-对照组之间分布差异有统计学意义,病例组A等位基因频率明显低于对照组(P=0.022),携带A等位基因者发生胆石病的危险低于携带G等位基因者(OR=1.465,95%CI 1.055~2.034,P=0.023).结论 CYP8B1基因SNP rs3732860和中国汉族人群胆囊结石形成有关,A等位基因可能对胆囊结石病发病有保护作用.

Abstract：

Objective To identify the single nucleotide polymorphisms of human CYP8B1gene and explore the association of some of these SNPs with gallstone disease in Chinese population.Methods The exon and part of promoter were sequenced by a fluorescent labeling automatic method to identify and characterize the SNPs in Chinese population. For SNPs with an allelic frequency of over 10%, a case-control study was performed in patients and controls.Results Eleven SNPs were found within a 5119 bp region. Among them, 1 was in coding region, 5 in promoter and 5 in 3′-UTR. There were 3 novel SNPs and 12 SNPs in SNP database were not found. The allelic frequency of rs3732860 polymorphism showed a significant difference (P=0.022) in the association study. The subjects with A allele had a significantly lower frequency of gallstone disease than those with G allele (OR=1.465, 95%CI 1.055-2.034, P=0.023).Conclusion SNP rs3732860 of CYP8B1 gene is associated with gallstone disease in Chinese population. And A allele may play a protective role in the pathogenesis of gallstone.     

CTLA-4基因多态性与炎症性肠病的相关性研究

目的炎症性肠病(IBD)的发病机制与T细胞免疫应答过度有关。细胞毒T淋巴细胞相关抗原-4(CTLA-4)主要在已激活的T细胞上表达,通过与CD28竞争与B7结合,抑制T细胞激活,维持免疫系统内环境稳定。CTLA-4基因多态性与一些自身免疫性疾病相关,但未见与炎症性肠病的研究。本文研究CTLA-4基因多态性与炎症性肠病的相关性,旨在阐明炎症性肠病的遗传易感性。方法对68例无血缘关系的湖北汉族炎症性肠病患者(54例溃疡性结肠炎,14例克罗恩病)以及140例正常对照者,采用序列特异性引物PCR方法检测CTLA-4外显子4的3'非转录区包含AT重复序列的特异性等位基因。扩增产物用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,硝酸银染色,部分样品经测序以确定片段长度。结果共发现CTLA-4基因有18种等位基因,其中122bp等位基因与正常对照组比较,在溃疡性结肠炎患者中显著增高(7.4%vs0.3%,P=0.0002/Pc=Sig,OR=22.320,95%CI:2.755～180.80)。结论CTLA-4基因微卫星多态性与溃疡性结肠炎显著相关。     

艾迪莎对溃疡性结肠炎患者血清IL-8的影响

目的探讨艾迪莎对溃疡性结肠炎(UC)患者血清白介素8(IL8)的调节作用及作用机制。方法60例UC患者随机分为两组:A组30例和B组30例。A组采用艾迪莎治疗,B组采用柳氮磺胺吡啶治疗。采用双抗体夹心法ELISA法测定两组患者治疗前后和30例健康志愿者血清IL8的水平。结果A组显效率为80.0%(24/30),B组显效率为53.3%(16/30),两组比较,有显著性差异(P<0.05)。A组治疗后血清IL8水平与对照组比较无显著性差异(P>0.05),B组治疗后血清IL8水平仍高于对照组(P<0.05)。结论艾迪莎治疗UC疗效显著,能够下调IL8的表达及生成,可能是其治疗UC的作用机制之一。     

巨噬细胞炎性蛋白1α和载脂蛋白E基因多态性与炎症性肠病易感性的关系

目的 探讨巨噬细胞炎性蛋白1α(MIP-1α)基因和载脂蛋白E(ApoE)基因多态性是否与炎症性肠病(IBD)的发生相关,并探讨这两个基因之间的相互作用.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,在183例IBD患者[包括142例溃疡性结肠炎(UC)患者和41例克罗恩病(CD)患者]以及160名健康对照者中检测MIP-lα和ApoE等位基因和基因型的频率.结果 携带MIP-1α-906(TA)6/(TA)6基因型或者APOE484等位基因可以增加UC的发病风险,UC患者组MIP-1α-906位点(TA)6/(TA)6基因型频率为50%,显著高于正常对照组中的34%(OR=1.909,95%C/=1.204～3.028);UC患者ApoE ε4+基因型频率为40.8%,显著高于正常对照组中的22.5%(OR=2.379,95%CI=1.451～3.896).同时携带MIP-1α-906(TA)6/(TA)6和APOE4ε4的个体发生UC的风险更大(P<0.01,OR=3.288,95%17/=1.777～6.084).而CD组与对照组间的MIP-lα和ApoE基因多态频率差异无统计学意义.结论 MIP-lot基因-906(TA)6/(TA)6多态性和APOFAε4基因多态性可能是UC发病的遗传危险因素;MIP-1α基因多态性与ApoE基因多态性之间有协同作用,ApoEε4等位基因与MIP-1α-906(TA)6/(TA)6基因型同时存在时,患UC的危险性显著提高.

