人EGFL7基因短发夹结构RNA慢病毒载体的构建及鉴定

目的构建人类表皮生长因子域7（EGFL7）基因RNA干扰（RNAi）慢病毒载体。方法将靶向EGFL7基因的短发夹结构RNA（shRNA）表达序列连接到包含U6启动子及绿色荧光蛋白（GFP）报告基因的慢病毒载体pGCL-GFP中,获得重组质粒,命名为pGCL-GFP-vshEGFL7,经多聚酶链反应（PCR）和测序鉴定后,与慢病毒包装质粒pHelper 1.0及pHelper 2.0通过lipofectamine 2000共转染至包装细胞293T,包装产生病毒液,测定其滴度。结果PCR扩增和测序结果证实EGFL7shRNA核苷酸链序列插入正确,包装慢病毒产生病毒悬液的滴度为4.8×107TU/ml。结论成功构建人EGFL7基因shRNA慢病毒载体。     

miR-221基因干扰慢病毒载体的构建及其有效靶序列的筛选与表达检测

目的 构建携带人miR-221 基因的miRNA 干扰慢病毒载体并寻找其有效靶序列,为胶质瘤的研究提供一种新的方法.方法 合成含干扰序列的双链DNA oligo 直接连入酶切后的RNA 干扰载体上.将产物转入细菌感受态细胞,对长出的克隆进行PCR 鉴定,阳性克隆即为目的 基因RNA 干扰慢病毒载体质粒.再将目的 基因与目的 载体分别进行双酶切,纯化酶切产物后进行定向连接,其产物转入细菌感受态细胞,再对PCR 鉴定阳性的克隆进行测序和分析比对,比对正确即为融合蛋白过表达质粒载体,然后将两种质粒共转染入293T 细胞,用western bolt 法检测其有效敲减靶序列.结果 重组质粒经测序鉴定证明各转录模板完整、正确插入到相应质粒中,共转染后发现编号为PscSI576 的靶点干扰效果最好.结论 本实验成功构建了人miR-221 基因的RNA 干扰慢病毒载体,并找到了有效的干扰靶序列.     

大鼠硫酸软骨素蛋白多糖基因shRNA慢病毒载体的构建及干扰效率鉴定*☆

背景：最近研究发现硫酸软骨素蛋白多糖(NG2)在中枢神经系统中参与多种生理病理功能,慢病毒载体可感染分裂期细胞或非分裂期的细胞,并能在细胞内高效稳定的表达。 目的：构建大鼠源性NG2基因shRNA慢病毒载体并检测其干扰效率。 方法：选择大鼠NG2基因RNA干扰的靶序列,合成Oligo DNA,退火形成双链DNA,与Hpa Ⅰ和Xho Ⅰ双酶切后的pFU-GW-RNAi载体连接产生pLV-NG2-RNAi,PCR筛选阳性克隆,测序鉴定。将重组载体与pHelper 1.0载体、pHelper 2.0载体通过lipofectamineTM 2000共转染293T细胞包装产生慢病毒LV-NG2-RNAi,收集病毒上清并浓缩。采用孔稀释滴度测定法计算病毒滴度。将LV-NG2-RNAi慢病毒感染C6细胞,于感染后96 h提取细胞总蛋白,采用Western blot检测NG2的表达。 结果与结论：经PCR和测序证实构建片段大小及DNA序列与目的序列一致,实验成功构建大鼠NG2基因shRNA慢病毒载体LV-NG2-RNAi。包装浓缩慢病毒的滴度为8×1011 TU/L。Western blot检测显示在感染复数为50时,感染LV-NG2-RNAi慢病毒的C6细胞较感染对照慢病毒及未感染细胞NG2的表达明显降低,干扰效率可达100%(P < 0.05)。结果证实了实验成功构建大鼠NG2基因shRNA慢病毒载体,且该载体能够在细胞水平有效沉默靶基因。     

