2017年山西省婴幼儿流行性脑脊髓膜炎病例病原学分析

目的分析2017年山西省由B群脑膜炎奈瑟菌引起的3例婴幼儿流行性脑脊髓膜炎（流脑）病例病原学特征。方法收集3例婴幼儿流脑病例的临床流行病学资料,采集病例脑脊液和血液标本进行脑膜炎奈瑟菌培养、分离、鉴定和血清分群,采用多位点序列分型（MLST）方法进行分子分型,药敏E-test试纸条法检测抗生素敏感性。结果3例B群流脑病例发病月龄分别为12 d、5月龄和8月龄,符合化脓性脑膜炎症状,脑脊液标本均分离培养出3株B群脑膜炎奈瑟菌。 MLST序列分型分析显示,2株菌为ST-5664（CC4821）,1株为ST-5662。 3株B群菌株均对环丙沙星、左氧氟沙星和复方新诺明等药物耐药。结论山西省首次从病例标本中分离到B群脑膜炎奈瑟菌,3例B群流脑病例均为婴幼儿发病,且主要基因型属于CC4821。     

一起产气荚膜梭菌食物中毒事件的实验室检测分析

目的应用3种方法对一起食物中毒事件中的可疑样品进行检测和结果分析。方法应用实时荧光PCR、数字PCR和平板计数培养法检测食物中毒事件中的可疑食品盐水猪肝,并对分离菌株用脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分型。 应用细菌生化试验、实时荧光PCR鉴定可疑食品中的产气荚膜梭菌;应用数字PCR对毒力基因进行绝对定量。结果可疑食品产气荚膜梭菌平板计数值为4 400 000 CFU/g,并分离到22个产气荚膜梭菌单菌落,实时荧光PCR检测可疑食品样本产气荚膜梭菌plc和cpe基因阳性,其中3个菌落plc+/cpe+,19个菌落plc+/cpe–;数字PCR检测可疑食品样本plc基因绝对定量值为1064 拷贝/μl;22个单菌落分为2种PFGE带型。结论通过3种方法检测可疑食品中产气荚膜梭菌,说明该起食物中毒可能由产气荚膜梭菌导致。     

一起GⅠ型诺如病毒混合感染多克隆蜡样芽胞杆菌致急性胃肠炎暴发事件实验室分析

  目的  通过一起急性胃肠炎暴发事件的实验室检测,分析暴发相关病原特征。  方法  对患者粪便、呕吐物标本以及可疑污染食品样本进行相关病原及毒力基因的实时荧光PCR筛查以及阳性菌的培养检测,对分离菌株进一步进行毒力基因分布分析和脉冲肠凝胶电泳分型分析。  结果  25例患者的粪便标本诺如病毒荧光PCR阳性,检出率为71.43%（25/35）,均为GⅠ型;5例患者的6份标本中蜡样芽胞杆菌荧光PCR和病原培养均为阳性,1名厨师粪便标本蜡样芽胞杆菌荧光PCR和培养结果均为阳性。 7件可疑食品样本中4件检出蜡样芽胞杆菌,其中5份食品样本ces基因阳性。 19株蜡样芽胞杆菌分离株脉冲场凝胶电泳（PFGE）分为14种带型,5例患者分离株中有2株PFGE带型相同且与厨师来源菌株分型一致,相同食品来源分离株的PFGE带型不完全一致。 19株分离株均不携带ces基因。  结论  诺如病毒和蜡样芽胞杆菌可能是导致本次急性胃肠炎暴发事件重要病原,以多病原快速筛查为指导的实验室检测对于病原的识别具有重要意义。     

