血液放置时间和RNA反复冻融对RNA质量的影响

正在临床和科研工作中,血液和组织是比较容易获取的生物标本,特别适用于临床和实验室检测及生物样本库收集保存。DNA、RNA和蛋白质是三种重要的生物大分子,其中RNA在人类多种生理和病理过程中发挥着举足轻重的作用。RNA通常是从组织、全血和培养的细胞中提取获得~([1]),高质量RNA可满足RT-PCR、Northern blot、基因表达谱、转录组测序和阵列分析等生物学实验的研究需求~([2-3])。由于     

生物样本库临床及随访信息的采集和管理

正样本库的建设在疾病的研究中起着重要的作用~([1-2])。人们很早就认识到患者的临床样本是研究人体疾病的重要材料。随着对疾病的认识加深,研究人员发现,样本和样本捐赠者疾病诊治和转归的信息在研究中也起到了至关重要的作用。例如在疾病发生发展分子机制的研究中,首先通过对病变组织的DNA、RNA和蛋白等生物大分子进行分析,获得疾病的基因/蛋白表型;而后通过患者的诊治及转归信     

生物样本库的临床信息整合探讨

<正>转化医学是近年来国际医学健康领域日渐崛起的一门新兴学科~([1]),倡导以患者为中心,强调基础研究人员与临床医生的密切合作,以提高医疗总体水平。来源于医院患者的生物样本库是开展转化医学研究的重要基础~([2]),其中生物样本的临床信息作为临床生物样本库的重要组成部分,更是为转化医学研究提供主要支撑。然而临床生物样本数据量庞大且非结构化,分布较为分散,如何从海量的临床数据中提取出可用信息,并与生物样本本身信息进行关联,形成临床数     

自动化在生物样本库中的应用现状

<正>为了将基础医学研究的成果充分应用到临床疾病诊治中,近年来,转化医学和精准医学的概念逐渐兴起,作为有望成为跨越这个鸿沟的桥梁,生物样本库如雨后春笋般地出现在全国各地,科研工作者也把目光投向生物样本库的标准化建设以及随之而来的价值发掘上~([1])。然而,生物样本库普遍存在样本数量少、样本数据不完整、质量不达标等现象,严重地影响了相关研究结果的可靠性~([2-3])。因此,高效地获     

中山大学附属第五医院生物样本库的建立与完善

<正>生物样本库即标准化收集、处理、保存和使用各种离体生物样本和表型信息,为生物医学研究提供科研材料的资源库~([1])。生物样本库涵盖了丰富的疾病临床信息与样本生物学信息,为疾病的研究、遗传和健康事业发展提供了战略性资源,是支撑转化医学和精准医疗实施的前提,更是研究型医院与学科建设的基石。欧美国家非常重视生物样本库的建设,1999年英国建     

华西生物样本库低温储存系统安全管理

正转化医学和精准医学的快速发展带来了大量的生物样本资源需求,也促进了生物样本库的高速发展~([1-2])。高质量的生物样本是基础和临床研究的重要来源,也是实现转化医学与精准医学的物质基础~([3])。生物样本库建设及管理过程中的规范化、标准化日益受到重视,其中,安全管理是样本库     

生物样本库的现状、发展与思考

正生物样本库是生命科学和生物技术基础设施的重要组成部分,对经济增长和医疗保健能产生重大影响。根据国际经济合作与发展组织(OECD)的定义,生物样本库指的是"人口中生物材料以及存储在相关组织中的数据和信息的集合"~([1])。生物样本库是生物样本的存储场所,生物样本包括但不     

外泌体在缺血性脑卒中的研究进展

正1外泌体概述外泌体是直径在30~100 nm的胞外囊泡,通过细胞被释放到细胞外液中~([1])。它们存在于生物体液中,诸如血液和脑脊液。外泌体携带有DNA、RNA、蛋白质和脂质等。由于外泌体的微泡结构为其内在的小分子提供了一个安全稳定的环境,同时这些信号小分子利用循环系统在胞间信号交换发挥重要作用,这让外泌体表现出一个成熟、稳定的信号传输系统~([2])。研究发现,外泌体中的m RNA和micro RNA     