小鼠α1，3-半乳糖基转移酶RNA干扰重组慢病毒的构建与鉴定

背景：研究表明,通过抑制α1,3-半乳糖基转移酶的生成而减少甚至避免供体Galα(1,3)Gal的生成,是渡过器官移植后超急性排斥反应的一条切实可行的方法。 目的：构建小鼠α1,3-半乳糖基转移酶基因的RNA干扰慢病毒载体,有效沉默小鼠血管内皮细胞的α1,3-半乳糖基转移酶基因表达,以期为有效控制异种移植超急性排斥反应提供稳定的转染细胞载体。 设计、时间及地点：单一样本观察,于2006-07/2007-05在天津医科大学总医院普外研究所完成。 材料：慢病毒载体系统(四质粒)购自Tronolab公司,包装细胞293T细胞株购自中科院上海细胞所。 方法：在线软件设计小鼠α1,3-半乳糖基转移酶基因发卡小分子干扰RNA片段。合成的双链DNA片段并将其连接到Tele-sh003/U6.2载体的黏性末端,产生重组质粒Tele-sh003/U6.2-shRNA/α1,3-半乳糖基转移酶。对干扰质粒做测序分析。用磷酸钙法将得到的阳性重组子与慢病毒包装质粒共转化293T细胞,72 h后收集含病毒上清液,超速离心后得到重组慢病毒。用实时定量聚合酶链反应测定病毒滴度。 主要观察指标：干扰质粒的测序分析,慢病毒颗粒的包装和滴度测定。 结果：小鼠α1,3-半乳糖基转移酶基因小发卡RNA片段被成功克隆进Tele-sh003质粒中,测序结果显示干扰质粒小干扰RNA编码序列与设计片段的序列完全一致。所得慢病毒亦为阳性克隆,经定量聚合酶链反应测定病毒滴度为2×108 Tu/mL。 结论：成功构建出小鼠α1,3-半乳糖基转移酶基因的小发卡RNA慢病毒RNA干扰表达载体,为进一步控制异种移植超急性排斥反应提供了稳定的转染细胞的载体。     

应用Cyclin D1和bcl-2为靶标的siRNA慢病毒载体构建和鉴定

背景：近年来,与骨肉瘤耐药相关的基因研究大多局限于单个基因或单个通路。而进行细胞凋亡和细胞周期调控双通道同时阻断有可能逆转药物耐受机制。 目的：构建bcl-2和cyclin D1特异性siRNA慢病毒载体,拟将其转入骨肉瘤耐药细胞株,探讨对骨肉瘤耐药性的逆转作用。 方法：采用限制性内切酶酶切、T4DNA连接酶连接等方法,将bcl-2和cyclin D1基因分别插入慢病毒载体pSIH1-H1-copGFP shRNA Vector中,构建bcl-2和cyclin D1与pSIH1-H1-copGFP共表达的慢病毒载体(pSIH1-H1-copGFP- bcl-2-siRNA和pSIH1-H1-copGFP-cyclinD1-siRNA)。构建成功后的慢病毒质粒系统和pPACK包装质粒共转染293T细胞,过滤,浓缩病毒,利用荧光蛋白作为报告基因,对病毒滴度和感染效率进行检测。 结果与结论：4对bcl-2和cyclin D1特异性siRNA与双酶切慢病毒载体pSIH1- H1-copGFP shRNA Vector连接成功。共转染293T细胞包装病毒并浓缩后滴度达1.14×104 ifu/μL,适合感染目的细胞。实时荧光定量PCR检测结果显示对bcl-2和cyclinD1基因的干扰效率最高分别达88%和87%。证实将siRNA技术应用于bcl-2和cyclin D1,能够构建出有效的bcl-2和cyclin D1特异性siRNA慢病毒载体。     