杭州市富阳区住院腹泻患者艰难梭菌感染及菌株分子特征分析

目的了解浙江省杭州市富阳地区住院腹泻患者艰难梭菌感染情况,研究感染患者临床危险因素及分离菌株的分子特征。方法收集2017年5月至2018年2月就诊于第一人民医院的228例腹泻患者的粪便标本,通过厌氧培养进行艰难梭菌菌株分离和鉴定,进行多位点序列基因分型,以琼脂稀释法测定菌株耐药性,对患者临床资料进行统计分析。结果228份标本共检测出产毒型艰难梭菌41株,其中31株为医院获得性腹泻;阳性患者平均年龄67.8岁,主要来自消化内科（34.1%）和肾内科（19.5%）。 ST2、ST3和ST54为主要基因型。 所有菌株对万古霉素、甲硝唑、四环素、哌拉西林敏感。 临床资料统计分析显示,＞60周岁、患基础性疾病和有抗生素用药史的阳性患者数量远高于阴性患者比例（χ2＝4.229、9.022、5.767,P＝0.023、0.001、0.009）。结论杭州市富阳区住院腹泻患者艰难梭菌感染患者主要来源于院内感染。 患有基础性疾病、8周内有抗生素用药史的老年患者为感染的危险因素;在院内感染防控中需进一步加强监测。     

五种益生菌菌株对脐血单核细胞表达CD4CD25的影响

目的:研究不同剂量的5种国内益生菌菌株(长双歧杆菌6-1株、婴儿双歧杆菌CGMCC313-1株、嗜酸乳杆菌YIT2004株、粪链球菌YIT0072株和酪酸梭状芽胞杆菌CGMCC313-2株)对脐血单核细胞(CBMC)的表达CD4、CD25的影响.方法:取7例健康孕妇的脐血分离出CBMC,分别与上述5种益生菌菌株,以菌和CBMC比例2:1(低)、20:1(中)和200:1(高)共培养24-36小时,同时设阴性对照(PBS)和阳性对照(脂多糖,LPS),采用流式细胞仪检测各组CBMC表面CD4CD25分子表达情况.结果:5种益生菌菌株中,除了高剂量的酪酸梭状芽胞杆菌株CGMCC313-2株组CBMC表达CD4CD25与阴性对照组表达有显著差异(P＜0.01)外,其余益生菌组表达CD4CD25与阴性对照组无明显差别(P＞0.05).结论:酪酸梭状芽胞杆菌CGMCC313-2株可影响Tn细胞分化为CD4+CD25+CBMC.     

深圳市南山区腹泻患者弯曲菌感染及病原学特征分析

目的获得本地区秋季腹泻患者弯曲菌的感染现状及病原学特征。方法收集深圳市南山区2018年9 — 11月腹泻患者的粪便标本,采用双孔滤膜法分离培养弯曲菌并应用荧光聚合酶链式反应（PCR）方法进行菌种鉴定。 应用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）对分离菌株进行分子分型,应用琼脂稀释法获得菌株对11种抗生素的最小抑菌浓度（MIC）。 根据菌株的序列分型（ST）结果,结合既往菌株分型数据进行本地区菌株的遗传聚类分析。结果共采集腹泻患者粪便标本150份,其中男性患者74例,女性患者76例,年龄在1～86岁之间。 150份粪便标本中共分离到弯曲菌18株,检出率为12.00%（18/150）。 菌种鉴定发现,空肠弯曲菌占77.78%（14/18）,结肠弯曲菌占22.22%（4/18）。 14株空肠弯曲菌可分为11种PFGE带型,8个ST型别,以ST9763最多（35.71%,5/14）,是本研究新发现ST型别。 14株空肠弯曲菌对四环素全部耐药,对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、庆大霉素、链霉素及克林霉素100.00%敏感。 ST型别最小生成树聚类分析结果表明,不同宿主来源菌株没有显著聚集性,腹泻患者分离菌株分布在不同来源的组群中。结论采用双孔滤膜法提高了腹泻患者中弯曲菌的检出率。本地区弯曲菌的感染仍以空肠弯曲菌为主, 分离菌株对四环素类、喹诺酮类抗生素呈现较高的耐药特征,分离的空肠弯曲菌ST呈弥散分布特点。     

