基于ISSR的新疆贝母属植物遗传多样性研究

目的 通过对新疆贝母属植物进行遗传多样性分析,以期获得新疆贝母属不同种之间的遗传多态性.方法 应用琼脂糖凝胶电泳法结合ISSR分子标记,对所选材料进行遗传多样性与亲缘关系的综合分析.结果 2％琼脂糖凝胶电泳扩增总条带数为185条,其中多态性条带为181条,多态性条带比率(PPB)为97.84％.基于UPGMA软件对10种贝母的遗传差异性分析表明,12个ISSR引物可以将新疆贝母不同种之间遗传差异明显区分开来,其遗传相似系数范围在0.37～0.80,以0.50为最低遗传相似系数,可将10种贝母分成4个大类.结论 揭示了10种贝母种质资源间的遗传多样性与亲缘关系,为新疆野生贝母属植物资源的收集和种间分类等提供理论依据.     

利用SRAP和ISSR标记分析川党参的 遗传多样性

目的:川党参Codonopsis tangshen的遗传多样性研究.方法:对18个不同来源地的川党参种质进行SRAP(sequence-related amplified polymorphism),ISSR (inter simple sequence repeat)分析.利用TREECONW软件分析遗传相似系数,UPGMA方法构建亲缘关系系统图.结果:29条SRAP引物组合共得到329条扩增条带,其中有266条呈现多态性,占80.85%,平均遗传相似系数为0.712 1.21条ISSR引物共得到223条扩增条带,其中有166条呈现多态性,占74.44%,平均遗传相似系数为0.778 1.2种标记均表明川党参具有较高的遗传多样性.聚类结果显示川党参种质亲缘关系与地理分布相关性不显著.2种标记系统得到了相似但并不完全相同的聚类图,2种标记方法间存在显著相关性(r=0.802,P＜0.01).结论:川党参种质的遗传多样性水平较高.SRAP与ISSR标记均适用于川党参种质的遗传多样性分析.     

白芷种质资源遗传多样性的ISSR研究

目的 应用ISSR分子标记技术分析中药白芷的遗传多样性.方法 对4大类商品白芷及白芷近缘野生种兴安白芷共20个居群的白芷种质进行ISSR分析,利用NTSYS2.1e软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图.结果 9条引物共得到97条扩增条带,其中多态性条带37条,占38%;20个居群的样品聚为两大类.结论 不同产地栽培白芷的遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近;而兴安白芷与4大类商品白芷存在遗传差异.     

珠子参种质资源遗传多样性的ISSR分析

目的研究珠子参Panax japonicus种质资源的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记技术,通过聚类分析和主坐标分析,研究3个主要产地珠子参的19个样本的遗传多样性和亲缘关系。结果 13条ISSR引物扩增出181条带,其中有166条呈现多态性,占91.71%,遗传相似系数变化范围0.60~0.83。聚类分析和主坐标分析结果一致,将源于同一地区的珠子参样本聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论珠子参样本之间的遗传多样性水平较高,种质间的亲缘关系和地理位置有一定关系。     

12种翻白草种质资源遗传多样性的ISSR分析

目的 进行翻白草Potentilla discolor种质资源的遗传多样性研究.方法 对12份翻白草种质进行ISSR分析.利用POPGENE 1.32软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图.结果 12条引物共得到128条扩增条带,其中有101条呈现多态性,占78.91%.遗传相似系数变化范围0.179 2～0.632 5.聚类结果显示翻白草种质亲缘关系与地理分布有一定相关性,可以看出来源于同一地区的部分翻白草种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律.结论 翻白草的遗传多样性水平较高,种质问的亲缘关系和地理位置有一定关系.     