小鼠TNF-α基因RNAi慢病毒载体的构建及体外研究

目的为探讨TNF-α在C型Niemann-Pick病（NPC）神经变性中的作用,构建携带小鼠TNF-α-siRNA的慢病毒载体并进行体外研究。方法设计3个TNF-α-siRNA序列和1个无关对照序列,克隆到酶切的pSIH1-H1-copGFP siRNA载体;重组质粒转染293T细胞,通过实时定量PCR检测筛选出干扰效果最佳的TNF-α-siRNA;筛选出的pSIH-siRNA、pSIH-negative分别与慢病毒包装质粒共转染293T细胞生成慢病毒;慢病毒感染BV-2细胞和星形胶质细胞,采用RT-PCR以及Elisa检测TNF-α-siRNA的沉默效果。结果成功构建携带TNF-α-siRNA的慢病毒载体,滴度达2×10^8ifu／L;慢病毒感染BV-2和星形胶质细胞,表达GFP且可下调TNF-α表达。结论TNF-α-siRNA能明显下调TNF-α的表达,为研究和治疗神经变性疾病以及TNF-α相关疾病提供了有力的工具。     

沉默Toll样受体4基因表达的RNAi慢病毒载体的构建******

背景：Toll样受体4 (toll-like receptor4,TLR4)是介导内毒素/脂多糖应答的主要受体,在由内毒素诱导的炎性反应的信号通路中发挥着重要作用。 目的：构建人TLR4基因的RNA干扰慢病毒载体,并观察其对人脐静脉内皮细胞TLR4在蛋白水平的沉默效应。 方法：利用Invitrogen在线软件设计人TLR4基因shRNA序列,合成、退火形成双链寡核苷酸后克隆到线性载体pENTRTM/H1/TO的黏性末端,并进行DNA测序。得到的阳性重组子再与慢病毒载体进行重组反应,从而获得干扰TLR4基因真核表达的慢病毒载体。在脂质体的介导下将慢病毒包装辅助复合体和TLR4基因的真核表达慢病毒载体导入293FT细胞包装病毒,测定病毒滴度,感染人脐静脉内皮细胞,检验其干扰TLR4基因表达的有效性。 结果与结论：实验成功构建TLR4基因真核表达慢病毒干扰载体并获得相应的慢病毒,病毒滴度为8.7×106 U/mL。免疫印迹杂交结果表明,所获得的慢病毒感染人脐静脉内皮细胞TLR4基因在蛋白水平的表达显著降低。实验成功构建了人TLR4基因慢病毒RNA干扰表达载体,并验证了其在人脐静脉内皮细胞上的有效性。     

人神经生长因子β亚基慢病毒载体的构建*

背景：糖尿病神经源性膀胱的发病与神经生长因子缺乏有关,β亚基是构成神经生长因子(NGF)3种亚基中惟一具有生物活性的亚基,慢病毒载体是基因治疗的理想载体。 目的：构建过表达人神经生长因子β亚基(β-NGF)基因的慢病毒载体。 方法：通过目的基因的获得,载体质粒双酶切,载体质粒与目的基因的连接将人β-NGF基因克隆到慢病毒载体质粒pGC-FU中,构建重组慢病毒载体质粒pGC-FU-β-NGF。观察人β-NGF基因的克隆情况,并进行重组慢病毒载体质粒pGC-FU-β-NGF的PCR鉴定和测序。 结果与结论：构建的重组慢病毒载体质粒pGC-FU-β-NGF进行PCR实际获得的产物与预计PCR产物大小一致,即初步判断为构建成功的重组质粒。所获得的β-NGF基因经测序后与GenBank报道序列完全一致。说明pGC-FU-β-NGF中携带有正确的β-NGF基因。结果证实,实验成功构建了携带人β-NGF基因的重组慢病毒载体质粒。     

Nesprin基因RNAi慢病毒载体的构建*

背景：Nesprin蛋白缺失将影响细胞骨架组织和动态平衡,引起细胞骨架刚性丧失或导致细胞过早成熟老化,其对间充质干细胞的作用如何？ 目的：构建Nesprin蛋白siRNA慢病毒载体,并转染骨髓间充质干细胞。 方法：针对Nesprin靶基因序列设计并合成4对miRNA oligo,将4种miRNA干扰质粒转入大鼠血管平滑肌细胞,筛选最有效干扰序列;将最佳干扰序列和pDONR221载体进行重组反应,获得含干扰序列的入门载体,再将入门载体和慢病毒表达目的载体pLenti6/V5-DEST进行重组反应,获得含干扰序列的慢病毒表达载体,转染包装细胞293T细胞,包装慢病毒,以293T细胞GFP蛋白水平测定病毒滴度。慢病毒转染大鼠骨髓间充质干细胞。 结果与结论：测序证实合成的4对miRNA oligo正确,RT-PCR和western-blot筛选出最佳干扰miRNA质粒为SR-3,成功构建了Nesprin siRNA的慢病毒载体LV-siNesprin。包装慢病毒,浓缩病毒悬液的活性滴度为106 TU/mL。慢病毒成功了转染骨髓间充质干细胞细胞。     