2018－2019年浙江省余姚市河水环境中沙门菌多样性及耐药性分析

目的了解浙江省余姚地区河水中沙门菌的分布和污染情况。方法2018 — 2019年采集余姚市12个监测点的河水,进行增菌、分离、生化鉴定、血清分型、药敏试验及耐药基因检测。结果采集河水样品192份,检出含有沙门菌样品116份,检出率为60.42%,其中姚江姚江桥点检出率最高（87.50%）。 阳性水样共检出菌株177株,分为25个血清型,其中鼠伤寒沙门菌（16.38%）、德尔卑沙门菌（12.43%）和鼠伤寒单相变种（11.30%）位居前3位,各监测点中以姚江三管堂点血清型检出最多。 春季分离到的血清型别更丰富。 39株表现为对所测试的16种抗生素泛敏感,而其他菌株则表现为至少对1种抗生素表现出耐药性。 耐药率较高的为青霉素类和四环素类抗生素,其中氨苄西林耐药率为72.31%,哌拉西林为51.41%,四环素为66.10%。 对3种及以上的抗生素耐药的多重耐药菌菌株有34株。 β-内酰胺类抗生素相关耐药基因tem检出率为67.23%,oxa为6.78%,ctx-M为12.43%;四环素类抗生素相关耐药基因则分别为tetA型（55.37%）、tetB型（11.30%）和tetG型（7.91%）。结论余姚地区河水中沙门菌检出率高、菌型丰富、耐药率严重、耐药机制复杂,食源性防控中应注意环境来源的沙门菌的危害。     

2016年山东省聊城市临床病例中2种罕见施万菌的鉴定

目的对2016年山东省聊城市临床患者分离株进行鉴定以及分析其生化特性和药物敏感性。方法对患者来源标本及6株菌株进行选择性培养基分离培养，并进行生化试验、溶血试验、耐盐耐热实验和药敏试验，使用API生化鉴定系统、VITEK 2 Compact、全自动快速微生物质谱检测系统进行鉴定，并进行16S rRNA和gyrB序列分析。结果8株菌在菌落形态和生化特性上差异无统计学意义，只有溶血状态有所不同，临床鉴定系统有局限性，只能分辨到海藻施万菌和腐败施万菌，进一步使用16S rRNA和gyrB序列检测方法，确认患者分离株属于2种罕见的施万菌，即鲍施万菌和优佩内施万菌。结论首次在中国大陆的临床病例中，鉴定了2株由罕见施万菌导致的感染病例。 由施万菌属引起的临床感染还需要进一步重视，并加强监测。     

单增李斯特菌感染一例患者的病因溯源

目的对一例单增李斯特菌感染患者的致病因素进行调查和溯源分析。方法在现场流行病学调查的基础上,对患者、患者家庭食品、厨房用具等进行样本采集并进行单增李斯特菌的菌株分离鉴定。对分离菌株的6个毒力基因（prfA、plcB、hly、actA、iap、inlA）进行检测,使用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）技术进行分子分型分析,对分离菌株进行同源性分析。结果19份样本中共分离出6株单增李斯特菌,1株来自患者,2株来自厨房环境用具样本（冰箱冷藏室内壁涂抹1份和小号菜板涂抹1份）,3株来自患者家庭中食物（分别是猪肝1份、甜玉米粒罐头1份和红焖牛肉罐头1份）。除冰箱冷藏室内壁涂抹和甜玉米粒罐头2个样本检出的菌株plcB毒力基因阴性外,另外5个毒力及其他菌株的所有毒力基因全部为阳性。分离菌株均为ST121型,PFGE带型100%一致。结论患者家庭厨房食用食物和环境皆被单增李斯特菌污染,引起交叉感染,致使患者感染发病。     

