结直肠腺癌中Fascin-1 mRNA和蛋白的表达及意义

目的检测Fascin-1 mRNA和蛋白在结直肠腺癌中的表达及预后意义。方法应用RT-PCR、组织芯片及免疫组化EnVision两步法检测结直肠腺癌组织中Fascin-1 mRNA和蛋白的表达,分析其与结直肠腺癌临床病理特征及预后的关系。结果Fascin-1 mRNA在结直肠腺癌组织中的相对表达量(1.309 6±0.947 1)明显高于癌旁正常组织(0.364 1±0.405 3),两组比较差异有统计学意义(t=5.805,P0.05);Fascin-1蛋白在结直肠腺癌组织中的高表达率为29.2%(38/130),显著高于癌旁正常组织(2.3%,3/130,P0.01)。Fascin-1 mRNA的显著上调和Fascin-1蛋白的高表达与结直肠腺癌淋巴结转移、TNM分期相关(P均0.05)。Fascin-1蛋白的高表达与肿瘤位置相关(P0.05)。Kaplan-Meier生存曲线显示:Ⅲ+Ⅳ期结直肠腺癌中Fascin-1蛋白高表达组患者较Fascin-1蛋白低表达组患者总生存率低(P0.05)。结论 Fascin-1 mRNA和蛋白的表达与结直肠腺癌的侵袭转移和患者不良预后密切相关,可作为晚期结直肠腺癌不良预后的有效评估指标,并有望成为结直肠腺癌侵袭转移早期识别的新型靶点。     

溶质载体家族6成员1通过调节PI3K/Akt信号通路磷酸化促进乳腺癌细胞的迁移和侵袭

目的 探讨溶质载体家族6成员1（SLC6A1）对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响及分子机制。 方法 下载并综合分析数据集GSE125989和GSE100534,筛选差异基因;通过STRING数据库和Cytoscape 3.6.1 软件构建差异基因的蛋白相互作用网络,并筛选hub基因;通过Ualcan和GEPIA数据库检测hub基因SLC6A1在乳腺癌中的表达及其对预后的影响;转染SLC6A1-siRNA干扰乳腺癌细胞MDA-MB-231中SLC6A1的表达;细胞划痕实验和Transwell实验检测乳腺癌细胞迁移和侵袭能力的变化;基因集富集分析和Western blotting检测SLC6A1在乳腺癌中发挥作用的机制;采用SC79激活Akt通路并检测细胞迁移和侵袭能力的变化。 结果 共筛选出92个乳腺癌原位癌与转移瘤的差异基因,并确定Ⅰ型胶原蛋白α1（COL1A1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、SLC6A1等20个hub基因;SLC6A1在乳腺癌组织中高表达（P＜0.001）,且与患者预后相关（P=0.01）;SLC6A1表达被干扰后,乳腺癌细胞迁移和侵袭能力显著下降（P＜0.05）;SLC6A1表达降低可抑制PI3K/Akt信号通路的磷酸化（P＜0.05）;激活PI3K/Akt通路后 SLC6A1-siRNA对乳腺癌细胞迁移和侵袭的抑制作用消失（P＜0.05）。 结论 SLC6A1通过调节PI3K/Akt信号通路促进乳腺癌的侵袭和转移。     

