蛋白质组学及其在骨科疾病研究中的应用与展望

蛋白质组学是后基因组时代的新研究领域,主要研究细胞、组织或器官内蛋白质的表达及功能,通过检测蛋白质来分析生命中重要的病理生理变化.利用蛋白质组学方法能发现与疾病诊断、治疗、判断预后有关的低丰度、小分子量蛋白质和多肽的信息,进而在基础医学和临床医学研究中取得重要突破.蛋白质组学在骨科疾病的研究中已取得很大进展,显示了广阔的发展前景.本文就蛋白质组学技术的发展、研究现状及其在骨科学中的应用与展望作一综述.     

蛋白质组学在药理毒理模型和药物作用机制研究中的应用

随着后基因组时代的到来,蛋白质组的研究手段渗入生命科学及医药卫生的各个学科研究领域.蛋白质组(proteome)是指细胞或组织基因组所表达的全部蛋白质.同一基因组在不同细胞、不同组织中的表达情况各不相同,即使是同一细胞,在不同的发育阶段、不同的生理条件甚至不同的环境影响下,其蛋白质的存在状态也不尽相同.     

蛋白质组学在肿瘤研究中的应用

1蛋白质组学的概念 随着人类基因组计划的实施和完成，科学家们提出了后基因组计划的概念，并将研究要点转移到功能基因组学方面。而生物功能的主要体现物质是蛋白质。1994年，澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和wiuiams首先提出蛋白质组（proteome）的概念，并将其定义“基因组所表达的全部蛋白质”。目前，对蛋白质组的确切定义是：一种细胞、组织或完整的生物体所拥有的全套蛋白质。这是一动态的概念，它不仅在一个机体的不同组织和细胞中不同，而且在同一机体的不同发育阶段、不同生理状态及不同外界环境下也有不同。     

蛋白质芯片技术在蛋白质组学中的应用

随着人类基因组计划的基本完成，以功能基因组学和蛋白质组学为主要研究内容的后基因组时代来临。由于同一基因组在不同细胞，不同组织中的表达情况各不相同，即使是同一细胞在不同的发育阶段，不同的生理条件，甚至不同的环境影响下，其蛋白质的存在状况也不尽相同。基因只是遗传物质的载体，蛋白质才是生理功能的执行者。基     

抗体芯片技术在高血压病痰瘀互结研究中的应用探讨

人类生命科学进入了后基因组时代,对生命的复杂活动进行全面和深入的认识,必然要在一定的生理或病理条件下动态的研究蛋白质变化。蛋白组学是功能基冈组学研究的核心。蛋白组学是指建立在高通量筛选分析技术基础上的方法学,     

未知蛋白的研究策略

蛋白质是最主要的生命活动的载体,更是功能执行者。其表达模式和功能的研究成为后基因组时代研究的重要内容。可以利用分子生物学、生物化学及生物信息学等方法对研究的未知蛋白质分子进行测序,鉴定其功能以及预测分析其结构等可以阐明生命活动在生理或病理条件下的变化机制,进一步有利于研究人类疾病的发病机制。本文阐述如何利用分子生物学、生物化学、生物信息学等技术对未知蛋白质进行鉴定及功能分析。     

我国科学家获得肺癌血清标志蛋白分子

高等学校蛋白质组学研究院正式宣布：我国首次利用蛋白质芯片技术筛选出肺癌的15个血清标志蛋白分子。与基因的知名度不一样，蛋白质对公众来说还很陌生。如果说基因发现人体密码，那么具体执行各种功能的任务则落到蛋白质的头上。在完成人体基因组测序后，科技将从基因组时代过渡到后基因组时代，蛋白质将取代基因成为主角。与基因组相比，人类蛋白质数量更大，相互作用更复杂，并直接造成细胞生命活动的基础。任何生理、病理变化或药物影响的结果，都与蛋白质成分和数量的改变密切相关。从理论上说，通过对蛋白质动态的分析，可以探查出疾…     

蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析

后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究.关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础.目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等.文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法.     

蛋白质相互作用及互作网络的生物信息学分析

后基因组时代的最终目标是认识真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物学功能,即蛋白质组学研究。关键的挑战之一就是对蛋白质相互作用网络的研究,将有助于从系统角度加深对细胞结构和功能的认识,并且为新药靶位点的发现和药物设计提供理论基础。目前,用生物信息学的手段来研究蛋白质相互作用网络显示出巨大的优势,主要包括蛋白质相互作用网络的绘制与显示、网络的拓扑结构分析、网络结构模块的研究及网络的比对等。文章试图从生物信息学的角度认识蛋白质相互作用,并总结蛋白质相互作用网络的生物信息学分析方法。     

KIAA基因家族的研究进展

人类基因组计划实施和完成过程中,不断地发现KIAA基因,这是一类新识别的大片段cDNA,可编码巨大蛋白质,而对巨大蛋白质的功能研究已经成为后基因组计划的一大主题.该文就KIAA基因家族数据库的建立、序列特征、功能分类、研究新进展作一综述.     

基于原子力显微镜的单分子探测技术及其在医学研究中的应用

随着生命科学和医学研究进入后基因组时代,越来越多的研究人员开始关注如何直接探测生物分子的结构和功能.基因组和蛋白质组的研究方法为科研工作者提供了有关蛋白质序列、表达方式和相互作用的大量数据.尽管这些信息很重要,但它们不足以使科研工作者了解复杂的生命过程.要阐明生命过程,包括各种病理过程的分子机制,还需要了解细胞中各种生物分子的时空分布、结构和相互作用的动态过程等问题.     