某医院重症监护病房鲍曼不动杆菌分布及其耐药性研究

摘要 目的 了解医院重症监护病房(ICU)患者标本分离鲍曼不动杆菌分布及耐药特征。方法 采用细菌分离鉴定和药敏试验方法,对某医院ICU住院患者送检标本分离鲍曼不动杆菌分布及其耐药性进行检测,并与其他临床科室作比较分析。结果 全院共分离出鲍曼不动杆菌474株,其中ICU为221株,占检出总数的46.62%;神经外科占34.49%,仅次于ICU;各科室分离的鲍曼不动杆菌主要来源于痰标本;ICU患者标本检出的鲍曼不动杆菌中多重耐药菌株比例高于其他科室,且检出率呈现增加趋势;临床分离的鲍曼不动杆菌对临床常用抗菌药物普遍耐药,耐药率大多超过50%,仅对替加环素较敏感,其中对阿莫西林、头孢西丁、氨苄西林、头孢唑林及呋喃妥因等抗菌药物耐药率均达100%。结论 该医院ICU患者鲍曼不动杆菌感染率居各临床科室之首,主要为呼吸道感染,多重耐药菌株比例较高,提示应严密监控和加强防范措施。     

Susceptibility of Clostridium botulinum to thirteen antimicrobial agents.

A total of 224 strains of Clostridium botulinum (including isolates from 14 patients with infant botulism and 4 with wound botulism) and 15 strains of C. sporogenes were tested by agar dilution for susceptibility to tetracycline, metronidazole, erythromycin, penicillin, rifampin, chloramphenicol, clindamycin, cephalothin, cefoxitin, vancomycin, sulfamethoxazole-trimethoprim, nalidixic acid, and gentamicin. At least 90% of the C. botulinum strains tested (except for nonproteolytic strains of toxin type F with penicillin) were susceptible to all drugs except sulfamethoxazole-trimethoprim, nalidixic acid, and gentamicin. Minimal inhibitory concentrations for strains from patients with infant and wound botulism were similar to those for other C. botulinum strains.     

四川省自贡市食品和环境携带屎肠球菌的耐药性和多位点序列分型研究

目的 研究四川省自贡市食品和环境样本中屎肠球菌耐药性及携带毒力基因情况,并对分离菌株进行序列分型（ST）。方法 对2013年采集的157份食品和环境样本进行屎肠球菌分离鉴定,全自动微生物鉴定仪检测屎肠球菌对14种常见抗生素的敏感性;使用聚合酶链式反应方法检测屎肠球菌携带毒力基因（hyl,esp）的情况,并应用多位点序列分型（MLST）方法对分离菌株进行序列分型。结果 自贡地区肉制品和冰箱拭子样本屎肠球菌分离率为28.03%（44/157）,其中耐药菌株的比例为86.36%（38/44）。分离菌株对红霉素、四环素和利福平的耐药率分别为65.91%（29/44）、31.82%（14/44）和27.27%（12/44）,对环丙沙星,高浓度链霉素和高浓度庆大霉素以及氯霉素也有一定的耐药率。分离到1株喹奴普丁-达福普丁耐药的菌株。未检测到对青霉素类、糖肽类、脂肽类、喹诺酮类和恶唑烷酮类抗生素耐药的菌株。44株屎肠球菌分为38个ST型别,ST94克隆群为优势克隆群,包括13株菌。分离到1株CC17克隆群的屎肠球菌多重耐药菌株和1株ST957的八重耐药菌株。检测到2株携带esp基因的屎肠球菌。结论 自贡市食品和环境中存在多种ST型别的屎肠球菌,且对多种抗生素耐药。应重视肉制品中耐药屎肠球菌对公众健康的潜在威胁。     

In vitro activities of daptomycin,vancomycin, quinupristin- dalfopristin,linezolid, and five other antimicrobials against 307 gram-positive anaerobic and 31 Corynebacterium clinical isolates