基于TCGA数据库的结直肠癌差异表达基因筛选及CCDC78新基因验证

目的:通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中大样本结直肠癌组织基因表达谱RNA测序(RNA-Seq)数据进行生物信息学分析,挖掘与结直肠癌预后密切相关的新基因,并对筛选出的新基因进行验证和功能研究。方法:从TCGA数据库下载结直肠癌RNA-Seq数据筛选差异表达基因,采用R-survival包对差异表达基因进行生存分析,筛选出与结直肠癌预后相关的基因,并从中挑选尚未在肿瘤研究中报道的表达上调最显著的新基因进行验证。采用RT-qPCR检测新基因在人结肠癌细胞、人正常结肠上皮细胞、人结直肠癌组织及配对的癌旁组织中表达水平的变化。采用慢病毒载体构建稳定沉默新基因表达的结肠癌细胞,以转染阴性对照慢病毒的结肠癌细胞为对照,采用CCK-8和Transwell实验研究稳定沉默新基因表达对结肠癌细胞活力、迁移和侵袭的影响。结果:(1)筛选出结直肠癌差异表达基因4 017个,Kaplan-Meier生存分析显示69个基因与结直肠癌患者预后差密切相关(P0. 01),其中表达上调基因36个,这36个基因中有11个尚未在肿瘤研究中被报道。(2)表达上调倍数前3位的基因为CCDC78、PGGHG及TSPEAR,这3个基因的mRNA表达水平在结肠癌细胞中显著上调(P0. 01),CCDC78 mRNA表达水平在结直肠癌组织中也显著上调(P0. 01)。(3)稳定沉默CCDC78表达可显著抑制结肠癌细胞活力、迁移和侵袭(P0. 01)。结论:基于TCGA数据库的生物信息学分析有助于发现与结直肠癌预后相关的新基因;CCDC78可能是一个新的与结直肠癌预后差相关的癌基因。     

结直肠腺癌中HIF-1α、VEGF的表达及其相关性

目的 探讨缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)、血管内皮生长因子(VEGF)在结直肠正常组织、腺瘤及腺癌组织中的表达及其之间的相关性.方法 采用免疫组织化学SP法检测64例原发性结直肠腺癌、20例腺瘤及20例正常结直肠组织中HIF-1α、VEGF蛋白的表达,分析其与临床病理特征之间的关系.结果 结直肠正常组织、腺瘤及腺癌组织中HIF-1α的阳性表达率分别为15%、25%和51.6%,正常组织与腺瘤之间的差异无统计学意义(P>0.05),正常组织与腺癌、腺瘤与腺癌之间的差异具有统计学意义(P<0.05);VEGF在正常组织、腺瘤及腺癌组织中的阳性表达率分别为20%、30%和62.6%,VEGF在正常组织与腺瘤之间的差异无统计学意义(P>0.05),正常组织与腺癌、腺瘤与腺癌之间的差异具有统计学意义(P<0.05).HIF-1α与结直肠腺癌Dukes分期、浸润深度、淋巴结转移及组织学分级明显相关(P<0.05);VEGF的表达与Dukes分期及淋巴结转移密切相关(P<0.05),与浸润深度及组织学分级无关(P>0.05).HIF-1α与VEGF的表达呈显著正相关(r=0.577,P<0.01).结论 HIF-1α及VEGF蛋白可以作为检测结直肠腺瘤癌变的指标,HIF-1α及VEGF蛋白的高表达可能在结直肠癌侵袭转移过程中发挥重要作用.     

SERPINE1对胃腺癌病人预后、免疫及细胞功能的影响

目的 探讨SERPINE1在胃腺癌中的表达及其对患者预后的影响。方法 应用GEPIA检索胃腺癌预后基因,并分析排名前10位的的预后基因在胃腺癌和胃正常组织中是否存在差异。HPA数据库分析SERPINE1在胃腺癌组织表达。STRING和GeneMANIA数据库分析SERPINE1的相关作用蛋白。TIMER数据库分析SERPINE1是否与胃腺癌免疫及预后是否相关。siRNA抑制SERPINE1表达,Quantitative Real-time PCR验证抑制情况。应用MTT和Transwell研究SERPINE1对胃腺癌细胞增殖和侵袭影响。结果 我们发现SERPINE1是胃腺癌预后差异基因;同时,SERPINE1高表达与胃腺癌病人总生存期和无病生存期相关。抑制SERPINE1表达后,胃癌细胞的增殖和侵袭能力降低。TIMER数据库分析证明SERPINE1与胃腺癌免疫细胞浸润相关。我们通过STRING和GeneMANIA数据库发现PLG,PLAT,PLAU,PLAUR和VTN在PPI中与SERPINE1密切相关。结论 SERPINE1在胃组织中不表达,在胃腺癌中表达;其高表达与胃腺癌患者不良的...     