Abstract：

Objective To investigate whether the macrophage inflammatory protein 1 alpha(MIP-1α)and apolipoprotein E(ApoE)gene polymorphisms,either alone or in combination,affect the susceptibility to inflammatory bowel disease(IBD).Methods Genomic DNA of IBD patients with Crohn's disease(CD,n=41)and with ulcerative colitis(UC,n=142)and healthy controls(n=160)was extracted and genotyped for the MIP-1α and ApoE gene polymorphisms by restriction fragment length polymorphism assay.Results MIP-1α-906(TA)6/(TA)6 homozygotes had a significantly elevated risk of UC(OR=1.909,95%CI=1.204-3.028).The carriers of APOF4ε4 were at a significantly higher risk for UC with OR of 2.379(95%CI=1.451-3.896).And a combination of these two loci,MIP-1α-906(TA)6/(TA)6/APOE4ε4 were strongly associated with a higher risk of UC(OR=3.288;95%CI=1.777-6.084).Conclusion The polymorphisms of MIP-1α-906(TA)6/(TA)6 and ApoE are probably independent genetic risk factors for UC.And the coexistence of both may exert an additive effect on the UC risks.     

NFKB1基因多态性与溃疡性结肠炎相关性研究

目的　探讨NFKB1 基因单核苷酸多态性rs3774963 C>G和rs11722146 A>G与溃疡性结肠炎的相关性。方法　采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测149例溃疡性结肠炎患者组和168例健康对照组NFKB1 基因多态性。结果　在rs3774963 C>G位点,溃疡性结肠炎组GG基因型占53.0%,明显高于对照组（38.7%）,差异具有统计学意义（P = 0.005）。G等位基因频率（73.2%）亦明显高于对照组（61.9%）,差异具有统计学意义（P = 0.003）。在rs11722146 A>G位点,两组间基因型和等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。两位点溃疡性结肠炎不同分型基因型和等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。结论　NFKB1 基因rs3774963 C>G多态性与溃疡性结肠炎的发病具有相关性,其中G等位基因是溃疡性结肠炎的遗传危险因素。     

炎症性肠病相关基因研究进展

炎症性肠病包括溃疡性结肠炎和克罗恩病,是一组病因未明的非特异性慢性肠道炎症性疾病,近年来发病呈上升趋势。越来越多的研究显示,相关基因的多态性在炎症性肠病的发病中起重要作用。很多文章从遗传学的角度讨论了与IBD有关的几组易感基因,如NOD2基因、白细胞介素相关基因、HLA基因、肿瘤坏死因子基因,以及近期内才被认为和IBD相关的MDR1(ABCB)基因、MY09B基因。     

孕烷X受体基因位点与炎症性肠病的易感性相关

背景与目的：孕烷X受体（PXR）可调节一组参与对外源性化学物质应答的基因。相关研究显示，外源性化学物质的代谢可能在炎症性肠病（IBD）中起作用，而低水平的PXR可能与疾病表现有关。该研究目的是探讨PXR编码基因（NR1I2）的功能性多态性与IBD人群之间的关系。方法：采用病例一对照研究，选取了422例患有IBD的爱尔兰人群及其相匹配的对照人群350例；检查了8个NR1I2单核苷酸多态性（SNP），此前报道这些多态性与PXR所调节的基因活性改变有关。结果：该研究表明，与对照人群相比，患有IBD、克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）人群中NR1I2与SNP-23585（IBD：OR1．62，95％CI1．31～2．00；P=0．000008），-24381（IBD：OR1．50，95％CI1．21～1．84；P=0．0002）之间有显的相关性；SNP 7635（P=0．0008）和8055（P=0．007）与IBD和CD有关，但与UC无关。患IBD的风险与这些位点的基因型紧密相关，尤其是-25385CC基因型（OR2．92，95％CI1．87～4．66；P=0．00001）。作还在患人群中发现了与IBD表型特异性相关的基因型和单倍型。     