KIAA基因家族的研究进展

人类基因组计划实施和完成过程中，不断地发现KIAA基因，这是一类新识别的大片段cDNA，可编码巨大蛋白质，而对巨大蛋白质的功能研究已经成为后基因组计划的一大主题。该文就KIAA基因家族数据库的建立、序列特征、功能分类、研究新进展作一综述。     

差异蛋白组学分析与鉴定方法的研究进展

2001年2月,参与人类基因组计划的各国科学家宣布人类基因组图谱基本绘制完成,蛋白质组学理论及技术的迅速发展及完善,被认为是后基因组研究中的最主要部分。差异蛋白质组学是结构蛋白质组学研究的一个分支,通过获得细胞或生物体在蛋白质组上的差别或变化的足够信息,就能够指证它们所处的状态,以及它们的状态是正常或是异常,     

质谱技术在蛋白质组学中的应用

蛋白质组学是后基因组时代的一个新领域,它通过在蛋白质水平上对细胞或机体基因表达的整体蛋白质的定量研究,来揭示生命的过程和解释基因表达控制的机理[1].蛋白质组学分为表达蛋白质组学(Expression Proteomics)和细胞图谱蛋白质组学(Cell Map Proteomics),前者指细胞和组织表达的蛋白质的定量图谱,它依赖二维凝胶电泳图谱和图像分析,它能在整体蛋白质水平上研究细胞的通路,以及疾病、药物和其它生物刺激所引起的紊乱,因此它可能发现疾病标志和阐明生物通路;后者是指通过纯化细胞器或蛋白质复合物,用质谱鉴定蛋白质组分,确定蛋白质和蛋白质相互作用的亚细胞位置[2].90年代以来随着人类基因组计划的实施,引发了生物信息学(Bioinformatics)的发展,使蛋白质分析发生了革命性的变化.现在将高分辨2-维电泳、高灵敏度的生物质谱和快速增长的蛋白质和DNA数据库三者结合起来,为高通量的蛋白质组学(High throughout Proteomics)铺平了道路[3].这里主要介绍质谱技术在蛋白质组学中的应用.     

技术进步是后基因组时代生命科学发展的动力——“第三届国际后基组生命科学技术皋术论坛”（3＇IFPT）会议综述

人类基因组计划已经结束，生命科学正处在以研究基因及其表达产物蛋白质结构与功能为核心内容的“后基因组时代”。结构基因组、蛋白质组以及药物基因组的研究已成为新的热点，并开始了新一轮大规模的国际竞争与合作。为加强国际生命科学领域专家学者的交流与合作，促进后基因组生命科学技术的发展，由江苏省科学技术协会主办，东南大学、南京大学、日本遗传工程研究会等12个单位协办的“第三届国际后基因组生命科学技术学术论坛”（3’IPPT）于2005年4月25-26日在桂林成功举行。     

钠-氢交换蛋白的研究进展

钠-氢交换蛋白质是维持细胞内环境的主要细胞膜蛋白质之一,其主要功能是调节细胞内pH值,使之保持在生理范围之内。细胞内pH值的变化,直接或间接的影响细胞的生长、分裂、增殖、分化和死亡,以及细胞的移动和肿瘤细胞的转移。     

代谢组学-生命科学研究的新平台

人类基因组计划的基本完成表明后基因组时代的到来,生命科学的主要任务是基因组功能分析。有人估计认识其功能比认识其结构任务更艰巨,花时间更长（50年或更长）。研究的热点转移到基因的功能和几个“组学”研究：以基因、mRNA、蛋白质、代谢产物为研究对象的基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学。进一步提出系统生物学概念,     

功能蛋白质组学研究

1990年国际上开始实施人类基因组计划，2001年2月，完成人类基因组图谱，标志着后基因组时代已经到来。新时代的最终目的，是阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达模式和生命功能。目前，我们更为注重那些可能涉及到特定功能机理的蛋白质群体，即功能蛋白质组的研究，主要的研究手段为双向凝胶电泳、Edman降解法测N端序列、质     

蛋白质相互作用网络在蛋白质功能预测中的应用

人类基因组计划（human genomic project，HGP）大规模测序工作的完成标志生命科学的研究将进入后基因组时代（post—genomic era）。由于蛋白质是生理功能的执行者以及生命现象的体现者，对蛋白质功能的研究将成为后基因时代研究的核心内容之一。伴随着生物信息学的迅猛发展以及基因表达谱和蛋白质相互作用数据的激增，利用计算方法对蛋白质功能进行预测和注释成为越来越有效的一种手段。目前应用较为广泛的蛋白质功能预测主要基于以下几方面：同源序列、基因组对比、系统进化特征谱、基因表达谱数据以及蛋白质相互作用网络等。     

蛋白质天然构象预测的研究进展

继人类基因组计划完成后,如何弄清相应的基因序列的功能及其之间的关系,即比较彻底地解开生命的奥秘成为后基因组计划的主要任务。基因的功能最终主要通过蛋白质来完成,因此,如何根据已知的氨基酸序列来预测相应的蛋白质天然构象成为后基因组计划中最重要的组成部分之一,这为比较彻底界定其功能奠定分子生物学基础。本文从以下几个方面进行了详细地介绍:(1)组成蛋白质天然构象预测方法的基本元素即序列比对方法、构象空间搜索方法及有关的蛋白质数据库;(2)结构预测方法的评估与分类;(3)描述预测性能较好及有比较发展前景的预测方法;(4)天然构象预测的前景等。