射干内生真菌Fusarium proliferatum的ISSR和SRAP位点遗传多样性分析

目的为了解射干内生真菌Fusarium proliferatum的遗传多样性。方法选用了52条ISSR引物和90条SRAP引物对17株射干内生真菌F. proliferatum进行了遗传多样性分析。筛选出了27条ISSR引物和38条SRAP引物可用于遗传多样性分析。结果结果,27条ISSR引物共扩增出了178个条带,其中131条(63%)具有多态性;38条SRAP引物能够扩增出357条稳定性较好的条带,其中323条(91%)具有稳定性差异。27条ISSR引物PCR扩增产物的多态性信息量(PIC)介于0.19～0.91,平均为0.70;38条SRAP引物PCR扩增产物的多态性信息量PIC介于0～0.93,平均为0.73。聚类分析结果表明,根据27个ISSR、38个SRAP及ISSR+SRAP遗传位点分析得出遗传相似系数变化范围分别为0.73～0.99、0.72～0.95和0.73～0.95,平均分别为0.84、0.85和0.85。根据材料间的遗传相似系数聚类,三者之间的聚类有较小的差异,但总体上,17株内生真菌被聚为3大类,分离自根的内生真菌F. proliferatum聚为一类,分离自茎和叶的F. proliferatum聚集于另外两类。研究表明,内生真菌F. proliferatum遗传相似性较大,其亲缘关系较近,与传统方法鉴定出的结果一致。结论采用分子标记技术比传统的方法鉴定更为有效,同时,ISSR和SRAP标记可更真实地反映射干内生真菌F. proliferatum的遗传多样性,为该内生真菌在分子生物技术方面的研究等提供一定参考。     

黄连种质资源遗传多样性的ISSR研究

目的：进行黄连Coptis chinensis种质资源的遗传多样性研究。方法：对32份黄连种质进行ISSR分析。利用TREECONW软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果：16条引物共得到106条扩增条带,其中有51条呈现多态性,占48.1%。遗传相似系数变化范围0.825 8~0.935 1。聚类结果显示黄连种质亲缘关系与地理分布无明显相关性,但可以看出来源于同一地区的部分黄连种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论：栽培黄连的遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近。     

野生红景天的RAPD和ISSR遗传多样性分析

目的采用RAPD和ISSR分子标记进行野生红景天种间亲缘关系及种内的遗传多样性分析。方法用CTAB法提取基因组DNA,然后通过筛选得到的11个RAPD及11个ISSR引物对不同采集地的4种野生红景天进行遗传多样性分析。结果 11条RAPD引物共扩增出96条条带,多态性百分比为90.62%;11条ISSR引物共扩增出102条条带,多态性百分比为100%。ISSR多态性的检测能力优于RAPD;聚类分析结果表明,ISSR法、RAPD和ISSR联用法均将17个样品聚为3大类;RAPD将样品聚为4大类。结论 2种标记均可用于红景天属植物种间亲缘关系与种内遗传多样性研究;4种红景天种内存在一定的遗传差异,种间基因流较小。     

黄精属8种药用植物遗传多样性的ISSR分析

目的:从分子水平对黄精属8种药用植物的遗传多样性和遗传关系进行研究。方法:采用ISSR分子标记技术,对黄精属8个种的植物进行多态性分析,并通过UPGMA聚类法进行聚类分析,探讨8种药用植物的亲缘关系。结果:在筛选到的6条引物中,共获得62条清晰的DNA标记谱带,多态性谱带60条,多态性位点百分率为96.8%,表明8个品种间具有较高的遗传多样性。8种黄精属植物的遗传相似系数在0.4194~0.7258之间,平均达0.5904。其中,节根黄精与滇黄精遗传相似系数最小为0.4194,亲缘关系最远;节根黄精与多花黄精遗传相似系数最大为0.7258,亲缘关系最近。此外,利用NTSYS-pc 2.1软件对样品进行了UPGMA聚类分析,结果显示8种黄精属植物在阈值为0.55时可聚为两大类。结论:8种黄精属植物间遗传相似性较低,在遗传物质上存在显著的遗传变异,具有丰富的遗传多样性。     

石斛属植物遗传多样性的简单重复间系列分析

目的 研究我国石斛属植物间的亲缘关系.方法 从55个ISSR引物中筛选出14个多态性好的引物对石斛属(Dendrobium)植物基因组DNA进行简单重复间序列(ISSR)分析.利用POPGENE32软件计算ISSR扩增产物的Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),标记系统的有效等位基因数(effective number of alleles, NE).应用NTSYS(3.0)软件计算Nei's遗传距离和遗传相似系数.按照非加权平均距离法(UPGMA)构建聚类关系图.结果 14条引物共扩增出123条带,多态性带112条,约占总数的91.06%,平均每个引物扩增的DNA带数为8.79条.Nei's基因多样性指数(H)为0.351 9,Shannon信息指数(I)为0.528 2,有效等位基因数(NE)为1.594 5,种间的相似系数介于0.090 9～0.695 7,平均为0.377 9.结论 我国石斛品种的遗传基础比较丰富,ISSR分子标记构建的亲缘关系树状图与经典分类系统基本一致.