Association of interleukin-6 gene polymorphisms with bone mineral density in Mexican women

BACKGROUND: The interleukin-6 gene (IL-6) stimulates osteoclast development; therefore, it has been implicated in osteoporosis. In this study, the association of osteoporosis with three IL-6 gene markers (a CA dinucleotide repeat and two single nucleotide polymorphisms [SNPs]: G-174C and G-572C) was tested in the Mexican population. METHODS: Population sample was comprised of 70 osteoporotic women, 70 non-osteoporotic women, and 500 subjects from the general population who were genotyped for the IL-6 markers. SNPs were analyzed by real-time PCR using the 5' exonuclease assay, whereas the CA dinucleotide polymorphism was evaluated by PCR and capillary electrophoresis. The allele-phenotype relationship was analyzed with the statistical method STRAT that considered population stratification and the results were adjusted with potential confounders for osteoporosis by a longitudinal multivariate model. RESULTS: We found that the C allele of the G-174C SNP and the A3 allele of the CA polymorphism are associated with increased bone mineral density (BMD) (p<0.0001), whereas the G-572C SNP is not (p=0.19). In concordance, subjects heterozygous for the A3 allele have higher BMD and T score average values (90.75% and -0.87, respectively) than those who did not present any A3 allele (81.4% and -1.45, respectively). Likewise, subjects with the CC genotype of the G-174 SNP have higher BMD (96.5%) and T score average value (-0.33) than those bearing the CG or GG genotype (lumbar BMD, 88.5 and 79.98%, respectively; T score: -1.07 and -1.75, respectively). CONCLUSIONS: The CA repeat and the G-174C SNP of the IL-6 gene may become useful markers for osteoporosis in the Mexican population.     

白细胞介素-1和白细胞介素-10基因多态性与脓毒症发病的相关性研究

目的：探讨脓毒症患者白细胞介素-1（IL-1）和IL—10基因单核苷酸多态性（SNP）的频率分布以及与脓毒症易感性的相关性，观察不同多态性基因型对细胞因子表达的影响。方法：选择2001年10月至2004年12月在该院普通外科住院的181例患者，分为脓毒症组（100例）和全身炎症反应综合症（SIRS）组（81例），以150例健康人群作为对照组。取外周血白细胞提取基凶组DNA，用PCR扩增限制性内切酶长度多态性的方法，检测IL-1基因上＋3953T、IL-10基因上-592A和-1082A，共3个SNP。在诊断为SIRS或脓毒症24h内取外周血单个核细胞提取总RNA，用RT—PCR法检测IL-1和IL-10mRNA的表达；同时取血浆用ELISA法检测细胞因子蛋白表达。结果：SIRS组和脓毒症组中，＋3953T、-592A出现的频率明显高于对照组。在脓毒症早期，IL-1mRNA及蛋白的表达水平在＋3953C／T组明显高于C／C组；而IL-10两个SNP对脓毒症早期的IL-10表达水平，无明显的影响作用。结论：该研究显示，IL-1及，IL-10基因上SNP差异可能是脓毒症患者易感的原因之一。在脓毒症发生机制中，有促炎介质和抑炎因子的共同参与，其表达水平与SIRS及脓毒症的发生和严重程度相关。     

SERPINB8基因多态性与汉族人寻常型银屑病表型的相关性研究

目的 探讨18q22.1区域内SERPINB8基因单核苷酸多态性 rs514315位点与汉族人寻常型银屑病临床表型(发病年龄、临床类型及家族史)的相关性.方法 选取汉族人群中7 227例患者和11 313例健康对照的SERPINB8基因rs514315位点的基因分型资料.数据资料应用SPSS 10.0统计软件对资料进行...     