川楝素通过MMP9抑制肾癌细胞的增殖、迁移和侵袭

目的：基于网络药理学方法探讨川楝素治疗肾癌的靶点及作用机制，并通过体外内实验进行验证。方法：通过SwissTarget数据库和TargetNet数据库获取川楝素的作用靶点，GeneCards数据库获取肾癌疾病相关靶点；采用DAVID数据平台对靶点进行GO分析；利用基因表达汇编（GEO）数据库的组织芯片分析靶点基因在肾癌组织的表达水平；基于肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库分析靶点基因与肾癌临床表型的关系。采用CCK-8实验及异种移植实验观察川楝素对肾癌细胞体内外增殖的影响；采用Transwell侵袭和迁移实验观察川楝素对肾癌细胞侵袭和迁移的影响；构建基质金属蛋白酶9(MMP9)过表达质粒并转染人肾癌细胞系ACHN和769-P，观察上调MMP9表达对肾癌细胞增殖、侵袭及迁移的影响。结果：基于网络药理学分析结果，川楝素作用于肾癌的靶点包括MMP9在内共有13个靶点；TCGA数据库的临床数据表明，MMP9在肾癌组织中的表达较正常肾组织表达上调（P<0.05），且其高表达与肾癌临床分期晚、分化程度低、复发及预后差密切相关（P<0.05）。功能实验中，川楝素呈时间和剂量依赖性抑制MMP...     

结直肠腺瘤及腺癌组织中FOXO1表达及其临床意义

目的检测结直肠腺瘤及腺癌组织中转录因子FOXO1的表达,在组织学水平上初步探讨FOXO1在结直肠腺瘤癌变过程中的作用及其与临床病理特征的关系。方法采用Western blot法免疫组化SP两步法检测146例结直肠腺瘤、48例结直肠腺癌及48例癌旁组织中FOXO1蛋白的表达水平。结果 FOXO1在结直肠腺瘤及腺癌组织中的表达明显低于正常组织,组间比较差异有统计学意义(P0.01)。结直肠腺瘤组织中FOXO1表达与肿物大小相关,腺癌组织中FOXO1表达与肿瘤分化程度相关。结论 FOXO1在人类肠道癌前病变(腺瘤)及腺癌组织细胞核表达减少和缺失,可能是导致结肠腺癌发病的机制之一,其在结直肠癌的发生、发展过程中起抑癌基因的作用,有望成为下一个潜在的临床治疗靶点。     

结直肠腺癌中PTEN和NDRG1的表达及其与预后的关系北大核心CSCD

目的探讨PTEN和分化相关基因（NDRG1）在结直肠腺癌组织中的表达及其临床病理意义。方法收集91例结直肠腺癌、30例结直肠腺瘤和21名正常肠黏膜组织标本及其临床资料,采用免疫组织化学法检测PTEN和NDRG1蛋白的表达,并结合临床资料分析其临床意义。结果PTEN和NDRG1在结直肠腺癌中的阳性表达率分别为55．0％（50／91）和76．9％（70／91）,与正常肠黏膜组和结直肠腺瘤组比较,差异有统计学意义（P〈0．05）。PTEN表达下调和NDRG1过度表达与淋巴结转移明显相关（P〈0．05）。结直肠腺癌组织中PTEN和NDRG1的表达存在负相关关系（rs＇=0．251,P=0．016）。PTEN蛋白阴性表达组的结直肠腺癌患者无病生存时间和总生存时间明显低于PTEN蛋白阳性表达组,差异有统计学意义（P〈0．05）。结论PTEN失表达有可能成为结直肠腺癌癌变早期的分子生物学标志物之一,并可作为评估结直肠腺癌患者预后的指标之一。NDRG1与结直肠腺癌的发生发展有关,但不能作为临床评估结直肠腺癌患者预后的指标。联合检测PTEN和NDRG1,可作为疑难病例的辅助诊断指标。     