Vasculostatin慢病毒表达载体的构建

目的构建Vasculostatin慢病毒表达载体。方法通过基因合成方法获得Vasculostatin的完整序列,将此片段定向克隆到pL enti-CMV-EF1p-eG FP载体多克隆位点区,筛选重组质粒,采用磷酸钙方法将Lenti-CMV-Vasculostatin/EF1p-eG FP与载体pC MV-VSGS与pC MV-Gag-Pol共转染293T细胞,转染后收获上清离心纯化病毒并检测病毒滴度。结果成功构建Vasculostatin的慢病毒表达载体,检测病毒的滴度为2.5×107/ml。结论 Vasculostatin慢病毒表达载体为研究Vasculostatin对血管生成的抑制作用提供工具。     

Nurrl基因shRNA表达载体的构建及其鉴定

目的构建针对小鼠核受体相关因子1(Nurr1)的短发夹RNA(shRNA)表达载体,为进一步体内外研究Nurr1基因的功能奠定基础。方法选择两段RNA干扰靶序列,在体外分别合成两段互补的寡核苷酸,退火后与线性化的pSilenCirele质粒连接、转化感受态细胞DH5α,扩增、纯化得到所需质粒,通过酶切后琼脂糖电泳以及基因测序鉴定其分子量及插人片段的序列。结果纯化质粒的大小为4．6kb,插入的寡核苷酸序列与设计的序列完全相符。结论成功构建了针对:Nurr1基因的shRNA的表达载体。     

大鼠delta阿片受体短发卡RNA干扰真核表达载体的构建和鉴定

背景：长期应用阿片受体治疗疼痛会导致药物耐受或成瘾,可能与delta阿片受体密度上调有关。 目的：设计及构建大鼠delta阿片受体短发卡RNA真核表达载体并鉴定。 方法：根据大鼠delta阿片受体mRNA序列设计并体外合成短发卡RNA寡核苷酸片段,退火形成双链,克隆到线性化质粒pGenesil-1,然后进行酶切和测序鉴定。 结果与结论：酶切证明delta阿片受体-短发卡RNA已经插入到质粒载体pGenesil-1里,测序结果证明均为插入正确的克隆质粒,而且质量均符合设计标准,证实靶向大鼠delta阿片受体基因的短发卡RNA真核表达载体构建成功。     

RNA干扰对大鼠脑内水通道蛋白4表达的影响研究

目的探讨RNA干扰(RNA interference,RNAi)对大鼠脑内水通道蛋白4(aquaporin4,AQP4)表达的抑制作用。方法构建特异性抑制AQP4表达的短发夹环质粒载体AQP4RNAi pGenesil-2。Wistar成年大鼠80只随机分为假手术组、脂质体组、对照质粒组和AQP4RNAi组(n=20),采用右侧脑室给药的方法分别于术后2、5、7、15d进行一般情况观察,对双侧大脑半球、脑干和小脑进行光、电镜检查,运用免疫荧光和原位杂交方法分别检测AQP4蛋白和mRNA的表达。结果脑室内注入AQP4短发夹环质粒载体后大鼠的精神、运动、行为未见明确异常,光、电镜病理检查发现神经元和胶质细胞形态、分布和脑室的形态结构与假手术组相比未见明显改变。AQP4蛋白和mRNA的表达呈进行性减少,至术后第7天,分别减少62.75%±3.6%和63.65%±2.35%。结论短发夹环AQP4RNAi质粒载体能有效减少脑内AQP4的表达,对中枢神经的功能无明显影响。     