IL-12B基因多态性及单倍型与克罗恩病的关系研究

目的探讨IL-12B基因多态性及单倍型与克罗恩病(CD)的关系。方法选取94例CD患者（CD组）和106例健康体检者（对照组）,采用改良多重高温连接酶检测反应技术检测IL-12B基因2个功能性单核苷酸多态性（SNP）位点rs3212227和rs6887695的等位基因及基因型,用Haploview4.2软件进行连锁不平衡和单倍型分析,并分析IL-12B基因多态性及单倍型与CD的关系。结果CD组与对照组比较,该2个IL-12B基因SNP位点的突变等位基因和基因型频率均无统计学差异（均P＞0.05）。进一步亚组分析发现回肠型CD组患者rs6887695位点的突变C等位基因和GC+CC基因型频率均明显低于与对照组（28.75%vs44.34%,P＜0.05,OR=0.507,95%CI：0.291~0.882;50.00%vs71.70%,P＜0.05,OR=0.395,95%CI：0.186~0.836）;而上述2个位点的等位基因及基因型频率分布在结肠病变（结肠型+回结肠型）CD组患者与对照组间比较均无统计学差异（均P＞0.05）。此外,CD患者组内分层比较发现,与结肠病变CD组比较,回肠型CD组患者rs6887695位点的突变C等位基因、GC+CC基因型以及CC基因型频率亦均明显降低（28.75%vs50.00%,P＜0.05,OR=0.404,95%CI：0.218~0.745;50.00%vs72.22%,P＜0.05,OR=0.385,95%CI：0.163~0.908;7.50%vs27.78%,P＜0.05,OR=0.150,95%CI：0.037~0.613）。经Haploview4.2软件分析发现rs3212227和rs68876952个SNP位点之间存在中等强度连锁不平衡关系（D忆=0.545,r2=0.235）,但CD组与对照组比较,各单倍型的频率均无统计学差异（均P＞0.05）。结论IL-12B基因rs6887695位点多态性与CD的临床表型相关,该位点基因突变后可能降低回肠型CD的发病风险。     

CCR2和CCR5基因多态性与结核性脓胸的关系

目的探讨CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A单核苷酸多态性(SNP)与结核性脓胸的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对结核性脓胸患者300例和健康对照组300例进行CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A SNPs检测。结果与CCR2基因-190 GG基因型相比,携带AG和AA基因型均可增加结核性脓胸发病风险(OR=2.254,95%CI 1.043~4.868;OR=8.728,95%CI 4.224~18.033)。进行分层分析发现,无卡介苗(BCG)接种史、体质量指数(BMI)<18.5 kg/m~2均增加结核性脓胸发病风险(OR=3.309,95%CI 2.108~4.382;OR=2.767,95%CI 1.918~3.993)。CCR5基因-59029 G/A各基因型未入选回归方程,无统计学意义(P>0.05)。结论CCR2基因-190 G/A SNP可能与结核性脓胸的发病风险有关;CCR5基因-59029 G/A SNP可能与结核性脓胸无关。     

IL-8基因多态性对慢性HBV感染者血清IL-8水平的影响

目的 探讨IL-8基因多态性对血清IL-8水平的影响以及IL-8基因多态性在慢性HBV感染发病机制中的可能作用.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)检测60例慢性HBV感染者和60例健康人群IL-8-251A/T位点多态性,同时采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组血清中IL-8的水平.结果 慢性HBV感染者和健康对照者间 IL-8-251A/T多态性位点各基因型频率和等位基因频率相比,差异有统计学意义(P<0.05).基因型为AA型、TA型的慢性HBV感染者其血清IL-8水平显著高于基因型为TT型的慢性HBV感染者(P<0.01)和所有基因型的健康对照(P<0.01).结论 IL-8-251A/T基因多态性与慢性HBV感染者血清IL-8水平有密切关系,提示IL-8-251A/T基因多态性可能会影响慢性HBV感染中患者的转归起重要的作用.     

骨保护素基因启动子单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的相关研究

目的探讨骨保护素基因启动子149、950T/C单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的相关性。方法提取192例脊髓型颈椎病和192例性别年龄匹配的健康人外周血DNA,聚合酶链反应产物根据限制性内切酶作用后不同分解产物和等位基因来判断每例患者骨保护素的基因型。确定对照组、疾病组不同的基因型及等位基因,评价颈椎病严重度以JOA评分,同时采用颈椎MRI评价病变节段,采用χ2检验比较两组的基因型分布差异。采用两元回归分析来确定脊髓型颈椎病的独立风险因子。结果在疾病组和对照组之间,149T/C基因型分布及等位基因频率间差异存在统计学意义。对于950 T/C单核苷酸多态性,两组分布差异并无统计学意义。对于149T/C基因型,其JOA评分、颈椎MRI受累节段两者差异无统计学意义。Logistic回归分析结果 149 T/C SNP、平均桌面工作时间为脊髓型颈椎病发病的独立风险因素。结论骨保护素149 T/C单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的发病有关,而与其严重度无关。950T/C单核苷酸多态性与脊髓型颈椎病的发病无明确相关性。149 T/C SNP、平均桌面工作时间为脊髓型颈椎病发病的独立风险因素。