利用生物信息分析筛选结肠癌发生潜在基因及机制

目的通过生物信息学的方法来分析结直肠癌发生的潜机制。方法利用GEO2R分析差异基因表达,利用DAVID分析进行富集分析。利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析。通过TCGA数据库对核心基因进行差异验证和预后分析。结果通过差异分析,我们得到216个差异基因。通过富集分析发现,差异基因主要和细胞粘附有关,主要位于PPAR信号通路上。蛋白相互作用分析后,我们找到了8个核心基因(IL8、SST、SPP1、GCG、CXCL12、LPAR1、COL1A2和MMP1)和一个模型。经过TCGA数据库验证,我们发现8个基因都存在差异,同时两个基因预后有意义。结论找到了8个风险相关的核心基因和2个预后相关基因,这些核心基因可能可以用做结直肠癌发病预测的靶标。     

肺腺癌组织血管内皮生长因子受体3(VEGFR3)高表达与患者预后不良正相关

目的研究肺腺癌组织血管内皮生长因子受体3(VEGFR3)的表达及意义,通过敲低A549细胞VEGFR3水平研究对其生物学行为的影响及机制。方法用免疫组织化学法检测78例肺腺患者组织, 35例癌旁组织中VEGFR3的表达并分析与临床病理指标的关系。利用TCGA数据库分析血管内皮生长因子C(VEGF-C)和VEGFR3与肺腺癌患者预后的关系。利用RNA干扰技术抑制A549肺癌细胞中VEGFR3的表达并给予VEGF-C刺激,采用CCK-8法检测A549细胞的增殖, Transwell~(TM)实验检测A549细胞侵袭和迁移, Western blot法检测蛋白激酶B(AKT)信号通路蛋白水平。结果肺腺癌组织中VEGFR3的表达明显高于癌旁组织。肺腺癌组织VEGFR3的表达与恶性程度、 TNM分期、淋巴结转移呈正相关, VEGFR3高表达的患者生存率显著低于VEGFR3低表达的患者。敲低VEGFR3水平抑制A549细胞的增殖、侵袭和迁移。外源性VEGF-C能够促进VEGFR3的表达,激活AKT信号通路。沉默VEGFR3可降低VEGF-C对AKT通路的激活效应。结论肺腺癌组织VEGFR3高表达与预后不良正相关。沉默VEGFR3阻断AKT信号通路抑制A549细胞的增殖、侵袭和迁移。     

ARHGAP10基因在肺腺癌中的表达及其机制

目的:基于生物信息学技术探讨Rho GTPase活化蛋白10（ARHGAP10）在肺腺癌发生发展中的潜在分子机制,为后续深入研究提供生物信息学证据。方法:通过利用TCGA数据库,获取肺腺癌患者RNA高通量序列及相关患者的临床资料,其中包括514例肺腺癌患者的癌组织以及59例相关的癌旁组织;GSE115002肺腺癌基因芯片数据从GEO下载,芯片包含52例肺腺癌患者的癌组织和匹配的癌旁正常组织。通过R语言技术比较ARHGAP10在TCGA和GSE115002中肺腺癌组织和癌旁正常组织之间表达差异,并进一步分析ARHGAP10表达与肺癌患者临床预后的相关性;挖掘两个数据库中ARHGAP10重叠基因,对重叠基因进行GO和KEGG富集分析,采用STRING数据库获取ARHGAP10的相关基因互作蛋白网络,TIMER数据库分析ARHGAP10与免疫浸润的相关性。结果:与癌旁正常组织相比较,肺腺癌组织中ARHGAP10呈现低表达状态（P<0.01）。与ARHGAP10低表达组相比较,ARHGAP10高表达患者拥有更长的总生存期和无进展生存期（P<0.05）。TCGA和GSE115002肺腺癌数据库中ARHGAP10的共同相关基因共133个,与MAPK、PI3K-AKT等信号通路以及细胞外基质受体结合、肌动蛋白细胞骨架、肿瘤信号通路等生物学进程相关。本研究发现PRELP、LIMS2、PPAP2B、MRPL42、SRP9、TSNAX等蛋白在ARHGAP10相互作用网络中发挥重要作用,ARHGAP10与DC细胞、中性粒细胞浸润正相关,与PD-L1表达呈正相关。结论:ARHGAP10在肺腺癌中起抑癌作用,与肺腺癌的生存预后正相关,可作为肺腺癌患者潜在的临床预后标志物。     