携带大鼠脑源性神经营养因子(BDNF)基因重组慢病毒载体的构建及体外表达检测

目的 构建携带大鼠脑源性神经营养因子(BDNF)基因重组慢病毒载体,并检测其体外表达目的 基因的能力.方法 应用基因克隆技术将大鼠BDNF基因克隆人慢病毒载体pFUW中,经过PCR、酶切和测序鉴定后,与包装质粒共转染293T细胞,制备并收集携带BDNF基因的慢病毒,重组病毒感染体外培养Hela细胞,利用实时定量PCR、蛋白质免疫印迹方法检测BDNF的表达情况,观察病毒转染效果.结果 PCR、酶切和测序鉴定,成功克隆了pFUW-BDNF重组子.所包装的重组慢病毒对Hela细胞的感染效率>90%,实时定量PCR、蛋白质免疫印迹方法可以检测到重组慢病毒感染Hela细胞后能高水平表达BDNF.结论 成功构建了携带BDNF基因慢重组病毒载体,并可在体外高水平表达其所携带的目的 基因,为将其进一步应用于神经系统损伤性疾病的治疗研究奠定了方法学某础.

Abstract：

Objective To construct lentiviral vector encoding the SD rat brain derived neurotrophic factor (BDNF) gene and examine its ability to express the BDNF gene in vitro. Methods The specific BDNF sequence was cloned into the plasmid of pFUW to construct the BDNF expression plasmid pFUW-BDNF. The recombinant plasmids were identified by DNA sequencing and restriction digestion. Then the packaging cell lines (293T cell) were cotransfected with the pFUW-BDNF together with the plasmids pLP1, pLP2 and pLP/VSVG by phosphate-calcium deposit method. The recombinant lentiviral vector was used to infecte the Hela cell, the expression of BDNF was detected by real-time quantitative PCR and western blot. Results The results showed the recombinant lentiviral vector carrying BDNF gene was constructed successfully and its infection efficiency in hela cell was above 90%. The recombinant lentiviral vector could up-regulated the expression of the BDNF gene. Conclusions The lentiviral vector carrying BDNF gene can enhance the expression of BDNF gene significantly,which lays the basis for its application in the treatment of the neurodamaged disease.     

PYGO2基因RNA干扰真核表达载体的构建

目的构建PYGO2基因RNA干扰（RNAi）的真核细胞表达载体。方法以PYGO2为靶基因,以pSUPER．puro质粒为载体,设计构建重组体,根据基因库（GenBank）提供的PYGO2基因核苷酸序列,在http：／／www．ambion．com网站上使用siRNA Target Finder软件进行目的基因的siRNA序列对应DNA的设计与筛选,选择设计两条带发夹结构的核苷酸序列,克隆到空载体pSUPER．puro中,转化DH5α菌株,提取质粒,进行限制性内切酶酶切鉴定和测序分析,将重组的pSUPER．puro-PYGO2质粒转染胶质瘤C6细胞48h,检测其对该细胞PYGO2蛋白的影响。结果经酶切鉴定筛选出的重组体测序结果与目的序列完全一致,重组载体显著降低胶质瘤细胞PYGO2的蛋白表达,重组载体构建成功。结论利用RNAi技术可成功构建抑制PYGO2表达的siRNA真核表达载体。     

RNA干扰及其在胶质瘤基因治疗中的应用

RNA干扰（RNA interference。RNAi）是双链RNA（double—stranded RNA，dsRNA）降解特异性靶基因转录出的mRNA。从而抑制靶蛋白表达的现象。自从二十世纪九十年代发现RNAi这一现象以来，RNAi已被广泛应用于研究基因功能、信号转导通路和基因治疗等方面。随着分子生物学、分子遗传学等学科的发展．发现了许多与肿瘤发生、发展和预后密切相关的基因。经过大量临床前期试验表明，针对特异性靶基因的小干扰RNA（short／small interfering RNA．siRNA）治疗胶质瘤是行之有效的。为基因治疗胶质瘤提供了新的思路。[第一段]