白血病细胞源外泌体的作用研究进展

<正>白血病(leukemia)是一类造血干/祖细胞恶性克隆性疾病。外泌体是活细胞分泌到胞外的一种纳米级的微囊泡,是细胞间对话的信息和物质载体~([1])。外泌体携带亲本细胞来源的蛋白质、核酸(mRNA、microRNA和DNA等)及脂质等生物信息分子,可近距离和/或经体液流动远距离、特异性调控靶细胞的生理和病理活动~([2-3])。靶细胞摄取外泌体的途径主要有网格蛋白介导的内吞途径、小窝蛋白依赖型内     

儿童专科医院样本库的生物样本特征分析及策略建议

正生物样本库为转化研究提供重要的研究资源~([1]),其通过与疾病特征和研究目的相关联的顶层设计、系统规范地收集健康个体来源的和疾病个体来源的血液、组织、各种体液等样本,经过与样本特性相适宜的处理后再将样本冷冻保存~([2])。生物样本库的规范建设和科学管理至关重要,对各种样本分析前变量开展质控研究以建立科学的样本处理和存     

外泌体定量技术研究

正在上世纪80年代Trams等~([1])最早于培养的绵羊红细胞上清液中发现外泌体(exosomes,ES),并首先提出了ES概念。ES是由细胞主动分泌的直径在40~100 nm的囊泡结构~([2]),由磷脂双分子层包裹了细胞质组成,它包含亲代细胞的蛋白质、DNA、RNA、小分子等。近年来,研究人员陆续观察了不同类型细胞中ES的形成过程,并且能够从血浆、尿     

生物样本库中血液样本microRNA和DNA的检测方法学探讨

目的探讨建立南京医科大学第一附属医院生物样本库中血液生物样本microRNA的检测方法以及血凝块中DNA的鉴定方法。方法随机选取本院生物样本库自2012-2014年存储的胃癌、肝癌血浆标本进行microRNA的提取,后经Q-PCR验证miR-21和miR-387的表达情况以及将对应的血凝块样本进行全血样本DNA的提取,通过全自动核酸分析仪鉴定提取的DNA的完整性。结果 Q-PCR结果表明,冻存血浆在保存了1、2、3年后都能检测到相关的microRNA的表达,同时血凝块中提取的DNA,经全自动核酸分析仪鉴定,DNA完整性也较好。结论该方法能够初步验证我院生物样本库中冻存的血样标本中的RNA和DNA的保存质量,血样质量基本能满足后续科研实验的需求。本研究中的血样标本质量鉴定的方法切实、可行,能较准确地反映生物样本库中血样本的质量,为今后我院组织样本的质量控制体系的建立奠定基础。     

人脑组织库样本100例质量及影响因素分析

目的检测人脑组织库中保存的脑组织蛋白质、DNA及RNA质量,分析影响其质量的主要因素。方法选取中国医学科学院北京协和医学院人脑组织库保存的100例全脑组织样本,提取蛋白质、DNA及RNA,测定其浓度及吸光度,电泳检测完整性,用Western blotting及Rael-time PCR分别检测。根据不同年龄、死亡原因、取材延迟时间以及样本保存时间进行分组,统计学分析影响脑组织质量的因素。结果人脑组织库中大部分脑组织的DNA、RNA和蛋白质质量保存完好,不同年龄、死亡原因对其质量无显著影响。取材延迟时间超过24h者,其蛋白质浓度及RNA浓度及质量有显著下降。样本保存时间对蛋白质及DNA质量无显著影响,但保存1年以上可能对RNA浓度有影响。结论进行RNA相关分析的人脑组织标本取材延迟时间最好控制在8 h之内,-80℃环境下保存1年之内为佳。而DNA和蛋白质相关分析的时间可以适当延长。     