The activities of daptomycin, a cyclic lipopeptide, and eight other agents were determined against 338 strains of gram-positive anaerobic bacteria and corynebacteria by the NCCLS reference agar dilution method with supplemented brucella agar for the anaerobes and Mueller-Hinton agar for the corynebacteria. The daptomycin MICs determined on Ca(2+)-supplemented (50 mg/liter) brucella agar plates were one- to fourfold lower than those determined in unsupplemented media. Daptomycin was highly active (MICs, 8 microg/ml were inhibited by <1 microg of daptomycin per ml. Daptomycin MICs were >or=4 microg/ml for most strains of Clostridium clostridioforme, Clostridium paraputrificum, Clostridium tertium, and Clostridium ramosum; the isolates were generally more resistant to other antimicrobials. Daptomycin was two- to fourfold less active against Actinomyces spp. than vancomycin, quinupristin-dalfopristin, or linezolid. Twenty-nine of 31 strains of Corynebacterium spp., including Corynebacterium jeikeium, Corynebacterium amycolatum, and Corynebacterium pseudodiphtheriticum, were inhibited by 相似文献   

婴儿艰难梭菌携带状况及菌株特征研究

目的调查婴儿艰难梭菌的携带状况及菌株特征。方法收集2015年8-11月在该院住院或门诊治疗的1岁内婴儿粪便标本238份,利用免疫层析法快速初筛艰难梭菌,阳性标本再利用CDIF平板进行厌氧培养以获得菌株,利用PCR方法检测艰难梭菌毒素A、B的编码基因tcdA、tcdB和二元毒素编码基因cdtA、cdtB,运用slpA测序分型(slpA ST)方法对菌株进行基因分型。结果 238份粪便标本共分离出50株艰难梭菌,3月、3~6月和6月至1岁三组婴儿艰难梭菌的分离率分别为9.3%,17.6%和27.3%,三组见比较差异有统计学意义(χ~2=6.940,P=0.0310.05)。52.0%(26/50)的菌株为产毒株,其中69.2%(18/26)的菌株产毒模式为tcdA+tcdB+cdtA-cdtB-。50株艰难梭菌可分为11种slpA ST型,产毒株最常见的基因型为slpA ST fr-02和kr-02,而非产毒株则为xr-03。结论 1岁内婴儿艰难梭菌携带率较高,且过半为产毒株,大多同时产毒素A和B。产毒株与非产毒株的基因型存在差别。     

Susceptibility of clostridia from farm animals to 21 antimicrobial agents including some used for growth promotion

The minimal inhibitory concentrations of 21 antimicrobial agents were determined by an agar dilution method against 68 strains of 18 Clostridium species isolated from caeca of pigs, cattle and poultry. Of the therapeutically used antibiotics, chloramphenicol was most active in vitro followed by penicillin G, the lincosamides and tetracycline. Penicillin-resistant Cl. butyricum strains produced a beta-lactamase. Avoparcin, carbadox, monensin, nitrovin and virginiamycin were the most effective of the growth promoting antimicrobial agents. Many clostridial species were naturally resistant to flavomycin and Cl. sporogenes was naturally resistant additionally to bacitracin, tiamulin, the lincosamides and virginiamycin component M. The macrolide, lincosamide and streptogramin resistant strains showed four different patterns of resistance to the antibiotics. One of these resistance patterns was the natural resistance of Cl. sporogenes to the lincosamides and virginiamycin component M which is a streptogramin group A antibiotic.     

DNA probe analysis for the carriage of enterotoxigenic Clostridium perfringens in feces of a Mexican subpopulation

Clostridium perfringens has been implicated as a causative agent of foodborne poisoning, infectious diarrhea (not associated with foods), gas gangrene, and several veterinary diseases. Fecal carriage of enterotoxigenic strains of this bacterium appears to be important in the development of infectious diarrhea and as a source of C. perfringens contamination of foods. In this work, carriage of this bacterium in feces of a Mexican population was analyzed. C. perfringens was found in 126 of the 200 fecal samples obtained from healthy individuals from northern Mexico. The samples had an average of 7.4 x 10(3) spores per gram, with the elderly population showing the highest levels. Dot blot analyses using a dig-labeled probe specific for the enterotoxin gene showed that 7% of the samples had isolates with toxigenic potential.     