结直肠癌中SPOCD1的表达及相关分子机制

目的 探讨含SPOC结构域蛋白1(SPOC domain-containing protein 1, SPOCD1)在结直肠癌中的表达及相关分子机制。方法 利用TCGA数据库和GEO数据库分析结直肠癌和癌旁正常组织中SPOCD1 mRNA的表达;采用免疫组化和Western blot法检测结直肠癌和癌旁正常组织或细胞系中SPOCD1蛋白表达,并分析其与临床病理特征的关系;应用GEPIA和Prognoscan数据库分析SPOCD1表达与结直肠癌患者预后的关系;基因集富集分析SPOCD1可能参与的通路;采用GEPIA数据库分析基因表达之间的相关性;利用siRNA沉默结直肠癌细胞系HCT116中SPOCD1蛋白表达,Western blot法验证下游基因。结果 TCGA和GEO数据库分析结果显示,SPOCD1 mRNA在结直肠癌组织中的表达显著增加;免疫组化结果显示,SPOCD1蛋白在结直肠癌组织中高表达(67.8%,40/59),显著高于癌旁正常组织(37.3%,22/59)(P<0.001);SPOCD1在结直肠癌细胞系(HCT116和LoVo)中的表达高于正常结直肠细胞系(NCM...     

结直肠肿瘤中CXCR7、NDRG1的表达

目的 探讨CXCR7、NDRG1蛋白在结直肠肿瘤中的表达及其对结直肠肿瘤发生、发展的影响.方法 采用免疫组化染色技术观察人结直肠正常黏膜组织、结直肠腺瘤、无淋巴结转移(无LNM)结直肠腺癌组织及伴有淋巴结转移(有LNM)结直肠腺癌组织中CXCR7、NDRG1蛋白的表达水平.结果 (1)结直肠正常黏膜组织、腺瘤组织、无LNM结直肠腺癌组织及有LNM结直肠腺癌组织中CXCR7蛋白表达逐渐增高,其中后者CXCR7的表达与其他组别相比,差异有统计学意义(P＜0.05);CXCR7的表达与淋巴结转移呈正相关关系(rs=0.341),与肿瘤TNM分期有关(P＜0.05).(2)NDRG1蛋白表达逐渐增高,差异均有统计学意义(P＜0.05);NDRG1的表达与淋巴结转移呈正相关关系(rs＝0.402),与肿瘤TNM分期有关(P＜0.05).(3)CXCR7与NDRG1在结直肠肿瘤中的表达呈正相关关系(P=0.003,rs=0.334),2者均具有诊断准确性.结论 CXCR7、NDRG1在结直肠腺癌发生发展整个过程的不同阶段起着重要的作用,两者在促进肿瘤转移方面具有正相关性.     

结直肠腺癌差分化细胞群中EZH2、β-catenin蛋白的表达及其临床意义

目的探讨EZH2、β-catenin蛋白在结直肠腺癌中差分化细胞群(pooly differentied cluster, PDC)中的表达,并分析两者在结直肠腺癌PDC中表达的相关性。方法采用HE染色观察结直肠腺癌中PDC的形态学特点,应用免疫组化EnVision两步法检测EZH2和β-catenin蛋白在PDC中的表达,并复习相关文献。结果结直肠腺癌PDC中EZH2蛋白高表达率(76%)高于癌旁正常组织及非PDC的结直肠腺癌(P0.05);EZH2蛋白表达与淋巴结转移、pTNM分期有关(P0.05),与结直肠腺癌PDC患者年龄、性别、肿瘤直径、组织分级、病变部位无关(P0.05);β-catenin蛋白的核高表达率(38%)高于癌旁正常组织(P0.05);β-catenin蛋白核表达与淋巴结转移、血管侵犯及pTNM分期有关(P0.05),与结直肠癌PDC患者年龄、组织学分级、肿瘤直径及病变部位均无关(P0.05);EZH2蛋白高表达、β-catenin蛋白核表达在结直肠腺癌PDC中呈正相关(r_s=0.254,P0.05)。结论 EZH2、β-catenin蛋白在结直肠腺癌PDC中表达的异常,可能通过激活Wnt/β-catenin信号通路共同参与上皮-间质转化,促进结直肠腺癌的侵袭、转移。     