长链非编码RNA MEG3 调控作用相关的信号通路研究进展

正随着基因组学的不断发展,越来越多的研究表明lncRNA表达水平的改变与疾病的发展和状态有明显的联系,尤其在肿瘤中发挥举足轻重的作用~([1])。LncRNA是长度大于200个核苷酸的转录RNA,保守性低,在体内通过控制蛋白质的合成、RNA的成熟和转运以及改变染色体结构从而使转录基因沉默等机制发挥调控作用~([2])。MEG3是一类重要的lncRNA,具有肿瘤抑制作用~([3]),有望成为肿瘤诊断的生物标志物和肿瘤治疗的靶点,以下就MEG3在肿瘤及多种相关疾病关系密切的信号通路的作用及其机制作一综述。     

全自动核酸提取仪与手动提取组织DNA的效率比较

正近年,随着众多与疾病诊断、预后及治疗相关的分子标志物的出现,以石蜡组织DNA为材料进行分子水平的基因检测及筛查已成为临床诊断及相关研究的常规手段。对于各种基因分析而言,重要的是能够获得足够纯度和数量的DNA~([1])。DNA提取是分子生物学研究的一项基础技术,其提取的质量好坏及数量的多少直接影响到分子生物学实验的开展~([2])。目前病理科所使用的DNA大部分为人工提取,     

FFPE组织提取DNA样本质量评价的多中心调研

正中性福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixed paraffin embedded,FFPE)一直是病理科处理组织样本的标准程序,也是病理科形态学诊断的基石~([1])。随着医学的发展,靶向药物在临床治疗中被广泛地使用,FFPE的组织块还必须用于药物靶点的基因诊断,特别是体细胞突变相关基因诊断,为患者提供基因的诊断结果以指导临床诊疗~([2-3])。然而,由于整     

西红花苷促进小鼠脾淋巴细胞增殖

正西红花苷(crocin)是从栀子和西红花2种传统中药材中提取的水溶性类胡萝卜素,是这2种中药材的主要药理活性成份。它水溶性好,容易被机体吸收,生物利用度高,西红花苷具有广泛的药理活性,是一种高效的抗氧化剂~([1])、此外,它还具有保护心血管~([2])、抗炎~([3-4])、神经保护~([5-7])及机体免疫力的作用~([8]),同时研究还发现西红花苷是一种天然肿瘤抑制剂,可以诱导多种肿瘤细胞发生凋亡,发挥抗肿瘤     

黄芪对间充质干细胞增殖及分化的影响*

<正>黄芪最早记载于《神农本草经》~([1]),具有脱毒生肌、补中益气、利水消肿等疗效~([2])。已知黄芪的根可提取三种具有药效的活性成分为大分子多糖、小分子皂苷和异黄酮~([1])。现代药理研究表明,黄芪的活性成分具有抗氧化、抗疲劳、抗衰老、增强免疫力、抗辐射、抗肿瘤,调血糖等作用,极具临床使用价值~([2-3])。间充质干细胞(mesenchymal stem cells, MSCs)以其免疫原性相对较低、来源便利、易培养而备受组织工程领域的青睐,广泛用于神经系统、心血管系统疾病、骨科疾病、肿瘤等疾病的细胞治疗研究中[1]。大量的研究证明黄芪对MSCs的生物学特性有显著的促进作用。本文就黄芪对MSCs增殖及分化的影响综述如下。     

TP73-AS1在肿瘤中的表达及调控作用

<正>随着高通量测序技术的发展,成千上万种长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)进入人们的视野。lncRNA是一类长度超过200个核苷酸并缺少开放阅读框的不具备蛋白质编码功能的RNA~([1-2])。研究发现lncRNA参与诸多生物学进程的关键步骤,包括染色质重塑、基因转录、转录后调节和蛋白质翻译等~([3-5])。LncRNA机制的不断被阐明,也为肿瘤的研究提供了新的可能。LncRNA在多种肿瘤的增殖、迁移侵袭和抗凋亡     

生物样本库安全管理体系的建立与完善

正精准医学时代的到来促进了生物样本库的迅速发展~([1]),我国生物样本库的数量已经呈现逐步上升趋势。然而,生物样本库建设过程中安全管理体系的建立需要引起生物样本库建设者的高度重视。生物样本库安全管理体系需要考虑生物安全和生物安保两个层面,其中生物安全(biosafety)是