引起我国首例婴儿肉毒中毒丁酸梭菌全基因组序列分析

  目的  对我国首次分离自婴儿肉毒中毒病例粪便样品的1株产E型肉毒毒素的丁酸梭菌进行全基因组测序，解析菌株产毒的遗传学特性。  方法  对从婴儿肉毒中毒病例粪便样品中分离的产E型肉毒毒素丁酸梭菌分离株TJ-S提取基因组DNA，利用Pacific Biosciences RSⅡ 平台对菌株进行全基因组测序，并进行序列分析。  结果  TJ-S基因组由一个染色体和一个质粒组成，大小分别为3 949 987 bp和747 151 bp。 GC含量分别为28.8%和28.2%。 染色体上携带产肉毒毒素的bont/e基因，该基因位于典型orfX基因簇内，且在基因簇上游存在3个转座酶编码基因。 遗传进化分析发现，菌株TJ-S在亲缘关系上与引起英国婴儿肉毒中毒的2株产E型肉毒毒素的丁酸梭菌分离株最为接近。  结论  丁酸梭菌携带的产E型肉毒毒素基因位于稳定的orfX基因簇内，可引起人类肉毒中毒。 本报道是我国第一次对产E型肉毒毒素丁酸梭菌进行全基因组学分析。     

2019年新疆喀什地区健康人群脑膜炎奈瑟菌携带情况调查研究

  目的   了解新疆喀什地区健康人群脑膜炎奈瑟菌（Neisseria meningitidis,Nm）的携带情况。   方法   在喀什地区4个县（市）,按年龄分组采取整群随机抽样方式采集703份健康人咽拭子,通过细菌培养和实时荧光定量PCR（real-time PCR）方法检测Nm带菌率,采用血清玻片凝集法和real-time PCR方法鉴定菌株的血清群,结合流行病学资料进行分析。   结果   本研究共分离Nm菌株91株,健康人群带菌率为12.94%。 其中B、C、W、Y、E群菌株分别占32.97%（30/91）、13.18%（12/91）、16.48%（15/91）、12.09%（11/91）、1.10%（1/91）,血清不可分群（nongroupable,NG）菌株占24.17%（22/91）。 各年龄组人群Nm带菌率差异有统计学意义（χ2=45.725,P<0.05）,0～ 、3～ 、5～、7～、15～、≥20岁年龄组的带菌率分别为5.88%（6/102）、4.90%（5/102）、9.18%（9/98）、14.20%（23/162）、27.27%（27/99）、15.00%（21/140）。 real-time PCR方法检测Nm阳性标本185份,培养和real-time PCR两种方法检测的带菌率差异有统计学意义（χ2=153.589,P<0.05）。   结论   喀什地区健康人群Nm带菌率处于较高水平,15～岁年龄组是高携带人群,健康人群分离菌株血清群复杂。 real-time PCR方法可以作为培养的辅助方法,提高检测阳性率。     

一起产志贺毒素大肠埃希菌O146∶H10引起的食物中毒的溯源分析

  目的  对2019年广西壮族自治区桂林市发生的一起校内食物中毒进行病原检测及溯源分析。  方法  对该起食物中毒事件开展流行病学调查,采集腹泻患者粪便、餐厨工作人员肛拭子、留样食品、厨房环境及餐厨用具涂抹样本,按常规方法进行病原分离和鉴定,对分离的病原菌进行毒力基因检测及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型分析。  结果  本次食物中毒事件共造成87人出现腹泻或其他症状。从1例腹泻患者粪便及1位餐厨工作人员肛拭子标本中分离到产志贺毒素大肠埃希菌,血清型均为O146∶H10,志贺毒素基因均为stx_1c亚型,且2株分离株具有相同的PFGE带型。  结论  这起食物中毒是由产志贺毒素大肠埃希菌O146∶H10引起,为国内首次报道由非O157产志贺毒素大肠埃希菌引起的食物中毒事件。