Expression and clinical significance of CD151 and integrin α3β1 in colorectal tumors

目的:探讨CD151和整合素α3β1在直肠腺瘤及结直肠腺癌组织中的表达及其与临床各个病理因素之间的关系,并且研究两者的相关性.方法:应用免疫组织化学双染方法对正常结直肠黏膜、结直肠腺瘤及结直肠腺癌组织各120例进行CD151和整合素α3β1检测,并进行Kaplan-Meier生存分析.采用Spearman等级相关分析CD151和整合素αβ1之间的相关性.结果:CD151结直肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织的阳性率分别为21.7％、52.5％、72％,腺瘤和腺癌组织分别与正常黏膜比较均具有统计学意义.整合素α3β1在结直肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织的阳性率分别为34.2％、55％、70％,腺瘤和腺癌组织分别与正常黏膜比较均具有统计学意义.在结直肠腺癌中,CD151和整合素α3β1的表达与患者年龄、性别和肿瘤的部位、大小无相关性,与肿瘤的分化程度、浸润深度、淋巴结转移及Duke's分期有关.CD151和整合素α3β1在大肠正常黏膜、腺瘤及腺癌组织中的表达经双变量相关分析,表达呈正相关.从图的Kaplan-Meier生存曲线及Log-Rank检验可知,CD151+、α3β1+、CD151+α3β1+与大肠癌患者5年生存期密切相关,是影响大肠癌预后的因素.结论:CD151和整合素α3β1在大肠癌的表达密切相关,提示CD151与整合素α3β1复合物存在于大肠癌,其表达对预后产生明显的影响.CD151与整合素α3β1联合表达是临床预后判断的可靠指标.     

Wnt信号通路成员蛋白NKD1、β-catenin和Cyclin D1在结直肠腺癌中的表达及意义

目的观察NKD1、β-catenin和Cyclin D1蛋白在结直肠正常黏膜、腺瘤和腺癌组织中的表达,探讨NKD1、β-catenin和Cyclin D1在结直肠正常黏膜-腺瘤-腺癌这一癌变过程中的表达变化及临床意义。方法应用免疫组化SP法检测38例结直肠正常黏膜、70例腺瘤、128例腺癌组织中NKD1、β-catenin和Cyclin D1蛋白的表达。结果 NKD1在结直肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织中的阳性率依次降低(P0.05),其在轻度异型增生腺瘤组织中的阳性率高于重度异型增生腺瘤组织(P0.05);β-catenin异位表达率与Cyclin D1阳性率在结直肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织中均依次升高(P0.01),且Cyclin D1在重度异型增生腺瘤组织中的阳性率高于中度及轻度异型增生腺瘤(P0.05)。NKD1、β-catenin、Cyclin D1在结直肠腺癌组织中的表达均与癌分化程度、Duke分期、淋巴结转移有关(P0.05)。在结直肠腺癌组织中NKD1的阳性率和β-catenin异位表达率呈负相关(r_s=-0.645,P0.01)。在结直肠腺癌组织中β-catenin异位表达率和Cyclin D1阳性率呈正相关(r_s=0.618,P0.01)。结论 NKD1、β-catenin、Cyclin D1三者可能参与结直肠肿瘤的发生、发展,有望成为评价结直肠腺癌恶性程度及预后的指标。     

WNT信号抑制因子DKK3基因 对结直肠癌细胞系HCT116迁移与侵袭的影响

目的分析DKK3在结直肠癌组织中的表达及对患者预后的影响,同时探索DKK3对结直肠癌细胞增殖、迁移以及侵袭能力的影响,并对机制进行一定的探索。方法在线数据库分析DKK3在结直肠癌组织中的表达及其对患者预后的影响。用RNA干扰技术,下调DKK3;用MTT检测细胞增殖,同时运用细胞小室迁移实验检测细胞迁移及侵袭能力,并通过RT-qPCR技术以及Western blot技术检测迁移相关蛋白表达。结果与正常组织相比,DKK3在结直肠癌组织中的表达显著上调并会导致患者整体预后情况变差(P0.05),干涉DKK3后细胞增殖速率明显减缓(P0.05),并且细胞迁移以及侵袭能力减弱(P0.01)。MMP2、 MMP7以及MMP9与DKK3的表达呈正相关关系(P0.001)。在敲低DKK3后,MMP2、 MMP7、 MMP9以及p-ERK的表达均显著下调(P0.01)。结论 DKK3在结直肠癌细胞系HCT116中表达上调,可能通过MAPK/ERK信号通路促进细胞增殖以及迁移能力。     

肺腺癌预后代谢相关基因的生物信息学分析

目的 基于代谢基因的生物信息学构建肺腺癌预后模型及验证。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达数据集(GEO)肺腺癌相关数据，套索(LASSO)回归构建多基因预后模型并计算风险值(RS)。单因素、多因素Cox独立预后分析，通过受试者工作特征(ROC)曲线评价模型的ROC曲线下面积(AUC)并进行生存分析。构建列线图评价模型的可行性，通过基因集富集分析(GSEA)进行代谢基因功能富集分析。肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析患者RS与免疫细胞浸润以及与免疫检查点分子表达的相关性。结果 运用TCGA数据库基于18个代谢相关基因构建肺腺癌预后模型，RS可以作为独立的预后因子。ROC曲线下面积为0.713。生存分析显示，与高风险组相比，低风险组总体生存率更高，预后模型与免疫细胞的浸润以及与免疫检查点分子的表达有关。结论 代谢相关基因肺腺癌预后模型的RS是独立预后因子，模型具有较高的预后判断价值。     

轴丝动力蛋白中链基因1在肺腺癌中低表达且抑制肺腺癌细胞侵袭能力

目的 探讨轴丝动力蛋白中链基因1(DNAI1)在肺腺癌(LUAD)中的表达情况以及对肺腺癌侵袭能力的影响.方法 微阵列基因芯片筛选肺腺癌组织(3例)与癌旁组织(3例)的差异表达基因;聚类热图(heatmap)、火山图(volcano plot)展示筛选后mRNA的表达和分布情况;利用DAVID数据库进行基因本体论(GO...     

ALYREF对肺腺癌细胞增殖、迁移和上皮-间质转化的影响

目的 探讨ALYREF在肺腺癌组织中的表达及其对肺腺癌细胞增殖、迁移和上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)的影响。方法 利用TCGA数据库分析ALYREF在肺腺癌中的表达及其与预后的关系;应用免疫组化验证肺腺癌及其癌旁组织中ALYREF的表达水平。构建沉默ALYREF的A549和H1299稳转细胞株;通过RTCA和克隆形成实验检测细胞增殖,采用Transwell实验评估细胞迁移,运用Western blot检测增殖、迁移及EMT相关蛋白的表达水平。RNA-seq测序沉默ALYREF的A549细胞及对照细胞,进行GO/KEGG通路富集分析,分析ALYREF可能参与的功能通路,并通过功能回复实验进行验证。结果 TCGA数据库分析结果显示：ALYREF在肺腺癌组织中显著高表达(P<0.001);高表达ALYREF患者的总生存期(overall survival, OS)更短(P<0.05)。沉默ALYREF可以抑制A549和H1299细胞的增殖、迁移和EMT进程。RNA-seq测序显示：差异表达基因在TGF-β通路富集最明...